#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 19, 2024; 10:03 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Borrone J., Meerow A., Kuhn D., Whitlock B., & Schnell R. 2007. The potential of the WRKY gene family for phylogenetic reconstruction: an example from the Malvaceae. Molecular Phylogenetics and Evolution, null. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1838] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=23; TAXLABELS Guazuma_ulmifolia Herrania_albiflora Herrania_cuatrecasana Herrania_kanukuensis Herrania_nitida Herrania_nycterodendron Herrania_purpurea Herrania_umbraticola Theobroma_angustifolium_1 Theobroma_angustifolium_2 Theobroma_bicolor Theobroma_cacao_1 Theobroma_cacao_2 Theobroma_cacao_3 Theobroma_chocoense Theobroma_gileri Theobroma_grandiflorum Theobroma_mammosum Theobroma_microcarpum_1 Theobroma_microcarpum_2 Theobroma_similarum Theobroma_speciosum Theobroma_velutinum ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa2; DIMENSIONS NTAX=23; TAXLABELS Guazuma_ulmifolia Herrania_albiflora Herrania_cuatrecasana Herrania_kanukuensis Herrania_nitida Herrania_nycterodendron Herrania_purpurea1 Herrania_umbraticola Theobroma_angustifolium_1 Theobroma_angustifolium_2 Theobroma_bicolor Theobroma_cacao_1 Theobroma_cacao_2 Theobroma_cacao_3 Theobroma_chocoense Theobroma_gileri Theobroma_grandiflorum Theobroma_mammosum Theobroma_microcarpum_1 Theobroma_microcarpum_2 Theobroma_similarum Theobroma_speciosum Theobroma_velutinum ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M1963] TITLE 'WRKY 12-13-14'; LINK TAXA = Taxa2; DIMENSIONS NCHAR=2188; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Herrania_kanukuensis 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Herrania_purpurea1 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Herrania_umbraticola 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Theobroma_speciosum 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Herrania_albiflora 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Theobroma_bicolor 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Theobroma_speciosum 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Theobroma_velutinum 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Herrania_cuatrecasana, 22 Herrania_albiflora, 23 Guazuma_ulmifolia; TREE Fig._2 = [&R] (23,(((22,(17,16))sect._Herrania,((21,19),20,18)sect._Subcymbicalyx)Herrania,(((((15,14),6),(9,3)),7)sect._Glossopetalum_except_T._mammosum_,(((13,(2,1)sect._Oreanthes),(8,(5,4))sect._Telematocarpus),(12,11,10)sect._Theobroma))Theobroma)); END; BEGIN TREES; TITLE Tb8486; LINK TAXA = Taxa2; TRANSLATE 1 Theobroma_velutinum, 2 Theobroma_speciosum, 3 Theobroma_similarum, 4 Theobroma_microcarpum_2, 5 Theobroma_microcarpum_1, 6 Theobroma_mammosum, 7 Theobroma_grandiflorum, 8 Theobroma_gileri, 9 Theobroma_chocoense, 10 Theobroma_cacao_3, 11 Theobroma_cacao_2, 12 Theobroma_cacao_1, 13 Theobroma_bicolor, 14 Theobroma_angustifolium_2, 15 Theobroma_angustifolium_1, 16 Herrania_umbraticola, 17 Herrania_purpurea1, 18 Herrania_nycterodendron, 19 Herrania_nitida, 20 Herrania_kanukuensis, 21 Herrania_cuatrecasana, 22 Herrania_albiflora, 23 Guazuma_ulmifolia; TREE Fig._1 = [&R] 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