#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 25, 2024; 15:46 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Theriot E.C., Ashworth M., Nakov T., Ruck E.C., & Jansen R.K. 2015. Dissecting signal and noise in diatom chloroplast protein encoding genes with phylogenetic information profiling. Molecular Phylogenetics and Evolution, 89: 28-36. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S18390] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=208; TAXLABELS Acanthoceras_zachariasii_HK250 Achnanthes_coarctata_HK079 Achnanthes_sp._HK303 Achnanthes_sp._HK311 Actinocyclus_sp_FL_HK345 Actinocyclus_sp_GU52O_HK347 Actinocyclus_sp_Panama_HK262 Actinocyclus_subtilis_HK168 Actinocyclus_tinydrum_CA_HK346 Actinoptychus_sp_HK050 Actinoptychus_undulatus_HK261 Amphipentas_pentacrius_HK289 Amphipleura_pellucida_HK287 Amphitetras_antediluviana_HK223 Amphora_coffeaeformis_HK089 Araphid_ribbon_FL_HK315 Arcocellulus_mammifer_HK044 Ardissonea_formosa_HK209 Ardissonea_fulgens_HK305 Ardissonea_fulgens_v_gigantea_HK167 Asterionella_formosa_HK144 Asterionellopsis_glacialis_HK107 Asterionellopsis_socialis_HK181 Attheya_longicornis_HK317 Attheya_septentrionalis_HK112 Aualcodiscus_oreganus_HK348 Aulacodiscus_orientalis_HK208 Aulacoseira_granulata_HK094 Bacillaria_paxillifer_HK130 Bellerochea_horologicalis_HK235 Bellerochea_malleus_HK265 Berkeleya_rutilans_HK154 Biddulphia_alternans_HK292 Biddulphia_biddulphiana_FL_HK328 Biddulphia_biddulphiana_HK271 Biddulphia_sculpta_HK252 Biddulphia_tridens_FL_HK327 Biddulphia_tridens_HK239 Biddulphiopsis_membranacea_HK166 Bleakeleya_notata_HK247 Bolidomonas_pacifica_HK015 Brockmanniella_brockmannii_HK040 Caloneis_lewisii_HK060 Campylosira_cymbelliformis_HK122 Centronella_reicheltii_HK150 Cerataulina_pelagica_HK230 Cerataulina_pelagica_HK232 Cerataulus_smithii_NC_HK331 Cerataulus_smithii_TX_HK224 Chaetoceros_muelleri_HK028 Chaetoceros_peruvianus_HK202 Chrysanthemodiscus_floriatus_HK171 Climaconeis_riddleae_HK178 Cocconeis_placentula_HK077 Cocconeis_sp._HK312 Corethron_hystrix_FL_HK241 Corethron_hystrix_HK004 Corethron_sp_OR_HKXXX Coscinodiscus_concinnus_HK267 Coscinodiscus_radiatus_HK031 Coscinodiscus_sp_FLconcave_HK298 Coscinodiscus_sp_Panama_HK263 Coscinodiscus_wailesii_HK229 Craticula_cuspidata_HK061 Ctenophora_pulchella_HK105 Cyclophora_castracanei_HK243 Cyclophora_tabellariformis_HK306 Cyclophora_tenuis_HK216 Cyclophora_tenuis_HK307 Cyclophora_tenuis_HK308 Cyclostephanos_dubius_HK051 Cyclotella_meneghiniana_HK052 Cyclotella_sp_HK126 Cylindrotheca_closterium_HK180 Cymatopleura_elliptica_HK215 Cymatosira_lorenziana_HK283 Dactylosolien_blavyanus_HK301 Delphineis_sp_HK133 Denticula_kuetzingii_HK104 Detonula_confervacea_HK111 Diatoma_elongatum_HK119 Diatoma_tenue_HK078 Dimeregramma_dubium_Guam_HK325 Dimeregramma_sp_TX_HK288 Diploneis_subovalis_HK084 Ditylum_brightwelli_HK285 Ditylum_sol_HK240 Ellerbeckia_arenaria_B12 Endictya_oceanica_HK259 