#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 24, 2024; 21:58 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Hou Z., Fu J., & Li S. 2007. A molecular phylogeny of the genus Gammarus (Crustacea: Amphipoda) based on mitochondrial and nuclear gene sequences. Molecular Phylogenetics and Evolution, null. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1846] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=66; TAXLABELS Crangonyx_pseudogracilis Dikerogammarus_villosus_GM Gammarus_abstrusus Gammarus_accretus Gammarus_bousfieldi Gammarus_brevipodus Gammarus_comosus Gammarus_craspedotrichus Gammarus_crinicornis Gammarus_curvativus Gammarus_decorosus Gammarus_electrus Gammarus_elevatus Gammarus_emeiensis Gammarus_fasciatus_MN Gammarus_fossarum_PO Gammarus_glabratus Gammarus_gonggaensis_BX1 Gammarus_gonggaensis_BX2 Gammarus_gregoryi Gammarus_kangdingensis Gammarus_koreanus Gammarus_lacustris_BJ1 Gammarus_lacustris_NA Gammarus_lacustris_QH1 Gammarus_lichuanensis_HB1 Gammarus_lichuanensis_HB2 Gammarus_liui Gammarus_locusta_CA Gammarus_madidus Gammarus_martensi Gammarus_minus_IL Gammarus_montanus Gammarus_nekkensis_BJ1 Gammarus_nekkensis_BJ2 Gammarus_nekkensis_HB1 Gammarus_nipponensis Gammarus_pengi Gammarus_pexus Gammarus_pseudolimnaeus_IL Gammarus_pulex_NL Gammarus_qiani Gammarus_riparius Gammarus_roeseli Gammarus_shanxiensis Gammarus_shenmuensis Gammarus_sichuanensis Gammarus_sinuolatus Gammarus_sp1 Gammarus_sp2 Gammarus_sp3 Gammarus_sp4 Gammarus_sp5 Gammarus_sp6 Gammarus_stalagmiticus Gammarus_takesensis Gammarus_taliensis Gammarus_tastiensis Gammarus_tigrinus Gammarus_translucidus Gammarus_troglophicus_IL 'Jesogammars (Annanogammarus) debilis' 'Jesogammarus (Jesogammarus) hebeiensis' Platorchestia_japonica Sinogammarus_chuanhui_GZ Sinogammarus_chuanhui_SC ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa2; DIMENSIONS NTAX=72; TAXLABELS Crangonyx_pseudogracilis Dikerogammarus_villosus Gammarus_abstrusus Gammarus_accretus Gammarus_aequicauda Gammarus_annulatus Gammarus_balcanicus Gammarus_bousfieldi Gammarus_comosus Gammarus_craspedotrichus Gammarus_crinicornis Gammarus_curvativus Gammarus_decorosus Gammarus_duebeni_MA Gammarus_electrus Gammarus_emeiensis Gammarus_fasciatus_MN Gammarus_fasciatus_WA Gammarus_fossarum_PO Gammarus_glabratus Gammarus_gonggaensis_BX1 Gammarus_gonggaensis_BX2 Gammarus_gregoryi Gammarus_kangdingensis Gammarus_koreanus Gammarus_lacustris_BJ1 Gammarus_lacustris_BJ2 Gammarus_lacustris_BK Gammarus_lacustris_HV Gammarus_lacustris_NA Gammarus_lacustris_QH1 Gammarus_lacustris_VI Gammarus_lacustris_WA Gammarus_lichuanensis_HB1 Gammarus_lichuanensis_HB2 Gammarus_locusta_CA Gammarus_locusta_FR Gammarus_martensi Gammarus_minus_IL Gammarus_montanus Gammarus_mucronatus Gammarus_nekkensis_BJ1 Gammarus_nekkensis_BJ2 Gammarus_nekkensis_HB1 Gammarus_nipponensis Gammarus_oceanicus Gammarus_pexus Gammarus_pseudolimnaeus_IL Gammarus_pulex_NL Gammarus_qiani Gammarus_riparius Gammarus_roeseli Gammarus_sichuanensis Gammarus_sinuolatus Gammarus_sp1 Gammarus_sp2 Gammarus_sp3 Gammarus_sp4 Gammarus_sp5 Gammarus_sp6 Gammarus_stalagmiticus Gammarus_takesensis Gammarus_taliensis Gammarus_tastiensis Gammarus_tigrinus Gammarus_translucidus Gammarus_troglophicus_IL 'Jesogammarus (Annanogammarus) debilis' 'Jesogammarus (Jesogammarus) hebeiensis' Platorchestia_japonica Sinogammarus_chuanhui_GZ Sinogammarus_chuanhui_SC ; 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TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M1989] TITLE Gammarus_Combine; LINK TAXA = Taxa4; DIMENSIONS NCHAR=5139; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Crangonyx_pseudogracilis 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Dikerogammarus_villosus 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Gammarus_aequicauda 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Gammarus_balcanicus 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Gammarus_bousfieldi 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Gammarus_comosus 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Gammarus_craspedotrichus 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Gammarus_crinicornis 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Gammarus_emeiensis GGGGCCTGAGCCAGAGTAGTCGGCACATCCCTTAGTGTGATTATCCGCTCAGAACTAAGCGCCCCCGGTAATTTGATCGGAGATGACCAGCTATACAATGTTATAGTCACAGCCCATGCTTTTGTTATAATCTTTTTTATGGTAATACCTATCATGATTGGGGGATTTGGTAACTGACTAGTGCCCCTTATACTAGGTAGACCAGACATAGCTTTTCCTCGAATAAACAACATAAGATTTTGACTCCTACCCCCCTCCCTCACTCTCCTCCTCATAAGAGGCATAGTGGAAAGGGGAGTGGGCACAGGTTGAACCGTGTACCCCCCCCTAGCTGGGCCCATGGCCCATAGAGGGGCTGCTGTTGACCTAGCTATTTTCTCTCTTCACTTAGCAGGTGCCTCCTCTATTTTGGGCGCTGTTAATTTCATCTCTACCGTTCTAAACATACGAGCATCCGGGATGTCAATAGACCAAATGCCTCTTTTTGTCTGATCTGTTTTCATTACAGCCATCCTACTACTACTTTCATTGCCCGTTCTTGCAGGAGCCATCACAATACTTCTAACTGACCGAAATCTTAACACCTCATTTTTTGACCCTAGGGGGGGCGGCGACCCAATTCTTTACCAGCACCTATTCTGATTTTTTGGTCACCCTCGAAACAAAGTAGAAAAACCGGAAGGTTTTTCTAGGG-ATGAAAAAA-TTTTCACTTACAATGAAAAATACCTAGT--AGGCATCTTTTTA---CTGCAAGTGGGTGCTATGGTAAAAGAAAAAGTGGGGGTTGTACCTTTTGTATCAGGGGGGCTTAAAAATGTAGTTAGG---GTCTAATCGATTTAAGCGGAGCTTCTTTC----TTAGTCTTTAGTAGAAGTTAAAGAATGAAGTAT--TTAAGAGGTGAAAAATGTTCGACGTTTGTGGTATCTAATTACTTTGTTGA--TAGAAGGGTTAAGCTTTTGTATGTTT-ATGAAAAA----GTGTAGTTA-AGAAAACTAGGCTTTAGATTAGCCAGGCTAATAGGTT-GTTTAAAATAATTTTAAAG---TTGTTATTTGTAGCGTAAATT-TATAAGAGTCGTGCTTGTAAATTTTAATAAATAAAGATAATGAGTCTATTGAACAGT-AGTTGGAGCCTAAAAATGACTCAATAAAGGTTAGAAAGTTTAACAAAAACATTTTTATACGTGTAATTTATGGTACGACCTGCCCGGTGCTTGG-TTAA-CGGCTGCGGTATTTTGACTGTGCTAAGGTAGCATAATCACTTGTTATTTAATTGGTAGCTGGAATGAACGGTTAAACTAACGT-ATTTAGTTTGTTGGGCTAAAT-GGTAAATTAAAGTCAAGGTAAGAATTCTTTGATTT-TTTAGGGGACGATAAGACCCTAGAAGCTTTATAAGGAATTAATC-ATT-GGTGCTGGTTGAGGT---------TTTTTTTTACTGGGGCGGTATAGGTACTTAAACTAGCTTAGTTTTGATA----------------GATCCTT-TGAATAAAGAAAGAACGGGTAAGTTACTCTAGGGATAACAGTGCAATATTTTTGAAGAGATCTTATCGATAAAAGTGTTTGCAACCTCGATGTTGAATTAAG-ATTTCTGCGTGGAGCAGAAGATACGTG--AGAGGGTTTGTTCAACCATATCCCGAAG--GCGGCGTTG-GTGCTTGCTTGTCTTGCGCT-TTCAC--TGCTCTGACGGATGCTTTTATTAGACCAAGCCGCTGAGGACTTGAGAG--GTTTCTCTCC--TGTCTGACTCGTGTAA-TGGTGACTCTGGATAACCAA----CTCTGACAAGCGAACGTACTCCTCTTCTGAGCGAGACGGCGCTGCCACTTTCGAGTGTCTGCCTTATCAGCTATCAACCGTTCGTTATGCGCGACCGATGGCTTTGACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGAGAGGCAGCCTGAGAGACGGCTACC-ACGTCCAAGGACGGCAGCAGGCACGCAAATTACCCAATCCCAGCCAATGGGGGAGGTAGTGACGAAATCTAACGATGCGGGCGCCCTTTCTGGGGCCCCGCAATCGGAATGGGCACTTTCTAAACAACCTGTTGAGAACCTACTGAAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTTCAGCAGCATCTATTAAAGTTGCTGCGG-TTAAAAGGCTCGCAGTTGAATGTCTGTATCGAGCGCAGGTCAGGTGGACGTTGGGGCGTG-GAAGTACGGGCAGCT-GGATGTTCGGAGGGCTTC--GTGCTCAACGGC--TCCTTCGGCTTTTCCACACACCCCCGTCCGTGACAAGCCTCCTCGCTCG--GGTACATAACGGGAATTGGTCAAACGGAG-TGTGGTCGGTGGTCGAGGTGCGTGGCTTC--GGTTGCGCTCTTCTTCTGTC--GGCTGCG-TTAAGCTCCATCGGTT---TCACAGTCACCTTGAGTAAATCAGAGTGCTCAAAGCAGTCGTAGGGGCCTTGCGCCCTGTG-AACAGTCTTGACGGACTGACTTGGTTTTGCATGGCATGTCGGAAGACGACGTCGT------------GTGCTGGCTCAGAGGA--TAAATCAGTG---GTACAA--GC-CAGC-----CTC------GACGTAATGATTAAAAGGGTCGGTCGAGGGCATTGGTATTGCGAGGCGAGAGGTGAAATTCTGTGACCCCCGCAAGGCCTCCTGAAGCGAAAGCGTCTGCCAAGGACGTTTTCATTAATCATGAACGAAAGTTAGAGGATCGAAGGCGATCAGATACCGCCCTAGTTCTAACCCTAAACGATGCCAACCATCAATCCGCGCGTAGCACCCT-TCTTAACGGGCTCGGCGGGCAGCTCCCCACTCACGGGAAACCAGAGCCTCTGGGTTCCGGGGGGAGTCTGGTTGCAAAGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAAGGCACCACCAGGCGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGCCATCTCACC-AGGCCAGCACTCTTGTATGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTCGATTCAGTGGATGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATCTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGACTCTCCCCTGCTAACTAGTCGGTTGGATCTTGATCAGCGG-GTTGCGTGCCGAGT--AACTCTCGC-TGTGCGGGTTGTGCGTAGCT---GGGCCTCACGGTTC--GTTGCGTGC-TCTCGTGTGGTGTTGGAT-GCCTTGGATCACACT--GCACCCCAAGTCC-GCCGCTTATGC--T-ATAACTCTTCTTAGAGGGATTCACGGCACTGAAGCCGTAAGAGACTGAGAGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGCTCTGGGCCGCACGCGCGCTACAATGCCGGGCACAGCAGGTGTTTCTCCTTCTCCGATAGGAGCGGG-TAACCCTCTGAA-AGCCAGTGTTCTT--GCAAGTGCTTCCTCCCTCGTGGAGTT-GCAC-AGAGGCGTGCTTGGG-CCTGGGGCTTGCAATTCTTT-CCCACCAACGAGGAATGCCTAGTAGCGGCGGG-TCACTGAGCCCGCTGTGACTCAGTCCCTGCCCTTTGTACA-CACCGCCCGTCGCTACTACCGATT-GGGTGTACCAGTGAGAGCCTTGGA-CTGGCGTCCGTTGTTACTCGCAAGAAACCTCCCGGGCCCCCCGGCCTGCGGCGGAATGTTGCGTAAAGGGAAAGGTCGTAGTCAAACCCCACAGCCACGCGAACTCTAAGTC-AGCCACGAATAGGCTATCCCAA--CTAACGGCGGGA--AAGACTCCACGGAGGGTGTAAGACCCGTGTGGGCGCGTGTTAAAGCTGTGCG-GGCTCGGCCTCTTTTCCCTGAGAGTCGCGTTGCTTGAGCATGCAGCGCTAATCAGGTCGTAAACTCGATCTAAGGCTAAATATGTCCACAGACCCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGCACTCTGGAGAGAGAGTCAAAAGACCGTGAAACCGCTCAGAGTATAAGCCCATGGCAGCTTGGAAGGC-----ATATCGCTAGCGGGGCATC-GG-------TCT-TCCTTAAC----CGGGAG-----CTGGTGTTACCTTGCTTCTGTTGTGGCTCGTCACGGTAGGGGGGTCGAGTCCACATCCCGCC-GACGTGTGGGGAGTTCTCG-GGCGTGTTGT-TGTCTCTCGGTTGACTTCG--GTCGCGCCGTT-GGGCT-CTTCGCGCTTGGTTCTCTCTT---AAACA-CGGACGTTCAGACTCAAAGGCAAGACGCGATAACC-----------AGCCCACCACGGCACGTTGTGAGGTCACCCACAGGCTT---GACTTTTGATTGTG-ATCCTTGACGCCGAGCAAGCTCGATGCGTG--TCGCTGATGTTCCAAACCAGACAGACATGTCAGGACGGTGGAACGACACGCGCTCAAC--AGTCAGGATCGGGCAAT-GACA-GAGTT----CTGGTATGATCC-TCATGCGACGAGCCGGCTTCTGGCCGAGTT-------CCGATGCTCAGGTCTC------CCGC-ATGTGCCGCGGGAGATCGC-----------TTTGACGGTCTGGAGCTTTC---ACAAGTC-----------CTCTC--AGTCGGG-CAACGGAAAGAGTGGTGTAAAGTCCAA-GCCCATCGGTCAC-GTCTCGAAACACGGGCCAAGGAGTATAGCATGTGTGCAAGTTTAAGGGTCTCCCGAAACCCGAAGGCGAAGTGAAAGCATGTAAGCGGCGGGTGA---ACTACAGA-GAGATCCCGTCAGC-TAGAGGGTACCCT-CGGGTCCCTACGGCTTTGGCA-GAGTTGATCCTGCAGCGGTA--CCTAACCAGTACGCTC-AGGCGCAAACTCCAGGCTCACGTTATGC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Gammarus_fasciatus_MN 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Gammarus_fasciatus_WA 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Gammarus_fossarum_PO 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Gammarus_glabratus 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Gammarus_gregoryi 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Gammarus_lacustris_BJ1 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Gammarus_lacustris_VI 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Gammarus_locusta_FR 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Gammarus_martensi 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Gammarus_minus_IL 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Gammarus_montanus 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Gammarus_mucronatus 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Gammarus_nekkensis_BJ1 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Gammarus_oceanicus 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Gammarus_qiani 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Gammarus_sinuolatus 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Gammarus_sp3 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Gammarus_sp6 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Gammarus_takesensis 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Gammarus_tigrinus 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Gammarus_translucidus 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Gammarus_troglophicus_IL 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'Jesogammarus (Annanogammarus) debilis' 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GCTGGTC-TTCG-GGCTGCGATGTGAGCACCGTGGAGCACTCATGCTATGACCCGAAAGATAGTGAACTATGCCTTGCGAGGGCGAAGCCCCAGGAAACTGGGGTGGAGGCCCGTAGCCGTTGTGACG??????????? 'Jesogammarus (Jesogammarus) hebeiensis' 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Sinogammarus_chuanhui_GZ 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Gammarus_lacustris_NA 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Gammarus_lacustris_QH1 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Gammarus_lichuanensis_HB1 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Gammarus_lichuanensis_HB2 ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CGAAGTC-AGCCACGAATAGGCTATCCCAA--CTAACGGCGGGA--AAGACTCCACGGAGGGTGTAAGACCCGTGTGGGCGCGTGTTAAAGCTGTGCG-GGCTCGGCCTCTTTTCCCTGAGAGTCGCGTTGCTTGAGCATGCAGCGCTAAGCAGGTCGTAAACTCGATCTAAGGCTAAATATCTCCACAGAACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGCACTCTGGAGAGAGAGTCAAAAGACCGTGAAACCGCTCAGAGTATAAGCCCATGGCAGCTTGGAAGGC-----ATATCGCTAGCGGGGCATC-GG-------TCT-CCCTTGAC----GGGGAG-----CTGGTGTTACCTTGCTTCTGTTGTGGCTCGTCATGGTAGGGGGGTCAAGTCCACATCCCGCCAATCGTGTGGGGAGTTCTCG-GGCGTGTTGT-TGTCTCTCGGTTGACTTCG--GTCGTGCCGTTGGGGCT-CTTCGCGCTTGGTTCTCTTTC----AACA-CGGACGTTCAGACTCAAAGGCAAGACGCGATAACC-----------AGCCCACCACGGCACGTTGTGTGGTCACCCACAGGCTC---AACTTTCGATTGTG-ATCCTTGACGCCGAGCAAGCACTATGCGTG--TCGCTGATGTTCCTAACCAGGCCGAGTTGCCAGGATCGTGGAACGACACGCGCTCAAC--AGTCAGGATCGGGCGAT-AACA-GAGTT----CTGGTACGATCC-TCATGCGACGAGCTGGCTTCTGGCCGAGTT-------CCGATGCTCAGGTCTC------CCGC-ATGTGCCGCGGGAGATCGC-----------TTTGACGGTCTGGAGCTTTC---ACAAGTC-----------CTCTC--AGTCGGG-CAACGGAAAGAGTGGTGTAAAGTCCAA-GCCCATCGGTCAC-GTCTCGAAACACGGGCCAAGGAGTATAGCATGTGTGCAAGTTTAAGAGTCTCCCAAAACTCGAAGGCGAAGTGAAAGCAAGGTGGCGGCGGGTGA---TCTACGTA-GAGATCCCGTCAGC-TGGAGGGTCCTTC--GGGGCTCTCCGGCTTTGGCA-GAGTTGATCCTGTTGCGGAA--GT--ACC-----GCTC-AGGCGCAAACTCCAGGCTCACGTTACGCACTGGTT-CTCG-GACTGTGCTGTGAGCACTGTGGAGCATGCATGCTATGACCCGAAAGATAGTGAACTATGCCTGGCGAGGGCGAAGCCCCAGGAAACTGGGGTGGAGGCCCGTAGCCGTTGTGACG??????????? Gammarus_liui 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Gammarus_locusta_CA 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Gammarus_madidus 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Gammarus_martensi