#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 27, 2024; 3:21 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Donadio S., Nicola M.V., Scataglini M., & Pozner R. 2016. A new species of Mastigostyla from Argentina (Iridoideae, Iridaceae). Systematic Botany, 41(3). TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S17829] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=87; TAXLABELS Ainea_conzattii Alophia_veracruzana Anomatheca_laxa Aristea_coerulea Babiana_sp Belamcanda_chinensis Bobartia_gladiata Calydorea_pallens Calydorea_sp__MP 'Cardenanthus vargasii 025.2011_JQ670369' Chasmanthe_aethiopica Cipura_campanulata Cobana_sp__MP Crocosmia_mathewsiana Crocus_pulchellus Cyanixia_socotrana Cypella_aquatilis 'Cypella cyrtophylla SP880_JQ670391' Cypella_mexicana Cypella_rosei Devia_xeromorpha Dierama_robustum Dietes_robinsoniana Diplarrhena_latifolia Doryanthes_palmeri Duthiastrum_linifolium Eleutherine_latifolia Ennealophus_euryandrus Ferraria_uncinata Fosteria_sp_MP Freesia_alba Geissorhiza_heterostyla Gelasine_elongata Geosiris_aphylla Gladiolus_guienzii Herbertia_pulchella Hesperantha_pseudopilosa Hesperoxiphion_peruvianum Iris_unguicularis Isophysis_tasmanica Ixia_latifolia Ixiolirion_tataricum Klattia_flava Lapeirousia_neglecta Libertia_ixioides Mastigostila_cabrerae_Zuloaga_37 Mastigostila_coronata_Zanotti_210 Mastigostyla_sp._01_046.2011_JQ670392 Melasphaerula_ramosa Micranthus_junceus Moraea_namaquamontana Nemastylis_geminif Nemastylis_sp__MP Nemastylis_tenuis Neomarica_northiana Nivenia_corymbosa Olsynium_filifolium Onira_unguiculata Orthrosanthus_chimboracensis Pardanthopsis_dichotoma Patersonia_glabrata Pillansia_templemannii Radinosiphon_New Radinosiphon_leptostachya Romulea_monadelpha Savannosiphon_euryphyllus Sessilanthera_MP 'Sisyrinchium micranthum SP839_JQ670414' Solenomelus_pedunculatus Sparaxis_variegata Syringodea_bifucata Syringodea_unifolia Thereianthus_racemosus Tigridia_alp_ssp_alp Tigridia_alp_ssp_obt Tigridia_flammea_MP Tigridia_orthantha_MP Tigridia_pavonia Tigridia_philipp Tigridia_seleriana_MP Trimezia_martinicensis Tritonia_disticha Tritoniopsis_unguicularis Watsonia_angusta Witsenia_maura Xenoscapa_fistulosa Zephyra_elegans ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M37524] TITLE 'Iridaceae rps16+trnL-F'; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=2040; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Zephyra_elegans