#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 16, 2024; 13:50 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Yang L., Machado C.A., Dang X., Peng Y., Yang D., Liao W., & Zhang D. 2014. The incidence and pattern of co-pollinator diversification in dioecious and monoecious figs. Evolution, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S16785] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=105; TAXLABELS Anidarnes_gracilis Apocryptophagus_sp. 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Ceratosolen_constrictus_1 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Ceratosolen_emarginatus_12 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Ceratosolen_fusciceps_5 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Ceratosolen_gravelyi_b7 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Eupristina_koningsbergeri_13 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Eupristina_koningsbergeri_5 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Kradibia_gibbosae_11 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GCCTGGTGGCCATCAGGCCGCGGCCACCGGTGGACTTGAGTCGTCGTGTTCAGGCCTGAGTCGGGGAGACACGTTAGCGACGCATTGGCCTGCGGATGCGCG--TCGAGCTT-GGTTCGG-CGCCGCGTTCGTGCTCATTGGTGTCGTTGGCGTGTCTCCCCGACCGTTGGGTGTCGGCCGGGACTG-GCTGTCGCGACGCGTGCGCGACGCGGCAGCGTCTT-CCGGCCGGCGCCCGGCGGTCAACTTGTGGGGCGCTTCAGGCTCGTCGGCGGTCACCCCGCACGGCGAACG-TCGCCGCGTG-GGTGGTCGTCGACGAGTC-GGTGTGCACGCCCCAGGCTTGGGACGTCTCATGGCGCGGGTGTCAGAACCTAGGCGCGTAAGGCCCTG-CCGGGAGTGGCTCGGGTGCCCTGGCGCATAAGTTTAAACTTATAAATATGACCAAGACATAGAAAGTAGTGAGAAAGTAAAAATGAAGAGATAAGAAAAACCGGGTAAAAAATCCAAAAGGGAAT-TTCGCCTTTATGG--C---CATGTAG--CACTTAGTAACGTCGCGACTACTACGTAGA------T----CACC-AC-CACTTATAAGAT--GCAATTGACGAGTAACCACT-C--------------TGTCGA-----CGT--CCC-T-CGGG-GC-----GTCG--TGT--------------CCAGTGAGATTTATTTCGTAT-----G------GC-----------GTTA-T-CTCGGACGGGCCTCG---GTCGGG-TC------------TT-T-----A-G---TC-CGAT---TACCGGTCGGCGACGCTACTGCTTTGGGTACTTTACCCGTAAACACCAAGGAAATGAGTCATTTCTACAGGAACGATG---AAAAATGAAAGTCG----AA-G-TCGAGAGATC--------T Ceratosolen_gravelyi_2 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GCCTGGTGGCCATCAGGCCGCGGCCACCGGTGGACTTGAGTCGTCGTGTTCAGGCCTGAGTCGGGGAGACACGTTAGCG-CGA-CGGGCTGGAGGAGGCGGCTCTCGGGTTT-GACTCGG-GTCCGCTTTCGCGGTCTCG-TTGTCGCTAATGTGTCTCCCCGACCGTTGGGTGTCGGCCGGGGCAA-GCTGTCGCGTCGCGTGCGCGACACGGCAGCGTCGTACCGGCCGGCGCCCGGCGGTCACCGTGCGGGGCGCTTCAGGCTCGTCGGCGGTTATCCGGCACGGCGAACGTTCGCCGCGCG-GGTGGCCGTCGACGAGAC--GCCACGTGGC-GCAGGCTTGGGACGTCTCATGGCGCGGGTGATA-AGCCTAGGCGCGTAAGGCCTCGCTCGGGAGTGGCCCGGGCGCTCGAGCGCATAAGTTTAAACTTATAAATATGACCAAGACATAGAAAGTAGTGAGAAAGTAAAAATGAAGAGATAAGAAAAACCGGGTAAAAAACCCAAAAGAGAAT-TTT--CTCTATGG--C---CATGTGC--CACTTAGTAACGTCGCGACTACTACGTAGC------T----CACT-ACATACTTATAAGAT--CTAATTGACAAGTAACCACG-A--------------TATCGG-----TCG-TCGC-T-TGCGGCG-----ATCG--TGT--------------TTAGTGAGATCTACTACTTAT-----G------GT-----------GTTA-T-CTCGGACGGGCTC-----TCACC----------------CC-C-----G---------TCA---TACCGGTCGGCGACGCTACTGCTTTGGGTACTTTACCCGTAAACACCAAGGAAATGAGTCATTTGTTAAAA-TGAAC----AAAAATGAAAGTCG----GA-G-TCGAGAGATC--------T Eupristina_koningsbergeri_6 