#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 26, 2024; 18:03 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Delgado-salinas A., Bibler R., & Lavin M. 2006. Phylogeny of the Genus Phaseolus (Leguminosae): A Recent Diversification in an Ancient Landscape. Systematic Botany, null. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1606] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=166; TAXLABELS Dolichopsis_paraguarensis Macroptilium_atropurpureum Macroptilium_erythroloma Mysanthus_uleanus Oxyrhynchus_volubilis Phaseolus_acutifolius_14 Phaseolus_acutifolius_151 Phaseolus_acutifolius_235 Phaseolus_acutifolius_236 Phaseolus_acutifolius_237 Phaseolus_acutifolius_238 Phaseolus_acutifolius_239 Phaseolus_albescens_201 Phaseolus_albescens_302 Phaseolus_albescens_54 Phaseolus_albiflorus_1851 Phaseolus_albiflorus_1852 Phaseolus_albinervus Phaseolus_albivioaceus Phaseolus_altimontanus Phaseolus_amblyosepalus_221 Phaseolus_amblyosepalus_88 Phaseolus_angustissimus Phaseolus_augustii_168 Phaseolus_augustii_17 Phaseolus_bolivianus Phaseolus_campanulatus Phaseolus_carterae Phaseolus_chiapasanus_300 Phaseolus_chiapasanus_7 Phaseolus_coccineus_153 Phaseolus_coccineus_174 Phaseolus_coccineus_186 Phaseolus_coccineus_231 Phaseolus_coccineus_301 Phaseolus_coccineus_56 Phaseolus_coccineus_57 Phaseolus_coccineus_58 Phaseolus_coccineus_76 Phaseolus_costaricensis Phaseolus_dasycarpus_1856 Phaseolus_dasycarpus_1857 Phaseolus_dumosus_119 Phaseolus_dumosus_1785 Phaseolus_dumosus_295 Phaseolus_dumosus_53 Phaseolus_esperanzae Phaseolus_filiformis_121 Phaseolus_filiformis_20 Phaseolus_glabellus_21 Phaseolus_glabellus_241 Phaseolus_gladiolatus Phaseolus_grayanus_130 Phaseolus_grayanus_161 Phaseolus_grayanus_1813 Phaseolus_grayanus_1814 Phaseolus_hintonii Phaseolus_jaliscanus Phaseolus_juquilensis_156 Phaseolus_juquilensis_1783 Phaseolus_juquilensis_99 Phaseolus_laxiflorus Phaseolus_leptostachyus_179 Phaseolus_leptostachyus_24 Phaseolus_leptostachyus_25 Phaseolus_leptostachyus_307 Phaseolus_lignosus Phaseolus_lunatus_124 Phaseolus_lunatus_189 Phaseolus_lunatus_204 Phaseolus_lunatus_230 Phaseolus_lunatus_27 Phaseolus_lunatus_308 Phaseolus_macrolepis_1511 Phaseolus_macrolepis_1849 Phaseolus_maculatifolius_145 Phaseolus_maculatifolius_1880 Phaseolus_maculatus_191 Phaseolus_maculatus_234 Phaseolus_maculatus_29 Phaseolus_macvaughii Phaseolus_magnilobatus Phaseolus_marechalii_170 Phaseolus_marechalii_305 Phaseolus_micranthus Phaseolus_microcarpus_131 Phaseolus_microcarpus_32 Phaseolus_mollis Phaseolus_neglectus_242 Phaseolus_neglectus_33 Phaseolus_nelsonii Phaseolus_nodosus Phaseolus_novoleonensis_1860 Phaseolus_novoleonensis_1861 Phaseolus_oaxacanus_163 Phaseolus_oaxacanus_1866 Phaseolus_oaxacanus_35 Phaseolus_oligospermus_203 Phaseolus_oligospermus_36 Phaseolus_pachyrrhizoides Phaseolus_parvifolius_150 Phaseolus_parvifolius_1862 Phaseolus_parvulus Phaseolus_pauciflorus_164 Phaseolus_pauciflorus_1825 Phaseolus_pedicellatus_1863 Phaseolus_pedicellatus_1864 Phaseolus_pedicellatus_1881 Phaseolus_pedicellatus_39 Phaseolus_pedicellatus_42 Phaseolus_perplexus_194 Phaseolus_perplexus_208 Phaseolus_persistentus Phaseolus_plagiocylix Phaseolus_pluriflorus_3 Phaseolus_pluriflorus_4 Phaseolus_polymorphus Phaseolus_polystachios Phaseolus_reticulatus_1867 Phaseolus_reticulatus_44 Phaseolus_ritensis_205 Phaseolus_ritensis_45 Phaseolus_rotundatus Phaseolus_salicifolius_158 Phaseolus_salicifolius_1869 Phaseolus_sinuatus Phaseolus_smilacifolius Phaseolus_sonorensis Phaseolus_talamancensis Phaseolus_tenellus Phaseolus_texensis_1883 Phaseolus_texensis_1884 Phaseolus_tuerckheimii_128 Phaseolus_tuerckheimii_1871 Phaseolus_tuerckheimii_50 Phaseolus_viridis Phaseolus_vulgaris_118 Phaseolus_vulgaris_120 Phaseolus_vulgaris_175 Phaseolus_vulgaris_176 Phaseolus_vulgaris_177 Phaseolus_vulgaris_233 Phaseolus_vulgaris_303 Phaseolus_vulgaris_304 Phaseolus_vulgaris_59 Phaseolus_vulgaris_60 Phaseolus_vulgaris_Z48779 Phaseolus_xanthotrichus_10 Phaseolus_xanthotrichus_9 Phaseolus_xolocotzii_165 Phaseolus_xolocotzii_207 Phaseolus_zimapanensis_123 Phaseolus_zimapanensis_43 Ramirezella_strobilophora Strophostyles_helvola Strophostyles_umbellata Vigna_adenantha Vigna_gentryi Vigna_linearis Vigna_longifolia Vigna_peduncularis Vigna_populnea Vigna_radiata Vigna_speciosa Vigna_trichocarpa Vigna_unguiculata ; 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END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa3; DIMENSIONS NTAX=82; TAXLABELS Dolichopsis_paraguariensis Macroptilium_atropurpureum Macroptilium_erythroloma Mysanthus_uleanus Oxyrhynchus_volubilis Phaseolus_acutifolius_238 Phaseolus_acutifolius_239 