#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 25, 2024; 16:16 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Villarreal J., & Renner S.S. 2014. A review of molecular-clock calibrations and substitution rates in liverworts, mosses, and hornworts, and a timeframe for a taxonomically cleaned-up genus Nothoceros. Molecular Phylogenetics and Evolution, . 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Nothoceros_fuegiensis_Goffinet_9501_Chile_JC53 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Nothoceros_vincentianus_Villarreal_896_Costa_Rica_JC43 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Nothoceros_vincentianus_Villarreal_904_Costa_Rica_JC45 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; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * UNTITLED (CHARACTERS = Nothoceros) = N: 1-5999; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = Nothoceros) = N: 1-5999; END; BEGIN TREES; TITLE Maximum_likelihood_Nothoceros; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Dendroceros_difficilis_VonKonrat_sn_Fiji_JC104, 2 Megaceros_flagellaris_Cargill_855_Australia_JC102, 3 Megaceros_leptohymenius_Cargill_535_Australia_B36, 4 Nothoceros_giganteus_Engel_27407_New_Zealand_JC28, 5 Nothoceros_endiviaefolius_Allen_26401_Chile_JC78, 6 Nothoceros_endiviifolius_Duckett_sn_Chile_JC25, 7 Nothoceros_fuegiensis_Duckett_sn_Chile_JC24, 8 Nothoceros_fuegiensis_Goffinet_9501_Chile_JC53, 9 Nothoceros_fuegiensis_Goffinet_9525_Chile_JC54, 10 Nothoceros_fuegiensis_Goffinet_9526_Chile_JC51, 11 Nothoceros_fuegiensis_Goffinet_9527_Chile_JC50, 12 Nothoceros_fuegiensis_Goffinet_9528_Chile_JC52, 13 Nothoceros_fuegiensis_Goffinet_9553_Chile_JC55, 14 Nothoceros_renzagliensis_Villarreal_1080_Colombia_JC190, 15 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Nothoceros_vincentianus_Villarreal_841_Panama_JC20, 34 Nothoceros_vincentianus_Villarreal_896_Costa_Rica_JC43, 35 Nothoceros_aenigmaticus_Churchill_1301_Bolivia_JC128, 36 Nothoceros_aenigmaticus_Villarreal_1012_USA_NC_MA107, 37 Nothoceros_aenigmaticus_Villarreal_1025b_Mexico_JC159, 38 Nothoceros_aenigmaticus_Villarreal_1027_Mexico_JC161, 39 Nothoceros_aenigmaticus_Villarreal_1082_Colombia_JC188, 40 Nothoceros_aenigmaticus_Villarreal_1083_Colombia_JC191, 41 Nothoceros_aenigmaticus_Villarreal_787_Venezuela_JC17, 42 Nothoceros_aenigmaticus_Villarreal_791_Venezuela_JC91, 43 Nothoceros_aenigmaticus_Villarreal_804_Costa_Rica_JC39, 44 Nothoceros_aenigmaticus_Villarreal_855_Costa_Rica_JC40, 45 Nothoceros_aenigmaticus_Villarreal_892_Costa_Rica_JC41, 46 Nothoceros_aenigmaticus_Villarreal_902_Costa_Rica_JC44, 47 Nothoceros_aenigmaticus_Villarreal_935A_USA_TN_MA30A; TREE tree_1 = [&R] (((((44:7.097053324144645E-4,45:5.139473059809196E-4):0.0020071885007590705,(((42:4.787321579309561E-4,41:8.6169985323097E-7):9.408523975132603E-4,43:0.0011995989052618972):2.343153493505738E-4,(46:9.88893371497016E-4,(((37:8.6169985323097E-7,38:8.6169985323097E-7):2.3402172273405918E-4,(36:4.856911562786729E-4,47:8.6169985323097E-7):2.402472667050579E-4):0.0018871285466212702,(35:0.0021364732480993963,(39:9.474412586475957E-4,40:8.6169985323097E-7):7.083238857781039E-4):7.062053910704904E-4):2.214614104684155E-4):2.3482461083954606E-4):9.998338385947211E-4):0.0012164116503580302,((((22:0.005200289059543904,(26:0.0033111059616987193,24:3.1779528141058315E-4):8.6169985323097E-7):0.001021927899756606,25:8.810278660345421E-4):0.005305753648057199,(((30:0.004844325340599746,31:0.00300871503102186):0.002188615706596215,((29:0.001365627226288746,((34:0.0011394147770559253,28:3.199742362962629E-4):3.2190294871975634E-4,33:0.001809470389847481):0.0018181061942237674):0.0010150994450385093,(27:0.005246548492856304,32:2.902126214145356E-4):0.0018787903464382602):0.003063193716876769):0.0035108327607416235,23:0.006782239915427405):0.0031807643102395484):0.0010423975924033974,(17:0.006974946546999757,(18:0.0027669730129751126,((21:4.6498725188977557E-4,19:0.001040533459793039):0.0013102525571151392,20:0.0010620645472773445):4.8711704524280263E-4):0.007889964123780823):0.001014979257620346):5.556109281594626E-4):0.0017528794027827299,(15:0.0023499132416531106,16:0.004595766014245863):0.012370513072388258):0.002208100195357949,(((7:2.366597892598514E-4,((13:8.6169985323097E-7,(((10:8.6169985323097E-7,8:2.3062800989551903E-4):8.6169985323097E-7,11:8.6169985323097E-7):8.6169985323097E-7,9:8.6169985323097E-7):8.6169985323097E-7):8.6169985323097E-7,12:8.6169985323097E-7):8.6169985323097E-7):0.011193888215153349,(4:0.004423835862230513,(6:8.6169985323097E-7,5:8.6169985323097E-7):0.00839448163139795):0.0034385370104369466):0.00511479133335343,(1:0.05976276832367712,(2:0.047651902037863805,3:0.028602744808863014):0.007005068060759476):0.036598564109171124):0.014750574056317767,14:0.005529012935000064); 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