#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 16, 2024; 21:17 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Rosado A.W., Machado A.R., & Pereira O.L. 2015. First Report of Pestalotiopsis adusta Causing Postharvest Rot Disease on Immature Coconut in Brazil. Plant Disease, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S16957] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=50; TAXLABELS Pestalotiopsis_adusta_COAD_1781 Pestalotiopsis_adusta_ICMP6088 Pestalotiopsis_anacardiacearum_I Pestalotiopsis_camelliae_MFLUCC1 Pestalotiopsis_camelliae_MFLUCC1.2 Pestalotiopsis_cf_algeriensis_SD Pestalotiopsis_chinensis_MFLUCC1 Pestalotiopsis_clavata_MFLUCC12 Pestalotiopsis_cocculi_EY2AR Pestalotiopsis_cocculi_YC4D Pestalotiopsis_disseminata_MAFF2 Pestalotiopsis_disseminata_TAP29 Pestalotiopsis_diversiseta_MFLUC Pestalotiopsis_ericacearum_IFRDC Pestalotiopsis_funerea_ICMP7314 Pestalotiopsis_furcata_MFLUCC12 Pestalotiopsis_gaultheria_IFRD_4 Pestalotiopsis_hainanensis_CNU06 Pestalotiopsis_hansenii_T11 Pestalotiopsis_heterocornis_358 Pestalotiopsis_inflexa_MFLUCC12 Pestalotiopsis_intermedia_MFLUCC Pestalotiopsis_jesteri_MFLUCC12 Pestalotiopsis_karstenii_PSHI686 Pestalotiopsis_kunmingensis_766 Pestalotiopsis_lawsoniae_PSHI101 Pestalotiopsis_lespedezae_PN3DH Pestalotiopsis_linearis_MFLUCC12 Pestalotiopsis_linearis_MFLUCC12.2 Pestalotiopsis_maculans_CBS322_7 Pestalotiopsis_microspora_PSHI31 Pestalotiopsis_neglecta_TAP08O03 Pestalotiopsis_neglecta_TAP99M11 Pestalotiopsis_olivacea_PSH263 Pestalotiopsis_olivacea_YY6A Pestalotiopsis_pallidotheae_MAFF Pestalotiopsis_pallidotheae_XSCZ Pestalotiopsis_palustris_TAP99M1 Pestalotiopsis_rhododendri_IFRDC Pestalotiopsis_rosea_MFLUCC12_02 Pestalotiopsis_trachicarpicola_1 Pestalotiopsis_trachicarpicola_2 Pestalotiopsis_unicolor_MFLUCC12 Pestalotiopsis_unicolor_MFLUCC12.2 Pestalotiopsis_verruculosa_MFLUC Pestalotiopsis_vismiae_LH03Pv Pestalotiopsis_vismiae_XJ03Pv Seiridium_sp_SD096 pestalotiopsis_heterocornis_408 pestalotiopsis_lespedezae_EC12A ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M45228] TITLE Pestalotiopsis; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=1472; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Pestalotiopsis_anacardiacearum_I 