#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on March 28, 2024; 19:33 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Inuma T., Khodaparast S., & Takamatsu S. 2007. Multilocus phylogenetic analyses within Blumeria graminis, a powdery mildew fungus of cereals. Molecular Phylogenetics and Evolution, null. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1742] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=28; TAXLABELS Blumeria_graminis_ex_Agropyron_MUMH2335 Blumeria_graminis_ex_Avena_MUMH1700 Blumeria_graminis_ex_Avena_MUMH1724 Blumeria_graminis_ex_Bromus_MUMH1720 Blumeria_graminis_ex_Bromus_MUMH2192 Blumeria_graminis_ex_Bromus_MUMH3273 Blumeria_graminis_ex_Dactylis_MUMH1703 Blumeria_graminis_ex_Dactylis_MUMH815 Blumeria_graminis_ex_Diarrhena_MUMH92 Blumeria_graminis_ex_Elymus_MUMH1721 Blumeria_graminis_ex_Hordeum_AF188934 Blumeria_graminis_ex_Hordeum_MUMH147 Blumeria_graminis_ex_Hordeum_MUMH1704 Blumeria_graminis_ex_Hordeum_MUMH1719 Blumeria_graminis_ex_Lolium_MUMH2288 Blumeria_graminis_ex_Lolium_MUMH903 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1619 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1620 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1705 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1706 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1718 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH839 Blumeria_graminis_ex_Secale_MUMH2289 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1707 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1708 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1711 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1712 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1713 ; 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TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M1747] TITLE Fig._2b; LINK TAXA = Taxa4; DIMENSIONS NCHAR=379; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = Fig._2a) = N: 1-612; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = Fig._2a) = N: 1-612; END; BEGIN TREES; TITLE Tb8228; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Blumeria_graminis_ex_Bromus_MUMH1720, 2 Blumeria_graminis_ex_Elymus_MUMH1721, 3 Blumeria_graminis_ex_Avena_MUMH1724, 4 Blumeria_graminis_ex_Bromus_MUMH2192, 5 Blumeria_graminis_ex_Lolium_MUMH2288, 6 Blumeria_graminis_ex_Secale_MUMH2289, 7 Blumeria_graminis_ex_Agropyron_MUMH2335, 8 Blumeria_graminis_ex_Bromus_MUMH3273, 9 Blumeria_graminis_ex_Hordeum_AF188934, 10 Blumeria_graminis_ex_Hordeum_MUMH1719, 11 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1718, 12 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1713, 13 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1712, 14 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1711, 15 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1708, 16 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1707, 17 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1706, 18 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1705, 19 Blumeria_graminis_ex_Hordeum_MUMH1704, 20 Blumeria_graminis_ex_Dactylis_MUMH1703, 21 Blumeria_graminis_ex_Avena_MUMH1700, 22 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1620, 23 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1619, 24 Blumeria_graminis_ex_Lolium_MUMH903, 25 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH839, 26 Blumeria_graminis_ex_Dactylis_MUMH815, 27 Blumeria_graminis_ex_Hordeum_MUMH147, 28 Blumeria_graminis_ex_Diarrhena_MUMH92; TREE Fig._2a = [&R] (28,(((((27,10,9),19),((16,15,14,13,12,2,7),6)),((((25,(23,22,18,5)),(17,11)),8),1)),4),(((26,20),24),(21,3))); END; BEGIN TREES; TITLE Tb8227; LINK TAXA = Taxa5; TRANSLATE 1 Blumeria_graminis_ex_Hordeum_AB103065, 2 Blumeria_graminis_ex_Agropyron_DNA158, 3 Blumeria_graminis_ex_Bromus_MUMH3273, 4 Blumeria_graminis_ex_Agropyron_MUMH2335, 5 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH2291, 6 Blumeria_graminis_ex_Secale_MUMH2289, 7 Blumeria_graminis_ex_Dactylis_glomerata, 8 Blumeria_graminis_ex_Lolium_MUMH2288, 9 Blumeria_graminis_ex_Bromus_MUMH2192, 10 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1725, 11 Blumeria_graminis_ex_Avena_MUMH1724, 12 