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TreeBASE (cc) 1994-2008

Study reference:
Tang C.Q., Obertegger U., Fontaneto D., & Barraclough T. 2014. Sexual species are
separated by larger genetic gaps than asexual species in rotifers. Evolution, .

TreeBASE Study URI:  http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S14643]

BEGIN TAXA;
        TITLE  Taxa1;
        DIMENSIONS NTAX=20;
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            Pleuretra_lineata_A447_PL5_COI
            Pleuretra_lineata_CZ1PL12COI
            Pleuretra_lineata_CZ1PL1COI
            Pleuretra_lineata_CZ1PL23COI
            Pleuretra_lineata_CZ1PL27COI
            Pleuretra_lineata_M25PL5
            Pleuretra_lineata_M25PL7
            Pleuretra_lineata_M25PL8
            Pleuretra_lineata_M9PL1COID
            Pleuretra_lineata_MO17PC3
            Pleuretra_lineata_MO17PC4
            Pleuretra_lineata_MO17PC7
            Pleuretra_lineata_MO17PL14COI
            Pleuretra_lineata_MO17PL9COI
            Pleuretra_lineata_S83B1P
            Pleuretra_lineata_S91PLP
            Pleuretra_lineata_SP1PL19COI
            ;
END;

BEGIN TAXA;
        TITLE  Taxa2;
        DIMENSIONS NTAX=129;
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BEGIN TAXA;
        TITLE  Taxa3;
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BEGIN TAXA;
        TITLE  Taxa10;
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        TAXLABELS
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BEGIN TAXA;
        TITLE  Taxa11;
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        TAXLABELS
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            ;
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BEGIN TAXA;
        TITLE  Taxa12;
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BEGIN TAXA;
        TITLE  Taxa13;
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        TAXLABELS
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            Dissotrocha_macrostyla_DmacrostylaDMA382b
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BEGIN CHARACTERS;
[! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M18428]

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MATRIX
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Synchaeta_tremula_gi|187475941|gb|EU499898.1|            AACTCTTTATTTTTTATTTGGTATATGAACAGGATTAATTGGTTTAAGAATAAGATTGCTAATTCGTTTAGAATTAGGTATTATTGG?CCTTTTTTAGGTGAGGAGCATCTTTATAATGTATTAGTAACTGCTCATGCTTTTGTTATAATTTTTTTTATAGTTATGCCTATTTCTATAGGAGGATTTGGTAATTGACTAATTCCTCTAATATTAGGTGTAGCAGATATAGCATTTCCTCGAATGAATAATTTATCATTTTGATTATTAATTCCAGCATTTATGCTATTACTCTTAAGAAGAATTTTAGATGCTGGAGTAGGTACAGGATGAACTGTTTATCCTCCTTTATCTGATTCTAAATTTCATTCAGGTATTTCTGTAGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATTTAGCTGGTATTTCTTCTATTTTAGGTAGAATTAATTTTATAACTACTATTATTTGTTCTCGTACTACTAAAATGGTAAGAATAGATCGATTACCTCTTATATTATGATCATTAGGGGTTACAGCATTTTTATTGTTAACTACTTTACCAGTTTTAGCTGGTGCTATTACTATGTTATTAACTGATCGTAATTTCAATACTTCATTTTTTGATCCTTCAGGAGGAGGTA???????????????????????????????????????????
Synchaeta_tremula_gi|187475943|gb|EU499899.1|            AACTCTTTATTTTTTATTTGGTATATGAACAGGATTAATTGGTTTAAGAATAAGATTGCTAATTCGTTTAGAATTAGGTATTATTGGACCTTTTTTAGGTGATGAGCATCTTTATAATGTATTAGTAACTGCTCATGCTTTTGTTATAATTTTTTTTATAGTTATGCCTATTTCTATAGGAGGATTTGGTAATTGACTAATTCCTCTAATATTAGGTGTAGCAGATATAGCATTTCCTCGAATGAATAATTTATCATTTTGATTATTAATTCCAGCATTTATGCTATTACTCTTAAGAAGAATTTTAGATGCTGGAGTAGGTACAGGATGAACTGTTTATCCTCCTTTATCTGATTCTAAATTTCATTCAGGTATTTCTGTAGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATTTAGCTGGTATTTCTTCTATTTTAGGTAGAATTAATTTTATAACTACTATTATTTGTTCTCGTACTACTAAAATGGTAAGAATAGATCGATTACCTCTTATATTATGATCATTAGGGGTTACAGCATTTTTATTGTTAACTACTTTACCAGTTTTAGC?GGTGCTATTACTATGTTATTAACTGATCGTAATTTCAATACTTCATTTTTTGATCCCTCAGGAGGAGGG????????????????????????????????????????????
Synchaeta_tremula_gi|187475951|gb|EU499903.1|            AACACTTTATTTTCTATTTGGTATGTGAACAGGATTAATTGGTTTAAGTATAAGACTTTTAATTCGTTTAGAATTAGGTATTATTGGACCTTTTTTAGGCGATGAGCATCTTTACAATGTATTAGTAACTGCTCATGCTTTTGTAATAATTTTTTTTATAGTTATACCTATTTCTATAGGAGGATTTGGTAATTGATTAATTCCTTTAATACTAGGTGTAGCAGATATGGCTTTCCCACGTATAAATAACTTATCTTTTTGACTTTTAATTCCAGCTTTTATACTATTATTATTAAGAAGTATTCTAGACGCTGGAGTAGGTACAGGGTGAACTGTTTATCCTCCTTTATCTGATTCTAAATTTCATTCTGGTATTTCTGTAGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATTTAGCTGGTATTTCTTCTATTTTAGGAAGAATTAATTTTATAACTACTATTATTTGTTCTCGTACTACTAAAATAGTTAGAATAGATCGATTACCTCTTATATTATGATCATTAGGAGTAACAGCATTTTTATTATTAACCACACTCCCAGTTTTAGCTGGTGCAATTACTATGTTGTTAACTGATCGTAATTTTAATACTTCATTCTTTGATCCTTCCGGAGGAGG?????????????????????????????????????????????
Synchaeta_tremula_gi|187475955|gb|EU499905.1|            AACACTTTATTTTCTATTTGGTATGTGAACAGGATTAATTGGTTTAAGTATAAGACTTTTAATTCGTTTAGAATTAGGTATTATTGGACCTTTTTTAGGCGATGAGCATCTTTACAATGTATTAGTAACTGCTCATGCTTTTGTAATAATTTTTTTTATAGTTATACCTATTTCTATAGGAGGATTTGGTAATTGATTAATTCCTTTAATACTAGGTGTAGCAGATATGGCTTTTCCACGTATAAATAACTTATCTTTTTGACTTTTAATTCCAGCTTTTATGCTATTATTATTAAGAAGTATTCTAGACGCTGGAGTAGGTACAGGGTGAACTGTTTATCCTCCTTTATCTGATTCTAAATTTCATTCTGGTATTTCTGTAGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATTTAGCTGGTATTTCTTCTATTTTAGGAAGAATTAATTTTATAACTACTATTATTTGTTCTCGTACTACTAAAATAGTTAGAATAGATCGATTACCTCTTATATTATGATCATTAGGAGTAACAGCATTTTTATTATTAACCACACTCCCAGTTTTAGCTGGTGCAATTACTATGTTG??AACTGATCGTAATTTTAATACTTCATTCTTTGATCCTTCCGGAGGAGG?????????????????????????????????????????????
Synchaeta_tremulaoblonga_gi|379996103|gb|JN936549.1|     AACTCTTTACTTCGTCTTTGGTATATGAGCAGGTTTAGTTGGTCTTAGTATAAGACTACTAATTCGTCTAGAATTAGGTATTATTGGACCTTTTTTAGGTGATGAGCATCTTTATAATGTCATTGTAACTGCTCATGCTTTTGTAATAATTTTTTTTATAGTTATACCTATTTCTATAGGAGGATTTGGTAATTGATTAATTCCACTAATGTTAGGAGTTGCTGATATAGCATTCCCTCGATTGAATAATTTGTCTTTTTGACTATTAATCCCAGCGTTTATGCTATTACTTTTAAGAAGTATTCTTGATGCTGGAGTTGGTACTGGATGAACAGTTTATCCTCCATTATCTGATTCTAAATTTCATTCTGGTATTTCTGTTGATCTTGCAATTTTTAGTCTTCATATTGCTGGTATTTCATCTATTTTAGGTAGAATTAATTTTATGACTACTATTATTTGTTCTCGTACTACAAAAATAGTGAGAATAGATCGTCTTCCTTTGATAATTTGATCATTAGGAGTAACAGCATTTCTTTTAGTAACGACTTTACCTGTATTAGCAGGGGCTATTACTATGCTCCTTACAGATCGTAATTTTAACACTTCATTTTTTGATCCTTCTGGAGGAGGTAATCCTGTTTTATACCAACACCTATTC?????????????????
Synchaeta_tremulaoblonga_gi|379996107|gb|JN936551.1|     AACTCTTTACTTCGTCTTTGGTATATGAGCTGGTTTAGTTGGTCTTAGTATGAGACTACTGATTCGTTTAGAATTAGGTATTATTGGACCTTTTTTAGGTGATGAGCATCTTTATAATGTCATTGTAACTGCTCATGCTTTTGTTATGATTTTCTTTATAGTTATGCCTATTTCTATGGGAGGATTTGGTAACTGATTAATTCCATTAATACTAGGAGTCGCTGATATGGCATTCCCTCGATTAAATAACTTATCTTTTTGATTATTAATTCCTGCATTTATGCTATTACTTCTTAGTAGTATTCTTGATGCTGGAGTTGGTACTGGATGAACAGTTTACCCTCCATTATCTGATTCTAAATTTCATTCTGGAATTTCTGTTGATCTTGCAATTTTTAGTCTTCATATTGCTGGTATTTCGTCTATTTTAGGGAGAATTAACTTTATGACTACTATTATTTGTTCTCGTACTACTAAAATAGTGAGAATAGATCGTCTTCCTTTAATAATTTGATCCTTAGGGGTAACAGCATTCCTTTTAGTAACAACTTTACCTGTATTAGCAGGGGCTATTACTATGCTTCTTACAGACCGAAATTTTAATACTTCATTTTTTGATCCTTCTGGAGGAGGTAATCCTGTTTTATACCAACATTTATTC?????????????????
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Synchaeta_tremulaoblonga_gi|379996143|gb|JN936569.1|     AACTCTTTATTTTTTATTTGGTATATGAACAGGATTAATTGGTTTAAGAATAAGATTGCTAATTCGTTTAGAATTAGGTATTATTGGACCTTTTTTAGGTGATGAGCATCTTTATAATGTATTAGTAACTGCTCATGCTTTTGTTATAATTTTTTTTATAGTTATGCCTATTTCTATAGGAGGATTTGGTAATTGACTAATTCCTCTAATATTAGGTGTAGCAGATATAGCATTTCCTCGAATGAATAATTTATCATTTTGACTATTAATTCCAGCATTTATGCTATTACTATTAAGAAGAATTTTAGATGCTGGAGTAGGTACAGGATGAACTGTTTATCCTCCTTTATCTGATTCTAAATTTCATTCAGGTATTTCTGTAGATTTAGCTATTTTTAGTCTACATTTAGCTGGTATTTCTTCTATTCTAGGTAGAATTAATTTTATAACTACTATTATTTGTTCTCGTACTACTAAAATGGTAAGAATAGATCGATTACCTCTTATATTATGATCATTAGGGGTTACAGCATTTTTATTGTTAACTACTTTACCAGTTTTAGCTGGTGCTATTACTATGTTATTAACTGATCGTAATTTCAATACTTCATTTTTTGATCCTTCAGGAGGAGGTAATCCTGTACTTTACCAACATTTATTT?????????????????
;
END;

BEGIN CHARACTERS;
[! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M18423]

	TITLE Macrotrachela_spp_haplotype_alignment;
	LINK TAXA = Taxa9;
	DIMENSIONS NCHAR=1542;
	FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -;

MATRIX
[                                                                     10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220       230       240       250       260       270       280       290       300       310       320       330       340       350       360       370       380       390       400       410       420       430       440       450       460       470       480       490       500       510       520       530       540       550       560       570       580       590       600       610       620       630       640       650       660       670       680       690       700       710       720       730       740       750       760       770       780       790       800       810       820       830       840       850       860       870       880       890       900       910       920       930       940       950       960       970       980       990       1000       1010       1020       1030       1040       1050       1060       1070       1080       1090       1100       1110       1120       1130       1140       1150       1160       1170       1180       1190       1200       1210       1220       1230       1240       1250       1260       1270       1280       1290       1300       1310       1320       1330       1340       1350       1360       1370       1380       1390       1400       1410       1420       1430       1440       1450       1460       1470       1480       1490       1500       1510       1520       1530       1540  ]
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BEGIN CHARACTERS;
[! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M18422]

	TITLE Keratella_cochlearis_haplotype_alignment;
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Keratella_cochlearis_138KC1Tovel15m     TACTCTATATTTTATTTTTGGTATTTGGGCTGGTTTTATTGGTTTAAGTATAAGTCTTTTAATTCGCTTGGAGTTAGGTGTTGTTGGGCCTTTCTTGTCTGATGAGCATCTTTATAACGTTATTGTTACTGCTCACGCTTTTATCATAATCTTCTTTATGGTTATGCCTATTTCCATAGGTGGTTTTGGTAATTGGTTAATTCCTCTCATACTAGGTGTAGCTGACATGGCTTTCCCTCGCATAAATAATCTTTCTTTCTGACTTTTAGTCCCTTCCTTTACTTTCCTTCTACTTTCTTCTATCCTTGATTCAGGAGCTGGAACAGGGTGGACTGTCTATCCTCCTCTTTCTGATTCTAAGTATCATTCTGGTATCTCAGTTGATCTGGCTATTTTTAGTCTTCATCTAGCAGGTATTTCTTCTATTCTCGGTAGGATTAATTTTCTTACAACAATCATTTGTTCTCGTACTACTAAGGTTATTTCTCTTGATCGTATGCCTCTTATGCTTTGAGCAATTTCTGTTACGGCTATTCTTTTGATCACCAGATTGCCAGTCTTAGCAGGTGCCATTAC??T?CTTTTAACTGATCGAAATCTAAATACTTCTTTCTTTGA???????????????????????????????????????????
Keratella_cochlearis_138KC7Tovel15m     TACTCTATATTTTATTTTTGGTATTTGGGCTGGTTTTATTGGTTTAAGTATGAGCCTTTTAATTCGTTTGGAGTTAGGTGTTGTTGGACCTTTCTTATCTGATGAGCATCTTTATAACGTTATTGTTACTGCTCATGCTTTTATCATAATTTTCTTTATGGTTATGCCTATTTCCATGGGTGGTTTTGGTAATTGGTTAATTCCCCTTATATTAGGCGTAGCTGACATGGCTTTCCCTCGTATAAATAATCTTTCTTTCTGACTTTTAGTCCCTTCCTTTACTTTCCTTCTACTTTCTTCTATTCTTGATTCAGGAGTTGGAACAGGGTGGACTGTGTATCCTCCCCTTTCTGATTCTAAGTATCATTCTGGTATCTCAGTTGATCTGGCTATTTTTAGTCTTCATCTAGCAGGTATTTCTTCTATTCTTGGCAGGATTAACTTTCTTACAACAATCATTTGTTCTCGTACTACTAAGGTTATTTCTCTTGATCGTATGCCTCTTATGCTTTGAGCAATTTCTGTGACGGCTATTCTTTTGATCACTAGATTGCCAGTCTTAGCAGGTG??ATT?C??TGCTTTTAACTGATCGAAACTTAAATACTTCTTTCTTTGAT??????????????????????????????????????????
Keratella_cochlearis_14KC1Cresp         TACTTTGTACTTCATTTTTGGCATTTGGGCTGGGTTTATTGGTTTAAGTATGAGTCTCTTGATTCGTCTAGAGCTCGGTGTTGTTGGTCCTTTTCTGTCTGATGAGCATCTTTATAATGTTATTGTTACTGCTCATGCTTTCATTATGATTTTCTTCATGGTTATGCCTATTTCTATAGGTGGTTTTGGTAATTGACTGATTCCTCTTATGTTAGGTGTAGCTGACATGGCCTTCCCTCGTATGAACAATCTTTCTTTCTGGCTTTTAATTCCTTCTTTTACCTTCCTTCTTCTTTCTTCAATTCTTGATTCAGGGGTTGGAACAGGGTGGACCGTCTATCCTCCACTTTCTGATTCTAAGTATCATTCTGGTATTTCAGTTGACTTGGCTATTTTTAGCCTTCATTTAGCTGGTATTTCATCCATTCTTGGTAGAATTAACTTTCTTACAACAATTATTTGCTCTCGTACTACCAAAGTTATCTCTCTTGATCGTATGCCTCTTATGCTTTGAGCAATCTCTGTGACCGCTATTCTTCTTATTACTAGGCTGCCAGTTCTGGCAGGTGCTATTACTATGCTTTTAACTGATCGAAACTTGAACACTTCTTTCTTTGATCCTGCTGGTGGCGGAAATCCTATTCTTTACCAGCATTTATTC
Keratella_cochlearis_15KC1Antho         TACTCTATATTTTATTTTTGGTATTTGGGCTGGTTTTATTGGTTTAAGTATGAGTCTTTTAATTCGTTTGGAGTTAGGAGTTGTTGGACCTTTCTTATCTGATGAGCATCTTTATAACGTTATTGTTACTGCTCATGCTTTTATCATAATTTTCTTTATGGTTATGCCTATTTCCATGGGTGGTTTTGGTAATTGGTTAATTCCCCTTATACT?GGCGTAGCTGACATGGCTTTCCCTCGTATAAATAATCTTTCTTTCTGACTTTTAGTCCCTTCCTTTACTTTCCTTCTACTTTCTTCTATTCTTGATTCAGGAGTTGGAACAGGGTGGACTGTCTATCCTCCCCTTTCTGATTCTAAGTATCATTCTGGTATCTCAGTTGATCTGGCTATTTTTAGTCTTCATCTAGCAGGTATTTCTTCTATTCTTGGCAGGATTAACTTTCTTACAA???TC?TTTGTTCTCGTACTACTAAGGTTATTTCTCTTGATCGTATGCCTCTTATGCTTTGAGCAATT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Keratella_cochlearis_3KC1Terlag         CACTCTTTACTTCATTTTTGGAATTTGAGCTGGTTTTATTGGTCTAAGTATGAGTCTTCTAATTCGCTTAGAACTTGGTGTGG?GGGTCCATTTTTATCTGATGAGCACCTTTATAATGTAATTGTTACTGCTCACGCTTTCATTATAATTTTCTTCATGGTTATGCCTATTTCGATAGGTGGGTTTGGTAATTGGCTTATTCCTCTTATACTAGGAGTTGCTGATATAGCTTTCCCTCGCATGAACAACTTATCTTTTTGGCTTCTAATTCCTTCTTTTACTTTTCTTCTCCTGTCTTCTATCCTTGATTCAGGGGTAGGAACTGGTTGAACTGTTTACCCCCCTCTCTCCGACTCTAAATATCATTCTGGTATTTCAGTTGACTTAGCTATTTTCAGTCTTCATTTAGCAGGAATTTCTTCCATTCTTGGTAGGATTAATTTTCTTACTACTATCATTTGCTCTCGCACAACTAAGGTTATCTCTCTTGATCGTATGCCTCTAATGCTTTGGGCTATTTCTGTTACTGCTGTTCTTTTAATTACTAGGTTGCCTGTTTTAGCAGGTGCTATTACAATGCTCCTAACTGATCGAAACCTTAATACTTCCTTCTTTGATCCTGCTGGTGGTGGTAATCCAGTTCTTTATCAGCATCTTTTT
Keratella_cochlearis_3KC2Terlag         TTCCTTGTATTTTGTTTTCGGTATTTGAGCTGGTTTCATTGGTCTTAGGATAAGATTGTTGATTCGTCTCGAGTTGGGTGTAGTCGGTCCTTTTTTGGCTGATGAGCACCTCTATAATGTTTTAGTAACAGCTCATGCCTTTATCATGATTTTTTTTGTGGTCAT?CCTATCTCTATAGGGGGTTTTGGTAACTGGCTTATTCCTCTTATGTTGGGTGTTGCTGATATGGCTTTCCCCCGCATGAATAATCTTTCTTTTTGGTTATTAGTTCCTTCTTTTTCTTTTCTTCTTCTATCCTCTCTGCTGGACTCTGGGGTAGGGACTGGTTGAACTGTTTACCCCCCACTATCCGATTCTAAGTACCATTCTGGTATCTCTGTTGATTTGGCTATTTTTAGTCTTCACTTGGCTGGTATTTCTTCTATTTTAGGTAGAATTAACTTTCTTACAACTATTGTTTGCTCTCGCACTACTAAGAGTATTTCATTAGATCGTATGCCTCTTATGCTTTGAGCTCTTTCCGTAACTGCTATTTTACTCATTACTAGTTTGCCCGTTCTAGCAGGTGCTATCACTATACTTTTAACTGATCGCAATCTTAATACTTCTTTTTTTGATCCTGCAGGGGGTGGAAATCCTGTCCTTTATCAGCATCTGTTC
Keratella_cochlearis_3KC4Terlag         TACTCTATATTTTATTTTTGGTATTTGGGCTGGTTTCATTGGTTTAAGTATGAGTCTTTTAATTCGTTTGGAGTTAGGTGTTGTTGGACCTTTCTTATCTGATGAGCATCTTTATAACGTTATTGTTACTGCTCATGCTTTTATCATAATTTTCTTTATGGTTATGCCTATTTCCATGGGTGGTTTTGGTAATTGGTTAATTCCCCTTATACTAGGCGTAGCTGACATGGCTTTCCCTCGTATAAATAATCTTTCTTTCTGACTTTTAGTCCCTTCCTTTACTTTCCTTCTACTTTCTTCTATTCTTGATTCAGGAGTTGGAACAGGGTGGACTGTCTACCCTCCCCTTTCTGATTCTAAGTATCATTCTGGTATCTCAGTTGATCTGGCTATTTTTAGTCTTCATCTAGCAGGTATTTCTTCTATTCTTGGCAGGATTAACTTTCTTACAACAATCATTTGTTCTCGTACTACTAAGGTTATTTCTCTTGATCGTATGCCTCTTATGCTTTGAGCAATTTCTGTGACGGCTATTCTTTTGATCACTAGATTGCCAGTCTTAGCAGGTGCCATTACAATGCTTTTAACTGATCGAAACCTAAGTACTTCTTTCTTTGATCCTGCAGGTGGTGGTAATCCAATTCTTTATCAGCATTTATTC
Keratella_cochlearis_3KC5Terlag         TACTCTATATTTTATTTTTGGTATTTGGGCTGGTTTTATTGGTTTAAGTATGAGTCTTTTAATTCGTTTGGAGTTAGGTGTTGTTGGACCTTTCTTATCTGATGAGCATCTTTATAACGTTATTGTTACTGCTCATGCTTTTATCATAATTTTCTTTATGGTTATGCCTATTTCCATGGGTGGTTTTGGTAATTGGTTAATTCCCCTTATACTAGGCGTAGCTGACATGGCTTTCCCTCGTATAAATAATCTTTCTTTCTGACTTTTAGTCCCTTCCTTTACTTTCCTTCTGCTTTCTTCTATTCTTGATTCAGGAGTTGGAACAGGGTGGACTGTCTATCCTCCCCTTTCTGATTCTAAGTATCATTCTGGTATCTCAGTTGATCTGGCTATTTTTAGTCTTCATCTAGCAGGTATTTCTTCTATTCTTGGCAGGATTAACTTTCTTACAACAATCATTTGTTCTCGTACTACTAAGGTTATTTCTCTTGATCGTATGCCTCTTATGCTTTGAGCAATTTCTGTGACGGCTATTCTTTTGATCACTAGATTGCCAGTCTTAGCAGGTGCCATTACAATGCTTTTAACTGATCGAAACCTAAATACTTCTTTCTTTGATCCTGCAGGTGGTGGGAATCCAATTCTTTATCAGCATTTATTC
Keratella_cochlearis_3KC6Terlag         TACTCTATATTTTATTTTTGGTATTTGGGCTGGTTTTATTGGTCTAAGTATGAGTCTTTTAATTCGTTTGGAGTTAGGTGTTGTTGGGCCTTTCTTGTCTGACGAGCATCTTTATAACGTTATTGTTACTGCTCATGCTTTTATCATAATCTTCTTTATGGTTATGCCTATTTCCATGGGTGGCTTCGGTAATTGGCTAATTCCCCTTATACTAGGTGTAGCTGACATGGCTTTCCCTCGTATAAATAATCTTTCTTTCTGACTTTTAGTTCCTTCCTTTACTTTCCTTCTTCTTTCTTCTATTCTTGATTCAGGAGCTGGAACAGGGTGGACTGTCTATCCTCCTCTTTCTGATTCTAAGTATCATTCTGGTATCTCAGTTGATCTGGCCATTTTTAGTCTCCATCTAGCAGGTATTTCTTCTATTCTTGGTAGGATTAATTTTCTTACAACAATCATTTGTTCTCGTACTACTAAGGTTATTTCTCTTGATCGTATGCCTCTTATGCTTTGAGCAATTTCTGTTACGGCTATTCTTCTGATCACCAGATTGCCAGTCTTAGCAGGTGCCATTACAATGCTTTTAACTGATCGAAATCTAAATACCTCTTTCTTTGATCCTGCAGGTGGTGGGAATCCTATTCTTTATCAGCACTTGTTC
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Keratella_cochlearis_55KC10Voels        AACTCTCTATTTTATTTTTGGAATTTGGGCTGGTTTTATCGGCCTGAGTATGAGTCTTCTAATCCGTCTAGAGCTTGGTGTTGTAGGTCCATTTTTATCAGATGAGCACCTTTATAACGTCATTGTAACTGCTCATGCCTTCATTATAATTTTTTTTATAGTTATGCCTATTTCTATAGGTGGTTTTGGTAATTGGCTCATTCCACTTATGTTAGGGGTTGCTGATATGGCTTTCCCTCGTATAAATAATTTGTCATTTTGACTTCTTATTCCTTCTTTTACATTCCTTCTTCTTTCTTCTATTCTAGATTCAGGGGTTGGAACTGGTTGAACTGTTTACCCCCCCCTCTCTGATTCTAAGTACCATTCCGGTATTTCAGTTGATCTTGCTATTTTTAGTCTTCATTTAGCAGGAATTTCTTCTATTCTTGGCAGAATTAATTTTCTTACTACCATTGTTTGTTCTCGTACTACTAAAGTCATTTCCCTTGATCGTATGCCTCTTATACTTTGAGCTATCTCAGTTACTGCTGTCCTTTTGATTACTAGATTGCCTGTTTTGGCTGGTGCTATCACCATGCTCTTAACTGATCGTAATCTTAATACTTCCTTCTTTGATCCTGCTGGTGGGGGTAATCCAGTTCTTTATCAGCATCTTTTC
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Keratella_cochlearis_5KC8Lavaro         TTCCGTGTATTTTGTTTTCGGTAT????GCTGGTTTC?TTGGTCTTAGGAT?AGATTGTTGATTCGTCTCGAG??????????TC?GTCCTTTTTTGGCTGATGAGCACCTCTATAATGTTTTAG?AACAGCTCATGCCTTTATCATGATTTTTTTTATGGTCATGCCTATCTCTATAGGGGGTTTTGGTAACTGGCTTATTCCTCTTATGTTGGGTGTTGCTGATATGGCTTTCCCCCGCATGAATAATCTTTCTTTTTGGTTATTAGTTCCTTCTTTTTCTTTTCTTCTTCTATCCTCTCTGCTGGACTCTGGGGTAGGGACTGGTTGAACTGTTTACCCCCCACTATCCGATTCTAAGTACCATTCTGGTATCTCTGTTGATTTGGCTATTTTTAGTCTTCACTTGGCTGGTATTTCTTCTATTTTAGGTAGAATTAACTTTCTTACAACTATTGTTTGCTCTCGCACTACTAAGAGTATTTCGTTAGATCGTATGCCTCTTATGCTTTGAGCTCTTTCCGTAACTGCTATTTTACTCATTACTAGTTTGCCCGTTCTAGCAGGTGCTATCACTATACTTTTAACTGATCGCAATCTTAATACTTCTTTTTTTGATCCTGCAGGGGGTGGAAATCCTGTCCTCTATCAGCATCTGTTC
Keratella_cochlearis_7KC1Levico         CACTCTTTACTTCATTTTTGGAATTTGAGCTGGTTTTATTGGTCTAAGTATGAGTCTTCTAATTCGCTTAGAACTTGGTGTGGTGGGTCCATTTTTATCTGATGAGCACCTTTATAATGTAATTGTTACTGCTCACGCTTTCATTATAATTTTCTTCATGGTTATGCCTATTTCGATAGGTGGGTTTGGTAATTGGCTTATTCCTCTTATACTAGGAGTTGCTGATATAGCTTTCCCTCGCATGAACAACTTATCTTTTTGGCTTCTAATTCCTTCTTTTACTTTTCTTCTCCTGTCTTCTATCCTTGATTCAGGGGTAGGAACTGGTTGAACTGTTTACCCCCCCCTCTCCGACTCTAAGTATCATTCTGGTATTTCAGTTGACTTAGCTATTTTCAGTCTTCATTTAGCAGGAATTTCTTCCATTCTTGGTAGGATCAATTTTCTTACTACTATCATTTGCTCTCGCACAACT?AGGTTATCTCTCTTGATCGTATGCCTCTAATGCTTTGGGCTATTTCTGTTACTGCTGTTCTTTTAATTACTAGGTTGCCTGTTTTAGCAGGTGCTATTT???TGCTCCTAACTGATCGAAACCTTAATACTTCCTTCTTTG????????????????????????????????????????????
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Keratella_cochlearis_7KC5Levico         CACTCTTTACTTCATTTTTGGAATTTGAGCTGGTTTTATTGGTCTAAGTATGAGTCTTCTAATTCGCTTAGAACTTGGTGTGGTGGGTCCATTTTTATCTGATGAGCACCTTTATAATGTAATTGTTACTGCTCACGCTTTCATTATAATTTTCTTCATGGTCATGCCTATTTCGATGGGTGGGTTTGGTAATTGGCTTATTCCTCTTATACTAGGAGTTGCTGATATAGCTTTCCCTCGCATGAACAACTTATCTTTTTGGCTTCTAATTCCTTCTTTTACTTTTCTTCTCCTGTCTTCTATCCTTGATTCAGGGGTAGGAACTGGTTGAACTGTTTACCCCCCTCTCTCCGACTCTAAGTATCATTCTGGTATTTCAGTTGACTTAGCTATTTTCAGTCTTCATTTAGCAGGAATTTCTTCCATTCTTGGTAGGATTAATTTTCTTACTACTATCGTTTGCTCTCGCACAACT?AGGTTATCTCTCTTGATCGTATGCCTCTAATGCTTTGGGCTATCTCTGTTACTGCTGTTCTTTTGATTACTAGGTTGCCTGTTTTAGCAGGTGCTATT?CAATGCTCCTAACTGATCGAAACCTTAATACTTCCTTCTTCGATCCTGCTGGTGGTGGTAATCCAGTTCTTTATCAGCATCTTTTT
Keratella_cochlearis_7KC6Levico         TTCCTTGTATTTTGTTTTCGGTATTTGAGCTGGTTTCATCGGTCTTAGAATAAGATTGTTGATTCGTCTTGAGTTGGGTGTAGTCGGTCCTTTTTTGGCTGATGAGCACCTTTATAATGTTTTAGTAACAGCTCATGCTTTCATTATGATTTTTTTTATGGTCATGCCTATCTCTATAGGAGGTTTTGGTAATTGGCTTATTCCTCTTATGTTGGGTGTTGCTGATATGGCTTTCCCCCGCATGAATAATCTTTCTTTCTGGTTATTAGTCCCTTCTTTTTCTTTTCTTCTTCTTTCTTCTCTGCTGGACTCTGGTGTAGGGACTGGTTGAACTGTTTACCCCCCACTATCTGATTCTAAGTACCATTCTGGTATTTCTGTTGATTTGGCTATTTTTAGTCTTCACTTAGCTGGTATCTCTTCTATTTTAGGTAGAATTAACTTTCTTACTACTATCGTTTGCTCTCGCACTACTAAGAGTATTTCATTAGATCGTATGCCTCTTATGCTTTGAGCTCTTTCCGTAACTGCTATTTTACTCATTACTAGTTTGCCCGTTCTGGCAGGTGCTATTACTATGCTTTTAACTGATCGTAATCTTAATACTTCTTTTTTTGATCCTGCAGGGGGTGGAAATCCTGTCCTTTATCAGCATCTGTTC
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Keratella_cochlearis_9KC3Raierm         AACCCTCTATTTTATTTTTGGAATTTGGGCTGGTTTTATCGGCCTGAGTATGAGTCTCCTAATCCGTCTAGAGCTTGGTGTTGTAGGCCCATTTTTATCAGATGAGCACCTTTATAACGTCATTGTAACTGCTCATGCCTTCATTATAATTTTTTTTATAGTTATGCCTATTTCTATAGGTGGTTTTGGTAATTGACTCATTCCACTTATGTTAGGGGTTGCTGATATGGCTTTCCCTCGTATAAATAATTTGTCATTTTGACTTCTTATTCCTTCTTTTACATTCCTTCTTCTTTCTTCTATTCTAGATTCAGGGGTTGGAACTGGTTGAACTGTTTACCCCCCCCTCTCTGATTCTAAGTACCATTCCGGTATTTCAGTTGATCTTGCTATTTTTAGTCTTCATTTAGCAGGAATTTCTTCTATTCTTGGCAGAATTAATTTTCTTACTACCATTGTTTGTTCTCGTACTACTAAAGTCATTTCCCTTGATCGTATGCCTCTTATACTTTGAGCTATCTCAGTTACTGCTGTCCTTTTGATTACTAGATTGCCTGTTTTGGCTGGTGCTATCACCATGCTCTTAACTGATCGTAATCTTAATACTTCCTTCTTTGATCCTGCTGGTGGGGGTAATCCAGTTCTTTATCAGCATCTTTTC
Keratella_cochlearis_9KC5Raierm         TTCTTTGTATTTTATTTTCGGTATTTGGGCTGGGTTTATCGGTCTTAGTATGAGTTTGCTTATTCGTCTTGAGTTGGGTGTTGTAGGTCCTTTCTTGTCAGATGAGCATCTTTATAATGTCTTAGTCACTGCTCATGCTTTTATTATGATTTTTTTTATGGTTATGCCTATTTCTATAGGAGGTTTTGGTAATTGGTTAATTCCTTTAATGCTTGGTGTTGCAGATATGGCTTTCCCTCGTATGAACAACCTTTCTTTTTGACTGCTTATTCCTTCTTTCTCTTTTTTGCTTCTTTCTTCCTTGCTAGATTCTGGTGTTGGTACTGGTTGAACGGTTTATCCTCCTTTGTCAGACTCTAAGTATCATTCAGGTATTTCCGTTGATTTAGCTATTTTTAGTCTTCATCTGGCTGGTATCTCTTCTATTTTGGGTAGGATTAACTTTCTTACTACTATCGTTTGCTGCCGTACAACAAAGGCTATTTCTTTGGATCGTATGCCTCTCATGCTGTGGGCTCTTTCTGTTACCGCTGTCTTGCTTATTACAAGGCTTCCTGTTCTAGCTGGGGCTATTACTATGCTTCTAACTGATCGTAACTTAAACACTTCTTTTTTCGACCCTGCAGGAGGTGGTAATCCTGTTTTATACCAACATCTATT?
;
END;