AACCTCCCGGGCCACCCGGCCTGCGGCGGAATGTTGCGTAAAGGGAAAGGTCGTAGTCAAACCCCACAGCCACGCGAACTCTAAGTC-AGCCACGAATAGGCTATCCCAA--CTAACGGCGGGA--AAGACTCCACGGAGGGTGTAAGACCCGTGTGGGCGCGTGTCAAAGCTGTGCG-GGCTCGGCCTCTTTTCCCTGAGAGTCGCGTTGCTTGAGCATGCAGCGCTAAGCAGGTCGTAAACTCGATCTAAGGCTAAATATCTCCACAGAACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGCACTCTGGAGAGAGAGTCAAAAGACCGTGAAACCGCTCAGAGTATAAGCCCATGGCAGCTTGGAAGGC-----ATATCGCTAGCGGGGCATC-GG-------TCT-CCCTTCAC----GGGGAG-----CTGGTGTTACCTTGCTTCTGTTGTGGCTCGTCACGGTAGGGGGGTCAAGTCCACATCCCGCC-AACGTGTGGGGAGTTCTCG-GGCGTGTTGT-TGTCTCTCGGTCGACTTCG--GTTG-GTCGTT-GGGCT-CTTCGCGCTTGGTTCTCTTTC----AACA-CGGACGTTCAGACTCAAAGGCAAGACGCGATAACC-----------AGCCCACCACGGCACGTTGCGAGGTCACCCACAGGCTC---AACTTTCGATTGTG-ATCCTTGACGCCGAGCAAGCACAATGCGTG--TCGCGGATGTTCCTAACCAGGCAACGTTGCCAGGACCGTGGGACGACACGCGCTCAAC--AGTCAGGATCGGGCGAA-GACA-GAGTT----CTGGTATGATCC-TCTTGCAACGAGCCGGCTTCTGGCCAACTT-------CCGATGCTCAGGTCTT------CCGC-ATGTGCCGCGGGAGATCGC-----------CTTGACGGTCTGGAGCTTAT---TCAAGTC-----------CTCTC--AGTCGGG-CAACGGAAAGAGTGGTGTAAAGTCCAA-GCCCATCGGTCAC-GTCTCGAAACACGGGCCAAGGAGTATAGCATGTGTGCAAGTCTAAGAGTCTCACAAAACTCGAAGGCAAAGTGAAAGCAAGTAAGCGGCGGGTGA---TCTACGGA-GAGATCCCGTCAGC-TAGAGGGTCCCTC--GGGGCCCTCCGGCTTTGGCA-GAGTCGATCCTGCAGTGGTA--CCGAATACGTATGCTC-AGGCGCAAACTCCAGGCTCACGTTTCGCACTGGTC-TTCG-GACTGTGCTGTGAGCACTGTGGAGCATGTATGCTATGACCCGAAAGATAGTGAACTATGCCTGGCGAGGGCGAAGCCCCAGGAAACTGGGGTGGAGGCCCGTAGCCGTTGTGACGTGCA??????? 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Gammarus_nekkensis_BJ1 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Gammarus_nekkensis_HB1 AACCTCCCGGGCCACCCGGCCTGCGGCGGAATGTTGCGTAAAGGGAAAGGTCGTAGTCAAACCCCACAGCCACGCGAACTCTAAGTC-AGCCACGAATAGGCTATCCCAA--CTAACGGCGGGA--AAGACTCCACGGAGGGTGTAAGACCCGTGTGGGCGCGTGTCAAAGCTGTGCG-GGCTCGGCCTCTTTTCCCTGAGAGTCGCGTTGCTTGAGCATGCAGCGCTAAGCAGGTCGTAAACTCGATCTAAGGCTAAATATCTCCACAGAACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGCACTCTGGAGAGAGAGTCAAAAGACCGTGAAACCGCTCAGAGTATAAGCCCATGGCAGCTTGGAAGGC-----ATATCGCTAGCGGGGCATC-GG-------TCT-TCCCTTTCGG--GGGGAG-----CTGGTGTTACCTTGCTTCTGTTGTGGCTCGTCACGGTAGGGGGGTCAAGTCCACATCCCGCC-GTCGTGTGGGGAGTTCTCG-GGTGCGTCGA-TGTCTTTCGGTTGACTTCG--GTTG-GCCGTTTTGGCT-CTTCGTGCTCGGTTCTCTTTC----AACA-CGGTCGTTCAGACTCAGAGGCAAGACGCGATAACC-----------AGCCCACCACGGCACGTTGTGAGGTCACCCACAGGCTC---GGCTTTCGATTGTG-ATCCTTGACGCCGAGCAAGCACAATGCGTG--TCGCAGATGTCCCTAACCAGGCAACGCTGCCAGGACTGTGGGACGACACGCGCTCAAC--AGTCAGGATCGGGCGAT-GACA-GAGTT----CTGGTATGATCC-TCATGCGACGAGCCGGCTTCTGGCCAAATT-------CCGATGCTCAGGTCTC------CCGC-ATGTGCCGCGGGAGATCGC-----------TTTGGCGGTCTGGAGCTGTT---ACAAGTC-----------CTCTC--AGCCGGG-CAACGGAAAGAGTGGTGTAAAGTCCAA-GCCCATCGGTCAC-GTCTCGAAACACGGGCCAAGGAGTATAGCATGTGTGCAAGTCTAAGAGTCTCACAAAACTCGAAGGCAAAGTGAAAGCAAGTAAGCGGCGGGTGA---TCTACGGA-GAGATCCCGTCAGC-TAGAGGGTCCCTC--GGGGCCCTCCGGCTTTGGCA-GAGTTGATCCTGCAGCGGTA--CCGCATACGTACGCTC-AGGCGCAAACTCCAGGCTCACGTTTCGCACTGGTT-CTCG-GACTGTGCTGTGAGCACTGTGGAGCATGCATGCTATGACCCGAAAGATAGTGAACTATGCCTGGCGAGGGCGAAGCCCCAGGAAACTGGGGTGGAGGCCCGTAGCCGTTGTGACGTGCAAATCCAT Gammarus_nipponensis AACCTCCCGGGCCACCCGGCCTGCGGCGGAATGTTGCGTAAAGGGAAAGGTCGTAGTCAAACCCCACAGCCACGCGAACTCTAAGTC-AGCCACGAATAGGCTATCCCAA--CTAACGGCGGGA--AAGACTCCACGGAGGGTGTAAGACCCGTGTGGGCGCGTGTCAATGCTGTGCG-GGCTCGGCCTCTTTTCCCTGAGAGTCGCGTTGCTTGAGCATGCAGCGCTAAGCAGGTCGTAAACTCGATCTAAGGCTAAATATCTCCACAGAACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGCACTCTGGAGAGAGAGTCAAAAGACCGTGAAACCGCTCAGAGTATAAGCCCATGGCAGCTTGGAAGGC-----ATATCGCTAGCGGGGCATC-GG-------TCT-TCCTTCAC----GGGGAG-----CTGGTGTTACCTTGCTTTTGTTGTGGCTCGTCACGGTAGGGGGGTCAAGTCCACATCCCGCC-GACGTGTGGGGAGTTCTCG-GGCGCGTTGG--GTTTTTCGGTCGGCTTCG--GTTG-GCCGTTTCAGCC-CTTCGCGCTTGGTTCTCTTTC----AACA-CGGACGTTCAGACTCAGAGGCAAGACGCGATAAAC-----------AGCCCACCACGGCACGTTGTGAGGTCACCCACAGGCTC---AACTTTTGATTGTG-GTCCTTGACGCCGAGCAAGCACAATGCGTG--TCGCAGATGTTCCTAACCCGGC---TTTGCCAGGATCGTGGAACGACACGCGCTCAAC--AGTCAGGACCGGGCTAT-GACA-GAGTT----CTGGTATGATCC-TCTTGCGACGAGCCGGCTTCTGGCCAAATTCC-----GATATGCTCAGGTCTC------CCGC-ATGTGCCGCGGGAGATCGC-----------CTTGACGGTCTGGAACTTGT---ACGAGTC-----------CTCTC--AGTCGGG-CGTCGGAAAGAGTGGTGTAAAGTCCAA-GCCCATCGGTCAC-GTCTCGAAACACGGGCCAAGGAGTATAGCATGTGTGCAAGTCTAAGAGTCTCACAAAACTCGAAGGCGAAGTGAAAGCAAGTACGCGGCGGGTGA---TCTACGGA-GAGATCCCGTCGGC-TAGAGGGTCCCTC--GGGGCCCTCCGGCTTTGGCA-GAGTTGATCCTGCAGCGGTA--CCGCATACGTACGCTC-AGGCGCAAACTCCAGGCTCACGTTTCGCACTGGTT-CTCG-GACTGTGCTGTGAGCACTGTGGAGCATGCATGCTATGACCCGAAAGATAGTGAACTATGCCTGGCGAGGGCGAAGCCCCAGGAAACTGGGGTGGAGGCCCGTAGCCGTTGTGACGTGCAAATCC?? Gammarus_pengi ????TCCCGGGCCACCCGGCCTGCGGCGGAATGTTGCGTAAAGGGAAAGGTCGTAGTCAAACCCCACAGCCACGCGAACTCTAAGTC-AGCCACGAATAGGCTATCCCAA--CTAACGGCGGGA--AAGACTCCACGGAGGGTGTAAGACCCGTGTGGGCGCGTGTCAAAGCTGTGCG-GGCTCGGCCTCTTTTCCCTGAGAGTCGCGTTGCTTGAGCATGCAGCGCTAAGCAGGTCGTAAACTCGATCTAAGGCTAAATATCTCCACAGAACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGCACTCTGGAGAGAGAGTCAAAAGACCGTGAAACCGCTCAGAGTATAAGCCCATGGCAGCTTGGAAGGC-----ATATCGCTAGCGGGGCATC-GG-------TCT-TCCTTCAC----GGGAAG-----CTGGTGTTACCTTGCTTCTGTTGTGGCTCGTCAAGGTAGGGGGGTCAAGTCCACATCCCGCC-AACGTGTGGGGAGTTCTCG-GGCGTGTTGT-TGTCTCTCGGTCGGCTTCG--GTTG-GTCGTT-GGGCT-CTTCGCGCTTGGTTCTCTTTC----AACA-CGGACGTTCAGACTCAAAGGCAAGACGCGATAACC-----------AGCCCACCACGGCACGTTGTGAGGTCACCCACAGGCTC---GACTTTCGATTGTG-GTCCTTGACGCCGAGCAAGCACAATGCGTG--TCGCAGATGTTCCTAACCAGGCAATGTTGCCAGGATCGTGGAACGACACGCGCTCAAC--AGTCAGGATCGGGCGAA-GACA-GAGTT----CTGGTACGATCC-TCTTGCGACGAGCCGGCTTCTGGCCAACTT-------CCGATGCTCAGGTCTC------CCGC-ATGTGCCGCGGGAGATCGC-----------TTTGACGGTCTGGAGCTTAT---ACAAGTC-----------CTCTCTTAGTCGGG-CAACGGAAAGAGTGGTGTAAAGTCCAA-GCCCATCGGTCAC-GTCTCGAAACACGGGCCAAGGAGTATAGCATGTGTGCAAGTCTAAGAGTCTCACAAAACTTGAAGGCAAAGTGAAAGCAAGTAAGCGGCGGGTGA---TCTACGGA-GAGATCCCGTCAGC-TAGAGGGTCCTTC--GGGGCCCTCCGGCTTTGGCA-GAGTCGATCCTGCAGTGGTA--CCGAATACGTATGCTC-AGGCGCAAACTCCAGGCTCACGTTTCGCACTGGTT-CTCG-GACTGTGCTGTGAGCACTGTGGAGCATGCATGCTATGACCCGAAAGATAGTGAACTATGCCTGGCGAGGGCGAAGCCCCAGGAAACTGGGGTGGAGGCCCGTAGCCGTTGTGACGTGCAAATCCAT Gammarus_pexus ?????????????????????????????????????????????AAAGGTCGTAGTCAAACCCCACAGCCACGCGAACTCTAAGTC-AGCCACGAATAGGCTATCCCAA--CTAACGGCGGGA--AAGACTCCACGGAGGGTGTAAGACCCGTGTGGGCGCGTGTCAAAGCTGTGCG-GGCTCGGCCTTTTTTCCCTGAGAGTCGCGTTGCTTGAGCATGCAGCGCTAAGCAGGTCGTAAACTCGATCTAAGGCTAAATATGTCCACAGAACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGCACTCTGGAGAGAGAGTCAAAAGACCGTGAAACCGCTCAGAGTATAAGCCCATGGCAGCTTGGAAGGC-----ATATCGCTAGCGGGGCATC-GG-------TCT-TCCTTCGC----GGGGAG-----CTGGTGTTACCTTGCTTCTGTTGTGGCTCGTCAAGGTAGGGGGGTCAAGTCCACATCCCGCC-GTCGTGTGTGAGGTTCTCG-GGTGCGT-GT-TGTCTTTCGGTTGACTTCG--GTTG-GCCGTT-GGGCT-CTTCGTGCTTGGTGCTTCTTT----AACA-CGGACGTTCAGACTCAAAGGCAAGACGCGATAACC-----------AGCCCACCACGGCACGTTGTGAGGTCACCCACAGGCTC---AACTTTCGATTGTG-AACCTTGACGCCGAGCA-GCACAATGCGTG--TCGCTTATGTTCCTAACCAGGCAACGCTGCCAGGACCGTGGAACGACACGCGCTCAAC--AGTCAGGTTCGAGCGAT-GACA-GAGTT----CTGGTACGATCC-TCTTGCGACGAGCCGGCTTCTGGCCAAAAT-------CCGCTGCTCAGGTCTC------CCGC-ATGTGCCGCGGGAGATCGCC----------CTTGACGGTCTGGAGCTTTT---ACAAGTC-----------CTCTC--AGTCGGG-CAACGGATAGAGTGGTGTAAAGTCCAA-GCCCATCGGTCAC-GTCTCGAAACACGGGCCAAGGAGTATAGCATGTGTGCAAGTCTAAGGGTCTCACAAAACCCGAAGGCGAAGTGAAAGCAAGTAAGCGGCGGGTGA---TCTACGGA-GAGATCCCGTCAGC-TAGAGGGACCCTC--GGGTCTCTCCGGCTTTGGCA-GAGTTGATCCTGCAGCGGTA--CCGCACACGTACGCTC-AGGCGCAAACTCCAGGCTCACGTTTCGCACTGGTT-CTCG-GACTGTGCTGTGAGCACTGTGGAGCATGCATGCTATGACCCGAAAGATAGTGAACTATACCTGGCGAGGGCGAAGCCCC??????????????????????????????????????????????? Gammarus_pseudolimnaeus_IL ?ACCTCCCGGGCCACCCGGCCTGCGGCGGAATGTTGCGTAAAGGGAAAGGTCGTAGTCAAACCCCACAGCCACGCGAACTCTAAGTC-AGCCACGAATAGGCTATCCCAA--CTAACGGCGGGA--AAGACTCCACGGAGGGTGTAAGACCCGTGTGGGCGCGTGTCAAAGCTGTGCG-GGCTCGGCCTCTTTTCCCTGAGAGTCGCGTTGCTTGAGCATGCAGCGCTAAGCAGGTCGTAAACTCGATCTAAGGCTAAATATATCCACAGAACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGCACTCTGGAGAGAGAGTCAAAAGACCGTGAAACCGCTCAGAGTATAAGCCCATGGCAGCTTGGAAGGC-----ATATCGCTAGCGGGGCATC-GGTG-----CTC-TTCCTTTCGGG-GGGGGGCT---CTGGTGTCACTTTGCTTTTGTTGTGGCTCGTCAAGGTAGGGCGGTCAAGTCCGAATCCCGCC-GTCGTGTGGGAGGTTCTTT-GGCGCGTCGT-TGTCTTTCGGTTGGCTTCG--GTTG-ATCGTT-GGGCT-CTTCGTGCTTGGTTCCTCATT----AACA-CGGACGTTCAGACTCAATTGCAAGACGCGATAACC-----------AGCCCACCACGGCACGTTGTGAGGTCACCCACAGGCTC---AACTTTCGATTGTG-ATCCTTGACGCCGAGCAAGCACAATGCGTG--TCGCAATTGTTCCTAACCGGGTTCTTGGGCCAGGACCGTGGAACGACACGCGCTCCAC--AGTCAGGATCGGGCGAT-GACC-GAGTTA--TCTGGTGCGATCC-TCTTGCGACGAGCTGGCTTCTGGCCAAATT-------CCGACGAACAGGTCTC------CCGC-ATGTGCCGCGGGAGATCGCCT---------CCTGACGGTCTGGACACTT----ACAAGTC-----------CTCTC--AGTCGAG-CGTCGGAAAGAGTGGTGTAAAGTCCAA-GCCCATCGGTCAC-GTCTCGAAACACGGGCCAAGGAGTATAGCATGTGTGCAAGTCTAAGGGTCTCACAAAACCCGAAGGCGAAGTGAAAGCAAGTAAGCGGCGGGTGA---TCTACGGA-GAGATCCCGTCAGC-TAGAGGGACCCTC--GGGTCTCTCCGGCTTTGGCA-GAGTTGATCCTGCAGCGGTA--CCGCATACGTACGCTC-AGGCGCAAACTCCAGGCTCACGTTTCGCACTGGTT-CTCG-GACTGTGCTGTGAGCACTGTGGAGCATGCATGCTATGACCCGAAAGATAGTGAACTATGCCTGGCGAGGGCGAAGCCCCAGGAAACTGGGGTGGAGGCCCGTAGCCGTTGTGACGTGCAAATCCAT Gammarus_pulex_NL AACCTCCCGGGCCACCCGGCCTGCGGCGGAATGTTGCGTAAAGGGAAAGGTCGTAGTCAAACCCCACAGCCACGCGAACTCTAAGTC-AGCCACGAATAGGCTATCCCAA--CTAACGGCGGGA--AAGACTCCACGGAGGGTGTAAGACCCGTGTGGGCGCGTGTCAAAGCTGTGCG-GGCTCGGCCTCTTTTCCCTGAGAGTCGCGTTGCTTGAGCATGCAGCGCTAAGCAGGTCGTAAACTCGATCTAAGGCTAAATATCTCCACAGAACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGCACTCTGGAGAGAGAGTCAAAAGACCGTGAAACCGCTCAGAGTATAAGCCCATGGCAGCTTGGAAGGC-----ATATCGCGAGCGGGGCATC-GG-------TCT-TCCTTCGC----GGGGAG-----CCGGTGTTACCTTGCCTCTGTTGTGGCTCGTTATGGTAGGGGGGTCAAGTCCACATCCCGCC-GTCGTGTGGGGAGTTCTCG-GGCGTGTCGT-TGCTTTGCGGTTGACCTCG--GTTG-ATCGTA-GGGCT-CTTCGTGCTTGGTTCTTCTTT---AGACA-CGGACGTTCAGACTCAGAGGCAAGACGCGATAACC-----------AGCCCACCACGGCACGTTGTGAGGTCACCCACAGGCTC---AACTTTCGATTGTG-GTCCTTGACGCCGAGCAAGCACAATGCGTG--TCGCAGATGTTCCTAACCGGACAATTTTGTCAGGACCGTGGAACGACACGCGCTCAAC--AGTCAGGACCGGGCGAT-GACA-GAGTT----CTGGTACGATCC-TCTTGCGACGAGCCGCCTTCTGGCCGATTT-------CCGATGCTCAGGTCTC------CCGC-ATGTGCCGCGGGAGATCGC-----------TTTGGCGGTCTGGACC-CGT---AAGAGTC-----------CTCTC--AGCCGGG-CAACGGAAAGAGTGGTGTAAAGTCCAA-GCCCATCGGTCAC-GTCTCGAAACACGGGCCAAGGAGTATAGCATGTGTGCAAGTCTAAGGGTCTCACAAAACCCGAAGGCGAAGTGAAAGCAAGTAAGCGGCGGGTGA---TCTACGGA-GAGATCCCGTCAGC-TAGAGGGGTCCTC--GGACTCCTCCGGCTTTGGCA-GAGTTGATCCTGCAGCGGTA--CCGCATACGTACGCTC-AGGCGCAAACTCCAGGCTCACGTTTCGCACTGGTT-CTCG-GACTGTGCTGTGAGCACTGTGGAGCATGCATGCTATGACCCGAAAGATAGTGAACTATGCCTGGCGAGGGCGAAGCCCCAGGAAACTGGGGTGGAGGCCCGTAGCCGTTGTGACGTGCAAATCCA? Gammarus_qiani AACCTCCCGGGCCACCCGGCCTGCGGCGGAATGTTGCGTAAAGGGAAAGGTCGTAGTCAAACCCCACAGCCACGCGAACTCTAAGTC-AGCCACGAATAGGCTATCCCAA--CTAACGGCGGGA--AAGACTCCACGGAGGGTGTAAGACCCGTGTGGGCGCGTGTCAAAGCTGTGTG-GGCTCGGCCTCTTTTCCCTGAGAGTCGCGTTGCTTGAGCATGCAGCGCTAAGCAGGTCGTAAACTCGATCTAAGGCTAAATATCTCCACAGAACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGCACTCTGGAGAGAGAGTCAAAAGACCGTGAAACCGCTCAGAGTATAAGCCCATGGCAGCTTGGAAGGC-----ATATCGCTAGCGGGGCATC-GG-------TCT-CCCTTCAC----GGGGAG-----CTGGTGTTACCTTGCTTCTGTTGTGGCTCGTCATGGTAGGGGGGTCAAGTCCACATCCCGCC-AACGTGTGGGGAGTTCTCG-GGCGTGTTGC-TGTCTCTCGGTTGACTTCG--GTTG-GCCGTT-GGGCT-CTTCGCGCTTGGTTCTCTTTC----AACA-CGGACGTTCAGACTCAAAGGCAAGACGCGATAACC-----------AGCCCACCACGGCACGTTGCGAGGTCACCCACAGGCTT---TACTTTTGATTGTG-GTCCTTGACGCCGAGCAAGCACAATGCGTG--TCGCTGATGTTCCTAACCAGGCAATGGTGCCAGGATCGTGGAACGACACGCGCTCAAC--AGTCAGGATCGGGCAAT-GACA-GAGTT----CTGGTACGATCC-TCATGCGACTGGCCGGCTTCTGGCCAACTT-------CCGATGCTCAGGTCTC------TCGC-ATGTGCCGCGGGAGATCGC-----------CTTGACGGTCTGGACCTT-------GAGTC-----------CTCTC--AGTCGGG-CAACGGAAAGAGTGGTGTAAAGTCCAA-GCCCATCGGTCAC-GTCTCGAAACACGGGCCAAGGAGTATAGCATGTGTGCAAGTCTAAGAGTCTCCCAAAACTCGAAGGCAAAGTGAAAGCAAGTAAGCGACGGGTGA---TCTACGGA-GAGATCCCGTCAGC-TAGAGGGTCCCTT--GGGGCCCTCCGGCTTTGGCA-GAGTTGATCCTGCAGCGGTA--CCGCATACGTACGCTC-AGGCGCAAACTCCAGGCTCACGTTTCGCACTGGTT-CTCG-GACTGTGCTGTGAGCACTGTGGAGCATGCATGCTATGACCCGAAAGATAGTGAACTATGCCTGGCGAGGGCGAAGCCCCAGGAAACTGGGGTGGAGGCCCGTAGCCGTTGTGACGTGCAAATC??? Gammarus_riparius ?????????????????GGCCTGCGGCGGAATGTTGCGTAAAGGGAAAGGTCGTAGTCAAACCCCACAGCCACGCGAACTCTAAGTC-AGCCACGAATAGGCTATCCCAA--CTAACGGCGGGA--AAGACTCCACGGAGGGTGTAAGACCCGTGTGGGCGCGTGTTAAAGCTGTGCG-GGCTCGGCCTCTTTTCCCTGAGAGTCGCGTTGCTTGAGCATGCAGCGCTAAGCAGGTCGTAAACTCGATCTAAGGCTAAATATCTCCACAGAACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGCACTCTGGAGAGAGAGTCAAAAGACCGTGAAACCGCTCAGAGTATAAGCCCATGGCAGCTTGGAAGGC-----ATATCGCTAGCGGGGCATC-GG-------TCT-CCCTTCGC----GGGGAG-----CTGGTGTTACCTTGCTTCTGTTGTGGCCCGTCATGGTAGGGGGGTCAAGTCCACATCCCGCCAGACGTGTGGGGAGTTCTCG-GGCGTGTTTA-TGTTTCTCGGTTGACTTCG--GTCGTGCCGTTGGGACT-ATTCGCGCTTGGTTCTCTTTC----AACA-CGGACGCTCAGACTCAAAGGCAAGACGCGATAACC-----------AGCCCACCACGGCACGTTGTGAGGTCACCCACAGGCTC---AACTTTCGATTGTG-ATCCTTGACGCCGAGCAAGCACGGTGCGTG--TCGCTGATGTTCCTAACCAGGCCAAGTTGCCAGGACCGTGGAACGACACGCGCTCAAC--AGTCAGGATCGAGCGAT-GACA-GAGTT----CTGGTATGATCC-TCTTGTGACGAGCCGCCTTCTGGCCAATTT-------CCGATGCTCAGGTCTC------CCGC-ATGTGCCGCGGGAGGTCCC-----------CTTGACGGTCTGGAGCTTGT-AACTAAGTC-----------CTCTC--AGTCGGG-CAACGGAAAGAGTGGTGTAAAGTCCAA-GCCCATCGGTCAC-GTCTCGAAACCCGGGCCAAGGAGTATAGCATGTGTGCAAGTCTAAGAGTCTCCCAAAACTCGAAGGCAAAGCGAATGCAAGTCGGCGGCGGGTGA---TCTACACA-GAGATCCCGTCAGCCGAGAGGGTCCCTC--GGGGTCTTCCGGCTTTGGCA-GAGTTGATCCTGCTCC---------CACACGTACGCTC-AGGCGCAAACTCCAGGCTCACGTTTCGCACTGGTT-CTCG-GACTGTGCTGTGAGCACTGTGGAGCATGCATGCTATGACCCGAAAGATAGTGAACTATGCCTGGCGAGGGCGAAGCCCCAGGAAACTGGGGTGGAGGCCCGTAGCCGTTGTGACGTGCAAATCCAT Gammarus_roeseli ??????????????CCCGGCCTGCGGCGGAATGTTGCGTAAAGGGAAAGGTCGTAGTCAAACCCCACAGCCACGCGAACTCTAAGTC-AGCCACGAATAGGCTATCCCAA--CTAACGGCGGGA--AAGACTCCCCGGAGGGTGTAAGACCCGTGTGGGCGCGTGTTAAAGCTGTGTG-GGCTCGGCCTCTCTTCCCTGAGAGTCGCGTTGCTTGAGCATGCAGCGCTAATCAGGTCGTAAACTCGATCTAAGGCTAAATATCTCCACAGAACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGCACTCTGGAGAGAGAGTCAAAAGACCGTGAAACCGCTCAGAGTATAAGCCCATGGCAGCTTGGAAGGC-----ATATCGCTAGCGGGGCATC-GG-------TCT-CCCTTCGC----GGGGAG-----CTGGTGTTACCTTGCTTCTGTTGTGGCTCGTCAAGGTAGGGGGGTCAGGTCCACATCCCGCC-ATCGTGTGGGGAGTTCCTG-GGCGTGTCGT-TGCTTTGCGGTTGACTTCG--GTTG-GCCGTA-GGGCT-CTTCGCGCTTGGGGCTTCTTT---AGACA-CGGACGTTCATACTCAGTTGCAAGACGCGATAACC-----------AGCCCACCACGGCACGTTGTGAGGTCACCCACAGGCTC---ACCTTTCGATTGTT-GTCCTTGACGCCGAGCAAGCACAATGCGTG--TCGCAGATGTTCCTAACCTGGCAAGCTTGTC-GGACAGTGGAACGACACGCGCTCAAA--AGTCAGGACCGGGCGAT-GACA-GAGTT----CTGGTCTGATCC-TCTTGTGACGAGCCGGCTTCTGGCCGATTT-------CCGATGCTCAGGTCTC------TCGC-ATGTGCCGCGGGAGATCGC-----------CTTGACGGTCTGGACCTTG----ACAAGTC-----------CTCTC--AGTCGGG-CAACGGAAAGAGTGGTGTAAAGTCCAA-GCCCATCGGTCAC-GTCTCGAAACACGGGCCAAGGAGTATAGCATGTGTGCAAGTCTAAGGGTCTCACAAAACCCGAAGGCGAAGTGAAAGCAAGTAAGCGGCGGGTGA---TCTACGGA-GAGATCCCGTCAGC-TAGAGGTTCCCTC--GGGTTCCTCCGGCTTTGGCA-GAGTTGATCCTGCAGCGGTA--CTGCATTGGTACGCTC-AGGCGCAAACTCCAGGCTCACGTCTCGCACTGGTT-CTTG-GACTGTGCTGTGAGCACTGTTGAGCATGCATGCTATGACCCGAAAGATAGTGAAGTATGCCTGGCGAGGGCGAAGCCCCAGGAAACTGGGGTGGAGGCCCGTAGCCG??????????????????? Gammarus_shanxiensis ?ACCTCCCGGGCCACCCGGCCTGCGGCGGAATGTTGCGTAAAGGGAAAGGTCGTAGTCAAACCCCACAGCCACGCGAACTCTAAGTC-AGCCACGAATAGGCTATCCCAA--CTAACGGCGGGA--AAGACTCCACGGAGGGTGTAAGACCCGTGTGGGCGCGTGTTAAAGCTGTGCG-GGCTCGGCCTCTTTTCCCTGAGAGTCGCGTTGCTTGAGCATGCAGCGCTAAGCAGGTCGTAAACTCGATCTAAGGCTAAATATCTCCACAGAACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGCACTCTGGAGAGAGAGTCAAAAGACCGTGAAACCGCTCAGAGTATAAGCCCATGGCAGCTTGGAAGGC-----ATATCGCTAGCGGGGCATC-GG-------TCT-TCCTTTAC----GGGGAG-----CTGGTGTTACCTTGCTTCTGTTGTGGCTCGTCACGGTAGGGGGGTCAAGTCCACATCCCGCC-GACGTGTGGGGAGTTCTCG-GGCGTGTTGT-TGTCTCTCGGTCGACTTCG--GTTG-GTCGTT-GGGCT-CTTCATGCTTGGTTCTCTTTC----AACA-CGGACGTTCAGACTCAAAGGCAAGACGCGATAACC-----------AGCCCACCACGGCACGTTGTGAGGTCACCCACAGGCTC---GACTTTCGATTGTG-ATCCTTGACGCCGAGCAAGCACAATGCGTG--TCGCTGATGTTCCTAACCAGGCCGAGTTGCCAGGACGGTGGAACGACACGCGCTCAAC--AGTCAGGATCGGGCGAT-GACA-GAGTT----CTGGTACGATCC-TCTTGCGACGAGCCGGCTTCTGGCCAACTT-------CCGATGCTCAGGTCTC------CCGC-ATGTGCCGCGGGAGATCGC-----------CTTGACGGTCTGGAGCTTTT---ACAAGTC-----------CTCTC--AGTCGGG-CAACGGAAAGAGTGGTGTAAAGTCCAA-GCCCATCGGTCAC-GTCTCGAAACACGGGCCAAGGAGTATAGCATGTGTGCAAGTTTAAGAGTCTCCCAAAACTCGAAGGCGAAGTGAAAGCAAGTAAGCGGCGGGTGA---TTTACGTA-GAGATCCCGTCAGC-TGGAGGGTCCCTC--GGG-CCCTCCGGCTTTGGCA-GAGTTGATCCTGCAGCGGTA--CCGAATACGTACGCTC-AGGCGCAAACTCCAGGCTCACGTTTCGCACTGGTT-TTCG-GACTGTGCTGTGAGCACTGTGGAGCATGCATGCTATGACCCGAAAGATAGTGAACTATGCCTGGCGAGGGCGAAGCCCCAGGAAACTGGGGTGGAGGCCCGTAGCCGTTGTGACGTGCAAATCCAT Gammarus_shenmuensis 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Gammarus_sichuanensis 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Gammarus_sinuolatus AACCTCCCGGGCCACCCGGCCTGCGGCGGAATGTTGCGTAAAGGGAAAGGTCGTAGTCAAACCCCACAGCCACGCGAACTCTAAGTC-AGCCACGAATAGGCTATCCCAA--CTAACGGCGGGA--AAGACTCCACGGAGGGTGTAAGACCCGTGTGGGCGCGTGTTAAAGCTGTGCG-GGCTCGGCCTTTTTTCCCTGAGAGTCGCGTTGCTTGAGCATGCAGCGCTAAGCAGGTCGTAAACTCGATCTAAGGCTAAATATCTCCACAGAACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGCACTCTGGAGAGAGAGTCAAAAGACCGTGAAACCGCTCAGAGTATAAGCCCATGGCAGCTTGGAAGGC-----ATATCGCTAGCGGGGCATC-GG-------TCT-TCCTTCAC----GGGGAG-----CTGGTGTTACCTTGCTTTTGTTGTGGCTCGTCA-GGTAGGGGGGTCAAGTCCACATCCCGCC-GCCGTGTGGGGAGTTCTCG-GGCATGTTGT-TGTCTCTCGGTTGACTTCG--GTTG-GCAGTT-GGGCT-CTTCGTGCTTGGTTCTTCTTA----TACA-CGGTCGTTCAGACTCAAAGGCAAGACGCGATAACC-----------AGCCCACCACGGCACGTTGTGAGGTCACCCACAGGCTC---GACTTTTGATTGTG-ATCCTTGACGCCGAGCAAGCACAATGCGTG--TCGCAGATGTTCCTAACCAGACATGCATGTCAGGACTGTGGAACGACACGCGCTCAAC--AGTCAGGATCGGGCAAT-GACA-GAGTT----CTGGTACGATCC-TCTTGCAACGAGCCGCCTTCTGGCCGATTT-------CCTCTGCTCAGGTCTC------CCGC-ATGTGCCGCGGGAGATCGC-----------TTCGACGGTCTGGAGCTTAT---ACAAGTC-----------CTCTC--AGTCGGG-CAACGGAAAGAGTGGTGTAAAGTCCAA-GCCCATCGGTCAC-GTCTCGAAACACGGGCCAAGGAGTATAGCATGTGTGCAAGTCTAAGGGTCTCACAAAACTCGAAGGCGAAGTGAAAGCAAGTAAGCGGCGGGTGA---TCAACGTT-GAGATCCCGTCAGC-TAAAGGGTACCCA-CGGGTCCCTTCGGCTTTGGCA-GAGTTGATCCTGCAGCGGTA--CCTAGCAAGTACGCTC-AGGCGCAAACTCCAGGCTCACGTTTCGCACTGGTC-TTCG-GACTGTGCTGTGAGCACTGTGGAGCATGCATGCTATGACCCGAAAGATAGTGAACTATGCCTGGCGAGGGCGAAGCCCCAGGAAACTGGGGTGGAGGCCCGTAGCCGTTGTGACGTGCAAATCCAT Gammarus_sp1 AACCTCCCGGGCCCCCCGGCCTGCGGCGGAATGTTGCGTAAAGGGAAAGGTCGTAGTCAAGCCCCACAGCCACGCGAACTCTAAGTC-AGCCACGAATAGGCTATCCCAA--CTAACGGCGGGA--AAGACTCCATGGAGGGTGTAAGACCCGTGTGGGCGCGTGTCAAAGCTGTGCG-GGTTCGGCCTCTTTTCCCTGAGAGTCGCGTTGCTTGAGCATGCAGCGCTAAGCAGGTCGTAAACTCGATCTAAGGCTAAATATCTCCACAGGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGCACTCTGGAGAGAGAGTCAAAAGACCGTGAAACCGCTCAGAGTATAAGTCCATGGCTGCTTGGAAGGC-----AAATCGCTAGCGGGGCATC-GG------CTTT-CCCTTCACA---GGGGGG-----CGGGTGTTACCTTGCTTCTGTTGTGGCTCGTCAAGGTAGGGGGGTCAAGTCCACATCCCGCC-GACGTGTGGGGAGTTCTCG-GGCGTGCTGT-TGTTTCTCGGTTGACTTCG--GTTG-ACTGGGGGGCGTGCTTCACGTTTGGTTCTTCTTC----TACA-CGGACGTTCAGATTCAAAGGCAAGACGCGAATACAG----------AGCCCACCACGGCACGTTGTGAGGTCACCCTCAGGCTC---GATTTTTGATTGTG-GTCCTTGCCGCCGAGCAAGTTCCATGCGTG--TCGCTGATGTTCCTAACCAGGCAATGTTGCCAGGATTACGGTACGACACGCGCTCAAA--AGGCAGGACCGGGCAAT-GACA-AAGTA----CTGGTATGATCC-TCATGCGACGAGCCGGCTTCTGGCCGAGTT-------CCGATGCTCAGGTCTC------CCGC-ATGTGCCGCGGGAGATCGC-----------TTTGACGGTCTGGAGCTTTC---ACAAGTC-----------CTCTC--AGTCGGG-CAACGGAAAGAGTGGTGTAAAGTCCAA-GCCCATCGATCAC-GTCTCGAAACACGGGCCAAGGAGTATAGCATGTGTGCAAGTTTAAGGGTATCCCAAAACCCGAAGGCAAAGTGAAAGCATGGTGGCGGCGGGTGA---TCTACACA-GGGATCCCGTCAGC-TAGAGGGTGCCACGTGGGGCCCTCCGGCATTGGCT-GAGTCGATCCTGAAGCGGTA--CCGTATACGTACGCTC-AGGCGCAAACTCCAGGCTCACGTTTCGCACTGGTT-CTTG-AACTGTGCTGTGAGCACTGTGGAGCATGTATGCTATGACCCGAAAGATAGTGAACTATGCTTGGCGAGGGCGAAGCCCCAGGAAACTGGGGTGGAGGCCCGTAGCCGTTGTGACGTGCAAAT???? 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Gammarus_sp6 ??????????????CCCGGCCTGCGGCGGAATGTTGCGTAAAGGGAAAGGTCGTAGTCAAACCCCACAGCCACGCGAACTCTAAGTC-AGCCACGAATAGGCTATCCCAA--CTAACGGCGGGA--AAGACTCCACGGAGGGTGTAAGACCCGTGTGGGCGCGTGTCAAAGCTGTGCG-GGCTCGGCCTCTTTTCCCTGAGAGTCGCGTTGCTTGAGCATGCAGCGCTAAGCAGGTCGTAAACTCGATCTAAGGCTAAATATCTCCACAGAACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGCACTCTGGAGAGAGAGTCAAAAGACCGTGAAACCGCTCAGAGTATAAGCCCATGGCAGCTTGGAAGGC-----ATATCGCGAGCGGGGCATC-GG-------TCT-TCCTTCGC----GGGGAG-----CCGGTGTTACCTTGCCTCTGTTGTGGCTCGTTATGGTAGGGGGGTCAAGTCCACATCCCGCC-GTCGTGTGGGGAGTTCTCG-GGCGTGTCGT-TGCTTTGCGGTTGACCTCG--GTTG-ATCGTA-GGGCT-CTTCGTGCTTGGTTCTTCTTT---AGACA-CGGACGTTCAGACTCAGAGGCAAGACGCGATAACC-----------AGCCCACCACGGCACGTTGTGAGGTCACCCACAGGCTC---AACTTTCGATTGTG-GTCCTTGACGCCGAGCAAGCACAATGCGTG--TCGCAGATGTTCCTAACCGGACAATTTTGTCAGGACCGTGGAACGACACGCGCTCAAC--AGTCAGGACCGGGCGAT-GACA-GAGTT----CTGGTACGATCC-TCTTGCGACGAGCCGCCTTCTGGCCGATTT-------CCGATGCTCAGGTCTC------CCGC-ATGTGCCGCGGGAGATCGC-----------TTTGGCGGTCTGGACC-CGT---AAGAGTC-----------CTCTC--AGCCGGG-CAACGGAAAGAGTGGTGTAAAGTCCAA-GCCCATCGGTCAC-GTCTCGAAACACGGGCCAAGGAGTATAGCATGTGTGCAAGTCTAAGGGTCTCACAAAACCCGAAGGCGAAGTGAAAGCAAGTAAGCGGCGGGTGA---TCTACGGA-GAGATCCCGTCAGC-TAGAGGGGTCCTC--GGACTCCTCCGGCTTTGGCA-GAGTTGATCCTGCAGCGGTA--CCGCATACGTACGCTC-AGGCGCAAACTCCAGGCTCACGTTTCGCACTGGTT-CTCG-GACTGTGCTGTGAGCACTGTGGAGCATGCATGCTATGACCCGAAAGATAGTGAACTATGCCTGGCGAGGGCGAAGCCCCAGGAAACTGGGGTGGAGGCCCGTAGCCG??????????????????? Gammarus_stalagmiticus ?????????????????GGCCTGCGGCGGAATGTTGCGTAAAGGGAAAGGTCGTAGTCAAACCCCACAGCCACGCGAACTCTAAGTC-AGCCACGAATAGGCTATCCCAA--CTAACGGCGGGA--AAGACTCCACGGAGGGTGTAAGACCCGTGTGGGCGCGTGTCAAAGCTGTGCG-GGCTCGGCCTTTTTTCCCTGAGAGTCGCGTTGCTTGAGCATGCAGCGCTAAGCAGGTCGTAAACTCGATCTAAGGCTAAATATGTCCACAGAACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGCACTCTGGAGAGAGAGTCAAAAGACCGTGAAACCGCTCAGAGTATAAGCCCATGGCAGCTTGGAAGGC-----ATATCGCTAGCGGGGCATC-GG-------TCT-TCCTTCGC----GGGGAG-----CTGGTGTTACCTTGCTTTTGTTGTGGCTCGTCATGGTAGGGGGGTCAAGTCCACATCCCGCC-GACGTGTGGGGAGTTCTCG-GGCGCGTTGA-TGTCTTTCGGTTGGCTTCG--GTCG-GCCGTTTTGGCT-CTTCGTGCTTGGTTCTCTTTC----AACA-CGGACGTTCAGACTCAAAGGCAAGACGCGATAACC-----------AGCCCACCACGGCACGTTGTGAGGTCACCCACAGGCTC---AACTTTCGATTGTG-AACCTTGACGCCGAGCA-GCACAATGCGTG--TCGCTTATGTTCCTAACCAGGCAACGCTGCCAGGACCGTGGAACGACACGCGCTCAAC--AGTCAGGTTCGAGCGAT-GACA-GAGTT----CTGGTACGATCC-TCTTGCGACGAGCCGGCTTCTGGCCAAAAT-------CCGCTGCTCAGGTCTC------CCGC-ATGTGCCGCGGGAGATCGCC----------CTTGACGGTCTGGAGCTTTT---ACAAGTC-----------CTCTC--AGTCGGG-CAACGGATAGAGTGGTGTAAAGTCCAA-GCCCATCGGTCAC-GTCTCGAAACACGGGCCAAGGAGTATAGCATGTGTGCAAGTCTAAGGGTCTCACAAAACCCGAAGGCGAAGTGAAAGCAAGTAAGCGGCGGGTGA---TCTACGGA-GAGATCCCGTCAGC-TAGAGGGACCCTC--GGGTCTCTCCGGCTTTGGCA-GAGTTGATCCTGCAGCGGTA--CCGCACACGTACGCTC-AGGCGCAAACTCCAGGCTCACGTTTCGCACTGGTT-CTCG-GACTGTGCTGTGAGCACTGTGGAGCATGCATGCTATGACCCGAAAGATAGTGAACTA????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Gammarus_translucidus ????????????????????????????GGATGTTGCGTAAAGGGAAAGGTCGTAGTCAAACCCCACAGCCACGCGAACTCTAAGTC-AGCCACGAATAGGCTATCCCAA--CTAACGGCGGGA--AAGACTCCACGGAGGGTGTAAGACCCGTGTGGGCGCGTGTCTATGCTGTGTG-GGCTCGGCCTCTTTTCCCTGAGAGTCGCGTTGCTTGAGCATGCAGCGCCAAGCAGGTCGTAAACTCGATCTAAGGCTAAATATCTCCACAGAACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGCACTCTGGAGAGAGAGTCAAAAGACCGTGAAACCGCTCAGAGTATAAGCCCATGGCAGCTTGGAAGGC-----ATATCGCTAGCGGGGCATC-GG-------TCT-CCCTTCTC----GGGGAG-----CTGGGGTTACCTTGCTTCTGTTGTGGCTCGTCATGGTAGGGGGGTCAAGTCCACATCCCGCC-AACGTGTGGGGAGTTCTTG-GGGGTGTTGG-CGTCTCTCGGTTGACCTCG--GTTG-CCGTTGGGCGGT-CTTCGCGCTTGGTTCTCTTTC----AACA-CGGACGTTCAGACACACAGGTAAGACGCGATAACC-----------AGCCCACCACGGCACGTTGTGAGGTCACCCACAGGCTC---AGCTTTCGATTGTG-ATCCTTGACGCCGAGCAAGCACAATGCGTG--TCGCAGATGTTCCTAACCAGGCAACGTTGCCAGGACTGTGGAACGACACGCGCTCAAA--AGTCAGGATCGGGCGAT-GACA-GAGTA----CTGGTACGATCC-TCATGCGACGAGCCGGCTTCTGGCCAAATT-------CCGGTGCTCAGGTCTC------CCGC-ATGTGCCGCGGGAGATCGC-----------CCAGGCGGTCTGGAGCTTAT---ACAAGTC-----------CTCTC--AGCCGGG-CAACGGAAAGAGTGGTGTAAAGTCCAA-GCCCATCGGTCAC-GTCTCGAAACACGGGCCAAGGAGTATAGCATGTGTGCAAGTCTAAGAGTCTCACAAAACTCGAAGGCAAAGTGAAAGCAAGTAAGCGGCGGGTGA---TCTACGGA-GAGATCCCGTCAGC-TAGAGGGTCCCTT--GGGGCCCTCCGGCTTTGGCA-GAGTTGATCCTGCAGCGGTA--CCGCATACGTACGCTC-AGGCGCAAACTCCAGGCTCACGTTTCGCACTGGTT-CTCG-GACTGTGCTGTGAGCACTGTGGAGCATGCATGCTATGACCCGAAAGATAGTGAAGTATGCCTGGCGAGGGCGAAGCCCCAGGAAACTGGGGTGGAGG????????????????????????????? Gammarus_troglophicus_IL AACCTCCCGGGCCACCCGGCCTGCGGCGGAATGTTGCGTAAAGGGAAAGGTCGTAGTCAAACCCCACAGCCACGCGAACTCTAAGTC-AGCCACGAATAGGCTATCCCAA--CTAACGGCGGGA--AAGACTCCACGGAGGGTGTAAGACCCGTGTGGGCGCGTGTCAAAGCTGTGCG-GGCTCGGCCTCTTTTCCCTGAGAGTCGCGTTGCTTGAGCATGCAGCGCTAAGCAGGTCGTAAACTCGATCTAAGGCTAAATATATCCACAGAACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGCACTCTGGAGAGAGAGTCAAAAGACCGTGAAACCGCTCAGAGTATAAGCCCATGGCAGCTTGGAAGGC-----ATATCGCTAGCGGGGCATC-GGTG-----CTC-TTCCTTTCGGG-GGGGGGCT---CTGGTGTCACTTTGCTTTTGTTGTGGCTCGTCAAGGTAGGGCGGTCAAGTCCGAATCCCGCC-GTCGTGTGGGAGGTTCTTT-GGCGCGTCGT-TGTCTTTCGGTTGGCTTCG--GTTG-ATCGTT-GGGCT-CTTCGTGCTTGGTTCCTCATT----AACA-CGGACGTTCAGACTCAATTGCAAGACGCGATAACC-----------AGCCCACCACGGCACGTTGTGAGGTCACCCACAGGCTC---AACTTTCGATTGTG-ATCCTTGACGCCGAGCAAGCACAATGCGTG--TCGCAATTGTTCCTAACCGGGTTCTTGGGCCAGGACCGTGGAACGACACGCGCTCCAC--AGTCAGGATCGGGCGAT-GACC-GAGTTA--TCTGGTGCGATCC-TCTTGCGACGAGCTGGCTTCTGGCCAAATT-------CCGACGAACAGGTCTC------CCGC-ATGTGCCGCGGGAGATCGCCT---------CCTGACGGTCTGGACACTT----ACAAGTC-----------CTCTC--AGTCGAG-CGTCGGAAAGAGTGGTGTAAAGTCCAA-GCCCATCGGTCAC-GTCTCGAAACACGGGCCAAGGAGTATAGCATGTGTGCAAGTCTAAGGGTCTCACAAAACCCGAAGGCGAAGTGAAAGCAAGTAAGCGGCGGGTGA---TCTACGGA-GAGATCCCGTCAGC-TAGAGGGACCCTC--GGGTCTCTCCGGCTTTGGCA-GAGTTGATCCTGCAGCGGTA--CCGCATACGTACGCTC-AGGCGCAAACTCCAGGCTCACGTTTCGCACTGGTT-CTCG-GACTGTGCTGTGAGCACTGTGGAGCATGCATGCTATGACCCGAAAGATAGTGAACTATGCCTGGCGAGGGCGAAGCCCCAGGAAACTGGGGTGGAGGCCCGTAGCCGTTGTGACGTGCAAATCCAT 'Jesogammars (Annanogammarus) debilis' AACCTCCCGGGCCACCCGGCCTGCGGCGGAATGTTGCGTTAAGGGAAAGGTCGTAGTTAAACCCTACAGCCACGCGATC-CTAAGTT-TGCCACGAATTGGCAATCCCAAACCAAAATGCGGGA--TAAACTCCATGGAGGGTGTCAGACCCGTGTGGACGCGTGTCAATGCTGTGTG-GGCTCGGCCT---TTCCCTGAGAGTCGCGTTGCTTGAGCATGCAGCGCTAAGCAGGTCGTAAACTCGATCTAAGGCTAAATATTTCCACAGGACCGATAGCAAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGCACTCTGAAGAGAGAGTCAAAAGACCGTGAAACCGCTCAGGGTATAAGCCCATGGTGATTTGGAAGGCGGAACACATGATAAGGAGTGCTACTTGGCTTAGTACTGTCCGTCTCGTGCACGCACTTG----GGAGGTTAAGTTG---TGCAGTACATCGT-AA--TG-------CCGCTGCCGATCGGGAG--TTGGGTTGGGAGTTGCTG----GCGGCGCGTGTCAAA-GCGTGTCGTCT---TCG----GCTCTCGCT-CTTC-TCTTGCGATCGACCG-----ACCA--GGAGGTGCAGA-T-----GCGAGACTGTGTTATA-----------TGCCCACCACAACACGTTGCGAGGTCACCCACAGGCTC---GACTGCCGATTGCGCATCCATT-CT-CGGGCAGGC----TGCG-G-----CAGA-G-TCGTTACCAGGCAA-GGTT------CGGCGATGCAGCTCTG-CTCGGA---GT--GGGTCGGGCGGC-GACT-GAGTT----CTGGTATGATCC-TCCTGCGACGAGTTGCTTTCTGACCAGAACAGCGCGCCATGGATTCACATCTCGTGTTTCTGT-GTGTACAAAGGGAAGGCTGCCTTGTCCCCTTAAGGCGGTTTGTGCCCTCTGC-ATGAGCTTAATCAGCAAGGCCTC--CGTCGCGCTGCTGTACCGTGTGGTGTAAAGTCCAA-AGCCATCGGTCAC-GTCTCGAAACACGGGCCAAGGAGTATAGCATGTGTGCAAGTCTAAGGGTTCCACAAAACCTGCAGGCGAAGTGAAAGCAACTTTGTGGCGG-TGATG-TCTATATG-GCTGACCCGTTAGT---GTGAGTC--TC--AGGA--CTCGTGCTTAAGCA-GAGCTGATCCGG-TCCGAAAGGCTGATTGCTAAATGGC-TGGCGCAAGCTCCGGGCTCACGTATATCGCTGGTC-TTCG-GGCTGCGATGTGAGCACCGTGGAGCACTCATGCTATGACCCGAAAGATAGTGAACTATGCCTTGCGAGGGCGAAGCCCCAGGAAACTGGGGTGGAGGCCCGTAGCCGTTGTGACG??????????? 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Dikerogammarus_villosus 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Gammarus_abstrusus 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Gammarus_bousfieldi 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Gammarus_comosus 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Gammarus_electrus 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Gammarus_emeiensis 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Gammarus_gregoryi 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Gammarus_lacustris_BJ1 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Gammarus_stalagmiticus 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Gammarus_takesensis ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ACTGTTTATCCTCCCTTAGCCTCCATTACCTCCCACAGAGGCGGAGCGGTACACCTAGCGATTTTTTCTCTTCACTTAGCAGGGGCATCCTCTATCTTAGGAGCTATAAATTTTATCTCAACAATTATTAATATGCGAAGACCTAGAATGTCCATAGACCAAATACCATTATTTGTTTGGTCTGTTTTCATTACAGCAATTTTACTACTACTTTCTTTACCTGTATTAGCTGGAGCTATTACTATGCTTTTTACTGACCGAAACTTAAATACCTCCTTTTTTGACC??