#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 23, 2024; 16:22 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Millanes A.M., Truong C., Westberg M., Diederich P., & Wedin M. 2014. Host switching promotes diversity in host-specialized mycoparasitic fungi: uncoupled evolution in the Biatoropsis-Usnea system. Evolution, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S15383] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=41; TAXLABELS Biatoropsis_usnearum_AA10 Biatoropsis_usnearum_AA9 Biatoropsis_usnearum_AM10 Biatoropsis_usnearum_AM110 Biatoropsis_usnearum_AM112 Biatoropsis_usnearum_AM137 Biatoropsis_usnearum_AM138 Biatoropsis_usnearum_AM139 Biatoropsis_usnearum_AM140a Biatoropsis_usnearum_AM141 Biatoropsis_usnearum_AM142 Biatoropsis_usnearum_AM143 Biatoropsis_usnearum_AM144 Biatoropsis_usnearum_AM155 Biatoropsis_usnearum_AM166 Biatoropsis_usnearum_AM168 Biatoropsis_usnearum_AM171 Biatoropsis_usnearum_AM172 Biatoropsis_usnearum_AM190 Biatoropsis_usnearum_AM191a Biatoropsis_usnearum_AM192a Biatoropsis_usnearum_AM195 Biatoropsis_usnearum_AM196 Biatoropsis_usnearum_AM201 Biatoropsis_usnearum_AM202a Biatoropsis_usnearum_AM203 Biatoropsis_usnearum_AM211 Biatoropsis_usnearum_AM212 Biatoropsis_usnearum_AM213a Biatoropsis_usnearum_AM214 Biatoropsis_usnearum_AM215d Biatoropsis_usnearum_AM229 Biatoropsis_usnearum_AM295 Biatoropsis_usnearum_AM296 Biatoropsis_usnearum_AM297 Biatoropsis_usnearum_AM298 Biatoropsis_usnearum_AM299 Biatoropsis_usnearum_AM307 Biatoropsis_usnearum_AM8 Biatoropsis_usnearum_CO294 Tremella_cetraricola_AM111 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! 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Biatoropsis_usnearum_CO294 TTAATGATTTGGGCCGCCTGCAAGATCAAAATCCTTCATACCCATGTGAACCTGTTGG-CCCTCGGGTCATCAACCA---CCAAACACGGTGTAACGAACGTACGAATTGAAAAACCTAATAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTTGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCCTTTTGGTATTCCGAAAGGCATGCCTGTTTGAGTGTCATGAAACATCAATCCCCCTTGGGTCTTTGTGCCGAGG-GGAGGATTTGGACTTGGGTGTTGCCCTGGCTCGCCTCAAATCTGTTAGTGGATGCGACCCTTTGGCCGGACGTAATAAGTTCCGTCTGTGCCGTCACGTCTGCTTCAATACCCCT--GTTTTATTTA?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAAAGAGAGTTAAACAGTATGTGAAATTGTTGAAAGGGAAACGATTGAAGTCAGTCGTGTCATGAGGATTCAGCCGGCCCTGCCGGTGTACTTCCTCTTGACGGGTCAACATCAGTTTTGACCGGCGGATAAGGGAGATGGGAATGTGGCACCTTCGGGTGTGTTATAGCCCGTCGCCGCATACGTCGGACGAGACTGAGGCATGCAGCTCGCCCTTCGGGGCCGGGGTTCGCCCACGTCCGAGCTTAGGATGTTGACGGAATGGCTTTAAACGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATATCTGCGAGTGTTTGGGTGTCAAACCCGGGCGCGCAATGAAAGTAAACGTAGGAGGGATCCGTAAGGAGCACCTTCGACCGATCTGGATCTTCTGTGATGGATTTGAGTAAGAGCATATATGCTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGCGAAGCCAGGGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGTAGCGATTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGTATAGGGGCGAAAGACTAATCAAAATTATTTTAGCATAATGAGCCAAAATAATCTAAATAGTCCTGTCCAAAAACCGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGGTAAGGGCCACCCATCGGAATCTTAAGTAGGCGTCAAGGGTGCGTAGCTTG-ATTAAGACTAGAGTTTTATCGGGGCAAGACCCACACACGGAGGAGGGCTTAAATTCATTGATCCCGTGGCGAGGGCTAATGGCGAAGGCATTTTGCTAGATAAATACTGACGGTAAGGCACGAAAGCCAGGGCAGGGAAGCCGATTAGAGACCGTCGTACTCCTGGCTGTAAACTATGCAGACCCAACTTTAGTATAATTTAAGTTGCCGCTAACGCTTTGAGTCTGCCGCCAGCATGGTACAGCCGCAAGGCCGACACGCAAACGACGAGACCGTCTGTGGTATTAATCGGGTGCGGGGCATGCTGTTTAATCCGTCAATACGCGTAAAATCTTACCATGTCTTGAATATTTATTAATTGCTTTTATTAATTTAATTTATACAGGTGTTGCATGGCTGTCGTCAGCTAGTGCTTGTAAGGCGTAAGGTTTGTTCCATATAACTAGCGCAAGCCTCACCATATATTACTTGTGTGGCCCTTATTTTATGCAAATTTGGTG-T?GAGGAGTA Tremella_cetraricola_AM111 TTAGTGATTTGGGTCACCTTCAC-----ACATTCCTCCTACCTCTGTGAACCTGTT-GGCCTCTGGCCATTC--TTACTCCAAACATTGATGTAACAAGCGTGATGAATCAT-ACCATAATAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCCTTTTGGTATTCCGAAAGGCATGCCTGTTTGAGTGTCGTGAAACCTCAATCCCCTTGGGTTTTGTTACCCGGGTGG--GAATTGGATTCTGGGTGTTGCCTGGGCTCACCTGAAAAGCATCTGTGGGATGAAGTCGGAGGACGGGCGTAATAGTTTCGCCCAATGCCCTTCGGCCTGCTCAGAACACCCCACACCATTTTACGACCTCAAATCAGGTAGGGCTACCCGCTGAACTTAAGCATATCAATAAGCGGAGGAAAAGAAACTAACAAGGATTCCCCTAGTAGCGGCGAGCGAACCGGGAAGAGCTCAAATTTGTAATCTGGCGTCCTTTGGGCGTCCGAGTTGTAATCTATAGAAGCGTCATCTGTGCCGGACCGTGTCCAAGTCCCTTGGAACAGGGTATCAAAGAGGGTGACAATCCCGTGCTTGACACGACGACCGGTGCTCTGTGATACGCTCTCTACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCAAAACGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAAAGAGAGTTAAACAGCATGTGAAATTGTTGAAAGGGAAACGATTGAAGTCAGTCATGTCGCGGGGATTCAGCCGGCCCTGCCGGTCTACTTCCTCCCGATGGGTCAACATCAGTTTTGACCGGCGGATAAGGGGGACGGGAAGGTATCACCCTCGGGTGTGTTATAGCCCGTTGTCGTATACGCCGGTTGAGACTGAGGAATGCAGCTCGCCTT-TATGGCCGGGGTCCGCCCACGTCCGAGCTTAGGATGTTGACGTAATGGCTTTAAACGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATATCTGCGAGTGTTTGGGTGTCAAACCCGAGCGCGCAATGAAAGTAAACGTAGGAGGGATCCGCAAGGAGCACCTTCGACCGATCTGGATCTTCTGTGATGGATTTGAGTAAGAGCATATATGCTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGCGAAGCCAGGGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGTAGCGATTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGTATAGGGGCGAAAGACTAATCATAACGACTCCTGAATGATGATCTA----AGTTCTATTAGTCCTGTCCAAATTCTGTGCCAGCAGACGCGGTAAGACAGAAAGGGCAACCCATCGGAGTTATGAATAGGTGTAAAGGGTACGTAGCCGGCATAATTGCTAGAGTTTAATGGAAGTAGAAACAATACCTAGAGTAGGGCTGATATCTTATGATACTAGGGGGAGAACCAACGGCGAAAGCATTCTACTAAGTAAAAACTGACGGTAAGGTACGAAGGCTAAGGAATGAATAGGGATTAGATACCCCAGTACTCTTAGCTGTAAACGATGCAGATTAAAGATTAGCCTAGTTAGTCTTAATGCTAACGCGTTAAATTTGCCACCTGTATAGTATAGTCGCATGACCGAAATACAAATAATTAGACCGCCCGTG--AGCAAACGGA-GTGAAGCATGTTATTTAATACGATAGTACGCGTAAAATCTTACCACATCTTGCATACCTAC--ATTGTCTGAAATAACGTAGTG--TACAGGTGTTGCATGGCTGTCGCCAGTTAGTGCTCGTAAGGCCTAAGGTTAATTCCGTTTAACTAACGAAATCCTCGCTAT{AG}AGTTTATCT{CT}ATAGTCTCATTCTGATAAAGAGTGACTTTAGGAGGACTA ; END; BEGIN TREES; TITLE 'Biatoropsis-Usnea Bayesian con'; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Biatoropsis_usnearum_AA10, 2 Biatoropsis_usnearum_AA9, 3 Biatoropsis_usnearum_AM10, 4 Biatoropsis_usnearum_AM110, 5 Biatoropsis_usnearum_AM112, 6 Biatoropsis_usnearum_AM137, 7 Biatoropsis_usnearum_AM138, 8 Biatoropsis_usnearum_AM139, 9 Biatoropsis_usnearum_AM140a, 10 Biatoropsis_usnearum_AM141, 11 Biatoropsis_usnearum_AM142, 12 Biatoropsis_usnearum_AM143, 13 Biatoropsis_usnearum_AM144, 14 Biatoropsis_usnearum_AM155, 15 Biatoropsis_usnearum_AM166, 16 Biatoropsis_usnearum_AM168, 17 Biatoropsis_usnearum_AM171, 18 Biatoropsis_usnearum_AM172, 19 Biatoropsis_usnearum_AM190, 20 Biatoropsis_usnearum_AM191a, 21 Biatoropsis_usnearum_AM192a, 22 Biatoropsis_usnearum_AM195, 23 Biatoropsis_usnearum_AM196, 24 Biatoropsis_usnearum_AM201, 25 Biatoropsis_usnearum_AM202a, 26 Biatoropsis_usnearum_AM203, 27 Biatoropsis_usnearum_AM211, 28 Biatoropsis_usnearum_AM212, 29 Biatoropsis_usnearum_AM213a, 30 Biatoropsis_usnearum_AM214, 31 Biatoropsis_usnearum_AM215d, 32 Biatoropsis_usnearum_AM229, 33 Biatoropsis_usnearum_AM295, 34 Biatoropsis_usnearum_AM296, 35 Biatoropsis_usnearum_AM297, 36 Biatoropsis_usnearum_AM298, 37 Biatoropsis_usnearum_AM299, 38 Biatoropsis_usnearum_AM307, 39 Biatoropsis_usnearum_AM8, 40 Biatoropsis_usnearum_CO294, 41 Tremella_cetraricola_AM111; TREE Fig._2A = [&R] (41:0.205614,((15:0.007091,(3:0.001072,33:0.001904,39:0.001177):0.008142):0.075253,((29:0.102185,((4:0.027809,(1:0.001035,37:0.003069):0.010278):0.049807,(17:0.002453,23:0.001125,(22:0.001837,24:4.69E-4,25:4.65E-4,26:0.001003,(27:0.002687,35:4.6E-4,36:5.07E-4):0.00103):0.00195):0.063496):0.087305):0.03266,((6:4.49E-4,16:0.001049,18:4.33E-4,28:4.26E-4,(32:0.001038,(2:4.4E-4,14:4.32E-4,40:0.00116):0.00171):0.001063):0.046851,((30:4.97E-4,(7:5.58E-4,10:0.001,11:4.46E-4,(8:4.83E-4,31:3.97E-4):9.31E-4):0.001107):0.005693,((12:4.34E-4,13:4.42E-4,38:0.001051):0.005108,(5:0.003646,9:0.001126,19:5.92E-4,20:0.001045,21:5.8E-4,34:0.00185):0.001064):0.003511):0.049148):0.022296):0.022164):0.205614); END;