#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 26, 2024; 6:43 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Perrigo A.L., Romeralo M., & Baldauf S.L. 2015. Molecular phylogeny based on nuclear and mitochondrial DNA reveals cryptic diversity in the social amoeba Dictyostelium aureostipes (Amoebozoa). Molecular Phylogenetics and Evolution, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S16240] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=10; TAXLABELS Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_BW6OH110 Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_I3 Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_JKS150 Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_KP3 Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_OH111 Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_YA6 Dictyostelium_sp._BP7B Dictyostelium_sp._MAQ52B Dictyostelium_sp._TH3B Dictyostelium_sp._TH4B ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa2; DIMENSIONS NTAX=68; TAXLABELS Dictyostelium_amphisporum Dictyostelium_antarticum Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_B15A Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_BW6_OH110 Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_GSE7B Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_I3_1 Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_JKS150_1 Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_KP3 Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_OH111 Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_OH396 Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_OH438 Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_SF2 Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_YA6_1 Dictyostelium_aureostipes_var_helveticum_52A1 Dictyostelium_aureostipes_var_helveticum_HM592 Dictyostelium_aureostipes_var_helveticum_HM593 Dictyostelium_aureostipes_var_helveticum_NOR90A Dictyostelium_aureostipes_var_helveticum_Nor83C Dictyostelium_aureostipes_var_helveticum_Nor99A 'Dictyostelium aureostipes var helveticum Sweden 11-F' 'Dictyostelium aureostipes var helveticum Sweden-8W' 'Dictyostelium aureostipes var helveticum Sweden14-1' 'Dictyostelium aureostipes var helvetium GE-1' Dictyostelium_aureostipes_var._helveticum_HM594_ Dictyostelium_bifurcatum_UK5 Dictyostelium_delicatum Dictyostelium_exiguum Dictyostelium_fasciculatum Dictyostelium_fasciculatum_HM595 Dictyostelium_fasciculatum_Ice238_A2 Dictyostelium_fasciculatum_NOR84E_ssu Dictyostelium_fasciculatum_NOR86D Dictyostelium_fasciculatum_NZ155B1 Dictyostelium_fasciculatum_SH3 Dictyostelium_fasciculoideum Dictyostelium_granulophorum_CHII_4 Dictyostelium_macrocarpum Dictyostelium_medusoides_OH592 Dictyostelium_mexicanum_MexTF4B1 Dictyostelium_microsporum Dictyostelium_myxobasis_NT2A Dictyostelium_parvisporum Dictyostelium_sp._AKL28B Dictyostelium_sp._AKL43C Dictyostelium_sp._AU7B_SSU Dictyostelium_sp._BP7B Dictyostelium_sp._CR6B1 Dictyostelium_sp._Chile10B1 Dictyostelium_sp._Got3A2 Dictyostelium_sp._Got5B4 Dictyostelium_sp._Got8A1_SSU Dictyostelium_sp._Got9A1 Dictyostelium_sp._KAL7A Dictyostelium_sp._LR2_OH164 Dictyostelium_sp._MAQ52B Dictyostelium_sp._NZ125B Dictyostelium_sp._NZ40C Dictyostelium_sp._OZ17A_SSU Dictyostelium_sp._TAS30A Dictyostelium_sp._TH18B Dictyostelium_sp._TH1A Dictyostelium_sp._TH39A Dictyostelium_sp._TH3B_SSU Dictyostelium_sp._TH4B_SSU Dictyostelium_sp._THC11X Dictyostelium_sp._Thai2C1 Dictyostelium_sp._Thai3A2 Dictyostelium_stellarum_SAB7B ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa3; DIMENSIONS NTAX=24; TAXLABELS Dictyostelium_antarticum_1 Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_GSE7B Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_OH438 Dictyostelium_delicatum_1 Dictyostelium_fasciculatum_1 Dictyostelium_fasciculatum_HM595 Dictyostelium_fasciculatum_Ice238A2 Dictyostelium_fasciculatum_NOR84E Dictyostelium_fasciculatum_NOR86D Dictyostelium_fasciculatum_NZ155B1 Dictyostelium_fasciculatum_SmokOW9A Dictyostelium_fasciculoideum_1 Dictyostelium_myxobasis_1 Dictyostelium_sp._AKL43C Dictyostelium_sp._CR6B1 Dictyostelium_sp._Chile10B1 Dictyostelium_sp._Got5B4 Dictyostelium_sp._Got8A1 Dictyostelium_sp._Got9A1 Dictyostelium_sp._KAL7A Dictyostelium_sp._NZ125B Dictyostelium_sp._NZ40C Dictyostelium_sp._OZ17A Dictyostelium_sp._TAS30A_1 ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa4; DIMENSIONS NTAX=14; TAXLABELS Dictyostelium_antarticum Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_B15A Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_OH396 Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_SF2 Dictyostelium_fasciculatum_SH3 Dictyostelium_myxobasis Dictyostelium_sp._AU7B_ITS Dictyostelium_sp._CR6B1_ITS Dictyostelium_sp._TH11CX Dictyostelium_sp._TH18B Dictyostelium_sp._TH1A Dictyostelium_sp._TH39A Dictyostelium_sp._Thai2C1 Dictyostelium_sp._Thai3A2 ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa5; DIMENSIONS NTAX=14; TAXLABELS Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_I3_1 Dictyostelium_aureostipes_var_helveticum_52A1 Dictyostelium_aureostipes_var_helveticum_HM592 Dictyostelium_aureostipes_var_helveticum_HM593 Dictyostelium_aureostipes_var_helveticum_HM594_SSU Dictyostelium_aureostipes_var_helveticum_NOR90A Dictyostelium_aureostipes_var_helveticum_Nor83C Dictyostelium_aureostipes_var_helveticum_Nor99A Dictyostelium_aureostipes_var_helveticum_Sweden_11F Dictyostelium_aureostipes_var_helveticum_Sweden_14_1 Dictyostelium_aureostipes_var_helveticum_Sweden_8W Dictyostelium_aureostipes_var_helvetium_GE1 Dictyostelium_sp._AKL28B Dictyostelium_sp._TH4B_SSU ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M25012] TITLE Dictyostelid_Group_A&B; LINK TAXA = Taxa2; DIMENSIONS NCHAR=2572; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1990 2000 2010 2020 2030 2040 2050 2060 2070 2080 2090 2100 2110 2120 2130 2140 2150 2160 2170 2180 2190 2200 2210 2220 2230 2240 2250 2260 2270 2280 2290 2300 2310 2320 2330 2340 2350 2360 2370 2380 2390 2400 2410 2420 2430 2440 2450 2460 2470 2480 2490 2500 2510 2520 2530 2540 2550 2560 2570 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Dictyostelium_amphisporum 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Dictyostelium_antarticum AACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTTTCAAGGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATAAGCTCTTGTACGGCTAGACTGCAGACGGCTCATTACAACGGTTGTATCTTACAGGGCATCCGGGTCGCAAGACCTTCTGGATAACCGCAGTAAATCGGGGCTAATACATACAAACGGAGGGATGGAGAGGGCAACCTTGAAGTTTCTGCGATGGACATTTAGCTATTCGACCAACCCC-GCAA-GGGAATGGTTGGAACCGGTTCATATTGCTAATCGAC-TCTAGCTTGCTAGTAGTCTGATAAGCCCTATAGACAACCGCCCTATCAACTTGATGGTAAGGTTTTGGCTTACCATGGTTGTAACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGAGAGGACGCCTGAGAAACGGCGTCCACATCTACGGGTGGCAGCAGGCGCGTAAATTGCCCAATCTCAACAGAGAGGAGGCGGTGACAATAAATCCCGATGGCTTTGGGGGCAACCCCAGGCTAATCAGAATAAGTACACATTAAATCCCTTAA-CCAATATAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCATATACTAATGTTGTTGCAGTT-AAAACG-CTCGTAGCTTAA-TATCTTTTGAGCTACT-------------------------------ATCGACTGTCATCCTCTTATGTAA---GCCGCAAGGTCCAAGTAAGA---GGACC-------------------AGTCGGCTCAAACACTGTAGGTCATG----CGGC-TAGCAATAGTT------GC-----ATAATCGACTGTGCATAAACCTTGATGCTCAAGGT--AGGCC-TTTATAGGGTAGATACACAGTGCATGGCATTGTGGAACAAGGCATC-TCGCGGCTTAGTTGG-TGGGCCGCGGGGGCAATGATTAATAGGAAGGAGCGGGGGCCTTCATATTGCAGGGCGAGAGGTGAAATTCGTTGACCCTTGCAAGATGTCCTACAGCGAAAGCATTGGCCAAGTGCCTCCCCATTAGTCAAGAACGAAAGTTTGGGGATCAAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCCAAACCATAAACTATGTCGACCAGCGATTAGGCGGGCTACCTTCTTCGAGAGCTGCCTAGCAGCTTGTGGGAAACCATGAGTGCTTGGACTCTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACACCATGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAA-TTTGACTCAACACGGG-AAAGCTTACCAAGCTCAGATATGATTAGGATTGACAGA-CTAAAAGATCTTTCATGATCTCATAAGTGGTGGTGCATGGTCGTTCTTA-GTTGGTGGAGTGATTTGTCAGGTCAATTCCGGTAACGGACGAGACCTCGACCTGCTAACTAGTGGGATTCATTCTTTCGATTGACGAGGCAGGTATTG---------CTTTGATTATA----GGGGGCAA----CTTTTATAGTC-GGGTAGTGCT-----TGTAT-TAGTCTGGGAGAGTGGGTTTCAAAAATT-TAATTAATCTTCCTAGAGGTACTTCTGGCTCTAAGCCAGAGGAAGTCCGAGGCAATAA-CAGGTCTGTGATGCCCTTAGATATCTTGGGCCGCACGCGTGCTACAATGTAGGCGCTAATGAGTT-TA---TTTACAT-CCATCTCCG-CAAG-GAGTAT-GGTAATCTTGGAATCCCCTGCGTGATTGGGCTTGACCACTGTAACTGTGGTCATCAACGAGGAATTCCTTGTATGCGCGAGTCACTATCTCGCGCAGAATCTGTCCCTGCCCTTTGTACACGCCGCCCGTCGCTCCTACCGATCGAACGATCAGGTAAAGTGGACAGAC-TGAAACCC-GCA-AGGGTTTTTGGAAGTCC-ATTGAACCT-CGCCGTTTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTATCGGTAGGTGAACCTGCAGAAGGATCAA--GATGTATTAGGACAACCAATCGATGGAGGAGTTGCATTTAAAGATACAAAAACAACAAGATTAATCAGTTTAGAAAGAAAAGCACCAGGAATTGTAACTAGAAAATCTGTACATGAGTCAATGTTAACAGGAGTAAAAATTGTTGATGCCTTATTACCAATTGGAAGAGGACAACGTGAATTAATTATTGGAGATCGTCAAACAGGTAAATCTTCAATTGCAATTGATGCAATCTTAAATCAAAAAACAAATAAAGATATTGTATGTGTATACGTATCAGTAGGACAAAAAAAATCAACAATTAGAAGATTAGTTGAAATGTTAAATGTTAAAGGTTCTTTAAAATATAGTATTGTAGTAGTATCATCAGCGTCTGATGCATCTCCTTTACAATTTTTAGCACCATATACAGGATGTGCAATCGGAGAATATTTTAGAGATAAAGGAGAACATGCTTTAATTATTTATGATGATTTAAGTAAACATGCCGTAGCCTACCGTCAAATGTCTTTATTATTAAGACGTCCTCCAGGACGAGAA 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Dictyostelium_granulophorum_CHII_4 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Dictyostelium_macrocarpum 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Dictyostelium_parvisporum 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Dictyostelium_sp._TH18B 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Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_B15A 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Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_OH396 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Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_SF2 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Dictyostelium_fasciculatum_SH3 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Dictyostelium_myxobasis 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Dictyostelium_sp._AU7B_ITS 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Dictyostelium_sp._TH3B 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Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_GSE7B 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Dictyostelium_delicatum_1 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Dictyostelium_fasciculatum_1 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Dictyostelium_fasciculatum_NOR86D 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Dictyostelium_sp._NZ40C 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Dictyostelium_sp._TAS30A_1 