#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 25, 2024; 14:17 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Mynssen C.M., Vasco A., Moran R., Sylvestre L.S., & Rouhan G. 2015. Desmophlebiaceae and Desmophlebium: a new family and genus of Eupolypod II ferns. Taxon, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S18023] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=94; TAXLABELS Anisocampium_cumingianum_Chensn Anisocampium_niponicum Asplenium_abscissum_Jimenez2503 Asplenium_angustum_Boudrie3254 Asplenium_cordatum_unknownCV817 Asplenium_feei_Lemieux2272 Asplenium_juglandifolium_Schneidersn Asplenium_nidus_FischerT9 Asplenium_phyllitidis_Schneidersn Asplenium_salicifolium_Boudrie3248 Asplenium_scolopendrium_Christenhusz3867 Asplenium_serratum_VianeRV10607 Asplenium_theciferum_Schuettpelz258 'Athyrium filix-femina Larsson7' Athyrium_otophorum_Smithsn Athyrium_yokoscense_Katosn Blechnum_brasiliense_Christenhusz4968 Blechnum_orientale_Zhang2565 Cornopteris_banahaoensis_uknown761633 'Cornopteris decurrenti-alata Schuettpelz1215A' Cystopteris_diaphana_Sylvestre2198 Cystopteris_fragilis_Larsson21 Deparia_lancea_Schuettpelz298 Deparia_petersenii_Damasceno2 Deparia_petersenii_Katosn Diplaziopsis_brunoniana_SGLUBN11PYU Diplaziopsis_cavaleriana_SGLUCQ1PYU Diplazium_acanthopus_Cicuzza806 'Diplazium accedens YatskievychMBG2001-1125' Diplazium_alatum_Wei259 Diplazium_amamianum_XP333 Diplazium_ambiguum_Mynssen1338 Diplazium_asperum_Zhang545 Diplazium_australe_Parris1 Diplazium_balliviani_Weigelt9232 Diplazium_bantamense_Cicuzza455 Diplazium_bellum_Wei206 Diplazium_bicolor_Kessler13009 Diplazium_bombonasae_Moran7493 Diplazium_celtidifolium_Christenhuzs4934 Diplazium_centripetale_Christenhusz4236 Diplazium_conterminum_Wei56 Diplazium_cordifolium_Karger1516 Diplazium_crassiusculum_Wei66 Diplazium_cristatum_Weigelt90474 Diplazium_donianum_Zhang5562 Diplazium_giganteum_Li12 Diplazium_hirtipes_Zhang4454 Diplazium_lechleri_Mynssen1170 Diplazium_lechleri_Tuomisto6170 Diplazium_legalloi_Christenhusz4063 Diplazium_leptocarpon_Mynssen1325 Diplazium_leptocarpon_Mynssen960 Diplazium_lindbergii_Kessler12992 Diplazium_lindbergii_Mynssen1266 Diplazium_lonchophyllum_Lyonack3140 Diplazium_longifolium_Zhang6301 Diplazium_macrodictyon_Moran6756 Diplazium_macrophyllum_Weigelt90229 Diplazium_malaccense_Cicuzza168 Diplazium_mettenianum_Wei70 Diplazium_muricatum_Wei197 Diplazium_mutilum_Mynssen952 Diplazium_plantaginifolium_Moran339 Diplazium_prominulum_Boyle5703 Diplazium_pullingeri_Zhang2826 Diplazium_roemerianum_Mynssen955 Diplazium_rostratum_Mynssen1288 Diplazium_sanderi_Smith2848 Diplazium_sibiricum_Wei176 Diplazium_striatum_Kessler13350 Diplazium_subserratum_KuoChiou15146 Diplazium_subspectabile_Li1209 Gymnocarpium_oyamense_Nakatosn Gymnocarpium_remotipinnatum_Yatskievych Hemidictyum_marginatum_Christenhusz2476 Hemidictyum_marginatum_Mynssen1397 Homalosorus_pycnocarpos_Cranfillsn