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((170:1.229694,(172:0.5448329,(169:2.286277,171:0.8364049):0.1139454):0.3034779):0.11262695,((((52:0.02018625,55:0.03713688):0.01257833,(54:0.01200058,(51:0.005072803,53:0.005144451):0.005033237):0.01070415):0.4905286,(50:0.4830313,(((17:0.01105624,20:0.005296792):0.0253194,(15:0.01188863,((16:0.005187613,19:0.005228734):0.01261806,(18:0.01234614,21:0.00492206):0.005101779):0.008086004):0.0458955):0.5466661,(((107:0.01105897,(108:0.01788051,(99:0.01170174,111:0.01196066):0.005043751):0.007604893):0.01120781,(98:0.01047505,(((102:0.01177781,104:0.0049045):0.004779342,(106:0.01158358,110:0.01190232):0.005126771):0.006383272,((100:0.01105348,105:0.01915623):0.004976709,(101:0.0102086,(109:0.0100018,(97:0.01214481,103:0.02662638):0.007530505):0.01201956):0.01042197):0.005506542):0.005891383):0.01198956):0.8498576,(((12:0.008002824,(3:0.01197307,5:0.01719844):0.01182452):0.1846353,(13:0.01261572,((1:0.005090778,14:0.005168986):0.004922467,(((2:0.01224546,9:0.005133552):0.005263735,(8:0.005044176,11:0.004945131):0.005191423):0.005157452,((4:0.005284128,6:0.005173667):0.00499488,(7:0.005241464,10:0.005024435):0.004735297):0.004595748):0.004545214):0.005769732):0.1814392):0.3020244,(168:0.3748625,(71:0.03194706,(72:0.0108478,(58:0.01865816,(70:0.006220441,(66:0.03273162,((69:0.005093007,(62:0.005517744,(59:0.01213265,(57:0.01210745,60:0.0192298):0.00533838):0.01193051):0.01231849):0.005100828,((68:0.02908589,(63:0.03577049,65:0.02180038):0.01159773):0.01406822,((56:0.005217053,61:0.01206991):0.02065139,(64:0.01267458,67:0.005122279):0.005222016):0.008889138):0.01200289):0.008617704):0.01195782):0.01223708):0.005664372):0.0140896):0.240332):0.1573503):0.08972881):0.1052344):0.1214955):0.113856):0.1377637,((((118:0.02133641,((114:0.005324861,120:0.01247036):0.01123213,(115:0.02716935,(113:0.01205067,124:0.01202584):0.005643771):0.006601634):0.0145202):0.07232236,(117:0.008830659,((112:0.01966672,(116:0.00490708,(121:0.01248721,123:0.01219319):0.005152093):0.01273671):0.02186402,((119:0.005102226,125:0.004963458):0.004965689,(122:0.01909113,126:0.01919353):0.005053321):0.01127069):0.01420041):0.05426522):0.5803052,((75:0.005633016,(89:0.01988916,((73:0.004963341,77:0.01210231):0.005053881,(79:0.01299707,(81:0.004947911,82:0.01202897):0.02032468):0.01234036):0.01243863):0.05497576):0.01069068,(((80:0.01218091,88:0.01927539):0.005146793,(85:0.01919815,87:0.01218135):0.005171005):0.005060608,((76:0.01267157,84:0.01289831):0.01126098,((74:0.01224553,86:0.005147751):0.01234941,(78:0.005171008,83:0.01964141):0.005424251):0.006112439):0.01871947):0.0118541):0.9812565):0.2509054,((((28:0.04568795,(27:0.02978288,((23:0.004972557,25:0.004700048):0.004718661,(24:0.004759497,(22:0.00505477,26:0.01195618):0.01152729):0.004706195):0.01671714):0.05192285):0.9259374,(146:0.01726955,(145:0.01141548,((147:0.01192568,(148:0.01233351,149:0.01921252):0.01208883):0.004951128,((138:0.004953572,150:0.01229538):0.004784424,(139:0.01205863,144:0.01204946):0.005195003):0.005118206):0.01271044):0.009901541):0.5165086):0.9137887,(((153:0.01970787,158:0.00539928):0.01197367,((140:0.01175658,141:0.01155783):0.005304916,((152:0.004923666,159:0.00498815):0.004959849,(157:0.005014302,160:0.01184212):0.004867067):0.004541214):0.005303089):0.01165488,((151:0.007588404,156:0.01477067):0.01149768,((154:0.01117675,162:0.01221895):0.005461671,((142:0.00496794,161:0.004850271):0.004887129,(143:0.01238083,155:0.005200225):0.005047729):0.005197349):0.006093216):0.01159138):0.8772292):0.2921271,(((34:0.005136