GCTCTTGTACGGCTAGACTGCAGACGGCTCATTACAACGGTTGTATCTTACAGGGCATCCGGGTCGCAAGACCTTCTGGATAACCGCAGTAAATCGGGGCTAATACATACAAACGGAGGGATGGAGAGGGCAACCTTGAAGTTTCTGCGATGGACATTTAGCTATTCGACCAACCCCGCAAGGGAATGGTTGGAACCGGTTCATATTGCTAATCGACTCTAGCTTGCTAGTAGTCTGATAAGCCCTATAGACAACCGCCCTATCAACTTGATGGTAAGGTTTTGGCTTACCATGGTTGTAACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGAGAGGACGCCTGAGAAACGGCGTCCACATCTACGGGTGGCAGCAGGCGCGTAAATTGCCCAATCTCAACAGAGAGGAGGCGGTGACAATAAATCCCGATGGCTTTGGGGGCAACCCCAGGCTAATCAGAATAAGTACACATTAAATCCCTTAACCAATATAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCATATACTAATGTTGTTGCAGTT-AAAACGCTCGTAGCTTAATATCTTTTGAGCTACTATCGACTGTCATCCTCTTATGTAAGCCGCAAGGTCCAAGTAAGAGGACCAGTCGGCTCAAACACTGTAGGTCATGCGGCTAGCAATAGTTGCATAATCGACTGTGCATAAACCTTGATGCTCAAGGTAGGCCTTTATAGGGTAGATACACAGTGCATGGCATTGTGGAACAAGGCATCTCGCGGCTTAGTTGGTGGGCCGCGGGGGCAATGATTAATAGGGAGGAGCGGGGGCCTTCATATTGCAGGGCGAGAGGTGAAATTCGTTGACCCTTGCAAGATGTCCTACAGCGAAAGCATTGGCCAAGTGCCTCCCCATTAGTCAAGAACGAAAGTTTGGGGATCAAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCCAAACCATAAACTATGTCGACCAGCGATTAGGCGGGCTACCTTCTTCGAGAGCTGCCTAGCAGCTTGTGGGAAACCATGAGTGCTTGGACTCTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACACCATGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAA-TTTGACTCAACACGGG-AAAGCTTACCAAGCTCAGATATGATTAGGATTGACAGA-CTAAAAGATCTTTCATGATCTCATAAGTGGTGGTGCATGGTCGTTCTTA-GTTGGTGGAGTGATTTGTCAGGTCAATTCCGGTAACGGACGAGACCTCGACCTGCTAACTAGTGGGATTCATTCTTTCGATTGACGAGGCAGGTATTGCTTTGATTATAGGGGGCAACTTTTATAGTCGGGTAGTGCTTGTATTAGTCTGGGAGAGTGGGTTTCAAAAATTTAATTAATCTTCCTAGAGGTACTTCTGGCTCTAAGCCAGAGGAAGTCCGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATATCTTGGGCCGCACGCGTGCTACAATGTAGGCGCTAATGAGTTTATTTACATCCATCTCCGCAAG-GAGTATGGTAATCTTGGAATCCCCTGCGTGATTGGGCTTGACCACTGTAACTGTGGTCATCAACGAGGAATTCCTTGTATGCGCGAGTCACTATCTCGCGCAGAATCTGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATCGAACGATCAGGTAAAGTGGACAGACTGAAACCCGCAAGGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ; END; BEGIN TREES; TITLE Aureostipes; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Dictyostelium_sp._TH3B, 2 Dictyostelium_sp._TH4B, 3 Dictyostelium_sp._BP7B, 4 Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_BW6OH110, 5 Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_OH111, 6 Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_KP3, 7 Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_I3, 8 Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_JKS150, 9 Dictyostelium_sp._MAQ52B, 10 Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_YA6; TREE con_50_majrule = [&R] (1:0.004032558,2:0.004021154,(3:0.01249006,(((4:0.001124675,5:8.555514E-4):0.001581486,(6:0.001669048,7:4.200749E-4):8.240107E-4):0.004350843,(8:0.03334019,(9:3.448593E-4,10:0.001313467):0.01173746):0.004034104):0.02213303):0.156233); END; BEGIN TREES; TITLE Helveticum; LINK TAXA = Taxa5; TRANSLATE 1 Dictyostelium_aureostipes_var_helveticum_52A1, 2 Dictyostelium_aureostipes_var_helveticum_Sweden_11F, 3 Dictyostelium_aureostipes_var_helveticum_Sweden_8W, 4 Dictyostelium_aureostipes_var_helvetium_GE1, 5 Dictyostelium_aureostipes_var_helveticum_HM592, 6 Dictyostelium_aureostipes_var_helveticum_HM593, 7 Dictyostelium_aureostipes_var_helveticum_Sweden_14_1, 8 Dictyostelium_aureostipes_var_helveticum_Nor83C, 9 Dictyostelium_aureostipes_var_helveticum_Nor99A, 10 Dictyostelium_aureostipes_var_helveticum_NOR90A, 11 Dictyostelium_aureostipes_var_helveticum_HM594_SSU, 12 Dictyostelium_sp._AKL28B, 13 Dictyostelium_sp._TH4B_SSU, 14 Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_I3_1; TREE con_50_majrule = [&R] (1:0.009566587,4:0.01869603,5:0.05518312,6:0.005863458,7:0.004312256,8:0.004277392,9:0.004447339,10:0.004397006,11:0.01111447,12:0.004522058,(13:0.1662087,14:0.2159868):1.277059,(2:0.004714368,3:0.004773266):0.01068209); END; BEGIN TREES; TITLE Myxobasis; LINK TAXA = Taxa4; TRANSLATE 1 Dictyostelium_sp._TH39A, 2 Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_B15A, 3 Dictyostelium_sp._TH18B, 4 Dictyostelium_sp._TH11CX, 5 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Dictyostelium_fasciculatum_SmokOW9A, 9 Dictyostelium_antarticum_1, 10 Dictyostelium_sp._NZ125B, 11 Dictyostelium_sp._TAS30A_1, 12 Dictyostelium_sp._NZ40C, 13 Dictyostelium_fasciculatum_NZ155B1, 14 Dictyostelium_sp._OZ17A, 15 Dictyostelium_sp._KAL7A, 16 Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_GSE7B, 17 Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_OH438, 18 Dictyostelium_sp._Got8A1, 19 Dictyostelium_fasciculatum_NOR84E, 20 Dictyostelium_fasciculatum_HM595, 21 Dictyostelium_fasciculatum_Ice238A2, 22 Dictyostelium_fasciculatum_NOR86D, 23 Dictyostelium_sp._CR6B1, 24 Dictyostelium_myxobasis_1; TREE con_50_majrule = [&R] (1:0.03165658,7:0.007193573,(((((2:0.00335008,(3:2.103189E-4,4:2.11673E-4):8.968436E-4):0.004817908,((19:0.002760319,21:2.129427E-4,22:5.335866E-4):4.981476E-4,20:8.904742E-4):0.004855439):0.02303601,(5:0.009374331,(6:0.002761609,18:0.009445428):0.001702302):0.01473227):0.0190058,8:0.001271922,(14:5.184924E-4,15:2.165122E-4,16:5.186397E-4,17:2.145356E-4):5.280458E-4,(23:0.03091219,24:0.0196188):0.05244637):0.001879598,(9:0.002869615,((10:2.118029E-4,12:4.540839E-4,13:2.075146E-4):0.001165905,11:0.001546269):0.001175052):0.001002958):0.003875878); END; BEGIN TREES; TITLE Dictyostelid_Group_A&B_all; LINK TAXA = Taxa2; TRANSLATE 1 Dictyostelium_myxobasis_NT2A, 2 Dictyostelium_stellarum_SAB7B, 3 Dictyostelium_mexicanum_MexTF4B1, 4 Dictyostelium_medusoides_OH592, 5 Dictyostelium_granulophorum_CHII_4, 6 'Dictyostelium aureostipes var helveticum Sweden-8W', 7 'Dictyostelium aureostipes var helveticum Sweden 11-F', 8 'Dictyostelium aureostipes var helvetium GE-1', 9 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Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_SF2, 32 Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_B15A, 33 Dictyostelium_sp._AU7B_SSU, 34 Dictyostelium_delicatum, 35 Dictyostelium_fasciculoideum, 36 Dictyostelium_fasciculatum_SH3, 37 Dictyostelium_sp._Got9A1, 38 Dictyostelium_sp._AKL43C, 39 Dictyostelium_sp._Got5B4, 40 Dictyostelium_sp._Chile10B1, 41 Dictyostelium_antarticum, 42 Dictyostelium_sp._NZ125B, 43 Dictyostelium_sp._NZ40C, 44 Dictyostelium_fasciculatum_NZ155B1, 45 Dictyostelium_fasciculatum, 46 Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_GSE7B, 47 Dictyostelium_sp._KAL7A, 48 Dictyostelium_sp._OZ17A_SSU, 49 Dictyostelium_aureostipes_var_aureostipes_OH438, 50 Dictyostelium_sp._Got8A1_SSU, 51 Dictyostelium_fasciculatum_Ice238_A2, 52 Dictyostelium_parvisporum, 53 Dictyostelium_amphisporum, 54 Dictyostelium_bifurcatum_UK5, 55 Dictyostelium_sp._BP7B, 56 Dictyostelium_sp._TH1A, 57 Dictyostelium_sp._TH39A, 58 Dictyostelium_sp._TH18B, 59 Dictyostelium_sp._THC11X, 60 Dictyostelium_sp._CR6B1, 61 Dictyostelium_sp._TAS30A, 62 Dictyostelium_fasciculatum_NOR84E_ssu, 63 Dictyostelium_fasciculatum_HM595, 64 Dictyostelium_macrocarpum, 65 Dictyostelium_exiguum, 66 Dictyostelium_microsporum, 67 Dictyostelium_fasciculatum_NOR86D, 68 Dictyostelium_aureostipes_var_helveticum_52A1; TREE '-con 50 majrule' = [&R] 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