Hymenasplenium_cheilosorum_Schaefer55 Hymenasplenium_triquetrum_Sylvestre2208 Hymenasplenium_unilaterale_Ranker2072 Matteuccia_struthiopteris_Henry96872 Onoclea_sensibilis_Schuettpelz353 Onoclea_sensibilis_Zhang3791 Pentarhizidium_intermedium_3394PE Rhachidosorus_consimilis_LiLUJ21 Rhachidosorus_mesosorus_Matsumotosn Thelypteris_dentata_Schuettpelz607 Thelypteris_palustris_Larsson16 Woodsia_mollis_Larsson103 Woodsia_plummerae_Schuettpelz1235A Woodsia_polystichoides_LiLUFJS5 Woodwardia_prolifera_LiLUWY17 Woodwardia_unigemmata_Schuettpelz ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M32634] TITLE Desmophlebiaceae_and_Desmophlebium; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=5489; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Asplenium_abscissum_Jimenez2503 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Asplenium_feei_Lemieux2272 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Asplenium_juglandifolium_Schneidersn 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Asplenium_nidus_FischerT9 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Asplenium_phyllitidis_Schneidersn 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Asplenium_salicifolium_Boudrie3248 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Asplenium_scolopendrium_Christenhusz3867 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Athyrium_otophorum_Smithsn 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'Cornopteris decurrenti-alata Schuettpelz1215A' 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Diplazium_acanthopus_Cicuzza806 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'Diplazium accedens YatskievychMBG2001-1125' 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Diplazium_amamianum_XP333 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Diplazium_balliviani_Weigelt9232 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Diplazium_bantamense_Cicuzza455 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Diplazium_bellum_Wei206 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Diplazium_bombonasae_Moran7493 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Diplazium_celtidifolium_Christenhuzs4934 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Diplazium_cordifolium_Karger1516 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Diplazium_donianum_Zhang5562 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Diplazium_lindbergii_Kessler12992 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Diplazium_muricatum_Wei197 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Diplazium_prominulum_Boyle5703 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Diplazium_pullingeri_Zhang2826 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Diplazium_sibiricum_Wei176 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Diplazium_subspectabile_Li1209 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Hemidictyum_marginatum_Christenhusz2476 