#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on March 29, 2024; 8:54 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Chang E.S., Neuhof M., Rubinstein N., Diamant A., Philippe H., Huchon D., & Cartwright P. 2015. Genomic insights into the evolutionary origin of Myxozoa within Cnidaria. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S17743] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=77; TAXLABELS Acanthoeca_like_sp_10tr Acropora_cervicornis Aiptasia_pallida 'Amoebidium parasiticum JAP-7-2' Amphimedon_queenslandica Aphrocallistes_vastus Aurelia_aurita Beroe_abyssicola Bolocera_tuediae Botryllus_schlosseri Branchiostoma_floridae Buddenbrockia_plumatellae Capitella_teleta Capsaspora_owczarzaki_atcc30864 Chondrilla_nucula Ciona_intestinalis Clytia_hemisphaerica Corticium_candelabrum Craspedacusta_sowerbyi Crassostrea_gigas Cyanea_capillata Daphnia_pulex Ectopleura_larynx Edwardsiella_lineata Enteromyxum_leei Ephydatia_muelleri Eunicella_cavolinii Euplectella_aspergillum Euplokamis_dunlapae Gorgonia_ventalina Helobdella_robusta Homo_sapiens Hormathia_digitata Hydra_magnipapillata Hydractinia_polyclina Ilyanassa_obsoleta Ixodes_scapularis Kudoa_iwatai Latimeria_menadoensis Leucetta_chagosensis Ministeria_vibrans_atcc50519 Mnemiopsis_leidyi Monosiga_brevicollis_mx1 Monosiga_ovata Montastraea_faveolata Myxobolus_cerebralis Nanomia_bijuga Nasonia_vitripennis Nematostella_vectensis Octopus_vulgaris Oscarella_carmela 'Oscarella sp. SN-2011' Patiria_miniata Pediculus_humanus_corporis Petromyzon_marinus Petrosia_ficiformis Pleurobrachia_pileus Pocillopora_damicornis Polypodium_hydriforme Porites_australiensis Saccoglossus_kowalevskii Salpingoeca_sp._ATCC50818 Sarcotragus_fasciculatus Sphaeroforma_arctica_jp610 Sphaeromyxa_zaharoni Stephanoeca_diplocostata Stomolophus_meleagris Strigamia_maritima Strongylocentrotus_purpuratus Sycon_ciliatum Sycon_coactum Tetracapsuloides_bryosalmonae Thelohanellus_kitauei Trichoplax_adhaerens Tripedalia_cystophora Urticina_eques Vallicula_multiformis ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M31752] TITLE Myxozoans_200_Protein_coding_genes; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=51940; FORMAT DATATYPE=Protein SYMBOLS= "A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y" MISSING=? 