#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 27, 2024; 4:34 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Proios K., Michaloudi E., Papakostas S., Kappas I., Vasileiadou K., & Abatzopoulos T.J. 2014. Updating the description and taxonomic status of Brachionus sessilis Varga, 1951 (Rotifera: Brachionidae) based on detailed morphological analysis and molecular data. Zootaxa, 3873(4): 345-370. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S16282] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=52; TAXLABELS Brachionus_angularis_1 Brachionus_angularis_2 Brachionus_angularis_3 Brachionus_bidentatus Brachionus_calyciflorus_1 Brachionus_calyciflorus_2 Brachionus_calyciflorus_3 Brachionus_calyciflorus_4 Brachionus_calyciflorus_5 Brachionus_dimidiatus_1 Brachionus_dimidiatus_2 Brachionus_dimidiatus_3 Brachionus_diversicornis Brachionus_forficula Brachionus_ibericus_1 Brachionus_ibericus_2 Brachionus_ibericus_3 Brachionus_ibericus_4 Brachionus_leydigii Brachionus_manjavacas_1 Brachionus_manjavacas_2 Brachionus_plicatilis_1 Brachionus_plicatilis_2 Brachionus_plicatilis_3 Brachionus_plicatilis_4 Brachionus_quadridentatus_1 Brachionus_quadridentatus_2 Brachionus_rotundiformis_1 Brachionus_rotundiformis_2 Brachionus_rubens_1 Brachionus_rubens_2 Brachionus_rubens_3 Brachionus_sessilis_Balaton_1 Brachionus_sessilis_Balaton_2 Brachionus_sessilis_Doirani_1 Brachionus_sessilis_Doirani_2 Brachionus_sessilis_Doirani_3 Brachionus_sessilis_Doirani_4 Brachionus_sessilis_Doirani_5 Brachionus_sp._Almenara_1 Brachionus_sp._Almenara_2 Brachionus_sp._Austria_1 Brachionus_sp._Austria_2 Brachionus_sp._Austria_3 Brachionus_sp._Cayman_1 Brachionus_sp._Cayman_2 Brachionus_sp._Nevada_1 Brachionus_sp._Tiscar_1 Brachionus_sp._Tiscar_2 Brachionus_urceolaris Lecane_bulla_1 Plationus_patulus ; 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TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M23891] TITLE 'Brachionus sessilis DNA alignment COI(1-575)_ITS1(576-1013)_16S(1014-1301)'; LINK TAXA = Taxa3; DIMENSIONS NCHAR=1301; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Keratella_cochlearis 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Brachionus_sp._Austria_3 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; END; BEGIN TREES; TITLE Brachionus_sessilis_MLT_of_ITS1; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Lecane_bulla_1, 2 Brachionus_bidentatus, 3 Brachionus_forficula, 4 Brachionus_diversicornis, 5 Brachionus_angularis_1, 6 Brachionus_angularis_2, 7 Brachionus_angularis_3, 8 Plationus_patulus, 9 Brachionus_dimidiatus_3, 10 Brachionus_dimidiatus_1, 11 Brachionus_dimidiatus_2, 12 Brachionus_manjavacas_1, 13 Brachionus_manjavacas_2, 14 Brachionus_sp._Austria_1, 15 Brachionus_sp._Austria_2, 16 Brachionus_sp._Austria_3, 17 Brachionus_sp._Nevada_1, 18 Brachionus_plicatilis_1, 19 Brachionus_plicatilis_2, 20 Brachionus_plicatilis_3, 21 Brachionus_plicatilis_4, 22 Brachionus_rotundiformis_1, 23 Brachionus_rotundiformis_2, 24 Brachionus_sp._Tiscar_1, 25 Brachionus_sp._Tiscar_2, 26 Brachionus_sp._Cayman_1, 27 Brachionus_sp._Cayman_2, 28 Brachionus_ibericus_1, 29 Brachionus_ibericus_2, 30 Brachionus_ibericus_3, 31 Brachionus_ibericus_4, 32 Brachionus_sp._Almenara_1, 33 Brachionus_sp._Almenara_2, 34 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Brachionus_ibericus_4, 33 Brachionus_dimidiatus_1, 34 Brachionus_urceolaris_1, 35 Brachionus_angularis_1, 36 Brachionus_angularis_2, 37 Brachionus_rubens_1, 38 Brachionus_rubens_2, 39 Keratella_cochlearis; TREE 'Bayesian 50MajRule of COI+ITS+16S' = [&R] 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END; BEGIN TREES; TITLE Brachionus_sessilis_Bayesian_of_COI; LINK TAXA = Taxa4; TRANSLATE 1 Brachionus_ibericus_1, 2 Brachionus_ibericus_2, 3 Brachious_ibericus_3, 4 Brachionus_ibericus_4, 5 Brachionus_ibericus_5, 6 Brachionus_sp._Almenara_1, 