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Pestalotiopsis_camelliae_MFLUCC1.2 TTATAGAGTTTTTTAAACTCCCAACCCATGTGAACTTACC-ATTGTTGCCTCGGCAGAAGCTACCCGGT---ACCTTACCTTGGAACGGCCTAC---------CCTGTAGCGCCTTACCCTGGAACGGCTTACCCTGCAGCG-GCTGCCGGTGGACTACCAAACTCTTGTTATTTTTATGTTATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAGCCTACTGCTTTTGTTAG--CTGTAGCTCCTGAAATACAACGGCGGATCTGCGATATCCTCTGAGCGTAGT-A-----ATTTTTTTCCTCGCTTTTGACTGGAGTTGCAGCGTCTTTAGCCGCTAAACCCCCC-AA--TTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTTTCATCAAGAACATGATTACTGGTACCTCGCAGGCCGACTGCGCTATCCTCATCATTGCCGCTGGTACTGGTGAGTTCGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGCCAGACTCGTGAGCACGCTCTGCTTGCCTTCACCCTGGGTGTCAAGCAGCTCATCGTTGCCATCAACAAGATGGACACTGCCAAGTGGTCCGAGGCCCGCTACAAGGAGATCATCAAGGAGACCTCCAACTTCATCAAGAAGGTTGGCTACAACCCCAAGGAGGTTCCCTTCGTCCCCATCTCCGGTTTCAACGGTGACAACATGTTGGAGGAGACCACCAACGCCCCCTGGTACAAGGGTTGGGAGAAGGAGGTCAAGGGTGTCAAGAAGGAGGGCAAGACCCTCTTCCAGGCCATTGACGCCATCAACCCCCCTAGCCGTCCCACCGACCCAGTTGTTTCC--GGCACCG-GACTG-ACC-GAAGACGAAGTTGTCAGGGCGGAAGAGCTGACCGAAAGGACCGGCGCGGACGGCATCCATGGTACCGGGCTCGAGATCGACGAGGACGGCACGAGGAACGTACTTGTTGCCGGAAGCCTCGTTGAAGTAGACGCTCATGCGCTCGAGCTGGAGCTCGGAGGTACCGTTGTAGCTGAAC---CACGAGTGTTAGCTGACATG-TTTCGTGGGAAGCAGGTAGCCAAGGGAACGGTACGTACACTCCATTGCTGTCGAGACCGTGCTCGCCAGAGATGGTTTGCCTATCAGAGGCCTGTCAGTATCAAGTCTTTCGCTTGGTTT-AACCAAGTA---GTTGATAACGTCGT----TGTCGAGTT---------GCGAGAGG-CGTCGTG----------CTGAGGCGCGTC--GAG-GTAGATG-AACTACATACCAGAAAGCAGCACCG Pestalotiopsis_cf_algeriensis_SD TTATAGAGTTTTCTAAACTCCCAACCCATGTGAACTTACC-ATTGTTGCCTCGGCAGAAGCTGCTCGGC-GCGCCTTACCTTGGAACGGCCTAC---------CCTGTAGCGCCTTACCCTGGAACGGCTTACCCTGCAACG-GCTGCCGGTGGACTACCAAACTCTTGTTATTTTATGGTTATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAGCCTACTGCTTTTGCTAG--CTGTAGCTCCTGAAATACAACGGCGGATCTGCGATATCCTCTGAGCGTAGT-A-----ATTTTTATC-TCGCTTTTGACTGGAGTTGCAGCGTCTTTAGCCGCTAAACCCCCC-AA-TTTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTTTCATCAAGAACATGATTACTGGTACTTCCCAGGCCGACTGCGCCATTCTCATCATTGCCGCCGGTACTGGTGAGTTCGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGCCAGACTCGTGAGCACGCTCTGCTCGCCTTCACCCTGGGTGTCAAGCAGCTCATCGTTGCCATCAACAAGATGGACACTGCCAAGTGGTCTGAGGCCCGTTACAAGGAGATCATCAAGGAGACCTCCAACTTCATCAAGAAGGTTGGCTACAACCCCAAGGAGGTTCCCTTCGTCCCCATCTCCGGTTTCAACGGTGACAACATGTTGGACGAGACCACCAACGCCCCCTGGTACAAGGGTTGGGAGAAGGAGGTCAAGGGTGTCAAGAAGGAGGGCAAGACTCTCTTCCAGGCCATTGACGCCATCAACCCCCCTAGCCGTCCCACCGACCCAGTTGTTTCC--GGCACCG-GACTG-ACC-GAAGACGAAGTTGTCAGGGCGGAAGAGCTGGCCGAAAGGACCGGCGCGGACGGCGTCCATGGTACCGGGCTCGAGATCGACGAGGACGGCACGAGGAACGTACTTGTTGCCGGAAGCCTCGTTGAAGTAGACGCTCATGCGCTCGAGCTGGAGCTCGGAGGTGCCGTTGTAGCTGAGCAAGCACGAGTGTTAGCTAACATG-TTCGTGGGAAAGCAAGTAGGCAAGGAAACGGTACGTACACTCCATTGCTGTCGAGACCGTGCTCGCCAGAGATGGTTTGCCTATCAGAGACCGGTCAGTATCAAGTCTTTGGTTCGGTTCCAACCAAGAA---GCCGAGAATGTCGT----CGTCGAGTT---------GCGGAGGG-TGTCGTA----------TTGAGGCGTGTC--GAG-GTAGATG-GGCTACATACCAGAAAGCAGCACCG Pestalotiopsis_chinensis_MFLUCC1 TTATAGAGTTTTCTAAACTCCCAACCCATGTGAACTTACC-ATTGTTGCCTCGGCAGAAGCTACCTGGT--TACCCTACCTTGGAACGGCCTAC---------CCTGTAGCGCCTTACCCTGGAACGGCCTACCCTGTAACG-GCTGCCGGTGGACTACCAAACTCTTGTTATTTTATTGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAGCCTACCGCTTTTGCTAG--CGGTAGCTCCTGAAATACAACGGCGGATCTGCGATATCCTCTGAGCGTAGT-A-----ATTTTTATC-TCGCTTTTGACTGGAGTTGCAGCGTCTTTAGCCGCTAAACCCCCCAAATTTTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGT???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Pestalotiopsis_clavata_MFLUCC12 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Pestalotiopsis_disseminata_MAFF2 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Pestalotiopsis_furcata_MFLUCC12 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Pestalotiopsis_hainanensis_CNU06 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Pestalotiopsis_trachicarpicola_2 TTATAGAGTTTTCTAAACTCCCAACCCATGTGAACTTACC-ATTGTTGCCTCGGCAGAAGCTGCTCGGT-GCACCCTACCTTGGAACGGCCTAC---------CCTGTAGCGCCTTACCCTGGAACGGCTTACCCTGTAACG-GCTGCCGGTGGACTACCAAACTCTTGTTATTTTATTGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAGCCTACTGCTTTTGCTAG--CTGTAGCTCCTGAAATACAACGGCGGATCTGCGATATCCTCTGAGCGTAGTAA-----ATTTTTATC-TCGCTTTTGACTGGAGTTGCAGCGTCTTTGGCCGCTAAATCCCCC-AA-TTTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTTTCATCAAGAACATGATTACTGGTACTTCCCAGGCCGACTGCGCCATTCTCATCATTGCCGCCGGTACTGGTGAGTTCGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGCCAGACTCGTGAGCACGCTCTGCTTGCCTTCACCCTGGGTGTCAAGCAGCTCATCGTTGCCATCAACAAGATGGACACTGCCAAGTGGTCCGAGGCCCGTTACAAGGAGATCATCAAGGAGACCTCCAACTTCATCAAGAAGGTTGGCTACAACCCCAAGGAGGTTCCCTTCGTCCCCATCTCCGGTTTCAACGGTGACAACATGTTGGACGAGACCACCAACGCCCCCTGGTACAAGGGTTGGGAGAAGGAGGTCAAGGGTGTCAAGAAGGAGGGCAAGACTCTCTTCCAGGCCATTGACGCCATCAACCCCCCTAGCCGTCCCACCGACCCAGTTGTTTCC--GGCACCG-GACTG-ACC-GAAGACGAAGTTGTCAGGGCGGAAGAGCTGACCGAAAGGACCGGCGCGGACGGCATCCATGGTACCGGGCTCGAGATCGACGAGGACGGCACGAGGAACGTACTTGTTGCCGGAAGCCTCGTTGAAGTAGACGCTCATGCGCTCGAGCTGGAGCTCGGAGGTACCGTTGTAGCTGAACAAGCACGACTGTTAGCTGACATG-TTCACGAGAAAGCGAACAGCCAGGGAAAGGGTACGTACACTCCATTGCTGTCGAGACCGTGCTCGCCAGAGATGGTTTGCCTATCATAGACCGGTCAGTATCGAGTCTTTCGTATGGTTCCAACCAAGCA---GTTGAGATTATCGT----GGTCGAGTT---------GCCGGGGG-TGTCGTAT---------TTGAGGCGCGTC--GAG-GTAGATG-GGCTACATACCAGAAAGCAGCACCG Pestalotiopsis_unicolor_MFLUCC12 TTATAGAGTTTTCTAAACTCCCAACCCATGTGAACTTACC-ATTGTTGCCTCGGCAGAAGCTACCTGGT--TACCTTACCTTGGAACGGCCTAC---------CCTGTAGCGCCTTACCCTGGAACGGCCTACCCTGTAACG-GCTGCCGGTGGACTACCAAACTCTTGTTATTTTATTGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAGCCTACTGCTTTTGCTAG--CGGTAGCTCCTGAAATACAACGGCGGATCTGCGATATCCTCTGAGCGTAGT-A-----ATTTTTATC-TCGCTTTTGACTGGAGTTGCAGCGTCTTTAGCCGCTAAACCCCCC-AAATTTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CCAGTTGTTTCC--GGCACCG-GACTG-ACC-GAAGACGAAGTTGTCAGGGCGGAAGAGCTGACCGAAAGGACCGGCGCGGACGGCATCCATGGTACCGGGCTCGAGATCGACGAGGACGGCACGAGGAACGTACTTGTTGCCGGAAGCCTCGTTGAAGTAGACGCTCATGCGCTCGAGCTGGAGCTCGGAGGTACCGTTGTAGCTGAAAAACCACGAGTGTTAGCTGAGATG-TTCGTGGGAAAGCAAGTAGCCAAGGAAAGGGTACGTACACTCCATTGCTGTCGAGACCGTGCTCGCCAGAGATGGTTTGCCTATCAGGGACCGGTCAGTATCAAGTCTTTCCCTTGTTTCCAACCAAGCACTTGTTGAGAACGTCGT----TGTCGAGTT---------GCGGGGGGTTGTCGTA----------TTGAGGCGTGTC--GAG-GTAGATG-GGCTACATACCAGAAAGCAGCACCG Pestalotiopsis_unicolor_MFLUCC12.2 TTATAGAGTTTTCTAAACTCCCAACCCATGTGAACTTACC-ATTGTTGCCTCGGCAGAAGCTACCTGGT--TACCTTACCTTGGAACGGCCTAC---------CCTGTAGCGCCTTACCCTGGAACGGCCTACCCTGTAACG-GCTGCCGGTGGACTACCAAACTCTTGTTATTTTATTGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAGCCTACTGCTTTTGCTAG--CGGTAGCTCCTGAAATACAACGGCGGATCTGCGATATCCTCTGAGCGTAGT-A-----ATTTTTATC-TCGCTTTTGACTGGAGTTGCAGCGTCTTTAGCCGCTAAACCCCCC-AA-TTTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTTTCATCAAGAACATGATTACTGGTACCTCGCAGGCCGACTGCGCTATCCTCATCATTGCCGCTGGTACTGGTGAGTTCGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGCCAGACTCGTGAGCACGCTCTGCTTGCCTTCACCCTGGGTGTCAAGCAGCTCATCGTTGCCATCAACAAGATGGACACTGCCAAGTGGTCCGAGGCCCGTTACAAGGAGATCATCAAGGAGACCTCCAACTTCATCAAGAAGGTTGGCTACAACCCCAAGGAGGTTCCCTTCGTCCCCATCTCCGGTTTCAACGGTGACAACATGTTGGACGAGACCACCAACGCCCCCTGGTACAAGGGTTGGGAGAAGGAGGTCAAGGGTGTCAAGAAGGAGGGCAAGACTCTCTTCCAGGCCATTGACGCCATCAACCCCCCTAGCCGTCCCACCGACCCAGTTGTTTCC--GGCACCG-GACTG-ACC-GAAGACGAAGTTGTCAGGGCGGAAGAGCTGACCGAAAGGACCGGCGCGGACGGCATCCATGGTACCGGGCTCGAGATCGACGAGGACGGCACGAGGAACGTACTTGTTGCCGGAAGCCTCGTTGAAGTAGACGCTCATGCGCTCGAGCTGGAGCTCGGAGGTACCGTTGTAGCTGAAAAACCACGAGTGTTAGCTGAGATG-TTCGTGGGAAAGCAAGTAGCCAAGGAAAGGGTACGTACACTCCATTGCTGTCGAGACCGTGCTCGCCAGAGATGGTTTGCCTATCAGGGACCGGTCAGTATCAAGTCTTTCCCTTGTTTCCAACCAAGCACTTGTTGAGAACGTCGT----TGTCGAGTT---------GCGGGGGGTTGTCGTA----------TTGAGGCGTGTC--GAG-GTAGATG-GGCTACATACCAGAAAGCAGCACCG Pestalotiopsis_verruculosa_MFLUC TTATAGAGTTTTCTAAACTCCCAACCCATGTGAACTTACC-ATTGTTGCCTCGGCAGAAGCTACCTGGT--TACCCTACCTTGGAACGGCCTAC---------CCTGTAGCGCCTTACCCTGGAACGGCCTACCCTGTAACG-GCTGCCGGTGGACTACCAAACTCTTGTTATTTTATTGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGT-GGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAGCCTACCGCTTTTGCTAG--CGGTAGCTCCTGAAATACAACGGCGGATCTGCGATATCCTCTGAGCGTAGT-A-----ATTTTTATC-TCGCTTTTGACTGGAGTTGCAGCGTCTTTAGCCGCTAAACCCCCCAAATTTTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTTTCATCAAGAACATGATTACTGGTACCTCGCAGGCCGACTGCGCTATCCTCATCATTGCCGCTGGTACTGGTGAGTTCGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGCCAGACTCGTGAGCACGCTCTGCTTGCCTTCACCCTGGGTGTCAAGCAGCTCATCGTTGCCATCAACAAGATGGACACTGCCAAGTGGTCCGAGGCCCGTTACAAGGAGATCATCAAGGAGACCTCCAACTTCATCAAGAAGGTTGGCTACAACCCCAAGGAGGTTCCCTTCGTCCCCATCTCCGGTTTCAACGGTGACAACATGTTGGACGAGACCACCAACGCCCCCTGGTACAAGGGTTGGGAGAAGGAGGTCAAGGGTGTCAAGAAGGAGGGCAAGACTCTCTTCCAGGCCATTGACGCCATCAACCCCCCTAGCCGTCCCACCGAC???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Pestalotiopsis_vismiae_LH03Pv TTATAGAGTTTTCTAAACTCCCAACCCATGTGAACTTACC-ATTGTTGCCTCGGCAGAAGCTGCTCGGC-GCGCCTTACCTTGGAACGGCCTAC---------CCTGTAGCGCCTTACCCTGGAACGGCTTACCCTGCAACG-GCTGCCGGTGGACTACCAAACTCTTGTTATTTTATGGTTATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAGCCTACTGCTTTTGCTAG--CTGTAGCTCCTGAAATACAACGGCGGATCTGCGATATCCTCTGAGCGTAGT-A-----ATTTTTATC-TCGCTTTTGACTGGAGTTGCAGCGTCTTTAGCCGCTAAACCCCCC-AA-TTTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGT???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Pestalotiopsis_vismiae_XJ03Pv TTATAGAGTTTTCTAAACTCCCAACCCATGTGAACTTACC-ATTGTTGCCTCGGCAGAAGCTGCTCGGC-GCGCCTTACCTTGGAACGGCCTAC---------CCTGTAGCGCCTTACCCTGGAACGGCTTACCCTGCAACG-GCTGCCGGTGGACTACCAAACTCTTGTTATTTTATGGTTATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAGCCTACTGCTTTTGCTAG--CTGTAGCTCCTGAAATACAACGGCGGATCTGCGATATCCTCTGAGCGTAGT-A-----ATTTTTATC-TCGCTTTTGACTGGAGTTGCAGCGTCTTTAGCCGCTAAACCCCCC-AA-TTTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGT???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Seiridium_sp_SD096 TTACAGAGTTATCCAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACC-TTTGTTGCCTCGGCAGAAGCTACCTGGT---ACCCTTC--TGGGACAGCCTACCTGGACCTACCTGGAACGGCT-ACCCTGGATCGACCTACCCTGTAGCGCACTGCCGGTGGACCATTCAACTCTTGTTATTTTATTGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCACTAGTATTCTGGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTATTGGGAATCTACTGTA----------CTGTAGTTCCTCAAATCCAACGGCGGATCTGTGGTGTCCTCTGAGCGTAGTAA-----ATCTTTATC-TCGCTTTTGTCAGGTGCCGCAGCTCCC--AGCCGCTAAACCCCCC-AA-TTTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTTTCATCAAGAACATGATTACTGGTACTTCCCAGGCCGATTGCGCCATTCTCATCATTGCCGCCGGTACTGGTGAGTTCGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGCCAGACTCGTGAGCACGCTCTGCTCGCCTTCACCCTCGGTGTCAAGCAGCTCATCGTCGCCATCAACAAGATGGACACCGCCAAGTGGTCCGAGGCCCGTTACAAGGAGATTATCAAGGAGACTTCCTCTTTCATCAAGAAGGTTGGCTACAACCCCAAGGAGGTTCCCTTCGTCCCCATCTCCGGCTTCAACGGTGACAACATGTTGGAGGAGACTACCAACGCTCCCTGGTACAAGGGTTGGGAGAAGGAGGTCAAGGGTGTCAAGAAGGACGGAAAGACCCTCTTCCAGGCCATTGACGCCATCAACCCCCCCAGCCGTCCCACAGACCCAGTTGTTGCC--AGCACCG-GATTG-ACC-GAAAACGAAGTTGTCGGGGCGGAAGAGCTGACCGAAGGGACCAGCGCGGACGGCGTCCATGGTACCGGGCTCGAGATCCACGAGGACAGCACGGGGAACGTACTTGTTGCCAGAGGCCTCGTTGAAGTAAACGCTCATGCGCTCGAGCTGGAGCTCCGAAGTGCCATTATAGCTGTGAAGGAGACGCGGTCAGCTTTGATGCTTCACCCGGATGATACCATGTAGGAATGGGATACATACACTCCATTGCTGTCGAGACCGTGCTCGCCGGAGATGGTTTGCCTGTGATGGAACCGTCAGTACTATGT-TGCTGGATGGTACTC----------------GAATTTCGT----TCTCGAGATTTCGGGCCGGCTGCGACACGTCGT-----------TTGTTCGGAATC--GAGAATGGA---GGCTACATACCAGAAAGCAGCACCG pestalotiopsis_heterocornis_408 