#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 23, 2024; 7:35 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Escobar garcía P., Schönswetter P., Fuertes aguilar J., Nieto feliner G., & Schneeweiss G.M. 2009. Five molecular markers reveal extensive morphological homoplasy and reticulate evolution in the Malva alliance (Malvaceae). Molecular Phylogenetics and Evolution, 50: 226-239. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S17938] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=43; TAXLABELS Alcea_rosea Althaea_armeniaca Althaea_cannabina Althaea_hirsuta Althaea_longiflora Althaea_ludwigii Althaea_officinalis Anisodontea_malvastroides Kitaibela_vitifolia Lavatera_acerifolia Lavatera_agrigentina Lavatera_arborea Lavatera_assurgentiflora Lavatera_bryoniifolia Lavatera_cretica Lavatera_flava Lavatera_maritima Lavatera_maroccana Lavatera_mauritanica Lavatera_oblongifolia Lavatera_olbia Lavatera_phoenicea Lavatera_plazzae Lavatera_plebeia Lavatera_punctata Lavatera_thuringiaca Lavatera_triloba_pallescens Lavatera_triloba_triloba Lavatera_trimestris Malope_malacoides Malope_trifida Malva_aegyptia Malva_alcea Malva_cretica_althaeoides Malva_hispanica Malva_moschata Malva_neglecta Malva_nicaeensis Malva_parviflora Malva_sylvestris Malva_tournefortiana Malva_trifida Malva_verticillata ; END; BEGIN CHARACTERS; [! 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Althaea_armeniaca 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Lavatera_arborea 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Lavatera_assurgentiflora 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Lavatera_bryoniifolia 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Lavatera_cretica 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Lavatera_flava 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Lavatera_maritima 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Lavatera_oblongifolia 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Lavatera_olbia 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Lavatera_phoenicea 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Lavatera_trimestris 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Malva_aegyptia 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Malva_hispanica 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Malva_nicaeensis 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Malva_parviflora 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Malva_sylvestris 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Malva_tournefortiana 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Malva_trifida 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Malva_verticillata 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; END; BEGIN SETS; CHARSET cpDNA (CHARACTERS = Malva_alliance) = 1-4911; CHARSET ITS (CHARACTERS = Malva_alliance) = 4912-5689; END; BEGIN TREES; TITLE Malva_alliance; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Althaea_armeniaca, 2 Althaea_hirsuta, 3 Althaea_longiflora, 4 Althaea_cannabina, 5 Althaea_officinalis, 6 Althaea_ludwigii, 7 Lavatera_cretica, 8 Lavatera_agrigentina, 9 Lavatera_bryoniifolia, 10 Lavatera_triloba_triloba, 11 Lavatera_triloba_pallescens, 12 Lavatera_flava, 13 Lavatera_assurgentiflora, 14 Lavatera_acerifolia, 15 Lavatera_arborea, 16 Lavatera_maritima, 17 Lavatera_maroccana, 18 Lavatera_mauritanica, 19 Lavatera_oblongifolia, 20 Lavatera_olbia, 21 Lavatera_plebeia, 22 Lavatera_phoenicea, 23 Lavatera_plazzae, 24 Lavatera_punctata, 25 Lavatera_thuringiaca, 26 Lavatera_trimestris, 27 Malope_malacoides, 28 Malope_trifida, 29 Malva_aegyptia, 30 Malva_trifida, 31 Malva_cretica_althaeoides, 32 Malva_hispanica, 33 Malva_tournefortiana, 34 Malva_alcea, 35 Malva_moschata, 36 Malva_neglecta, 37 Malva_nicaeensis, 38 Malva_parviflora, 39 Malva_sylvestris, 40 Malva_verticillata, 41 Alcea_rosea, 42 Anisodontea_malvastroides, 43 Kitaibela_vitifolia; TREE con_50_majrule = [&R] (42:0.003854,((43:0.018937,(41:0.007559,(4:0.002311,(1:1.0E-8,5:0.001218):0.001251):0.00676):7.06E-4):0.005848,((27:0.002271,28:0.002487):0.012247,(22:0.006337,((29:0.001307,30:6.48E-4):0.008884,((31:0.005419,(6:0.006561,(2:0.002487,3:0.002571):0.003132):0.001343):0.002519,(((14:0.0014,16:0.002341):0.002201,((15:0.001889,18:0.002948):0.002912,((13:7.33E-4,21:0.001873):7.23E-4,((7:6.79E-4,37:0.001738):4.03E-4,(39:3.53E-4,(36:9.55E-4,(38:3.93E-4,40:7.98E-4):0.001257):0.001197):3.57E-4):8.4E-4):0.001376):0.005615):0.004796,((32:0.004704,(34:0.001485,(33:7.61E-4,35:6.3E-4):3.5E-4):0.008516):0.00131,(26:0.008694,(11:0.008809,17:0.004033,(25:0.005253,((19:0.002526,20:0.001332):5.83E-4,(23:0.004496,((9:0.003054,10:3.79E-4):0.001234,(24:0.00279,(8:8.34E-4,12:5.61E-4):0.001657):2.17E-4):8.66E-4):2.35E-4):0.001586):8.14E-4):4.99E-4):5.2E-4):0.001744):0.001546):0.001203):0.003507):0.00774):0.004521):0.003854); TREE con_50_majrule = [&R] (42:0.0040995,(((41:0.008408,43:0.020882):1.35289E-7,(4:0.002445,(1:1.0E-8,5:0.001291):0.001354):0.00738):0.006679,((27:0.00239,28:0.002681):0.01335,((2:0.004701,31:0.00364):0.003297,(29:0.001392,30:6.85E-4):0.011258,((3:0.005504,6:0.007045):0.001945,((14:0.002573,16:0.001425):0.006584,(22:0.012065,((26:0.008874,(23:0.002958,(15:0.004641,(13:0.001128,21:0.002269,(7:0.001043,(38:1.0E-8,(18:0.006682,40:8.31E-4):4.28E-4):0.003009,(37:0.002128,(36:0.002123,39:2.06E-4):4.22E-4):2.09E-4):0.001205):0.002033):0.009649):0.00219):6.45E-4,((32:0.00522,(34:0.00161,(33:7.99E-4,35:6.63E-4):3.22E-4):0.008937):0.00177,(17:0.005187,24:0.004448,(11:0.01002,((8:8.5E-4,12:6.19E-4):0.003102,(20:0.002023,(9:0.002417,10:0.001201):0.001644,(19:0.003149,25:0.006942):1.69E-4):0.0):0.001108):2.42E-4):2.69E-4):2.64E-4):0.001813):9.67E-4):0.002021):5.47E-4):0.012842):0.005207):0.0040995); END;