BEGIN CHARACTERS;
[! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M18429]

	TITLE Testudinella_spp_haplotype_alignment;
	LINK TAXA = Taxa7;
	DIMENSIONS NCHAR=661;
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MATRIX
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Pleuretra_lineata_MO17PC4          ????TTATATTTTATTATTGGAATTTGATCTGGATTTTTAGGGGCTAGAATTAGTTTAATTATTCGTACTGAATTAGGGATAGTTGGTAGAATTATTATAGATGAGCAAATTTATAATTCTATGGTAACGGCTCATGCTTTTTTGATGATTTTTTTTTTTGTTATACCTGTAGCTGTTGGAGGTTTTGGGAATTGATTATTACCTTTAATAATAAATGTTATGGATATAGCTTTTCCTCGTTTGAATAATTTAAGATTTTGGTTAGTGCCTGTTGCATTATTGTTTATAATTATAAGTTTATTAGTAGGTTTAGGTGCAGGAACTGGTTGAACAGTTTATCCTCCTTTATCTAATTCTATTTATCATTTTGGTGGTTCTGTTGATTTGGCTATTTTTAGTTTACATGTAGCTGGTGTGTCTTCAATTTTAGGAGGAATTAATTTTATTACTACTTGTTTAAAAGGTAAGATTAGTTATGTTTTATCTTTAGAGTTTTTAAATTTATTTGTCTGAGC?TTAATTGTTAC?AG?TTCTTATTAGT?TTAAGTTTACCTGTT??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Pleuretra_lineata_MO17PC7          ????TTATATTTTATTATTGGAATTTGATCTGGATTTTTAGGTGCTAGAATTAGTTTAATTATTCGTACTGAATTAGGGATAGTTGGTAGAATTATTATAGATGAGCAAATTTATAATTCTATGGTAACGGCTCATGCTTTTTTGATGATTTTTTTTTTTGTTATACCTGTAGCTGTTGGAGGTTTTGGGAATTGATTATTACCTTTAATAATAAATGTTATGGATATAGCTTTTCCTCGTTTGAATAATTTAAGATTTTGGTTAGTGCCTGTTGCATTATTGTTTATAATTATAAGTTTATTAGTAGGTTTAGGTGCAGGAACTGGTTGAACAGTTTATCCTCCTTTATCTAATTCTATTTATCATTTTGGTGGTTCTGTTGATTTGGCTATTTTTAGTTTACATGTAGCTGGTGTGTCTTCAATTTTAGGAGGAATTAATTTTATTACTACTTGTTTAAAAGGTAAGATTAGTTATGTTTTATCTTTAGAGTTTTTAAATTTATTTGTTTGAGCCTTAATTGTTAC?AGATT?TTATTAGTTTTAAGTTTACCTGTTTTGGCTGGTGGAATTACAATAT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Pleuretra_lineata_MO17PL14COI      ????TTATATTTTATTATTGGAATTTGATCTGGATTTTTAGGTGCTAGAATTAGTTTAATTATTCGTACTGAATTAGGGATAGTTGGTAGAATTATTATAGATGAGCAAATTTATAATTCTATGGTAACGGCTCATGCTTTTTTGAAGATTTTTTTTTTTGTTATACCTGTAGCTGTTGGAGGTTTTGGGAATTGATTATTACCTTTAATAATAAATGTTATGGATATAGCTTTTCCTCGTTTGAATAATTTAAGATTTTGGTTAGTGCCTGTTGCATTATTGTTTATAATTATAAGTTTATTAGTAGGTTTAGGTGCAGGAACTGGTTGAACAGTTTATCCTCCTTTATCTAATTCTATTTATCATTTTGGTGGTTCTGTTGATTTGGCTATTTTTAGTTTACATGTAGCTGGTGTGTCTTCAATTTTAGGAGGAATTAATTTTATTACTACTTGTTTAAAAGGTAAGATTAGTTATGTTTTATCTTTAGAGTTTTTAAATTTATTTGTCTGAGCTTTAATTGTTA??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
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Pleuretra_lineata_S91PLP           ????????????????????????TTGATCTGGCTTTTTGGG?GCGAGAATTAGGTTAATTATTCGTACTGAATTAGGTATGGTAGGTAGGATTATTATAGATGAACAAATTTATAATTCAATAGTAACCGCTCATGCCTTTTTAATAATTTTTTTTTTTGTAATACCCGTAGCTGTAGGTGGATTTGGTAATTGATTACTACCATTGATAATAAATGTTATAGATATGGCTTTTCCTCGTTTAAATAATTTAAGTTTTTGATTAGTGCCTGTTGCTTTATTATTTATAATTATAAGATTGTTGGTAGGTTTAGGTGCGGGGACAGGTTGAACTGTTTATCCTCCTTTATCAAATTCTATTTATCATTTTGGAGGTTCTGTTGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATGTAGCTGGTGTATCTTCTATTTTAGGGGGGATTAATTTTATTACAACTTGTTTAAAAGGGAAAATTAGGTATATTTTATCTTTAGAATTTTTAAATTTATTTGTCT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
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Ascomorpha_ecaudis_113AE2Tovela15m     AACCTTATACTTTCTTTTTGGCTTGTGAGCAGGGATAATTGGTTTAAGCTTAAGCTTTATTATTCGCCTAGAATTAGGAACAATTGGCTCCTACCTAGGGGATGAGCATCTCTACAATGTTGTTGTTACAGCCCATGCATTCATTATGATTTTTTTCATAGTTATGCCTATTTCGATAGGAGGGTTTGGTAATTGGCTTCTTCCACTGCTTCTTGGGACAGCAGATATGGCTTTTCCCCGCCTCAATAATTTATCATTTTGACTCCTAATTCCATCTTTTATGCTATTGCTTTTATCTTCTATTTTAGATGCTGGCGTTGGAACTGGGTGGACCGTCTACCCCCCCCTGTCAGATTTAAAATTTCATAGAGGTATTTCCGTAGATCTTGCAGTTTTTAGACTGCACATTGCAGGTGTGTCTTCAATTTTAGGGAGAATAAACTTCTTAACTACTATTATTAGCTGCCGTAGGGCAAAACTTTACTCCCTAGATCGCCTCCCTCTTATAGTATGAGCCCTGATAATTACTGCATTCCTACTAATTACTAGTCTGCCAGTTTTGGCTGGAGCTATTACTATGCTGCTTACAGATCGCAATTTCAACACCTCTTTTTTTGAC??????????????????????????????????????????
Ascomorpha_ecaudis_113AE4Tovela15m     AACCTTATACTTTCTTTTTGGCTTGTGAGCAGGGATAATTGGTTTAAGCTTAAGCTTTATTATTCGCCTAGAATTAGGAACAATTGGCTCCTACCTAGGGGATGAGCATCTCTACAATGTTGTTGTTACAGCCCATGCATTCATTATGATTTTTTTCATAGTTATGCCTATTTCGATAGGAGGGTTTGGTAATTGGCTTCTTCCACTGCT?CTTGGGACAGCAGATA?GGCTTTTCCCCGCCTCAATAATTTATCATTTTGACTCCTAATTCCATC?TTTATGCTATTGCTTTTATCTT?TATTTTAGATGCTGGCGTTGGAACTGGGTGGACCGTCTACCCCCCCCTGTCAGATTTAAAATTTCATAGAGGTATTTCCGTAGATCTTGCAATTTTTAGACTGCACATTGCAGGTG?GTCTTCAATTTTAGGGAGAATAAACTTCTTAACTACTATTATTAGCTGCCGTAGGGCAAAACTTTACTCCCTAGATCGCCTCCCTCTTATAGTATGAGCCCTGATAATTACTGCATTCCTACTAATTACTAGTCTGCCAGTTTTGGCTGGAGCTATTACTATGCTGCTTACAGATCGCAATTTCAACACCTCTTTTTTTGAC??????????????????????????????????????????
Ascomorpha_ecaudis_127AE1ColBricon     AACCTTATACTTTCTTTTTGGCTTGTGAGCAGGAATAATTGGTTTAAGCTTAAGCTTTATTATTCGCCTAGAATTAGGAACAATTGGCTCCTACCTAGGGGATGAGCATCTCTACAATGTTGTTGTTACAGCCCATGCATTCATTATGATTTTTTTCATAGTTATGCCTATTTCGATAGGAGGGTTTGGTAATTGGCTTCTTCCACTGCTTCTTGGGACAGCAGATATGGCTTTCCCCCGCCTTAATAACTTATCATTTTGACTCCTAATTCCATCTTTTATGTTGTTGCTTTTATCTTCTATTTTAGATGCGGG?GTCGGAACTGGGTGG?CC??C??CCCCCCCC??TC??ATTTAAAATTT?A?AGAGGTATTTCCGTAGATCTTGCAATTTTTAGACTGCACATTGCAGGCGTGTCTTCTATTTTAGGGAGAATAAACTTCTTAACTACTATTATTAGCTGCCGTAGGGCAAAACTTTACTCCCTAGA?C?CCT?CCTCTTATAGTATGAGCCCTGATAATTACTGCATTCCTACTAATTACTAGCCTGCCAGTTTTGGC?GG?GCTATTACT?TGCTGCTTACAGATCGCAATTTCAACACCTCTTTTTTTGACCC????????????????????????????????????????
Ascomorpha_ecaudis_176AE1Terlago       TACTTTATATTTTATTTTTGGTGTATGAGCTGGGTTTGTAGGACTTAGAATAAGACTTTTAATCCGATTAGAGTTAGGAGTAGTTGGATCTTTTTTAGGGGATGAGCATTTATATAATGTCATTGTTACAGCTCATGCTTTTGTGATAATTTTTTTTATAACTATGCCTATTTCAATAGGAGGATTTGGTAACTGGTTAATTCCTTTGATATTAGGTGTTGCTGATATAGCTTTTCCTCGTATAAACAATCTTTCTTTTTGATTTTTAATTCCTTCATTTTTATTCCTCTTATTATCTTCTATTTTAGATGCAGGAGTTGGAACTGGATGAACTGTATACCCTCCTCTTTCTGATTCAAAATATCATAGAGGTATTTCTGTTGATTTAGCTATTTTTAGCCTTCATGTAGCTGGTGTTTCTTCAATTCTTGGTAGAATTAATTTTCTTACTACTATTTTATGTTCTCGAACAACAAGGTTAATTTCTTTAGATCGTATGCCTTTAATAATTTGAGCTCTTGCAGTAACTAGAGTTTTATTAATTACTAGATTACCAGTATTGGCTGGTGCTATCA?TATGCTGTTAACTGATCGAAATTTTAATACTTCTTTTTTTG????????????????????????????????????????????
Ascomorpha_ecaudis_176AE4Terlago       TACTTTATATTTTATTTTTGGTGTATGAGCTGGGTTTGTAGGACTTAGAATAAGACTTTTAATCCGATTAGAGTTAGGAGTAGTTGGATCTTTTTTAGGGGATGAGCATTTATATAATGTCATTGTTACAGCTCATGCTTTTGTGATAATTTTTTTTATAACTATGCCTATTTCAATAGGAGGATTTGGTAACTGGCTAATTCCTTTGATACTAGGTGTTGCTGATATAGCTTTTCCTCGTATAAACAATCTTTCTTTTTGATTTTTAATTCCTTCATTTTTATTTCTCTTATTATCTTCTATTTTAGATGCAGGAGTTGGAACTGGATGAACTGTATACCCTCCTCTTTCTGATTCAAAATATCATAGAGGTGTTTCTGTTGATTTAGCTATTTTTAGCCTTCATGTAGCTGGTGTTTCTTCAATTCTTGGTAGAATCAATTTTCTTACTACTATTTTATGTTCTCGAACAACAAGGTTAATTTCTTTAGATCGTATGCCTTTAATAATTTGAGCTCTTGCAGTAACTAGAGTTTTATTAATTACTAGATTACCAGTATTGGCTGGTGCTAT?A?T?TGC??TTAACTGATCGAAATTTTAATACTTCTTTTTTTGATC?????????????????????????????????????????
Ascomorpha_ecaudis_4AE9Roncone         AACCTTGTATTTTCTTTTTGGCTTATGGGCAGGGATAATTGGTTTAAGCTTAAGCTTTATTATTCGCCTAGAATTAGGAACAATTGGCTCCTACCTAGGGGATGAGCATCTCTACAATGTTGTTGTTACAGCCCATGCATTCATTATGATTTTTTTCATAGTTATGCCTATTTCGATAGGAGGGTTTGGTAATTGGCTTCTTCCACTGCTTCTTGGGACAGCAGATATGGCTTTCCCTCGCCTTAATAATTTATCATTTTGACTCCTAATCCCATCTTTTATGATATTGCTTTTATCTTCTATTTTAGATGCTGGCGTCGGAACTGGGTGAACCGTCTACCCTCCATTGTCAGATTTAAAATTTCATAGGGGTATCTCCGTTGATCTTGCAATTTTTAGACTGCACATTGCAGGCGTGTCTTCTATTTTAGGGAGAATAAACTTCTTAACTACTATTATTAGCTGCCGTAGGGCAAAACTTTACTCCCTAGATCGCCTCCCTCTTATAGTATGGGCCCTGATAATTACTGCGTTCCTACTAGTCACTAGTCTGCCAGTTTTGGCTGGGGCTATTACTATGTTGCTTACAGATCGCAATTTTAATACCTCTTTTTTTGA???????????????????????????????????????????
Ascomorpha_ecaudis_71AE1Reier          AACCTTATACTTTCTTTTTGGCTTGTGAGCAGGGATAATTGGTTTAAGCTTAAGCTTTATTATTCGCCTAGAATTAGGAACAATCGGCTCCTACCTAGGGGATGAGCATCTCTACAATGTTGTTGTTACAGCCCATGCATTCATTATGATTTTTTTCATAGTTATGCCTATTTCGATAGGAGGGTTTGGTAATTGGCTTCTTCCACTGCTTCTTGGGACAGCAGATATGGCTTTCCCCCGCCTTAATAATTTATCATTTTGACTCCTAATTCCATCTTTTATGTTGTTGCTTTTATCTTCTATTTTAGATGCTGGCGTCGGAACTGGGTGGACCGTCTACCCCCCCTTGTCAGATTTAAAATTTCATAGAGGTATTTCCGTAGATCTTGCAATTTTTAGACTGCACATTGCAGGCGTGTCTTCAATTTTAGGGAGAATAAACTTCTTAACTACTATTATTAGCTGCCGTAGGGCAAAACTTTACTCCCTAGATCGCCTCCCTCTTATAGTATGAGCCCTGATAATTACTGCATTCCTACTAATTACTAGTCTGCCAGTTTTGGCTGGAGCTATTACTTTGCTGCTTACAGATCGCAATTTCAACACCTCTTTTTTTGACC?????????????????????????????????????????
Ascomorpha_ovalis_182AO1Tenno          TACGTTGTACTTTGTTTTTGGAAT?TGAGCTGGTTTTGTAGGTCTTAGTATAAGACTTTTAATTCGTCTTGAGCTTGGGGTTGTAGGATCTTTCTTAGGTGACGAGCATCTATATAATGTTATTGTTACTGCTCATGC?TTTGTAATAATTTTTTTTATGACTATGCCTATTTCAATGGGTGGATTTGGTAACTGATTAATTCCTTTAATGCTTGGTGTTGCT?ATATGGCTTTTCCAC??A?AAATAACCTTTCTTTTTGATTTCTTATTCCTTC?TTTTTATT?CTTTTGCTTT?TTCTATTCTAGATGCTGGGGTTGGT?CAGGTTG??CTGTTTATCCTCCT?TATCTGATTCAAAGTATCATAGAGGAATCTCTGTAGATTTGGCTATTTTTAGTCTTCATGTTGCTGGTGTTTCTTCAATTTTAGGTAGAATTAATTTTTTAACTACTATTTTATGTTCTCGAACTACTAAACTAATTTCTATAGATCGAATGCCTCTTATAATTTGAGCTCTTGGAGTAAC?AGGGTTCTTTTAATTACTAGCTTACCCGTCT?AGCAGGTGCTATTA???T?C???TTACTGATC?TAATTTTAA?AC?TCTTTCTTTGAT??????????????????????????????????????????
Ascomorpha_ovalis_182AO3Tenno          TACTCTATATTTCATTTTTGGTGTTTGAGCTGGGTTCGTTGGTCTTAGGATGAGACTTCTTATTCGTCTTGAGCTAGGTGTTGTTGGTCCCTTTTTAGGTGACGAGCATCTCTATAATGTGATTGTTACTGCTCATGCTTTTGTTATGATTTTCTTTATGACAATACCTATTTCAATGGGTGGCTTTGGTAACTGGTTAATTCCCCTTATACTTGGAGTAGCCGATATGGCTTTCCCTCGCATGAATAATCTCTCTTTTTGATTTCTTATTCCTTCATTTTTATTTCTACTGTTATCCTCTATTCTTGATGCTGGTGTTGGTACAGGTTGAACTGTTTACCCTCCTCTCTCAGATTCTAAGTATCATAGAGGGGTTTCCGTTGATTTAGCTATTTTTAGACTTCATGTTGCTGGTGTCTCTTCTATTTTAGGTAGGATCAACTTTCTTACTACAATTCTTTGTTCTCGTACAACTAGTTTAATCTCTCTAGACCGTATACCTCTAATGATTTGGGCTCTAGCTGTAACAAGGGTTCTTCTTATTACTAGGTTGCCGGTTCTTGCAGGGGCAATTA?T?TGC?TCTTACTGATCGTAATTTTAA?ACTTCTTTCTTTGAT??????????????????????????????????????????
Ascomorpha_ovalis_185AO3Lases          TACTTTATATTTCATTTTTGGTGTTTGAGCTGGGTTTGTTGGTCTTAGGATGAGACTTCTTATTCGTCTTGAGTTAGGTGTTGTTGGTCCCTTTTTAGGTGATGAACATCTCTATAATGTGATTGTTACTGCTCATGCTTTTGTTATGATTTTCTTTATGACAATACCTATTTCAATGGGTGGCTTTGGTAACTGGTTAATTCCCCTAATACTTGGAGTAGCCGATATGGCTTTCCCTCGTATGAATAATCTTTCTTTTTGATTTCTTATTCCTTCATTTTTATTTCTACTGTTATCCTCTATTCTTGATGCTGGTGTCGGTACAGGTTGAACTGTTTACCCTCCTCTCTCAGATTCTAAGTATCATAGAGGGGTTTCCGTTGATTTAGCTATTTTTAGACTTCATGTTGCTGGTGTCTCTTCTATTTTAGGTAGGATCAACTTTCTTACTACAATTCTTTGTTCTCGTACAACTAGCTTAATCTCTCTAGACCGTACACCTCTAATGATTTGGGCTCTAGCTGTAACAAGGGTTCTTCTTATTACTAGGTTGCCAGTTCTTGCAGGGGCAATTA?T?TGCT??TTACTGATCGTAATTTTAATACTTCTTTCTTTGA???????????????????????????????????????????
Ascomorpha_ovalis_185AO4Lases          TACTTTATATTTCATTTTTGGTGTTTGAGCTGGGTTTGTTGGTCTTAGGATGAGACTTCTTATTCGTCTTGAGTTAGGTGTTGTTGGTCCCTTTTTAGGTGATGAACATCTCTATAATGTGATTGTTACTGCTCATGCTTTTGTTATGATTTTCTTTATGACAATACCTATTTCAATGGGTGGCTTTGGTAACTGGTTAATTCCCCTAATACTTGGAGTAGCCGATATGGCTTTCCCTCGTATGAATAATCTTTCTTTTTGATTTCTTATTCCTTCATTTTTATTTCTACTGTTATCCTCTATTCTTGATGCTGGTGTCGGTACAGGTTGAACTGTTTACCCTCCTCTCTCAGATTCTAAGTATCATAGAGGGGTTTCCGTTGATTTAGCTATTTTTAGACTTCATGTTGCTGGTGTCTCTTCTATTTTAGGTAGGATCAACTTTCTTACTACAATTCTTTGTTCTCGTACAACTAGTTTAATCTCTCTAGACCGTACACCTCTAATGATTTGGGCTCTAGCTGTAACAAGGGTTCTTCTTATTACTAGGTTGCCAGTTCTTGCAGGGGCAATTACTATGCTTCTTACTGATCGTAATTTTAATACTTCTTTCTTTGAT??????????????????????????????????????????
Ascomorpha_ovalis_185AO5Lases          TACTTTATATTTTATTTTTGGTGTATGAGCTGGGTTTGTAGGACTTAGAATAAGACTTTTAATCCGATTAGAGTTAGGAGTAGTTGGATCTTTTTTAGGGGATGAGCATTTATATAATGTCATTGTTACAGCTCATGCTTTTGTGATAATTTTTTTTATAACTATGCCTATTTCAATAGGAGGATTTGGTAACTGGCTAATTCCTTTGATACTAGGTGTTGCTGATATAGCTTTTCCTCGTATAAACAATCTTTCTTTTTGATTTTTAATTCCTTCATTTTTATTTCTCTTATTATCTTCTATTTTAGATGCAGGAGTTGGAACTGGATGAACTGTATACCCTCCTCTTTCTGATTCAAAATATCATAGAGGTGTTTCTGTTGATTTAGCTATTTTTAGCCTTCATGTAGCTGGTGTTTCTTCAATTCTTGGTAGAATCAATTTTCTTACTACTATTTTATGTTCTCGAACAACAAGGTTAATTTCTTTAGATCGTATGCCTTTAATAATTTGAGCTCTTCCCGTAACTAGAGTT?TATTAATTACTAGATTACCAGTATTGGCTGGTGCTATCACTATGCT??TAACTGATCGAAATTTTAATACTTCTTTTTTTGAT??????????????????????????????????????????
Ascomorpha_ovalis_185AO8Lases          TACGCTCTATTTTATTTTTGGTATCTGAGCTGGTTTCGTTGGTCTTAGAATAAGGCTTTTAATTCGTATGGAGCTAGGTGTTGTTGGGGCTTTCCTTGGTGACGAGCATCTCTACAATGTCTTAGTGACTGCCCACGCTTTTGTAATGATTTTCTTCATGACTATGCCTATTTCTATAGGTGGCTTTGGAAACTGACTAATTCCTCTTATGCTAGGTGTAGCTGATATGGCTTTTCCTCGTATGAACAATCTCTCTTTTTGGTTAATAGTCCCTTCTTTTATGTTTCTTCTGTTGTCAAGAATCCTGGATGCTGGTGTAGGTACAGGTTGAACAGTCTACCCGCCTCTGTCAGATTCAAAGTTCCACTCAGGTATCTCTGTAGATTTAGCCATCTTCAGGCTTCATTTGGCTGGGGTTTCTTCAATTTTAGGAAGAATCAACTTTCTAACTACTATTATTTGCTCACGTACAACTAAATTAGTGTCTTTAGACCGTCTTCCTCTTATACTCTGGGCTCTATCCGTTACTGCTGTTCTTCTAGTGACTAGACTTCCCGTTTTAGCTGGTGCTATCACTATGCTTTTAACAGATCGTAACTTCAACACCTCTTTCTTTGA???????????????????????????????????????????
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Dissotrocha_aculeata_A602DA2                  GACTTTGTATTTTGTTATAGGTGTGTGAGCTGGGTTGTTAGGGGCGAGTATAAGGTTAATTATTCGTACTGAGCTTGGTATAATTGGTAATGTTATTATAGATGAACAGATTTATAATACTATAGTGACAGCTCATGCTTTTTTAATGATTTTTTTTTTTGTTATGCCTGTGACTATAGGGGGGTTTGGAAATTGGTTGTTGCCATTGATAGTTAATGCTGTAGATATAGCTTTTCCTCGTTTGAATAATTTAAGTTTTTGATTAGCTCCGGTTTCTTTGATGTTTATGGCTATGAGAATGTTGGTGAGATTGGGGGCAGGGACTGGTTGGACGGTTTATCCTCCTTTGTCGAATTCTGTGTATCATTTTGGGGGTTCTGTGGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATGTGGCTGGTGTTTCTTCTATTTTAGCGAGAATTAATTTTATTACTACATGTTTGAAAAGAAAAATAAGATATATTATGAGAGTAGAGTTTTTAACTTTGTTTGTTTGAGCTATAATTATTACTAGATTTTTGTTAGTGTTAAGATTGCCTGTTTTAGCTGGGGGTATTACTATATTATTATTAGATCGTAATTTTGGGTCATCTTTTTTTGATCCTAGAGGAGGGGGGAATCCGATTTTA???????????????
Dissotrocha_aculeata_A734DA2                  GACGTTGTATTTTATTATAGGAGTATGGGCTGGGTTGTTAGGGGCTAGTATAAGATTAATTATTTGAACTGAGTTAGGGATAATTGGAAAAGTAATTATAGATGAGC??GTTTATAA?AC??TGATTAC?GCTC??GCTTTTTTAATAA?TTTTTTTTTTGTAATGCCAGTGACTATAGGGGGATTTGGAAATTGATTATTGCCTTTAATAATAAAAGCAGCTGATATGGCATTTCCGCGTTTAAATAATTTAAGGTTTTGGTTAGCTCCTGTGTCATTGATGTTTATAGTAATGAGATTGTTGGTTAGGTTGGGGGCTGGGACCGGGTGAACTGTTTATCC?CCTTTATCAAATTCAGTATATCATTTTGGGGGTTCAGTAGATTTAGCTATTTTTAGATTGCATGTGGCTGGGGTTTCTTCTATTTTAGCGAGAATTAATTTTATTAGAACTTGTTTGAAAGGTAAGATAAGGTATGTGATTAGATTTGAGTTTTTGACTTTATTTGTTTGAGCTATAATCATTACGAGGTTTTTATTGGTTTTAAGGCTGCCTGTGTTAGCGGGTGGAAATACTATACTTTTGTTGGATCGTAATTTTGGGTCGTCGTTTTTTGATCCTAGGGGGGGGGG?AATCCTATTT?????????????????
Dissotrocha_aculeata_A735DA1                  GACGTTGTATTTTATTATAAGAGTATGGGCTGGGTTGTTAGGGGCTAGTATAAGATTAATTATTCGAACTGAGTTAGGGATAATTGGAAAAGTAATTATAGATGAGCAGGTTTATAAAACATTGATT?CCGCTCAAGCTTTTTTAATAATTTTTTTTTTTGTAATGCCAGTGACTATAGGGGGATTTGGAAATTGATTATTGCCTTTAATAATAAA?GCAGCTGATATGGCATTTCCGCGTTTAAACAATTTAAGGTTTTGGTTAGCTCCTGTGTCATTGATGTTTATAGTAATGAGATTGTTGGTTAGGTTGGGGGCTGGGACCGGGTGAACTGTTTATCC?CCTTTATCAAATTCAGTATATCATTTTGGGGGTTCAGTAGATTTAGCTATTTTTAGATTGCATGTGGCTGGGGTTTCTTCTATTTTAGCGAGAATTAATTTTATTAGAACTTGTTTGAAAGGTAAGATAAGGTATGTGATTAGATTTGAGTTTTTGACTTTATTTGT?TGAGCTATAATC?TTACGAGGTTTTTATTGGTTTTAAGGCTGCCTGTGTTAGCGGGTGGAATTACTATACTTTTGTTGGATCGTAATTTTGGGTCGTCGTTTTTTGATCCTAGGGGGGGGGG?AATCCTATT??????????????????
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Dissotrocha_aculeata_DisaculA341DA            ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TTTTTTTTTTGTAATACC?GTGACTATAGGGGGGTTTGGGAATTGATTATTGCCTTTAATAATAAATGCAGCTGACATGGCATTTCCGCGATTAAATAATTTAAGGTTTTGGCTAGCTCCCGTGTCATTGATGTTTATGGCAATAAGA?TGTTGGTTAGGTTAGGGGCTGGGACTGGGTGAACTGTCTACCCACCTTTATCAAATTCGGTATATCATTTTGGGGGTTCGG?AGATTTGGCTATTTTTAGATTACATGTGGCTGGGGTTTCTTCTATTTTAGCCAGAATTAATTTTATTA?GACTTGTTTGAAAGGAAAGATAAGGTATGTGATTAGACA????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
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Rotaria_macrura_A539RM1                                AACTTTATATTTTATTATTGGAGTTTGATCAGGTTTTTTAGGTGCGAGAATTAGATTAATTATTCGTACTGAATTAGGAATAGTGGGGAGAATTATTTTAGATGATCAAATTTATAATTCAATAGTTACTGCACATGCTTTTTTAATGATTTTTTTTTTTGTTATACCTGTTTCTATGGGGGGGTTTGGGAATTGGTTACTTCCTTTAATGATAAATGTAGCAGATATAGCTTTTCCTCGTTTAAATAATCTAAGGTTTTGGTTAGTGCCTGTGTCTTTATTATTTATATCTATGAGTTTATTAGTTGGATTAGGACCAGGGACTGGATGGACTGTCTATCCTCCTTTGTCTAATTCTGTTTATCATTTTGGTGGGTCAATTGATTTAGCAATTTTTAGGTTGCATGTAGCTGGTGTTTCTTCTATTTTAGCTAGAATTAATTTTATTACTACTTGTATAAAGGGAAAAATTAGTTATGTTTTGAGTTTAGAGTATTTGACTTTATTTACATGAGCTATAATTGTTACTAGGTTTTTGTTAGTTTTAAGTTTACCTGTTTTAGCAGGTGGTATTACTATATTATTGTTAGATCGTAATTTTGGTTCTTCTTTTTTTGATCCTAGAGGAGGAGGGAATCCTAT???????????????????
Rotaria_macrura_gi|109892291|gb|DQ656818.1|            ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TTTCGATAGGGGGATTTGGAAACTGGTTATTACCTTTAATAATAAATGTTGCAGATATAGCATTTCCTCGGTTAAATAATTTAAGATTTTGGTTAGTACCCATTTCTTTATTGTTCATGTCAATAAGTTTATTAGTAGGGCTTGGTCCAGGGACTGGTTGGACCGTTTATCCACCTTTATCTAATTCAATTTATCATTTTGGGGG?TCTATTGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATATTGC?GG?GTGTCT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Rotaria_macrura_gi|109892293|gb|DQ656819.1|            ????TTATATTTTGTTGTTGGGGTATGATCAGGATTTTTAGGGGCAAGAATCAGGTTGATTATTCGTACAGAGTTAGGGATAGTAGGAAGTATTATTCTAGATGATCAAATTTATAATTCCATAGTGACTGCGCATGCTTTTCTGATGATTTTTTTTTTTGTAATGCCTGTGTCAATGGGGGGATTTGGGAATTGATTGTTGCCTTTAATAATGAATGTGGCAGATATGGCTTTTCCTCGTTTAAATAATTTAAGGTTTTGATTAGTGCCTATTTCTTTGTTATTTATGTGTATGAGTTTATTAGTTGGTTTAGGTCCCGGGACAGGATGAACGGTATATCCTCCTTTATCAAATTCTATTTATCATTTTGGCGGTTCTATTGATTTAGCTATTTTTAGATTGCATATTGCAGGGGTTTCTTCTATTTTAGCTAGTATTAATTTTATTACTACTTGTATAAAGGGGAAAATTAGTTATGTTATAAGATTAGAATATTTAACGTTATTTACTTGAGCGATGATTGTGACAAGGTTTTTATTAGTTTTAAGTTTACCTGTTTTAGCTGGGGGTATCACTATGTTGCTGTTAGATCGAAATTTTGGGTCTTCTTTTTTTGA?CCTAG?????????????????????????????????????
Rotaria_magnacalcarata_A595RMN1                        AACTTTGTATTTTGTTGTTGGTGTTTGATCTGGGTTTTTAGGAGCTAGAATAAGGTTAATTATTCGTACTGAGTTAGGAATAGTTGGAAGAATTATTATAGACGATCAAATTTATAATTCTATGGTTACAGCTCATGCTTTTTTGATAATTTTTTTTTTTGTTATACCAGTAGCTATAGGAGGTTTTGGAAATTGATTACTACCTTTAATGATGAATGTTATAGATATAGCATTTCCTCGTTTAAATAATTTGAGTTTTTGATTAGTGCCTGTTTCTTTGTTATTTATGAGAATAAGATTATTGGTAGGGTTAGGGCCGGGGACAGGATGAACGGTTTACCCGCCTTTATCTAATTCTGTTTATCATTTTGGAGGGTCAATTGATTTAGCTATTTTTAGATTACATGTAGCGGGTGTTTCATCTATTTTGGCTAGAATTAATTTTATTACTACTTGTATAAAGGGGAAAATTAGTTATGTTATAAGATTTGAGTATTTGACTTTATTTGTTTGAGCTATAATTGTTACTAGATTTTTATTAGTATTAAGTTTACCTGTTTTAGCAGGTGGTATTACGATGTTGTTGTTAGATCGTAATTTTGGTGCTTCTTTTTTTGACCCAAGAGGGGGAGGGAATCCTATT??????????????????
Rotaria_magnacalcarata_A754RR1                         AACTTTGTATTTTGTTGTTGGTGTATGATCTGGGTTTTTGGGAGCCAGAATAAGATTAATTATTCGTACTGAGTTAGGAATAGTCGGTAGAATTATTATAGATGATCAGATTTATAATTCTATGGTTACTGCTCATGCGTTTTTGATAATTTTTTTCTTTGTTATGCCGGTTGCTATGGGAGGTTTTGGTAATTGATTATTGCCTTTGATAATGAATGTGATGGATATAGCATTCCCTCGTTTAAATAATTTAAGATTTTGACTGGTACCTGTTTCTTTGTTATTTATAAGAATAAGATTATTAGTTGGACTGGGTCCGGGGACTGGTTGAACAGTTTACCCTCCTTTATCTAATTCTGTCTATCATTTTGGAGGATCTATTGATTTGGCTATTTTTAGTTTACATGTGGCTGGTGTTTCGTCAATTTTAGCGAGAATTAATTTTATTACTACTTGTATAAAAGGAAAAATCAGGTATGTAATAAGATTTGAGTATTTGACTTTATTTGTTTGAGCAATAATTGTTACTAGATTTTTATTGGTTCTTAGTTTACCTGTTTTAGCAGGTGGGATTACGATACTATTGTTAGATCGTAATTTTGGAGCTTCTTTTTTTGATCCTAGAGGAGGAGGTAATCCTAT?T?????????????????
Rotaria_magnacalcarata_gi|109892301|gb|DQ656823.1|     ????????????????????????????????GGTTCTTGGGAGCCAGAGTCAGGCTAATTATTCGAACAGAGTTAGGAATGGCGGGAAGAGTTATTATAGACGATCAAATTTATAATTCTATGGTAACAGCTCATGCTTTTCTAATAATTTTTTTTTTTGTAATACCAGTAGCGGTAGGGGGATTTGGGAATTGATTATTGCCTTTAATGATAAATGTTATAGATATAGCATTCCCTCGTTTAAATAATTTAAGATTTTGATTAGTGCCTGTGTCTTTAACCTTTATATGTATAAGATTGTTAGTTGGATTAGGCCCAGGGACAGGCTGAACTGTGTATCCTCCTTTGTCTAACTCTGTTTATCATTTTGGGGGCTCTATTGATCTAGCGATTTTCAGGCTGCATATCGCAGGGGTCTCTTCAATTTTAGGGGCAATTAATTTTATTAGAACTTGTATAAAAGGTAAAGTAAGGTTTATATTAAGATTAGAATATTTAACTT?ATTTGTTTGGGCTATAATTGTGCCAAGATTTTTATTAG?GTTGAGTTTACCTG?CTCAGCAGGGGGTATTACAATGT?A?TGCCGGACCGCAATT?CGGTTCATCTTTCTTTGATCC????????????????????????????????????????
Rotaria_magnacalcarata_gi|109892313|gb|DQ656829.1|     ????TTGCATTTTATTGTTGGTGTTTGATCAGGGTTCTTGGGAGCCAGAGTCAGGTTAATTATTCGAACAGAGTTAGGAATGGCGGGAAGAGTTATTATAGATGATCAAATTTATAATTCTATGGTAACAGCTCATGCTTTTCTAATAATTTTTTTTTTTGTAATACCAGTAGCGGTAGGGGGATTTGGGAATTGATTATTGCCTTTAATGATAAATGTTATAGATATAGCATTCCCTCGTTTAAACAATTTAAGATTTTGATTAGTGCCTGTGTCTTTAACCTTTATATGTATAAGATTGTTAGTTGGATTAGGCCCAGGAACAGGCTGAACCGTGTATCCTCCTTTGTCTAACTCTGTTTATCACTTTGGGGGTTCTATTGATCTAGCGATTTTCAGGCTGCATATCGCAGGGGTCTCTTCAATTTTAGGGGCAATTAATTTTATTAGAACTTGTATAAAAGGTAAAGTAAGGTTTATATTAAGATTAGAATATTTAACTTTATTTGTTTGGGCTATAATTGTGACAAGATTTTTATTAGTGTTGAGTTTACCTGTTTCAGCAGGGGGTATTACAATGTCATTGTCGGATCGTAATTTCGGTTCATCTTTCTTTGATCCAAGAGGAGGAGGGAATCCTATTTTGTATCA?CATTTATTT
Rotaria_magnacalcarata_gi|239504945|gb|FJ430108.1|     ????TTGCATTTTATTGTTGGTGTTTGATCTGGATTTCTGGGGGCTAGAGTTAGTTTAATCATTCGAACAGAGTTGGGGATAGCTGGGAGAGTTATTATAGATGATCAAATTTACAATTCTATGGTAACAGCACATGCTTTTTTAATAATTTTTTTCTTTGTGATGCCAGTAGCGGTAGGGGGTTTTGGGAATTGGTTGCTTCCATTAATAATAAATGTTATAGATATAGCGTTCCCTCGTTTAAATAATTTAAGATTTTGATTGGTTCCTGTGTCTTTGGTTTTTATATGTATAAGATTACTAGTTGGGCTAGGTCCAGGGACAGGTTGAACTGTGTATCCTCCTTTGTCTAATTCTGTTTATCATTTTGGGGGCTCTATTGATTTAGCCATTTTTAGACTGCATATTGCAGGGGTTTCTTCAATTTTAGGGGCAATTAATTTTATTACAACTTGTATAAAAGGGAAGGTAAGATTTGCATCAAGATTGGAGTATTTAACTTTATTTGTTTGGGCTATAATTGTGACAAGATTCTTATTGGTATTGAGTTTGCCTGTTCCAGCAGGGGGTATTACAATGTT???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Rotaria_magnacalcarata_gi|239504961|gb|FJ430116.1|     ????TTGCATTTTATTGTTGGTGTTTGATCTGGATTTCTGGGGGCTAGAGTTAGTTTAATCATTCGAACAGAGTTGGGGATAGCTGGGAGAGTTATTATAGATGATCAAATTTACAATTCTATGGTAACAGCACATGCTTTTCTAATAATTTTTTTCTTTGTGATGCCAGTAGCGGTAGGGGGTTTTGGGAATTGGTTGCTTCCATTAATAATAAATGTTATAGATATAGCGTTCCCTCGTTTAAATAATTTAAGATTTTGATTGGTTCCTGTGTCTTTGGCTTTTATATGTATAAGATTATTAGTTGGGCTAGGCCCAGGGACAGGTTGAACCGTGTATCCTCCTTTGTCTAATTCTGTTTATCACTTTGGGGGCTCTATTGATTTAGCCATTTTTAGATTGCATATTGCAGGGGTTTCTTCAATTCTAGGGGCAATTAATTTTATTACAACTTGTATAAAAGGGAAGGTAAGATTTGCATCAAGATTGGAGTATTTAACTTTATTTGTTTGGGCTATAATTGTGACAAGATTCTTATTGGTATTGAGTTTGCCTGTTTCAGCAGGGGGTATCACAACGTTGTCGCTAGATCGTAACTTTGGTTCCTCTTTCTTTGATCCCAGGGGCGGAGGGAACCCAATTTTG???????????????
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Rotaria_neptunia_gi|109892315|gb|DQ656830.1|           ????????????????????????????????GGTTTTTAGGTGCGAGAAT?AGTTTAATTATTCGTACGGAATTGGGAATAGTTGGTAGGGTAATTATGGATGATCAGATTTATAATTCAATAGTAACGGCTCATGCTTTTTTGATGATTTTTTTTTTTGTGATACCGGTGGCGATAGGGGGTTTTGGTAATTGGTTACTTCCTTTAATAATAAATGTTGCGGATATGGCTTTTCCTCGATTGAATAATTTGAGGTTTTGATTGGTCCCTATTTCTTTATTGTTTATGTCGTTGAGTTTATTAGTAGGGCTTGGACCAGGCACTGGTTGGACTGTTTATCCTCCTTTATCTAATTCTGTTTATCATTTTGGAGGCTCAATTGATTTAGCTATTTTTAGATTGCATATTGCTGGGGTTTCTTCTATTTTAGCCAGGATTAATTTTATTACGACTTGTATGAAAGGTAAGATTAGTTATGTGTTGAGATTAGAGTATTTAACTTTATTTA?GTGGGCTATAATTGTAACAAGGTTTTTGTTAGTTTTAAGGTTACCAGTTTTAGCAGGAGGGATTACAATGTTATTGTTAGATCGAAATTTTGGGGCTTCTTTTTTTGATCCTAGAGGAGGAGGGAA?????????????????????????
Rotaria_neptunia_gi|109892317|gb|DQ656831.1|           ????TTATATCTTATTTTAGGAGTATGAGCTGGGTTTTTAGGTGCCAGAATTAGTTTAATTATTCGCACTGAGTTAGGAATGGTTGGCAGGGTTATTATGGATGATCAGATTTATAATTCGATGGTAACGGCTCATGCTTTTTTGATGATTTTTTTTTTTGTGATGCCGGTAGCTATAGGAGGATTTGGTAATTGACTACTCCCTTTGATGATAAATGTTGCTGATATGGCTTTTCCTCGATTGAATAATCTGAGGTTTTGATTAGTCCCTATTTCTTTATTGTTTATGTCTTTGAGTTTATTAGTGGGGTTGGGCCCAGGAACAGGATGAACTGTTTATCCTCCTTTGTCTAATTCTGTTTATCATTTTGGAGGCTCAATTGATTTAGCGATTTTTAGGCTACATATTGCTGGGGTTTCTTCTATTTTAGCTAGAATTAATTTTATTACAACTTGCATGAAAGGAAAGGTTAGTTATGTGTTGAGATTAGAATATTTAACTTTATTTAGGTGAGCTATAATTGTAACTAGGTTTTTGTTGGTTTTAAGGCTGCCAGTTTTAGCAGGTGGTATTACGATGCTGTTATTAGATCGGAATTTTGGGGCTTCTTTTTTTGACCCTAGAGGAGGAGGGAATCCAATTCTTTATCAGCATCTATTT
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Rotaria_neptunoida_A751RRN2                            AACTTCGTATTTTTTGGTTGGTGTGTGATCTGGTTTTTTAGGAGCTAGTGTAAGTTTAATTATTCGTACTGAGTTGGGTATAGTAGGTAGAGTTATTATAGATGATCAAATTTATAATTCTATGGTGACAGCTCATGCTTTTTTGATGATTTTTTTTTTTGTTATACCTGTGGCTATGGGGGGTTTTGGTAATTGATTATTGCCTTTAATGATGAATGTGATGGATATGGCTTTTCCTCGATTGAATAATTTGAGTTTTTGGTTAGTGCCAGTTTCTTTATTATTTATATGTATGAGTTTATTGATTGGGTTGGGACCTGGGACTGGGTGGACTGTGTATCCTCCTTTATCTAATTCTGTTTATCATTTTGGAGGGTCTATTGATGTAGCTATTTTTAGTTTGCATGTAGCTGGTGTGTCTTCAATTTTAGCTAGAATTAATTTTATTACAACATGTATGAAAGGGAAGATCAGGTATGTGATAAGATTAGAATATTTAACTTTGTTTAGGTGGGCAATAGTTGTTACTAGGTTTTTATTAGTGTTAAGATTACCTGTGTTGGCTGGTGGAATTACTATATTATTATTGGATCGTAATTTTGGATCTTCTTTTTTTGATCCGAGAGGTAGGGGAAATC???????????????????????
Rotaria_neptunoida_gi|109892367|gb|DQ656856.1|         ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CTTTTTTGATGATTTTTTTTTTTGTTATACCTGCTGCTATAGGGGGGTTTGGGAATTGGTTATTACCTTTAATAATGAATGTGGCAGATATAGCTTTTCCTCGTTTAAATAATTTAAGGTTTTGGTTGGTACC?GTGTCTTTGTTATTTATGTCTTTAAGTTTGTTGGTTGGTTTAGGGCCTGGGAC?GGTTGGACTGTATATCCTCCTTTATCAAATTCTGTATATCATTTTGGAGGGTCTATTGATTTAGCTATTTTTAGATTACATGTAGCTGGTGTTTCTTCGATTTTAGCTAGAATTAATTTTATTACTACTTGTATAAAAGGGAAAATTAGATATGTGTTAAGGTTGGAGTATTTGACTTTATTTAGATGAGCAATGATTGTTACTAGGTTTTT?TTAGTTTTAAGATTACCTGTTTTAGCTGGTGGTATTACGATGTTATTGTTAGATCGTAATTTT????????????????????????????????????????????????????????????
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Rotaria_rotatoria_A537RR2                              AACTTTGTATTTTGTTATTGGTGTTTGATCTGGGTTTTTAGGAGCTAGGATTAGACTTATTATTCGTACTGAGTTAGGGATGGTAGGTAGAGTTATTATAGATGATCAGATTTATAATTCTATGGTAACGGCGCATGCTTTTTTAATAATTTTCTTTTTTGTTATACCTGTAGCTGTAGGGGGTTTTGGTAATTGATTATTGCCTTTAATAATGAATGTTATGGATATAGCTTTTCCTCGTTTGAATAATTTAAGGTTTTGATTAGTGCCTATTTCTTTGGTGTTTATGTGTATAAGATTGTTGGTCGGATTAGGGCCAGGGACAGGATGAACTGTTTATCCTCCTTTATCAAATTCTGTGTATCATTTTGGAGGTTCTATTGATTTAGCTATTTTTAGGTTACATATTGCAGGGGTGTCTTCGATTTTAGGGTCTATTAATTTTATTACTACTTGTATAAAAGGGAAAATTAGATTTGTTTTAAGATTAGAGTATTTAACATTGTTTGTATGAGCAATGATTGTTACCAGGTTTTTATTAGTATTGAGGTTACCAGTATTAGCTGGAGGGATTACTATATTATTATTAGATCGTAATTTTGGGTCATCTTTTTTTGATCCTAGAGGGGGAGGAATCCTCTT???????????????????
Rotaria_rotatoria_A537RR3                              TACTTTGTATTTTATTATTGGGGTGTGGTCAGGGTTTTTGGGAGCTAGGATTAGTTTGATTATTCGTACGGAGTTAGGGATAGTTGGTAGGGTTGTGATAGATGATCAAATTTATAATTCAATGGTTACTGCACATGCTTTTTTAATAATTTTTTTTTTTGTAATGCCGGTGGCGGTAGGAGGGTTTGGTAATTGGTTACTACCTTTAATGATGAATGTTAGGGATATAGCTTTTCCTCGTTTAAATAATTTGAGATTTTGGTTGGTCCCTGTTTCTTTATTATTTATGTGTATAAGTTTGTTGGTTGGGTTAGGTCCAGGTACGGGTTGAACAGTTTATCCTCCTTTATCAAATTCTGTTTATCATTTTGGAGGATCAATTGATTTAGCTATTTTTAGGTTACATATTGCTGGGGTTTCTTCTATTTTAGGAGGGATTAATTTTATTACGACTTGTATAAAAGGTAAAATTAGGTTTGTTATGAGGTTAGAGTATTTGACTTTATTTATTTGAGCAATGATTGTAACTAGTTTTTTGTTGGTTTTAAGGTTGCCTGTGTTGGCGGGAGGTATTACTATGTTGTTATTAGATCGTAATTTTGGGTCCTCGTTTTTTGATCCGAGTGGAGGA??????????????????????????????
Rotaria_rotatoria_A539RR3                              AACTTTGCATTTTGTTATTGGAGTGTGGTCTGGGTTTTTAGGAGCGAGAATAAGATTAATTATTCGTACTGAGTTAGGGATGGTAGGAAGTATTATTATAGATGATCAGATTTATAATTCGATGGTAACGGCTCATGCTTTTTTAATGATTTTTTTTTTTGTTATACCAGTAGCAATGGGAGGATTTGGGAATTGATTGTTGCCTTTGATAATAAATGTAATGGATATAGCTTTTCCTCGATTGAATAATTTGAGATTTTGGTTAGTACCTGTTTCTTTGTTATTTATAAGAATAAGGTTATTAGTTGGGTTAGGGCCAGGAACTGGTTGAACTGTGTATCCTCCTTTATCTAATTCTGTATATCATTTTGGTGGGTCTATTGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATGTAGCTGGGGTATCTTCTATTCTAGCAAGGATTAATTTTATTACAACTTGTATGAAAGGGAAAATTAGATATGTAATGAGTTTAGAATATTTGACTTTGTTTGTTTGGGCTATGATTGTCACAAGATTTTTATTAGTTTTAAGATTGCCTGTATTAGCAGGAGGGATTACAATATTATTATTAGATCGTAATTTTGGGGCTTCTTTTTTTGATCCTAGAGG??????????????????????????????????
Rotaria_rotatoria_A539RR5                              AACTTTATATTTTGTTGTTGGTGTGTGATCTGGGTTTTTGGGAGCTAGGATAAGTTTAATTATTCGTACTGAGTTAGGAATAGTTGGCAGGATTATTATAGATGATCAAATTTATAATTCTATGGTAACAGCTCATGCTTTTTTAATAATTTTTTTTTTTGTTATACCTGTGGCTATAGGGGGATTTGGTAATTGGTTATTGCCTTTAATAATGAATGTAATAGATATAGCATTTCCTCGTTTAAATAATTTAAGGTTTTGATTAGTGCCTGTTTCTTTGTTATTTATAAGAATAAGGTTATTAGTGGGGCTAGGTCCTGGGACAGGTTGAACTGTTTATCCTCCATTGTCTAATTCTGTTTATCATTTTGGAGGCTCTATTGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATATTGCGGGTGTTTCTTCTATTTTAGCAAGAATTAATTTTATTACTACTTGTATGAAGGGGAAAATTAGTTATGTAATAAGATTTGAATATTTGACTTTATTTGTTTGAGCTATGATTGTTACTAGGTTTTTATTAGTTTTAAGATTACCTGTTTTAGCTGGAGGTATTACAATATTATTATTAGATCGTAATTTTGGTGCTTCTTTTTTTGATCCTAGAGGAGGA??????????????????????????????
Rotaria_rotatoria_A560RR8                              AACTTTGTATTTTGTTGTTGGTGTATGATCTGGGTTTTTGGGAGCCAGAATAAGATTAATTATTCGTACTGAGTTAGGAATAGTCGGTAGAATTATTATAGATGATCAGATTTATAATTCTATGGTTACTGCTCATGCGTTTTTGATAATTTTTTTCTTTGTTATGCCGGTTGCTATGGGAGGTTTTGGTAATTGATTATTGCCTTTGATAATGAATGTGATGGATATAGCATTCCCTCGTTTAAATAATTTAAGATTTTGACTGGTACCTGTTTCTTTGTTATTTATAAGAATAAGATTATTAGTTGGACTGGGTCCGGGGACTGGTTGAACAGTTTATCCTCCTTTATCTAATTCTGTCTATCATTTTGGAGGATCTATTGATTTGGCTATTTTTAGTTTACATGTGGCTGGTGTTTCGTCAATTTTAGCGAGAATTAATTTTATTACTACTTGTATAAAAGGAAAAATCAGGTATGTAATAAGATTTGAGTATTTGACTTTATTTGTTTGAGCAATAATTGTTACTAGATTTTTATTGGTTCTTAGTTTACCTGTTTTAGCAGGTGGGATTACGATATTATTGTTAGATCGTAATTTTGGAGCTTCTTTTTTTGATCCTAGAGGAGGAGG????????????????????????????