TTATAGAGTTTTCTAAACTCCCAACCCATGTGAACTTACC-ATTGTTGCCTCGGCAGAAGCTGCTCGGC-GCGCCTTACCTTGGAACGGCCTAC---------CCTGTAGCGCCTTACCCTGGAACGGCTTACCCTGCAACG-GCTGCCGGTGGACTACCAAACTCTTGTTATTTTATAGTTATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAGCCTACTGCTTTTGCTAG--CTGTAGCTCCTGAAATACAACGGCGGATCTGCGATATCCTCTGAGCGTAGT-A-----ATTTTTATC-TCGCTTTTGACTGGAGTTGCAGCGTCTTTAGCCGCTAAACCCCCC-AA-TTTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CCAGTTGTTTCC--GGCACCG-GACTG-ACC-GAAGACGAAGTTGTCAGGGCGGAAGAGCTGGCCGAAAGGACCGGCGCGGACGGCGTCCATGGTACCGGGCTCGAGATCGACGAGGACAGCACGAGGAACGTACTTGTTGCCGGAAGCCTCGTTGAAGTAGACGCTCATGCGCTCGAGCTGGAGCTCGGAGGTGCCGTTGTAGCTGAGCAAGCACGAGTGTTAGCTAACATG-TTCGTGGGAAAGCAAGTAGCCAAGGAAACGGTACGTACACTCCATTGCTGTCGAGACCGTGCTCGCCAGAGATGGTTTGCCTATCAGAGACCGGTCAGTATCAAGTCTTTCGTTCGGTTCCAACCAAGAA---GCCGAGAATGCCGT----CGTCGAGTT---------GCGGAGGG-TGTCGTA----------TTGAGGCGTGTC--GAG-GTAGATG-G???????????????????????? pestalotiopsis_lespedezae_EC12A TTATAGAGTTTTCTAAACTCCCAACCCATGTGAACTTACC-ATTGTTGCCTCGGCAGAAGCTGCTCGGT-GCACCTTACCCTGGAACGGCCTAC---------CCTGTAGCGCCTTACCCTGGAACGGCTTACCCTGTAGCG-GCTGCCGGTGGACTACCAAACTCTTGTTATTTTATTGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAGCCTACTGCTTTTGCTAG--CGGTAGCTCCTGAAATACAACGGCGGATCTGCGATATCCTCTGAGCGTAGT-A-----ATTTTTATC-TCGCTTTTGACTGGAGTTGCAGCGTCTTTAGCCGCTAAATCCCCC-AA-TTTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TCGGCCGTTATG--G-----------G-ACA-GGAGAC-AAGTTGTCAGGGCGGAAGAGCTGACCGAAAGGACCGGCGCGGACGGCATCCATGGTACCGGGCTCGAGATCGACGAGGACGGCACGAGGAACGTACTTGTTGCCGGAAGCCTCGTTGAAGTAGACGCTCATGCGCTCGAGCTGGAGCTCAGAGGTACCGTTGTAGCTGAACAATCACGGGTATTAGCTGAGATG-TTCGTGGGAAAGCAAGTAGCCAAGGAAAGGGTACGTACACTCCATTGCTGTCGAGACCGTGCTCGCCAGAGATGGTTTGCCTATCAGAGACCGGTCAGTATCAAGTCTTTTCTTTGGTTCCAACCAAGCAGTTGTTGAGAAGGTCGT----TGTCGAGTT---------GCAAAGGGTTGTCGTA----------TTGAGGCGCGTC--GAG-GTAGATA-GGCTACGTACCAGAAAGCAGCACCG ; END; BEGIN TREES; TITLE Pestalotiopsis; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Pestalotiopsis_karstenii_PSHI686, 2 Pestalotiopsis_maculans_CBS322_7, 3 Pestalotiopsis_funerea_ICMP7314, 4 Pestalotiopsis_hansenii_T11, 5 Pestalotiopsis_lawsoniae_PSHI101, 6 Pestalotiopsis_vismiae_XJ03Pv, 7 Pestalotiopsis_vismiae_LH03Pv, 8 Pestalotiopsis_pallidotheae_MAFF, 9 Pestalotiopsis_pallidotheae_XSCZ, 10 Pestalotiopsis_chinensis_MFLUCC1, 11 Pestalotiopsis_microspora_PSHI31, 12 Pestalotiopsis_neglecta_TAP08O03, 13 Pestalotiopsis_olivacea_PSH263, 14 Pestalotiopsis_heterocornis_358, 15 