Phaseolus_albescens Phaseolus_albinervus Phaseolus_altimontanus Phaseolus_angustissimus Phaseolus_augusti Phaseolus_bolivianus Phaseolus_carterae Phaseolus_chiapasanus Phaseolus_coccineus_56 Phaseolus_coccineus_57 Phaseolus_coccineus_58 Phaseolus_coccineus_76 Phaseolus_costaricensis Phaseolus_dasycarpus Phaseolus_dumosus_119 Phaseolus_dumosus_1785 Phaseolus_esperanzae Phaseolus_filiformis Phaseolus_glabellus Phaseolus_gladiolatus Phaseolus_grayanus_130 Phaseolus_grayanus_1813 Phaseolus_hintonii Phaseolus_jaliscanus Phaseolus_juquilensis Phaseolus_laxiflorus Phaseolus_leptostachyus_24 Phaseolus_leptostachyus_25 Phaseolus_lunatus Phaseolus_macrolepis Phaseolus_maculatus Phaseolus_macvaughii Phaseolus_marechalii Phaseolus_micranthus Phaseolus_microcarpus Phaseolus_mollis Phaseolus_neglectus Phaseolus_oaxacanus Phaseolus_oligospermus Phaseolus_pachyrrhizoides Phaseolus_parvifolius Phaseolus_parvulus Phaseolus_pauciflorus Phaseolus_pedicellatus Phaseolus_perplexus Phaseolus_persistentus Phaseolus_pluriflorus Phaseolus_polystachios Phaseolus_reticulatus Phaseolus_ritensis Phaseolus_smilacifolius Phaseolus_tenellus Phaseolus_texensis_1883 Phaseolus_texensis_1884 Phaseolus_tuerckheimii Phaseolus_viridis Phaseolus_vulgaris_118 Phaseolus_vulgaris_120 Phaseolus_vulgaris_177 Phaseolus_xanthotrichus_10 Phaseolus_xanthotrichus_9 Phaseolus_zimapanensis Ramirezella_strobilophora Strophostyles_helvola Strophostyles_umbellata Vigna_adenantha Vigna_gentryi Vigna_linearis Vigna_longifolia Vigna_peduncularis Vigna_populnea Vigna_radiata Vigna_speciosa Vigna_trichocarpa Vigna_unguiculata ; 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TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M2667] TITLE ITS; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=812; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Dolichopsis_paraguarensis 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Phaseolus_glabellus ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGTAAA??CACGACTGATCCAGAAAGGAATGACTGGAAAAAGTAGCATGTCGTATCAATGAAGAGTTTTCAAAATATTTCATTCTTATAGGATCCAGCTCAAATTTTTGTTTGAATTTTTGGCTCGTAAAAAAAAAA---------TTCAGTTGGGTTTCATTTATAAAGGGATAGAACTTGGTGGTTCTAATTCTAATAGGGAAACAAAAAGCATCGAGCTTTC----ATTTCTTTTTTATTTGGATCATTACCCCATCTAATTGTACGTTAAAAAGAGGTTAGTGCTTGATGTGGGAAAAGCTTTTCTGGTGAATGGGTTA-----TTTTTGTTATGAGTCCTAACTATA-TAGCTAGTTTCCATTAT----TAGTATTTTGGGATAGCGATAAATGTGTAAAAGAAAGAGTATATTGAT----AAAGATCTTTTTTCCAAAATCAAAAGAGCGATTAGGTAAAAAAAAAA---TAAAGGATTCTTAAT------TAGCTCGTTATCCT------AGAAAAAAAA-TTAGGTGAAAAAGCGATTAGAGAGAGTCCGTTCATGGGTTTGACTTGTTTTCTAGGTATATATATAT----------------------------ACCTAGAATTCTATGTTTTGACCATATCGCACTATGTATCATTTGATAATCCAATGAATCTCTGATTCTTTATTTGA------CCAAATAGACTTTTTTAATGTTTAATGGAGAAATATCAAGCATATTTAGAACTC---CGTAGATCTCGATACCAGGATATCCTATACCCACTTTTTTTTCGGGAATCTATTTATGGACTAGCTTATGGTCATGAGTCCTTTTTTATAGAAAATGTAGATTCTAACAATAAATTTAGTTTACTAATTGTAAAACGTTTAAGTACTCGAATGTATCAACAGACTAATTTCATTCTTTTTGCTAACGATTCTAACAAAAAGACTTTTGGGGGTTATAACTATAATTTTGATTCTCAAATAATATTAGAAGGTTTTGGTGTCGTCGTGGAGATTCTATTTTCTCTACAATTCTTTATCTCTTCCTTAAGGGGATTAGAAAGCGTAAAATCTTATAAAAATTTGCAATCAATTCATTCCATTTTTCCCTTTTTCGAAGAGAAATTGATATATTTAAATCATAAGTCAGATATACGAATACCTTATCCTATCCATCTGGAAATCTTGGTTCAAATCCTTCGATATTGGATAAAAGATGTCTCTTTCTTTCATTTAATAAGGTTTTTTTTTTATTACTATTCTAATTGGAATAGTCTTTTTCCTCCAAAAAAATGGATTTCTACTTTTTTTTCAAAAAGGAATCTAAGAATTTTCTTGTTCCTATATAATTTATATGTATGGGAATATGAATCTATCTTTCTTTTTTTACGTAACAAATCCTCTCTGTTACAGTTAAAACATTTTCGTGTTTTTTTTGAGCGAATTTTTTTCTATGAAAAAATCAAACATCTTGTAGAAGTATCTACAAAGAATTGTTCATATACCTTATTCTTCTTTAAGGATACTTTCATCCATTATGTTAGATATCAAGGAAAATCAATTCTTATTTTAAAGAATACTCCTCTTTTGATAAATAAATGGAAATACTATTTTATATATTTATGGCAATGTTATTTTGATATTTGGGCTGGACCAGAAACGATCTATATAAACCAATTATCTCAGTATTCATTTCACTTTTTAGGCTATTTTTTAAGTATTCCACAAAATCTTTCAGTAGTACGAAGTCAAATGTTGCAAAATTCATTTCTAATCAAAATTGTTATAAAAAAACTTGATACAATAATTCCCATTATTCCTCTAATGAGATCATTGGCTAAATCAAAATTTTGTAATGTAATGGGTCATCCTATTAGTAAACCGGTTTGGGCCAATTTCTCTGATTTTGATATTCTTGACCGGTTTTTGCGCATATGCAGAAATTTTTCTCATTATTACAATGGATCCGCAAAAAAAAAGAGTTTCTATCAAATCAAATATATACTTCGGTTTTCTTGTATAAAAACTTTGGCTCGTAAGCACAAAAGTACTGTGCGCACTTTTTTGAAAAAATTAAGTTCAGAAAAATTGTTGGAAGAATTTTTTACAGAAGAAGAGCTTTTTTCTTTTCTTTTTCCAAGAACTTCTTTGACTTTGCGGAGGTTTTATAGAGGTCGGATTTGGTATTTGGATATTCTTTTCAGAAACGATTTCGTCAATCATTTAGAATTGAAA---ATAGGTTATGATATTTTTTAAATCGGTGTCAATTGATAAAACGAAATTCTTTT---------TATTAAA{CT}GAGGATAAAAAAAA--TCATTTTTTTAG-AATCTCCTATA------------------TCTAT------AGGATTTTGAAATGCTCATGTAGTCAGAGTAAAGATTCGGG{CG}TTAATGAATTGAATATTTAACTT-----TCTTAG?GTCTTTTGCTAGGCAAGTAATTCAGGTTTAAA{AT}GTATACATAGGGAAAGCCGTGTGCAATGAAAAATGC?AACACGGCTTGGGGAGGGATTT?????????????????????????????????????????????????? Phaseolus_gladiolatus ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGTAAA??CACGACTGATCCAGAAAGGAATGACTGGAAAAAGTAGCATGTCGTATCAATGAAGAGTTTGAAAAATATTTCATTCTTATAGGATCCAGCTCAAATTTTTGTTTGAATTTTTGGCTCGTAAAAAAAAAA---------TTCAGTTGGGTTTCATTTATAAAGGGATAGAACTTGGTGGTTCTAATTCTAATAGGGAAACAAAAAGCATCGAGCTTTC----ATTTATTTTTTATTTGGATCATTACCCCATCTAATTGTACGTTAAAAAGAGGTTAGTGCTTGATGTGGGAAAAGCTTTTCTGGTGAATGGGTTA-----TTTTTGTTATGAGTCCTAACTATA-TAGCTAGTTTCCATTAT----TGGTATTTTGGGATAGCGATAAATGTGTAAAAGAAAGAGTATATTGAT----AAAGATATTTTTTCCAAAATCAAAAGAGCGATTAGGTAAAAAAAAA----TAAAGGATTCTTCAT------TAGCTCGTTATCCT------AGAAAAAAA--TTAGGTGAAAAATCGATTAGAGAGAGTCTGTTCATGGGTTTGACTTGTTTTCTAGGTATATATATATAT--------------------------ACCTAGAATTCTATGTTTTGACCATATCGCACTATGTATCATTTGATAATCCAATGAATCTCTGATTCTTTATTTGA------CCAAATAGACTTTTTGAATGTTTAATGGAGAAATATAAAGCATATTTAGAACTC---CGTAGATCTCGATACCAGGATATCCTATACCCACTTTTTTTTCGGGAATCTATTTATGGACTAGCTTATGGTCATGAGTCCTTTTTTATAGAAAATGTAGATTATAACAATAAATTTAGTTTACTAATTGTAAAACGTTTAAGTACTCGAATGTATCAACAGACTAATTTCATTCTTTTTGCTAACGATTCTAACAAAAATACTTTTGTGGGTTATAACTATACTTTTGATTCTCAAATAATATTAGAAGGTTTTGGTGTCGTCGTGGAGATTCTATTTTCTCTACAATTATTTATCTCTTCCTTAAGGAGATTAGAAAGCGTAAAATCTTATAAAAATTTGCAATCAATTCATTCCATTTTTCCCTTTTTCGAAGATAAACTGATATATTTAAATCATAAGTCAGATATACGAATACCTTATCCTATCCATCTGGAAATCTTGGTTCAAATCCTTCGATATTGGATAAAAGATGTCTCTTTCTTTCATTTAATAAGGTTTTTTTTTTATTACTATTCTAATTGGAATAGTCTTTTTCCTCCAAAAAAATGGATTTCTACTTTTTTTTCAAAAAGGAATCTAAGAATTTTCTTGTTCCTATATAATTTATATGTATGGGAATATGAATCTATCTTTCTTTTTTTACGTAACAAATCCTCTCAGTTACAGTTAAAACATTTTCGCGTTTTTTTTGAGCGAATTCTTTTCTATGAAAAAATAAAACATCTTGTAGAAGTATCTACAAAGAATTGTTCATATACTTTATTCTTCTTTAAGGATACTTTCATCCATTATGTTAGATATCAAGGAAAATCAATTCTTATTTTAAAGAATACTCCTCTTTTGATAAATAAATGGAAATACTATTTTATATATTTATGGCAATGTTATTTTGATATTTGGGCTGGACCAGAAACGATCTATATAAACCAATTATCTCAGTATTCCTTTCGCTTTTTAGGCTATTTTTTAAGTATTCCACAAAATCTTTCAGTAGTAC?AAGTCAAA?GTTGCAAAATTCATTTCTAATCAAAATTGTTATCAAAAAACTTGATACAATAATTCCCATTATTCCTCTAATGAGATCATTGGCTAAATCAAAATTTTGTAATGTAATGGGTCATCCTATTAGTAAACCGGTTTGGGCCAATTTCTCTGATTTTGATATTCTTTACCGGTTTTTGCGCATATGCAGAAATTTTTCTCATTATTACAATGGATCCGCAAAAAAAAAGAGTTTCTATCAAATCAAATATATACTTCGGTTTTCTTGTATAAAAACTTTGGCTCGTAAGCACAAAAGTACTGTGCGCACTTTTTTGAAAAAATTAAGTTCAGAAAAATTGTTGGAAGAATTTTTTACAGAAGAAGAGCTTTTTTCTTTTATTTTTCCAAGAACTTCTTTGACTTTGCGGAGGTTTTATAGAGGTCGGATTTGGTATTTGGATATTCTTTTCAGAAACGATTTCGTCAATCATTTAGAATTGAAA---ATAGGTTATGATATTTTTTAAATTGGTGTAAATTGATAAAACGAAATTCTTTT---------TATTAAATGAGGATAAAAAAAAA-TCATTTTTTTAA-AATATCCTATA------------------TCTAT------AGGATTTTGAAATGTTCATGTAGTCAGAGTCAAGATTCGGGGTTAATGAATTGAATATTTCACTT-----TCTTAGAGTCTTTTGCTAGGCAAGTAATTCAGGTTTCAATGTATACATAGGGAAAGCCGTGTGCAATGAAAAATGCAAACACGGCTTGGGGAGGGATTTTTTCTTGTTTTATT-CTATT-GTTGAATTTGATTAAA-GAATAAAT???? Phaseolus_grayanus_130 TATCGGCTTTTAAGAGCGACTCTATTTTTTACACATTCCTATGAAGCAATCGGTTCGTCGATACTATTGGTAGAGCTTGTAAAACCACGACTGATCCAGAAAGGAATGACTGGAAAAAGTAGCATGTCGTATCAATGAAGAGTTTTAAAAATATTTCATTCTTATAGGATCCAGCTCAAATTTTTGTTTGAATTTTTGGCTCGTAAAAAAAAAA---------TTCAGTTGGGTTTCATTTATAAAGGGATAGAACTTGGTGGTTCTAATTCTAATAGGGAAACAAAAAGCATCGAGCTTTC----ATTTATTTTTTATTTGGATCATTACCCCATCTAATTGTACGTTAAAAAGAGGTTAGTGCTTGATGTGGGAAAAGCTTTTCTGGTGAATGGGTTCT----TTTTTTTTATGAGTCCTAACTATA-TAGCTAGTTTCCATTAT----AGTTATTTTGGGATAGCGATCAATGTGTAAAAGAAAGAGTATATTGAT----AAAGATCTTTTTTCCAAAATCAAAAGAGCGATTAGGTAAAAAAAAA----TAAAGGATTCTTAAT------TAGCTCGTTATCCT------AGATAAAAAAATTAGGTGAAAAATCGATTAGAGAGAGTCCGTTCATGGGTTTGACTTGTTTTCTAGGTATATAGATAT----------------------------ACCTAGAATTCTCTGTTTTGACCATATCGCACTATGTATCATTTGATAATCCAATGAATCTCTGATTCTTTATTTGA------CCAAATAGACTTTTTGAATGTTTAATGGAGAAATATCAAGCATATTTAGAACTC---CGTAGATCTCGATACCAGGATATCCTATACCCACTTTTTTTTCGGGAATCTATTTATGGACTAGCTTATGGTCATGAGTCCTTTTTTATAGAAAATGTAGATTATAACAATAAATTTAGTTTACTAATTGTAAAACGTTTAAGTACTCGAATGTATCAACAGACTAATTTCATTCTTTTTGCTAACGCTTCTAACAAAAATACTTTTGTGGGTTATAACTATAATTTTGATTCTCAAATAATATTAGAAGGTTTTGGTGTCGTCGTGGAGATTCTATTTTCTCTACAATTCTTTATCTCTTCCTTAAAGGGATTAGAAAGCGTAAAATCTTATAAAAATTTGCAATCAATTCATTCCATTTTTCCCTTTTTCGAAGATAAACTGATATATTTAAATCATAAGTCAGATATACGAATACCTTATCCTATCCATCTGGAAATCTTGGTTCAAATCCTTCGATATTGGATAAAAGATGTCTCTTTCTTTCATTTCATAAGGTTTTTTTTTAATTACTATTCTAATTGGAATAGTATTTTTCCTCCAAAAAAAGGGATTTCTACTTTTTTTTCAAAAAGGAATCTAAGAATTTTCTTGTTCCTATATAATTTATATGTATGGGAATATGAATCTATCTTTCTTTTTCTACGTAAAAAATCCTCTCAGTTACAGTTAAAACATTTTCGCGTTTTTTTTGAGCGAATTTTTTTCTATGAAAAAATAAAACATCTTGTAGAAGTATCTACAAAGAATTGTTCATATACCTTATTCTTCTTTAAGGATACTTTCATCCATTATGTTAGATATCAAGGAAAATCCATTCTTATTTTAAAGAATACTCCTCTTTTGATAAATAAATGGAAATACTATTTTATATATTTATGGCAATGTTATTTTGATATTTGGGCTGGACCAGAAACGATCTATATAAACCAATTATCTCAGTATTCATTTCACTTTTTAGGCTATTTTTTAAGTATTCCACAAAATCTTTCAGTAGTACGAAGTCAAATGTTGCAAAATTCATTTCTAATCAAAATTGTTATCAAAAAACTTGATACAAGAATTCCCATTATTCCTCTAATGAGATCATTGGCTAAAACAAAATTTTGTAATGTAATGGGTCATCCTATTAGTAAACCGGTTTGGGCCAATTTCTCTGATTTTGATATTCTTGACCGGTTTTTGCGCATATGCAGAAATTTTTCTCATTATTACAATGGATCCGCAAAAAAAAAGAGTTTATATCAAATCAAATATATACTTCGGTTTTCTTGTATAAAAACTTTGGCTCGTAAGCACAAAAGTACTGTGCGCACTTTTTTGAAAAAATTAAGTTCAGAAAAATTGTTGGAAGAATTTTTTACAGAAGAAGAGCTTTTTTCTTTTATTTTTCCAAGAACTTCTTTGACTTTGCGGAGGTTTTCTAGAGGTCGGGTTTGGTATTTGGATATTCTTTTCAGAAACGATTTCGTCAATCATTTAGAATTGAAA---ATAGGTTATGATATTTTTTAAATTAGTGTAAATTGATAAAACGAAATTCTTTTT---------ATTAAATGAGGATAAAAAAAA--TCATTTTTTTT--AATCTCCTATA------------------CCTAT------AGGATTTTTAAATGCTCATGTAGTCAGAGTCAAGATTCGGGGTTAATGAATTGAATATTTAACTT-----TCTTAGAGTCTTTTGCTAGGCAAGTAATTCAGGTTTAAATGTATACATAGGGAAAGCCGTGTGCAATGAAAAATGCAAACACGGCTTGGGGAGGGATTTTTTCTTGTTTTATT-CTATT-GTTGAATTTGATTAAA-GAATAAATAT?? 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Phaseolus_hintonii ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGTAAA??CACGACTGATCCAGAAAGGAATGACTGGAAAAAGTAGCATGTCGTATCAATGAAGAGTTTTAAAAATATTTCATTCTTATAGGATCCAACTCAAATTTTTGTTTGAATTTTTGGCTCGTAAAAAAAAAA---------TTCAGTTGGGTTTCATTTATAAAGGGATAGAACTTGGTGGTTCTAATTCTAATAGGGAAACAAAAAGCATCGAGCTTTC----ATTTATTTTTTATTTGGATCATTACCCCATCTAATTGTACGTTAAAAAGAGGTTAGTGCTTGATGTGGGAAAAGCTTTTCTGGTGAATGGGTTA-----TTTTTGTTATGAGTCCTAACTATA-TAGCTAGTTTCCATTAT----TGGTATTTTGGGATAGCGATAAATGTGTAAAAGAAAGAGTATATTGAT----AAAGATATTTTTTCCAAAATCAAAAGAGCGATTAGGTAAAAAAAAAAAA-TAAAGGATTCTTCAT------TAGCTCGTTATCCT------AGAAAAAAA--TTAGGTGAAAAATCGATTAGAGAGAGTCCGTTCATGGGTTTGACTTGTTTTCTAGGTATATATATATAT--------------------------ACCTAGAATTCTATGTTTTGACCATATCGCACTATGTATCATTTGATAATCCAATGAATCTCTGATTCTTTATTTGA------CCAAATAGACTTTTTTA-------ATGGAGAAATATAAAGCATATTTAGAACTC---CGTAGATCTCGATACCAGGATATCCTATACCCACTTTTTTTTCGGGAATCTATTTATGGACTAGCTTATGGTCATGAGTCCTTTTTTATAGAAAATGTAGATTATAACAATAAATTTAGTTTACTAATTGTAAAACGTTTAAGTACTCGAATGTATCAACAGACTAATTTCATTCTTTTTGCTAACGATTCTAACAAAAATACTTTTGTGGGTTATAACTATAATTTTGATTCTCAAATAATATTAGAAGGTTTTGGTGTCGTCGTGGAGATTCTATTTTCTCTACAATTATTTCTCTCTTCCTTAAGGAGATTAGAAAGCGTAAAATCTTATAAAAATTTGCAATCAATTCATTCCATTTTTCCCTTTTTCGAAGATAAACTGATATATTTAAATCATAAGTCAGATATACGAATACCTTATCCTATCCATCTGGAAATCTTGGTTCAAATCCTTCGATATTGGATAAAAGATGTCTCTTTCTTTCATTTAATAAGGTTTTTTTTTTATTACTATTCTAATTGGAATAGTCTTTTTCCTCCAAAAAAATGGATTTCTACTTTTTTTTCAAAAAGGAATCTAAGAATTTTCTTGTTCCTATATAATTTATATGTATGGGAATATGAATCTATCTTTCTTTTTTTACGTAACAAATCCTCTCAGTTACAGTTAAAACATTTTCGCGTTTTTTTTGAGCGAATTCTTTTCTATGAAAAAATAAAACATCTTGTAGAAGTATCTACAAAGAATTGTTCATATACCTTATTCTTCTTTAAGGATACTTTCATCCATTATGTTAGATATCAAGGAAAATCAATTCTTATTTTAAAGAATACTCCTCTTTTGATAAATAAATGGAAATACTATTTTATATATTTATGGCAATGTTATTTTGATATTTGGGCTGGACCAGAAACGATCTATATAAACCAATTATCTCAGTATTCATTTCGCTTTTTAGGCTATTTTTTAAGTATTCCACAAAATCTTTCAGTAGTACGAAGTCAAATGTTGCAAAATTCATTTCTAATCAAAATTGTTATCAAAAAACTTGATACAATAATTCCCATTATTCCTCTAATGAGATCATTGGCTAAATCAAAATTTTGTAATGTAATGGGTCATCCTATTAGTCAACCGGTTTGGGCCAATTTCTCTGATTTTGATATTCTTTACCGGTTTTTGCGCATATGCAGAAATTTTTCTCATTATTACAATGGATCCGCAAAAAAAAAGAGTTTCTATCAAATCAAATATATACTTCGGTTTTCTTGTATAAAAACTTTGGCTCGTAAGCACAAAAGTACTGTGCGCACTTTTTTGAAAAAATTAAGTTCAGAAAAATTGTTGGAAGAATTTTTTACAGAAGAAGAGCTTTTTTCTTTTATTTTTCCAAGAATTTCTTTGACTTTGCGGAGGTTTTATAGAGGTCGGATTTGGTATTTGGATATTCTTTTCAGAAACGATTTCGTCAATCATTTAGAATTGAAA---ATAGGTTCTGATATTTTTTAAATTGGTGTAAATTGATAAAACGAAATTCTTTT---------TATTAAATG?GGATAAAAAAAAA-TCATTTTTTT?A-A?TATCCTATA------------------TCTAT------AGGATTTTGAAATGTTCATGTA{CG}TCAGAATCAAGATTCGGGGTTAA{CT}GAATCGAATATTGAACT{CT}-----TC{CT}TAGAGTCT{CT}CTGCTAGGCAAGTAATTCAGGTTTCAAAGTATACATAGGGAAAGCCGTGTGCAATGAAAAATGC????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Phaseolus_pluriflorus ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGTAAAACCACGACTGATCCAGAAAGGAATGACTGGAAAAAGTAGCATGTCGTATCAATGAAGAGTTTTAAAAATATTTCATTCTTATAGGATCCAGCTCAAATTTTTGTTTGAATTTTTGGCTCGTAAAAAAAAAA---------TTCAGTTGGGTTTCATTTATAAAGGGATAGAACTTGGTGGTTCTAATTCTAATAGGGAAACAAAAAGCATCGAGCTTTC----ATTTATTTTTTATTTGGATCATTACCCCATCTAATTGTACGTTAAAAAGAAGTTAGTGCTTGATGTGGGAAAAGCTTTTCTGGTGAATGGGTTA-----TTTTTTTTATGAGTCCTAACTATA-TAGCTAGTTTCCATTAT----AGTTATTTTGGGATAGCGATAAATGTGTAAAAGAAAGAGTATATTGAT----AAAGATCTTTTTTCCAAAATCAAAAGAGCGATTAGGTAAAAAAAAAAA--TAAAGGATTCTTAAT------TACG---TTATCCT------AGAAAAAAAA-TTAGGTGAAAAATCGATTAGAGAGAGTCCGTTCATGGGTTTGACTTGTTTTCTAGGTATATATATAT----------------------------ACCTAGAATTCTCTGTTTTGACCATATCGCACTATGTATCATTTGATAATCCAATGAATCTCTGATTCTTTATTTGA------CCAAATAGACTTTTTTAATGTTTAATGGAGAAATATCAAGCATATTTAGAACTC---CGTAGATCTCGATACCAGGATATCCTATACCCACTTTTTTTTCGGGAATCTATTTATGGACTAGCTTATGGTCATGAGTCCTTTTTTTTAGAAAATTTAGATTATAACAATAAATTTAGTTTACTAATTGTAAAACGTTTAAGTACTCGAATGTATCAACAGACTAATTTCATTCTTTTTGCTAACGATTCTAACAAAAATACTTTTGTGGGTTATAACTATAATTTTGATTCTCAAATAATATTAGAAGGTTTTGGTGTCGTCGTGGAGATTCTATTTTCTCTACAATTATTTATCTCTTCCTTAAGGGGATTAGAAAGCGTAAAATCTTATAAAAATTTGCAATCAATTCATTCCATTTTTCCCTTTTTCGAAGATAAACTGATATATTTAAATCATAAGTCAGATATACGAATACCTTATCCTATCCATCTGGAAATCTTGGTTCAAATCCTTCGATATTGGATAAAAGATGTCTCTTTCTTTCATTTAATAAGGTTTTTTTTTTATTACTATTCTAATTGGAATAGTCTTTTTACTCCAAAAAAATGGATTTCTACTTTTTTTTCAAAAAGGAATCTAAGAATTTTCTTGTTCCTATATAATTTATATGTATGGGAATATGAATCTATCTTTCTTTTTCTACGTAACAAATCCTCTCAGTTACAGTTAAAACATTTTCGCGTTTTTTTTGAGCGAATTTTTTTCTATGAAAAAATAAAACATCTTGTAGAAGTATCTACAAAGAATTGTTCATATACCTTATTCTTCTTTAAGGATACTTTCATCCATTATGTTAGATATCAAGGAAAATCCATTCTGATTTTAAAGAATACTCCTCTTTTGATAAATAAATGGAAATACTATTTTATATATTTATGGCAATGTTATTTTGATATTTGGGCTGGACCAGAAACGATCTATATAAACCAATTATCTCAGTATTCATTTCACTTTTTAGGCTATTTTTTAAGTATTCCACAAAATCTTTCAGTAGTACGAAGTCAAATGTTGCAAAATTCATTTCTAATCAAAATTGTTATCAAAAAACTTGATACAATAATTCCCATTATTCCTCTAATGAGATCATTGGCTAAAACAAAATTTTGTAATGTAATGGGTCATCCTCTTAGTAAACCGGTTTGGGCCAATTTCTCTGATTTTGATATTCTTGACCGGTTTTTGCGCATATGCAGAAATTTTTCTCATTATTACAATGGATCCGCAAAAAAAAAGAGTTTATATCAAATCAAATATATACTTCGGTTTTCTTGTATAAAAACTTTGGCTCGTAAGCACAAAAGTACTGTGCGCACTTTTTTGAAAAAATTAAGTTCAGAAAAATTGTTGGAAGAATTTTTTACAGAAGAAGAGCTTTTTTCTTTTCTTTTTCCAAGAACTTCTTTGACTTTGCGGAGGTTTTATAGAGGTCGGGTTTGGTATTTGGATATTCTTTTCAGAAACGATTTCGTCAATCATTTAGAATTGAAA---ATAGGTTATGATATTTTTTAAATCGGTGTAAATTGATAAAACGAAATTCTTTTTATTAAATTTATTAAATGAGGATAAAAAAAA--TCATTTTTTTG--AATCTCCTATA------------------TCTAT------AGGATTTTTAAATGCTCATGTAGTCAGAGTCAAGATTCGGGGTTAATGAATTGAATATTTAACTT-----TCTTAGAGTCTTTTGCTAGGCAAGTAATTCAGGTTTAAATGTATACATAGGGAAAGCCGTGTGCAATGAAAAATGCAAACACGGCTTGGGGAGGGATTTTTTCTTGTTTTATT-CTATT-GTTGAATTTGATTAAA-GAATAAAT???? 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Phaseolus_zimapanensis 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Vigna_radiata ??????????????AGCGACTCTATTTTTTACACATTTCTATGAAGCAATCGATTCGTCGATACTATCGGTAGAGCTTGTAAAACCACGACTGATCCAGAAAGGAATGACTGGAAAAAGTAGCATGTCGTATCAATGAAGAATTCTAAAAATATTTCATTCTTATAGGATCCAGCTCAAATTTTTGTTTGAATTTTTGGCTCGTAACAAAAAAAA--------TTCAGTTGGGTTTGATTAATAAAGGGATAGAACTTGGTGGTTCTAATTCTAATAGGAAAACCAAAAGCATCGAGCTTTC----GTTTCTTTTTTATTTGGAGCATTACCCCATCTAATTGTACGTTAAAAATAGGTTAGTGCTTGATGTGGGAAAAGCTTTTCTGGTAAATGGGTTA-----TTTTTTTTATGAGTCCTAACTATA-TAGCTATTTTCCATTATCTTTTGGTATTTTGGGGTAGCGATAAATGTGTAAAAGAAAGAGTATATTGAT----AAAGATATTTTTTCCAAAATCAAAAGAGCGATTAGGTAAAAAAA------TAAAGGATTCTTAAT------TAGCTCGTTATCCT------AGAACAAAAA-TTAGGCGAAAAATCGATTAGAGAGAGTCCGTGAATGGGTTTTACTTGTTTTCTAGGTATCTATTTAT----------------------------ACCTATAATTTTCTGTTTTGACCATATCGCACTATGTATCATTTGATAATCCAATGAATCTCTGATTCTTTGTTTGA------CCAAATAGACTTTTTGA-------ATGGAGCAATATAAAGCATATTTAGAACTT---CATAGATCTCGATACCAGGACATCCTATACCCACTTTTTTTTCGGGAATCTATTTATGGACTAGCTTATCGTCATGAGTATTTTTTTATAGAAAATGTAGATTATAACAATAATTTTAGTTTACTAATTGTAAAACGTTTAAGTACTCGAATGTATCAACAGACTCATTTCATTCTTTTTGTTAACGATTCTAAAAAAAATACTTTTGTGGGTTATAACTATCATTTTTATTCTCAAATAATATTAGAAGGTTTTGGTATCGTCGTGGAGATTCTATTTTCTCTACAATTATTTAGCTCTTCCTTAAGGGGATTAGAAATCGTAAAATCTTCTACAAATTTGCAATCAATTCATTCGATTTTTCCCTTTTTCGAAGATAAACTGATATATTTAAATCATAAGTCAGATATACGAATACCTTATCCTATCCATCTCGAAATCTTGGTTCAAATCCTTCGATATTCGATAAAAGATGTATCTTTCTTTCATTTAATAAGGTTGTTTTTTTATTACTATTCTAATAGGAATAGTCTTTTTCCTCCAAAAAAATGGATTTTTACTTTTTTTTCAAAAAGGAATCGAAGAATTTTCTTGTTCCTATATAATTTATATGTATGGGAATATGAATCTATCTTTCTTTTTCTACGTAACAAATCCTCTCAGTTACAGTTAAAACATTTTCGCGTTTTTTTTGAGCGAATTTTTTTCTATGAAAAAATAAAACATCTTGTAAAAGTATCTACTAAGAATTGTTCATATACTTTATTCTTCTTTAAGGATACTTTCATCCATTATGTTAGATATCAAGGAAAATCAATTCTGGTTTTAAAGAATACTCCCTTTTTTATAAATAAATGGAAATACTATTTTATATATTTATGGCAATGTCATTTTGATATTTGGGCTGGACTAGAAACGATCTATATAAACGAATTATCTCAGTATTCATTTCACTTTTTAGGCTATTTTTTAAGTATTCCACTAAATCTTTCAGTAGTACGAAGTCAAATGTTGCAAAATTCATTTCTAATTCAAATTGTTATCAAAAAACTTGATACAATAGTTCCCATTATTCCTCTAATGAGATCATTGGCTAAAACAAAATTTTGTAATGTAATGGGTCATCCTATTAGTAAGCCGGTTTGGGCCAATTTATCTGATTTTGATATTCTTGACCGGTTTTTGCGCATATGCAGAAATTTTTCTCATTATTACAATGGATCTGCAAAAAAAAAGAGTTTTTATCAAATAAAATATATACTTCGGTTTTCTTGTATAAAAACTTTGGCTCGTAAGCACAAAAGTACTGTGCGCATTTATTTGAAAAAATTAAGTTCAGAAAAATTATTGGAAGAATTTTTTACAGAAGAAGATCTTTTTTCTTTGATTTTTCCAAGAACTTCTTTTACTTTGCGTAGGTTTTATAGAGGTCGGATTTGGTATTTGGATATTCTTTTCAGAAACGATTTCGTCAATTATTTATAAGTTAAA---ATAGGTTATGATATTTTTTAAATCGGTGTAAATTGATAAAACGAACTTCCTTCTTTT-----TATTAAATGAGGATAAAAAAA---TCATTTTTTTT--AGTCTTCTATA------------------TCTAT------AGGATTTTGAAATGCTCATGTAGTCAGAGTCAAGATTCGGGGTTAATAAATTGAATATTATATTTCACTTTCTTAGAGTCTTTTGCTAGGCAAGTAATTCAGGTTTAGATGTATACATAGGGAAAGCCGTGTGCAATGAAAACTGCAAACACGGCTTGGGGAGGGATTTTTTCTTGTTTTAT????????????????????????????????????? Vigna_speciosa ????????????????????????TTTTTTACACATTTCTATGAA?CAATCGGTTCGTCGATACTATTGGGAAAGCTTGTAAAACCACGACTGATCCAGAAAGGAATGACTGGAAAAAGTAGCATGTCGTATCAATGAAGAATTTTAAAAATATTTCATTCTTATAGGATCCAGCTCAAATTTTTGTTTGAATTTTTGGCTCGTAACAAAAAAAAA-------TTCAGTTGGGTTTCATTAATAAAGGGATAGAACTTGGTGGTTCTAATTCTAATAGGGAAACAAAAAGCATCGAGCTTTC----ATTTATTTTTTATTTGGATCATTACCCCATCTAATTGTACGTTAAAAAGAGGTTAGTGCTTGATGTGGGAAAAGCTTTTCTGGTGAATGGTTTA-----TTTTTGTTATGAGTCCTAACTATA-TAGCTATTTTCCATTATCTTTTGGTATTTTGGGGTAGCGATAAATGTGTAAAAGAAAGAGTATATTGAT----AAAGATATTTTTTCCAAAATCAAAAGAGCGATTAGGTAAAAAAAAA----TAAAGGATTCTTAAT------TAGCTCGTTATCCT------AGAACAAAAA-TTAGGCGAAAAATCGATTAGAGAGAGTCCGTTGATGGGTTTGACTTGTTTTCTAGGTATATATATATAT--------------------------ACCTAGAATTCTCTGTTTTGACCATATCGCACTATGTATCATTTGATAATCCAATGAATCTCTGATTCTTTGTTTGA------CCAAATAGACTTTTTGA-------ATGGAGAAATATCAAGCATATTTAGAACTC---CATAGATCTCGATACCAGGATATCCTATACCCACTTTTTTTTCGGGAATCTATTTATGGACTAGCTTATGGTCATGAGTCCTTTTTTATAGAAAATGTAGATTATAACAATAAATTGAGTTTACTAATTGTAAAACGTTTAAGTACTCGAATGTATCAACAGACTCATTTCATTCTTTTTGCTAACGATTCTAACAAAAAGACTTTTGTGGGTTATAACTATAATTTTGATTCTCAAATAATATTAGAAGGTTTTGGTGTCGTCGTGGAGATTTTATTTTCTCTACAATTATTTATCTCTTCCTTAAGGGGATTAGAAAACGTAAAATCTTATCAAAATTTGCAATCAATTCATTCCATTTTTCCCTTTTTCGAAGATAAACTGATATATTTAAATCATAAGTCAGATATACGAATACCCTATCCTATCCATCTGGAAATCTTGGTTCAAATCCTTCGATATTGGATAAAAGATGTCTCTTTCTTTCATTTAATAAGGTTGTTTTTTTATTACTATTATAATTGGAATAGTCTTTTTCCTCCAAAAAAATGGATTTCTACTTGTTTTTCAAAAAGGAATCTAAGAATTTTCTTGTTCCTATATAATTTATATGTATGGGAATATGAATCTATCTTTCTTTTTCTACGTAACAAATCCTCTCAGTTACAGTTAAAACATTTTCGCGTTTTTTTTGAGCGAATTTTTTTCTATGAAAAAATAAAACATCTTGTAGAAGTATCTACTAAGAATTGTTCATATACCTTATTCTTCTTTAAGGATACTTTCATCCATTATGTTAGATATCAAGGAAAATCAATTCTCGTTTTAAAGAATACTCCTCTTTTGATAAATAAATGGAAATACTATTTTATATATTTATGGCAATGTCATTTTGATATTTGGGCTGGACCAGGAACGATCTATATAAACCAATTATCTCAGTATTCATTTCACTTTTTAGGCTATTTTTTAAGTATTCCACAAAATCTTTCAGTAGTACGAAGTCAAATGTTGCAAAATTCATTTCTAATCAAAATTGTTATCAAAAAACTTGATACAATAGTTCCCATTATTCCTCTAATCAGATCATTGGCTAAAACAAAATTTTGTAATGTAATGGGTCATCCCATTAGTAAGCCGGTTTGGGCCAATTTCTCTGATTTTGATATTCTTGACCGGTTTTTGCGCATATGCAGAAATTTTTCTCATTATTACAATGGATCCGCAAAAAAAAATAGTTTCTATCAAATAAAATATATACTTCGGTTTTCTTGTATAAAAACTTTGGCTCGTAAGCACAAAAGTACTGTGCGCACTTTTTTGAAAAAATTAAGTTCAGAAAAATTATTGGAAGAATTTTTTACAGAAGAAGATCTTTTTTCTTTTATTTTTTCAAGAACTTCTTTGACTTTGCGGAGGTTTTATAGAGGTCGGATTTGGTATTTGGATATTCTTTTCAGAAACGATTTCGTCAATCATTTAGAATTTAAA---ATAGGTTATGATACTTTTTAAATCGGTGTAAATTGATAAAACGAAATTCTTTT---------TATTAAATGAGGATAAAAAAAAA-TCATTTTTTTT--AATCTTCTATA------------------TCTATAGGAATAGGATTTGGAAATGCTCATGTAGTCAGAGTCAAGATTCGGGGTTAATGAATTGAAGATTTAACTT-----TCTTAGAATATTTTGCTAGGCAAGTAATTCAGGTTTAGATGTATACATAGGGAAAGCCGTGTGCAATGAAAAATGCAACCTCGGC???????????????????????????????????????????????????????????????? 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Phaseolus_albescens 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Phaseolus_albinervus 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Phaseolus_costaricensis 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Phaseolus_esperanzae 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Phaseolus_filiformis 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Phaseolus_glabellus 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Phaseolus_gladiolatus 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Phaseolus_jaliscanus 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Phaseolus_juquilensis 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Phaseolus_lunatus 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Phaseolus_microcarpus 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Phaseolus_mollis 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Phaseolus_parvulus 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Phaseolus_polystachios 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Phaseolus_reticulatus 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Phaseolus_tenellus 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Vigna_longifolia 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Vigna_speciosa 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Phaseolus_polystachios, 29 Phaseolus_pluriflorus, 30 Phaseolus_persistentus, 31 Phaseolus_perplexus, 32 Phaseolus_pedicellatus, 33 Phaseolus_pauciflorus, 34 Phaseolus_parvulus, 35 Phaseolus_parvifolius, 36 Phaseolus_pachyrrhizoides, 37 Phaseolus_oligospermus, 38 Phaseolus_oaxacanus, 39 Phaseolus_neglectus, 40 Phaseolus_mollis, 41 Phaseolus_microcarpus, 42 Phaseolus_micranthus, 43 Phaseolus_marechalii, 44 Phaseolus_macvaughii, 45 Phaseolus_maculatus, 46 Phaseolus_macrolepis, 47 Phaseolus_lunatus, 48 Phaseolus_leptostachyus_25, 49 Phaseolus_leptostachyus_24, 50 Phaseolus_laxiflorus, 51 Phaseolus_juquilensis, 52 Phaseolus_jaliscanus, 53 Phaseolus_hintonii, 54 Phaseolus_grayanus_1813, 55 Phaseolus_grayanus_130, 56 Phaseolus_gladiolatus, 57 Phaseolus_glabellus, 58 Phaseolus_filiformis, 59 Phaseolus_esperanzae, 60 Phaseolus_dumosus_1785, 61 Phaseolus_dumosus_119, 62 Phaseolus_dasycarpus, 