Rotaria_rotatoria_A562RR1                              AACTTTATATTTTATTGTTGGAGTTTGGTCTGGATTTTTGGGGGCTAGAGTTAGTTTAATTATTCGTACTGAGTTAGGTATAATTGGAAGAGTAATTATAGATGATCAAATTTATAATTCTATGGTTACAGCACATGCTTTTTTAATAATTTTTTTTTTTGTTATGCCTGTTGCTGTAGGTGGGTTTGGTAATTGGTTGCTTCCTTTGATGATGAATGTTATGGATATAGCATTTCCTCGTTTAAATAATTTGAGTTTTTGATTAGTTCCTATTTCATTGTTGTTTATATCTATAAGATTATTAGTTGGTTTAGGGCCTGGGACTGGTTGAACAGTTTATCCTCCTTTATCTAATTCTATTTATCATTTTGGGGGCTCTATTGATTTGGCTATTTTTAGATTGCATATTGCTGGTGTCTCATCTATTTTGGGAGGGATTAATTTTATTACTACTTGTATAAAAGGAAAAATTAGGTTTATTATAAGATTAGAATATTTAACATTATTTGTTTGAGCAATAATTGTTACGAGATTTTTGTTAGTTTTAAGACTTCCTGTTTTAGCTGGGGGGATTACTATATTATTATTAGATCGTAATTTTGGTGCATCATTTTTTGATCCTAGAGGTGG???????????????????????????????
Rotaria_rotatoria_A563RR1                              GACTTTATATTTTATTATTGGAGTGTGGTCAGGTTTTTTGGGTGCAAGAATAAGGTTGATTATTCGTACTGAGTTAGGGATAGTTGGGAGTGTAATTATAGATGATCAAATTTATAATTCTATAGTAACTGCTCATGCTTTTCTTATAATTTTTTTTTTTGTAATACCTGTTGCTGTAGGGGGATTTGGTAATTGATTATTACCTTTAATAATAAATGTTATAGATATAGCTTTTCCTCGTTTAAATAATTTAAGGTTTTGATTAGTTCCTATTTCTTTATCTTTTATGTGTTTAAGATTATTGGTAGGACTGGGTGCTGGTACAGGATGAACTGTTTATCCTCCTTTGTCTAATTCTATTTATCATTTTGGCGGCTCAGTTGATTTTGCAATTTTTAGTCTACATATTGCTGGTGTGTCATCTATTTTAGGGGGAATTAATTTTATTACTACTTGTATAAAAGGGAAGATTAGGTTTATTTTAAGTTTAGAGTATTTAACTTTATTTGTTTGGGCTATGATTGTGACTAGATTTTTATTGGTTTTAAGATTACCTGTGTTAGCTGGGGGAATTACTATGCTTTTATTAGATCGTAATTTTGGGTCTTCTTTTTTTGATCCTAGGGGAGGA??????????????????????????????
Rotaria_rotatoria_A566RR6                              TACTTTGTATTTTATTATTGGTGTTTGATCAGGGTTTTTAGGGGCTAGTATCAGATTAATTATTCGTACTGAGCTTGGAATAGTAGGAAGTGTTATTATAGATGAACAGATTTATAATTCAATAGTAACAGCTCATGCTTTTCTTATAATTTTTTTTTTTGTGATGCCTGTTGCTGTGGGTGGTTTCGGGAATTGATTATTACCTTTAATAATAAATGTTATAGATATAGCTTTTCCTCGTTTAAATAATTTAAGATTTTGGTTGGTGCCTATTTCTTTATTATTTATATGTTTAAGATTATTGGTTGGTTTAGGCCCTGGCACTGGGTGAACTGTTTATCCTCCATTATCGAATTCTATTTATCATTTTGGGGGTTCTGTTGATTTAGCAATTTTTAGATTACATATTGCAGGGGTCTCTTCAATTTTAGGGGGTATTAATTTCATTACGACTTGTATAAAAGGAAAGATTAGATTTGTTATAAGTTTAGAATATTTAACTTTATTTACTTGGGCTATAATTGTAACTAGATTTTTATTAGTTTTGAGTTTACCTGTTTTAGCGGGGGGGATTACTATGTTATTGTTAGATCGTAATTTTGGTTCTTCTTTTTTTGATCCTAGTGGAGGA??????????????????????????????
Rotaria_rotatoria_A568RR1                              AACTTTATATTTTGTTATTGGTGTTTGGTCAGGTTTTTTAGGGGCTAGGATTAGCCTTATTATTCGTACTGAATTAGGAATAGTAGGTAGAGTAATTATAGATGATCAGATTTATAATTCAATGGTTACAGCACATGCTTTTTTAATGATTTTTTTTTTTGTTATACCTGTAGCTGTAGGAGGTTTTGGAAATTGGTTACTTCCTTTGATAATAAATGTTATAGATATAGCTTTTCCTCGTTTAAATAATTTAAGATTTTGATTAGTTCCTATTTCATTAGTTTTTATATGTATGAGGTTATTGGTAGGGTTAGGTCCTGGTACAGGGTGAACTGTTTATCCTCCTTTATCTAATTCTGTTTATCATTTTGGAGGGTCTATTGATTTAGCTATTTTTAGGTTGCATATTGCAGGTGTTTCTTCTATTTTAGGGGCTATTAATTTTATTACGACTTGTATGAAAGGGAAAATTAGGTTTGTTTTAAGATTAGAATATTTAACTTTGTTTGTTTGGGCTATGATTGTTACTAGATTTTTATTAGTATTAAGATTACCGGTTTTAGCTGGTGGAATTACTATATTATTATTAGATCGTAATTTTGGTTCTTCTTTTTTTGATCCTAGAGGGGGAGGGAAT????????????????????????
Rotaria_rotatoria_A570RR1                              AACTTTATATTTTGTTCTTGGAGTTTGAGCAGGATTTTTAGGTGCGAGAATAAGTTTAATTATTCGTACTGAATTAGGGATGGTAGGTCAGATTATTATAGATGATCAGATTTATAATTCTATAGTAACAGCGCATGCTTTTTTAATGATTTTTTTTTTTGTAATACCTGTTGCAATAGGGGGGTTTGGTAATTGACTTTTACCGTTAATAATGAATGTTATAGATATAGCTTTTCCTCGATTAAATAATTTAAGTTTTTGATTAGTTCCTATTTCATTACTTTTTATGAGAATAAGATTGTTAGTTGGGTTAGGGCCTGGGACAGGGTGAACTGTATATCCGCCTTTATCAAATTCTGTTTATCATTTTGGGGGTTCAATTGATATGGCTATTTTTAGGTTACATATTGCTGGGGTTTCTTCAATTTTAGCTAGGATTAATTTTATTACGACTTGTATAAAAGGTAAGATTAGGCATGTTTTAAGGTTAGAGTATTTAACTTTATTTGTTTGGGCTATAATTGTAACTAGGTTTTTGTTAGTTTTAAGATTACCTGTATTAGCTGGTGGGATTACTATGTTATTATTAGATCGTAATTTTGGAGCATCTTTTTTTGATCCTAG?????????????????????????????????????
Rotaria_rotatoria_A587RR1                              ???????????TTTGTATTGGTGTATGATCTGGATTTTTAGGTGCGAGAATTAGATTAATTATTCGTACAGAGTTAGGGATGGTAGGTAGAATTATTATAGATGATCAGATTTATAATTCTATAGTTACTGCTCATGCATTTTTAATAATTTTTTTTTTTGTAATGCCTGTAGCCGTAGGGGGGTTTGGGAATTGGTTACTTCCTTTAATGATGAATGTTATAGATATAGCATTTCCTCGTTTGAATAATTTGAGATTTTGATTAGTGCCTATTTCTTTGTTATTTATGTGTATAAGTTTATTGGTTGGATTAGGCCCTGGTACTGGTTGGACAGTTTATCCTCCTTTGTCGAATTCTGTTTATCATTTTGGGGGCTCAATTGATTTAGCTATTTTTAGATTGCATATTGCGGGAGTTTCTTCTATTTTAGGGGCTATTAATTTTATTACTACATGTATAAAAGGGAAAATTAGATTTGTAATGAGTTTAGAATATTTAACTTTATTTACTTGAGCAATGATTGTTACTAGGTTTTTATTAGTTCTAAGTTTGCCTGTTTTAGCAGGTGGTATTACTATATTGTTGTTAGATCGTAATTTTGGGTCTTCTTTTTTTGATCCTAGAGGAGGTGGTAATCCTATTTTATATCAGCATTTATTT
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Rotaria_rotatoria_A602RR2                              ?????????TTTTGTTCTTGGTATTTGAGCGGGTTTTTTAGGGGCTAGAATAAGTTTAATTATTCGCACGGAATTAGGTATAGTTGGTAGAATTATTATAGATGATCAGATTTATAATTCTATAGTTACTGCTCATGCTTTTTTAATAATTTTTTTTTTTGTTATGCCTGTGTCTATAGGCGGTTTTGGAAATTGATTACTACCTTTAATAATAAATGTTATGGATATAGCTTTTCCACGTTTGAATAATTTGAGGTTTTGATTAGTGCCTATTTCTTTGTTGTTTATAAAAATGAGATTATTAGTAGGGTTAGGACCTGGAACGGGTTGAACTGTTTACCCTCCTTTGTCAAATTCTGTTTATCATTTTGGAGGATCTATTGATTTGGCTATTTTTAGATTACATATTGCTGGTGTTTCTTCTATTTTAGGTAGAATTAATTTTATTACAACTTGTATAAAAGGGAAAATTAGTTATGTTTTAAGGTTAGAGTATTTAACTTTGTTTGTGTGAGCTGTAATTGTAACAAGATTTTTGTTAGTGTTAAAATTGCCTGTTTTAGCAGGTGGTATTACGATGTTATTATTGGATCGTAATTTTGGTTCTTCTTTTTTTGATCCTAGAGGAGGAGGTAATCCTGTGTTATACCAGCATTTATTT
Rotaria_rotatoria_A672RR4                              GACATTATATTTTGTTGTAGGAGTTTGATCGGGATTTTTAGGAGCAAGAATAAGATTGATTATTCGTACTGAGTTAGGAATAGTAGGGAGGGTGATTATAGATGATCAAATTTATAATGCAATGGTGACTGCACATGCTTTTTTAATGATTTTTTTTTTTGTGATACCTGTAGCAATAGGTGGTTTTGGGAATTGGTTGTTACCGTTGATAATGAATGTTATGGATATAGCTTTTCCTCGTTTGAATAATTTGAGGTTTTGGCTGGTGCCTATTTCTTTGTCATTTATGAGATTAAGGCTTTTGATTGGGTTAGGTCCTGGGACTGGATGAACTGTGTATCCTCCTTTATCTAATTCTGTTTATCATTTTGGTGGGTCTATTGATGTAGCTATTTTTAGTTTACATATTGCTGGTGTATCTTCTATTTTGGCTAGAATTAATTTTATTACTACATGTATGAAGGGAAAGATTAGTTATGTAATAAGATTAGAGTATTTAACTTTATTCAGATGAGCAATGGTTGTTACTAGTTTTTTATTGGTTTTAAGATTACCGGTTTTAGCTGGGGGTATTACAATATTATTATTAGATCGTAATTTTGGCTCTTCTTTTTTTGATCCAAGAGGAGGGGG?AATCCAATT??????????????????
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Rotaria_rotatoria_A691RR5                              GACTTTGTATTTTATTATTGGGGTATGATCTGGGTTTTTAGGTGCAAGAATAAGGTTAATTATTCGTACTGAATTAGGTATAGTAGGTAGTGTTATTATAGATGATCAAATTTATAATTCTATAGTAACTGCTCATGCTTTTTTAATAATTTTTTTTTTTGTAATGCCTGTTGCTGTAGGAGGGTTTGGTAATTGACTTTTACCTTTAATAATAAATGTAATAGATATAGCTTTTCCTCGGTTAAATAATTTGAGGTTTTGATTAGTTCCTATTTCTTTATTATTTATGTGTATAAGATTATTAGTAGGGTTAGGGGCTGGGACTGGTTGGACAGTATACCCTCCTTTGTCTAATTCTGTGTATCATTTTGGTGGGTCAGTTGATTTAGCTATTTTTAGCCTTCATATTGCAGGTGTGTCTTCTATTTTAGGGGGGATTAATTTTATTACTACTTGTATAAAAGGTAAAATTAGTTTTATTTTAAGGTTAGAATATTTGACTTTATTTGTTTGGGCTATAATTGTTACTAGATTTTTATTAGTTTTAAGTTTACCGGTATTAGCTGGAGGAATTACTATGCTTTTATTAGATCGTAATTTTGGTTCTTCTTTTTTTGATCCTAGAGGAGGAGGTAATCCTAT?TT????????????????
Rotaria_rotatoria_A692RR5                              ??????TATATTTTGTTCTTGAGTTTGAGCAGGTTTTTTAGGCGCGAGAATAAGCTTAATTATTCGTTCCGAGTTAGGGATAGTGGGTCAGATTATTATAGATGATCAAATTTATAATTCTATGGTAACAGCTCATGCTTTCCTGATAATTTTTTTTTTTGTTATGCCGGTTGCTATAGGAGGATTTGGTAATTGACTTTTACCTTTGATAATAAATGTTATAGATATAGCTTTTCCTCGCTTAAATAATTTGAGTTTTTGATTAGTGCCTATTTCATTACTTTTTATAAGAATAAGATTATTGGTTGGTTTAGGACCGGGGACAGGGTGAACTGTGTACCCCCCTTTATCAAATTCTATCTATCATTTTGGAGGTTCTATTGATATAGCCATTTTTAGATTACATATTGCGGGTGTGTCTTCGATTTTAGGAAGAATTAATTTTATTACAACTTGTATGAAAGGGAAAATTAGCTATGTGTTAAGATTAGAATATTTAACTTTATTTGTTTGGGCTTTGATTGTTACTAGGTTTTTATTAGTTTTAAGATTACCAGTGTTAGCAGGAGGGATTACTATATTATTATTAGATCGTAATTTTGGTGCTTCTTTTTTTGATCCTAGAGGAGGAGGTA??????????????????????????
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Rotaria_rotatoria_A707RR6                              TACTTTATATTTTATTATTGGTGTTTGATCAGGATTTTTAGGAGCGAGTATTAGTTTAATTATTCGTACTGAATTAGGGATAGTAGGGAGTATTATTATGGATGAGCAAATTTATAATTCTATGGTTACAGCTCATGCTTTTTTAATAATTTTTTTTTTTGTTATACCTGTAGCTGTAGGGGGTTTTGGTAATTGATTGTTGCCTTTAATAATAAATGTTATAGATATAGCTTTTCCTCGTTTAAATAATTTGAGATTTTGGTTAGTTCCGATTGCTTTATTATTTATGAGTATAAGATTATTAGTAGGTTTAGGAGTAGGTACTGGTTGAACTGTTTATCCCCCTTTATCTAATTCTATTTATCATTTTGGGGGTTCAGTTGATTTAGCTATTTTTAGGCTTCATGTTGCTGGTGTCTCTTCAATTTTAGGAGGGATTAATTTTATTACTACTTGTTTAAAAGGAAAAATTAGATATATTTTGAGTTTAGAATTTTTAACTTTGTTTGTTTGAGCTATAATTGTTACTAGATTTTTATTAGTTTTAAGTTTACCTGTTTTAGCTGGTGGTATTACTATATTATTATTGGATCGTAATTTTGGATCTTCTTTTTTTGATC?????????????????????????????????????????
Rotaria_rotatoria_A708RR4                              TACTTTATATTTTATTATTGGAGTTTGGTCTGGGTTTTTAGGAGCAAGTATAAGATTAATTATTCGTACTGAGCTAGGAATAGTAGGAAGTGTGATTATAGATGATCAAATTTATAATTCTATAGTTACAGCACATGCTTTTTTAATAATTTTTTTTTTTGTTATGCCTGTCGCTGTTGGGGGATTTGGAAATTGATTATTGCCTTTGATAATAAATGTGATGGATATGGCTTTTCCTCGTTTAAATAATTTGAGTTTTTGGTTAGTTCCTATTTCTTTATTATTTATATGTATAAGTTTATTAGTAGGGTTAGGTGCTGGTACAGGTTGAACTGTTTATCCTCCTTTGTCTAATTCTGTTTATCATTTTGGGGGGTCTGTTGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATATTGCAGGTGTTTCTTCAATTTTAGGAGGTATTAATTTTATTACTACTTGTATGAAAGGTAAAATTAGTTTTGTTTTAAGTTTGGAGTATTTGACTTTATTTGTTTGGGCAATGATTGTTACTAGATTTTTATTGGTTTTAAGTTTACCTGTGTTGGCAGGAGGGATTACTATATTATTATTGGATCGAAATTTTGGTTCTTCTTTTTTTGATCCTAGTGGGGGTGGAAATCCTATT??????????????????
Rotaria_rotatoria_A712RR1                              AACTTTATATTTTGTTGTTGGTGTGTGATCTGGGTTTTTGGGAGCTAGGATAAGTTTAATTATTCGTACTGAGTTAGGAATAGTTGGCAGGATTATTATAGATGATCAAATTTATAATTCTATGGTAACAGCTCATGCTTTTTTAATAATTTTTTTTTTTGTTATACCTGTGGCTATAGGGGGATTTGGTAATTGGTTATTGCCTTTAATAATAAATGTAATAGATATAGCATTTCCTCGTTTAAATAATTTAAGGTTTTGATTAGTGCCTGTTTCTTTGTTATTTATAAGAATAAGGTTATTAGTGGGGTTAGGTCCTGGGACAGGTTGAACTGTTTATCCTCCATTGTCTAATTCTGTTTATCATTTTGGAGGCTCTATTGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATATTGCGGGTGTTTCTTCTATTTTAGCAAGAATTAATTTTATTACTACTTGTATGAAGGGGAAAATTAGTTATGTAATAAGATTTGAATATTTGACTTTATTTGTTTGAGCTATGATTGTTACTAGGTTTTTATTAGTTTTAAGATTACCTGTTTTAGCTGGAGGTATTACAATATTATTATTAGATCGTAATTTTGGTGCTTCTTTTTTTGATCCTAGAGGAGGAGG?AATCCGATTT?????????????????
Rotaria_rotatoria_A713RR1                              GACTTTATATTTTGTTATTGGGGTTTGGGCAGGATTTTTAGGTGCTAGAATTAGTTTAATTATTCGTACTGAGTTAGGGATAGTTGGAAGAATTATTATAGATGATCAGATTTATAATTCTATGGTGACAGCGCATGCATTTCTAATAATTTTTTTTTTTGTTATGCCTGTAGCTGTAGGAGGTTTTGGGAATTGGCTATTGCCTTTAATAATAAATGTTATAGATATAGCTTTTCCTCGTTTGAATAATTTAAGATTTTGGCTAGTTCCTATTTCTTTATTATTTATATGTATAAGTTTATTAGTAGGACTAGGGCCTGGGACGGGATGGACTGTGTATCCTCCATTATCTAATTCAGTTTATCATTTTGGGGGGTCTGTTGATTTAGCTATTTTTAGATTACATATTGCTGGTGTATCTTCTATTTTAGGAAGAATTAATTTTATTACAACTTGTATAAAAGGTAAAATTAGGTTTGCTATAAGTTTAGAATATTTAAGATTATTTACTTGGGCGATAATTGTGACTAGATTTTTATTAGTATTGAGGTTACCTGTTTTAGCAGGGGGGATTACAATACTTCTTTTAGATCGTAATTTTGGGTCTTCTTTTTTTGATCCTAGTGGGGGGGG?AATCCTATTT?????????????????
Rotaria_rotatoria_A713RR2                              GACTTTATATTTTGTTATTGGGGTTTGGGCAGGATTTTTAGGTGCTAGAATTAGTTTAATTATTCGTACTGAGTTAGGGATAGTTGGAAGAATTATTATAGATGATCAGATTTATAATTCTATGGTGACAGCGCATGCATTTCTAATAATTTTTTTTTTTGTTATGCCTGTAGCTGTAGGAGGTTTTGGGAATTGGCTATTGCCTTTAATAATAAATGTTATAGATATAGCTTTTCCTCGTTTGAATAATTTAAGATTTTGGCTAGTTCCTATTTCTTTATTATTTATATGTATAAGTTTATTAGTAGGACTAGGGCCTGGGACGGGATGGACTGTGTATCCTCCATTATCTAATTCAGTTTATCATTTCGGGGGGTCTGTTGATTTAGCTATTTTTAGATTACATATTGCTGGTGTATCTTCTATTTTAGGAAGAATTAATTTTATTACAACTTGTATAAAAGGTAAAATTAGGTTTGCTATAAGTTTAGAATATTTAAGATTATTTACTTGGGCGATAATTGTGACTAGATTTTTATTAGTATTGAGGTTACCTGTTTTAGCAGGGGGGATTACAATACTTCTTTTAGATCGTAATTTTGGGTCTTCTTTTTTTGATCCTAGTGGGGGGGGGA??????????????????????????
Rotaria_rotatoria_A714RR8                              AACTTTATATTTTGTTATTGGTGTTTGGTCAGGTTTTTTAGGGGCTAGGATTAGTCTTATTATTCGTACTGAATTAGGAATAGTAGGTAGAGTAATTATAGATGATCAGATTTATAATTCAATGGTTACAGCACATGCTTTTTTAATGATTTTTTTTTTTGTTATACCTGTAGCTGTAGGAGGTTTTGGAAATTGGTTACTTCCTTTGATAATAAATGTTATAGATATAGCTTTTCCTCGTTTAAATAACTTAAGATTTTGATTAGTTCCTATTTCATTAGTTTTTATATGTATGAGGTTATTGGTAGGGCTAGGTCCTGGTACAGGGTGAACTGTTTATCCTCCTTTATCTAATTCTGTTTATCATTTTGGAGGGTCTATTGATTTAGCTATTTTTAGGTTGCATATTGCAGGTGTTTCTTCTATTTTAGGGGCTATTAATTTTATTACGACTTGTATGAAAGGGAAAATTAGGTTTGTTTTAAGATTGGAATATCTAACTTTGTTTGTTTGGGCTATGATTGTTACTAGATTTTTATTAGTATTAAGATTACCGGTTTTAGCTGGTGGAATTACTATACTATTATTAGATCGTAATTTTGGTTCTTCTTTTTTTGATCCTAGAGGAGGAGGGTA?CCTATC??????????????????
Rotaria_rotatoria_A722RR6                              AACGTTGTATTTTATTATTGGTGTATGATCAGGGTTTTTAGGAGCTAGAATTAGGTTAATTATTCGTACTGAGCTTGGAATAGTAGGTAGGGTAATTATAGATGAGCAAATTTATAATTCTATAGTTACGGCTCATGCTTTTCTTATAATTTTTTTTTTTGTTATGCCAGTTGCTGTAGGAGGATTTGGTAATTGATTATTGCCTTTAATAATAAATGTTATGGATATAGCTTTTCCTCGTTTAAATAATTTGAGATTTTGGTTAGTACCTATTTCATTATTATTTATATGTTTAAGTTTATTAGTGGGTTTAGGTCCTGGTACTGGTTGAACTGTTTATCCTCCGTTGTCAAATTCTATTTATCATTTTGGAGGATCTATTGATTTAGCTATTTTTAGTTTACACATTGCAGGGGTTTCTTCTATTTTAGGGGGGATTAATTTTATTACGACTTGTATAAAAGGAAAAATTAGATTTGTTATAAGATTAGAGTACTTAACTTTATTTACTTGAGCTATAATTGTTACTAGATTTTTATTAGTTTTAAGGTTGCCAGTATTAGCTGGAGGTATTACTATATTATTGTTGGATCGTAATTTTGGTTCTTCTTTTTTTGATCCTAGTGGAGGAGGAAATCCTATTTTAT??????????????
Rotaria_rotatoria_A723RR2                              GACTTTATATTTTGTTATTGGTGTTTGATCGGGGTTTTTAGGGGCTAGAATTAGGCTTATTATTCGTACGGAGTTAGGGATAGTAGGAAGAGTAATTATAGATGATCAAATTTATAATTCTATAGTTACAGCACATGCGTTTTTAATAATTTTTTTTTTTGTAATACCAGTTGCTGTTGGTGGGTTTGGTAATTGATTATTACCATTAATAATGAATGTTATGGATATAGCTTTTCCTCGTTTAAATAATTTGAGATTTTGATTAGTGCCAATTTCATTAGTTTTTATGTGTATAAGATTATTAGTAGGGTTAGGACCTGGGACAGGTTGAACTGTGTATCCTCCCCTATCTAATTCTGTGTATCATTTTGGGGGTTCAATTGATTTGGCTATTTTTAGGTTACATATTGCTGGAGTTTCTTCAATTTTAGGGTCTATTAATTTTATTACTACTTGTATAAAAGGAAAAATTAGATTTGTTTTAAGGTTAGAATATTTAACTTTATTTGTGTGAGCGATGATTGTTACTAGTTTTTTATTAGTGTTAAGATTACCTGTATTAGCAGGGGGTATTACGATATTATTGTTAGATCGTAATTTTGGTTCTTCTTTTTTTGATCCAAGAGGAGGGGGGAATCCTATTT?????????????????
Rotaria_rotatoria_A729RR1                              AACTTTATATTTTGTTGTTGGGGTTTGGTCTGGTTTTTTAGGAGCTAGAATTAGGTTAATTATTCGTACTGAGTTAGGGATAGTGGGGAGGATTATTATAGATGATCAAATTTATAATTCTTTAGTTACTGCTCATGCATTTTTAATAATTTTTTTTTTTGTAATGCCTGTGGCTATGGGGGGGTTTGGTAATTGGCTTTTACCTTTAATAATAAATGTTATAGATATAGCATTTCCTCGTTTGAATAATTTGAGATTTTGGTTAGTGCCTGTTTCTTTGTTGTTTATGTGTATAAGGTTATTAGTTGGTTTAGGTCCGGGTACTGGTTGGACAGTTTATCCTCCTTTATCAAATTCTGTTTATCATTTTGGGGGGTCAATTGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATATTGCAGGGGTTTCTTCTATTTTGGCAAGAATTAATTTTATTACAACATGTATAAAAGGTAAAATTAGATATGTGATAAGGTTGGAGTATTTAACTTTATTTAGGTGGGCTATGATTGTTACTAGGTTTTTATTAGTTTTAAGATTACCTGTTTTAGCAGGTGGGATTACAATATTATTGTTAGATCGTAATTTTGGGGCTTCTTTTTTTGATCCTAGAGGAGGGGGTAATCCTATTT?????????????????
Rotaria_rotatoria_A737RR7                              GACTTTATATTTTGTTATTGGGGTTTGGTCAGGATTCTTAGGTGCTAGAATTAGTTTAATTATTCGTACTGAGTTAGGGATAGTTGGAAGAATTATTATAGATGATCAGATTTATAATTCTATGGTGACAGCGCATGCATTTCTAATAATTTTTTTTTTTGTTATGCCTGTAGCTGTAGGGGGTTTTGGGAATTGGCTATTACCTTTAATAATAAATGTTATAGATATAGCTTTTCCTCGTTTGAATAATTTAAGGTTTTGATTAGTTCCTATTTCTTTATTATTTATATGTATAAGTTTGTTAGTGGGGCTAGGGCCTGGGACTGGGTGGACTGTGTACCCTCCATTATCTAATTCAGTTTATCATTTTGGAGGGTCTGTTGATTTAGCTATTTTTAGATTACATATTGCTGGGGTATCTTCTATTTTAGGAAGAATTAATTTTATTACAACTTGTATAAAAGGTAAAATTAGGTTTGCTATAAGTTTAGAATATTTAAGATTATTTACTTGGGCAATAATTGTGACTAGATTTTTATTAGTATTGAGGCTACCTGTTTTAGCAGGGGGTATTACAATACTTCTTTTAGATCGTAATTTTGGGTCTTCTTTTTTTGATCCTAGTGGGGGAGG????????????????????????????
Rotaria_rotatoria_A741RR1                              GACTTTATATTTTGTTATTGGGGTTTGGTCAGGATTCTTAGGTGCTAGAATTAGTTTAATTATTCGTACTGAGTTAGGGATAGTTGGAAGAATTATTATAGATGATCAGATTTATAATTCTATGGTGACAGCGCATGCATTTCTAATAATTTTTTTTTTTGTTATGCCTGTAGCTGTAGGGGGTTTTGGGAATTGGCTATTACCTTTAATAATAAATGTTATAGATATAGCTTTTCCTCGTTTGAATAATTTAAGGTTTTGATTAGTTCCTATTTCTTTATTATTTATATGTATAAGTTTGTTAGTGGGGCTAGGGCCTGGGACTGGGTGGACTGTGTATCCTCCATTATCTAATTCAGTTTATCATTTTGGAGGGTCTGTTGATTTAGCTATTTTTAGATTACATATTGCTGGGGTATCTTCTATTTTAGGAAGAATTAATTTTATTACAACTTGTATAAAAGGTAAAATTAGGTTTGCTATAAGTTTAGAATATTTAAGATTATTTACTTGGGCAATAATTGTGACTAGATTTTTATTAGTATTGAGGCTACCTGTTTTAGCAGGGGGTATTACAATACTTCTTTTAGATCGTAATTTTGGGTCTTCTTTTTTTGATCCTAGTGGGGGAG?????????????????????????????
Rotaria_rotatoria_A743RR1                              AACTTTACATTTTCTTCTTGGAGTTTGAGCAGGGTTTTTAGGTGCTAGAATTAGGTTAATTATTCGTACGGAATTAGGTATAGTAGGAAGAATTATTATAGATGATCAGATTTATAATTCTATGGTGACAGCTCATGCATTTTTAATAATTTTTTTTTTTGTTATACCTGTGGCTATAGGTGGGTTTGGAAATTGATTATTGCCTTTAATAATGAATGTTATAGATATAGCATTTCCTCGTTTAAATAATTTGAGGTTTTGATTAGTTCCTATTTCGTTATTATTTATGTGTATAAGTTTATTGGTGGGATTAGGTCCTGGGACAGGTTGGACAGTTTATCCTCCTTTGTCGAATTCTGTTTATCATTTTGGTGGTTCTATTGATATGGCTATTTTTAGGTTACATATTGCTGGAGTTTCATCTATTTTAGGAAGAATTAATTTTATTACTACTTGTATAAAAGGTAAGATTAGTTATGTAATAAGGTTGGAGTATTTAACTCTATTTGTTTGAGCTATTATTGTTACAAGGTTTTTGTTAGTTTTAAGTTTACCTGTTTTAGCTGGTGGAATTACTATATTATTATTAGATCGTAATTTTGGTTCTTCTTTTTTTGATCCAAGAGGAGGAGGTAATCCTATT??????????????????
Rotaria_rotatoria_A743RR6                              AACTTTACATTTTGTTATTGGTGTTTGGTCAGGATTTTTAGGTGCTAGAATTAGGTTAATTATTCGTACTGAGTTAGGAATAGTAGGTAGGGTTATTATAGATGATCAAATTTATAATTCTATAGTTACAGCGCATGCTTTTTTAATAATTTTTTTTTTTGTAATGCCAGTTGCTGTTGGGGGATTTGGTAATTGATTATTACCTTTAATGATGAATGTCATAGATATAGCTTTTCCACGTTTAAATAATTTAAGATTTTGATTAGTGCCAATTTCATTGGTATTTATATGTATAAGATTATTAGTAGGATTAGGACCTGGAACAGGTTGAACTGTTTACCCTCCTTTATCGAATTCTGTGTATCATTTTGGGGGTTCAATTGATTTGGCTATTTTTAGTTTACATATTGCTGGAGTTTCTTCTATTTTAGGGTCTATTAATTTTATTACTACTTGTATAAAAGGTAAGATTAGTTTTGTGTTAAGATTAGAATATTTAACTTTATTTGTCTGAGCAATGATTGTTACAAGGTTTTTATTAGTATTAAGATTACCTGTTTTAGCAGGGGGTATTACTATATTATTATTAGATCGTAATTTTGGTTCATCTTTTTTTGACCCAAGAGGAGGAGGGAATCCTATTT?????????????????
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Rotaria_tardigrada_A537RT2                             AACGTTGTATTTTATTATTGGAGTTTGATCTGGTTTTTTAGGGGCTAGAATAAGTTTGATTATTCGTACTGAGTTAGGAATGGTAGGTAGAATTATTATAGATGATCAAATCTATAATTCAATAGTTACTGCTCATGCTTTTTTAATGATTTTCTTTTTTGTTATACCGGTGGCTATGGGGGGTTTTGGAAATTGATTGCTTCCGTTGATGATGAATGTTGCGGATATAGCTTTTCCTCGTTTAAATAATTTAAGATTTTGGTTAGTGCCGGTATCATTATTATTTATGTCTTTGAGATTATTGGTTGGTTTGGGACCGGGGACTGGTTGGACTGTATATCCTCCTTTGAGGAATTCTGTTTATCATTTTGGGGGCTCAATTGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATGTGGCTGGTGTTTCTTCTATTTTGGCTAGAATTAATTTTATTACTACGTGTATAAAGGGAAAGATTAGATATGTATTGAGATTAGAGTATTTAACTTTGTTTACATGGGCGATGATTGTTACTAGTTTTTTATTAGTGTTGAGATTGCCTGTGTTGGCGGGAGGTATTACTATGTTATTGTTAGATCGTAATTTTGGAGCTTCATTTTTTGATCCAAGAGGTGGGGG????????????????????????????
Rotaria_tardigrada_A572RT7                             GACGTTGTATTTTATTATTGGTGTATGGTCTGGTTTTTTAGGAGCAAGAATAAGGTTAATTATTCGAACAGAGTTGGGAATAGTTGGAAGAATTATTATAGATGATCAGATTTATAATTCATTAGTAACAGCACATGCTTTTTTAATGATTTTTTTTTTTGTTATACCAGTGGCTTTAGGAGGGTTTGGAAATTGGTTATTGCCTTTGATAATGAATGTTGCAGATATAGCTTTTCCTCGTTTAAATAATTTGAGGTTTTGGTTGGTTCCAGTTTCTTTATTGTTTATATCACTAAGGTTATTAGTTGGGTTAGGGCCTGGGACAGGGTGGACTGTGTATCCTCCGTTAAGGAATTCAGTTTATCATTTTGGGGGATCTATTGATTTAGCAATTTTTAGGTTGCATGTTGCAGGAGTGTCTTCAATTTTGGCTAGGATTAATTTTATTACTACATGTTTGAAAGGAAAAATTAGATATGTTTTAAGGTTGGAATATTTAACATTATTTGTTTGGGCAATAGTTGTTACTAGATTTTTATTAGTATTAAGGTTACCTGTGTTAGCTGGTGGAATTACTATATTATTGTTGGATCGTAATTTTGGGGCTTCTTTTTTTGATCCTAGAGGAGGGGGAAATCCTATTTTA???????????????
Rotaria_tardigrada_A595RT4                             GACTTTGTATTTCATTATTGGTGTTTGATCTGGTTTTTTGGGTGCAAGAATAAGTTTAATTATTCGTACGGAGTTAGGTATAGTAGGGAATATTATTATAGACGATCAAATTTATAATTCTATGGTAACTGCTCATGCTTTTTTAATGATTTTTTTTTTTGTTATGCCTGTGTCAATAGGGGGTTTTGGAAATTGGTTATTGCCTTTGATAATGAATGTTGCGGATATAGCTTTTCCTCGATTAAATAATTTAAGATTTTGGTTGGTTCCTGTTTCTTTATTATTTATATCTTTGAGTTTATTAGTTGGTTTAGGGCCTGGTACAGGTTGAACTGTATATCCTCCTCTAAGAAATTCTGTGTATCATTTTGGAGGATCAATTGATTTGGCTATTTTTAGATTACATGTAGCTGGTGTTTCTTCAATTTTGGCTAGTATTAATTTTATTACTACTTGTATGAAGGGTAAGATTAGATATGTTTTAAGATTAGAGTATTTAACATTATTTAGTTGAGCTATAATTGTCACTAGTTTTTTATTAGTTTTGAGTTTACCTGTTTTAGCAGGAGGAATTACTATGTTGTTATTAGATCGAAATTTTGGGGCTTCTTTTTTTGATCCGAGAGGGGGA??????????????????????????????
Rotaria_tardigrada_A602RT1                             TACTTTGTATTTTATTATTGGTGTTTGGTCTGGTTTTTTAGGGGCAAGAATAAGATTGATTATTCGTACAGAGCTAGGGATAGTAGGTAGAATTATTATAGATGATCAAATTTATAATTCTATAGTTACTGCTCATGCTTTTTTAATGATTTTTTTTTTTGTTATGCCTGTGGCAATAGGGGGGTTTGGGAATTGATTATTGCCTTTAATGATGAATGTTGCTGATATAGCTTTTCCTCGTTTAAATAATTTGAGATTTTGGTTAGTTCCTGTCTCTTTGTTATTTATATCTTTAAGTTTATTGGTTGGATTAGGTCCTGGAACGGGTTGGACTGTATATCCTCCTTTGAGAAATTCAGTTTATCATTTTGGTGGTTCTATTGATTTAGCTATTTTTAGCTTACATGTGGCTGGTGTTTCTTCAATTTTAGCTAGAATTAATTTTATTACTACTTGTATAAAAGGCAAGGTTAGATATGTATTAAGATTGGAGTATTTAACTTTATTTAGGTGGGCTATGATTGTTACTAGATTTTTATTAGTTTTAAGTTTACCTGTATTAGCAGGTGGTATTACTATATTATTATTAGATCGTAATTTTGGAGCTTCTTTTTTTGATCCAAGAGGGGGTGGTAATCCTATT??????????????????
Rotaria_tardigrada_A672RTN1                            AACTTTATATTTTATTATTGGAGTTTGGTCTGGTTTCTTAGGAGCTAGAATAAGGTTGATTATTCGTACGGAGTTAGGAATGGTTGGAAGGATTATTATAGATGATCAAATTTATAATTCGATGGTTACGGCTCATGCTTTTTTGATGATTTTTTTTTTTGTTATACCAGTTGCTATAGGGGGGTTTGGAAATTGGTTATTGCCTTTGATAATGAATGTGGCAGATATAGCTTTTCCTCGTTTAAATAATTTAAGGTTTTGGTTGGTGCCTGTATCTTTGTTATTTATGTCTTTAAGTTTATTGGTTGGTTTAGGACCTGGGACTGGTTGAACTGTATATCCTCCTTTATCAAATTCTGTATATCATTTTGGAGGTTCTATTGATTTAGCTATTTTTAGATTACATGTAGCTGGTGTTTCTTCGATTTTAGCTAGAATTAATTTTATTACTACTTGTATAAAAGGAAAAATTAGATATGTGTTAAGGTTGGAGTATTTAACTTTATTTAGGTGAGCAATGATTGTTACTAGGTTTTTGTTAGTTTTAAGATTACCTGTTTTAGCAGGCGGTATTACGATGTTATTGTTAGATCGTAATTTTGGTTCTTCATTTTTTGACCCAAGAGGA?GGGGTAATCCTATTT?????????????????
Rotaria_tardigrada_A695RR4                             ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GCTTTTTTAAAGATTTTTTTTTTTGTTATACCAGTGGCTTTAGGAGGGTTTGGAAATTGGTTATTGCCTTTGATAATGAATGTTGCAGATATAGCTTTTCCTCGTTTAAATAATTTGAGGTTTTGGTTGGTTCCAGTTTCTTTATTGTTTATATCATTAAGGTTATTAGTTGGGTTAGGGCCTGGGACAGGGTGGACTGTATATCCTCCGTTAAGGAATTCAGTTTATCATTTTGGGGGATCTATTGATTTAGCAATTTTTAGGTTGCATGTTGCAGGAGTGTCTTCAATTTTGGCTAGGATTAATTTTATTACTACATGTTTGAAAGGAAAAATTAGATATGTTTTAAGGTTGGAATATTTAACATTATTTGTTTGGGCAATAGTTGTTACTAGATTTTTATTAGTATTAAGGTTACCTGTGTTAGCTGGTGGAATTACTATATTATTGTTGGATCGTAATTTTGGGGCTTCTTTTTTTGATCCTAGAGGAGGGG?????????????????????????????
Rotaria_tardigrada_A717RT2                             AACGTTGTATTTTATTATTGGAGTTTGATCTGGTTTTTTAGGGGCTAGAATAAGTTTGATTATTCGTACTGAGTTAGGAATGGTAGGAAGAATTATTATAGATGATCAGATTTATAATTCTATGGTGACGGCTCATGCTTTTTTAATGATTTTTTTTTTTGTTATGCCGGTGGCTATAGGGGGTTTTGGGAATTGGTTACTTCCTTTAATGATAAATGTTGCGGATATGGCTTTTCCTCGTTTGAATAATTTGAGATTTTGGTTGGTACCTGTTTCATTGTTATTTATATCATTGAGGTTATTAGTTGGTTTGGGACCTGGAACGGGTTGGACTGTTTATCCTCCGTTAAGAAATTCTGTTTATCATTTTGGAGGATCAATTGATTTAGCTATTTTTAGGTTACATGTTGCTGGTGTTTCTTCGATTTTGGCTAGAATTAATTTTATTACTACGTGTATAAAAGGAAAAATTAGATATGTGTTAAGATTAGAGTATTTAACTTTGTTTACATGAGCGATGATTGTTACTAGGTTTTTATTAGTTTTAAGTTTGCCTGTTTTAGCGGGTGGGATTACTATATTGTTATTAGATCGTAATTTTGGAGCTTCATTTTTTGATCCTAGGGGTGGAG?????????????????????????????
Rotaria_tardigrada_A717RTM4                            AACTTTATATTTTGTTATTGGAGTTTGATCTGGCTTTTTAGGAGCTAGAATAAGGTTGATTATTCGTACGGAGTTAGGGATGGTTGGGAGAGTTATTATAGATGATCAAATTTATAACTCGATGGTGACTGCTCATGCTTTTTTGATAATTTTCTTTTTTGTAATACCAGTGGCAATGGGTGGATTTGGAAATTGGTTATTACCATTAATAATAAATGTAGCGGATATGGCTTTTCCTCGTTTAAATAATTTGAGGTTTTGATTGGTACCTGTATCTTTGTTATTTATATCTTTGAGTTTGTTAGTTGGTTTAGGACCTGGGACAGGGTGAACTGTGTATCCACCATTATCCAATTCTGTTTATCATTTTGGTGGATCTATTGATTTGGCAATTTTTAGATTACATGTAGCTGGTGTTTCTTCTATTTTAGCTAGAATTAATTTTATTACTACTTGTATAAAAGGAAAAATTAGTTATGTTTTGAGCTTAGAGTATTTAACTTTATTTAGATGGGCGATGGTGGTTACTAGGTTTTTATTAGTGTTAAGATTACCTGTTTTAGCAGGAGGGATTACTATATTGTTGTTAGATCGTAATTTTGGTTCGTCATTTTTTGATCCAAGAGGTGGCGGAAATCCTATTTTA???????????????
Rotaria_tardigrada_A717RTR1                            AACTTTATATTTTATTATTGGGGTTTGATCTGGTTTTTTAGGAGCTAGAATAAGATTAATTATTCGTACGGAGTTAGGAATGGTAGGGAGAATTATTATAGATGATCAAATTTATAATTCAATGGTAACTGCTCATGCTTTTTTAATGATTTTCTTTTTTGTTATACCAGTAGCTATGGGTGGGTTTGGAAATTGGTTATTACCGTTGATAATGAATGTAGCAGATATAGCTTTTCCTCGTTTGAATAATTTGAGGTTTTGGTTGGTGCCTGTTTCTTTATTATTTATGTCTTTAAGTTTGTTAGTTGGGTTAGGACCAGGGACAGGGTGAACTGTTTATCCACCGTTGTCAAATTCTGTTTATCATTTTGGAGGGTCAATTGATTTGGCAATTTTTAGATTACATGTAGCTGGGGTGTCTTCTATTTTAGCTAGAATTAATTTTATTACTACTTGTATAAAAGGAAAAATTAGTTATGTTTTGAGATTAGAATATTTGACTTTATTTAGATGAGCAATGGTTGTTACTAGTTTTTTGTTGGTGTTAAGATTACCTGTATTAGCTGGTGGGATTACTATATTATTATTAGATCGTAATTTTGGTTCTTCGTTTTTTGATCCTAGAGGTGGTGGTAA?????????????????????????
Rotaria_tardigrada_A721RTN3                            AACTTTATATTTTATTATTGGAGTTTGGTCTGGTTTTTTAGGAGCCAGAATAAGGTTAATTATTCGTACGGAGTTAGGGATGGTTGGAAGGATTATTATAGACGATCAAATTTATAATTCGATAGTTACGGCTCATGCTTTTTTGATGATTTTCTTTTTTGTTATACCAGTTGCTATAGGGGGGTTTGGAAATTGATTATTACCTTTAATAATGAATGTGGCAGATATAGCTTTTCCTCGTTTAAATAATTTAAGGTTTTGGTTGGTACCTGTGTCTTTGTTATTTATATCTTTAAGTTTATTGGTTGGTTTAGGACCTGGGACTGGATGGACTGTGTATCCTCCTTTATCAAATTCTGTGTATCATTTTGGGGGTTCTATTGATTTAGCTATTTTTAGGTTACATGTGGCTGGTGTTTCGTCGATTTTGGCTAGGATTAATTTTATTACTACTTGTATAAAGGGAAAAATTAGATATGTTTTAAGGTTGGAGTATTTAACTTTATTTAGGTGGGCAATGATTGTTACTAGGTTTTTGTTAGTTTTAAGATTACCTGTTTTAGCTGGTGGTATTACGATGTTGTTGTTAGATCGTAATTTTGGTTCTTCGTTTTTTGATCCGAGAGGAGGTGGTAATCCAATT??????????????????
Rotaria_tardigrada_A751RTN1                            AACTTTATATTTTATTATTGGGGTTTGGTCTGGTTTTTTAGGGGCCAGAATAAGATTAATTATTCGTACGGAGTTAGGAATGGTTGGAAGAATTATTATAGATGATCAAATTTATAATTCGATGGTTACGGCCCATGCTTTTTTGATAATTTTCTTTTTTGTTATACCTGTTGCTATAGGGGGGTTTGGGAATTGATTATTACCTTTGATAATGAATGTTGCAGATATAGCTTTTCCTCGTTTAAATAATTTAAGGTTTTGGTTAGTACCTGTGTCTTTGTTATTTATGTCTTTGAGTTTGTTGGTTGGTTTGGGACCTGGGACTGGTTGGACTGTATATCCTCCTTTATCAAATTCTGTATATCATTTTGGAGGCTCAATTGATTTAGCTATTTTTAGGTTACATGTAGCTGGTGTTTCTTCAATTTTAGCTAGAATTAATTTTATTACTACTTGTATAAAAGGGAAAATTAGATATGTGTTGAGGTTGGAGTATTTGACTTTATTTAGATGGGCTATGATTGTTACTAGGTTTTTGTTAGTTTTAAGATTACCTGTTTTAGCTGGTGGTATTACGATATTATTGTTAGATCGTAATTTTGGTTCTTCATTTTTTGACCCTAGAGGAGGGGGAAATCCAATTTTAT??????????????
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Rotaria_tardigrada_gi|109892237|gb|DQ656869.1|         ????TTGTATTTTATTATTGGGGTATGGTCTGGTTTTTTAGGAGCTAGGATAAGGTTGATTATTCGTACTGAGTTAGGGATAGTAGGGAGAATTATTATAGATGATCAAATTTATAATTCTTTAGTGACAGCTCATGCTTTTTTGATGATTTTTTTTTTTGTTATGCCGGTGGCATTAGGGGGGTTTGGGAATTGGTTGCTTCCTTTAATAATGAATGTTGCAGATATAGCTTTTCCTCGATTAAATAATTTGAGGTTTTGATTAGTGCCTGTCTCTTTGTTATTTATGTCTTTAAGGTTGTTAGTAGGGTTGGGTCCTGGGACTGGATGGACGGTGTATCCACCATTAAGAAATTCAGTTTATCATTTTGGTGGATCTATTGATTTGGCAATTTTTAGATTGCATGTTGCGGGTGTTTCGTCTATTTTAGCTAGGATTAATTTTATTACAACATGTATAAAAGGGAAAATTAGTTATGTGTTGAGATTGGAGTATTTAACATTATTTGTTTGGGCAATGGTTGTAACTAGGTTTTTGTTAGTATTAAGATTACCTGTGTTGGCTGGAGGGATTACTATATTGTTATTAGATCGTAATTT?GG?GCTTC????????????????????????????????????????????????????
Rotaria_tardigrada_gi|109892369|gb|DQ656857.1|         ????TTGTATTTTATTATTGGAGTTTGATCTGGTTTTTTAGGGGCTAGTATAAGTTTGATTATTCGTACGGAGTTAGGGATAGTAGGAAGAATTATTATAGATGATCAAATTTATAATTCTTTGGTGACAGCTCATGCTTTTTTAATGATTTTCTTTTTTGTTATACC?GTTTCTATAGGGGGTTTTGGAAATTGGTTACTTCCTTTAATGATAAATGTTGCAGATATGGCTTTTCCTCGTTTAAATAATTTGAGGTTTTGGTTAGTACCTGTTTCATTGTTGTTTATATCGTTGAGATTATTAGTTGGTTTGGGGCCTGGGACGGGATGGACTGTTTATCCCCCTTTAAGAAATTCTATTTATCATTTTGGAGGTTCAATTGATTTAGCTATTTTTAGTCTTCATGTTGCTGGTGTTTCTTCGATTTTGGCTAGAATTAATTTTATTACTACTTGTATAAAAGGAAAGATTAGTTATGTGTTAAGATTAGAGTATTTAACTTTGTTTACTTGGGCGATGATTGTTACTAGGTTTTTATTAGTT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
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Rotaria_tardigrada_gi|125487062|gb|EF173270.1|         ????TTGTATTTTATTATTGGAGTTTGATCTGGTTTTTTAGGGGCTAGTATAAGTTTGATTATTCGTACGGAGTTGGGGATAGTAGGAAGAATTATTATAGATGATCAAATTTATAATTCTTTGGTGACAGCTCATGCTTTTTTAATGATTTTCTTTTTTGTTATGCCTGTTGCTATAGGGGGTTTTGGAAATTGGTTACTTCCTTTAATGATAAATGTTGCAGATATGGCTTTTCCTCGTTTAAATAATTTGAGGTTTTGGTTAGTACCTGTTTCGTTGTTGTTTATATCGTTGAGATTACTAGTTGGTTTGGGGCCTGGGACGGGATGAACTGTTTATCCTCCTTTAAGAAATTCTGTTTATCATTTTGGAGGTTCAATTGATTTAGCTATTTTTAGTCTTCATGTTGCTGGTGTTTCTTCGATTTTGGCTAGAATTAATTTTATTACTACTTGTATAAAAGGAAAAATTAGTTATGTGTTAAGATTAGAGTATTTAACTTTGTTTACTTGGGCGATAATTGTTACTAGGTTTTTATTAGTTTTAAGTTTACCTGTTTTGGCAGGGGGGATTACTATGTTGTTGTTGGATCGTAATTTTGGAGCTTCGTTTTTTGATCCTAGAGGTGGA??????????????????????????????
Rotaria_tardigrada_gi|158515539|gb|EU076830.1|         ????????ATTTTATTATTGGTGTTTGATC?GGGTTTTT?GGAGCTAGTATAAGTTTAATTATTCGTACAGAGTTAGGAATAGTTGGTAGAATTATTATAGATGATCAAATTTATAATTCTATGGTTACGGCGCATGCTTTTTTAATGATTTTTTTTTTTGTTATACCTGTTGCTATAGGGGGATTTGGAAATTGATTATTACCTTTAATAATAAATGTTGCTGATATAGCATTTCCTCGTTTAAATAATTTGAGATTTTGGTTAG?GCCGGTTTCTTTGTTGTTTATATCTTTAAGATTGTTAGTAGGTTTAGGTCCGGGGACAGGTTGGACTGTTTATCCTCCTTTGAGAAATTCTATTTATCATTTTGGTGGGTCAATTGATTTAGCAATTTTTAGGTTACATGTGGCGGGTGTGTCTTCTATTTTAGCTAGAATTAATTTTATTACTACTTGTATAAAAGGGAAAATTAGGTATGTTTTGAGTTTAGAATATTTAACTTTATTTGTTTGAGCAATGATTGTTACTAGGTTTTTATTAGTTTTGAGTTTACCTGTGTTAGCAGG?GGTATTACTATATTGTTATTGGATCG???????????????????????????????????????????????????????????????????
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END;

