#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on March 28, 2024; 20:30 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Nagalingum N., Schneider H., & Pryer K. 2006. Molecular phylogenetic relationships and morphological evolution in the heterosporous fern genus Marsilea. Systematic Botany, null. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1680] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=33; TAXLABELS Marsilea_aegyptiaca Marsilea_ancylopoda Marsilea_angustifolia Marsilea_botryocarpa Marsilea_capensis Marsilea_crenata_2129 Marsilea_crenata_2131 Marsilea_crotophora Marsilea_distorta Marsilea_drummondii Marsilea_ephippiocarpa Marsilea_fadeniana Marsilea_farinosa Marsilea_gibba Marsilea_macrocarpa Marsilea_macropoda Marsilea_minuta_2118 Marsilea_minuta_2122 Marsilea_minuta_2359 Marsilea_mollis Marsilea_mutica Marsilea_nashii_2361 Marsilea_nashii_981 Marsilea_nubica_var._gymnocarpa_2198 Marsilea_nubica_var._gymnocarpa_2202 Marsilea_oligospora Marsilea_polycarpa Marsilea_quadrifolia Marsilea_schelpiana Marsilea_vera Marsilea_vestita Marsilea_villifolia Marsilea_villosa ; END; BEGIN CHARACTERS; [! 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Marsilea_angustifolia 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Marsilea_farinosa 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Marsilea_macropoda 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Marsilea_vestita 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Marsilea_villifolia TCCTGTTGGTGAAGTAACCCTTGGCCGAATCTTCAACGTACTTGGCGAACCCGTAGATAATATGGGTCCTGTAGAGAGTAGTACAACATTTCCGATTCACAGGCCTGCACCAGCTTTTACCCAATTGGATACCAAATTATCGATTTTTGAAACAGGGATTAAGGTTGTAGATCTTTTGGCCCCATATCGTCGAGGCGGTAAGATCGGATCATTTGGAGGGGCTGGAGTAGGTAAGACAGTCCTTATTATGGAACTGATTAATAATATTGCAAAAGCTCATGGAGGTGTATCTGTATCCGGTGGGGTAGGAGAACGTACACGTGAAGGTAATGATCTCTACATGGAGATGAAAGAATCCAAGGTTATTAATGAAGAGAACATATCCGAATCAAAGGTGGCTCTGGTTTATGGTCAGATGAATGAACCACCGGGAGCTCGTATGAGGGTTGGTCTAACTGCCCTAACAATGGCAGAATACTTCCGGGATGTCAACAAACAAGATGTACTTCTATTCATTGACAACATCTTCCGTTTCGTCCAAGCGGGATCAGAGGTCTCTGCGTTATTGGGTAGAATGCCTTCGGCTGTGGGTTATCAACCAACTCTTAGTACAGAAATGGGAACTCTACAGGAAAGAATTACTTCAACCAAAGAAGGATCCATAACCTCTATTCAAGCTGTTTACGTACCCGCGGACGATCTAACCGATCCGGCCCCTGCTACAACATTTGCACACCTAGACGCTACTACTGTGCTTTCGAGGGGATTAGCCGCGAAAGGTATTTATCCGGCCGTAGACCCCCTAGATTCGACCTCAACCATGTTACAACCCTGGATCGTGGGTGAGGAGCATTACGAAACGGCTCAAGGGGTTAAACAGACTTTACAGCGTTACAAGGAACTTCAGGATATTATAGCGATTCTTGGACTGGATGAATTATCCGAAGAGGACCGTTTAACAGTAGCTAGAGCTCGAAAAATAGAACGTTTCTTGTCACAACCATTTTTTGTTGCAGAAGTCTTTACTGGTTCTCCAGGTAAATACGTTAGTCTAGTAGAAACGATTAAGGGATTTCAAATGATTCTTTCTGGAGAATTGGATAATCTTCCTGAACAAGCTTTTTACCTGGTCGGTAATATTGATGAAGCTACCGCAAAGGCAGCGACTTTACAAGTGGAGGGTCAATAACAGGGATGGCTTTAAATCTTCGCGTAATGGCT????????????????????????????????????????????ATTACACTCCCGAATATCAGACCTCACCCCATGATATCTTGGCAGCCTTTAGAATGACCCCGCAACCCGGAGTACCACCTGAGGAAGCTGGAGCTGCAGTAGCTGCAGAATCTTCTACAGGTACATGGACTACCGTATGGACGGACGGACTTACCAGTCTTGACCGTTACAAAGGTCGTTGCTACGATATCGAACCCGTTGCCGGAGAGGAAAACCAATACATTGCATATGTAGCTTACCCCTTGGATCTATTTGAAGAGGGTTCTGTTACCAACATGTTCACCTCTATTGTAGGTAACGTATTTGGATTCAAAGCTCTACGTGCTCTTCGACTAGAAGATCTTCGAATCCCTCCTGCTTATTCCAAAACTTTCATTGGACCCCCTCACGGTATCCAGGTTGAAAGAGATAAACTGAACAAATACGGACGTCCTTTATTAGGATGCACCATCAAGCCAAAACTAGGCTTATCTGCTAAAAACTATGGTAGAGCTGTTTACGAATGTCTTCGTGGTGGACTTGACTTCACCAAGGATGATGAGAACGTAAACTCCCAACCATTCATGCGTTGGAGAGACCGTTTCTTATTCGTAGCAGAAGCTCTTTTCAAGTCTCAAGCTGAAACCGGCGAAATCAAGGGACACTACTTAAACGCTACTGCGGGTACTTGTGAAGAGATGATGAAAAGAGCTGTTTTCGCAAGAGAGCTGGGAGCGCCTATTGTTATGCACGACTACCTGACTGGAGGGTTTACTGCAAATACTAGCTTAGCTGTCTACTGTCGAGACAACGGGTTGCTTCTTCACATTCACCGTGCGATGCATGCTGTTATCGATAGACAGAAAAACCACGGTATCCACTTCCGTGTATTAGCTAAAGCATTACGTATGTCTGGTGGGGACCACATCCACTCTGGAACCGTAGTAGGTAAACTAGAAGGTGAACGAGAAGTAACTTTGGGCTTCGTCGATTTGCTTCGCGACGATTACATCGAAAAAGATCGTAGCCGTGGTATCTACTTCACCCAAGATTGGGTATCTATGCCAGGGGTACTGCCCGTAGCTTCTGGAGGTATCCACGTATGGCACATGCCTGCTCTAACCGAAATCTTCGGAGACGATTCCGTCTTACAGTTCGGTGGAGGAACTCTGGGCCACCCTTGGGGAAATGCACCTGGAGCTGTAGCTAACAGAGTTGCGTTAGAGGCTTGTGTACAAGCTCGTAACGAAGGACGTGACCTTGCTC????????????????????CGCTTGAAAATGATACGTCGTCTGAAAAGTTTGCCGGGGCTTACAGGTAAGGCACCCAATCCGAGAGAAAGTCGAGTCGCTGCTGATCAATCTACTTCGAAAAAGATATCTCAGTATTGCGTGCGCTTGGAAGCCAAACAGAGATTACGCTTTAACTATGGATTAACAGAACGCCAATTACTTAGATATGTTCGTATCGCTAGAAAAACCAAGGGTTCGACAGGCCAAGTATTGTTGCAATTACTCGAAATGCGTTTAGATAATATCGTTTTTCAATTAGGTTTGGCTCCAACTATTCCTGCAGCTAGGCAGTTGGTTAATCATAGACATATCTTAGTCAATGATCGTATTGTGGATGTACCAAGTTACCGTTGTGAACCACAAGACATTATTACTGTTCGGAATCGACCAACTTCCTATAATGTACTGAAAGGCGGTGTCTTTGAATCTTCCCGAAGCAATGAAATACCAGATCACTTGAGTCTTTCTATTTTGGAAGGCAACAAACCAAGGGGTGTTGTTAATCAAGTTGCCAAACGAGAATCTATGGATTTGAATATAAATGAGTTGTTAATCGTCGAGTATTATTCTCGTAAGGCTTAA??