7 Brachionus_sp._Almenara_2, 8 Brachionus_sp._Almenara_3, 9 Brachionus_sp._Almenara_4, 10 Brachionus_sp._Tiscar_1, 11 Brachionus_sp._Tiscar_2, 12 Brachionus_sp._Cayman_1, 13 Brachionus_sp._Cayman_2, 14 Brachionus_sp._Cayman_3, 15 Brachionus_sp._Cayman_4, 16 Brachiosus_rotundiformis_1, 17 Brachionus_rotundiformis_2, 18 Brachionus_rotundiformis_3, 19 Brachionus_dimidiatus_1, 20 Brachionus_dimidiatus_2, 21 Lecane_bulla_, 22 Plationus_patulus, 23 Brachionus_quadridentatus_1, 24 Brachionus_quadridentatus_2, 25 Brachionus_sessilis_Doirani_1, 26 Brachionus_sessilis_Doirani_2, 27 Brachionus_sessilis_Doirani_3, 28 Brachionus_sessilis_Doirani_4, 29 Brachionus_sessilis_Doirani_5, 30 Brachionus_sessilis_Balaton_1, 31 Brachionus_sessilis_Balaton_2, 32 Brachionus_sessilis_Balaton_3, 33 Brachionus_urceolaris_1, 34 Brachionus_angularis_1, 35 Brachionus_angularis_2, 36 Brachionus_rubens_1, 37 Brachionus_rubens_2, 38 Brachionus_urceolaris_2, 39 Brachionus_urceolaris_3, 40 Brachionus_urceolaris_4, 41 Brachionus_calyciflorus_1, 42 Brachionus_calyciflorus_2, 43 Brachionus_calyciflorus_3, 44 Brachionus_calyciflorus_4, 45 Brachionus_calyciflorus_5, 46 Brachionus_calyciflorus_6, 47 Brachionus_calyciflorus_7, 48 Brachionus_calyciflorus_8, 49 Brachionus_calyciflorus_9, 50 Brachionus_calyciflorus_10, 51 Brachionus_calyciflorus_11, 52 Brachionus_plicatilis_1, 53 Brachionus_plicatilis_2, 54 Brachionus_plicatilis_3, 55 Brachionus_plicatilis_4, 56 Brachionus_plicatilis_5, 57 Brachionus_sp._Austria_1, 58 Brachionus_sp._Austria_2, 59 Brachionus_sp._Austria_3, 60 Brachionus_sp._Austria_4, 61 Brachionus_sp._Nevada_1, 62 Brachionus_sp._Nevada_2, 63 Brachionus_sp._Nevada_3, 64 Brachionus_manjavacas_1, 65 Brachionus_manjavacas_2, 66 Brachionus_manjavacas_3, 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Brachionus_ibericus_4, 33 Brachionus_dimidiatus_2, 34 Brachionus_urceolaris_1, 35 Brachionus_angularis_1, 36 Brachionus_angularis_2, 37 Brachionus_rubens_1, 38 Brachionus_rubens_2, 39 Keratella_cochlearis; TREE 'Imported tree 0+' = [&R] (39:0.6510031994427313,(16:0.5639553318223975,((((27:0.11712999580676181,28:0.139414728721687)52:0.025998279237187377,(29:0.03348522025415085,30:0.04475476490261852)99:0.04639616909101274)100:0.2714584852099553,((35:0.004605438521517886,36:0.0017580291475896945)100:0.6104971461620325,(15:0.4528381213162961,((37:0.008844666194243135,38:0.013366874683285939)100:0.18169941094453657,((22:3.24104648087141E-6,23:3.24104648087141E-6)100:0.015005457532629727,(24:3.24104648087141E-6,(25:3.24104648087141E-6,26:3.24104648087141E-6)81:0.0016316944319927952)100:3.24104648087141E-6)100:0.39958239246495303)55:0.08232939132659196)99:0.1617241423690444)40:0.057253334618602554)34:0.08510607838878571,((14:0.009629060701224634,21:0.007641502877715172)100:0.229429476746325,(((11:0.1536555218856924,(12:0.05936264955718896,13:0.09884963615713567)100:0.0801885344625411)99:0.06305937106955875,(9:0.17810576311961762,(31:0.010275384627036407,(10:0.0029056985606188616,(20:0.006633326538226385,32:0.0012394504005731539)97:0.01172363260448207)94:0.023255473148886614)99:0.16296524385605857)99:0.044407744276567594)99:0.08838088757269985,((7:3.24104648087141E-6,8:0.007932606626145351)100:0.2050431070055285,((6:0.015455138603846239,(4:0.01362395799037585,5:0.021481157487249946)66:0.015291464909974309)100:0.12900877962116797,(3:0.1264295880688624,(18:0.0029267968727626687,(1:0.07513056176095388,(2:0.023180662186660685,(17:0.017214099971362484,(19:3.24104648087141E-6,33:0.35811668886562076)100:0.20374806150179242)51:0.016001253255026205):0.005617957451594276)49:0.003856424081666638)34:0.1816785337079764)100:0.02556840148448624)35:0.04451263078516932)84:0.11516204940435602)100:0.0367188595517879)64:0.13809029675146944)99:0.2690034143252347)93:0.6510031994427313); 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