887,37:0.01142006):0.01909164,((31:0.02047199,(32:0.01097158,33:0.005967667):0.03518867):0.02174797,(35:0.01076583,(36:0.01261847,(29:0.005228648,30:0.01260423):0.005418288):0.008989904):0.02769042):0.03565013):0.9550067,(((136:0.01329939,163:0.01162681):0.1662722,(((165:0.005063765,166:0.01197482):0.01130093,((130:0.01178828,133:0.00487642):0.01183415,(131:0.004992078,164:0.005054242):0.005069111):0.004756561):0.01198182,((129:0.01215375,134:0.01108937):0.01042004,((127:0.01148634,132:0.01052083):0.004780227,((128:0.005174359,167:0.01933867):0.00510931,(135:0.01168539,137:0.01187191):0.005244108):0.005748203):0.005105848):0.01133533):0.2287797):0.1338384,((41:0.005746072,(91:0.02662307,((40:0.01235787,93:0.005037876):0.005269808,(43:0.01908834,45:0.01220668):0.005005497):0.005187551):0.01217364):0.07453981,((92:0.01028325,(39:0.005076623,90:0.004978054):0.008188949):0.2084577,(47:0.009697167,(95:0.0276236,(96:0.004781368,(46:0.01360755,(42:0.023942,((38:0.004870783,44:0.01908295):0.005182425,(48:0.01200692,(49:0.01201355,94:0.005837034):0.01193311):0.005263885):0.007531773):0.0121216):0.01829698):0.01095401):0.02004416):0.2242414):0.06161429):0.2430669):0.4041878):0.1727563):0.1899083):0.1582494):0.11262695); 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Blastophaga_sp._3_15, 67 Blastophaga_sp._3_16, 68 Blastophaga_sp._3_17, 69 Blastophaga_sp._3_18, 70 Blastophaga_sp._3_19, 71 Blastophaga_sp._3_26, 72 Blastophaga_sp._3_27, 73 Blastophaga_sp._3_30, 74 Blastophaga_sp._3_33, 75 Blastophaga_sp._3_35, 76 Blastophaga_sp._3_37, 77 Ceratosolen_gravelyi_b2, 78 Ceratosolen_gravelyi_b4, 79 Ceratosolen_gravelyi_b7, 80 Ceratosolen_gravelyi_b9, 81 Ceratosolen_gravelyi_b10, 82 Ceratosolen_gravelyi_b14, 83 Ceratosolen_gravelyi_b15, 84 Ceratosolen_gravelyi_b22, 85 Ceratosolen_gravelyi_72, 86 Ceratosolen_gravelyi_85, 87 Ceratosolen_gravelyi_106, 88 Ceratosolen_constrictus_1, 89 Ceratosolen_constrictus_3, 90 Ceratosolen_constrictus_22, 91 Ceratosolen_constrictus_23, 92 Ceratosolen_constrictus_26, 93 Ceratosolen_constrictus_27, 94 Ceratosolen_constrictus_36, 95 Ceratosolen_constrictus_38, 96 Ceratosolen_constrictus_45, 97 Ceratosolen_constrictus_10, 98 Ceratosolen_constrictus_12, 99 Kradibia_gibbosae_10, 100 Kradibia_gibbosae_11, 101 Eupristina_sp._1_3, 102 Anidarnes_gracilis, 103 Odontofroggattia_sp., 104 Apocryptophagus_sp., 105 Idarnes_sp.; TREE con_all_compat = [&R] ((103:0.5726934,(104:0.277583,(102:0.7642987,105:0.4972732):0.1442394):0.1526361):0.3545982,((((21:0.001695807,(19:5.985539E-4,20:6.039943E-4):0.001549674):0.2401803,((91:0.001574467,92:0.002322062):0.001416217,((90:0.001571269,(94:0.001631352,95:0.002649168):0.001627147):7.016241E-4,((88:6.531734E-4,89:0.001584509):6.615151E-4,(93:0.001563936,96:0.001599334):6.629555E-4):6.754769E-4):0.001631743):0.2089522):0.5061812,((23:0.004664242,(24:7.318698E-4,(22:7.075713E-4,25:0.001609199):0.001688108):0.005536092):0.386651,((86:0.03555852,(82:0.001540759,((81:7.573596E-4,(80:0.001680001,83:7.025486E-4):0.001723665):0.00169017,((79:0.001554434,84:0.001664862):0.001279148,((77:0.00165241,85:0.001693835):7.644331E-4,(78:7.14822E-4,87:0.001698519):7.543469E-4):7.52367E-4):7.721327E-4):0.001714006):0.02967381):0.03312269,((29:9.346473E-4,(51:0.003836233,((28:0.001818741,33:0.00180136):7.441622E-4,(31:0.002856633,53