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GGTATTTTGACCGTGCTAAGGTAGCATAATCATTTGTTATTTAATTGGTAACTGGCATGAAAGGTTTAACTAACTT?ATTAAGTTTGTGAGACTAAAT?AAAAAATTAAAGTTAAGGTAAGAATTCTTTAATTT?TCTAGGGGACGATAAGACCCTAGAAGCTTGATAAAATGGATTTTTTTT?GTATTAGAAGTTTG??????????TTTATTTTACTGGGGCGGTAAAAATAACTAAGCTATTTATTATTTGAAG????????????????GATCCTT?AAAATAAAGAAAGAACGGGAAAGTTACTCTAGGGATAACAGTGCAATATTTTTGGATAGACCTTATTGATAAATATGTTTGCAACCTCGATGTTGAATTAAA?ATGTCTTTATAAAGCAGAAAGTATAAA??AGAAGGTTTGTTCAACC Gammarus_taliensis ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TCGAAACAAAGTAGAAAAACCTGAAGGTTTTTCTAAAG?GCGGTTAAAATTTTCACTTACAATGAAAGATGCCCTTTA?GGGCGCTTTTATA??TCGTTAAAAATCTAATAAAGAGTAAGAAATTTTGGTAAGTCTACCTTTTGTATCAGGGGAAGTCAAAAGTAAAACTAGT???AGGATATCGACTTAAGTAGAGCTTTGTATAA??AGAAATTATAATTGAATTTATAGTTTTAATGGAA?TTATGTGGTGAAAAATGTACGGTGCTTATGGTAACTATTTGTTTTTTT????GTTGAAGGGTAAGCTTTCATTAGTTT?AAGTATA?????TAAAAAAATTAGAGAATTAGGCTTTGTATTAGCCAAATTATTAAATT?GTTTCAAATAATCTAGTA????AAATAAAGTAATCTTAAGATT???AAAAGACTTAGTCTATTAATGGTAATAGGCTTAAATAATGAATTTATTGAATAAA?GATTGGAATACTTAAATAACTCATGATAGGTTAGAATGTTTAACAAAAACATTTTCTTTCGCGATAAATAAGATAAGACCTGCCCGGTGATTT??TTAA?CGGCTGCGGTATTTTGACTGTGCTAAGGTAGCATAATCATTTGCTTTTTAATTGGTAGCTGGAATGAAAGGTTAAACTAACTT?ATTTAGTTTGTTGTGTTTTTT?AAGAAATTAAAGTCAAGGTAAGAATTCTTTGATTT?ACTAGGGGACGATAAGACCCTAGAAGCTTGACGATAAGAATATTTATT?AGTTATAAAAATTAA?????????TTTGTTTTACTGGGGCGGTAAAGGTATATAAACTACTAGAATATTGACG????????????????GATCCTT?AAAATAAAGATAAACCGGAAAAGTTACTCTAGGGGTAACAGTGCGATATTTTTGGAGAGATCTTATCGATAGAAATGTTTGCAACCTCGATGTTGAATTAAA?ATGTCTACGTGAAGCAGCAGGTACGTA??AGA?????????????? Gammarus_tastiensis 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Gammarus_tigrinus 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Gammarus_troglophicus_IL 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'Jesogammarus (Annanogammarus) debilis' ??????TGAGCTGGCTTAGCCGGCACCTCTATGAGTATAATCATTCGCTCAGAATTAAGCTCTCCTGGTAATTTAATCGGAGACGATCAAATCTATAACGTTATAGTAACAGCTCACGCATTTGTAATAATTTTCTTCATAGTTATACCAATTATAATTGGCGGCTTTGGAAACTGACTAATTCCTTTAATATTAGGTAGGCCTGACATAGCTTTCCCTCGAATAAATAACATAAGGTTCTGGTTACTCCCCCCTTCCCTAATTTTACTTTTAATATCCGGCCTAATTGAAAGGGGTGTCGGCACCGGTTGAACTGTGTACCCCCCGCTAGCAGGCGCAGAAGCCCATAGCGGGGCTTCTGTGGATCTAGCCATTTTTTCACTACATTTAGCAGGAGCTAGTTCCATTTTAGGGGCAATTAATTTTATTACTACCGTGATTAATATACGGACATCGGGTATTACTATAAGCTCTATGCCTTTATTTGTTTGGTCTGTTTTTATCACAGCCATTCTACTTCTACTCTCTTTACCAGTACTAGCTGGTGCTATCACTATGCTACTAACTGACCGTAACTTAAATACATCTTTTTTTGATCCTAGCGGGGGAGGGGACCCGATTCTCTATCAACATTTGTTTTGATTTTTTGGTCACCC?CCTTTGGGTGTTTTTAAAAATAAAGCTTTATAGCGGT?TCAGTTGCATTGATCAGAGCCTTTTAGGTGTTTTTATAAGAGTACTAATGGGTATTAAAAGTAAATTTTAGTAAGTTATTTACCTTTTGTTTCAGGGTTTTTTTATTTGTAAAATATAGAGATCTTGATTGATTTAGGGCTAAATGTATATATTTATGTTAAAAATAAGTTAAATTGTTTAGTGGTAAAATTTTATCGGTGAGTCTGGTATCTAGTTAAATTTAATAGACTTTAGGTCTACTGTCGGTGACAGG???TGTGGTATAAGGGTAATCTTTATATTAAATTAAACTGTGTATTATTTCGTTAAAACTGAGCTTTAAATTTGCTATGTTACATAGTTTGTTAAAAATAATAATTTTAG??TTGTTTATAGTGTTTATTATT?AGTTTATTGTTCCGTAGTTTATAGAAATATTTATAATGAAGGAATTAGTATTTTTGA???GAGGTGTATAAAAGGAACTCAGTGTATTTTTGATAGTTTAACAAAAACATTTTTTT?ACTAGAGTGTAAAATAAGGCCTGCCCAGTGAAATT?TAAA?CGGCTGCGGTACTCTGACCGTGCTAAGGTAGCATAATCACTTGGTTTTTAATAGGGACCTGGAATGAAAGGTCAAACAAAT???ATTATTTTCTTTTTTGTAAGGAGTGAATTTAAGGTTTAAGTAAAAACGCTTAAGACA?TTTGTGTGACGATAAGACCCTAAAAGCTTTATTTTTAAATTTGGTATA?TTTTTAATAGTTAAAATTGTA???GATAATTGGTTGGGGTAATAACTCTAAAAAAATTAGGGTAGTTTAAATAAGAATAATTAAATTTAGATCCTT?ATTATTAGGATAA?TAGTTGTAGTTACTTTAGGGGTAACAGGGTAATTATTTTATGGAGTTCTTATCTACAAAATAGATTGCTACCTCGATGTTGAATTAAA?ATTTCTACGTGATGCAAAAGATGCGTT??AGAGGGTTTGTTCAACC 'Jesogammarus (Jesogammarus) hebeiensis' 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Platorchestia_japonica 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Gammarus_aequicauda 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Gammarus_annulatus 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Gammarus_balcanicus 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Gammarus_bousfieldi 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Gammarus_comosus ????CCCGAGG--TCTGTGGTTTGTGCTTGCTTGCCTTGCACT-TCCAT--TGCTCTGACGGATGCTTTTATTAGACCAAGCCGCTGAGGACTTGAGAG--CTTGCTCTCC--TGTCTGACTCGTGTAA-TGGTGACTCTGGATAACCA------CTTGACAAGCGCACGTACTTCTCTTCTGAGCAAGACGGCGCTGCCACTTTCGAGTGTCTGCCTTATCAGCTATCAACCGTTCGCTATGCGCGACCGATGGCTTTGACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGAGAGGCAGCCTGAGAGACGGCTACC-ACGTCCAAGGACGGCAGCAGGCACGCAAATTACCCAATCCCAGCAAATGGGGGAGGTAGTGACGAAATCTAACGATGCGGGCGCCCTTTCTGGGGCCCCGCAATCGGAATGGGCACTTTCTAAACAACCTGTTGAGAACCTACTGAAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTTCAGCAGCATCTATTAAAGTTGCTGCGG-TTAAAAGGCTCGCAGTTGAATGTCTGTATCGAGCGCAGGTCAGGTGGACGTTGGGGCGTG-GAAGTACGGGCTTTTTGGATGTCTGGAGGGCTTC--GTGCCCAACGGC--TCCTTGGGCTTTTCCACACACCCCCGTCCGTGACAAGCCTCCTCGCTCG--GGTACATAACGGGAATTGTTAAAACGGAG-TGTGGTCGACGCTTGGGGTGCGTGGCTTC--GGCTGCGTGCTTCTTCGTTC--GGCTGCG-TCAAGCTCCATCGGTT---TCACGGTCACCTTGAGTAAATCAGAGTGCTCAAAGCAGTCGTAGGGGCCTTGCGCCCTGTG-AACAGTCTTGACGGACTGACTTGGTTTTGCATGGCATGTCGGAAGACGACGTCGT------------GTGCTGGCTCAGAGGA--TAAATCAGTG---GTGCAA--GC-CAGC-----CTC------GACGTAATGATTAAAAGGGACGGTCGAGGGCATTGGTATTGCGAGGCGAGAGGTGAAATTCTGTGACCCCCGCAAGACCTCCTGAAGCGAAAGCGTCTGCCAAGGACGTTTTCATTAATCATGAACGAAAGTTAGAGGATCGAAGGCGATCAGATACCGCCCTAGTTCTAACCCTAAACGATGCCAACCATCAATCCGCGCGTAGCACCCT-TCTTAACGGGCTCGGCGGGCAGCTCCCCACTCACGGGAAACCAGAGCCTCTGGGTTCCGGGGGGAGTCTGGTTGCAAAGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAAGGCACCACCAGGCGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGCCATCTCACC-AGGCCAGCACTCTTGTACGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTCGATTCAGTGGATGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATCTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGACTCTCCCCTGCTAACTAGTCGGTTGGATCTTGATCAGAGG-GTTGCGTGCCGAGT--AACTCTCGC-TGTGCGTGGGTTTCGTAGCG---TTGCCTCCCGGCTC--GTTGCGTGC-TCGCGTGTGGTGTTGGAT-GCCTTGGATCACACT--GCACCCCAAGTCC-GCCGCTCATGC--T-ATAACTCTTCTTAGAGGGATTCACGGCACTGAAGCCGTAAGAGACTGAGAGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGCTCTGGGCCGCACGCGCGCTACAATGCCGGGCACAGCAGGTGTTTCTCCTTCTCCGACAGGAGCGGG-TAACCCTCTGAA-AGCCAGTGTTCTT--GCAAGTGCTTCCTCCCTTGTGGAGTT-GCAC-AGAGGCGTGCTTGGG-CCTGGGACTTGCAATTCTTT-CCCACCAACGAGGAATGCCTAGTAGCGGCGGG-TCACTGAGCCC????