#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 20, 2024; 6:18 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Specht C. 2006. Systematics and Evolution of the Tropical Monocot Family Costaceae (Zingiberales): A Multiple Dataset Approach. Systematic Botany, 31(1). 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Costus_chartaceus 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Costus_curvibracteatus 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Costus_dubius 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Costus_englerianus 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Costus_erythrocoryne 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Costus_fissiligulatus 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Costus_gabonensis 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Costus_globosus 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Costus_guanaiensis_var_guanaiensis 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Costus_lateriflorus 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Costus_letestui 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Costus_lucanusianus 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Costus_maculatus 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Costus_mosaicus 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Costus_paradoxus 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Costus_pictus 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Costus_pulverulentus 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Costus_sp._126 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Costus_talbotii 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Costus_varzearum 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Monocostus_uniflorus 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Siphonochilus_kirkii 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Tapeinochilos_dahlii 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Tapeinochilos_pubescens 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Tapeinochilos_queenslandiae 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Tapeinochilos_solomonensis ??????????????????????????-TGGTAACTTCCAAATTCAGAG-AAACCCTGGAATTAAAAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTTATT-----TTGAG-AAAACAAAGGTTTATA------AAACTAG------TAATAAATAAGGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACGAATGAAGTTGAC-TACGTTTCGTTGGTAGTTGGAATCCGTCTCTCAAAATGACAGCAAAAGATATTCCTATATACCTAATACGTACGTATACATACTGACATATCAAACG-----ATTAATCATGACCGGAATCCATATATATA------TAATTAG----ATTAGTTAT---AATATGAAT------------AATATGAATGTTATAAT-----------ATAATATAT----------------------GAATGTTATAATATAATAT----------GAAAAATTCAGAATTATTGTGAATCCATTCCAATAGAAGTTGATTTAATAAT-CGAATATTCAATT-----ATTAAATCATTCATTCCAGAGTTTGATAGATCTTTTGAA-AAAC------TAAGTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATAC-----CGACAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAGAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCCAATAAAAAGCCCATTTGACTTCCTAAGTATTTATC------------TTTTCATCAGTGGTTCAGTTCAAACAAAATTTACTATCTTTCTCATTCACTCTATTCTTTCA------CAAATGGATCCG--AACTAAAATCCTTGGCTTGGATCTTATCCCAATTTGAATAGATACAATACCTGTACAAATAAACATATATGGGCAAAGAATCTCTATTATTGAATCATTCACAGTCCAT----------------------ATCATTATCCTTATATTAGG-------AAAATTTTTGACTACTTTTTAGTCCCTTTAA-----------------------------TTGACATAGACACAAGTACTTTACTAGAATGA------TGCACGGGAAATGAAATGGTGCGGGATAG??????????????????????-ACACAACACAACAA??????????AAGTGTCGACTATG-ATCTTTTACACGTTTGGATG-AAG-CAACAAATTCGTCCAGACTATTGGTA--GAGTCTATAAG---ACCACGACTGATC--CTCAAAGGTAATGAATGGAAAAAGCAGCATGTCGTAAAAAA--TTAAAATTTAATT-AATTTAATAAAATAACAAA------TTG-ATTAAATTAATTAAATTGA---------AAATG-ACAAATTCA-AGTGA-AACTTTGAGTTTA-TCC--------------------TTTACAGTT-GGTCTAG-TGAATAAATGGATAGGGCCCTATGGCTCCAATTCTGGTAAAACAAAAGGCAACGAGCTTATGTTCTTAATTTGAATTGAATGATTACCCGATCTAATTAGACGTTAAAAATA-----AATTAGTGCCCGATACGGGAAAGGGTG-TGTTCTCCTGTAACTGTAAGTAGACCATTCATTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTT-AATGAATCCTAA----------------------CTATTCTTT--ATTATGG---------ATTAGAGACAGATGTGTAAAAGAAA--CAGTATACTGATAAAGAGAATT-AATTCCAAAGTCAAAAGAGCGATCGGGTTGCAAAAATAAAAATAAAGGGTTTTTATTCTCTTGG-----AATTAGAACGAAG-ATAAATCAATTTGAATTGAA--------AGAGAGTAAAAAGATCTGTTGATTGG-ACTCCCTCTTTTCGGGGTAT-----ATATTTTTTTT--------ATTACTATTCTA--------------------------TTCTATATATAATAT---------ATTACTATTCTAT-----ATAC---------ATAA-TAT-CTAT----------------------ATACATAATAGAATACATAATACCCTGTTTTGACCATATTGCACTATGTATCATTCATTTGATAACCCAAGAAATGCCCCCTACCTCTGCTTCAA-GTAGAAATATAAATG-----------------------GAAGAATTACAAGGATATTTAGAAAAAGATAGAT-CTCGGCAACAACACTTTCTATATCCACTTCTCTTT--CAAGAGTATATT-TACGTATTTGCTTT-GCTTATGATC-ACGGGTTA-AATAGTTCGATTTTCGA-TAAACCCGTGAAAA-CCTGG-CCAAACAACAAACCAAAA????