#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 19, 2024; 23:15 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Litsios G., & Salamin N. 2014. Hybridisation and diversification in the adaptive radiation of clownfishes. BMC Evolutionary Biology, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S16652] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=46; TAXLABELS Abudefduf_saxatilis Amphiprion_akallopisos_GA067 Amphiprion_akallopisos_GA072 Amphiprion_akindynos_GA032 Amphiprion_allardi_GA033 Amphiprion_barberi_GA071 Amphiprion_bicinctus_GA036 Amphiprion_chagosensis_GA098 Amphiprion_chrysogaster_GA077 Amphiprion_chrysopterus_GA031 Amphiprion_chrysopterus_GA035 Amphiprion_chrysopterus_GA040 Amphiprion_clarkii_GA002 Amphiprion_clarkii_GA003 Amphiprion_clarkii_GA030 Amphiprion_clarkii_GA044 Amphiprion_ephippium_GA057 Amphiprion_frenatus_GA068 Amphiprion_latezonatus_GA023 Amphiprion_latifasciatus_GA083 Amphiprion_mccullochi_GA056 Amphiprion_melanopus_GA012 Amphiprion_nigripes_GA055 Amphiprion_ocellaris_GA009 Amphiprion_ocellaris_GA021 Amphiprion_omanensis_GA051 Amphiprion_pacificus_GA069 Amphiprion_percula_GA017 Amphiprion_percula_GA039 Amphiprion_percula_GA053 Amphiprion_perideraion_GA015 Amphiprion_perideraion_GA020 Amphiprion_polymnus_GA019 Amphiprion_polymnus_GA038 Amphiprion_rubrocinctus_GA070 Amphiprion_sandaracinos_GA018 Amphiprion_sandaracinos_GA037 Amphiprion_sebae_GA029 Amphiprion_tricinctus_GA058 Chromis_cyanea Chrysiptera_rex Neopomacentrus_azysron Pomacentrus_amboinensis Premnas_biaculeatus_GA008 Premnas_biaculeatus_GA025 Premnas_biaculeatus_GA065 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! 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Amphiprion_ocellaris_GA009 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Amphiprion_percula_GA053 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Pomacentrus_amboinensis GGTCCAGCCTGCCCAGTGACTGTT-TGTTCAACGGCCGCGGTACTTTGACCGTGCGAAGGTAGCGCAATCACTTGTCTTTTAAATGGAGACCTGTATGAATGGTTAAACGAGGGCTTGACTGTCTCCTTTTTCCAGTCAATGAAATTGATCTTCCCGTGCAGAAGCGGGAATAACACCATAAGACGAGAAGACCCTGTGGAGCTTTAGACACTAAATCAGCCCTCGTCC-AAAACCCTTATTAAAGGGCTGAACGCTAGAGTGATACCTGATCTGTTGTCTTCGGTTGGGGCGACCTTGGGGAAAGAAAGAACCCCCACGAGGAACGGAAGTAC-------TACTTCTAAAACTGAGAGCCACCACTCAAAGTACCAAAAACTTTGACCAACAATATGATCCAGCTT-AACGCCGATCAACGGACCAAGTTACCCCAGGGATAACAGCGCAATCCTCTTCTAGAGCCCATATCGACAAGAGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGACATCCTAATGGTGCAGCCGCTATTAAGGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAGTCCT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Premnas_biaculeatus_GA008 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Amphiprion_barberi_GA071 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Amphiprion_latezonatus_GA023 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Amphiprion_mccullochi_GA056 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Amphiprion_sebae_GA029 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Amphiprion_tricinctus_GA058 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Pomacentrus_amboinensis CACGAGCTGGACAA{CT}GGAGAATCCACGCCGCTTCGCTTCCTCTTCAACCTCAGCAGCATCCCAGACGATGAGCTGCTGTCCTCCGCAGAACTGAGGCTCTACCGCCATCAGATCGACGAGGCCTTGGCCGACTCCCTCTCAGACGGCCACGGGCTTCACCGGATAAATGTGTACGAGGTGCTAAAACCACCGCAAGCCGGGCAGCTGATCACGCAGCTTCTGGATACGCGACTCGTGCACCACAACGCGTCGCGCTGGGAGAGCTTTGACGTCAGCCCTGCCGTGCTGCGCTGGACTCGTGAGCGCCTCCCTAATTACGGACTGGCAGTGGAGGTTCTGCACCTCAACCAGACTCCGCGCCACCAGGGCCGACACGTACGCATCAGCCGCTCGCTACACCAAGAGCCCGGCGAGGACTGGGAGCAGCTACGCCCTCTCCTGGTCACCTTTGGCCACGATGGGAAGGGTCACCCGCTGACCCGCCGGACCAAGCGCAGCCCCAAACAACGGGGCCGTAAGCGCAACCGCAACTGCCGGCGCCACGCAC??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CTTCTCCCCGGCTTTCACCAGTTTGAATGGCAGCCAGCTCTCAAGAATGTGTCTCCATCTTGCAACGTTGCCATTATTAACGGGCTCTCTGGATGGGCTTCCTCGGTGGATGACTCCCCGGCTGACACAATCACTCGGCGCTTTCGTTATGATGTGGCACTGGTGTCTGCGTTAAAGGATCTGGAGGAGGACATCATGGACGGGCTGAGAGAGAGTGGGATGGAAGACAGCGCTTGCACCTCAGGCTTTAGCGTTATGATCAAGGAGTGTTGTGATGGCATGGGTGATGTCAGCGAGAAGCACGGCGGAGGACCTGTTGTTCCCGAGAAGGCAGTACGCTTCTCTTTCACCATTATGTCTGTCTCCATCCTCGCAGACGGCAAGAAGGAGGAGGTTACCATTTTCACTGAGCCAAAACCAAACTCAGAGATGTCCTGCAAGCCCCTCTGCCTGATGTTTGTGGATGAGTCAGACCATGAGACACTCACAGCTCTCCTGGGGCCCATAGTTGCAGAGCGGAATGCAATGAAAGAGAGCAGACTCATCCTGTCCATCGGCGGCCTGTCTCGCTCTTTCCGCTTCCACTTCAGGGGCACGGGATACGATGAGAAGATGGTGCGTGAGATGGAGGGTCTGGAGGCCTCGGGGTCCACATATGTCTGCACTCTGTGTGACTCCACCCGTGCAGAAGCCTCGAAAAACATGGTGCTTCACTCAGTCACTCGCGGTCATGAGGAGAACCTCGAACGATACGAAATCTGGAGGACCAACCCCTTCTCTGAGTCTGCAGAAGAGCTGCGAGACAGAGTCAAAGGGGTCTCCTCTAAGCCCTTCTTGGAGACCCATCCCACGCTCGATGCATTGCACTGCGACATCGGCAACGCCAGTGAATTCTTTAAAATCTTCCAGGACGAGATCGGGGAAATGCACAAAAAGGTCAACCCCAGCCGGGAGCAACGGCGCAGCTGGAGGGCAGCCCTGGACAAACAGCTGAGGAAGAAGATGAAGCTTAAACCGGTAATGAGGATGAACGGGAACTATGCCCGCCGGCTAATGACCATGGAGGCCGTGGAGGCGGTGTGTGAGCTGGTGCCCTCCGAGGAGAGGAGGGAGGCACTGAGGGAGCTCATGAGGCTCTACCTGC????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????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Premnas_biaculeatus_GA008 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Premnas_biaculeatus_GA025 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Premnas_biaculeatus_GA065 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