Blumeria_graminis_ex_Hordeum_MUMH1723, 13 Blumeria_graminis_ex_Hordeum_MUMH1722, 14 Blumeria_graminis_ex_Elymus_MUMH1721, 15 Blumeria_graminis_ex_Bromus_MUMH1720, 16 Blumeria_graminis_ex_Hordeum_MUMH1719, 17 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1718, 18 Blumeria_graminis_ex_Aegilops_MUMH1717, 19 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1714, 20 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1713, 21 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1712, 22 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1711, 23 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1710, 24 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1709, 25 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1708, 26 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1707, 27 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1706, 28 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1705, 29 Blumeria_graminis_ex_Hordeum_MUMH1704, 30 Blumeria_graminis_ex_Dactylis_MUMH1703, 31 Blumeria_graminis_ex_Bromus_MUMH1702, 32 Blumeria_graminis_ex_Bromus_MUMH1701, 33 Blumeria_graminis_ex_Avena_MUMH1700, 34 Blumeria_graminis_ex_Apera_MUMH1699, 35 Blumeria_graminis_ex_Anthoxanthum_MUMH1698, 36 Blumeria_graminis_ex_Agropyron_MUMH1697, 37 Blumeria_graminis_ex_Dactylis_MUMH1621, 38 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1620, 39 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1619, 40 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1040, 41 Blumeria_graminis_ex_Bromus_MUMH968, 42 Blumeria_graminis_ex_Lolium_MUMH903, 43 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH839, 44 Blumeria_graminis_ex_Dactylis_MUMH815, 45 Blumeria_graminis_ex_Secale_MUMH839, 46 Blumeria_graminis_ex_Triticum_AB022376, 47 Blumeria_graminis_ex_Hordeum_AB022399, 48 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH123, 49 Blumeria_graminis_ex_Bromus_AB022362, 50 Blumeria_graminis_ex_Diarrhena_MUMH92; TREE Fig._1b = [&R] (50,(((49,3),((48,43,(40,27,10),39,38,34,28,17,8,5),((41,32,15),31))),(((47,(29,16,13,12,1)),6),46,45,36,26,25,24,23,22,21,20,19,18,14,4,2),9),(((44,37,35,30,7),(33,11)),42)); END; BEGIN TREES; TITLE Tb8230; LINK TAXA = Taxa2; TRANSLATE 1 Blumeria_graminis_ex_Diarrhena_MUMH92, 2 Blumeria_graminis_ex_Hordeum_MUMH147, 3 Blumeria_graminis_ex_Dactylis_MUMH815, 4 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH839, 5 Blumeria_graminis_ex_Lolium_MUMH903, 6 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1619, 7 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1620, 8 Blumeria_graminis_ex_Avena_MUMH1700, 9 Blumeria_graminis_ex_Dactylis_MUMH1703, 10 Blumeria_graminis_ex_Hordeum_MUMH1704, 11 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1705, 12 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1706, 13 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1707, 14 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1708, 15 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1711, 16 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1712, 17 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1713, 18 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1718, 19 Blumeria_graminis_ex_Hordeum_MUMH1719, 20 Blumeria_graminis_ex_Bromus_MUMH1720, 21 Blumeria_graminis_ex_Elymus_MUMH1721, 22 Blumeria_graminis_ex_Avena_MUMH1724, 23 Blumeria_graminis_ex_Bromus_MUMH2192, 24 Blumeria_graminis_ex_Lolium_MUMH2288, 25 Blumeria_graminis_ex_Secale_MUMH2289, 26 Blumeria_graminis_ex_Agropyron_MUMH2335, 27 Blumeria_graminis_ex_Bromus_MUMH3273; TREE Fig._3 = [&R] (1,(((((2,19),10),((13,14,15,16,17,21,26),25)),(((((4,7),(6,11,24)),(12,18)),20),27)),23),(((3,9),5),(8,22))); END; BEGIN TREES; TITLE Tb8226; LINK TAXA = Taxa3; TRANSLATE 1 Blumeria_graminis_ex_Agropyron_DNA158, 2 Blumeria_graminis_ex_Secale_DNA163, 3 Blumeria_graminis_ex_Bromus_AF011283, 4 Blumeria_graminis_ex_Avena_AF011284, 5 Blumeria_graminis_ex_Hordeum_AF011285, 6 Blumeria_graminis_ex_Secale_AF011286, 7 Blumeria_graminis_ex_Triticum_AF011287, 8 Blumeria_graminis_ex_Hordeum_AF073352, 9 Blumeria_graminis_ex_Diarrhena_MUMH92, 10 Blumeria_graminis_ex_Bromus_AB000935, 11 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH123, 12 Blumeria_graminis_ex_Hordeum_D84372, 