BEGIN CHARACTERS;
[! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M18424]

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Philodina_acuticornis_gi|209405787|gb|EU751116.1|      TACTTTATATTTTGTTATTGGGATTTGATCAGGTTTTTTAGGGGCGAGTATTAGTTTAATTATTCGTACTGAATTAGGAATAGTTGGAAGTATTATTCTTGATGAACAGATTTATAATTCTATAGTTACTGCTCATGCTTTTTTGATAATTTTCTTTTTTGTTATACCTGTAGCTGTAGGGGGTTTTGGTAATTGATTACTTCCTTTAATAATGAATGTTATAGATATAGCATTTCCTCGATTGAATAATTTGAGTTTTTGACTTGTTCCAGTTGCTTTATTATTTATGAGTTTAAGATTATTAGTAGGTTTAGGTCCTGGTACAGGTTGAACTGTTTATCCTCCTTTGTCTAATTCTGTATATCATTTTGGAGGATCAGTTGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATGTTGCTGGTGTTTCTTCTATTTTGGGAGGTATTAATTTTATTACTACATGTTTGAAAGGAAAAATTAGTTATGTTTTAAGGTTTGAATTTTTGACTTTATTTGTATGAGCTATAATTGTTACTAGGTTTTTGTTAGTTCTTAGTTTACCTGTATTAGCAGGTGGAATTACTATATTAT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
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Philodina_sp_gi|209405831|gb|EU751138.1|               TACTTTGTATTTTATTATTGGTATTTGATCAGGTTTTTTAGGTGCGAGAATTAGTTTAATTATTCGTACTGAATTAGGTATAGTAGGAAGAATTATTTTAGATGAGCAGATTTATAATTCTATAGTTACTGCTCATGCTTTTTTAATAATTTTTTTTTTTGTTATACCAGTTGCTGTTGGAGGTTTTGGTAATTGGTTACTTCCTTTGATAATGAATGTTATGGATATGGCTTTTCCTCGTTTAAATAATTTAAGATTTTGATTGGTTCCTGTTGCTTTATTATTTATATCTTTAAGTTTGTTAGTTGGTTTAGGTCCTGGAACAGGTTGAACTGTATATCCTCCTTTATCTAATTCTATTTATCATTTTGGTGGTTCGGTTGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATGTTGCTGGTGTATCATCTATTTTAGGTGGTATTAATTTTATTACTACTTGTTTGAAGGGTAAAATCAGATATGTTTTAAGATTTGAGTTTTTAACTTTATTTGTCTGAGCTATGGTAGTTACTAGTTTTCTTTTAGTATTAAGATTGCCTGTTTTAGCTGGTGGAATTACTATATTATTATTAGAT?????????????????????????????????????????????????????????????????????
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Philodina_sp_gi|209405845|gb|EU751145.1|               TACTTTATATTTTGTTATTGGGATTTGATCAGGTTTTTTAGGGGCGAGTATTAGTTTAATTATTCGTACTGAATTAGGAATAGTTGGAAGTATTATTCTTGATGAACAGATTTATAATTCTATAGTTACTGCCCATGCTTTTTTGATAATTTTCTTTTTTGTTAT?CCTGTAGCCGTAGGGGGTTTTGGTAATTGATTACTTCCTTTAATAATGAATGTTATAGATATAGCATTTCCTCGATTGAATAATTTGAGTTTTTGACTTGTTCCAGTTGCTT?ATTATTTATGAGTTTAAGATTATTAGTAGGTTTAGGTCCTGGTCCAGGTTGAACTGTTTATCCCCCTTTGTCTAATTCTGTATATCATTTTGGAGGGTCAGTGGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATGTTGCTGGTGTTTCTTCTATTTTGGGAGGTATTAATTTTATTACTCCATGTTTGAAAGGAAAAATAAGTTATGTTTTAAGGTTTGAATTTTTGACTTTATTTGTATGAGCTATAATTGTTACTAGGTTTTTGTTAGTTCTTAGTTTCCCTGTATTAGCAGGTGGAATTACTATATTATTGTTAGATCGTAATTTGGGTTCTTCTTTTTTTGATCCTAG?????????????????????????????????????
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Philodina_sp_gi|209405945|gb|EU751195.1|               AACTTTATATTTTATTTTTGGGATTTGATCGGGGTTTTTGGGG?CAAGAATAAGAATAATTATTCGTTCTGAATTAGGAATAGTTGGTAGAATTATTATAGATGAGCAAATTTATAATGCTATAGGAACCGCTCACGCTTTTTTAAAAATTTTTTTTTTTGTTATCCCTGTTGCTGTTGGAGGCTTTGGAAATTGATTATTCCCTTTAATAATGAATGTTATAGATATAGCTTTTCCTCGTTTGAATAATTTAAGATTTTGGTTAGTTCCGGT?GCTTTATTATTTATAATTATAAGTTTATTGGTGGGATTAGGAGCTGGAACAGGTTGAACGGTTTATCCTCCTTTATCAAATTCCGTTTATCATTTTGGAGGTTCTGTTGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATGTTGCGGGAGTTTCTTCTATTTTAGGAGCTATTAATTTTATTACTACATGTTTAAAAGGAAAAATCAGATATGTTTTATCTTTTGAATTTTTAACTTTATTTGTTTGAGCAATAATTGTTACTAGATTTTTATTAGTTCTAAGATTACCTGTTTTAGCTGGAGGTATTACAATGTTATTATTAGATCGAAATTTTGGTTCTTCCTTTTTTG????????????????????????????????????????????
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Philodina_sp_gi|296011671|gb|HM033014.1|               ?????????????????????????????CTGGATTTTTAGGAGCGAGTATTAGATTAATTATTCGAACTGAGTTAGGTATGGTAGGTAGAATTATTATAGATGAGCAAATTTATAATTCTATAGTAACAGCTCATGCTTTTTTAATGATTTTCTTTTTTGTTATACCAGTAGCTGTTGGGGGGTTTGGAAATTGGTTATTACCTTTAATAATAAATGTAATAGATATAGCTTTTCCTCGTTTAAACAATTTAAGTTTTTGATTAGTTCCTGTTGCTTTATTATTTATAAGTTTAAGATTATTAGTAGGTTTAGGTCCAGGGACTGGTTGGACTGTTTATCCTCCTTTATCAAATTCTGTTTATCATTTTGGAGGTTCTGTTGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATGTTGCAGGGGTTTCTTCTATTTTAGGAGGTATTAATTTTATTACTACGTGTTTAAAAGGAAAAATTAGTTATGTTTTATCTTTAGAATTTTTAACTTTATTTGTGTGGGCTATAATTGTTACTAGATTTTTATTAGTATTAAGGTTGCCTGTTTTAGCAGGAGGAATTACTATATTATTATTAGATCGAAATTTTGGTTCTTCCTTTTTTGATC?????????????????????????????????????????
Philodina_sp_gi|407081089|gb|JQ309156.1|               ????TTGTATTTTATTATCGGAATTTGATCTGGATTTTTAGGTGCTAGAATAAGATTAATCATCCGTACTGAACTTGGGATGGTAGGTAGAATTATTATAGATGAACAAATTTATAATGCTATAGTAACTGCTCATGCATTTTTAATAATTTTCTTTTTCGTTATACCTGTAGCTGTAGGGGGCTTTGGTAATTGATTATTACCTCTAATAATAAATGTAGCTGATATAGCCTTTCCTCGCTTAAATAATTTAAGTTTTTGACTTGTGCCTGTAGCTTTATTATTCATAATCATAAGATTATTAGTAGGTCTAGGTGCAGGAACGGGCTGAACAGTTTACCCACCGTTGTCTAATTCCATTTATCATTTTGGGGGTTCTGTAGATTTGGCTATCTTTTCCCTACATGTGGCTGGAGTCTCTTCTATTTTAGGAGGTATTAATTTCATTACAACATGTCTAAAAGGTAAAATCAGTTATATTTTATCTCTTGAACATTTAAATTTATTTGTTTGAGCTATGATTGTTACAAGATTTTTACTTGTTTTAAGTCTTCCGGTATTAGCAGGGGGAATCACTATGTTATTATTGGATCGTAATTTTGGCTCTTCTTTTTTTGATCCTAGTGGTGGGGGAAATCCAATTTTATATCAACATCTATTT
Philodina_sp_gi|407081097|gb|JQ309160.1|               ????TTATATTTTAT?ATTGGAATT?GATCTGGTTTTTTAGGTGCTAGAATTAGATTAATTATTCGTACTGAATTAGGAATAGTGGGAAGAATTATCATAGATGAGCAAATTTATAATGCTATAGTAACTGCTCATGCTTTTTTAATAATTTTTTTTTTTGTTATGCCTGTAGCTGTTGGTGGTTTTGGTAATTGACTATTGCCTTTAATGATAAATGTAATAGATATAGCTTTTCCTCGTTTAAATAATTTAAGATTTTGATTGGTGCCTGTAGCATTATTATTTATAACAATAAGATTATTAGTAGGTTTAGGTGCAGGAACAGGTTGAACTGTGTATCCTCCTTTATCTAATTCTGTTTATCATTTTGGTGGTTCTGTCGATTTAGCAATTTTCAGTTTACATGTAGCTGGTGTTTCTTCTATTTTAGGAGGAATTAATTTTATTACCACATGCTTAAAAGGTAAAATTAGATATATTTTATCGTTTGAATTTTTAAATTTATTTGTTTGAGCAATAATTGTTACAAGATTTTTATTAGTGCTAAGTTTACCTGTTTTAGCTGGAGGAATTACAATGCTTTTATTAGATCGTAACTTTGGTTCTTCTTTTTTTGATCCCAGGGGTGGTGGTAATCCTATTTTATATCAGCATTTATTT
Philodina_sp_gi|407081105|gb|JQ309164.1|               ????TTGTATTTTATTATTGGAATTTGATCTGGGTTTTTAGGTGCTAGAATAAGATTGATTATTCGTACTGAATTAGGAATAGTAGGTAGAATTATTATAGATGAGCAAATTTATAATAGAATAGTGACAGCTCATGCTTTTTTAATAATTTTTTTTTTTGTTATACCTGTTGCTGTTGGAGGATTTGGAAATTGATTATTGCCTTTGATAATAAATGCTATAGATATAGCATTTCCTCGTTTGAATAATTTAAGATTTTGATTAGTGCCTGTAGCCTTATTATTTATGATTATAAGATTATTGGTAGGATTAGGAGCTGGAACAGGGTGAACGGTTTATCCTCCTTTATCTAATTCTGTGTATCATTTTGGAGGATCAGTAGATTTAGCAATTTTTAGATTGCATGTGGCTGGTGTTTCATCGATTCTAGGAGGTATTAATTTTATTACAACTTGTATAAAAGGTAAAATTAGTTATGTTCTTTCTTTTGAATTTTTAAATTTGTTTGTTTGAGCGATAATTGTTACAAGATTTTTATTAGTATTAAGTCTTCCTGTATTAGCGGGAGGTATTACAATATTATTGTTAGATCGTAATTTTGG??????????????????????????????????????????????????????????
Philodina_sp_gi|407081141|gb|JQ309182.1|               GACTTTATACTTTTTAATTGGGATTTGATCAGGATTTTTAGGTGCGAGTATAAGTTTAATTATTCGTACTGAGTTAGGGATAGTAGGAAGGGTGATTATAGATGAGCAGATTTATAATGCTATAGTGACAGCTCATGCTTTTTTAATGATTTTTTTCTTTGTTATACCTGTAGCTGTCGGAGGTTTTGGTAATTGGTTATTACCTTTAATAATAAATGTAATAGATATAGCTTTTCCTCGTTTAAATAATTTGAGTTTTTGACTAGTGCCTGTGGCTTTACTTTTTATAGTAATGAGTTTATTGGTAGGTTTAGGTCCTGGGACGGGTTGAACTGTTTATCCTCCTTTATCTAATTCTGTTTATCATTTTGGAGGTTCTGTTGACTTTGCTATTTTTAGTCTTCATGTTGCGGGGGTTTCTTCGATTTTAGGGGGGATTAATTTTATTACTACTTGTATAAAAGGAAAGATTAATTTTGTAATTTCGTTCGAGTTTTTAACTTTATTTGTTTGAGCAATGATTATTACTAGGTTTCTTTTAGTATTAAGGCTACCTGTGTTAGCTGGTGGTATTACTATGTTATTATTAGATCGTAATTTTGGTTCTTCTTTTTTCGATCCTAGGGGGGGTGGAAATCCTATTTTAT??????????????
Philodina_sp_gi|407081173|gb|JQ309198.1|               ????????????????????????????????GGTTTTTGGGTGCAAGAATAAGATTGATTATTCGTACTGAGTTAGGAATAGTAGGGAGTGTAATTATAGATGAGCAAATTTATAATAGAATAGTGACTGCTCATGCTTTTTTAATAATTTTTTTTTTTGTCATACCAGTGGCTGTTGGGGGATTTGGTAATTGACTATTACCTTTAATAATGAATGCTATAGATATAGCATTTCCTCGATTAAATAATTTAAGATTTTGATTAGTACCAGTTGCTTTATTTTTTATAGCTATAAGATTATTGATTGGGTTAGGGGCTGGGACAGGTTGAACTGTTTATCCTCCTTTATCTAATTCGGTTTATCATTTTGGAGGGTCAGTTGATTTTGCTATTTTTAGTCTACATGTTGCGGGTGTTTCTTCTATTTTAGGTGCAATTAATTTTATTACTACGTGTTTAAAAGGTAAGGCAAATTATATTTTATCTTTTGAATTTCTTAATTTATTTGTTTGAGCAATGATTGTGACAAGATTTTTATTAGTTTTAAGTTTACCAGTGTTAGCCGGAGGTATTACTATGTTATTATTAGATCGAAACTTTGGTTCTTCTTTTTTTGATCCTAGAGGAGGGGGAAATCCT?????????????????????
Philodina_sp_gi|71840308|gb|DQ078601.1|                ?????????????????????????????CGGGTTTTTTAGGAGCTAGTATTAGATTAATTATTCGTACAGAATTAGGAATAGTTAGAAGAATTATTATAGATGAACAAATTTATAATTCTATAGTTACAGCTCATGCTTTTTTAATAATTTTTTTCTTTGTTATACCTGTTGCTGTAGGTGGTTTTGGAAATTGACTATTACCTTTAATAATAAATGTGATAGATATAGCTTTTCCTCGTCTAAATAATTTAAGATTTTGATTAGTTCCTGTAGCTTTATTATTTATAAGATTAAGATTATTAGTTGGATTAGGGCCTGGGACAGGATGAACAGTATATCCTCCTTTATCTAATTCTGTTTATCATTTTGGTGGTTCTATTGATTTAGCAATTTTTAGTTTACATGTTGCAGGAGTTTCTTCAATTTTAGGGGGAATTAATTTTATTACAACCTGTTTAAAAGGTAAAATTAGATATGTTTTATCATTAGAATTTTTAACTTTGTTTAGATGAGCAATAGTTGTTACAAGATTTTTATTAGTATTAAGTTTACCAGTTTTAGCTGGAGGAATTACAATATTATTATTAGATCGAAATTTTGGATCTTCTTTCTTTGATC?????????????????????????????????????????
Philodina_sp_gi|71840348|gb|DQ078621.1|                ?????????????????????????????CTGGATTTTTAGGTGCAAGTATAAGTTTAATTATTCGAACAGAATTAGGAATAGTAGGTAGAATTATTATAGATGAACAAATTTATAATGCTATAGTTACTGCTCATGCTTTTTTAATAATTTTTTTTTTTGTTATACCTGTTGCTGTTGGTGGTTTTGGAAATTGATTATTACCTTTAATAATGAATGTTATAGATATAGCTTTTCCTCGTTTAAATAACTTAAGATTTTGATTAGTGCCAGTAGCTTTGTTGTTTATATCTATAAGATTATTGGTTGGTTTAGGTGCAGGTACAGGCTGAACTGTGTACCCTCCATTATCAAATTCTGTTTATCATTTTGGAGGTTCTGTTGATTTAGCAATTTTTAGTTTACATGTGGCTGGTGTGTCTTCAATTTTAGGAGGAATTAATTTTATTACTACTTGTTTAAAGGGTAAAGTTAGGTATGTTTTATCATTTGAATTTTTAACTTTATTTGTTTGGGCTATAATTGTTACTAGATTTTCATTGGTTTTGAGGTTACCTGTTTTAGCTGGTGGAATTACTATATTATTATTAGATCGAAATTTTGGTTCTTCTTTTTTTGATC?????????????????????????????????????????
Philodina_vorax_gi|209405869|gb|EU751157.1|            AACTTTATATTTTATTATTGGTGTTTGATCGGGTTTTTTAGGAGCTAGAAATAGTTTAATTTTTCGTACTGAATTAGGTATAGTAGGAAGTATTATTATAGATGAACAAATTTATAATTCTATGGTT?CTGCTCACGCCTTTTTAA?GATTTTTTTTTTTGTTATCCCTGTTGCCGTAGGTGGATTTGGAAATTGATTATTCCCTTTAATAATAAATGTAATAGATATAGCTTTTCCTCGTTTAAATAATTTAAGTTTTTGATTGGTGCCGGTTGCTTTATTATTTATAAGTTTAAGATTATTAGTTGGGTTAGGGCCTGGACCAGGATGAACTGTATATCCTCCGTTATCAAATTCTGTTTATCATTTTGGAGGTT?TATTGATTTAGCTATTTTTAGTTTACATGTTGCTGGGGTTTCTTCTATTTTGGGTGGAATTAATTTTATTACTACTTGTATAAAAGGTAAGATTAGTTATGTTTTAAGATTTGAATATTTAACTTTATTTGTTTGAGCTATGATTGTAACTAGATTTTTATTAGTATTAAGTTTCCCAGTTTTAGCTGGTGGAATTACTATATTATTATTGGATCGTAATTTGGGTTCTTCTTTT????????????????????????????????????????????????
;
END;

BEGIN CHARACTERS;
[! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M18426]

	TITLE Polyarthra_spp_haplotype_alignment;
	LINK TAXA = Taxa4;
	DIMENSIONS NCHAR=661;
	FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -;