Pestalotiopsis_kunmingensis_766, 16 Pestalotiopsis_neglecta_TAP99M11, 17 Pestalotiopsis_disseminata_TAP29, 18 Pestalotiopsis_disseminata_MAFF2, 19 pestalotiopsis_heterocornis_408, 20 Pestalotiopsis_palustris_TAP99M1, 21 Pestalotiopsis_olivacea_YY6A, 22 pestalotiopsis_lespedezae_EC12A, 23 Pestalotiopsis_lespedezae_PN3DH, 24 Pestalotiopsis_hainanensis_CNU06, 25 Pestalotiopsis_cocculi_EY2AR, 26 Pestalotiopsis_cocculi_YC4D, 27 Pestalotiopsis_unicolor_MFLUCC12, 28 Pestalotiopsis_adusta_COAD_1781, 29 Pestalotiopsis_adusta_ICMP6088, 30 Pestalotiopsis_rosea_MFLUCC12_02, 31 Pestalotiopsis_trachicarpicola_1, 32 Pestalotiopsis_trachicarpicola_2, 33 Pestalotiopsis_inflexa_MFLUCC12, 34 Pestalotiopsis_clavata_MFLUCC12, 35 Pestalotiopsis_furcata_MFLUCC12, 36 Pestalotiopsis_intermedia_MFLUCC, 37 Pestalotiopsis_verruculosa_MFLUC, 38 Pestalotiopsis_linearis_MFLUCC12, 39 Pestalotiopsis_camelliae_MFLUCC1, 40 Pestalotiopsis_camelliae_MFLUCC1.2, 41 Pestalotiopsis_linearis_MFLUCC12.2, 42 Pestalotiopsis_diversiseta_MFLUC, 43 Pestalotiopsis_unicolor_MFLUCC12.2, 44 Pestalotiopsis_anacardiacearum_I, 45 Pestalotiopsis_cf_algeriensis_SD, 46 Pestalotiopsis_jesteri_MFLUCC12, 47 Pestalotiopsis_ericacearum_IFRDC, 48 Pestalotiopsis_gaultheria_IFRD_4, 49 Pestalotiopsis_rhododendri_IFRDC, 50 Seiridium_sp_SD096; TREE PAUP_1 = [&R] (50:0.090277,(46:0.053367,(39:0.009256,(((42:0.009063,48:0.026137):0.003122,(47:0.019079,(8:0.022753,(15:0.012858,44:0.005591):0.016157):0.0):0.005842):0.002789,((1:0.005148,(35:0.001397,40:0.003118):0.017331):0.0,((38:0.00154,((10:0.0,37:0.0):0.003071,((3:0.002403,(12:0.0025,41:0.012748):0.0):0.0,(36:0.001547,(43:0.0,(24:0.002751,27:0.0):0.0):0.0):0.001564):0.0):0.0):0.009711,(33:0.01265,((2:0.004108,21:0.021284):0.0,(((34:0.001724,49:0.003446):5.21E-4,(5:0.0,(22:0.001819,23:0.001753):0.0):0.011117):0.011528,((11:0.004829,(7:0.0,((28:0.00225,29:7.36E-4):0.005747,(6:0.0,(14:0.0,(19:0.001087,(20:9.05E-4,45:0.0):0.003824):2.62876E-6):0.0):0.001765):0.0):0.004853):0.009856,(30:0.01058,(13:0.002417,(9:0.0,((17:0.003709,18:0.001799):0.003778,(4:0.0,(31:0.0,(32:0.0,(16:0.003647,(25:0.001818,26:0.0):0.001812):0.0):0.0):0.004339):1.39E-4):0.0):0.0):0.0052):0.004472):0.005206):0.002465):0.0):0.002128):0.003964):0.001274):0.0):0.038278):0.090277); END;