Entomoneis_sp._HK135 Epipsammic_chain_FL_HK316 Eucampia_sp_HK260 Eucampia_zodiacus_TX_HK320 Eunotia_curvata_HK086 Eunotia_glacialis_HK069 Eunotia_pectinalis_HK153 Eunotogramma_sp_HK294 Extubocellulus_cribriger_HK046 Fallacia_monoculata_HK082 Fallacia_pygmaea_HK093 Florella_pascuensis_HK175 Fragilariforma_virescens_HK132 Gomphonema_affine_HK098 Gomphonema_parvulum_HK081 Grammatophora_oceanica_HK147 Guinardia_delicatula_HK205 Guinardia_flaccida_HK272 Gyrosigma_acuminatum_HK085 Hemiaulus_sinensis_HK123 Hyalodiscus_sp_CA_HK344 Hyalodiscus_stelliger_HK042 Hyalosira_interrupta_HK248 Koernerella_recticostata_HK242 Lampriscus_orbiculatus_HK125 Lampriscus_shadboltianus_HK264 Lampriscus_shadboltianus_v._crenulata_HK257 Lemnicola_hungarica_HK129 Leptocylindrus_danicus_TX_HK238 Leptocylindrus_minimus_HK355 Leyanella_arenaria_HK045 Licmophora_paradoxa_HK106 Licmophora_remulus_HK302 Lithodesmioides_polymorpha_HK211 Lithodesmium_intricatum_CA_HK231 Lithodesmium_intricatum_HI_HK253 Lithodesmium_undulatum_HK029 Mastodiscus_radiatus_HK249 Mastogloia_sp_HK136 Melosira_nummuloides_HK041 Melosira_varians_HK266 Meuneira_membranacea_HK313 Minidiscus_trioculatus_HK036 Minutocellus_polymorphus_HK043 Nanofrustulum_cf_shiloi_HK056 Navicula_cryptocephala_HK090 Neidium_affine_HK064 Neidium_bisulcatum_HK076 Neidium_productum_HK063 Nitzschia_filiformis_HK073 Odontella_aurita_CanIsl_HK333 Odontella_aurita_Guam_HK334 Odontella_aurita_HK203 Odontella_longicruris_HK226 Odontella_longicruris_v_hyalina_HK284 Odontella_rhomboides_HK282 Odontella_rostrata_HK225 Opephora_sp_HK296 Palmerina_hardmaniana_HK233 Papiliocellulus_simplex_HK134 Paralia_sulcata_HK048 Perideraion_montgomeryii_HK246 Phaeodactylum_tricornutum_HK011 Pinnularia_brebissonii_HK092 Pinnularia_terminata_HK088 Placoneis_elginensis_HK096 Plagiogramma_sp_WA_HK324 Plagiogramma_staurophorum_HK212 Plagiogrammopsis_van_heurckii_HK293 Planktoniella_sol_HK035 Pleurosira_laevis_HK068 Podocystis_spathulatum_HK217 Porosira_glacialis_HK115 Proboscia_sp_FL_HK300 Proboscia_sp_TX_HK236 Psammoneis_japonica_HK299 Pseudosolenia_calcaravis_HK245 Rhabdonema_arcuatum_HK304 Rhaphoneis_amphiceros_HK237 Rhizosolenia_formosa_HK354 Rhizosolenia_imbricata_FL_HK244 Rhizosolenia_setigera_HK032 Rhizosolenia_setigera_TX_HK268 Rhizosolenia_shrubsolei_HK221 Roundia_cardiophora_HK219 Scoliopleura_peisonis_HK103 Stauroneis_acuta_HK059 Staurosira_construens_HK071 Staurosirella_pinnata_HK116 Stellarima_microtrias_HK108 Stephanopyxis_turris_HK213 Stictocyclus_stictodiscus_HK269 Striatella_unipunctata_FL_HK318 Striatella_unipunctata_HK177 Surirella_ovata_HK214 Synedra_bacillaris_HK291 Synedra_famelica_HK072 Synedra_ulna_HK075 Synedropsis_cf_recta_HK110 Synedropsis_hyperborea_HK117 Tabellaria_flocculosa_HK065 Tabularia_cf_tabulata_HK109 Terpsinoe_musica_HK273 Tetracyclus_sp._B16 Thalassiosira_pseudonana_HK008 Toxarium_hennedyanum_HK220 Toxarium_undulatum_HK210 Triceratium_bicorne_HK222 