MATRIX
[                                                       10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220       230       240       250       260       270       280       290       300       310       320       330       340       350       360       370       380       390       400       410       420       430       440       450       460       470       480       490       500       510       520       530       540       550       560       570       580       590       600       610       620       630       640       650       660 ]
[                                                        .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         .         . ]
Polyarthra_dolichoptera_124PD5Timmels           AACTCTGTATTTTATTTTTGGTATA?GAGCAGG?TTTATTGGCCTCAGTATAAGACTTTTAATTCGCATAGAATTAGGAGTTGT?GGTACCTTTTTAGGTGATGAGCATTTATATAATGTTCTTGTCACCGCTCACGCTTTTGTTATAATTTTCTTCATGGTTATGCCTATCTCTATAGGAGGTTTTGGTAATTG?CTTATTCCTCTTATGCTTGGAGTCGCAGACATAGCTTTCCCTCGAATGAATAATCTTTCATTCTGACTTCTAATCCCTTCCTTCTTATTTCTACTTCTATCTAGAATTTTAGATGCTGGAGTAGGTACAGGATGAACTGTATACCCCCCTCTCTCTGATTCCAAGTACCATTCAGGTATTTCTGTTGATTTAGCTATCTTCAGACTGCATTTAGCGGGTATCTCTTCTATTTTAGGGAGAATTAACTTCCTTACAACAATTATTTGTTCTCGTACTACTAAATTGGTCTCGCTAGACCGTCTTCCTTTAATGCTT?GAGCATTAGCTGTGACAGCTGTATTGCTCATTACTAGACTCCCTGTGTTAGCAGGAG????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_141PD4Napfen            AACTCTGTATTTTATTTTTGGTATATGAGCAGGCTTTATTGGCCTCAGTATAAGACTTTTAATTCGCATAGAATTAGGAGTTGTTGGTACCTTTTTAGGGGA?GAGCATTTATATAATGTT?TTGTCACCGCTCACGCCTTTGTTATAATTTT?TTCATGGTTATGCCTATCTCTATAGGAGGTTTTGGTAAT?GACTTATTC?TCTTATGCTTGGAGTCGCAGACATAGCTTTCCCTCGAATGAATAACCTTTCATT?TGACTT?TAATCCCTTCCTTCTTATTT?TACTT?TATCTAGAATTTTAGATG??GGAGTAGGTAC?GGATGAACTG?ATACCCCCCTCTCT?TGATT?CAAGTACCATTCAGGTATTTCTGTTGATTTAGCTATCTTC?G?CT?CAT?T?GCGGGTAT?T?TTCTATTTTAGGG?GAATTAACTTCCTTACAACAATTATT?GTT?T?GTA?TACTAAATTGGTCTCGCTAGACCGTCTTCCTTTAATGCTTTGAGCATTAGCTGTGACAGCTGTATTGCTCATTACTAGACTCCCTGTGTTAGCAGGAGCTATTACCATGCTTCTTACTGATCGTAATTTCAACACTTCTTTCTTTGA???????????????????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_143PD3Kaltern           AACTCTTTACTTTATCTTTGGTATATGAGCAGGTTTCATTGGCCTAAGTATAAGACTCTTAATTCGTATAGAGTTAGGTGTAGTAGGCTCATTCTTAGGTGACGAGCACATTTATAATGTTCTTGTTACTGCCCACGCTTTTATTATAATCTTCTTCATAGTTATGCCTATTTCTATAGGTGGATTTGGAAACTGGCTTATTCCTCTTATGCTAGGAGTAGCTGACATAGCTTTCCCTCGCATGAATAATCTTTCTTTCTGACTTATTATTCCTTCTTTTCTACTACTTCTTTTATCAAGAGTCTTAGACGCAGGTGCAGGTACTGGATGAACTGTTTATCCCCCTCTTTCTGACTCTAAGTACCATTCAGGTATTTCAGTAGATTTAGCTATTTTTAGTCTTCATCTTGCTGGAGTTTCATCTATTCTCGGTAGAATTAATTTTCTTTCAACAATTATTTGCTCTCGAACAACTAAGATAATCTCTCTTGACCGTTTACCTTTATTCCTGTGATCTATATCTATCACTGCTATTCTATTAATCACAAGATTACCAGTATTGGCCGGAGCTATTACTATATTACTCACAGATCGAAACTTTAATACATCCTTCTTTGA???????????????????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_143PD4Kaltern           TACACTCTATTTTATCTTTGGTATCTGAGCCGGTTTTATTGGTCTTAGAATGAGACTTCTAATTCGTATGGAGCTAGGTGTTGTCGGGGCTTTCCTTGGCGACGAGCATCTTTATAACGTTTTAGTTACTGCTCATGCTTTTGTAATGATTTTCTTTATAACAATGCCTATTTCTATAGGTGGTTTTGGGAATTGACTTATTCCTCTTATGCTAGGTGTAGCTGATATGGCTTTCCCTCGTATGAACAATCTTTCTTTCTGGTTAATGGTTCCTTCTTTCATGTTTCTTTTACTGTCAAGAATTCTTGATGCTGGTGTTGGTACAGGCTGAACAGTATACCCTCCTCTATCAGACTCAAAATTTCATTCGGGCATTTCTGTAGATTTAGCTATCTTTAGACTTCATTTAGCTGGTGTTTCTTCAATTCTAGGGAGAATTAACTTTCTAACTACTATCATTTGTTCTCGTACTACTAAGTTGGTGTCTTTAGATCGCCTACCACTTTTACTCTGGGCTATGTCTGTTACTGCCGTTCTTCTAGTTACTAGACTTCCTGTTTTAGCAGGTGCTATTACTATGCTTCTAACAGATCGTAATTTTAATACTTCATTTTTTGAC??????????????????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_144PD1Madrano           TACGCTCTATTTTATTTTTGGTATCTGAGCTGGTTTCATTGGTCTTAGAATGAGACTTTTAATTCGTATGGAGCTAGGTGTTGTTGGGGCTTTCCTTGGTGACGAGCATCTTTACAATGTCTTAGTGACTGCCCACGCTTTTGTAATGATTTTCTTCATGACTATGCCTATTTCTATAGGTGGCTTTGGAAATTGACTAATTCCTCTTATGCTAGGTGTAGCTGATATGGCTTTTCCTCGTATGAACAATCTCTCTTTTTGGTTAATGGTCCCTTCTTTTATGTTTCTTCTGTTGTCAAGAATTCTGGATGCTGGTGTAGGTACAGGCTGAACAGTCTACCCGCCTCTGTCAGATTCAAAGTTCCACTCAGGGATCTCTGTAGATTTAGCCATCTTTAGGCTTCATTTGGCTGGGGTTTCTTCAATTTTAGGGAGAATTAACTTTCTAACTACTATTATTTGCTCACGTACAACTAAATTAGTATCTTTAGACCGCCTTCCTCTTATACTTTGGGCTCTGTCCGTCACTGCTGTTCTTCTAGTAACTAGACTTCCCGTTTTAGCTGGTGCTATTACTATGCTTTTAACAGATCGTAATTTTAATACCTCTTTCTTTGA???????????????????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_144PD2Madrano           TACTCTCTATTTTATTTTTGGTATTTGAGCTGGTTTTATTGGGTTAAGAATAAGACTTCTTATCCGTTTAGAGTTAGGTGTAGTAGGAGCCTTTTTAGGTGACGAGCATCTTTATAATGTAATTGTTACGGCTCACGCTTTTATCATGATCTTCTTTATAGTTATGCCTATTTCAATGGGTGGTTTTGGTAATTGACTTATTCCTCTTATGCTGGGTGTTGTTGATATAGCATTCCCACGTATGAATAATCTTTCATTTTGACTTTTAGTTCCTTCTTTCACTTTTCTTCTCCTTTCTAGAATTCTTGACGCTGGGGTTGGTACAGGTTGAACCGTTTACCCCCCTCTGTCTGATGCTAAGTATCATTCTGGTATTTCTGTTGATCTTGCTATTTTCAGTCTTCATTTAGCTGGTGTCTCTTCTATTTTAGGTAGAATCAATTTTCTTACTACTATTGTGTGTTCTCGTACTACTAAGCTAATCTCTTTGGATCGTTTACCTTTATTACTATGGGCTATCTCTATTACTGCTATCTTACTTATTACAAGACTTCCTGTTTTAGCCGGTGCCATCACA?TGTTGTTAACTGACCGTAATTTTAATACCTCGTTTTTTGAT??????????????????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_144PD3Madrano           TACGCTCTATTTTATTTTTGGTATCTGAGCTGGTTTCATTGGTCTTAGAATAAGGCTTTTAATTCGTATGGAGCTAGGTGTTGTTGGGGCTTTCCTTGGTGACGAGCATCTCTACAATGTCTTAGTGACTGCCCACGCTTTTGTAATGATTTTCTTCATGACTATGCCTATTTCTATAGGTGGCTTTGGAAACTGACTAATTCCTCTTATGCTAGGTGTAGCTGATATGGCTTTTCCTCGTATGAACAATCTCTCTTTTTGGTTAATAGTCCCTTCTTTTATGTTTCTTCTGTTGTCAAGAATCCTGGATGCTGGTGTAGGTACAGGTTGAACAGTCTACCCGCCTCTGTCAGATTCAAAGTTCCACTCAGGTATCTCTGTAGATTTAGCCATCTTCAGGCTTCATTTGGCTGGGGTTTCTTCAATTTTAGGAAGAATCAACTTTCTAACTACTATTATTTGCTCACGTACAACTAAATTAGTGTCTTTAGACCGTCTTCCTCTTATACTCTGGGCTCTATCCGTTACTGCTGTTCTTCTAGTGACTAGACTTCCCGTTTTAGCTGGTGCTATCACTATGCTTTTAACAGATCGTAACTTCAACACCTCTTTCTTTG????????????????????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_148PD2Bodensee          TACGCTCTATTTTATTTTTGGTATCTGAGCTGGTTTCATTGGTCTTAGAATGAGACTTTTAATTCGTATGGAGCTAGGTGTTGTTGGGGCTTTCCTTGGTGACGAGCATCTTTACAACGTCTTAGTGACTGCTCACGCTTTTGTAATGATTTTCTTTATGACTATACCTATTTCTATAGGTGGCTTTGGAAATTGACTAATTCCTCTTATGCTAGGTGTAGCTGATATGGCTTTTCCTCGTATGAACAATCTCTCTTTTTGGTTAATGGTCCCTTCTTTCATGTTTCTTCTGTTGTCAAGAATTCTGGATGCTGGTGTAGGTACAGGCTGAACAGTCTACCCGCCTCTGTCAGATTCAAAGTTCCACTCAGGGATCTCTGTAGATTTAGCCATCTTCAGGCTTCATTTGGCTGGGGTTTCTTCAATTTTAGGGAGAATTAACTTTCTAACTACTATTATTTGCTCACGTACTACTAAATTAGTGTCTTTAGACCGTCTTCCTCTTATACTTTGGGCTCTGTCCGTCACTGCTGTTCTGCTAGTAACTAGACTTCCCGTTTTAGCTGGTGCTATTACTATGCTTTTAACAGATCGTAACTTTAACACCTCTTTCTTTGA???????????????????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_148PD3Bodensee          TACGCTCTATTTTATTTTTGGTATCTGAGCTGGTTTCATTGGTCTTAGAATAAGGCTTTTAATTCGTATGGAGCTAGGTGTTGTTGGGGCTTTCCTTGGTGACGAGCATCTCTACAATGTCTTAGTGACTGCCCACGCTTTTGTAATGATTTTCTTCATGACTATGCCTATTTCTATAGGTGGCTTTGGAAACTGACTAATTCCTCTTATGCTAGGTGTAGCTGATATGGCTTTTCCTCGTATGAATAATCTCTCTTTTTGGTTAATAGTCCCTTCTTTTATGTTTCTTCTGTTGTCAAGAATCCTGGATGCTGGTGTAGGCACAGGTTGAACAGTCTACCCGCCTCTGTCAGATTCAAAGTTCCACTCAGGTATCTCTGTAGATTTAGCCATCTTCAGGCTTCATTTGGCTGGGGTTTCTTCAATTTTAGGAAGAATTAACTTTCTAACTACTATTATTTGCTCACGTACAACTAAATTAGTGTCTTTAGACCGTCTTCCTCTTATACTCTGGGCTCTATCCGTTACTGCTGTTCTTCTAGTGACTAGACTTCCCGTTTTAGCTGGTGCTATCACTATGCTTTTAACAGATCGTAACTTCAACACCTCTTTCTTTGA???????????????????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_148PD4Bodensee          TACACTTTATTTTATTTTTGGTATTTGAGCTGGGTTCATTGGTCTTAGTATAAGGCTTTTAATTCGTATGGAACTTGGGGTTGTTGGTGCCTTTTTAGGGGATGAACATCTTTATAATGTTCTCGTTACGGCTCATGCTTTTGTAATGATTTTCTTTATAACTATGCCTATTTCTATAGGTGGTTTTGGTAATTGATTAATTCCTCTTATGTTGGGGGTTGTTGATATGGCTTTTCCTCGCATGAACAATCTTTCTTTTTGACTTTTAGTTCCTTCTTTTATGTTCCTTCTTCTTTCTAGAATTTTAGATGCTGGGGTTGGTACTGGTTGAACTGTGTATCCTCCTCTTTCTGATTCTAAGTTTCACTCAGGGATTTCTGTTGATTTAGCTATTTTTAGACTTCATCTTGCAGGAATTTCATCAATTTTAGGTAGAATTAACTTTTTAACTACTATTGTGTGTTCTCGTACAACTAAGTTGGTTTCTCTTGATCGCTTACCTTTGCTTTTATGGGCTATGTCTGTCACAGCTATTCTTTTAATTACTAGACTTCCTGTTTTAGCAGGGGCTATTACTATGCTACTTACTGATCGTAATTTTAACACTTCTTTCTTTGA???????????????????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_148PD5Bodensee          TACTCTCTATTTTATTTTTGGTATTTGAGCTGGTTTTATTGGGTTAAGAATAAGACTTCTTATCCGTTTAGAGTTAGGTGTAGTAGGAGCCTTTTTAGGTGACGAGCATCTTTATAATGTAATTGTTACGGCTCACGCTTTTATCATGATTTTCTTTATAGTTATGCCTATTTCAATGGGTGGTTTTGGTAATTGACTTATTCCTCTTATGCTGGGTGTTGTTGATATAGCATTCCCACGTATGAATAATCTTTCATTTTGACTTTTAGTTCCTTCTTTCACTTTTCTTCTCCTTTCTAGAATTCTTGACGCTGGGGTTGGTACAGGTTGAACCGTTTACCCCCCTCTGTCTGATGCTAAGTATCATTCTGGTATTTCTGTTGATCTTGCTATTTTCAGTCTTCATTTAGCTGGTGTCTCTTCTATTTTAGGTAGAATCAATTTTCTTACTACTATTGTGTGTTCTCGTACTACTAAGCTAATCTCTTTGGATCGTTTACCTTTATTACTATGGGCTATCTCTATTACTGCTATCTTACTTATTACAAGACTTCCTGTTTTAGCCGGTGCCATCACAATGTTGTTAACTGACCGTAATTTTAATACCTCGTTTTTTGAT??????????????????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_152PD3Haidersee         TACGCTCTATTTTATTTTTGGTATCTGAGCTGGTTTCATTGGTCTTAGAATAAGGCTTTTAATTCGTATGGAGCTAGGTGTTGTTGGGGCTTTCCTTGGTGACGAGCATCTCTACAATGTCTTAGTGACTGCCCACGCTTTTGTAATGATTTTCTTCATGACTATGCCTATTTCTATAGGTGGCTTTGGAAACTGACTAATTCCTCTTATGCTAGGTGTAGCTGATATGGCTTTTCCTCGTATGAATAATCTCTCTTTTTGGCTAATAGTCCCTTCTTTTATGTTTCTTCTGTTGTCAAGAATTCTGGATGCTGGTGTAGGTACAGGTTGAACAGTCTACCCGCCTCTGTCAGATTCAAAGTTCCATTCAGGTATCTCTGTAGATTTAGCCATCTTCAGGCTTCATTTGGCTGGGGTTTCTTCAATTTTAGGAAGAATCAACTTTCTAACTACTATTATTTGCTCACGTACAACTAAATTAGTGTCTTTAGACCGTCTTCCTCTTATACTCTGGGCTCTATCCGTTACTGCTGTTCTTCTAGTGACTAGACTTCCCGTTTTAGCTGGTGCTATCACTATGCTTTTAACAGATCGTAACTTCAACACCTCTTTCTTTG????????????????????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_152PD6Haidersee         TACACTCTATTTTATCTTTGGTATCTGAGCCGGTTTTATTGGTCTTAGAATGAGACTTCTAATTCGTATGGAGCTAGGTGTTGTCGGGGCTTTCCTTGGCGACGAGCATCTTTATAACGTTTTAGTTACTGCTCATGCTTTTGTAATGATTTTCTTTATAACAATGCCTATTTCTATAGGTGGTTTTGGGAATTGACTTATTCCTCTTATGCTAGGTGTAGCTGATATGGCTTTCCCTCGTATAAACAATCTTTCTTTCTGGTTAATGGTTCCTTCTTTTATGTTTCTTTTATTGTCAAGAATTCTTGATGCTGGTGTTGGTACAGGCTGAACAGTATACCCTCCTCTATCAGACTCAAAATTTCATTCGGGTATTTCTGTAGATTTAGCTATCTTTAGACTTCATTTAGCTGGTGTTTCTTCAATTCTAGGGAGAATTAACTTTCTAACTACTATCATTTGTTCTCGTACTACTAAGTTGGTGTCTTTAGATCGCCTACCACTTTTACTCTGAGCCTTGTCTGTTACTGCCGTTCTTCTAGTTACTAGGCTTCCTGTTTTAGCAGGTGCTATTACTATGCTTCTAACAGATCGTAATTTTAATACTTCATTTTTTGATC?????????????????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_153PU7Donau             TACTCTCTATTTTATTTTCGGTATATGAGCCGGTTTCATTGGTTTAAGGATAAGATTCCTTATTCGAATGGAATTGGGTGTAGTAGGTACATTCCTAGGTGACGAGCACCTTTATAACGTTCTTGTTACTGCTCATGCTTTTGTTATGATTTTCTTTATAGTTATGCCTATTTCTATGGGTGGTTTCGGTAACTGACTTATTCCTCTTATACTAGGTGTAGCTGATATGGCTTTCCCTCGTATGAACAACCTTTCGTTTTGACTAATTGTCCCATCTTTCCTGCTACTATT?CTTTCTAGAATTC?AGACGCAGGTGCTGGTACCGGTTGAACAGTATATCCTCCCCTATCTGACTCTAAGTTCCATTCTGGAATTTCTGTAGACCTTGCCATTTTTAGTTTACATCTTGCTGGTATCTCTTCTATTCTTGGTAGAATCAATTTTCTTTCTACAATTATTTGTTCTCGAACAACCAAGCTTGTTTCTCTAGATCGTCTTCCTCTGATGCTATGAGCTCTAGC?GTCACAGCAGTTCTGCTGGTTACTAGACTACCTGTTCTAGCGGGGGCTATTACT?TG?TGCTCACTGAT?GTAACTTTAACACTTCTTTCTT?GAC??????????????????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_154PD1Cembra            TACGCTCTATTTTATTTTTGGTATCTGAGCTGGTTTCATTGGTCTTAGAATGAGACTTTTAATTCGTATGGAGCTAGGTGTTGTTGGGGCTTTCCTTGGTGACGAGCATCTTTACAATGTCTTAGTGACTGCCCACGCTTTTGTAATGATTTTCTTCATGACTATGCCTATTTCTATAGGTGGCTTTGGGAATTGACTAATTCCTCTTATGCTAGGTGTAGCTGATATGGCTTTTCCTCGTATGAATAATCTCTCTTTTTGGTTAATGGTCCCTTCTTTTATGTTTCTTCTGTTGTCAAGAATTCTGGATGCTGGTGTAGGTACAGGCTGAACAGTCTACCCGCCTCTGTCAGATTCAAAGTTCCACTCAGGGATCTCTGTAGATTTAGCCATCTTTAGGCTTCATTTGGCTGGGGTTTCTTCAATTTTAGGGAGAATTAACTTTCTAACTACTATTATTTGCTCACGTACAACTAAATTAGTATCTTTAGACCGCCTTCCTCTTATACTTTGGGCTCTGTCCGTCACTGCTGTTCTTCTAGTAACTAGACTTCCCGTTTTAGCCGGTGCTATTACTATGCTTTTAACAGATCGTAATTTTAATACCTCTTTCTTTGAT??????????????????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_158PD1Griessbachsee     AACTCTGTATTTTATTTTTGGTATATGAGCAGGCTTTATTGGCCTCAGTATAAGACTTTTAATTCGCATAGAATTAGGAGTTGTTGGTACCTTTTTAGGTGATGAGCATTTATATAATGTTCTTGTCACCGCTCACGCCTTTGTTA?AATTTTCTTCATGGTTATGCCTATCTCTATAGGAGGTTTTGGTAATTGACTTATTCCTCTTATGCTTGGAGTCGCAGACATAGCTTTCCCTCGAATGAATAACCTTTCATTCTGACTTCTAATCCCTTCCTTCTTATTTCTACTTCTATCTAGAATTTTAGATGCTGGAGTAGGTACAGGATGAACTGTATACCCCCCTCTCTCTGATTCCAAGTACCATTCAGGTATTTCTGTTGATTTAGCTATCTTCAGACTGCATTTAGCGGGTATCTCTTCTATTTTAGGGAGAATTAACTTCCTTACAACAATTATTTGTTCTCGTACTACTAAATTGGTCTCGCTAGACCGTCTTCCTTTAATGCTTTGAGCATTAGCTGTGACAGCTGTATTGCTCATTACTAGACTCCCTGTGTTAGCAGGAGCTATTA?T?T??TTCTTACTGATCGTAATTTCAACACTTCTTTCTTTGACCC????????????????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_160PD2Crespeina         TACTCTCTATTTTATTTTTGGTATTTGAGCTGGTTTTATTGGGTTAAGAATAAGACTTCTTATCCGTTTAGAGTTAGGTGTAGTAGGAGCCTTTTTAGGTGACGAGCATCTTTATAATGTAATTGTTACGGCTCACGCTTTTATTATGATTTTCTTTATAGTTATGCCCATTTCAATGGGTGGTTTTGGTAATTGACTTATTCCTCTTATGCTGGGTGTTGTTGATATAGCATTCCCACGTATGAATAATCTTTCATTTTGACTTTTAGTTCCTTCTTTCACTTTTCTTCTCCTTTCTAGAATTCTTGACGCTGGGGTTGGTACAGGTTGAACCGTTTACCCCCCTCTGTCTGATGCTAAGTATCATTCTGGTATTTCTGTTGATCTTGCTATTTTCAGTCTTCATTTAGCTGGTGTCTCTTCTATTTTAGGTAGAATCAATTTTCTTACTACTATTGTGTGTTCTCGTACTACTAAGCTAATCTCTTTAGATCGTTTACCTTTATTACTATGAGCTATCTCTATTACTGCTATCTTACTTATTACAAGACTTCCTGTTTTAGCCGGTGCCATCA???T?TTGTTAACTGACCGTAACTTTAATACCTCGTTTTTTGATCCCTCAGG??????????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_162PD1Valle             TACGCTCTATTTTATTTTTGGTATCTGAGCTGGTTTCATTGGTCTTAGAATGAGACTTTTAATCCGTATGGAGCTAGGTGTTGTTGGGGCTTTCCTTGGTGACGAGCATCTTTACAATGTCTTAGTGACTGCCCACGCTTTTGTAATGATTTTCTTCATGACTATGCCTATTTCTATAGGTGGCTTTGGAAATTGACTAATTCCTCTTATGCTAGGTGTAGCTGATATGGCTTTTCCTCGTATGAATAATCTCTCTTTTTGGTTAATGGTCCCCTCTTTTATGTTTCTTCTGTTGTCAAGAATTCTGGATGCTGGTGTAGGTACAGGCTGAACAGTCTACCCGCCTCTGTCAGATTCAAAGTTCCACTCAGGGATCTCTGTAGATTTAGCCATCTTTAGGCTTCATTTGGCTGGGGTTTCTTCAATTTTAGGGAGAATTAACTTTCTAACTACTATTATTTGCTCACGTACAACTAAATTAGTGTCTTTAGACCGCCTTCCTCTCATACTTTGGGCTCTGTCCGTCACTGCTGTTCTTCTAGTAACTAGACTTCCCGTTTTAGCTGGTGCTATTACTATGCTTTTAACAGATCGTAATTTTAATACCTCTTTCTTTGATCCTTCTGGAGGA??????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_163PD2Fennberg          TACTCTCTATTTTATTTTTGGTATTTGAGCTGGTTTTATTGGGTTAAGAATAAGACTTCTTATCCGTTTAGAGTTAGGTGTAGTAGGAGCCTTTTTAGGTGACGAGCATCTTTATAATGTAATTGTTACGGCTCACGCTTTTATCATGATTTTCTTTATAGTTATGCCTATTTCAATGGGTGGTTTTGGTAATTGACTTATTCCTCTTATGCTGGGTGTTGTTGATATAGCATTCCCACGTATGAATAATCTTTCATTTTGACTTTTAGTTCCTTCTTTCACTTTTCTTCTCCTCTCTAGAATTCTTGACGCTGGGGTTGGTACAGGTTGAACCGTTTACCCCCCTCTGTCTGATGCTAAGTATCATTCTGGTATCTCTGTTGATCTTGCTATTTTCAGTCTTCATTTAGCTGGTGTCTCTTCTATTTTAGGTAGAATCAATTTTCTTACTACTATTGTGTGTTCTCGTACTACTAAGCTAATCTCTTTGGATCGTTTACCTTTATTACTATGAGCTATCTCTATTACTGCTATCTTACTTATTACAAGACTTCCTGTTTTAGCCGGTGCCATCACAATGTTGTTAACTGACCGTAATTTTAATACCTCGTTTTTTGATCCCTCAGGAGG???????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_163PD8Fennberg          TACACTCTATTTTATCTTTGGTATCTGAGCCGGTTTTATTGGTCTTAGAATGAGACTTCTAATTCGTATGGAGCTAGGTGTTGTCGGGGCTTTCCTTGGCGACGAGCATCTTTATAACGTTTTAGTTACTGCTCATGCTTTTGTAATGATTTTCTTTATAACAATGCCTATTTCTATAGGTGGTTTTGGGAATTGACTTATTCCTCTTATGCTAGGTGTAGCTGATATGGCTTTCCCTCGTATAAACAATCTTTCTTTCTGGTTGATGGTTCCTTCTTTCATGTTTCTTTTACTGTCAAGAATTCTTGATGCTGGTGTTGGTACAGGCTGAACAGTATACCCTCCTCTATCAGACTCAAAATTTCATTCGGGCATTTCTGTAGATTTAGCTATCTTTAGACTTCATTTAGCTGGTGTTTCTTCAATTCTAGGGAGAATTAACTTTCTAACTACTATCATTTGTTCTCGTACTACTAAGTTGGTGTCTTTAGATCGCCTACCACTTTTACTCTGAGCTTTGTCTGTTACTGCCATTCTTCTAGTTACTAGACTTCCTGTTTTAGCAGGTGCTATTACTATGCTTCTAACAGATCGTAATTTTAATACTTCATTTTTTGACC?????????????????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_172PU1TerlagoKL         TACTCTTTACTTTATTTTTGGTGTCTGGGCTGGTTTTATTGGTCTTAGAATAAGTCTTCTAATTCGTTTAGAGTTAGGAGTTGTCGGTGCTTTCTTAGGTGATGAGCACCTTTATAATGTTATTGTAACAGCTCATGCTTTTATTATGATTTTCTTCATAGTTATGCCTATCTCTATGGGTGGCTTTGGTAATTGACTAATTCCTCTTATGTTAGGGGTCGTTGATATGGCCTTCCCTCGAATGAACAATCTTTCTTTTTGACTATTAGTTCCTTCCTTTACTTTCCTTCTGCTATCTAGAATCCTAGACGCTGGGGTTGGGACCGGTTGAACTGTGTACCCTCCTCTGTCTGATGCCAAATACCATTCTGGTATTTCTGTTGATCTTGCTATTTTCAGTCTTCATCTGGCCGGAGTCTCATCTATTCTGGGTAGAATTAATTTTCTTACAACAATTATCTGTTCTCGTACTACTAAGCTAATTTCTTTAGACCGCTTACCTTTACTGCTCTGAGCTATGTCTATTACAGCTATTCTACTTGTTACAAGTTTACCTGTTCTAGCTGGGGCTATTACTATGCT??TAACTGATCGTAACTTTAACACTTCATTTTTTG????????????????????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_173PD1TerlagoGR         TACTTTATATTTTATTTTTGGTATATGAGCAGGTTTTATTGGATTAAGAATGAGTTTATTAATTCGTATAGAGTTAGGTGTAGTTGGTGCTTTTTTAGGTGATGAGCATTTATATAATGTTTTAGTCACAGCTCATGCTTTTGTTATAATTTTTTTTATGGTCATGCCTATTTCTATAGGAGGTTTTGGTAATTGGCTTATTCCTCTTATGCTAGGGGTAGCTGATATAGCTTTTCCACGTATAAATAATTTATCTTTTTGGCTTTTAGTTCCATCTTTTATATTTTTGCTTTTATCTAGAATTTTAGATGCTGGTGTTGGTACTGGATGAACAGTTTACCCTCCACTGGCAGATGCTAAGTATCATTCAGGTATTTCTGTTGATTTGGCGATTTTTAGTCTTCATTTAGCTGGAGTTTCTTCTATTTTAGGAAGAATTAATTTTTTAACTACTATTATTTGTTCTCGTACTACAAAATTGATTTCTATAGATCGTCTACCTTTGTTATTATGAGCAATTTCAGTTACAGCTGTATTGTTAATTACAAGACTACCGGTTTTAGCTGGAGCTATTA???T?CTGTTAACTGATCGTAATTTTAATACATCGTTTTTTG????????????????????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_175PD1TerlagoKL         TACTCTTTATTTCATTTTTGGCATTTGAGCTGGTTTTATTGGTTTAAGAATAAGACTGCTTATTCGCTTAGAGTTGGGTGTAGTAGGAGCCTTTTTAGGTGACGAGCATCTTTATAATGTAATTGTTACGGCTCACGCCTTTATTATGATTTTCTTTATAGTTATACCTATTTCAATGGGTGGTTTTGGTAATTGGCTTATTCCTCTTATGTTGGGTGTCGCTGATATAGCATTTCCCCGTATGAATAATCTTTCATTTTGACTTTTAGTTCCTTCTTTCACTTTTCTTCTTCTTTCTAGAATTCTTGACGCTGGGGTAGGTACAGGTTGAACGGTCTATCCCCCTTTGTCCGATGCTAAGTATCACTCTGGTATTTCTGTTGACCTTGCTATTTTTAGTCTTCATTTAGCTGGTGTCTCTTCTATTTTAGGTAGAATCAATTTTCTTACTACTATTGTGTGTTCTCGTACGACTAAGTTAATCTCTTTAGATCGTTTACCTCTATTACTATGGGCTATGTCTATTACTGCTGTCTTACTTATTACAAGACTTCCTGTTTTAGCTGGTGCTATCACA?TGTTGTTAACTGATCGTAATTTTAATACCTCGTTTTTTGATCCCTCAGGAGG???????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_175PD6TerlagoKL         TACGCTCTATTTTATTTTTGGTATCTGAGCTGGTTTCATTGGTCTTAGAATAAGGCTTTTAATTCGTATGGAGCTAGGTGTTGTTGGGGCTTTCCTTGGTGACGAGCATCTCTACAATGTCTTAGTGACTGCCCACGCTTTTGTAATGATTTTCTTCATGACTATGCCTATTTCTATAGGTGGCTTTGGAAACTGACTAATTCCTCTTATGTTAGGTGTAGCTGATATGGCTTTTCCTCGTATGAATAATCTCTCTTTTTGGTTAATAGTCCCTTCTTTTATGTTTCTTCTGTTGTCAAGAATTCTGGATGCTGGTGTAGGTACAGGTTGAACAGTCTACCCGCCTCTGTCAGATTCAAAGTTCCACTCAGGTATCTCTGTAGATTTAGCCATCTTCAGGCTTCATTTGGCTGGGGTTTCTTCAATTTTAGGAAGAATCAACTTTCTAACTACTATTATTTGCTCACGTACAACTAAATTAGTGTCTTTAGACCGTCTTCCTCTTATACTCTGGGCTCTATCCGTTACTGCTGTTCTTCTAGTGACTAGACTTCCCGTTTTAGCTGGTGCTATCACTCTGCTTTTAACAGATCGTAACTTCAACACCTCTTTCTTTGATCCTTCTGGAGGA??????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_175PD8TerlagoKL         TACTCTCTATTTTATTTTTGGTATTTGAGCTGGTTTTATTGGGTTAAGAATAAGACTTCTTATCCGTTTAGAGTTAGGTGTAGTAGGAGCCTTTTTAGGTGACGAGCATCTTTATAATGTAATTGTTACGGCTCACGCTTTTATCATGATTTTCTTTATAGTTATGCCTATTTCAATGGGTGGTTTTGGTAATTGACTTATTCCTCTTATGCTGGGTGTTGTTGATATAGCATTCCCACGTATGAATAATCTTTCATTTTGACTTTTAGTTCCTTCTTTCACTTTTCTTCTCCTTTCTAGAATTCTTGACGCTGGGGTTGGTACAGGTTGAACCGTTTACCCCCCTCTATCTGATGCTAAGTATCATTCTGGTATTTCTGTTGATCTTGCTATTTTCAGTCTTCATTTAGCTGGTGTCTCTTCTATTTTAGGTAGAATCAATTTTCTTACTACTATTGTGTGTTCTCGTACTACTAAGCTAATCTCTTTGGATCGTTTACCTTTATTACTATGGGCTATCTCTATTACTGCTATCTTACTTATTACAAGACTTCCTGTTTTAGCCGGTGCCATCACAATGTTGTTAACTGACCGTAATTTTAATACCTCGTTTTTTGATCCCTCAGGAGGA??????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_178PD1Lamar             TACGCTCTATTTTATTTTTGGTATCTGAGCTGGTTTCATTGGTCTTAGAATAAGGCTTTTAATTCGTATGGAGCTAGGTGTTGTTGGGGCTTTCCTTGGTGACGAGCATCTCTACAATGTCTTAGTGACTGCCCACGCTTTTGTAATGATTTTCTTCATGACTATGCCTATTTCTATAGGTGGCTTTGGAAACTGACTAATTCCTCTTATGCTAGGCGTAGCTGATATGGCTTTTCCTCGTATGAATAATCTCTCTTTTTGGTTAATAGTCCCTTCTTTTATGTTTCTTCTGTTGTCAAGAATTCTGGATGCTGGTGTAGGCACAGGTTGAACAGTCTATCCACCTCTGTCAGATTCAAAGTTCCACTCAGGGATCTCTGTAGATTTAGCCATCTTCAGGCTTCATTTGGCTGGGGTTTCTTCAATTTTAGGAAGAATCAACTTTCTAACTACTATTATTTGCTCACGTACAACTAAATTAGTGTCTTTAGACCGTCTTCCTCTTATACTCTGGGCTCTATCCGTTACTGCTGTTCTTTTAGTAACTAGACTTCCCGTTTTAGCTGGTGCTATCACTATGCTTTTAACAGATCGCAACTTCAACACCTCTTTCTTTGATCCTTCTGGAGGA??????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_178PD2Lamar             TACTCTTTATTTCATTTTTGGCATTTGAGCTGGTTTTATTGGTTTAAGAATAAGACTGCTTATTCGCTTAGAGTTGGGTGTAGTAGGAGCCTTTTTAGGTGACGAGCATCTTTATAATGTAATTGTTACGGCTCACGCCTTTATTATGATTTTCTTTATAGTTATACCTATTTCAATGGGTGGTTTTGGTAATTGGCTTATTCCTCTTATGCTGGGTGTCGCCGATATAGCATTTCCCCGTATGAATAATCTTTCATTTTGACTTTTAGTTCCTTCTTTCACTTTTCTTCTTCTTTCTAGAATTCTTGACGCTGGGGTAGGTACAGGCTGAACGGTTTATCCCCCTTTGTCCGATGCTAAGTATCATTCTGGTATTTCTGTTGACCTTGCTATTTTCAGTCTTCATTTAGCTGGTGTCTCTTCTATTTTAGGTAGAATCAATTTTCTTACTACTATTGTGTGTTCTCGTACGACTAAGTTAATCTCTTTAGATCGTTTACCTTTATTACTATGGGCTATGTCTATTACTGCTGTCTTACTTATTACAAGACTTCCTGTTTTAGCTGGTGCTATCACA?TGTT?TTAACTGAT?GTAATTTTAATACCTCGTTTTTTGATCCCTCAGGA?????????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_178PD6Lamar             TACGCTCTATTTTATTTTTGGTATCTGAGCTGGTTTTATTGGTCTTAGAATAAGGCTTTTAATTCGTATGGAGCTAGGTGTTGTTGGGGCTTTCCTTGGTGACGAGCATCTCTACAATGTCTTAGTGACTGCCCACGCTTTTGTAATGATTTTCTTCATGACTATGCCTATTTCTATAGGTGGCTTTGGAAACTGACTAATTCCTCTTATGCTAGGTGTAGCTGATATGGCTTTTCCTCGTATGAATAATCTCTCTTTTTGGTTAATCGTTCCTTCTTTTATGTTTCTTCTGTTGTCAAGAATCCTGGATGCTGGTGTAGGTACAGGTTGAACAGTCTACCCGCCTCTGTCAGATTCAAAGTTCCACTCAGGTATCTCTGTAGATTTAGCCATCTTCAGGCTTCATTTGGCTGGAATTTCTTCAATTTTAGGAAGAATCAACTTTCTAACTACTATTATTTGCTCACGTACAACTAAATTAGTGTCTTTAGACCGTCTTCCTCTTATACTTTGGGCTCTATCCGTTACTGCTGTTCTTCTAGTGACTAGACTTCCCGTTTTAGCTGGTGCTATCACTATGCTTTTAACAGATCGTAACTTCAACACCTCTTTCTTTGATCCTTCTGGAGGA??????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_181PD1Tenno             TACTCTTTATTTCATTTTTGGCATTTGAGCTGGTTTTATTGGTTTAAGAATAAGACTTCTTATTCGCTTAGAGTTGGGTGTAGTAGGAGCCTTTTTAGGTGACGAGCATCTTTATAATGTAATTGTTACGGCTCACGCCTTTATTATGATTTTCTTTATAGTTATACCTATTTCAATGGGTGGTTTTGGTAATTGGCTTATTCCTCTTATGCTGGGTGTCGCTGATATAGCATTTCCCCGTATGAATAATCTTTCATTTTGACTTTTAGTTCCTTCTTTCACTTTTCTTCTTCTTTCTAGAATTCTTGACGCTGGAGTAGGTACAGGCTGAACGGTTTATCCCCCTTTGTCCGATGCTAAGTATCATTCTGGTATTTCTGTTGACCTCGCTATTTTCAGTCTTCATTTAGCTGGTGTCTCTTCTATTTTAGGTAGAATCAATTTTCTTACTACTATTGTGTGTTCTCGTACGACTAAGTTAATCTCTTTAGATCGTTTACCTTTATTACTATGGGCTATGTCTATTACTGCTGTCTTACTTATTACAAGACTTCCTGTTTTAGCTGGTGCTATCACAATGTTGTTAACTGATCGTAACTTTAATACCTCGTTTTTTGAT??????????????????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_183PD1Valle             TACTTTATATTTTATTTTTGGTATATGAGCAGGTTTTATTGGATTAAGAATGAGTTTATTAATTCGTATAGAGTTAGGTGTAGTTGGTGCCTTTTTAGGTGATGAGCATTTATATAATGTTCTAGTCACAGCTCATGCTTTTGTTATAATTTTTTTTATGGTCATGCCTATTTCTATAGGAGGTTTTGGTAATTGACTTATTCCTCTTATGCTAGGGGTAGCTGATATAGCTTTTCCACGTATAAATAATTTATCTTTTTGGCTTTTAGTTCCATCTTTTATATTTTTGCTTTTATCTAGAATTTTAGATGCTGGTGTTGGTACTGGATGAACAGTTTACCCCCCTCTAGCAGATGCTAAATATCATTCAGGTATTTCTGTTGATTTGGCGATTTTTAGTCTTCATTTAGCTGGAGTTTCTTCTATTTTAGGAAGAATTAATTTTTTAACTACTATTATTTGTTCTCGTACTACAAAATTGATTTCTATAGATCGTTTACCTTTGTTATTATGAGCAATTTCAGTTACAGCTGTATTGTTAATTACAAGATTACCTGTTTTAGCTGGAGCTATTACAATATTGTTAACTGATCGTAATTTTAATACATCGTTTTTTGAT??????????????????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_184PD1Lases             TACGCTCTATTTTATTTTTGGTATCTGAGCTGGTTTCGTTGGTCTTAGAATAAGGCTTTTAATTCGTATGGAGCTAGGTGTTGTTGGGGCTTTCCTTGGTGACGAGCATCTCTACAATGTCTTAGTGACTGCCCACGCTTTTGTAATGATTTTCTTCATGACTATGCCTATTTCTATAGGTGGCTTTGGAAACTGACTAATTCCTCTTATGCTAGGTGTAGCTGATATGGCTTTTCCTCGTATGAACAATCTCTCTTTTTGGTTAATAGTCCCTTCTTTTATGTTTCTTCTGTTGTCAAGAATCCTGGATGCTGGTGTAGGTACAGGTTGAACAGTCTACCCGCCTCTGTCAGATTCAAAGTTCCACTCAGGTATCTCTGTAGATTTAGCCATCTTCAGGCTTCATTTGGCTGGGGTTTCTTCAATTTTAGGAAGAATCAACTTTCTAACTACTATTATTTGCTCACGTACAACTAAATTAGTGTCTTTAGACCGTCTTCCTCTTATACTCTGGGCTCTATCCGTTACTGCTGTTCTTCTAGTGACTAGACTTCCCGTTTTAGCTGGTGCTATCACT?T??TTTTAACAGATCGTAACTTCAACACCTCTTTCTTTGAT??????????????????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_209PD3Durst             TACTCTTTATTTTATTTTTGGTATTTGAGCTGGTTTTATTGGTTTAAGAATAAGACTGCTTATTCGCTTAGAGTTGGGTGTAGTAGGAGCCTTTCTAGGTGACGAGCATCTTTATAATGTAATTGTTACGGCTCACGCCTTTATTATGATTTTCTTTATAGTTATACCTATTTCAATGGGTGGTTTTGGTAATTGGCTTATTCCTCTTATGCTGGGTGTCGCTGATATAGCATTTCCCCGTATGAATAATCTTTCATTTTGACTTTTAGTTCCTTCTTTCACTTTTCTTCTTCTTTCTAGAATTCTTGACGCTGGGGTAGGTACAGGCTGAACGGTTTATCCCCCTTTGTCCGATGCTAAGTATCATTCTGGTATTTCTGTTGACCTTGCTATTTTCAGTCTTCATTTAGCTGGTGTCTCTTCTATTTTAGGTAGAATCAATTTTCTTACTACTATTGTGTGTTCTCGTACGACTAAGTTAATCTCTTTAGATCGTTTACCTTTATTACTATGGGCTATGTCTATTACTGCTGTCTTACTTATTACAAGACTTCCTGTTTTAGCTGGTGCTATCACAATGTTGTTAACTGATCGTAATTTTAATACCTCGTTTTTTGA???????????????????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_214PD3Paneveggio        TACGCTCTATTTTATTTTTGGTATCTGAGCTGGTTTCATTGGTCTTAGAATGAGACTTTTAATTCGTATGGAGCTAGGTGTTGTTGGGGCTTTCCTTGGTGACGAGCATCTTTACAATGTCTTAGTGACTGCCCACGCTTTTGTAATGATTTTCTTCATGACTATGCCTATTTCTATAGGTGGCTTTGGAAATTGACTAATTCCTCTTATGCTAGGTGTAGCTGATATGGCTTTTCCTCGTATGAATAATCTCTCTTTTTGGCTAATGGTCCCTTCTTTTATGTTTCTTCTGTTGTCAAGAATTCTGGATGCTGGTGTAGGTACAGGCTGAACAGTCTACCCGCCTCTGTCAGATTCAAAGTTCCACTCAGGGATCTCTGTAGATTTAGCCATCTTTAGGCTTCATTTGGCTGGGGTTTCTTCAATTTTAGGGAGAATTAACTTTCTAACTACTATTATTTGCTCACGTACAACTAAATTAGTATCTTTAGACCGCCTTCCTCTTATACTTTGAGCTCTGTCCGTCACTGCTGTTCTTCTAGTAACTAGACTTCCCGTTTTAGCTGGTGCTATTACTATGCTTTTAACAGATCGTAATTTTAATACCTCTTTCTTTGATCCTTCTGGAGGAGGGAATCCAGTTCTTTATCAGCATTTATTT