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Hemidictyum_marginatum_Mynssen1397 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Hymenasplenium_unilaterale_Ranker2072 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Rhachidosorus_consimilis_LiLUJ21 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Rhachidosorus_mesosorus_Matsumotosn 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Woodsia_mollis_Larsson103 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Woodsia_plummerae_Schuettpelz1235A 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Woodwardia_prolifera_LiLUWY17 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Woodwardia_unigemmata_Schuettpelz CAGTCTGGATAATCAACTACATTTGCGAATGGTTGATTATAACATCGGCTTGTTCAGATCCATGAAAAACGAATCCAATTAGTTTCA----GTTTCACTACCATCTCATTGTAAAACGGGTTTTATTTTTACCTCTCCCTCTTCCAGTAATA---TTTTTTTCGTAAACATGGTTATAAACATTCGACCCGACGAAATTAGCAGCATTATTCGCAAGCAAATTGAAGGGTATGTCCCGGAAGTAAAGGTTGTCAATATTGGTACCGTACTTTAAGTCGGAGATGGAATTGCCCGTATTCATGGACTTAACAAAGTAATGGCTGGCGAATTGGTGGAATCTGAGGATGGCACAGTAGGGATCGCTCTGAATCTGGAATCTGATAATGCCGGGGCTGTACCGACGGGTGATGGTTTGACCATACAAGAGGGAAGTTCTGTAAGAGCGACAGGAAAGATTGCCCAAATACCAGTCAGTGACTCGTTTCTGGGTCGTGTTGCAAATGCCTTGGCCCAACCTATCGACGGGAAAGGTCAAATCCCAGCTTCTGAGTTTAGACCGATCGAATCCCCCGCTCCAGGGATTATTTCGAGACGCTCCGTATACGAACCTTTACAAACAGGTCCTATCGCTATTGACTCCATGATTCCCATAGGTCGCGGTCAGCGAGAGTTAATTATTGGCGATAGACAGACTGGTAAAACAGCAGTAGCTACAGATACAATTTTGAATCAGAAAGGTCAGAATGTTATATGTGTCTATGTAGCCATTGGCCAAAAAGCTTCTTCTGTGGCTCAGGTAGTGGATACCTTTCAAGATCGTGGCGCCATGGAATATACGATTGTGGTGTCGGAGACTGCGAATTCTCCAGCCACTCTGCAATATCTCGCTCCTTATACCGGAGCAGCTTCAGCCGAATACTTCATGTATCGCAAGCAGCATACCCCGATTATTCATGACGATCCTTCTAAACAAGCCCAGGCTTACCGACAAATGTCTCTGCTACTAAGGAGACCACCTGGGCGAGAAGCATATCCGGGAGATGTTTTTTACCCACATCCTCGTCTTTCAGAGAGAGCAGCTAAGTTAAGTCTCCAATTAGGGGAGGGCAGCATGACCGCCTTACCTATCGTTGAGACGCAGGCGGGGGATGTCTCAGCTTACATCCCCACCAATGTTATTTCTATTACTGATGGCCAAATTTTTTTATCAGCAGATCTATTTAATGCTGGGATTCGACCAGCAATAAATGTGGGGATTTCCGTGTCAAGAGTGGGCTCCGCAGCTCAAATAAAAGCTATGAAACAGGTGGCCGGCAAATTGAAATTGGAATTAGCGCAATTCGCAGAGTTGGAGGCTTTCGCGCAATTCGCTTCCGATCTTGATAAGACTACTCAGAATCAGCTAGCTAGGGGCCAGCGATTGCGTGAACTGCTTAAACAGTCTCAATCAGCCCCATTATCAGTAGAGGAACAGGTGGCCACCACTTACACTGGAGTCAACGGATATTTGGATATACCAGAAGTTGAACAGGTCAAACGATTCCTGGTTCAGCTCCGCGAGTATGTAATAACCAGTAAACCTCAATTTGGTGAAATTACTCGTTCCACAAAAGTGTCTACAGAACAAGCGGAAACACTTTTGAGGGAAGCTATTAAGGAGTCGACAGAAATTTTTTTATATGGGTGCTGTTGATACGGGAGCCCCCCTTAGTGTTCCCGTTGGTGAAACTACTCTTGGACGAATATCCAACGTCCTCGGCGAACCCGTAGATAATTTGGGTCCTGT-----ACGAAGTAGTACGACATTTCCAATTCACAGGTCCGCCCCGGCATTTACCCAGCTGGATACTAAATTATCAATTTTTGAAACGGGTATAAAAGTTGTGGATCTCTTGGCTCCGTATCGGAGAGGCGGAAAAATTGGGTTATTTGGTGGGGCTGGAGTTGGAAAGACGGTTCTTATTACGGAATCAATCAATAACATTGCGAAAGCTCATGGAGGTGTATCCGTATCTGGCGGGGTAGGAGAACGTACACGTGAAGGTAATGACCTTTACATGGAAATGAAAGAATCAAAAGTTATTAATGAGCAAAATATTTCCGAGTCAAAGGTGGCTCTGGTTTATGGTCAGATGAATGAACCACCGGGAGCTCGTATGAGAGTTGGCTCAACTGCTCCAACAATGGCGGAATACTTTCGAGATGTTAACAAGCAAGATGTACTCCTATTTATTGACAACATTTTTCGCTTCGTCCAGGCGGGATCGGAGGTTTCGGCATTGCTGGGTAGGATGCCTTCCGCG-----GTGGGTTATCAACCGACCCTTGGTACAGAAATGGGATCATTGCAGGAAAGAATTACTTCCAC-----CAAGGAGGGATCAACAACTTCCATCCAAGCTGTTTACGTACCTGCCGATGATTTGACTGACCCGGCCCCCGCCACGACATCTGCACACCTAGACGCTACTACCGCGCTTTCAAGGGGATTAGCAGCGAAGGGTATTTATCCAGCCGTAGACCCTCTGGATTCGACCTCCACTATGTTACAGCCTCGGATTGTGGGTGAGGAGCATTATGACACGGCACAGGGAGTTAAGCAGACTTCGCAACGTTACAAGGAACTTCAAGATATTATAGCTATTCTCGGGCTAGACGAGTTATCCGAAGAAGATCGCCTGACGGTAGCTAGGGCTCGAAAAATAGAACGTTTCCTATCGCAACCTTTTTTCGTGGCAGAAGTTTTCACCGGCTCCCCGGGTAAATACGTCAGTTCATCAGAAACCATTAAGGGATTTCAAATGATTCTTCCTGGAGAGTTGGATAATCTCCCTGAACAAGCTTTTTACTTAGTTGGCAA-TATCGACGAAGCCACTGCAAAAGCTGCGTCTTTACA-AGCGGAGGTTACACCCCCGAATACAAGACCAAAGATACCGATATCTTAGCGGCCTTCCGCATGACTCCACAACCCGGGGTACCGGCTGAGGAAGCCGGAGCTGCGGTAGCTGCGGAATCCTCCACAGGTACGTGGACCACTGTATGGACAGATGGGTTGACCAATCTCGACCGTTACAAGGGCCGATGCTACGACATTGAACCCGTCGCTGGAGAAGAAAACCAGTATATTGCATATGTAGCTTATCCTTTGGATCTATTTGAAGAAGGTTCTGTCACCAACTTGTTCACTTCCATTGTAGGTAATGTTTTCGGATTTAAGGCTCTACGCGCCCTACGCTTAGAAGATCTTCGAATCCCTCCTGCCTATTCTAAAACTTTCATTGGACCGCCTCATGGTATTCAAGTCGAAAGGGATAAACTGAACAAATATGGACGTCCCTTATTGGGATGTACAATCAAGCCAAAATTAGGTCTGTCTGCTAAAAATTATGGTAGGGCCGTCTATGAATGCCTTCGTGGTGGACTTGATTTTACAAAAGATGATGAAAATGTAAATTCCCAGCCATTCATGCGTTGGAGAGATCGCTTCTTATTCGTAGCAGAAGCTCTTTTCAAATCCCAGGCTGAAACGGGCGAAATCAAAGGGCATTACTTAAATGCTACTGCAGGTACGTGTGAAGAGATGTTGAAGAGAGCTGTTTTTGCTAGAGAGTTGGGTGCACCAATAGTCATGCATGACTACTTGACCGGAGGGTTTACCGCAAATACCAGCTTAGCTTTTCACTGCCGAGACAATGGACTGCTTCTTCATATCCACCGTGCAATGCATGCTGTTATCGATAGACAACGAAATCACGGTATACATTTTCGCGTATTGGCCAAAGCATTACGCATGTCCGGTGGAGATCATATACACGCCGGAACTGTAGTAGGCAAACTAGAAGGTGAACGAGAAGTCACTTTGGGTTTCGTCGATTTACTTCGCGACGATTATATTGAAAAAGATCGTAGCCGCGGTATCTATTTCACGCAAGATTGGGTATCTATGCCGGGTGTACTCCCCGTAGCTTCGGGGGGTATCCACGTTTGGCACATGCCCGCCCTAACCGAAATCTTTGGGGACGACTCTGTTTTACAGTTCGGTGGAGGAACCTTGGGACATCCTTGGGGAAACGCACCCGGTGCGGTAGCCAACCGAGTCGCGTTGGAAGCT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? ; END; BEGIN SETS; CHARSET rbcL (CHARACTERS = Desmophlebiaceae_and_Desmophlebium) = 2914-4119; CHARSET rps4 (CHARACTERS = Desmophlebiaceae_and_Desmophlebium) = 4120-4534; CHARSET trnL (CHARACTERS = Desmophlebiaceae_and_Desmophlebium) = 4535-5489; CHARSET atpA (CHARACTERS = Desmophlebiaceae_and_Desmophlebium) = 1-1679; CHARSET atpB (CHARACTERS = Desmophlebiaceae_and_Desmophlebium) = 1680-2913; END; BEGIN TREES; TITLE Desmophlebiaceae_and_Desmophlebium_Comb5; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Anisocampium_cumingianum_Chensn, 2 Anisocampium_niponicum, 3 Asplenium_abscissum_Jimenez2503, 4 Asplenium_angustum_Boudrie3254, 5 Asplenium_cordatum_unknownCV817, 6 Asplenium_feei_Lemieux2272, 7 Asplenium_juglandifolium_Schneidersn, 8 Asplenium_nidus_FischerT9, 9 Asplenium_phyllitidis_Schneidersn, 10 Asplenium_salicifolium_Boudrie3248, 11 Asplenium_scolopendrium_Christenhusz3867, 12 Asplenium_serratum_VianeRV10607, 13 Asplenium_theciferum_Schuettpelz258, 14 'Athyrium filix-femina Larsson7', 15 Athyrium_otophorum_Smithsn, 