13 Blumeria_graminis_ex_Triticum_AB022377, 14 Blumeria_graminis_ex_Aneurolepidium_MUMH341, 15 Blumeria_graminis_ex_Secale_MUMH839, 16 Blumeria_graminis_ex_Dactylis_MUMH815, 17 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH839, 18 Blumeria_graminis_ex_Lolium_MUMH903, 19 Blumeria_graminis_ex_Bromus_MUMH968, 20 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1040, 21 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1619, 22 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1620, 23 Blumeria_graminis_ex_Dactylis_MUMH1621, 24 Blumeria_graminis_ex_Agropyron_MUMH1697, 25 Blumeria_graminis_ex_Anthoxanthum_MUMH1698, 26 Blumeria_graminis_ex_Apera_MUMH1699, 27 Blumeria_graminis_ex_Avena_MUMH1700, 28 Blumeria_graminis_ex_Bromus_MUMH1701, 29 Blumeria_graminis_ex_Bromus_MUMH1702, 30 Blumeria_graminis_ex_Dactylis_MUMH1703, 31 Blumeria_graminis_ex_Hordeum_MUMH1704, 32 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1705, 33 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1706, 34 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1707, 35 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1708, 36 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1709, 37 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1710, 38 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1711, 39 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1712, 40 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1713, 41 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1714, 42 Blumeria_graminis_ex_Aegilops_MUMH1717, 43 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1718, 44 Blumeria_graminis_ex_Hordeum_MUMH1719, 45 Blumeria_graminis_ex_Bromus_MUMH1720, 46 Blumeria_graminis_ex_Elymus_MUMH1721, 47 Blumeria_graminis_ex_Hordeum_MUMH1722, 48 Blumeria_graminis_ex_Hordeum_MUMH1723, 49 Blumeria_graminis_ex_Avena_MUMH1724, 50 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1725, 51 Blumeria_graminis_ex_Bromus_MUMH2192, 52 Blumeria_graminis_ex_Lolium_MUMH2288, 53 Blumeria_graminis_ex_Dactylis_glomerata, 54 Blumeria_graminis_ex_Secale_MUMH2289, 55 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH2291, 56 Blumeria_graminis_ex_Agropyron_MUMH2335, 57 Blumeria_graminis_ex_Bromus_MUMH3273; TREE Fig._1a = [&R] (9,(((((10,57,3),((((11,52,55),(17,22),21,32),(20,(26,43),33,50)),((19,(28,45)),29))),(((12,44,47,48,5,8),31),((13,14,15,24,34,35,36,37,38,39,(40,41),42,46,54,56,1,2,6,7),51))),(16,18,23,25,30,53)),(27,49,4))); END; BEGIN TREES; TITLE Tb8229; LINK TAXA = Taxa4; TRANSLATE 1 Blumeria_graminis_ex_Diarrhena_MUMH92, 2 Blumeria_graminis_ex_Hordeum_MUMH147, 3 Blumeria_graminis_ex_Secale_MUMH839, 4 Blumeria_graminis_ex_Dactylis_MUMH815, 5 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH839, 6 Blumeria_graminis_ex_Lolium_MUMH903, 7 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1619, 8 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1620, 9 Blumeria_graminis_ex_Avena_MUMH1700, 10 Blumeria_graminis_ex_Dactylis_MUMH1703, 11 Blumeria_graminis_ex_Hordeum_MUMH1704, 12 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1705, 13 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1706, 14 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1707, 15 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1708, 16 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1709, 17 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1711, 18 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1712, 19 Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1713, 20 Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1718, 21 Blumeria_graminis_ex_Hordeum_MUMH1719, 22 Blumeria_graminis_ex_Bromus_MUMH1720, 23 Blumeria_graminis_ex_Elymus_MUMH1721, 24 Blumeria_graminis_ex_Hordeum_MUMH1722, 25 Blumeria_graminis_ex_Avena_MUMH1724, 26 Blumeria_graminis_ex_Bromus_MUMH2192, 27 Blumeria_graminis_ex_Lolium_MUMH2288, 28 Blumeria_graminis_ex_Secale_MUMH2289, 29 Blumeria_graminis_ex_Agropyron_MUMH2335, 30 Blumeria_graminis_ex_Bromus_MUMH3273, 31 Blumeria_graminis_ex_Hordeum_X51326; TREE Fig._2b = [&R] (1,(((2,((11,24),21,31)),(((3,28),14,15,16,17,18,19,23),29)),26),((((4,10),6),(9,25)),(((((5,(7,12,27),8),20),13),22),30))); END;