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'Amoebidium parasiticum JAP-7-2' 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Aurelia_aurita 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Branchiostoma_floridae 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Capitella_teleta MPAYHSMALLPKGPAPDIIDEALNFFKANVFFRNYEIKGEADRTLIYITLYISECLKKLQRCQSKNAGLKEMNTLALARFYLPGEQFPLNGMYARPANRQEEDNMRAYLQQIRHETGIRVCEKVFDPATDKPSKWWMCFARRKFMDKSLSQPGMAATLKPYLTAVRHTLTAAMCLENFSSQVVERHNKPEVEVMSSKELLLSPVVISRNEKEKVLIEGSINSLRISIGVKQADEIEKILCHKFMRFMMMRAENFIVLRRKPVKGYDISFLITNFHTETMFKHKLVDFIIHFMEEIDKEISEMKLAVNSRARISAEEFLKRFPITCHAWNKDRSQIALSLNDSDVKIFSCWTLTHTLSEHQERVTGIDWAPGSNRIVTCGADRNAYVWAPTLVILRINRAATCVKWSPKENKFAVGSGARLISVCYFEQENDWWVSKRIKKPIRSTVTCLDWHPNNILLAAGSTDFKTRVFSGYVLGNLMAEFGWVHDVSFSASGDKLAWVGHDSSVSVRPFVTCTWINESNVLTAGHDCYPLVFSALKHFKALDSVHQNTITTSVDGLLAIWEVSTILEERILLEEFGRVLTIGDGIARVYGLKNIQAEEMVEFSSGLKGMALNLEPDNVGIVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPIGEGLLGRVVDALGNPIDGKGPIRARVGVKAPGIIPRISVKEPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTAIAIDTIINQKRFNDGTDEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQIVKRLTDADAMKYTIVVSATASDAAPLQYLAPYSGCAMGEFFRDNGKHALIMYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMSDAFGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFFKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQMKAMKQVAGSMKLELAQYREVAAFAQFGSDLDAATQQLLNRGVRLTELLKQGQYVPMAVEEQVAVIFAGVRGHLDKMDPAKITDFEEKFLSHVRLTQQDLLSTIRKEGMISESSEATMKALVTEFLANYVGGVRTTGESVRTQNVMAAASIANIVKSSLGPVGLDKMLVDDVGDVTITNDGATILKLLEVEHPAAKVLVELAQLQDQEVGDGTTSVVIIAAELLKNADELVKCKIHPTSIISGYRLACKEACKYIQENMTIKVDELCRDSLISAAKTSMSSKIIGSDMDFFSTMVVDAAQAVKTSDGKGGFRYPVKAVNVLKAHGASSRESLLIHGYALNCTVASQAMVKKVTGAKIACLDFSLQKAKMKLGVQLLIDDPTQLEAMRKRESDITKERIQKILATGVNVVLTTGGIDDLCLKYFVEAGAMAVRRCKKADLKRIAKATGAQLVVTLANLEGDETFDASMLGQAEEVVQERICDDELLLIKKPKVRSAASIILRGANDFMVDEMERSIHDALCVVKRVMESKSVVPGGGAVEAALSIYLENFATSLSSREQLAIAEFARSLLTIPKQLAVNAAQDSTELVAKLRAYHNTSQGLDLVEGIVRDSKKAGVFEPAISKIKSLKFATEAAITILRIDDMIKPVQVLRAGAEEEKSEIARLSSFVGAIAVGDLIKSTLGPKGMDKILQSVTNDGATILKSIGVDNPAAKVLINISKVQDDEVGDGTTSVTVLACELLKEAEQLVNQKMHPQNIIAGWRKAAAAAKAALLASTRDHGNDKFKEDLMNIARTTLSSKILTQHKDHFSKLAVDAVLRLNLDAIQIIKMSGGGLRDSYLDEGFLLQKTIGVNQPKRIENAKILVANTPMDTDKIKVFGSRVRVDAVSKVAELELAEKEKMKDKVGRILQNDLNVFINRQLIYNYPEQLFADAGVMAIEHADFEGVERLALVLGGEIASTFDSPEHIKLGHCDLIEEIMIGEEKLLKFSGVALGEACTLVLRGATQQILDEAERSMHDALCVMAQTVKETRTVYGGGCSEMLMANAVSLLAAKTPGKEAMAIESFARALRMLPTVIADNAGYDSADLVSELRAVHTDGKTTYGLDMDQGCIGDMAQLGITESYKVKNQVLVSGSEAAEMIVRVDNIIKAAPRQRDKEKPTQIRFSNITAAKAVADAIRTSLGPRGMDKMIQSSNGDVTITNDGATILKQMQLLHPAAKMLVELSKAQDVEAGDGTTTVTVIAGSLLDAAQKLLAKGIHPTSISDSFQKAAAKSVEILETMGTPLELSDRESLLKSASTSLNSKVVSQYSNILAPLCVDAVLNVIVNLTDIKIVKKLGGTVEDTELIGLLFDNKTAG-SKIEKAKIGLIQFCISPPKTDMENQVVVSDYEQMDRVLREERQYILNIVKQIKKTGCNVLLIQKSILRDAVNDLALHFLAKMKIMVIKDIEREDIEFVCKSLGCRPAASLDHFSADILGSADLVEEIGESKVTKVTGNGGKTVSVLVRGSNKLVLEEADRSIHDALCVIRCLVKKRALIAGGGAPEIELSLRLSEFAHTLSGMEQYCFRAFADAMEIIPFTLAENAGLNPIATVTELRNKHAQGMKTAGINVRKGAITNILEENVVQPLLVSTSAVHLAAETVRSILKIDDIVNLAFDEFGRPFLILRDQENQTRLTGLDAQKSHILAAKAVASTLRTSLGPKGLDKMMVGSDGDVTITNDGATILQQMDVDHQIAKLLVQLSKSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEQAEQLLDRGIHPIRVADGYEMAAQAAVNELDRIADSFPVDLENPEPLIRTAMTTLSSKIINKCHRQMAEIAVNAILAVADLERKDVDFELIKVEGKVGGQMEETLLVKGVIVDKDFSHPQMPREVKDAKMAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKKLRQYEQEKFEEMVQQVKDTGANLVICQWGFDDEANHLLLQRELPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFSELTAEKLGRAGVVKELSFGTTKDKMLVIEDCHNSRAVTIFIRGGNKMIIEEAKRSIHDALCVIRNLVKDHRIVYGGGAAEIACSVAVGQEADKISTLEQYAMRAFSEALESIPLALAENSGLAPIQTVAEVKSRQVLEKNPSLGIDCLNKGTNDMKAQHVIETLLSKKQQIMLATQVVKMILKIDDIRVIVLNQNTKREHGRKVQLGNVTAAKTIADIIRTCLGPRSMLKMLMDPMGGIVMTNDGNAILREIMVEHPAAKSMIEIARTQDEEVGDGTTSVIILAGEMMSVAEQFLEQQMHPTVIIGAYREALEDLITLLKDKVSMSVDVNNRQEMLKIIKSSVGTKFIKKWSDMACQIALDATTTVRREIDIKRYAKVEKIPGGAVEDSVVLRGVMLNKDVVHPKMKRRIENPKIVLLDCSLEYKKGESQTNIEISHEEDFMKILQQEEEYIQTVVAEVLALKPDLVITEKGVSDLAQHFFVKAGVSVIRRVRKSDNNRIARATGATIVSRTDELKEDDIGHGCGLFYIEKFGDEYFTFITECKEPKACTILLRGASKDILNEVERNLQDAMNVARNVMVDARLVPGGGAVEMALARALNQKAKSLTGVQQWPYRAVAKALEVIPRTLVQNCGASTIRTITALRAKHAVEGNSSFGVDGETGSIVDMKDFGIWEPYSVKAQTYKTAIETAILLLRIDDIVSQAPIILLKEGTDTSQGRPQLIGNINACQAIVDAVRTTLGPRGMDKLIVDGQGKATISNDGATIMNLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDSEVGDGTTSVVLLAGDFLKQCKPFIDEGVHPQVIVKAFRKATHLIVNRIKEIAVPVKKDDPNELRELLLKCASTALSSKLVARQKNFFSKMVVDAVMALDLLPLNMIGMKKVQGGGLEDSQLISGVAFKKTFSYAGFEMQPKAYKNLKIALLNIELELKAEKDNAEIRLDNVSEYQAVVDAEWKILYDKLDKIHQSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVDDQDLKRTMHACGGSIQTTVINDEVLGMCEEFEEIQIGGERYNLFRGCPKAKTCTIILRGGAEQFIEETERSLHDAIMIVRRAIKNDSIVAGGGAIEMELSKYLRDHSRTIPGKEQLLMGAMAKALEIIPHQLCDNAGFDATNILNKLRQKHGTWYGVDINSEDIADNLVACVWEPSVVKINALTAASEAACLILSVDETIQNPRMLKDGAKHYSGVEEAVLRNIVACKELAQKTRSAYGPFGQNKMVINHISKLFVTNDAATIIRELEVEHPAAKLLVMGSQQQEQEAGDATNFVLIFAGALLDHAESLIRMGLSVKEVIGGYEQALKKSMVLPLIRSSIMSKQYGNEDFLSEIIVDACLNILPFNVDSIRISKIAGQGVHNTSIVQGMVFKRQVEGDVNKSSGCKVAVYSCPLDLMQTETKGTVLIKSAQELLDYSTGEEKQVEEHIKSIADSGCSVIVAGGKVGELYLHYCNQYKLMVVRLMSKFDLRRLCKAIGATPLPRITVPTGEEMGHCDLVYTDEVGDTPVIIFKQTIVIRGATDNIMDDIERAVDDGVNTFKMITRDGRYLAGAGATEMELAKKISSFGEICPGLEQYAIGKFAESLEALPRALAENCGVEVVSKLYAAHQNAVENNIFDLFLTKHWALKFATRAACTVLSVDQIIMAKAAGGPKAVKALNPNAEVARAAQALAINTSAAKGLQDVLKTNLGPNGTMKMLVSGSGDIKLTKDGNVLLHEMQIQHPTASLIARVATAQDDITGDGTTSNVLIIGELLKQADMYITEGLHPRLLTEGFDAAKTKALEILDMDRDVLVNVAKTSLRTKVHPDLADLLTEHVVDAVLSIIDLHMVELMEMQHKTDMDTSLVKGLVLDHGARHPDMPKRLENAYILTCNVSMEYEKSEVNSGFFYKSASEREKLVAAERSFTDSKVKKIIEFKQKVCDKNFVIINQKGIDPLSLDMLAKEGIMALRRAKRRNMERLSLACGGVAMNSVEELSEDCLGYAGLVYEQVLGEEKFTYVENCKNPLSVTLLMKGPNKHTLTQIKDAVHDGLRAVKNAIEDDAVIPGAGAYEVVTHA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Ciona_intestinalis 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Daphnia_pulex MPAYHSMAILPRGPAPDVLDEALYYFKANVFFRTYEVKSEADRLLIYLTLYITECLKKLQKCSNKNTAQNEMYTLAISKFDIPGEGFPLNSVYAKPTSQHEADLLRQYLTQARQEMGLRLVDKVFCTEDGKPSKFWLCFAKKKFMDKSLSAPGMSATLRPYLSAVRSTLEAAMCLENFSSQVVERHNKPEVEVRTSKELLLNPVVISRNEKEKVLIEASINSVRISISIKQADEIEKILCHKFMRFMMMRAENFVVLRRKPVEGYDISFLITNFHTEAMYKHKLVDFVIHFMEEIDKEISEMKLAVNARARVCAEEFLKRFPITAHAWNKDRTKLAISPNSPEVHIYHFWKLEEILKEHDLKVTGIDWAPNTNRIVTCSADRNAYVWRPTLVLLRINRAATCVRWSPLENKFAVGSGARLISVCYFEKENDWWVSKHIKKPIRSTVTCLDWHPNDVLLAAGSTDFKVRVFSAYILGLMMAEFGWVHSVNFSSTGDRVAWVGHDSSISVLPFLSCLWVSENRLIAAGHGCCPMLFSAMKKFQSLDTLHQNAITAGVDGLLAIWEISSILEERILLEETGRVLSIGDGIARVYGLKNIQAEEMVEFSSGLKGMALNLEPDNVGVVVFGNDKLIKEGDIVKRTGAIVDVPIGAELLGRVVDALGNPIDGKGSLRARVGVKAPGIIPRISVREPMQTGIKAVDSLVPIGRGQRELIIGDRQTGKTAIAIDAIINQKRFNDGADEKKKLYCIYVAIGQKRSTVAQIVKRLTDSDAMKYTIVVAATASDAAPLQFLAPYSGCAMGEYFRDNGKHALIIYDDLSKQAVAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKMNEVHGGGSLTALPVIETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLETELFYKGIRPAINVGLSVSRVGSAAQTRAMKQVAGSMKLELAQYREVAAFAQFGSDLDASTQQLLSRGVRLTELLKQGQYVPMAIEEQVPVIYCGVRGYLDKLDPSKITAFEKEFLQHIKTTHADVLTAIAKDGKITDETDAKLKKIVTEFLATFLPGKRTTGNSVRTQNVLAASSIANIVKSSLGPVGLDKMLVDDVGDVTITNDGATILNLLEVQHPAAKVLVELAQLQDQEVGDGTTSVVIVAAELLKNADELVKQKIHPTSVISGYRLACKEAVKYIQDNLTLSVEELGKDCLINAAKTSMSSKIISADANFFAAMCVDAANAVRVTDNKGQAIYPIKAINVLKAHGKSARESLLITGYALNCSVASQAMVKKITNAKIACLDFSLQKTKMKMGVQVLVTDPEKLDAIRARESDITKERIQKILNAGANVILATGGIDDLCLKYFVEAGAMAVRRCKKADLKRIAKATGATLLSSMANLEGDESFEASSIGEAAEVSTERICDDELIIIKGTKARTAASIILRGPNDFYCDEMERSVHDALCVVKRVLESKTLVVGGGAVEVALSIYLESFATSLSSREQLAIAEFAHSLLVIPKTLAVNAAKDATDLVAKMRSYHHSSQGLDLMEGAVRDNRQAGVFEPAVSKIKSLKFATEAAITILRIDDMIKPTRILKHEGEEEKAEIARLSCFVGAIAIGELVKSTLGPKGMDKILVGVTNDGATILKAVGVDNPAAKVLVDMSKTQDAEVGDGTTSVTVLASELLREADKLVEMKFHPQTIIAGWRKASQAAKEALTNAAIDNGKDKFREDLMNIARTTLSSKILSQHKEFFAKISVDAVLRLNLQAIQIIKKQGGTLTDSFLDTGFLLDKKPGVNQPKRVENARILIANTPMDTDKIKVFGSRIRVDSVAKVAELELAEKEKMKEKIELILKHNCTVFINRQLIYNYPEQLFADAGVMAVEHADFDGIERLALVTGGEIVSTFGHPELVKLGRCDLIEEVMIGEDKLLRFSGVPLGEACTLVLRGATQQILDEAERSIHDALCVLASTVKETRTVYGGGCSEVLMAMAVYALAAKTPGKESMAMEAFARALLQLPVVIADNAGYDSAQLVSELRAAHSEGKATFGLNMDLGKIDCMQQLGVTESYVVKRQVLVSAAEAAEMILRVDDIIKAAPRRRTKSKPAEIRSSNIEAAKAVADAIRTSLGPRGMDKMIQSGKGDVTITNDGATILKQMKLVHPAAKMLVELSKAQDVEAGDGTTSVVVLAGSFLEAAQKLLEKGIHPTVISESFQKASVKAVEILEAMATPMKLEDRHSLLMSATTSLGSKVVSQHSALLAPLAVDAVLKVIVDLRDIRVIEKLGGTVDDTELVGLVLDQRSAG-SRMEKAKIGLIQFCISPPKTDMDNQVVVSDYNAMDRVLREERAYILNVAKQVKKAGCNVLLVQKSILRDAVSELALHFFDKMKIMVVKDIEREDIEFITKTLNCRPIASLDHFLPEYMATADLVESVGTSKVVKITGNVGKTVSVIVRGSNKLVLEEAARSLHDALCVIRCLVKKRFIIAGGGAPETELAYQLTQYAQGLPGVEAYCLRAFAESLEVIPMTLAENAGLNPIATVTDLRNKHACGFKSSGINVRKGAITNMLDEGVAQPLLVTTSAITLASETVRSILKIDDIVNLAFDEFGRPFIIIKDQDRQKRLTGNAAIKSHILAARTVASTLRTSLGPKGLDKLMVSADGDITITNDGATILKMMDVDHQIAKLLVQLSQSQDDEIGDGTTGVVVLAGALLEKAEHLLDKGVHPIRIADGFEMAARCAIQSLERNAETFPLDVNNLEPLIQTAMTTLGSKIVNKCHRHMAEIAVNAVLAVADMETRDVNFELIKVETKVGGQLEDTMLVKGVIVDKDFSHPQMPKVLKNVKIAILTCPFEPPKPKTKHKLDVTSVEDYKNLRKYEHEKFEEMVQQVKDSGAGLAICQWGFDDEANHMLLQRELPAVRWVGGPEIELIAIATGGRIVPRFEELTPDKLGYAGVVKELCFGTTKDRMLVIEECTNSKAVTIFIRGGNKMIVDEAKRSIHDALCVIRNLVRDNRIVYGGGAPEISCAIAVAKEADSIKTLEQYPFRAFADALESIPLALAENSGLNPIHTLTEIKARQVAENNAALGIDCLCKGTADMKEQHVIETLHSKKQQILLATQVVKMILKIDDVRIIVLSQNTKRESGKKVQIDNITAGKTVADVIRTCLGPRAMLKMLMDPMGGIVLTNDGNAILREITVQHPAAKSMIEISRTQDEEVGDGTTSVIILAGEVLAVSEPFLQQQMHPTLIISAYRQALEDAVTVLRDQISTPVDVNDRSQLLSIIKSCLGTKFINRWSEQACQIALDAVSTVRREIDIKRYAKVEKVPGGTMEDSCVLRGVMLNKDVTHPKMRRHIVKPRILLLDCNLEYKKGESQTNIEIMKEEDFTRILELEEEYVQKTCEDIIRVKPDVVFTEKGVSDLAQHYLVKAGITAIRRVRKSDNNRIARASGATIVNRTDEIREEDIGTKAGLFEIKKIGDEYFCFVVECEDPKACTILLRGASKDVLNEVERNLQDAMNVTRNVLLEPKLVPGGGASEMALAYALAEKAKSLTGVTQAPYRAIAQALEVIPRTLAQNCGATVIRTLTALRAKHAT-GESTWGINGETGELSDMKDLGIWDPLAVKLQVLKTAVETAILLLRIDDIVSQPQIILLKEGTEASQGRSQIISNINACQAIVDCVRTTLGPRGMDKLMVDMGGKATISNDGATIMKLLDVVHPAAKTLVDIAKSQDAEVGDGTTSVVILAGEFLKQMKPFVEEGVHSQIIIRGVRRATQLAVQFINEIAEKPKKDDETELRQLLEKCAATAMGSKLINQQKDFFSKMVVDAVLMLDLLPLNMIGIKKVPGGALEDTLLVAGVAFKKTFSYAGFEMQPKQYTDPKIALLNIELELKAERDNAEVRLENVEEYQKVVDAEWTILYDKLEKLHLSGAKVVLSKLPIGDVATQYFADRDMFCAGRVPDEDLKRTMKACGGSILTTVLGDSVLGTCQHFEESQIGGDRFNLFKGCPQAKTCTIIIRGGAEQFMEETERSLHDAIMIVRRAKKNDAVVAGGGAIEMELSKHLRDVSRTIAGKEQMLISAIARALEVIPRQLCDNAGFDSTNILNKLRQKHNRWMGVDILNEDVADNMEKCVWEPSLVKINALSAASEATCLILSVDETIKNPKMMKEGSRMFQGLEEAVIRNISACKQLAETVQTAYGPIGMNKMVINHLGKLFVTNDAATIIRELDVEHPAAKMMILGSQMQEQEVGDGTNFVIILAGALLEQAEALIRMGLTPNEIAEGYEKALEKALITKAITAAIMSKQYGNESFLTPLITEACVSILPFNVDNVRVSKILGGSLYQSQVVQGMVFKRQVEGDITRAEKAKIAVYTCPIDSVQTETKGTVLIQSSKELIDFSRGEENMLEKEIAAIAAAGVKVIVSGGKIGDLCLHYLNKYGIMGVRLQSKFDLRRLCKAINATALPRLTPPSAEEVGYADHIYTDEFGDTAVVIFRQTIIVRGATDNFLDDIERAIDDGINNFKVLSRDGRLVPGAGAVEVELARQINQFADKCPGLDQYAIQRFAQALETFPRILSDNAGLETVAALLAAHQDAVESGVVDLFAAKYWGMKYATAAACTVLRVDQIIMAKRAGGPKSISLLNPKAEIARAAQALAVNISAAKGIQDVMKSNLGPKGTMKMLVSGAGEIKITKDGNVLLHEMQIQHPTASLIARASTAQDEVTGDGTTSTVLVIGELLKQADLYVSEGLHPRILTEGFELAKVKALEVLEAKREILLQVARTSLRTKVHQVLADLLTEACVDAVLAIIDLHMVEIMEMQHKTEMDTQLIRGIVMDHGSRHPDMPKRVDNAYILTCNVSMEYEKSEVNSGFFYKTADEREKLVKAERQFIESRVQKVVDLKKKLCDKTFVLINQKGIDPLSLDMLAKEGIIALRRAKRRNMERLTLACGGIAMNSFDDLSESCLGYAGAVYEHVLGEDKYTFVEDCRNPRSVTILIKGPNKYTLTQTKDAIRDGLRAVVNALEDTFVVPGAGAVEIATHK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Ephydatia_muelleri 