:7.356043E-4):7.457004E-4):7.725531E-4):0.001783202):0.01569543,((52:0.001413698,(27:7.531909E-4,50:7.663555E-4):0.001378658):0.04309334,((35:0.002122304,54:0.003395629):0.002864857,(30:0.002847828,((34:0.00180722,37:0.002139884):0.001572148,(36:0.001607028,(26:6.573633E-4,32:0.00258551):6.639486E-4):7.15794E-4):0.001535746):0.003446312):0.03682773):0.01106091):0.07728044):0.241355):0.09650892):0.07907214,((((46:7.390157E-4,48:0.003300719):0.00687926,(47:0.001399384,49:0.003282289):0.002693589):0.5317893,((97:0.001667197,99:0.003545456):0.001499619,(98:7.747004E-4,100:0.001611786):0.001516773):0.5307311):0.07962175,((38:0.1273859,(41:0.004288211,(39:7.207796E-4,40:0.001662317):0.003339111):0.1538237):0.1273502,(((68:0.002984916,((64:6.579596E-4,70:0.001571144):0.001392223,(65:0.003421683,(63:0.001529926,74:0.001521048):6.866143E-4):7.721442E-4):0.001683176):0.01265685,(67:0.00123719,((62:0.002578779,(66:6.682523E-4,(71:0.001638883,73:0.001623926):6.809276E-4):0.001691043):0.002899886,((69:6.793273E-4,75:6.50661E-4):6.702847E-4,(72:0.002407492,76:0.002494808):6.783635E-4):0.001465001):0.001793236):0.01122936):0.4132217,(((58:0.001489261,61:0.001458542):0.001425667,((57:6.402142E-4,60:0.001565753):6.592051E-4,(55:8.559885E-4,(56:0.003853171,59:8.886296E-4):0.001474807):0.001365895):0.001475522):0.2963056,((18:0.004278918,(15:0.001799236,(16:0.001846332,17:0.001701803):9.591079E-4):0.005576265):0.1260462,((101:0.06647192,(43:0.001372814,(45:0.005170891,(42:0.001633052,44:0.001794411):0.00281976):0.004403784):0.04923127):0.04648798,((5:0.001637009,(4:0.001588936,6:0.001596535):0.002153194):0.03184671,(13:0.001725097,((1:7.232399E-4,7:7.201731E-4):7.187659E-4,(((2:0.001737255,3:7.19765E-4):7.117028E-4,(9:7.100505E-4,12:7.314645E-4):7.196512E-4):7.469444E-4,((8:7.0324E-4,14:7.050023E-4):7.203838E-4,(10:7.281591E-4,11:7.365598E-4):7.662833E-4):6.429801E-4):7.509681E-4):0.001044314):0.03437597):0.1347659):0.04321041):0.07979738):0.0822824):0.08086525):0.0390148):0.03468438):0.3545982); END; BEGIN TREES; TITLE Ceratosolen_28S_Bayes; LINK TAXA = Taxa6; TRANSLATE 1 Eupristina_sp._1_3, 2 Eupristina_koningsbergeri_4, 3 Eupristina_koningsbergeri_6, 4 Ceratosolen_emarginatus_12, 5 Ceratosolen_emarginatus_20, 6 Ceratosolen_emarginatus_53, 7 Blastophaga_sp._3_3, 8 Ceratosolen_gravelyi_2, 9 Ceratosolen_gravelyi_24, 10 Eupristina_sp._2_5, 11 Eupristina_altissima_15, 12 Ceratosolen_solmsi_marchali_36, 13 Blastophaga_sp._4_18, 14 Ceratosolen_fusciceps_43, 15 Platyscapa_quadraticeps_32, 16 Blastophaga_sp._1_9, 17 Kradibia_gibbosae_11, 18 Blastophaga_sp._2_31, 19 Ceratosolen_constrictus_17, 20 Odontofroggatia_sp., 21 Idarnes_sp., 22 Anidarnes_gracilis, 23 Apocryptophagus_sp.; TREE con_all_compat = [&R] ((20:0.2329511,(23:0.1053948,(21:0.2798969,22:0.1239228):0.08124245):0.02471269):0.2595626,((14:0.1351525,((8:0.00240777,9:0.003877013):0.01424519,(4:0.008800239,(5:0.005579921,6:0.005666978):0.002968812):0.01385064):0.09001757):0.02391727,((12:0.05745353,19:0.08838884):0.1557744,((16:0.05814036,18:0.03489702):0.06729104,((13:0.2249665,17:0.1679019):0.03727929,((7:0.1739866,15:0.08948219):0.03232371,(10:0.03141752,((1:0.01066838,11:0.006818796):0.01434598,(2:0.006871559,3:0.006537794):0.06679186):0.01778375):0.05508198):0.0511758):0.02951199):0.04130351):0.02814378):0.2595626); END;