63 Phaseolus_costaricensis, 64 Phaseolus_coccineus_76, 65 Phaseolus_coccineus_58, 66 Phaseolus_coccineus_57, 67 Phaseolus_coccineus_56, 68 Phaseolus_chiapasanus, 69 Phaseolus_carterae, 70 Phaseolus_bolivianus, 71 Phaseolus_augusti, 72 Phaseolus_angustissimus, 73 Phaseolus_altimontanus, 74 Phaseolus_albinervus, 75 Phaseolus_albescens, 76 Phaseolus_acutifolius_239, 77 Phaseolus_acutifolius_238, 78 Oxyrhynchus_volubilis, 79 Mysanthus_uleanus, 80 Macroptilium_erythroloma, 81 Macroptilium_atropurpureum, 82 Dolichopsis_paraguariensis; TREE 'trnK-ITS' = [&R] (((1,4),(2,7)),((((3,6),(((9,10),8),((81,80),(79,((11,12),82))))),((78,5),13)),((((((77,76),35),((((63,(61,60)),67,((66,65),64)),75),(19,18,17,30))),((58,69),72)),((((40,47),(((20,36),71),70)),(((51,43),(45,52),(25,28)),(74,27,26))),(44,((49,48),42)))),(((((34,24),(33,31)),29),(((39,73),62,32,50,59,54,55),(23,22))),(((68,(((15,16),53),(14,56))),(21,37)),((46,57),(38,41))))))); END; BEGIN TREES; TITLE Tb7911; LINK TAXA = Taxa2; TRANSLATE 1 Vigna_unguiculata, 2 Vigna_trichocarpa, 3 Vigna_speciosa, 4 Vigna_radiata, 5 Vigna_populnea, 6 Vigna_peduncularis, 7 Vigna_longifolia, 8 Vigna_linearis, 9 Vigna_gentryi, 10 Vigna_adenantha, 11 Strophostyles_umbellata, 12 Strophostyles_helvola, 13 Ramirezella_strobilophora, 14 Phaseolus_zimapanensis, 15 Phaseolus_xanthotrichus_9, 16 Phaseolus_xanthotrichus_10, 17 Phaseolus_vulgaris_177, 18 Phaseolus_vulgaris_1588, 19 Phaseolus_vulgaris_120, 20 Phaseolus_vulgaris_118, 21 Phaseolus_viridis, 22 Phaseolus_tuerckheimii, 23 Phaseolus_texensis_1884, 24 Phaseolus_texensis_1883, 25 Phaseolus_tenellus_1589, 26 Phaseolus_smilacifolius, 27 Phaseolus_ritensis, 28 Phaseolus_reticulatus, 29 Phaseolus_polystachios, 30 Phaseolus_pluriflorus, 31 Phaseolus_pedicellatus_39, 32 Phaseolus_pedicellatus_1789, 33 Phaseolus_pauciflorus, 34 Phaseolus_parvulus, 35 Phaseolus_parvifolius, 36 Phaseolus_pachyrrhizoides, 37 Phaseolus_oligospermus_36, 38 Phaseolus_oligospermus_1824, 39 Phaseolus_oaxacanus, 40 Phaseolus_neglectus, 41 Phaseolus_mollis, 42 Phaseolus_microcarpus, 43 Phaseolus_micranthus_306, 44 Phaseolus_marechalii_305, 45 Phaseolus_marechalii_170, 46 Phaseolus_macvaughii_28, 47 Phaseolus_macvaughii_19, 48 Phaseolus_maculatus_29, 49 Phaseolus_maculatus_234, 50 Phaseolus_macrolepis, 51 Phaseolus_lunatus, 52 Phaseolus_leptostachyus_25, 53 Phaseolus_leptostachyus_24, 54 Phaseolus_leptostachyus_23, 55 Phaseolus_laxiflorus, 56 Phaseolus_juquilensis, 57 Phaseolus_jaliscanus, 58 Phaseolus_hintonii, 59 Phaseolus_grayanus_1813, 60 Phaseolus_grayanus_130, 61 Phaseolus_gladiolatus, 62 Phaseolus_glabellus, 63 Phaseolus_filiformis, 64 Phaseolus_esperanzae, 65 Phaseolus_dumosus_1785, 66 Phaseolus_dumosus_119, 67 Phaseolus_dasycarpus, 68 Phaseolus_costaricensis, 69 Phaseolus_coccineus_76, 70 Phaseolus_coccineus_58, 71 Phaseolus_coccineus_57, 72 Phaseolus_coccineus_56, 73 Phaseolus_chiapasanus, 74 Phaseolus_carterae, 75 Phaseolus_bolivianus_18, 76 Phaseolus_bolivianus_1567, 77 Phaseolus_augusti, 78 Phaseolus_angustissimus_16, 79 Phaseolus_angustissimus_133, 80 Phaseolus_altimontanus, 81 Phaseolus_albinervus, 82 Phaseolus_albescens_54a, 83 Phaseolus_albescens_54, 84 Phaseolus_albescens_1772, 85 Phaseolus_acutifolius_239, 86 Phaseolus_acutifolius_238, 87 Oxyrhynchus_volubilis, 88 Mysanthus_uleanus, 89 Macroptilium_erythroloma, 90 Macroptilium_atropurpureum, 91 Dolichopsis_paraguariensis; TREE trnK = [&R] (1,(4,((2,7),(((3,(9,10),6,8,((90,89),88,((11,12),91))),((87,5),13)),((((((86,85),35),(((68,66,65),((17,18),20,19)),(84,83,82),(72,(71,70,69)))),((63,(78,79)),74)),((((41,51),(21,36,(77,75),76)),((56,44,45),(48,49,57),26,29,81,28,27)),((47,46),(54,53,52,43)))),((((67,(40,80),(31,55),32,64,59,60),(24,23)),(34,25),30,33),((73,((15,16),(58,(14,61))),((22,37),38)),((50,42),62,39)))))))); END; BEGIN TREES; TITLE Tb7912; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Vigna_unguiculata, 2 Vigna_trichocarpa, 3 Vigna_speciosa, 4 Vigna_radiata, 5 Vigna_populnea, 6 Vigna_peduncularis, 7 Vigna_longifolia, 8 Vigna_linearis, 9 Vigna_gentryi, 10 Vigna_adenantha, 11 Strophostyles_umbellata, 12 Strophostyles_helvola, 13 Ramirezella_strobilophora, 14 Phaseolus_zimapanensis_43, 15 Phaseolus_zimapanensis_123, 16 Phaseolus_xolocotzii_207, 17 Phaseolus_xolocotzii_165, 18 Phaseolus_xanthotrichus_9, 19 Phaseolus_xanthotrichus_10, 20 Phaseolus_vulgaris_Z48779, 21 Phaseolus_vulgaris_60, 22 Phaseolus_vulgaris_59, 23 Phaseolus_vulgaris_304, 24 Phaseolus_vulgaris_303, 25 Phaseolus_vulgaris_233, 26 Phaseolus_vulgaris_177, 27 Phaseolus_vulgaris_176, 28 Phaseolus_vulgaris_175, 29 Phaseolus_vulgaris_120, 30 Phaseolus_vulgaris_118, 31 Phaseolus_viridis, 