#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on May 04, 2024; 19:53 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Lo E., Duke N.C., & Sun M. 2014. Phylogeographic pattern of Rhizophora (Rhizophoraceae) reveals the importance of both vicariance and long-distance oceanic dispersal to modern mangrove distribution. BMC Evolutionary Biology, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S15468] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=52; TAXLABELS Bruguiera_gymnorrhiza_FIJ2 Rhizophora_apiculata_BLA22 Rhizophora_apiculata_CAT15 Rhizophora_apiculata_CHU20 Rhizophora_apiculata_DRI150 Rhizophora_apiculata_EMB45 Rhizophora_apiculata_GUA24 Rhizophora_apiculata_HAN2 Rhizophora_apiculata_IND43 Rhizophora_apiculata_IRI27 Rhizophora_apiculata_KOS18 Rhizophora_apiculata_PBA19 Rhizophora_apiculata_PBU22 Rhizophora_apiculata_PHI47 Rhizophora_apiculata_PNB30 Rhizophora_apiculata_SEM43 Rhizophora_apiculata_SRI22 Rhizophora_apiculata_TRI30 Rhizophora_apiculata_YAP33 Rhizophora_mangle_APA18 Rhizophora_mangle_PMX11 Rhizophora_mangle_PPA2 Rhizophora_mucronata_DRI83 Rhizophora_mucronata_GAZ2 Rhizophora_mucronata_IND4 Rhizophora_mucronata_IRI28 Rhizophora_mucronata_KOS43 Rhizophora_mucronata_MID13 Rhizophora_mucronata_PHI2 Rhizophora_mucronata_PNB51 Rhizophora_mucronata_SEM8 Rhizophora_mucronata_SRI2 Rhizophora_mucronata_TRI27 Rhizophora_mucronata_YAP66 Rhizophora_racemosa_PPA4 Rhizophora_samoensis_FIJ18 Rhizophora_stylosa_BLA3 Rhizophora_stylosa_CAT3 Rhizophora_stylosa_CHU3 Rhizophora_stylosa_DRI208 Rhizophora_stylosa_EMB3 Rhizophora_stylosa_FIJ1 Rhizophora_stylosa_GUA1 Rhizophora_stylosa_IND21 Rhizophora_stylosa_IRI1 Rhizophora_stylosa_KOS1 Rhizophora_stylosa_PBA1 Rhizophora_stylosa_PBU9 Rhizophora_stylosa_PHI26 Rhizophora_stylosa_TAW68 Rhizophora_stylosa_TRI1 Rhizophora_stylosa_YAP4 ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa2; DIMENSIONS NTAX=52; TAXLABELS Bruguiera_gymnorrhiza_FIJ2 Rhizophora_apiculata_BLA22 Rhizophora_apiculata_CAT15 Rhizophora_apiculata_CHU20 Rhizophora_apiculata_DRI150 Rhizophora_apiculata_EMB45 Rhizophora_apiculata_GUA24 Rhizophora_apiculata_HAN2 Rhizophora_apiculata_IND43 Rhizophora_apiculata_IRI27 Rhizophora_apiculata_KOS18 Rhizophora_apiculata_PBA19 Rhizophora_apiculata_PBU22 Rhizophora_apiculata_PHI47 Rhizophora_apiculata_PNB30 Rhizophora_apiculata_SEM43 Rhizophora_apiculata_SRI22 Rhizophora_apiculata_TRI30 Rhizophora_apiculata_YAP33 Rhizophora_mangle_APA18 Rhizophora_mangle_PMX11 Rhizophora_mangle_PPA2 Rhizophora_mucronata_DRI83 Rhizophora_mucronata_GAZ2 Rhizophora_mucronata_IND4 Rhizophora_mucronata_IRI28 Rhizophora_mucronata_KOS43 Rhizophora_mucronata_MID13 Rhizophora_mucronata_PHI2 Rhizophora_mucronata_PNB51 Rhizophora_mucronata_SEM8 Rhizophora_mucronata_SRI2 Rhizophora_mucronata_TRI27 Rhizophora_mucronata_YAP66 Rhizophora_racemosa_PPA4 Rhizophora_samoensis_FIJ18 Rhizophora_stylosa_BLA3 Rhizophora_stylosa_CAT3 Rhizophora_stylosa_CHU3 Rhizophora_stylosa_DRI208 Rhizophora_stylosa_EMB3 Rhizophora_stylosa_FIJ1 Rhizophora_stylosa_GUA1 Rhizophora_stylosa_IND21 Rhizophora_stylosa_IRI1 Rhizophora_stylosa_KOS1 Rhizophora_stylosa_PBA1 Rhizophora_stylosa_PBU9 Rhizophora_stylosa_PHI26 Rhizophora_stylosa_TAW68 Rhizophora_stylosa_TRI1 Rhizophora_stylosa_YAP4 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M21110] TITLE 'Combined chloroplast and nuclear, trnG-S, trnH-rpl2, ITS'; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=2027; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Rhizophora_apiculata_HAN2 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Rhizophora_racemosa_PPA4 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; END; BEGIN TREES; TITLE 'Rhizophora-bayesphylogeny'; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Rhizophora_stylosa_DRI208, 2 Rhizophora_stylosa_TRI1, 3 Rhizophora_stylosa_EMB3, 4 Rhizophora_stylosa_CAT3, 5 Rhizophora_stylosa_KOS1, 6 Rhizophora_stylosa_CHU3, 7 Rhizophora_stylosa_GUA1, 8 Rhizophora_stylosa_YAP4, 9 Rhizophora_stylosa_TAW68, 10 Rhizophora_stylosa_IRI1, 11 Rhizophora_stylosa_BLA3, 12 Rhizophora_stylosa_PBA1, 13 Rhizophora_stylosa_PBU9, 14 Rhizophora_stylosa_IND21, 15 Rhizophora_stylosa_PHI26, 16 Rhizophora_stylosa_FIJ1, 17 Rhizophora_mucronata_DRI83, 18 Rhizophora_mucronata_TRI27, 19 Rhizophora_mucronata_YAP66, 20 Rhizophora_mucronata_KOS43, 21 Rhizophora_mucronata_SRI2, 22 Rhizophora_mucronata_IRI28, 23 Rhizophora_mucronata_PHI2, 24 Rhizophora_mucronata_IND4, 25 Rhizophora_mucronata_SEM8, 26 Rhizophora_mucronata_PNB51, 27 Rhizophora_mucronata_GAZ2, 28 Rhizophora_mucronata_MID13, 29 Rhizophora_apiculata_DRI150, 30 Rhizophora_apiculata_CAT15, 31 Rhizophora_apiculata_EMB45, 32 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