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Gorgonia_ventalina 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'Oscarella sp. SN-2011' 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Pleurobrachia_pileus 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Strigamia_maritima 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27081-27261; END; BEGIN TREES; TITLE Myxozoans_Bayesian_Phylobayes_CAT_model; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Acanthoeca_like_sp_10tr, 2 Acropora_cervicornis, 3 Aiptasia_pallida, 4 'Amoebidium parasiticum JAP-7-2', 5 Amphimedon_queenslandica, 6 Aphrocallistes_vastus, 7 Aurelia_aurita, 8 Beroe_abyssicola, 9 Bolocera_tuediae, 10 Botryllus_schlosseri, 11 Branchiostoma_floridae, 12 Buddenbrockia_plumatellae, 13 Capitella_teleta, 14 Capsaspora_owczarzaki_atcc30864, 15 Chondrilla_nucula, 16 Ciona_intestinalis, 17 Clytia_hemisphaerica, 18 Corticium_candelabrum, 19 Craspedacusta_sowerbyi, 20 Crassostrea_gigas, 21 Cyanea_capillata, 22 Daphnia_pulex, 23 Ectopleura_larynx, 24 Edwardsiella_lineata, 25 Enteromyxum_leei, 26 Ephydatia_muelleri, 27 Eunicella_cavolinii, 28 Euplectella_aspergillum, 29 Euplokamis_dunlapae, 30 Gorgonia_ventalina, 31 Helobdella_robusta, 32 Homo_sapiens, 33 Hormathia_digitata, 34 Hydra_magnipapillata, 35 Hydractinia_polyclina, 36 Ilyanassa_obsoleta, 37 Sarcotragus_fasciculatus, 38 Ixodes_scapularis, 39 Kudoa_iwatai, 40 Latimeria_menadoensis, 41 Leucetta_chagosensis, 42 Ministeria_vibrans_atcc50519, 43 Mnemiopsis_leidyi, 44 Monosiga_brevicollis_mx1, 45 Monosiga_ovata, 46 Montastraea_faveolata, 47 Myxobolus_cerebralis, 48 Nanomia_bijuga, 49 Nasonia_vitripennis, 50 Nematostella_vectensis, 51 Octopus_vulgaris, 52 Oscarella_carmela, 53 'Oscarella sp. SN-2011', 54 Patiria_miniata, 55 Pediculus_humanus_corporis, 56 Petromyzon_marinus, 57 Petrosia_ficiformis, 58 Pleurobrachia_pileus, 59 Pocillopora_damicornis, 60 Polypodium_hydriforme, 61 Porites_australiensis, 62 Saccoglossus_kowalevskii, 63 Salpingoeca_sp._ATCC50818, 64 Sphaeroforma_arctica_jp610, 