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CCGATTTTT-GACTAAATCAAATCAAAAA-GCTTTTTTT-CTTTAAAAA-GTACGTAAACTTCTCCGAAGTAGTTTTCGTTGGTAAGAAGAAATGTCATTCCCGTTAATTCTCGATTTTGCGGAATCGAGTAGATTAGTAACGAAGCGGAACATTTCCGGTAGATAGAAACCACGAAAAAACTGATTAAGAAGGATAAAAAAAA-TCTATGGGTAGACATCTAAAATGTGTGTTTCATCGTCACTGAACCTTGGAAAATGATCTGAGCTTAGCAGTTATATAAGGATTGATCCTGGTTTATCAGGATTATCCAGCGTTTTTTCTCTTAAGCAATTTATTTTACGACTCGGTGAAAAACATTACCCTAAAGATTATGTCTTTTTAGAAAGAAAGAACGAAGTAACTGAAAGAA----GATTTACCGGATTTT-C-TAGCCAGTTT-----GAAACTGGTAGAATTCGTATTCTTATCAACGGGATCATCTAGGAAGTATAAGACTAGACTGACATAGATGGTATGGGGTGCTTCTT---CACAATAACGTTGTTCCTGTAACGGA----GTTGAATTCAGAAAAAGAAGTGTGTG-GGG-ATTTAAGTCTTCCTAGCAGGTTTATGCTACCGCATACTCCTCCTCGGACGAAAGAAAAAGAGACATAGGGATGACCTACTGTTATCGTAGACGGGATTGAGCATCCCCTACAGCTTTTGTATATCCCCCC---TCCATAAAGGAGCCGAATGAATAGAGACTTTCGTGTTCGGTTTTGAATTAGAGGTGTCATAACCACGAATTGGCATCGACTATAACCATTAGCCTTCCAAGCTACTGATGCGGGTTCGATTCCCGCTACCCGCT----AAAAAAAA--GAACGTACGCTTCA???????????????????????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Marsilea_villosa 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; END; BEGIN SETS; CHARSET rps4 (CHARACTERS = combined) = 2531-3133; CHARSET rbcl (CHARACTERS = combined) = 1222-2530; CHARSET IGS (CHARACTERS = combined) = 5018-5477; CHARSET trnLF (CHARACTERS = combined) = 3134-4083; CHARSET atpb (CHARACTERS = combined) = 1-1221; CHARSET trnGR (CHARACTERS = combined) = 4084-5017; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = combined) = N: 1-5477; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = combined) = N: 1-5477; END; BEGIN TREES; TITLE Tb8086; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Marsilea_aegyptiaca, 2 Marsilea_ancylopoda, 3 Marsilea_angustifolia, 4 Marsilea_botryocarpa, 5 Marsilea_capensis, 6 Marsilea_crenata_2129, 7 Marsilea_crenata_2131, 8 Marsilea_crotophora, 9 Marsilea_distorta, 10 Marsilea_drummondii, 11 Marsilea_ephippiocarpa, 12 Marsilea_fadeniana, 13 Marsilea_farinosa, 14 Marsilea_gibba, 15 Marsilea_macrocarpa, 16 Marsilea_macropoda, 17 Marsilea_minuta_2118, 18 Marsilea_minuta_2122, 19 Marsilea_minuta_2359, 20 Marsilea_mollis, 21 Marsilea_mutica, 22 Marsilea_nashii_981, 23 Marsilea_nashii_2361, 24 Marsilea_nubica_var._gymnocarpa_2198, 25 Marsilea_nubica_var._gymnocarpa_2202, 26 Marsilea_oligospora, 27 Marsilea_polycarpa, 28 Marsilea_quadrifolia, 29 Marsilea_schelpiana, 30 Marsilea_vera, 31 Marsilea_vestita, 32 Marsilea_villifolia, 33 Marsilea_villosa; TREE Fig._1 = [&R] ((((1,4,11,13,15,(29,30,32))15_clade,(24,25)Marsilea_nubica_clade),((((2,(16,(22,23))),((26,31),33)),20)Marsilea_nodorhizae_clade,(((3,10),((((6,7,18),17),19),12)),28)Marsilea_marsilea_clade),((5,14),9)5_clade)Marsilea_Group_II,((8,27)Marsilea_clemys_clade,21)Marsilea_Group_I); END;