16 Athyrium_yokoscense_Katosn, 17 Blechnum_brasiliense_Christenhusz4968, 18 Blechnum_orientale_Zhang2565, 19 Cornopteris_banahaoensis_uknown761633, 20 'Cornopteris decurrenti-alata Schuettpelz1215A', 21 Cystopteris_diaphana_Sylvestre2198, 22 Cystopteris_fragilis_Larsson21, 23 Deparia_lancea_Schuettpelz298, 24 Deparia_petersenii_Damasceno2, 25 Deparia_petersenii_Katosn, 26 Diplaziopsis_brunoniana_SGLUBN11PYU, 27 Diplaziopsis_cavaleriana_SGLUCQ1PYU, 28 Diplazium_acanthopus_Cicuzza806, 29 'Diplazium accedens YatskievychMBG2001-1125', 30 Diplazium_alatum_Wei259, 31 Diplazium_amamianum_XP333, 32 Diplazium_ambiguum_Mynssen1338, 33 Diplazium_asperum_Zhang545, 34 Diplazium_australe_Parris1, 35 Diplazium_balliviani_Weigelt9232, 36 Diplazium_bantamense_Cicuzza455, 37 Diplazium_bellum_Wei206, 38 Diplazium_bicolor_Kessler13009, 39 Diplazium_bombonasae_Moran7493, 40 Diplazium_celtidifolium_Christenhuzs4934, 41 Diplazium_centripetale_Christenhusz4236, 42 Diplazium_conterminum_Wei56, 43 Diplazium_cordifolium_Karger1516, 44 Diplazium_crassiusculum_Wei66, 45 Diplazium_cristatum_Weigelt90474, 46 Diplazium_donianum_Zhang5562, 47 Diplazium_giganteum_Li12, 48 Diplazium_hirtipes_Zhang4454, 49 Diplazium_lechleri_Mynssen1170, 50 Diplazium_lechleri_Tuomisto6170, 51 Diplazium_legalloi_Christenhusz4063, 52 Diplazium_leptocarpon_Mynssen1325, 53 Diplazium_leptocarpon_Mynssen960, 54 Diplazium_lindbergii_Kessler12992, 55 Diplazium_lindbergii_Mynssen1266, 56 Diplazium_lonchophyllum_Lyonack3140, 57 Diplazium_longifolium_Zhang6301, 58 Diplazium_macrodictyon_Moran6756, 59 Diplazium_macrophyllum_Weigelt90229, 60 Diplazium_malaccense_Cicuzza168, 61 Diplazium_mettenianum_Wei70, 62 Diplazium_muricatum_Wei197, 63 Diplazium_mutilum_Mynssen952, 64 Diplazium_plantaginifolium_Moran339, 65 Diplazium_prominulum_Boyle5703, 66 Diplazium_pullingeri_Zhang2826, 67 Diplazium_roemerianum_Mynssen955, 68 Diplazium_rostratum_Mynssen1288, 69 Diplazium_sanderi_Smith2848, 70 Diplazium_sibiricum_Wei176, 71 Diplazium_striatum_Kessler13350, 72 Diplazium_subserratum_KuoChiou15146, 73 Diplazium_subspectabile_Li1209, 74 Gymnocarpium_oyamense_Nakatosn, 75 Gymnocarpium_remotipinnatum_Yatskievych, 76 Hemidictyum_marginatum_Christenhusz2476, 77 Hemidictyum_marginatum_Mynssen1397, 78 Homalosorus_pycnocarpos_Cranfillsn, 79 Hymenasplenium_cheilosorum_Schaefer55, 80 Hymenasplenium_triquetrum_Sylvestre2208, 81 Hymenasplenium_unilaterale_Ranker2072, 82 Matteuccia_struthiopteris_Henry96872, 83 Onoclea_sensibilis_Schuettpelz353, 84 Onoclea_sensibilis_Zhang3791, 85 Pentarhizidium_intermedium_3394PE, 86 Rhachidosorus_consimilis_LiLUJ21, 87 Rhachidosorus_mesosorus_Matsumotosn, 88 Thelypteris_dentata_Schuettpelz607, 89 Thelypteris_palustris_Larsson16, 90 Woodsia_mollis_Larsson103, 91 Woodsia_plummerae_Schuettpelz1235A, 92 Woodsia_polystichoides_LiLUFJS5, 93 Woodwardia_prolifera_LiLUWY17, 94 Woodwardia_unigemmata_Schuettpelz; TREE con_50_majrule = [&R] ; END;