Triceratium_dictyotum_HK281 'Triceratium dubium CA_HK254' Triceratium_dubium_CanIsl_HK342 Triceratium_sp_HK047 Trieres_mobiliensis_HK204 Trieres_mobiliensis_HK227 Trieres_regia_HK322 Trieres_sinensis_HK037 Trigonium_formosum_HK258 Tryblionella_apiculata_HK087 Urosolenia_eriensis_HK054 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M37051] TITLE 'Diatoms atpB, psaA, psaB, psbA, psbC and rbcL'; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=9349; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1990 2000 2010 2020 2030 2040 2050 2060 2070 2080 2090 2100 2110 2120 2130 2140 2150 2160 2170 2180 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Amphipleura_pellucida_HK287 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Ardissonea_fulgens_HK305 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Attheya_septentrionalis_HK112 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Aulacoseira_granulata_HK094 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Berkeleya_rutilans_HK154 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Biddulphia_tridens_FL_HK327 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Biddulphia_tridens_HK239 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Cerataulus_smithii_NC_HK331 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Cyclophora_tabellariformis_HK306 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Cyclophora_tenuis_HK216 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Endictya_oceanica_HK259 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Eunotia_curvata_HK086 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Fallacia_pygmaea_HK093 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Grammatophora_oceanica_HK147 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Guinardia_delicatula_HK205 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Guinardia_flaccida_HK272 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Lampriscus_shadboltianus_HK264 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Lemnicola_hungarica_HK129 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Licmophora_remulus_HK302 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Odontella_longicruris_v_hyalina_HK284 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Phaeodactylum_tricornutum_HK011 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Podocystis_spathulatum_HK217 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Porosira_glacialis_HK115 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Psammoneis_japonica_HK299 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Rhizosolenia_setigera_HK032 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Scoliopleura_peisonis_HK103 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Stictocyclus_stictodiscus_HK269 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Striatella_unipunctata_FL_HK318 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Tetracyclus_sp._B16 