Polyarthra_dolichoptera_2PD5Lases               TACTCTCTATTTTATTTTTGGTATTTGAGCTGGTTTTATTGGGTTAAGAATAAGACTTCTTATCCGTTTAGAGTTAGGTGTAGTAGGAGCCTTTTTAGGTGACGAGCATCTTTATAATGTAATTGTTACGGCTCACGCTTTTATTATGATTTTCTTTATAGTTATGCCTATTTCAATGGGTGGTTTTGGTAATTGACTTATTCCTCTTATGCTTGGTGTTGTTGATATAGCATTTCCACGTATGAATAATCTTTCATTTTGACTTTTAGTTCCTTCTTTCACTTTTCTTCTCCTTTCCAGAATTCTTGACGCTGGGGTTGGTACAGGTTGAACCGTTTACCCCCCTCTGGCTGATGCTAAGTACCATTCTGGTATTTCTGTTGATCTTGCTATTTTCAGTCTTCATTTAGCTGGTATTTCTTCTATTTTAGGTAGAATCAATTTCCTTACTACTATTGTGTGTTCTCGTACTACTAAGCTAATCTCTTTAGATCGTTTACCTTTATTACTATGAGCTATCTCTATTACTGCTATCTTACTTATTACAAGACTTCCTGTTTTAGCTGGTGCTATTACAATGTTGTTAACTGACCGTAATTTTAATACCTCGTTTTTTGATCCCTCAGGAGGAGGTAATCCTATTTTATATCAGCATTTATTT
Polyarthra_dolichoptera_45PD5Kofelrast          AACTCTGTATTTTATTTTTGGTATATGAGCAGGCTTTATTGGCCTCAGTATAAGACTTTTAATTCGCATAGAATTAGGAGTTGTTGGTACCTTTTTAGGTGATGAGCATTTATATAATGTTCTTGTCACCGCTCACGCTTTTGTTATAATTTTCTTCATGGTTATGCCTATCTCTATAGGAGGTTTTGGTAATTGACTTATTCCTCTTATGCTTGGAGTCGCAGACATAGCTTTCCCTCGAATGAATAATCTTTCATTCTGACTTCTAATCCCTTCCTTCTTATTTCTACTTCTATCTAGAATTTTAGATGCTGGAGCAGGTACAGGATGAACTGTATACCCTCCTCTCTCTGATTCCAAGTACCATTCAGGTATTTCTGTTGATTTAGCTATCTTCAGACTGCATTTAGCGGGTATCTCTTCTATTTTAGGGAGAATTAACTTCCTTACAACAATTATTTGTTCTCGTACTACTAAATTGGTCTCGCTAGACCGTCTTCCTTTAATGCTTTGAGCATTAGCTGTGACAGCTGTATTGCTCATTACTAGACTCCCTGTGTTAGCAGGAGCTATTACTATGCTTCTTACTGATCGTAATTTCAACACTTCTTTCTTTGACCCTTCAGGTGGAGGTAATCCTGTATTATACCAACACCTTTTT
Polyarthra_dolichoptera_48.1.PolyPresena        AACTCTGTATTTTATTTTTGGTATATGAGCAGGCTTTATTGGCCTCAGTATAAGACTTTTAATTCGCATAGAATTAGGAGTTGTTGGTACCTTTTTAGGTGATGAGCATTTATATAATGTTCTTGTCACCGCTCACGCTTTTGTTATAATTTTCTTCATGGTTATGCCTATCTCTATAGGGGGTTTTGGTAATTGACTTATTCCTCTTATGCTTGGAGTCGCAGACATAGCTTTCCCTCGAATGAATAATCTTTCATTCTGACTTCTAATCCCTTCCTTCTTATTTCTACTTCTATCTAGAATTTTAGATGCTGGAGCAGGTACAGGATGAACTGTATACCCTCCTCTCTCTGATTCCAAGTACCATTCAGGTATTTCTGTTGATTTAGCTATCTTCAGACTGCATTTAGCGGGTATCTCTTCTATTTTAGGGAGAATTAACTTCCTTACAACAATTATTTGTTCTCGTACTACTAAATTGGTCTCGCTAGACCGTCTTCCTTTAATGCTTTGAGCATTAGCTGTGACAGCTGTATTGCTCATTACTAGACTCCCTGTGTTAGCAGGAGCTATTACTATGCTTCTTACTGATCGTAATTTCAACACTTCTTTCTTTGACCCTTCAGGTGGAGGTAATCCTGTATTATACCAACACCTTTTT
Polyarthra_dolichoptera_49.1HPolyLagazuoi       TACACTCTATTTTATCTTTGGTATCTGAGCCGGTTTTATTGGTCTTAGAATGAGACTTCTAATTCGTATGGAGCTAGGTGTTGTCGGGGCTTTCCTTGGCGACGAGCATCTTTATAACGTTTTAGTTACTGCTCATGCTTTTGTAATGATTTTCTTTATAACAATGCCTATTTCTATAGGTGGTTTTGGGAATTGACTTATTCCTCTTATGTTAGGTGTAGCTGATATGGCTTTCCCTCGTATAAACAATCTTTCTTTCTGGTTAATGGTTCCTTCTTTCATGTTTCTTTTACTGTCAAGAATTCTTGATGCTGGTGTTGGTACGGGCTGAACAGTATACCCTCCTTTATCAGACTCAAAATTTCATTCTGGCATTTCTGTAGATTTAGCTATCTTTAGACTTCATTTAGCTGGTGTTTCTTCAATTCTAGGGAGAATTAACTTTCTAACTACTATCATTTGTTCTCGTACTACTAAGTTGGTGTCTTTAGATCGCCTACCACTTTTACTCTGAGCTTTGTCTGTTACTGCCGTTCTTCTGGTTACTAGACTTCCTGTTTTAGCAGGTGCTATTACTCTGCTTCTAACAGATCGTAATTTTAATACTTCATTTTTTGACCCTT??????????????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_49.3.PolyLagazuoi       TACACTCTATTTTATCTTTGGTATCTGAGCCGGTTTTATTGGTCTTAGAATGAGACTTCTAATTCGTATGGAGCTAGGTGTTGTCGGGGCTTTCCTTGGCGACGAGCATCTTTATAACGTTTTAGTTACTGCTCATGCTTTTGTAATGATTTTCTTTATAACAATGCCTATTTCTATAGGTGGTTTTGGGAATTGACTTATTCCTCTTATGCTAGGTGTAGCTGATATGGCTTTCCCTCGTATAAACAATCTTTCTTTCTGGTTAATGGTTCCTTCTTTCATGTTTCTTTTACTGTCAAGAATTCTTGATGCTGGTGTTGGTACGGGCTGAACAGTATACCCTCCTTTATCAGACTCAAAATTTCATTCTGGCATTTCTGTAGATTTAGCTATCTTTAGACTTCATTTAGCTGGTGTTTCTTCAATTCTAGGGAGAATTAACTTTCTAACTACTATCATTTGTTCTCGTACTACTAAGTTGGTGTCTTTAGATCGCCTACCACTTTTACTCTGAGCTTTGTCTGTTACTGCCGTTCTTCTAGTTACTAGACTTCCTGTTTTAGCAGGTGCTATTACTATGCTTCTAACAGATCGTAATTTTAATACTTCATTTTTTGACCCTTCTGGAGGTGGGAATCCAGTTCTGTACCAGCATTTATTC
Polyarthra_dolichoptera_50.10.PolyVahrn         TACGCTCTATTTTATTTTTGGTATCTGAGCTGGTTTCATTGGTCTTAGAATAAGGCTTTTAATTCGTATGGAGCTAGGTGTTGTTGGGGCTTTCCTTGGTGACGAGCATCTCTACAATGTCTTAGTGACTGCCCACGCTTTTGTAATGATTTTCTTCATAACTATGCCTATTTCTATAGGTGGCTTTGGAAACTGACTAATTCCTCTTATGCTAGGTGTAGCTGATATGGCTTTTCCTCGTATGAATAATCTCTCTTTTTGGTTAATAGTTCCTTCTTTTATGTTTCTTCTGTTGTCAAGAATTCTGGATGCTGGTGTAGGTACAGGTTGAACAGTCTACCCGCCTCTGTCAGATTCAAAGTTCCACTCAGGTATCTCTGTAGATTTAGCCATCTTCAGGCTTCATTTGGCTGGGGTTTCTTCAATTTTAGGAAGAATCAATTTTCTAACTACTATTATTTGCTCACGTACAACTAAATTAGTGTCTTTAGACCGTCTTCCTCTTATACTCTGGGCTCTATCCGTTACTGCTGTTCTTCTAGTGACTAGACTTCCCGTTTTAGCTGGTGCTATCACTATGCTTTTAACAGATCGTAACTTCAACACCTCTTTCTTTGATCCTTCTGGAGGAGGGAATCCAGTTCTTTATCAGCATTTATTT
Polyarthra_dolichoptera_53.1.PolySerraia        TACTTTATATTTTATTTTTGGTATATGAGCAGGTTTTATTGGATTAAGAATGAGTTTATTAATTCGTATAGAGTTAGGTGTAGTTGGTGCTTTTTTAGGTGATGAGCATTTATATAATGTTCTAGTCACAGCTCATGCTTTTGTTATAATTTTTTTTATGGTCATGCCTATTTCTATAGGAGGTTTTGGTAATTGGCTTATTCCTCTTATGCTAGGGGTAGCTGATATAGCTTTTCCACGTATAAATAATTTATCTTTTTGGCTTTTAGTTCCATCTTTTATATTTTTGCTTTTATCTAGAATTTTAGATGCTGGTGTTGGTACTGGATGAACAGTTTACCCCCCTCTGGCAGATGCTAAATATCATTCAGGTATTTCTGTTGATTTGGCGATTTTTAGTCTTCATTTAGCTGGAGTTTCTTCTATTTTAGGAAGAATTAATTTTTTAACTACTATTATTTGTTCTCGTACTACAAAATTGATTTCTATGGATCGTTTACCTTTGTTATTATGAGCAATTTCAGTTACAGCTGTATTGTTAATTACAAGATTACCTGTTTTAGCTGGAGCTATTACAATATTGTTAACTGATCGTAATTTTAATACATCGTTTTTTGATCCTTCTGGTGGAGGTAATCCTATTTTATATCAACATTTATTT
Polyarthra_dolichoptera_53.3.PolySerraia        AACTTTATATTTTATCTTTGGTATATGAGCAGGTTTTATTGGGCTTAGTATAAGGCTTTTAATTCGTATAGAGTTAGGAGTAGTAGGGTCTTTTCTAGGAGACGAGCACTTGTACAATGTGTTAGTGACAGCTCATGCTTTTATTATAATTTTCTTTATAGTTATGCCTATTTCTATAGGAGGATTTGGTAATTGATTAATTCCTCTTATGCTAGGAGTAGCAGATATAGCTTTCCCCCGCATGAATAATCTCTCATTTTGACTATTAGTTCCATCATTTCTCTTCTTATTGTTGTCTAGAGTATTAGATGCTGGGGTTGGAACAGGCTGAACAGTATATCCACCTCTGTCTGACTCTAAATATCATTCTGGTATTTCTGTAGATTTAGCTATTTTTAGACTACACTTAGCTGGAGTTTCCTCAATTTTAGGAAGGATTAATTTTCTTACTACAATTATTTGCTCCCGTACTACTAAACTGATCTCTTTAGACCGTTTACCTCTTATCTTGTGAGCTATCGCCGTTACTGCGATTCTGTTAATTACAAGGCTTCCAGTCTTAGCTGGAGCCATTACTATACTTTTAACAGATCGTAATTTTAATACATCCTTTTTTGACCCATCAGGTGGAGGTAACCCTTTATTATATCAGCATTTATTC
Polyarthra_dolichoptera_58.4.PolyCei            AACGCTTTACTTTATTTTTGGCATGTGAGCTGGTTTTATTGGTTTAAGAATAAGCCTTCTTATTCGTATAGAGTTGGGGGTCGTTGGTGCGTTCTTAGGGGATGAGCATCTTTATAACGTTATCGTTACAGCCCACGCTTTTATCATAATTTTCTTTATGGTTATGCCTATTTCTATGGGTGGTTTTGGGAATTGACTTATTCCTCTCATACTAGGCGTAGCCGATATAGCTTTTCCTCGTATAAATAATCTTTCCTTTTGGCTGCTAGTTCCATCGTTTTTATTCCTTTTATTGTCTAGAATTCTGGATGCAGGGGTGGGCACTGGGTGAACCGTTTACCCTCCTTTATCTGATGCAAAGTACCACTCTGGTATTTCTGTGGATTTAGCTATTTTTAGTCTTCATTTAGCCGGTATCTCATCAATTTTAGGGAGCATTAACTTTCTTACTACTATTATTTGTTCTCGCACAACAAAACTAGCATCTTTAGATCGTTTACCTCTCCTTCTATGGGCTATTTCAGTTACTGCAGTCCTGTTAATTACTAGTTTGCCTGTGTTGGCTGGAGCTATTACTATACTGCTTACTGATCGTAATTTTAACACATCTTTTTTTGACCCTTCAGGAGGAGGTAACCCTATTCTTTACCAGCATTTGTTC
Polyarthra_dolichoptera_58.6.PolyCei            AACTTTATATTTTATTTTCGGTATATGAGCAGGTTTTATTGGCCTTAGAATGAGACTTCTAATTCGTATAGAATTAGGGGTTGTCGGTACCTTTTTAGGTGACGAACATCTGTATAATGTTCTCGTCACAGCTCACGCTTTCGTTATGATTTTCTTCATGGTTATGCCTATCTCCATAGGAGGTTTCGGTAACTGACTCATCCCA?TCATGCTTGGGGTAGCAGATATAG?CTTTCCTCGAATGAATAATCTTTCATTCTGACTTCTTATTCCTTCCTTCTTATTCCTTCTTCTATCCAGAATCCTTGATGCTGGGGTAGGCACTGGATGAACTGTATACCCTCCCCTTTCAGACTCTAAATACCATTCAGGTATTTCTGTTGATTTGGCTATTTTTAGTTTACATCTCGCAGGTATCTCTTCTATTTTAGGTAGAATTAATTTTCTTACAACAATTATTTGTTCTCGAACAACTAAGTTAGTCTCTTTAGACCGCCTGCCTCTTATGCTTTGAGCTTTAGCAGTGACAGCTGTATTGCTTATTACAAGGCTTCCTGTACTTGCAGGAGCCATTACTATACTTCTAACTGATCGTAATTTCAACACTTCTTTCTTTGACCCCTCAGGTGGAGGTAATCCTGTATTATACCAACACCTTTTT
Polyarthra_dolichoptera_66PD6TovelA             TACACTCTATTTTATCTTTGGTATCTGAGCCGGTTTTATTGGTCTTAGAATGAGACTTCTAATTCGTATGGAGCTAGGTGTTGTCGGGGCTTTCCTTGGCGACGAGCATCTTTATAACGTTTTAGTTACTGCTCATGCTTTTGTAATGATTTTCTTTATAACAATGCCTATTTCTATAGGTGGTTTTGGGAATTGACTTATTCCTCTTATGCTAGGTGTAGCTGATATGGCTTTCCCTCGTATAAACAATCTTTCTTTCTGGTTAATGGTTCCTTCTTTCATGTTTCTTTTATTGTCAAGAATTCTTGATGCTGGTGTTGGTACAGGCTGAACAGTATACCCTCCTCTATCAGACTCAAAATTTCATTCGGGTATTTCTGTAGATTTAGCTATCTTTAGACTTCATTTAGCTGGTGTTTCTTCAATTCTAGGGAGAATTAACTTTCTAACTACTATCATTTGTTCTCGTACTACTAAGTTGGTGTCTTTAGATCGCCTACCACTTTTACTCTGAGCTTTGTCCGTTACTGCCGTTCTTCTAGTTACTAGGCTTCCTGTTTTAGCAGGTGCTATTACTATGCTTCTAACAGATCGTAATTTTAATACTTCATTTTTTGATCCTTCTGGAGGTGGTAATCCAGTTCTGTACCAGCATTTATTC
Polyarthra_dolichoptera_82PD4Corredo            AACGCTTTACTTCATTTTTGGCATATGGGCCGGTTTTATTGGTTTAAGGATGAGTCTTCTTATTCGCATAGAGTTAGGTGTTGTTGGTGCGTTCTTAGGTGATGAGCATCTCTATAACGTTATTGTCACAGCTCACGCTTTTATTATAATTTTCTTCATAGTGATACCTATTTCCATGGGTGGTTTTGGTAACTGGCTAATTCCTCTTATGTTAGGCGTAGCTGATATAGCTTTTCCTCGTATGAACAATCTTTCTTTTTGGTTGCTAGTCCCGTCGTTTTTATTCCTCCTATTGTCTAGGATTCTTGATGCAGGGGTAGGAACTGGGTGAACTGTTTATCCTCCTCTAGCAGATGCAAAGTATCATTCTGGCATTTCTGTAGACTTAGCTATTTTTAGTCTTCATCTAGCCGGTGTTTCATCAATTCTAGGGAGTATTAACTTTCTTACTACTATTATCTGTTCTCGTACTACGAAACTGGCGTCTTTAGATCGTCTGCCTCTCCTTTTGTGGGCTATTTCAGTTACTGCGGTTCTATTAATTACTAGTTTGCCTGTGCTGGCCGGGGCTATTACCATGTTGCTTACTGATCGCAACTTTAATACATCTTTTTTCGACCCCT??????????????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_85PD3Crescino2          AACTTTATACTTTATTTTCGGTATATGAGCAGGCTTTATTGGCCTTAGAATGAGACTTTTAATTCGTATAGAATTAGGAGTTGTCGGTACCTTTTTAGGTGATGAACATTTATATAATGTTCTTGTCACAGCTCACGCTTTCGTAATGATTTTCTTCATGGTTATACCTATTTCTATAGGAGGGTTTGGTAACTGACTTATTCCCCTCATGCTTGGTGTAGCAGACATGGCTTTCCCTCGAATGAATAATCTTTCATTCTGACTTCTTATTCCTTCTTTCTTATTCCTTCTTTTATCCAGAATTCTTGATGCTGGAGTTGGTACTGGATGAACAGTTTATCCTCCTCTTTCAGATTCTAAATACCATTCAGGTATTTCTGTAGATTTAGCTATTTTTAGTCTACATTTAGCAGGTATTTCTTCTATTTTAGGTAGAATTAATTTTCTTACAACAATTATTTGTTCTCGTACTACTAAGCTGGTTTCTCTAGACCGCTTACCTCTTATGCTCTGAGCCATAGCAGTCACAGCTGTTTTACTTATTACAAGGCTTCCTGTGTTAGCAGGAGCTATTACTATACTCTTAACTGAT??TAATTTCAACACTTCTTTCTTTG????????????????????????????????????????????
Polyarthra_dolichoptera_85PD4Crescino2          AACTTTATATTTTATTTTCGGTATATGAGCAGGCTTTATTGGCCTTAGAATGAGACTTTTAATTCGTATAGAATTAGGAGTTGTCGGTACCTTTTTAGGTGATGAACATTTATACAATGTTCTTGTCACAGCTCACGCTTTCGTAATGATTTTCTTCATGGTTATACCTATTTCTATAGGAGGGTTTGGTAACTGACTTATTCCCCTTATGCTTGGTGTAGCAGATATGGCTTTCCCTCGAATGAATAATCTTTCATTCTGACTTCTTATTCCTTCTTTCTTATTCCTTCTTTTATCCAGAATTCTTGATGCTGGAGTTGGTACTGGATGAACAGTTTATCCTCCTCTTTCAGATTCTAAATACCATTCAGGTATTTCTGTAGATTTAGCTATTTTTAGTCTACATTTAGCAGGTATTTCTTCTATTTTAGGTAGAATTAATTTTCTTACAACAATTATTTGTTCTCGTACTACTAAGCTGGTTTCCCTAGACCGCTTACCTCTTATGCTCTGAGCTATAGCAGTTACAGCTGTTCTACTTATTACAAGGCTTCCTGTGTTAGCAGGAGCTATTACCATGCTCTTAACTGAT?GTAATTTCAACACTTCTTTCTTTG????????????????????????????????????????????
Polyarthra_remata_DQ297789.1Polyrem             ?ACTCTTTATTTTATTTTCGGTATATGAGCTGGTTTCATTGGCCTTAGGATAAGATTTCTTATTCGTTTGGAACTAGGTGTTGTTGGTGCCTTCTTAGGTGATGAGCATCTATACAATGTACTAGTAACTGCTCATGCTTTTATTATGATTTTCTTCATGGTTATGCCTATCTCTATGGGTGGTTTTGGTAATTGACTAATTCCTCTTATGCTAGGTGTAGCTGACATGGCTTTCCCTCGAATGAACAATCTTTCTTTCTGGCTTCTGGTCCCCTCTTTCCTTCTCTTACTTCTTTCTAGAATTCTTGACGCAGGTGTAGGTACTGGTTGAACTGTGTATCCTCCTCTCTCCGATTCTAAGTACCATTCTGGAATCTCTGTAGATCTAGCTATTTTTAGACTTCATCTAGCAGGTGTTTCTTCTATTCTTGGTAGAATTAACTTCCTTTCTACTATTATTTGTTCACGTACAACAAAGCTTATTTCTCTAGATCGTCTCCCTCTTATGCTTTGAGCGATGTCTGTGACAGCTGTTCTTCTAGTTACTAGACTGCCTGTTCTAGCAGGTGCTATTACTATGCTTCTTACTGATCGTAATTTCAACACTTCTTTCTTTGATCCATCCGGTGGTGGTAATCCTGTTCTCTACCAGCATTTATTC
Polyarthra_remata_EU499866.1Polyrem             AACTCTTTACTTCATTTTTGGTATGTGAGCCGGCTTTATTGGTCTCAGAATAAGACTTCTTATTCGAATGGAGCTCGGTGTAGTAGGAACCTTTCTAGGTGACGAGCACCTCTACAATGTTTTGGTAACAGCTCATGCTTTTGTTATAATTTTCTTCATGGTGATACCTATTTCAATAGGTGGTTTTGGTAACTGGCTGATTCCACTTATGCTAGGAGTAGCTGACATGGCTTTCCCACGTATAAATAATCTTTCTTTTTGGCTATTAGTGCCTTCTTTTCTTTTTCTCTTGCTTTCTAGGATTCTAGATGCAGGGGTAGGGACAGGGTGAACTGTTTACCCTCCTCTTGCTGACTCAAAGTATCATTCAGGTATCTCTGTTGATCTGGCTATTTTTAGCCTACATCTTGCTGGTATCTCGTCTATTTTAGGGAGGATTAATTTTCTTACAACAATCATTTGTTCTCGTACTACGAAGCTCGTTTCTTTGGATCGTTTGCCTTTAATGCTGTGGGCATTAGCTGTGACGGCAGTCTTGTTGATTACTAGGCTTCCTGTATTAGCAGGAGCCATTACTATACTTTTAACTGATCGTAACTTCAATACATCTTTTTTTGACCCC?CAGG?GG???????????????????????????????
Polyarthra_vulgaris_153PU8Donau                 AACTCTTTACTTTATCTTTGGTATATGAGCAGGTTTCATTGGCCTAAGTATAAGGCTCTTAATTCGTATAGAGTTAGGTGTAGTAGGCTCATTCCTAGGTGACGAGCACATTTATAATGTTCTTGTTACTGCTCACGCTTTTATTATAATTTTCTTTATAGTTATGCCTATTTCTATAGGTGGATTTGGAAACTGGCTTATTCCTCTTATGTTAGGAGTAGCTGATATAGCTTTCCCTCGCATGAATAATCTTTCTTTCTGACTTATTATTCCTTCTTTTCTACTTCTTCTTTTATCAAGAGTCTTAGATGCAGGTGTAGGTACTGGATGGACTGTTTATCCCCCTCTTTCTGACTCTAAGTACCATTCAGGTATTTCAGTAGATTTAGCTATTTTTAGTCTTCATCTTGCTGGAGTTTCATCTATTCTGGGTAGAATTAATTTTCTTTCAACAATTATTTGCTCTCGAACAACTAAGATAATCTCTCTTGACCGTTTACCTTTATTCCTGTGATCTGTATCTATCACTGCTATT??ATTAATTACAAGATTACCAGTATTAGC?GGAGCTATTA?T?T?CTACTCACAGATCGAAACTTCAATACATCCTTCTTTGA???????????????????????????????????????????
Polyarthra_vulgaris_165PD4Ampola                AACTCTTTACTTTATCTTTGGTATATGAGCAGGTTTCATTGGCCTAAGTATAAGACTCTTAATTCGTATAGAGTTAGGTGTAGTAGGCTCATTCCTAGGTGACGAGCACATTTATAATGTTCTTGTTACTGCCCACGCTTTTATTATAATCTTCTTTATAGTTATGCCCATTTCTATAGGTGGATTTGGAAACTGGCTTATTCCTCTTATGCTAGGAGTAGCTGACATAGCTTTCCCTCGCATGAATAATCTTTCTTTCTGACTTATTATTCCTTCTTTTCTACTTCTTCTTTTATCAAGAGTCTTAGACGCAGGTGTAGGTACTGGATGAACTGTTTATCCCCCTCTTTCTGACTCTAAGTACCATTCAGGTATTTCAGTAGATTTAGCTATTTTTAGTCTTCATCTTGCTGGAGTTTCATCTATTCTCGGTAGAATTAATTTTCTTTCAACAATTATTTGCTCTCGAACAACTAAGATAATCTCTCTTGACCGTTTACCTTTATTCCTGTGATCTGTATCTATCACTGCTATTCTATT?ATCACAAGATTACCAGTATTAGCCGGAGCTATTA?T?T?TT?CTCACAGATCGAAACTTTAATACATCCTTCTTTGACCCTTCTG???????????????????????????????????
Polyarthra_vulgaris_174PD5TerlagoMI             AACTCTTTACTTTATCTTTGGTATATGAGCAGGTTTCATTGGCCTAAGTATAAGACTCTTAATTCGTATAGAGTTAGGTGTAGTAGGCTCATTCCTAGGTGACGAGCACATTTATAATGTTCTTGTTACTGCTCACGCTTTTATTATAATTTTCTTTATAGTTATGCCTATTTCTATAGGTGGATTTGGAAACTGGCTTATTCCTCTTATGTTAGGAGTAGCTGATATAGCTTTCCCTCGCATGAATAATCTTTCTTTCTGACTTATTATTCCTTCTTTTCTACTTCTTCTTTTATCAAGAGTCTTAGATGCAGGTGTAGGTACTGGATGAACTGTTTATCCCCCTCTTTCTGACTCTAAGTACCATTCAGGTATTTCAGTAGATTTAGCTATTTTTAGTCTTCATCTTGCTGGAGTTTCATCTATTCTGGGTAGAATTAATTTTCTTTCAACAATTATTTGCTCTCGAACAACTAAGATAATCTCTCTTGACCGTTTACCTTTATTCCTGTGATCTGTATCTATCACTGCTATTCTATTAATTACAAGATTACCAGTATTAGCCGGAGCTATTACTATGCTACTCACAGATCGAAACTTCAATACATCCTTCTTTGACCCTTC?GGA?????????????????????????????????
Polyarthra_vulgaris_188PD1Madrano               TACTCTTTATTTTATTTTTGGTCTTTGAGCTGGTTTTATTGGTTTAAGTATAAGTTTAATTATTCGTATGGAGTTAGGAGTAGTTGGTGCTTTTTTAGGTGATGAACATCTATACAATGTTTTAGTTACTGCTCACGCTTTTATTATAATTTTTTTTATAGTTATGCCTATTTCTATAGGTGGGTTTGGTAATTGGTTGATCCCTTTAATACTTGGGGTTGCAGATATAGCTTTTCCTCGAATGAATAATTTATCTTTTTGACTTTTAGTTCCTTCTTTCGCTTTTTTATTATTATCTAGAATTTTAGATGCAGGGGTTGGAACAGGTTGAACAGTTTACCCTCCTCTCTCTGATGCTAAATTTCATTCAGGTATTTCTGTTGATTTAGCTATTTTTAGGCTTCATTTAGCTGGAATTTCTTCTATTTTAGGAAGAATTAATTTTCTTACAACTATTATTTGTTCTCGTACTACTAAATTAATTTCTTTAGATCGCTTACCTCTTATATTATGGGCAATAGCAGTCACTGCAGTGCTTTTGATTACTAGATTACCTGTGTTAGCAGGTGCTATTACTATACTTCTTACTGATCGTAATTTTAATACTTCTTTTTTTGACCCTTCTGGTGGAGGAAATCCTGTTTTATATCAACATTTATTT
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END;
BEGIN TREES;
      TITLE Pleu_all;
      LINK TAXA = Taxa1;
         TRANSLATE
            1    Pleuretra_lineata_M9PL1COID,
            2    Pleuretra_lineata_MO17PL14COI,
            3    Pleuretra_lineata_CZ1PL1COI,
            4    Pleuretra_lineata_CZ1PL23COI,
            5    Pleuretra_lineata_CZ1PL27COI,
            6    Pleuretra_lineata_S91PLP,
            7    Pleuretra_lineata_SP1PL19COI,
            8    Pleuretra_lineata_MO17PL9COI,
            9    Pleuretra_lineata_S83B1P,
            10   Pleuretra_lineata_M25PL5,
            11   Pleuretra_lineata_M25PL7,
            12   Pleuretra_lineata_M25PL8,
            13   Pleuretra_lineata_A447_PL4_COI,
            14   Pleuretra_lineata_A447_PL5_COI,
            15   Pleuretra_lineata_CZ1PL12COI,
            16   Pleuretra_lineata_A447_PL3_COI,
            17   Pleuretra_lineata_A447_PL1_COI,
            18   Pleuretra_lineata_MO17PC3,
            19   Pleuretra_lineata_MO17PC4,
            20   Pleuretra_lineata_MO17PC7;
      TREE PleuBEASTb = [&R] (((6:0.8554543557,2:0.8554543557):13.0687937,((((5:0.137130552,(4:0.0534554971,15:0.0534554971):0.08367505486):0.02381923437,3:0.1609497863):0.6880965571,(10:0.1697299571,(11:0.094983321,12:0.094983321):0.07474663606):0.6793163864):6.067646455,((17:0.4064247793,(16:0.2073135474,(13:0.02860942046,(1:0.01501435669,14:0.01501435669):0.01359506377):0.1787041269):0.199111232):1.942728519,(((8:0.02868031359):0.1220042235,(20:0.1486901056,18:0.1486901056):0.001994431501):0.01608885981,19:0.1667733969):2.182379901):4.567539501):7.007555258):9.055185095,7:22.97943315);
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END;
BEGIN TREES;
      TITLE Brap_all;
      LINK TAXA = Taxa2;
         TRANSLATE
            1    Brachionus_plicatilis_gi|400179462|gb|JX239171.1|,
            2    Brachionus_plicatilis_gi|400179458|gb|JX239169.1|,
            3    Brachionus_plicatilis_gi|400179454|gb|JX239167.1|,
            4    Brachionus_plicatilis_gi|400179450|gb|JX239165.1|,
            5    Brachionus_rotundiformis_gi|400179446|gb|JX239163.1|,
            6    Brachionus_ibericus_gi|400179438|gb|JX239159.1|,
            7    Brachionus_plicatilis_gi|400179434|gb|JX239157.1|,
            8    Brachionus_plicatilis_gi|400179430|gb|JX239155.1|,
            9    Brachionus_plicatilis_gi|400179426|gb|JX239153.1|,
            10   Brachionus_plicatilis_gi|400179422|gb|JX239151.1|,
            11   Brachionus_plicatilis_gi|400179418|gb|JX239149.1|,
            12   Brachionus_plicatilis_gi|400179410|gb|JX239145.1|,
            13   Brachionus_plicatilis_gi|400179406|gb|JX239143.1|,
            14   Brachionus_plicatilis_gi|400179402|gb|JX239141.1|,
            15   Brachionus_plicatilis_gi|400179460|gb|JX239170.1|,
            16   Brachionus_plicatilis_gi|400179456|gb|JX239168.1|,
            17   Brachionus_plicatilis_gi|400179452|gb|JX239166.1|,
            18   Brachionus_plicatilis_gi|400179448|gb|JX239164.1|,
            19   Brachionus_plicatilis_gi|400179440|gb|JX239160.1|,
            20   Brachionus_plicatilis_gi|400179436|gb|JX239158.1|,
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      TREE BrapRAxML = [&R] (124:1.0,(((118:0.006767,117:0.006767,116:0.006767):0.022988,19:0.029755):0.961953,((52:0.031832,115:0.031832):0.950055,(((((109:0.758832,(((87:0.314316,((49:0.006029,47:0.006029,110:0.006029):0.008468,5:0.014497):0.299819):0.160171,(50:0.314199,(75:0.240255,(86:0.075322,74:0.075322):0.164933):0.073944):0.160288):0.155482,(71:0.067482,(73:0.019316,72:0.019316):0.048166):0.562487):0.128863):0.03531,(((((82:0.042809,126:0.042809):0.367859,(125:0.215743,(12:0.026419,25:0.026419):0.189324):0.194926):0.180109,((119:0.050859,(80:0.008074,81:0.008074):0.042785):0.044624,((28:0.016795,14:0.016795):0.02016,26:0.036955,(13:0.008709,27:0.008709):0.028245):0.058528):0.495295):0.063473,(44:0.08381,((58:0.006541,37:0.006541):0.074267,70:0.080808,(41:0.07998,((69:0.07792,(((((83:0.006103,3:0.006103):0.036239,(65:0.035081,((18:0.001537,4:0.001537):0.014613,((66:0.004583,67:0.004583,17:0.004583):0.00509,68:0.009673):0.006477):0.018931):0.007261):0.02071,(((91:0.002911,85:0.002911):0.011175,((30:0.00665,(32:0.004393,29:0.004393):0.002256):0.004913,1:0.011563):0.002523,31:0.014086):0.005561,(107:0.00927,(96:0.007379,(103:0.005389,97:0.005389):0.00199,(106:0.005739,105:0.005739,101:0.005739,100:0.005739,108:0.005739):0.00164,99:0.007379):0.001891):0.010377,104:0.019647,102:0.019647,98:0.019647):0.043404):0.004554,84:0.067606):0.007272,(62:0.022445,((53:0.008061,(128:0.001444,42:0.001444):0.006617):0.002163,39:0.010224,(33:0.003673,90:0.003673):0.006551,54:0.010224):0.012221):0.052432):0.003042):6.52E-4,15:0.078572):0.001408):8.28E-4,(16:0.031849,(43:0.004731,127:0.004731):0.027118,(55:0.010675,(56:0.003783,34:0.003783):0.006891,40:0.010675):0.021174,(38:0.011951,(61:0.006218,60:0.006218,(59:0.003271,64:0.003271):0.002947):0.005732):0.019898,63:0.031849,(57:0.018814,(2:0.009856,35:0.009856,36:0.009856):0.008958,45:0.018814):0.013035):0.048959):0.003002):0.57044):0.067186,(92:0.18222,(93:0.052872,((51:0.007845,129:0.007845):0.014701,(95:0.019778,94:0.019778,(89:0.006083,46:0.006083):0.013695):0.002767):0.030326):0.129348):0.539217):0.072705):0.02248,(((((111:0.011868,112:0.011868,23:0.011868,121:0.011868):0.357608,11:0.369476):0.095298,10:0.464774):0.186993,24:0.651767):0.072608,(((7:0.005076,20:0.005076):0.01266,120:0.017736):0.407332,(79:0.030076,(77:0.013167,78:0.013167):0.016909):0.394992):0.299307):0.092247):0.022994,(((21:0.038866,(9:0.030457,22:0.030457):0.00841):0.009815,88:0.048682,8:0.048682):0.581877,76:0.630559):0.209057):0.054746,(6:0.075345,((113:0.00909,122:0.00909):0.051667,(114:0.016955,(48:0.002537,123:0.002537):0.014418):0.043802):0.014587):0.819017):0.087525):0.009822):0.008291);