GTTGGGTTGGTAAATAGTAA??TAGT???????ACATGATGGAGCTCGAGCAGAAAGTATTGATT?????CATTT?????????ATCGGGGGG???AAAA??TCTAGGGTTAGTGACAATTAAATTAA?TAAGTTAGACCGACTTTGT?AAATATATCCTCAATAT??????????ATAAAT????????????????????????CGAAAGG?TTAAAATTCGAACAAGTTT?????????GAAAT????????AAAAAAAAGTAAAATTTGTCAG??AATT???????????????????GGTAAGACTATTTCGATGAAAAA?????????????????????????????TGTATCACA?AGGGAATCAA?TCGTTCGTATTATTTTT???CCATAGAAA?????????????GAAATAACAAAAAA?????CAAAA?GGTACGTTGCTGCCATTTT?????GAAAGGAGTAAAGA???????TCGCCGAAGTAATGTCTAAACCCAATGATTTCACAA?A?????GCAAAGAGAAGGGATTCCGGAACAAGGAAACACTATTTT???CAATTGTCTCAATAA????????TTGGATTAGAGTGGGGAATAAAAA??????TAGA???????TTCGAGACGAGA?CAAACAAAAAA?GGTTAGAGACGGCTCAATAAA???????????TGTCTAAGGATTTCTCTTCGAATTCTTTCAGAATTACCCAACTTGAGTTATGAGTAGGAATGATATTTCTTTTTTT????????????????????CTGTAAG??????????????GAAGAACAAAAAAA??CGACTCAAATCATAGTCTAATCCATAATTTT????AT??????GGATCCATTT?GTC???????????????????????????????ATTATATACAGAAA???????TTAGAAT????CATTTTTT??CTCGAGCCGTATGAGGAGAAAACCTCCTATACGTTTCCTGGGGGGG???CATTGTTTAT?CTGCTAGGTGGTAACTTCCAAATTCAGAGAAACCCTGGAACTAAAAAT?????GGGCAATCCTGAGCCAAATCTTTATTTT?GAGAAAACAA??????????GGATTTT????????????TAAAACTAGAAAGAATAAAAAA????GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTGTTCTAACGAATGGAGTTGAATACGTT????????????????????????GCGTTGGTAGCTGGAATCCCTTTATCGAAATTAAA?????????????????????????????GAAAGGATGACCCTATATA?CCCAATACGTACGTATACATACT?GA?????????????TATATCA??????AACGA??TTAAATTCACGACCCGAATCCAT??????????ATTATA???????????????????TATATGCAAAA??????????TTTAGAGTTATTGTGGATCCATTCCAATCGAAGTTGAAGGAGGAATCGAATATTCAGTGATCAAATC?ATT?????CATTCCAGAGTTTGGT?????AGATCTTTTGAAAAACAGATTAATCG????????????GACGAGAATAAAGAGAGAGTCCCATTTTACATGTCAATACCGACAACAATGAAATTTATAGTAA?GAGGAAAATCCGTC?GACTTTAGAAATCGTGAGGGTTCAAGTCC???????????CTCTATCCCCAATAA?AAAGCCCATTTTACTTCCT?AACTA?TTTATC???????????????CTCTTTTTTTTT??????????????????CATCAATGGTTCAAACAAAATTCA?ATA?CCTTTCTCATTCACTC??TACTCT?TTCACAAATGGATCCGAACAGAAATCTTTGGATCTTATCCCGATTTGT?????ATAGA?TACGATACCTGTATAAATGAACATATAT???????????????GGGCAAGGAATTCCCATTATTGAATC??????????ATTCATAGTCCATATCATTATCCTTACATTTACAA? ; END; BEGIN TREES; TITLE Mastigostyla; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Zephyra_elegans, 2 Ainea_conzattii, 3 Alophia_veracruzana, 4 Anomatheca_laxa, 5 Aristea_coerulea, 6 Babiana_sp, 7 Belamcanda_chinensis, 8 Bobartia_gladiata, 9 Calydorea_pallens, 10 Calydorea_sp__MP, 11 Chasmanthe_aethiopica, 12 Cipura_campanulata, 13 Cobana_sp__MP, 14 Crocosmia_mathewsiana, 15 Crocus_pulchellus, 16 Cyanixia_socotrana, 17 Cypella_aquatilis, 18 Cypella_mexicana, 19 Cypella_rosei, 20 Devia_xeromorpha, 21 Dierama_robustum, 22 Dietes_robinsoniana, 23 Diplarrhena_latifolia, 24 Doryanthes_palmeri, 25 Duthiastrum_linifolium, 26 Eleutherine_latifolia, 27 Ennealophus_euryandrus, 28 Ferraria_uncinata, 29 Fosteria_sp_MP, 30 Freesia_alba, 31 Geissorhiza_heterostyla, 32 Gelasine_elongata, 33 Geosiris_aphylla, 34 Gladiolus_guienzii, 35 Herbertia_pulchella, 36 Hesperantha_pseudopilosa, 37 Hesperoxiphion_peruvianum, 38 Iris_unguicularis, 39 Isophysis_tasmanica, 40 Ixia_latifolia, 41 Ixiolirion_tataricum, 42 Klattia_flava, 43 Lapeirousia_neglecta, 44 Libertia_ixioides, 45 Melasphaerula_ramosa, 46 Micranthus_junceus, 47 