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Toxarium_undulatum_HK210 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Triceratium_bicorne_HK222 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Triceratium_dictyotum_HK281 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'Triceratium dubium CA_HK254' 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Triceratium_dubium_CanIsl_HK342 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Trieres_mobiliensis_HK204 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Trieres_sinensis_HK037 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'Diatoms atpB, psaA, psaB, psbA, psbC and rbcL') = 7473 6942 6945 6948 6951 6954 6957 6960 7476 6963 6966 6969 7479 7482 7485 7488 7491 7494 7497 7500 7503 7506 7509 7512 7515 7518 7521 7524 7527 7530 7533 7536 7539 7542 7545 7548 7551 7554 7557 7560 7563 7566 7569 7572 7575 7578 7581 7584 7587 7590 7593 7596 7599 7602 7605 7608 7611 7614 7617 7620 7623 7626 7629 7632 7635 7638 7641 7644 7647 7650 7653 7656 7659 7662 7665 7668 7671 7674 7677 7680 7683 7686 7689 7692 7695 7698 7701 7704 7707 7710 7713 7716 7719 7722 7725 7728 7731 7734 7737 7740 7743 7746 7749 7752 7755 7758 7761 7764 7767 7770 7773 7776 7779 7782 6972 6975 6978 6981 6984 6987 6990 6993 6996 6999 7002 7005 7008 7011 7014 7017 7020 7023 7026 7029 7032 7035 7038 7041 7044 7047 7050 7053 7056 7059 7062 7065 7068 7071 7074 7077 7080 7083 7086 7089 7092 7095 7098 7101 7104 7785 7107 7110 7788 7113 7791 7116 7119 7794 7122 7125 7797 7128 7800 7131 7134 7803 7137 7140 7806 7143 7809 7146 7149 7812 7152 7815 7155 7818 7821 7824 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'Diatoms atpB, psaA, psaB, psbA, psbC and rbcL') = 2533 1978 1981 1984 1987 1990 1993 1996 1999 2002 2005 2008 2011 1453 1456 1459 1462 1465 1468 1471 1474 1477 1480 1483 1486 1489 1492 1495 1498 1501 1504 1507 1510 1513 1516 1519 1522 1525 1528 1531 1534 1537 1540 1543 2014 2017 2020 2023 2026 2029 2032 2035 2038 1546 1549 2041 1552 1555 1558 1561 1564 1567 1570 1573 1576 1579 1582 1585 1588 1591 1594 1597 1600 1603 1606 1609 1612 1615 1618 1621 1624 1627 1630 1633 1636 1639 1642 1645 1648 1651 1654 1657 1660 1663 1666 1669 1672 1675 1678 1681 1684 1687 1690 1693 1696 1699 1702 1705 1708 1711 1714 1717 1720 1723 1726 1729 1732 2044 2047 2050 2053 2056 2059 2062 2065 2068 2071 2074 2077 2080 2083 2086 2089 2092 2095 2098 2101 2104 2107 2110 2113 2116 2119 2122 2125 2128 2131 2134 2137 2140 2143 2146 2149 2152 2155 2158 2161 2164 2167 2170 2173 2176 2179 2182 2185 2188 2191 2194 2197 2200 2203 2206 2209 2212 2215 2218 2221 2224 2227 2230 2233 2236 2239 2242 2245 2248 2251 2254 2257 2260 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(CHARACTERS = 'Diatoms atpB, psaA, psaB, psbA, psbC and rbcL') = 1481 1484 1487 1490 1493 1496 1499 1502 1505 1451 1508 1454 1511 1457 1514 1460 1463 1517 1466 1469 