END;
BEGIN TREES;
      TITLE Rota_all;
      LINK TAXA = Taxa6;
         TRANSLATE
            1    Rotaria_citrina_RcitrRCA3891,
            2    Rotaria_macroceros_A446RM04COI,
            3    Rotaria_macroceros_A446RM05COI,
            4    Rotaria_rotatoria_RrotaA305RRC2,
            5    Rotaria_rotatoria_RrotaA313RR,
            6    Rotaria_rotatoria_RrotaA336RRC,
            7    Rotaria_rotatoria_RrotaA363RR1,
            8    Rotaria_rotatoria_RrotaA405a,
            9    Rotaria_rotatoria_RrotaGiribet,
            10   Rotaria_rotatoria_RrotaKS5D5,
            11   Rotaria_rotatoria_RrotaMX5S4B1,
            12   Rotaria_rotatoria_RrotaNF2P3C1c,
            13   Rotaria_rotatoria_RrotaRRA382b,
            14   Rotaria_rotatoria_RrotaRRA389b,
            15   Rotaria_rotatoria_RrotaTZ2SID6,
            16   Rotaria_rotatoria_A435R04COI,
            17   Rotaria_rotatoria_A441R01COI,
            18   Rotaria_rotatoria_A441R02COI,
            19   Rotaria_rotatoria_A443R01COI,
            20   Rotaria_rotatoria_A443R03COI,
            21   Rotaria_rotatoria_A444R05COI,
            22   Rotaria_rotatoria_A444R06COI,
            23   Rotaria_rotatoria_A444R07COI,
            24   Rotaria_rotatoria_A444R08COI,
            25   Rotaria_rotatoria_A444R14COI,
            26   Rotaria_rotatoria_RrotaA466RR2,
            27   Rotaria_rotatoria_RrotaA466RR6,
            28   Rotaria_rotatoria_RrotaA466RR4,
            29   Rotaria_rotatoria_RrotaA466RR3,
            30   Rotaria_rotatoria_A486BD14Rrota,
            31   Rotaria_macroceros_A487RO01,
            32   Rotaria_macroceros_A487RO02,
            33   Rotaria_rotatoria_A489RR1COI,
            34   Rotaria_rotatoria_A470RR07COI,
            35   Rotaria_rotatoria_A470RR01COI,
            36   Rotaria_rotatoria_A469RL2COI,
            37   Rotaria_rotatoria_A469RR04COI,
            38   Rotaria_rotatoria_A468RR11COI,
            39   Rotaria_rotatoria_A468RX07COI,
            40   Rotaria_rotatoria_A480RR5COI,
            41   Rotaria_sordida_A445S02COI,
            42   Rotaria_rotatoria_A587RR1,
            43   Rotaria_rotatoria_A601RR6,
            44   Rotaria_rotatoria_A602RR2,
            45   Rotaria_rotatoria_A537RR2,
            46   Rotaria_rotatoria_A537RR3,
            47   Rotaria_rotatoria_A539RR3,
            48   Rotaria_rotatoria_A539RR5,
            49   Rotaria_rotatoria_A560RR8,
            50   Rotaria_rotatoria_A562RR1,
            51   Rotaria_rotatoria_A563RR1,
            52   Rotaria_rotatoria_A566RR6,
            53   Rotaria_rotatoria_A568RR1,
            54   Rotaria_rotatoria_A570RR1,
            55   Rotaria_magnacalcarata_A595RMN1,
            56   Rotaria_rotatoria_A672RR4,
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END;
BEGIN TREES;
      TITLE Poly_all;
      LINK TAXA = Taxa4;
         TRANSLATE
            1    Polyarthra_dolichoptera_48.1.PolyPresena,
            2    Polyarthra_dolichoptera_45PD5Kofelrast,
            3    Polyarthra_dolichoptera_82PD4Corredo,
            4    Polyarthra_dolichoptera_85PD3Crescino2,
            5    Polyarthra_dolichoptera_85PD4Crescino2,
            6    Polyarthra_dolichoptera_58.6.PolyCei,
            7    Polyarthra_dolichoptera_49.3.PolyLagazuoi,
            8    Polyarthra_dolichoptera_66PD6TovelA,
            9    Polyarthra_dolichoptera_49.1HPolyLagazuoi,
            10   Polyarthra_dolichoptera_50.10.PolyVahrn,
            11   Polyarthra_dolichoptera_53.3.PolySerraia,
            12   Polyarthra_remata_DQ297789.1Polyrem,
            13   Polyarthra_dolichoptera_53.1.PolySerraia,
            14   Polyarthra_dolichoptera_2PD5Lases,
            15   Polyarthra_dolichoptera_58.4.PolyCei,
            16   Polyarthra_remata_EU499866.1Polyrem,
            17   Polyarthra_dolichoptera_124PD5Timmels,
            18   Polyarthra_dolichoptera_141PD4Napfen,
            19   Polyarthra_dolichoptera_143PD3Kaltern,
            20   Polyarthra_dolichoptera_143PD4Kaltern,
            21   Polyarthra_dolichoptera_144PD1Madrano,
            22   Polyarthra_dolichoptera_144PD2Madrano,
            23   Polyarthra_dolichoptera_144PD3Madrano,
            24   Polyarthra_dolichoptera_148PD2Bodensee,
            25   Polyarthra_dolichoptera_148PD3Bodensee,
            26   Polyarthra_dolichoptera_148PD4Bodensee,
            27   Polyarthra_dolichoptera_148PD5Bodensee,
            28   Polyarthra_dolichoptera_152PD3Haidersee,
            29   Polyarthra_dolichoptera_152PD6Haidersee,
            30   Polyarthra_dolichoptera_153PU7Donau,
            31   Polyarthra_vulgaris_153PU8Donau,
            32   Polyarthra_dolichoptera_154PD1Cembra,
            33   Polyarthra_dolichoptera_158PD1Griessbachsee,
            34   Polyarthra_dolichoptera_160PD2Crespeina,
            35   Polyarthra_dolichoptera_162PD1Valle,
            36   Polyarthra_dolichoptera_163PD2Fennberg,
            37   Polyarthra_dolichoptera_163PD8Fennberg,
            38   Polyarthra_vulgaris_165PD4Ampola,
            39   Polyarthra_dolichoptera_178PD1Lamar,
            40   Polyarthra_dolichoptera_178PD2Lamar,
            41   Polyarthra_dolichoptera_178PD6Lamar,
            42   Polyarthra_dolichoptera_181PD1Tenno,
            43   Polyarthra_dolichoptera_183PD1Valle,
            44   Polyarthra_dolichoptera_184PD1Lases,
            45   Polyarthra_vulgaris_188PD1Madrano,
            46   Polyarthra_dolichoptera_209PD3Durst,
            47   Polyarthra_dolichoptera_214PD3Paneveggio,
            48   Polyarthra_dolichoptera_173PD1TerlagoGR,
            49   Polyarthra_vulgaris_174PD5TerlagoMI,
            50   Polyarthra_dolichoptera_175PD1TerlagoKL,
            51   Polyarthra_dolichoptera_175PD6TerlagoKL,
            52   Polyarthra_dolichoptera_175PD8TerlagoKL,
            53   Polyarthra_dolichoptera_172PU1TerlagoKL;
      TREE PolyBEASTb = [&R] (((53:29.9071933,(((18:0.08595198776,33:0.08595198776):0.2894981593,(17:0.2785828843,(1:0.1253698918,2:0.1253698918):0.1532129924):0.09686726279):12.48522491,((50:0.6520037597,51:0.6520037597):3.653480852,47:4.305484612):8.555190448):17.04651824):9.101986831,(((22:0.7899347019,19:0.7899347019):1.01293047,(31:0.2804658826,25:0.2804658826):1.52239929):21.91814877,45:23.72101394):15.28816619):6.841231173,(((((43:0.2637573739,44:0.2637573739):1.061846914,24:1.325604288):18.38085969,35:19.70646397):12.22738189,((((((36:0.4253690391,40:0.4253690391):0.0625353386,26:0.4879043777):0.1286025874,42:0.6165069651):3.792321642,(14:0.9423051743,(34:0.6068056387,(((27:0.1803966109,:0.1803966109):0.04021557445,28:0.2206121854):0.09770074207):0.2884927113):0.3354995356):3.466523433):5.608018694,23:10.0168473):21.45478737,(49:8.696546069,46:8.696546069):22.7750886):0.4622111916):5.705426512,(((((((37:0.6538455873,(32:0.5798206821,21:0.5798206821):0.07402490523):0.05041935466):0.7757934164,((((:0.08684857892):0.1888629758,:0.2757115547):0.275457196,(41:0.5134019472,((:0.05693093111):0.3953132709):0.06115774523):0.03776680353):0.2473086315,39:0.7984773822):0.6815809762):0.6195096965):6.345867537,(((7:0.1301450923,9:0.1301450923):1.562209099,((29:0.3635727335,48:0.3635727335):0.6452058755,:1.008778609):0.6835755828):0.142237504,20:1.834591696):6.610843896):12.14581662):6.148432893,(52:22.21853066,30:22.21853066):4.521154442):10.89958727):8.21113893);
      TREE PolyBEASTr = [&R] (((((31:0.1226120577,25:0.1226120577):0.3009315536,(19:0.1899383029,22:0.1899383029):0.2336053085):10.51770304,45:10.94124665):3.90685135,(53:10.57268228,((47:3.837064377,(51:0.4451630065,50:0.4451630065):3.391901371):1.635262661,((17:0.2149795537,(18:0.07739748069,33:0.07739748069):0.137582073):0.1268488113,(2:0.1578366398,1:0.1578366398):0.1839917252):5.130498674):5.100355237):4.275415722):0.8440891313,((((49:5.149487783,46:5.149487783):7.873544175,(23:9.199611822,((14:0.8523664344,((36:0.1877986818,(28:0.1101302263,(27:0.03423797362,:0.03423797362):0.07589225266):0.07766845547):0.1185910504,34:0.3063897322):0.5459767022):1.111179274,(((40:0.2486629079):0.02011435636,26:0.2687772643):0.1445824028,42:0.4133596671):1.550186042):7.236066114):3.823420136):1.655120274,(((43:0.1510043724,44:0.1510043724):0.4851260517,24:0.636130424):6.971512819,35:7.607643243):7.070508989):0.5472026003,((52:6.811639816,30:6.811639816):5.883021236,(((((((32:0.2060502768,37:0.2060502768):0.1019085744,21:0.3079588513):0.03089502221,:0.3388538735):0.4612648624):0.1807727799,(((41:0.1777118008,((:0.06192106824):0.08424944668,:0.1461705149):0.0315412859):0.03703647387,((:0.1825425837):0.005403178861):0.02680251212):0.2821554595,39:0.4969037342):0.4839877816):3.917147156,(((20:0.2852067504):0.02752314237,(9:0.07021371088,7:0.07021371088):0.2425161819):0.2316748195,(29:0.1876862796,48:0.1876862796):0.3567184327):4.353633959):5.904942116):1.891680265):2.53069378):0.4668322962);
      TREE PolyBEASTs = [&R] ((((35:8.749077812,(24:0.6731071469,(43:0.1005894763,44:0.1005894763):0.5725176706):8.075970665):5.909035756,((23:9.974238035,(((26:0.473882912,(40:0.1212326464,36:0.1212326464):0.3526502656):0.1568512409,42:0.6307341528):1.784978856,(((((22:0.08418632154,27:0.08418632154):0.03142362944,28:0.115609951):0.06435804283):0.1701679564,34:0.3501359502):0.4324815502,14:0.7826175004):1.633095508):7.558525026):3.617634307,(46:4.37018688,49:4.37018688):9.221685461):1.066241227):1.551801598,((((((9:0.08061963697,7:0.08061963697):0.1212759171,(20:0.1952545625,37:0.1952545625):0.006640991539):0.0461323832,(48:0.1033322838,29:0.1033322838):0.1446956534):4.95916103,(((((:0.1797217316):0.1171983695,:0.2969201011):0.1230386242,((25:0.2974707978,(:0.08780907834):0.2096617195):0.02224378484,41:0.3197145827):0.1002441427):0.08042502032,39:0.5003837456):0.6801172398,((((32:0.1392089854,21:0.1392089854):0.03683785651,:0.176046842):0.2555143616,:0.4315612036):0.4414163861,:0.8729775897):0.3075233958):4.026687982):5.876719624,:11.08390859):2.523374571,(30:7.18590866,52:7.18590866):6.421374502):2.602632004):0.7577470466,((53:10.96507442,(((1:0.06756397187,2:0.06756397187):0.240851298,(17:0.2372855327,(33:0.1889226383,18:0.1889226383):0.04836289438):0.07112973718):5.46069576,(47:4.084301545,(50:0.6026545192,51:0.6026545192):3.481647026):1.684809485):5.195963386):2.012113642,(((19:0.4605147098):0.5279487557,(31:0.06590090858):0.9225625568):9.493124548,45:10.48158801):2.495600044):3.990474155);
      TREE PolyRAxML = [&R] (53:1.0,(((50:0.032537,51:0.032537):0.214498,47:0.247035):0.171484,((2:0.002964,1:0.002964):0.01063,((33:0.004329,18:0.004329):0.006559,17:0.010888):0.002705):0.404926):0.581481,(((35:0.509564,(24:0.034924,(44:0.011059,43:0.011059):0.023865):0.47464):0.341275,(((((14:0.04401,(34:0.023604,(36:0.010435,(28:0.00368,27:0.00368,22:0.00368):0.006756):0.013169):0.020406):0.077375,((40:0.015872,42:0.015872,26:0.015872):0.007085,:0.022957):0.098428):0.394832,23:0.516217):0.216615,((52:0.431495,30:0.431495):0.204982,((((37:0.041828,((((((:0.003121):0.008181,41:0.011302,25:0.011302):0.001765,:0.013068):0.004017,39:0.017085):0.018587,:0.035672):0.004912,:0.040584):0.001244,32:0.041828):0.00194,21:0.043767):0.220448,(20:0.030771,((29:0.00687,48:0.00687):0.014314,(7:0.007661,9:0.007661):0.013522):0.009587):0.233444):0.253004):0.119257):0.096355):0.061822,(49:0.292761,46:0.292761):0.501893):0.056185):0.058002,(45:0.693221,((19:0.012325):0.023355,31:0.03568):0.657541):0.215619):0.09116);