32 Phaseolus_tuerckheimii_50, 33 Phaseolus_tuerckheimii_1871, 34 Phaseolus_tuerckheimii_128, 35 Phaseolus_texensis_1884, 36 Phaseolus_texensis_1883, 37 Phaseolus_tenellus, 38 Phaseolus_talamancensis, 39 Phaseolus_sonorensis, 40 Phaseolus_smilacifolius, 41 Phaseolus_sinuatus, 42 Phaseolus_salicifolius_1869, 43 Phaseolus_salicifolius_158, 44 Phaseolus_rotundatus, 45 Phaseolus_ritensis_45, 46 Phaseolus_ritensis_205, 47 Phaseolus_reticulatus_44, 48 Phaseolus_reticulatus_1867, 49 Phaseolus_polystachios, 50 Phaseolus_polymorphus, 51 Phaseolus_pluriflorus_4, 52 Phaseolus_pluriflorus_3, 53 Phaseolus_plagiocylix, 54 Phaseolus_persistentus, 55 Phaseolus_perplexus_208, 56 Phaseolus_perplexus_194, 57 Phaseolus_pedicellatus_42, 58 Phaseolus_pedicellatus_39, 59 Phaseolus_pedicellatus_1881, 60 Phaseolus_pedicellatus_1864, 61 Phaseolus_pedicellatus_1863, 62 Phaseolus_pauciflorus_1825, 63 Phaseolus_pauciflorus_164, 64 Phaseolus_parvulus, 65 Phaseolus_parvifolius_1862, 66 Phaseolus_parvifolius_150, 67 Phaseolus_pachyrrhizoides, 68 Phaseolus_oligospermus_36, 69 Phaseolus_oligospermus_203, 70 Phaseolus_oaxacanus_35, 71 Phaseolus_oaxacanus_1866, 72 Phaseolus_oaxacanus_163, 73 Phaseolus_novoleonensis_1861, 74 Phaseolus_novoleonensis_1860, 75 Phaseolus_nodosus, 76 Phaseolus_nelsonii, 77 Phaseolus_neglectus_33, 78 Phaseolus_neglectus_242, 79 Phaseolus_mollis, 80 Phaseolus_microcarpus_32, 81 Phaseolus_microcarpus_131, 82 Phaseolus_micranthus, 83 Phaseolus_marechalii_305, 84 Phaseolus_marechalii_170, 85 Phaseolus_magnilobatus, 86 Phaseolus_macvaughii, 87 Phaseolus_maculatus_29, 88 Phaseolus_maculatus_234, 89 Phaseolus_maculatus_191, 90 Phaseolus_maculatifolius_1880, 91 Phaseolus_maculatifolius_145, 92 Phaseolus_macrolepis_1849, 93 Phaseolus_macrolepis_1511, 94 Phaseolus_lunatus_308, 95 Phaseolus_lunatus_27, 96 Phaseolus_lunatus_230, 97 Phaseolus_lunatus_204, 98 Phaseolus_lunatus_189, 99 Phaseolus_lunatus_124, 100 Phaseolus_lignosus, 101 Phaseolus_leptostachyus_307, 102 Phaseolus_leptostachyus_25, 103 Phaseolus_leptostachyus_24, 104 Phaseolus_leptostachyus_179, 105 Phaseolus_laxiflorus, 106 Phaseolus_juquilensis_99, 107 Phaseolus_juquilensis_1783, 108 Phaseolus_juquilensis_156, 109 Phaseolus_jaliscanus, 110 Phaseolus_hintonii, 111 Phaseolus_grayanus_1814, 112 Phaseolus_grayanus_1813, 113 Phaseolus_grayanus_161, 114 Phaseolus_grayanus_130, 115 Phaseolus_gladiolatus, 116 Phaseolus_glabellus_241, 117 Phaseolus_glabellus_21, 118 Phaseolus_filiformis_20, 119 Phaseolus_filiformis_121, 120 Phaseolus_esperanzae, 121 Phaseolus_dumosus_53, 122 Phaseolus_dumosus_295, 123 Phaseolus_dumosus_1785, 124 Phaseolus_dumosus_119, 125 Phaseolus_dasycarpus_1857, 126 Phaseolus_dasycarpus_1856, 127 Phaseolus_costaricensis, 128 Phaseolus_coccineus_76, 129 Phaseolus_coccineus_58, 130 Phaseolus_coccineus_57, 131 Phaseolus_coccineus_56, 132 Phaseolus_coccineus_301, 133 Phaseolus_coccineus_231, 134 Phaseolus_coccineus_186, 135 Phaseolus_coccineus_174, 136 Phaseolus_coccineus_153, 137 Phaseolus_chiapasanus_7, 138 Phaseolus_chiapasanus_300, 139 Phaseolus_carterae, 140 Phaseolus_campanulatus, 141 Phaseolus_bolivianus, 142 Phaseolus_augustii_17, 143 Phaseolus_augustii_168, 144 Phaseolus_angustissimus, 145 Phaseolus_amblyosepalus_88, 146 Phaseolus_amblyosepalus_221, 147 Phaseolus_altimontanus, 148 Phaseolus_albivioaceus, 149 Phaseolus_albinervus, 150 Phaseolus_albiflorus_1852, 151 Phaseolus_albiflorus_1851, 152 Phaseolus_albescens_54, 153 Phaseolus_albescens_302, 154 Phaseolus_albescens_201, 155 Phaseolus_acutifolius_239, 156 Phaseolus_acutifolius_238, 157 Phaseolus_acutifolius_237, 158 Phaseolus_acutifolius_236, 159 Phaseolus_acutifolius_235, 160 Phaseolus_acutifolius_151, 161 Phaseolus_acutifolius_14, 162 Oxyrhynchus_volubilis, 163 Mysanthus_uleanus, 164 Macroptilium_erythroloma, 165 Macroptilium_atropurpureum, 166 Dolichopsis_paraguarensis; TREE ITS = [&R] (((1,4),(2,7)),((((((3,6),8),163),(((165,164),(11,12)),(166,((((((155,(160,(159,156,157,158))),161),(66,65)),(22,54,28,27,(21,26),25,24,23,30,(29,20))),(((153,(152,154)),((127,(124,123,122)),121)),131,(133,136),(135,134,128,(132,(130,129))))),((((144,(139,118,119)),(86,(101,(82,(104,(103,102)))))),((31,100),((141,(67,143,142)),((79,95),((98,99),(97,96,94)))))),(((((149,39),45,(48,47,46)),88),((((75,109),(44,(108,106)),(87,89),(84,83),(41,(40,49)),42,43,16,107),17),((91,148),90,74,73))),((53,(64,37),(62,63),56,55,76,(51,52),(145,146)),(((137,138),(140,(34,69,68,32)),((110,(18,19)),(115,85,14,15))),33,38,(93,92),(((72,71),70),(80,81)),((116,117),61,(36,35),114,(111,58),(113,50),60,59,120,(126,125),(105,57,112),(147,78,150,77,151)))))))))),(162,5)),((9,10),13))); END;