1520 1472 1523 1475 1478 1526 1529 1532 1535 1538 1541 1544 1547 1550 2036 1553 1556 2039 1559 2042 2045 1562 2048 2051 1565 2054 2057 1568 2060 2063 1571 2066 1574 2069 2072 1577 2075 1580 2078 2081 1583 2084 1586 2087 2090 1589 2093 2096 1592 2099 1595 2102 2105 1598 2108 1601 2111 2114 1604 2117 1607 2120 2123 2590 2593 1610 2596 2126 2129 2599 1613 2602 2132 2135 2605 1616 2608 2138 2141 2611 1619 2614 2144 2147 2617 1622 2620 2150 2153 2623 2156 1625 2159 2626 2629 2162 2632 2165 1628 2168 2635 2638 2171 1631 2174 2641 2644 2647 2650 2653 2656 2659 2662 2665 2668 2671 2674 2677 2680 2683 2686 2689 2692 2695 2698 2701 2704 2707 2710 2713 2716 2719 2722 2725 2728 2731 2734 2737 2740 2743 2746 2177 2180 2183 2186 2189 2192 2195 2198 2201 2204 2207 2210 2213 2216 2219 2222 2225 2228 2231 2234 2237 2240 2243 2246 2249 2252 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4240 4477 4480 4483 5011 4486 4489 4492 4495 4498 4501 4504 4507 4510 4513 4516 4519 4522 4525 4528 4531 4534 4537 4540 4543 4546 4549 4552 4555 4558 4561 4564 4567 4570 4573 4576 4579 4243 4246 4249 4252 4255 4258 4261 4264 4267 4270 4273 4276 4279 4282 4285 4288 4291 4294 4297 4300 4303 4306 4309 4312 4315 4318 4321 4324 4327 4330 4333 4336 4339 4342 4345 4348 4351 4354 4357 4360 4363 4366 4369 4372 4375 4378 4381 4384 4387 4582 4585 4588 4591 4594 4597 4600 4603 4606 4609 4612 4615 4618 4621 4624 4627 4630 4633 4636 4639 4642 4645 4390 4393 4396 4399 4402 4405 4408 4648 4651 5014 4654 4657 4411 4414 4417 4660 5017 4663 4420 4423 4666 4669 4426 5020 4429 4672 4675 4432 5023 4435 4678 4438 5026 4441 4681 5029 4684 4444 4447 5032 4450 4687 5035 4690 4453 4693 5038 4696 5041 4699 4702 5044 4705 5047 4708 4711 5050 5053 5056 4714 5059 4717 5062 4720 4723 5065 4726 5566 5569 4729 5068 4732 5572 5575 5578 5581 4735 4738 4741 4744 5584 4747 5587 5071 5590 4750 4753 5593 5074 5596 5599 4756 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5539 5542 5545 5548 5551 5554 5557 5560 5563; END; BEGIN TREES; TITLE 'Diatoms atpB, psaA, psaB, psbA, psbC and rbcL'; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Acanthoceras_zachariasii_HK250, 2 Achnanthes_coarctata_HK079, 3 Achnanthes_sp._HK303, 4 Achnanthes_sp._HK311, 5 Actinocyclus_sp_FL_HK345, 6 Actinocyclus_sp_GU52O_HK347, 7 Actinocyclus_sp_Panama_HK262, 8 Actinocyclus_subtilis_HK168, 9 Actinocyclus_tinydrum_CA_HK346, 10 Actinoptychus_sp_HK050, 11 Actinoptychus_undulatus_HK261, 12 Amphipentas_pentacrius_HK289, 13 Amphipleura_pellucida_HK287, 14 Amphitetras_antediluviana_HK223, 15 Amphora_coffeaeformis_HK089, 16 Araphid_ribbon_FL_HK315, 17 Arcocellulus_mammifer_HK044, 18 Ardissonea_formosa_HK209, 19 Ardissonea_fulgens_HK305, 20 Ardissonea_fulgens_v_gigantea_HK167, 21 Asterionella_formosa_HK144, 22 Asterionellopsis_glacialis_HK107, 23 Asterionellopsis_socialis_HK181, 24 Attheya_longicornis_HK317, 25 Attheya_septentrionalis_HK112, 26 Aualcodiscus_oreganus_HK348, 