END;
BEGIN TREES;
      TITLE Diss_all;
      LINK TAXA = Taxa13;
         TRANSLATE
            1    Dissotrocha_aculeata_DisacucryNUP1B5,
            2    Dissotrocha_aculeata_DisaculA341DA,
            3    Dissotrocha_aculeata_DisacumedBL2B1B4,
            4    Dissotrocha_macrostyla_DismacrA346DM,
            5    Dissotrocha_macrostyla_DismacrNUP2B4,
            6    Dissotrocha_macrostyla_DismactuA341DT,
            7    Dissotrocha_macrostyla_DismactuARG1A2P,
            8    Dissotrocha_macrostyla_DismactuNF5C3P,
            9    Dissotrocha_aculeata_A522DA1,
            10   Dissotrocha_aculeata_A522DA2,
            11   Dissotrocha_aculeata_A535DA1,
            12   Dissotrocha_aculeata_A535DA2,
            13   Dissotrocha_aculeata_A536DA1,
            14   Dissotrocha_aculeata_A602DA2,
            15   Dissotrocha_macrostyla_A751DM1,
            16   Dissotrocha_macrostyla_A751DM2,
            17   Dissotrocha_macrostyla_A756DMX2,
            18   Dissotrocha_macrostyla_A726DM1,
            19   Dissotrocha_aculeata_A734DA2,
            20   Dissotrocha_aculeata_A735DA1,
            21   Dissotrocha_macrostyla_A735DM1,
            22   Dissotrocha_aculeata_A487DA1,
            23   Dissotrocha_aculeata_A487DA2,
            24   Dissotrocha_aculeata_DaculeataDAA375,
            25   Dissotrocha_macrostyla_DmacrostylaDMA382b,
            26   Dissotrocha_macrostyla_A486BD04Dmacr,
            27   Dissotrocha_aculeata_M15DA1COI;
      TREE DissRAxML = [&R] (21:1.0,18:1.0,((((2:0.166492,(20:0.011045,19:0.011045):0.155447):0.56639,24:0.732883):0.052676,((((12:0.005954,11:0.005954):0.483358,6:0.489312):0.178382,(27:0.54756,(23:0.006964,22:0.006964):0.540596):0.120134,((13:0.56603,((3:0.041229,10:0.041229,9:0.041229):0.197074,14:0.238303):0.327727):0.068547,((8:0.022561,26:0.022561):0.49866,(7:0.033599,25:0.033599):0.487622):0.113356):0.033118):0.076929,1:0.744624):0.040936):0.038524,((5:0.490689,17:0.490689):0.145656,((16:0.011011,4:0.011011):0.486258,15:0.49727):0.139076):0.187738):0.175917);
      TREE DissBEASTr = [&R] (((1:16.46319204,(((((7:1.696888216,25:1.696888216):5.804469875,(26:1.839436905,8:1.839436905):5.661921186):2.344791101,(14:3.597258266,((10:0.3415860632,9:0.3415860632):0.7841208748,3:1.125706938):2.471551328):6.248890926):2.108662723,(6:8.619011894,(13:6.142903061,(12:0.1548698676,11:0.1548698676):5.988033194):2.476108833):3.335800021):0.1338402962,((22:0.1343004445,23:0.1343004445):9.726678469,27:9.860978913):2.227673298):4.374539827):1.074612985,((((16:0.6890244236,4:0.6890244236):10.05118138,15:10.7402058):2.122659192,(17:10.00901505,5:10.00901505):2.853849947):2.836676529,(18:0.2325391575,21:0.2325391575):15.46700237):1.838263498):2.546909544,(24:19.35090593,((20:0.1446277259,19:0.1446277259):6.306629011,2:6.451256737):12.89964919):0.7338086362);
      TREE DissBEASTb = [&R] (((17:7.534245399,5:7.534245399):9.22649082,(1:13.68842965,((4:0.3781601947,16:0.3781601947):9.404975266,15:9.78313546):3.905294187):3.072306573):4.225686557,(((18:0.2874386853,21:0.2874386853):12.50778571,(((20:0.8007846487,19:0.8007846487):3.104674442,2:3.905459091):5.513286491,24:9.418745582):3.37647881):3.713131018,(((27:9.501408886,(22:0.3460310969,23:0.3460310969):9.155377789):4.884616654,((3:0.6756950389,(9:0.3224611875,10:0.3224611875):0.3532338514):4.347560456,14:5.023255495):9.362770046):0.8076561658,(((13:5.304534837,(11:0.9984896375,12:0.9984896375):4.3060452):3.395239737,(6:3.677747993,(8:0.4074848202,26:0.4074848202):3.270263173):5.022026581):4.021210327,(7:2.510767313,25:2.510767313):10.21021759):2.472696806):1.314673704):4.478067367);
      TREE DissBEASTs = [&R] (24:47.84995563,((2:6.780506905,(20:0.2319779758,19:0.2319779758):6.548528929):23.57809993,((1:25.5852607,((18:0.2105699782,21:0.2105699782):24.43360549,((15:14.07807905,(4:0.2860099915,16:0.2860099915):13.79206905):6.97819333,(17:18.82809481,5:18.82809481):2.228177568):3.587903093):0.9410852311):4.184092439,((((((9:0.5969409856,10:0.5969409856):0.4715366183,3:1.068477604):6.153973256,14:7.22245086):12.97610584,13:20.1985567):1.437970369,((7:0.6922819041,25:0.6922819041):13.34361027,(26:0.9929911453,8:0.9929911453):13.04290103):7.600634898):4.249532936,((27:22.12428762,(22:0.4033552379,23:0.4033552379):21.72093238):3.171110094,(6:19.24940084,(11:0.2829344786,12:0.2829344786):18.96646636):6.045996869):0.5906622982):3.883293131):0.5892536972):17.49134879);



END;
BEGIN TREES;
      TITLE Phil_all;
      LINK TAXA = Taxa3;
         TRANSLATE
            1    Philodina_sp_gi|407081173|gb|JQ309198.1|,
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            4    Philodina_sp_gi|407081141|gb|JQ309182.1|,
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            6    Philodina_duplicalcar_gi|407081129|gb|JQ309176.1|,
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            8    Philodina_citrina_gi|407081121|gb|JQ309172.1|,
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            10   Philodina_citrina_gi|407081101|gb|JQ309162.1|,
            11   Philodina_sp_gi|407081097|gb|JQ309160.1|,
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            20   Philodina_flaviceps_gi|407081099|gb|JQ309161.1|,
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END;
BEGIN TREES;
      TITLE Test_all;
      LINK TAXA = Taxa7;
         TRANSLATE
            1    Testudinella_caeca_FL31Tc1,
            2    Testudinella_patina_EU499826TpatinaJG01,
            3    Testudinella_patina_FL5Tp6,
            4    Testudinella_patina_FL10Tp1,
            5    Testudinella_patina_FL118Tp7,
            6    Testudinella_clypeata_FL134Tc7,
            7    Testudinella_clypeata_FL124Tc7,
            8    Testudinella_clypeata_A758T2,
            9    Testudinella_clypeata_FL40Tc1,
            10   Testudinella_clypeata_FL119Tc16,
            11   Testudinella_clypeata_FL161Tc1,
            12   Testudinella_clypeata_A758T4,
            13   Testudinella_clypeata_FL132T2,
            14   Testudinella_clypeata_FL161Tc6,
            15   Testudinella_clypeata_FL119Tc13,
            16   Testudinella_clypeata_FL160Tc3,
            17   Testudinella_clypeata_FL158Tc3,
            18   Testudinella_clypeata_FL158Tc6,
            19   Testudinella_clypeata_FL73Tc2,
            20   Testudinella_clypeata_FL77Tc4,
            21   Testudinella_clypeata_FL77Tc5,
            22   Testudinella_clypeata_FL103Tc1,
            23   Testudinella_clypeata_FL132T8,
            24   Testudinella_clypeata_FL132T4,
            25   Testudinella_clypeata_FL73Tc5,
            26   Testudinella_clypeata_FL146Tc6,
            27   Testudinella_clypeata_FL149Tc3,
            28   Testudinella_clypeata_FL144Tc4,
            29   Testudinella_clypeata_FL144Tc1,
            30   Testudinella_clypeata_FL149Tc2,
            31   Testudinella_clypeata_FL149Tc5,
            32   Testudinella_clypeata_FL145Tc4,
            33   Testudinella_clypeata_FL133T1,
            34   Testudinella_clypeata_FL35Tc8;
      TREE TestBEASTs = [&R] ((((3:11.00614829,2:11.00614829):3.348358993,4:14.35450729):3.175584654,5:17.53009194):16.83068215,((6:19.11244683,((10:10.28260977,(((((23:0.3520509523,(24:0.1673070699,22:0.1673070699):0.1847438825):0.2717167906,((28:0.1740287742,29:0.1740287742):0.2547264633,((26:0.1151389586,25:0.1151389586):0.2345030374,((((32:0.09912385762,27:0.09912385762):0.07023516083,(34:0.08443942353,31:0.08443942353):0.08491959492):0.03451631685,33:0.2038753353):0.05022076298,30:0.2540960983):0.09554589779):0.07911324144):0.1950125055):0.2840053962,(19:0.6163166875,(20:0.3611450068,21:0.3611450068):0.2551716807):0.2914564517):0.3008497486,(((17:0.1093631144,18:0.1093631144):0.06998955566,16:0.1793526701):0.1510157367,15:0.3303684068):0.8782544809):7.259715822,(12:0.6705631173,((11:0.1582660519,14:0.1582660519):0.2685515536,13:0.4268176055):0.2437455118):7.797775592):1.814271062):4.804597952,((9:0.08720416782,8:0.08720416782):11.00667788,7:11.09388205):3.993325675):4.025239103):5.000094778,1:24.1125416):10.24823249);
      TREE TestBEASTb = [&R] (((((2:11.82068818,3:11.82068818):7.758777516,4:19.5794657):0.5773892494,5:20.15685494):17.44343029,1:37.60028524):5.288047216,((7:18.28277493,((8:0.06335743694,9:0.06335743694):14.46044391,((((13:0.2200886784,11:0.2200886784):0.09050083205,12:0.3105895104):0.0546564008,14:0.3652459112):8.07629567,(((15:0.5330608592,((18:0.1698933106,17:0.1698933106):0.05449675405,16:0.2243900647):0.3086707945):1.894264098,((19:0.4445135929,(20:0.3551990929,21:0.3551990929):0.08931449999):0.408307651,((24:0.2978943838,(23:0.1734091574,22:0.1734091574):0.1244852264):0.1745923882,((29:0.193059574,28:0.193059574):0.2054575004,((26:0.06108620843,25:0.06108620843):0.3155633442,(30:0.2706772868,((33:0.1717435892,32:0.1717435892):0.09434125186,((27:0.06768055561,34:0.06768055561):0.05354323419,31:0.1212237898):0.1448610513):0.004592445701):0.1059722658):0.02186752178):0.07396969763):0.3803344719):1.574503714):5.405073318,10:7.832398275):0.6091433058):6.082259767):3.758973586):8.214907138,6:26.49768207):16.39065038);
      TREE TestBEASTr = [&R] ((1:16.71101173,(6:14.75302325,(7:10.71400425,(((((20:0.1769787644,21:0.1769787644):0.3379464135,19:0.5149251779):0.9224682866,((23:0.1729848152,(22:0.1541963185,24:0.1541963185):0.01878849677):0.7320782424,((((25:0.09320102426,26:0.09320102426):0.106789809,30:0.1999908332):0.3702447757,((32:0.271163603,((31:0.013249651,34:0.013249651):0.005742289476,(33:0.008875835717,27:0.008875835717):0.01011610475):0.2521716625):0.1012681072,(29:0.08420932455,28:0.08420932455):0.2882223856):0.1978038988):0.1165235092,(15:0.3295285413,((17:0.1194405422,18:0.1194405422):0.1369602131,16:0.2564007552):0.07312778607):0.3572305768):0.2183039395):0.5323304068):5.721197204,(10:4.538038986,(12:1.624376091,((11:0.05229290854,14:0.05229290854):0.6980104653,13:0.7503033738):0.8740727176):2.913662895):2.620551682):3.3528161,(8:0.1103922974,9:0.1103922974):10.40101447):0.2025974807):4.039019001):1.957988478):9.466771192,((5:14.90669134,(2:8.76343258,3:8.76343258):6.143258757):3.462205576,4:18.36889691):7.808886008);
      TREE TestRAxML = [&R] ((1:0.689962,(6:0.526096,(7:0.414326,((9:0.001738,8:0.001738):0.343887,((((24:0.008357,(23:0.007588,22:0.007588):7.69E-4):0.00803,((26:0.002433,25:0.002433):0.010796,(31:0.01058,30:0.01058,32:0.01058,(29:0.004709,28:0.004709):0.005872,((15:0.003993,(16:0.003368,(18:0.002853,17:0.002853):5.15E-4):6.24E-4):0.006237,27:0.010229):3.51E-4,34:0.01058,33:0.01058):0.002649):0.003157):0.01036,((20:0.011025,21:0.011025):0.007325,19:0.01835):0.008397):0.197874,(10:0.18688,(14:0.013091,13:0.013091,(12:0.010845,11:0.010845):0.002246):0.173789):0.037741):0.121004):0.0687):0.111771):0.163865):0.310038,(4:0.509493,((2:0.318007,3:0.318007):0.122669,5:0.440675):0.068818):0.490507);



END;
BEGIN TREES;
      TITLE Asco_all;
      LINK TAXA = Taxa10;
         TRANSLATE
            1    Ascomorpha_ecaudis_71AE1Reier,
            2    Ascomorpha_ecaudis_4AE9Roncone,
            3    Ascomorpha_ecaudis_113AE2Tovela15m,
            4    Ascomorpha_ecaudis_113AE4Tovela15m,
            5    Ascomorpha_ecaudis_127AE1ColBricon,
            6    Ascomorpha_ecaudis_176AE1Terlago,
            7    Ascomorpha_ecaudis_176AE4Terlago,
            8    Ascomorpha_ovalis_182AO1Tenno,
            9    Ascomorpha_ovalis_182AO3Tenno,
            10   Ascomorpha_ovalis_185AO3Lases,
            11   Ascomorpha_ovalis_185AO4Lases,
            12   Ascomorpha_ovalis_185AO5Lases,
            13   Ascomorpha_ovalis_185AO8Lases;
      TREE AscoBEASTb = [&R] (13:56.13045114,((2:2.948392654,(5:1.317778915,((3:0.07516304374,4:0.07516304374):0.6997592484,1:0.7749222921):0.5428566231):1.630613739):34.94639988,(((6:1.338079377,(12:0.09671754083,7:0.09671754083):1.241361837):17.79490841,8:19.13298778):11.61700804,(9:1.345426108,(10:0.1234873992,11:0.1234873992):1.221938708):29.40456972):7.144796704):18.23565861);
      TREE AscoBEASTr = [&R] (13:8.776153032,(((8:3.64222612,((12:0.1084308037,7:0.1084308037):0.2579412637,6:0.3663720673):3.275854053):2.129495042,((11:0.07205008496,10:0.07205008496):0.5134506587,9:0.5855007436):5.186220418):2.274443872,(((5:0.3181836453,1:0.3181836453):0.1865460197,(3:0.07032389357,4:0.07032389357):0.4344057714):1.504098237,2:2.008827902):6.037337131):0.7299879989);
      TREE AscoBEASTs = [&R] ((((5:0.4823792702,1:0.4823792702):0.1864268636,(4:0.1588364755,3:0.1588364755):0.5099696583):0.5823380493,2:1.251144183):26.49536881,(13:18.67093303,((8:9.432537137,((12:0.09926754478,7:0.09926754478):0.241384279,6:0.3406518237):9.091885313):4.288423602,((11:0.02746146384,10:0.02746146384):0.7695406362,9:0.7970021001):12.92395864):4.949972293):9.075579963);
      TREE AscoRAxML = [&R] (((((2:0.022085,1:0.022085):0.001449,(4:0.001139,3:0.001139):0.022395):0.006124,5:0.029658):0.930835,(((11:0.001567,10:0.001567):0.022477,9:0.024044):0.47911,(8:0.290939,((12:0.002263,7:0.002263):0.008229,6:0.010492):0.280447):0.212216):0.457339):0.039507,13:1.0);



END;
BEGIN TREES;
      TITLE Macr_all;
      LINK TAXA = Taxa9;
         TRANSLATE
            1    Macrotrachela_quadricornifera_gi|402761743|gb|JX184003.1|,
            2    Macrotrachela_quadricornifera_gi|402761745|gb|JX184004.1|,
            3    Macrotrachela_sp_gi|296011563|gb|HM032960.1|,
            4    Macrotrachela_sp_gi|296011559|gb|HM032958.1|,
            5    Macrotrachela_sp_gi|296011555|gb|HM032956.1|,
            6    Macrotrachela_sp_gi|296011551|gb|HM032954.1|,
            7    Macrotrachela_sp_gi|296011547|gb|HM032952.1|,
            8    Macrotrachela_sp_gi|296011561|gb|HM032959.1|,
            9    Macrotrachela_sp_gi|296011557|gb|HM032957.1|,
            10   Macrotrachela_sp_gi|296011545|gb|HM032951.1|,
            11   Macrotrachela_sp_gi|71840180|gb|DQ078537.1|,
            12   Macrotrachela_quadricornifera_gi|239584319|gb|FJ426421.1|,
            13   Macrotrachela_quadricornifera_gi|239584315|gb|FJ426419.1|,
            14   Macrotrachela_quadricornifera_gi|239584303|gb|FJ426413.1|,
            15   Macrotrachela_quadricornifera_gi|239584295|gb|FJ426409.1|,
            16   Macrotrachela_quadricornifera_gi|239584321|gb|FJ426422.1|,
            17   Macrotrachela_quadricornifera_gi|239584305|gb|FJ426414.1|,
            18   Macrotrachela_quadricornifera_gi|239584301|gb|FJ426412.1|,
            19   Macrotrachela_quadricornifera_gi|209406123|gb|EU751284.1|,
            20   Macrotrachela_latior_gi|209406047|gb|EU751246.1|,
            21   Macrotrachela_latior_gi|209406043|gb|EU751244.1|,
            22   Macrotrachela_latior_gi|209406031|gb|EU751238.1|,
            23   Macrotrachela_latior_gi|209406023|gb|EU751234.1|,
            24   Macrotrachela_latior_gi|209406019|gb|EU751232.1|,
            25   Macrotrachela_latior_gi|209405999|gb|EU751222.1|,
            26   Macrotrachela_quadricornifera_gi|209405763|gb|EU751104.1|,
            27   Macrotrachela_multispinosa_gi|209405755|gb|EU751100.1|,
            28   Macrotrachela_multispinosa_gi|209405751|gb|EU751098.1|,
            29   Macrotrachela_multispinosa_gi|209405747|gb|EU751096.1|,
            30   Macrotrachela_habita_gi|209405699|gb|EU751072.1|,
            31   Macrotrachela_quadricornifera_gi|209405663|gb|EU751054.1|,
            32   Macrotrachela_ehrenbergi_gi|209405659|gb|EU751052.1|,
            33   Macrotrachela_ehrenbergi_gi|209405655|gb|EU751050.1|,
            34   Macrotrachela_latior_gi|209406045|gb|EU751245.1|,
            35   Macrotrachela_latior_gi|209406041|gb|EU751243.1|,
            36   Macrotrachela_latior_gi|209406033|gb|EU751239.1|,
            37   Macrotrachela_latior_gi|209406025|gb|EU751235.1|,
            38   Macrotrachela_quadricornifera_gi|209405757|gb|EU751101.1|,
            39   Macrotrachela_quadricornifera_gi|187475831|gb|EU499843.1|,
            40   Macrotrachela_quadricornifera_gi|187475827|gb|EU499841.1|,
            41   Macrotrachela_quadricornifera_gi|187475823|gb|EU499839.1|,
            42   Macrotrachela_quadricornifera_gi|187475819|gb|EU499837.1|,
            43   Macrotrachela_quadricornifera_gi|187475731|gb|EU499793.1|,
            44   Macrotrachela_quadricornifera_gi|187475727|gb|EU499791.1|,
            45   Macrotrachela_quadricornifera_gi|187475821|gb|EU499838.1|,
            46   Macrotrachela_quadricornifera_gi|187475729|gb|EU499792.1|,
            47   Macrotrachela_quadricornifera_gi|157365528|gb|EF650624.1|,
            48   Macrotrachela_quadricornifera_gi|157365464|gb|EF650592.1|,
            49   Macrotrachela_sp_gi|157365416|gb|EF650568.1|,
            50   Macrotrachela_sp_gi|157365412|gb|EF650566.1|,
            51   Macrotrachela_sp_gi|157365404|gb|EF650562.1|,
            52   Macrotrachela_quadricornifera_gi|157365392|gb|EF650556.1|,
            53   Macrotrachela_quadricornifera_gi|157365388|gb|EF650554.1|,
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            55   Macrotrachela_quadricornifera_gi|157365368|gb|EF650544.1|,
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            57   Macrotrachela_musculosa_gi|157365304|gb|EF650512.1|,
            58   Macrotrachela_quadricornifera_gi|157365300|gb|EF650510.1|,
            59   Macrotrachela_quadricornifera_gi|157365296|gb|EF650508.1|,
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            61   Macrotrachela_plicata_gi|157365284|gb|EF650502.1|,
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END;
BEGIN TREES;
      TITLE Kera_all;
      LINK TAXA = Taxa11;
         TRANSLATE
            1    Keratella_cochlearis_3KC1Terlag,
            2    Keratella_cochlearis_3KC2Terlag,
            3    Keratella_cochlearis_3KC4Terlag,
            4    Keratella_cochlearis_3KC5Terlag,
            5    Keratella_cochlearis_3KC6Terlag,
            6    Keratella_cochlearis_7KC1Levico,
            7    Keratella_cochlearis_7KC2Levico,
            8    Keratella_cochlearis_7KC5Levico,
            9    Keratella_cochlearis_7KC6Levico,
            10   Keratella_cochlearis_7KC8Levico,
            11   Keratella_cochlearis_5KC8Lavaro,
            12   Keratella_cochlearis_9KC3Raierm,
            13   Keratella_cochlearis_9KC5Raierm,
            14   Keratella_cochlearis_14KC1Cresp,
            15   Keratella_cochlearis_15KC1Antho,
            16   Keratella_cochlearis_54KC1Serra,
            17   Keratella_cochlearis_55KC10Voels,
            18   Keratella_cochlearis_55KC3Voels,
            19   Keratella_cochlearis_55KC4Voels,
            20   Keratella_cochlearis_55KC5Voels,
            21   Keratella_cochlearis_55KC7Voels,
            22   Keratella_cochlearis_138KC1Tovel15m,
            23   Keratella_cochlearis_138KC7Tovel15m;
      TREE KeraRAxML = [&R] (((((10:0.002178,8:0.002178):0.026781,(1:0.015359,6:0.015359):0.0136):0.444044,((19:0.055192,18:0.055192):0.042165,(((12:0.010528,17:0.010528):0.008964,21:0.019492):0.019666,20:0.039158):0.058199):0.375646):0.232713,(((4:0.054155,(22:0.031248,5:0.031248):0.022907,15:0.054155,23:0.054155):0.00265,3:0.056805):0.338961,14:0.395766):0.30995):0.294284,(13:0.624915,(((7:0.008331,(2:0.006788,11:0.006788):0.001543):0.053626,16:0.061957):0.011542,9:0.073499):0.551416):0.375085);
      TREE KeraBEASTs = [&R] (((((5:0.9322768539,22:0.9322768539):0.3781397377,((3:0.3450713869,(15:0.1428820363,4:0.1428820363):0.2021893506):0.05666390136,23:0.4017352883):0.9086813034):3.270492322,14:4.580908914):3.4939542,(((6:0.07868505865,1:0.07868505865):0.3095460189,(10:0.1084373148,8:0.1084373148):0.2797937628):5.379636491,((((17:0.2431917595,12:0.2431917595):0.07594950086,21:0.3191412604):0.1245969796,20:0.44373824):0.7887032814,(18:0.7293474643,19:0.7293474643):0.5030940571):4.535426048):2.306995545):7.344817416,(13:8.048067671,((9:0.2098072009,16:0.2098072009):0.5788358329,(7:0.08325085649,(11:0.05006332732,2:0.05006332732):0.03318752918):0.7053921774):7.259424637):7.371612859);
      TREE KeraBEASTr = [&R] ((((9:0.2529963376,16:0.2529963376):0.3639880674,(2:0.1811449865,(7:0.151745533,11:0.151745533):0.02939945358):0.4358394184):4.6813703,13:5.298354705):6.560254802,((((18:1.020754207,19:1.020754207):0.3866849784,((21:0.2096339925,(12:0.1131810113,17:0.1131810113):0.09645298119):0.221574949,20:0.4312089414):0.9762302439):3.965139375,((10:0.05413495668,8:0.05413495668):0.5549204315,(6:0.2136994673,1:0.2136994673):0.3953559208):4.763523172):4.178375592,(((22:1.407629837,5:1.407629837):0.7549991384,(23:0.6153606372,((4:0.1797046063,15:0.1797046063):0.1740861408,3:0.3537907471):0.2615698901):1.547268338):2.762659512,14:4.925288487):4.625665665):2.307655355);
      TREE KeraBEASTb = [&R] ((((((3:0.6725697689,15:0.6725697689):0.03650910035,(23:0.4620152516,4:0.4620152516):0.2470636176):1.303662568,(5:1.43571226,22:1.43571226):0.5770291765):7.070837158,14:9.083578595):10.54163267,(((10:0.08597072044,8:0.08597072044):0.3164395944,(1:0.2660478474,6:0.2660478474):0.1363624674):15.40523802,(((21:0.9125883605,(17:0.3763538296,12:0.3763538296):0.5362345309):0.2443500501,20:1.156938411):0.8778002112,(19:0.6409144612,18:0.6409144612):1.393824161):13.77290971):3.817562932):4.674775628,(((16:0.5072989377,9:0.5072989377):1.147794749,(7:0.4011948871,(11:0.3012234456,2:0.3012234456):0.09997144148):1.2538988):13.14905848,13:14.80415217):9.49583472);



END;
BEGIN TREES;
      TITLE Brac_all;
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