Moraea_namaquamontana, 48 Nemastylis_geminif, 49 Nemastylis_sp__MP, 50 Nemastylis_tenuis, 51 Neomarica_northiana, 52 Nivenia_corymbosa, 53 Olsynium_filifolium, 54 Onira_unguiculata, 55 Orthrosanthus_chimboracensis, 56 Pardanthopsis_dichotoma, 57 Patersonia_glabrata, 58 Pillansia_templemannii, 59 Radinosiphon_New, 60 Radinosiphon_leptostachya, 61 Romulea_monadelpha, 62 Savannosiphon_euryphyllus, 63 Sessilanthera_MP, 64 'Sisyrinchium micranthum SP839_JQ670414', 65 Solenomelus_pedunculatus, 66 Sparaxis_variegata, 67 Syringodea_bifucata, 68 Syringodea_unifolia, 69 Thereianthus_racemosus, 70 Tigridia_alp_ssp_alp, 71 Tigridia_alp_ssp_obt, 72 Tigridia_flammea_MP, 73 Tigridia_orthantha_MP, 74 Tigridia_pavonia, 75 Tigridia_philipp, 76 Tigridia_seleriana_MP, 77 Trimezia_martinicensis, 78 Tritonia_disticha, 79 Tritoniopsis_unguicularis, 80 Watsonia_angusta, 81 Witsenia_maura, 82 Xenoscapa_fistulosa, 83 'Cardenanthus vargasii 025.2011_JQ670369', 84 'Cypella cyrtophylla SP880_JQ670391', 85 Mastigostyla_sp._01_046.2011_JQ670392, 86 Mastigostila_coronata_Zanotti_210, 87 Mastigostila_cabrerae_Zuloaga_37; TREE t1 = [&R] ((1:0.038176,24:0.023382,41:0.107115):0.018433,(39:0.02189,((57:0.071485,(5:0.041164,33:0.079009,(52:0.008761,(42:0.016953,81:0.008607):0.010774):0.029291,((((79:0.007764,(59:8.63E-4,60:0.002625):0.008045):0.001685,(82:0.016863,(30:0.014767,(4:0.007455,20:0.004293):0.00334):0.003642):0.005717):0.002471,((63:0.036845,(16:0.009134,43:0.008923):5.13E-4):0.007885,(46:0.016256,69:0.012174,(58:0.005047,80:0.010026):0.003007):0.004878):0.002833):0.002453,((34:0.012782,45:0.011885):9.23E-4,((31:0.096381,36:0.014044):0.01257,(61:0.021858,(15:0.004352,(67:0.014323,68:0.010253):0.001876):0.004661):0.004575,(11:0.019929,25:0.014056,40:0.025072,62:0.021426,(6:0.00929,14:0.034596):0.00961,(21:0.020844,78:0.011682):0.006296):0.010356):0.005969):0.008258):0.024637):0.01933):0.007829,(23:0.011349,(((38:0.018968,(7:7.95E-4,56:1.0E-8):0.011469):0.014841,(8:0.002206,22:0.013561,28:0.007302,47:0.035472):0.008097):0.009241,((66:0.038843,((44:0.014699,55:0.010546):0.00563,(53:0.036894,(64:0.015732,65:0.015244):0.018928):0.0044):0.007299):0.017498,((51:0.010465,77:0.018963):0.006241,(((12:0.012916,(18:1.0E-8,19:0.001533):0.003948):0.006612,((9:0.003063,(48:0.003125,50:0.003849):8.61E-4):8.88E-4,(17:0.004613,(35:0.011658,54:0.001055):0.004513):0.001579):0.004585):0.004227,(3:0.011291,27:0.004586,37:0.002277,(26:0.009223,32:0.009204):0.008945,(75:0.009011,(87:0.003221,((83:1.0E-8,84:1.0E-8):7.55E-4,(85:1.0E-8,86:1.0E-8):7.57E-4):7.6E-4):0.003289):0.002638,(10:0.003026,13:0.003831,49:0.003121,70:1.0E-8,71:1.0E-8,72:0.00227,((2:1.0E-8,29:7.54E-4):7.51E-4,(73:1.0E-8,74:1.0E-8,76:0.001513):0.003035):0.001507):0.003892):0.007618):0.009189):0.011895):0.007562):0.005789):0.011488):0.00571):0.018433); END;