27 Aulacodiscus_orientalis_HK208, 28 Aulacoseira_granulata_HK094, 29 Bacillaria_paxillifer_HK130, 30 Bellerochea_horologicalis_HK235, 31 Bellerochea_malleus_HK265, 32 Berkeleya_rutilans_HK154, 33 Biddulphia_alternans_HK292, 34 Biddulphia_biddulphiana_FL_HK328, 35 Biddulphia_biddulphiana_HK271, 36 Biddulphia_sculpta_HK252, 37 Biddulphia_tridens_FL_HK327, 38 Biddulphia_tridens_HK239, 39 Biddulphiopsis_membranacea_HK166, 40 Bleakeleya_notata_HK247, 41 Bolidomonas_pacifica_HK015, 42 Brockmanniella_brockmannii_HK040, 43 Caloneis_lewisii_HK060, 44 Campylosira_cymbelliformis_HK122, 45 Centronella_reicheltii_HK150, 46 Cerataulina_pelagica_HK230, 47 Cerataulina_pelagica_HK232, 48 Cerataulus_smithii_NC_HK331, 49 Cerataulus_smithii_TX_HK224, 50 Chaetoceros_muelleri_HK028, 51 Chaetoceros_peruvianus_HK202, 52 Chrysanthemodiscus_floriatus_HK171, 53 Climaconeis_riddleae_HK178, 54 Cocconeis_placentula_HK077, 55 Cocconeis_sp._HK312, 56 Corethron_hystrix_FL_HK241, 57 Corethron_hystrix_HK004, 58 Corethron_sp_OR_HKXXX, 59 Coscinodiscus_concinnus_HK267, 60 Coscinodiscus_radiatus_HK031, 61 Coscinodiscus_sp_FLconcave_HK298, 62 Coscinodiscus_sp_Panama_HK263, 63 Coscinodiscus_wailesii_HK229, 64 Craticula_cuspidata_HK061, 65 Ctenophora_pulchella_HK105, 66 Cyclophora_castracanei_HK243, 67 Cyclophora_tabellariformis_HK306, 68 Cyclophora_tenuis_HK216, 69 Cyclophora_tenuis_HK307, 70 Cyclophora_tenuis_HK308, 71 Cyclostephanos_dubius_HK051, 72 Cyclotella_meneghiniana_HK052, 73 Cyclotella_sp_HK126, 74 Cylindrotheca_closterium_HK180, 75 Cymatopleura_elliptica_HK215, 76 Cymatosira_lorenziana_HK283, 77 Dactylosolien_blavyanus_HK301, 78 Delphineis_sp_HK133, 79 Denticula_kuetzingii_HK104, 80 Detonula_confervacea_HK111, 81 Diatoma_elongatum_HK119, 82 Diatoma_tenue_HK078, 83 Dimeregramma_dubium_Guam_HK325, 84 Dimeregramma_sp_TX_HK288, 85 Diploneis_subovalis_HK084, 86 Ditylum_brightwelli_HK285, 87 Ditylum_sol_HK240, 88 Ellerbeckia_arenaria_B12, 89 Endictya_oceanica_HK259, 90 Epipsammic_chain_FL_HK316, 91 Eucampia_sp_HK260, 92 Eucampia_zodiacus_TX_HK320, 93 Eunotia_curvata_HK086, 94 Eunotia_glacialis_HK069, 95 Eunotia_pectinalis_HK153, 96 Eunotogramma_sp_HK294, 97 Extubocellulus_cribriger_HK046, 98 Fallacia_monoculata_HK082, 99 Fallacia_pygmaea_HK093, 100 Florella_pascuensis_HK175, 101 Fragilariforma_virescens_HK132, 102 Gomphonema_affine_HK098, 103 Gomphonema_parvulum_HK081, 104 Grammatophora_oceanica_HK147, 105 Guinardia_delicatula_HK205, 106 Guinardia_flaccida_HK272, 107 Gyrosigma_acuminatum_HK085, 108 Hemiaulus_sinensis_HK123, 109 Hyalodiscus_sp_CA_HK344, 110 Hyalodiscus_stelliger_HK042, 111 Hyalosira_interrupta_HK248, 112 Koernerella_recticostata_HK242, 113 Lampriscus_orbiculatus_HK125, 114 Lampriscus_shadboltianus_HK264, 115 Lampriscus_shadboltianus_v._crenulata_HK257, 116 Lemnicola_hungarica_HK129, 117 Leptocylindrus_danicus_TX_HK238, 118 Leptocylindrus_minimus_HK355, 119 Leyanella_arenaria_HK045, 