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GAAAATAAACGACTATGT-CGGGTCT?AG?T?ATTCTTATGGATCTG?ATGCGGATTTTTATTAGT?TTTCTTCGTAAACAATCTT-CTTATTGGCGATTA-ACATCTTCT--GGAGTCTTTCATGAGCGAGCACA-?TTTTATA-GAAAAATAG-ATCATCTTGTAGTG-TGCC--GAAATTCTAA-TTATGTTGAGAAGACTCTATGGGTCTTCAAGGATCCTTTCATG-CATTATGTTCGA?ATCAAG?-AAAAGCGATTTTGGGTTCAAGAGGGACTCATTTTCTGATGAAGAAATGGAAATGTCACCTTGTCAATTTCTGGCAATATTATTTTCATTTTTGGTCTCAACCGTATAGGATTCATATAAACCAATTATCAAACTATTCCTTCTATTTTCTGGGTTATTTTTCAAGTGTACTAATAAATTCTTCGATGGTAAAGAATCAAATGGTAGATAATTCATTTCTAGTGAATACTCTTACTAAGAAATTCGATACTATAGTCCCAATTATTCCTCTTATTCGATCATTGTCTAAAGCTCAATTTTGTAACGTATCCGGGCATCCTATTAGTAAGCCAATTTGGACCGATTTATCAGATTGTGATATTATTAATCGATTTGGTCGGATATATAGAAATCTTTCTCACTACCATAG-TGGATCCTCAAAAAA--ACAGAGTTTG-TATCG-AATGAAG-TATATACTTCGACTTTCATGTGCCC-GAAC--TTTGGCCCG-TAAACATAAAA-GTGCAGTACGCTGTTTTTTGCAAAGATTAAGTTCGGGATTATTAGAAGAATT-CTTTACGG-AAGAAGGACAAG-TTCTTTCTTTGATCTTTCCCCCCAAAAC------GTCTTTTTCTTTACATGGATCATATAGAGAACGTATTTGGTATTTGGATATTATCCGTATCAATGATCTGGTAAATAATTTATAATAAAA--------------TTAGGTATGAGATAATTGA----------CAATTATAAATAGAGGATAAGATATA------ATAGAA--------------------------------------ATGATCTATAGATATAGTATAGATCAAGAGACAAAGA--TATTCAT-GAATTTTCATT-CTGAAATGCTCA------TGTAGTAG-TGTAG-TGGTTGAATCAACGGAGTAGTAAAAATTCTTATACTTTCCTTT------CTCGCGATGTTTTGTATTTG-TATATGTATACATAGGGAAAGTCGTGTGCAATGAAAAATGCAAGCACGGTTTGGGGAGAGATTTTTT???????????-?CACAACCCA??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????----???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GGGAAAGGAGGGTGATGCTACTCCTTTTACTGATGTCACTGTAAGT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; END; BEGIN SETS; CHARSET nuc (CHARACTERS = Combined_Costaceae_matrix) = 4178-5827; CHARSET chloro (CHARACTERS = Combined_Costaceae_matrix) = 1-4177; CHARSET morph (CHARACTERS = Combined_Costaceae_matrix) = 5828-5898; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = Combined_Costaceae_matrix) = N: 1-5898; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = Combined_Costaceae_matrix) = N: 1-5898; END; BEGIN TREES; TITLE Tb7599; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Tapeinochilos_solomonensis, 2 Tapeinochilos_queenslandiae, 3 Tapeinochilos_pubescens, 4 Tapeinochilos_holrungii, 5 Tapeinochilos_dahlii, 6 Tapeinochilos_ananasse, 7 Siphonochilus_kirkii, 8 Siphonochilus_decora, 9 Monocostus_uniflorus, 10 Dimerocostus_strobilaceus_a, 11 Dimerocostus_strobilaceus, 12 Dimerocostus_argenteus, 13 Costus_woodsonii, 14 Costus_villossisimus, 15 Costus_varzearum, 16 Costus_talbotii, 17 Costus_subsessilis, 18 Costus_stenophyllus, 19 Costus_spectabilis, 20 Costus_speciosus_b, 21 Costus_speciosus_a, 22 Costus_speciosus, 23 Costus_sp._126, 24 Costus_sp_nov, 25 Costus_pulverulentus_2, 26 Costus_pulverulentus, 27 Costus_plicatus, 28 Costus_pictus_2, 29 Costus_pictus, 30 Costus_phaeotrichus, 31 Costus_paradoxus, 32 Costus_mosaicus, 33 Costus_montanus, 34 Costus_megalobractea, 35 Costus_malortieanus, 36 Costus_maculatus, 37 Costus_lucanusianus, 38 Costus_letestui, 39 Costus_lateriflorus, 40 Costus_lasius, 41 Costus_lanceolatus, 42 Costus_laevis, 43 Costus_lacerus, 44 Costus_guanaiensis_var_tarmicus, 45 Costus_guanaiensis_var_guanaiensis, 46 Costus_globosus, 47 Costus_gabonensis, 48 Costus_fissiligulatus, 49 Costus_erythrocoryne, 50 Costus_englerianus, 51 Costus_dubius, 52 Costus_dinklagei, 53 Costus_deistelii, 54 Costus_cuspidatus, 55 Costus_curvibracteatus, 56 Costus_curcumoides, 57 Costus_comosus, 58 Costus_claviger, 59 Costus_chartaceus, 60 Costus_amazonicus, 61 Costus_allenii, 62 Costus_aff_lucanusianus, 63 Costus_aff_globosus_a, 64 Costus_aff_globosus, 65 Costus_afer, 66 Costus_acreanus; TREE Fig._1 = [&R] (7,(8,(((((((1,5),((2,3),6)),4)Tapeinochilos,((46,64),((22,21),43))Cheilocostus),(50,31)Paracostus)Asian_Costaceae,(((((((((((((((13,18),(26,25)),55),57),33),(23,24)),(((15,58),(59,49)),((((((14,45),27),44),60),(40,61)),35))),42),(29,28)),66)New_World_Costus,(((34,65),51),((62,37),53))African_melittophilous_Costus),(36,52)),((30,32),(47,48))),(16,(38,39))),19)Costus),((9,(11,12)),((17,54),(41,56))Chamaecostus))Costaceae)); END;