65 Sphaeromyxa_zaharoni, 66 Stephanoeca_diplocostata, 67 Stomolophus_meleagris, 68 Strigamia_maritima, 69 Strongylocentrotus_purpuratus, 70 Sycon_ciliatum, 71 Sycon_coactum, 72 Tetracapsuloides_bryosalmonae, 73 Thelohanellus_kitauei, 74 Trichoplax_adhaerens, 75 Tripedalia_cystophora, 76 Urticina_eques, 77 Vallicula_multiformis; TREE Bayesian_CAT_Model = [&R] (1:0.241422,66:0.129387,((63:0.354872,44:0.288754)1:0.184688,(45:0.37129,(((42:0.579873,14:0.387197)1:0.071893,(64:0.420388,4:0.21263)1:0.301429)1:0.090813,((29:0.103096,(77:0.11255,(58:0.109756,(43:0.055345,8:0.079461)1:0.026066)1:0.03234)1:0.044636)1:0.524453,(((((71:0.055842,70:0.047872)1:0.183183,41:0.136928)1:0.206819,((52:0.079065,53:0.093695)1:0.139681,18:0.177515)1:0.136164)1:0.019658,((28:0.109352,6:0.105561)1:0.603459,((37:0.261436,15:0.298612)1:0.025314,(26:0.245096,(57:0.113941,5:0.163019)1:0.108861)1:0.05383)1:0.048185)1:0.059975)1:0.020568,(74:0.400088,((((38:0.234903,(68:0.198918,((55:0.179199,49:0.162398)1:0.084954,22:0.21413)1:0.063396)1:0.014776)1:0.080523,((51:0.233368,(36:0.206702,20:0.153597)1:0.016695)1:0.040493,(31:0.276491,13:0.187986)1:0.053595)1:0.043322)1:0.034707,((62:0.165227,(69:0.168054,54:0.135705)1:0.079578)1:0.043683,(11:0.197496,((56:0.131691,(40:0.051757,32:0.061051)1:0.057095)1:0.093457,(16:0.181071,10:0.177162)1:0.203497)1:0.034725)1:0.018767)1:0.010276)1:0.060934,(((60:0.382371,(((65:0.566892,(73:0.420027,47:0.267713)1:0.412065)1:0.337792,(39:0.291117,25:0.385026)1:0.670472)1:0.311962,(72:0.190798,12:0.154641)1:0.990015)1:0.502903)1:0.177381,((19:0.14547,((34:0.103682,23:0.100824)1:0.047863,((48:0.149331,35:0.080322)1:0.012486,17:0.133135)1:0.014148)1:0.054369)1:0.090563,(75:0.156917,(21:0.085254,(67:0.069638,7:0.063396)1:0.032611)1:0.08053)1:0.018991)1:0.03463)1:0.089885,((30:0.022775,27:0.024936)1:0.191724,(((50:0.051253,24:0.051788)1:0.037372,((76:0.038036,9:0.048381)1:0.02719,(33:0.053691,3:0.046024)1:0.021567)1:0.048745)1:0.05722,((59:0.046085,46:0.028255)1:0.011322,(61:0.035129,2:0.084061)1:0.008577)1:0.076243)1:0.04942)1:0.038314)1:0.045462)1:0.013371)1:0.015511)1:0.029048)1:0.200868)1:0.189239)1:0.051057)1:0.346489); END;