120 Licmophora_paradoxa_HK106, 121 Licmophora_remulus_HK302, 122 Lithodesmioides_polymorpha_HK211, 123 Lithodesmium_intricatum_CA_HK231, 124 Lithodesmium_intricatum_HI_HK253, 125 Lithodesmium_undulatum_HK029, 126 Entomoneis_sp._HK135, 127 Mastodiscus_radiatus_HK249, 128 Mastogloia_sp_HK136, 129 Melosira_nummuloides_HK041, 130 Melosira_varians_HK266, 131 Meuneira_membranacea_HK313, 132 Minidiscus_trioculatus_HK036, 133 Minutocellus_polymorphus_HK043, 134 Nanofrustulum_cf_shiloi_HK056, 135 Navicula_cryptocephala_HK090, 136 Neidium_affine_HK064, 137 Neidium_bisulcatum_HK076, 138 Neidium_productum_HK063, 139 Nitzschia_filiformis_HK073, 140 Odontella_aurita_CanIsl_HK333, 141 Odontella_aurita_Guam_HK334, 142 Odontella_aurita_HK203, 143 Odontella_longicruris_HK226, 144 Odontella_longicruris_v_hyalina_HK284, 145 Odontella_rhomboides_HK282, 146 Odontella_rostrata_HK225, 147 Opephora_sp_HK296, 148 Palmerina_hardmaniana_HK233, 149 Papiliocellulus_simplex_HK134, 150 Paralia_sulcata_HK048, 151 Perideraion_montgomeryii_HK246, 152 Phaeodactylum_tricornutum_HK011, 153 Pinnularia_brebissonii_HK092, 154 Pinnularia_terminata_HK088, 155 Placoneis_elginensis_HK096, 156 Plagiogramma_sp_WA_HK324, 157 Plagiogramma_staurophorum_HK212, 158 Plagiogrammopsis_van_heurckii_HK293, 159 Planktoniella_sol_HK035, 160 Pleurosira_laevis_HK068, 161 Podocystis_spathulatum_HK217, 162 Porosira_glacialis_HK115, 163 Proboscia_sp_FL_HK300, 164 Proboscia_sp_TX_HK236, 165 Psammoneis_japonica_HK299, 166 Pseudosolenia_calcaravis_HK245, 167 Rhabdonema_arcuatum_HK304, 168 Rhaphoneis_amphiceros_HK237, 169 Rhizosolenia_formosa_HK354, 170 Rhizosolenia_imbricata_FL_HK244, 171 Rhizosolenia_setigera_HK032, 172 Rhizosolenia_setigera_TX_HK268, 173 Rhizosolenia_shrubsolei_HK221, 174 Roundia_cardiophora_HK219, 175 Scoliopleura_peisonis_HK103, 176 Stauroneis_acuta_HK059, 177 Staurosira_construens_HK071, 178 Staurosirella_pinnata_HK116, 179 Stellarima_microtrias_HK108, 180 Stephanopyxis_turris_HK213, 181 Stictocyclus_stictodiscus_HK269, 182 Striatella_unipunctata_FL_HK318, 183 Striatella_unipunctata_HK177, 184 Surirella_ovata_HK214, 185 Synedra_bacillaris_HK291, 186 Synedra_famelica_HK072, 187 Synedra_ulna_HK075, 188 Synedropsis_cf_recta_HK110, 189 Synedropsis_hyperborea_HK117, 190 Tabellaria_flocculosa_HK065, 191 Tabularia_cf_tabulata_HK109, 192 Terpsinoe_musica_HK273, 193 Tetracyclus_sp._B16, 194 Thalassiosira_pseudonana_HK008, 195 Toxarium_hennedyanum_HK220, 196 Toxarium_undulatum_HK210, 197 Triceratium_bicorne_HK222, 198 Triceratium_dictyotum_HK281, 199 'Triceratium dubium CA_HK254', 200 Triceratium_dubium_CanIsl_HK342, 201 Triceratium_sp_HK047, 202 Trieres_mobiliensis_HK204, 203 Trieres_mobiliensis_HK227, 204 Trieres_regia_HK322, 205 Trieres_sinensis_HK037, 206 Trigonium_formosum_HK258, 207 Tryblionella_apiculata_HK087, 208 Urosolenia_eriensis_HK054; TREE tree_1 = [&R] 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