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Gammarus_crinicornis ATATCCCGAGA----TGTGGCT-GTGCTTGCTTGTCTTGCGCT-TTCAT--TTTTCTGACGGATGCTTTTATTAGACCAAGCCGCTGAGGGCTTCGCGC-ACATTTCAACT--TGTCTGACTCGTGTGA-TGGTGACTCTGGATAACCAA----TTCTGACAAGCGCACGTACTCCTCAT-TGAGCGGGACGGCGCTGCCACTTTCGAGTGTCTGCCTTATCAGCTATCAACCGTTCGTTATGCGCGACCGATGGCTTTGACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGAGAGGCAGCCTGAGAGACGGCTACC-ACGTCCAAGGACGGCAGCAGGCACGCAAATTACCCAATCCCAGCAAATGGGGGAGGTAGTGACGAAATCTAACGATGCGGGCGCCCTTTCTGGGGCCCCGCAATCGGAATGGGCACTTTCTAAACAACCTGTTGAGAACCTACTGAAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTTCAGCAGCATCTATTAAAGTTGCTGCGG-TTAAAAGGCTCGCAGTTGAATGTCTGTATCGAGCGCAGGTCAGGTGGACGTTGGAGCGTG-GAAGTACGGGCAGTT-GGATGTTGTGTGTATTGC--GTATCACATGGC--TCCTTCGGCTTTTCCACACACTCCCGTCCGTAACAAGCCTCCTCGCTCG--GGTACATAACGGGAATCGGTTAAACGGAG-TGTGGCA-TAGTACTTTTATA----------------GTGCGAC---------TGCTGCG-TTAAGCTCCATCGGTT---TCACGGTCACCTTGAGTAAATCAGAGTGCTCAAAGCAGTCGTAGGGGCCTTGCGCCCTGTG-AACAGTCTTGACGGACTGACTTGGTTTTGCATGGCATGTCGGAAGACGACGTCGT------------GTGCTGGCTCAGAGAT--ATAATCAGTG---GTACAA--GC-CAGC-----CTC------GACGTAATGATTAAAAGGGACGGTCGAGGGCATTGGTATTGCGGGGCGAGAGGTGAAATTCTGTGACCCCCGCAAGACCTCCTGAAGCGAAAGCGTCTGCCAAGGACGTTTTCATTAATCATGAACGAAAGTTAGAGGATCGAAGGCGATCAGATACCGCCCTAGTTCTAACCCTAAACGATGCCAACCATCAATCCGCGCGTAGCACCCT-TCTTAACGGGCTCGGCGGGCAGCTCCCCACTCACGGGAAACCAGAGCCTCTGGGTTCCGGGGGGAGTCTGGTTGCAAAGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAAGGCACCACCAGGCGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGCCATCTCACC-AGGCCAGCACTCTTGTACGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTCGATTCAGTGGATGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATCTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGACTCTCCCCTGCTAACTAGTCGGTTGGATCTTGATCAGTGG-GTTGCGTGCTGAGT--AGTGCTCTT-CGCGGGCGTGTGTTCACAT----GGGCTTGCTCGTGT--GTGGCA------TATGTTTGTGTTGGGT-GCCTTGGATAACACT--GCACCCCAAGTCC-GCCGCTTATGC--T-ATAACTCTTCTTAGAGGGATTCACGGCACTGAAGCCGTAAGAGACTGAGAGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGCTCTGGGCCGCACGCGCGCTACAATGCCGGGTTCAGCAGGTGTTATTCCTGCTCCGTTAGGAGCGGG-TAACCCTATGAA-AGCCAGTGATTTTATGCAAGTGCTTCCTCC-TCACGGAGTT-GCAC-AAAGGCGTGCTTGGG-CCTGGGACTTGCAATTTTTT-CCCACCAACGAGGAATGCCTAGTAGCGGCGGG-TCACTGAGCCCGCCGTGACTCAGTCCCTGCCCTTTGTACA-CACCGCCCGTCGCTACTACCGATT-GGGTGTACCAGTGAGAGCCTTGGA-CTGGCGTCCGTTGTGGCTCGCAAGA Gammarus_curvativus ATATCCCGAAG--GCGGTGGCT-GTGCTTGCTTGTCTTGCGCT-TTCGC--TGCTCTGACGGATGCTTTTATTAGACCAAGCCGCTGAGGACTTGAGGG-GTTCTCTCTCC--TGTCTGACTCGTGTAA-TGGTGACTCTGGATAACCAAA---TTATGACAAGCGTACGTACTTCTCTTCTGAGCGAGACGACGCTGCCACTTTCGAGTGTCTGCCTTATCAGCTATCAACCGTTCGTTATGCGCGACCGATGGCTTTGACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGAGAGGCAGCCTGAGAGACGGCTACC-ACGTCCAAGGACGGCAGCAGGCACGCAAATTACCCAATCCCAGCAAATGGGGGAGGTAGTGACGAAATCTAACGATGCGGGCGCCCTTTCTGGGGCCCCGCAATCGGAATGGGCACTTTCTAAACAACCTGTTGAGAACCTACTGAAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTTCAGCAGCATCTATTAAAGTTGCTGCGG-TTAAAAGGCTCGCAGTTGAATGTCTGTATCGAGCGCAGGTCAGGTGGACGTTGGGGCGTG-GAAGTACGGGCAGTT-GGATGTCCGAGGGGTTTCGGGCTCGTCGCGGC--TCCTTCGGCTTTTCCACACACCCCCGTCCGTGACAAGCCTCCTCGCTCG--GGTACATAACAGGAATCGGTTAAACGGAG-TGTGGTCGGAGGTTGGGGTGCGTGGTTTC--GGTCGCGTGCTTCTCTTCTTTCGGCTGCG-TTAAGCTCCATCGGTT---TCACGGTCACCTTGAGTAAATCAGAGTGCTCAAAGCAGTCGTAGGGGCCTTGCGCCCTGTG-AACAGTCTTGACGGACTGACTTGGTTTTGCATGGCATGTCGGAAGACGACGTCGT------------GTGCTGGCTCAGAGGA--TAAATCAGTG---GTACAA--GC-CAGC-----CTC------GACGTAATGATTAAAAGGGACGGTCGAGGGCATTGGTATTGCGAGGCGAGAGGTGAAATTCTGTGACCCCCGCAAGACCTCCTGAAGCGAAAGCGTCTGCCAAGGACGTTTTCATTAATCATGAACGAAAGTTAGAGGATCGAAGGCGATCAGATACCGCCCTAGTTCTAACCCTAAACGATGCCAACCATCAATCCGCGCGTAGCACCCT-TCTTAACGGGCTCGGCGGGCAGCTCCCCACTCACGGGAAACCAGAGCCTCTGGGTTCCGGGGGGAGTCTGGTTGCAAAGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAAGGCACCACCAGGCGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGCCATCTCACC-AGGCCAGCACTCTTGTACGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTCGATTCAGTGGATGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATCTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGACTCTCCCCTGCTAACTAGTCGGTTGGATCTTGATCAGCGG-GTTGCGTGCCGAGT--AACTCTCGC-TGTGCGTGGCGTGCGTGGCT---GGGCCTCACGGTTCACGTCGCGTGC-CCGCGTGCGGTGCTGGAT-GCCTTGGATCACACT--GCACCCCAAGTCC-GCCGCTTATGC--T-ATAACTCTT?TTAGAGGGATTCACGGCACTGAAGCCGTAAGAGACTGAGAGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGCTCTGGGCCGCACGCGCGCTACAATGCCGGGCACAGCAGGTGTTTCTCCTTCTCCGACAGGAGCGGG-TAACCCTCTGAA-AGCCAGTGTTCTT--GCAAGTGCTTCCTCCCTCGTGGAGTT-GCAC-AGAGGCGTGCTTGGG-CCTGGGACTTGCAATTCTTT-CCCACCAACGAGGAATGCCTAGTAGCGGCGGG-TCACTGAGCCCGCTGTGACTCAGTCCCTGCCCTTTGTACA-CACCGCCCGTCGCTACTACCGATT-GGGTGTACCAGTGAGAGCCTTGGA-CTGGCGTCCGTTGTTGCTCGC???? Gammarus_duebeni_MA 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Gammarus_duebeni_SC1 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Gammarus_lacustris_BJ1 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Gammarus_oceanicus 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Gammarus_tigrinus ATATCCCGAAG--GTGGCGTTT-GTGCTTGCTTGCCTTGCGCT-CTCGT--TGCTCTGACGGATGCTTTTATTAGACCAAGCCGCTGAGGACTTGGAGG--CAA-CTCCT---TGTTCGACTCGTATAA-TGGTGACTCTGGATAACCAAA---TTCTGACAAGCGCACGTACTTCTCTTCTGAGCGAGACGGCGCTGCCACTTTCGAGTGTCTGCCTTATCAGCTATCAACCGTTCGTTATGCGCGACCGATGGCTTTGACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGAGAGGCAGCCTGAGAGACGGCTACC-ACGTCCAAGGACGGCAGCAGGCACGCAAATTACCCAATCCCAGCAAATGGGGGAGGTAGTGACGAAATCTAACGATGCGGGCGCCCTTTCTGGGGCCCCGCAATCGGAATGGGCACTTTCTAAACAACCTGTTGAGAACCTACTGAAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTTCAGCAGCATCTATTAAAGTTGCTGCGG-TTAAAAGGCTCGCAGTTGAATGTCTGTATCGAGCGCAGGTCAGGTGGACGTTGGGGCGTG-GAAGTACGGGCAGTTGGGGCTGTTGGATTCCTCA--GGACTGT--GGC--CCCTTCGGCTTTTCCACACACCCCCGTCCGTGACAAGCCTCCTCGCTCG--GGTACATAACGGGAATCGGTCAAACGGAG-TGTGGTCGTGTGTTCTTTCTCGTGGGCTT--CTGGTCTGCGGGGGAGGCGCGCGGCTGCG-TTAAGCTCCATCGGTT---TCACGGTCACCTTGAGTAAATCAGAGTGCTCAAAGCAGTCGTAGGGGCCTTGCGCCCTGTG-AACAGTCTTGACGGACTGACTTGGTTTTGCATGGCATGTCGGAAGACGACGTCGT------------GTGCTGGCTCAGAGGA--TAAATCAGTG---GTACAA--GC-CAGC-----CTC------GACGTAATGATTAAAAGGGACGGTCGAGGGCATTGGTATTGCGAGGCGAGAGGTGAAATTCTGTGACCCCCGCAAGACCTCCTGAAGCGAAAGCGTCTGCCAAGGACGTTTTCATTAATCATGAACGAAAGTTAGAGGATCGAAGGCGATCAGATACCGCCCTAGTTCTAACCCTAAACGATGCCAACCATCAATCCGCGCGTAGCACCCT-TCTTAACGGGCTCGGCGGGCAGCTCCCCACTCACGGGAAACCAGAGCCTCTGGGTTCCGGGGGGAGTCTGGTTGCAAAGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAAGGCACCACCAGGCGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGCCATCTCACC-AGGCCAGCACTCTTGTACGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTCGATTCAGTGGATGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATCTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGACTCTCCCCTGCTAACTAGTCGGTTGGATCTTGATCAGCGG-GTTGCGTGCCGAGT--AACTCTCGC-TGCGTTTTGGCTTTGCGCACTCTGTGTGC-ACTGTC--------------CTTTCGTGGTGTTGGAT-GCCTTGGATCACACT--GCACCCCAAGTCC-GCCGCTTATGC--T-ATAACTCTTCTTAGAGGGATTCACGGCACTGAAGCCGTAAGAGACTGAGAGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGCTCTGGGCCGCACGCGCGCTACAATGCCGGGCACAGCAGGTGTTTCTCCTGCTCCGACAGGAGCGGG-TAACCCTCTGAA-AGCCAGTGTTCTT--GCAAGTGCTTCCTCCCTCGTGGAGTT-GCAC-AAAGGCGTGCTTGGG-CCTGGGACTTGCAATTCTTT-CCCACCAACGAGGAATGCCTAGTAGCGGCGGG-TCACTGAGCCCGC??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Gammarus_troglophicus_IL 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Gammarus_troglophilus_LO 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'Jesogammarus (Annanogammarus) debilis' ATATCCCGAAG--GCGTGTTC-----CTTGCGTTCGC---------------GCTCTGACGGATGCTTTTATTAGACCAAACCGCTGAGGGCTTCGGCGTACGTGGCGCCT--CGCTTGACTCGTGCTA-TGGTGACTCTGAATAACC-----TCTTGGACAAGCGCACGTACCCCTCTTTTGAGTGGGACGGCGCTGCCACTTTCGAGTGTCTGCCTTATCAGCTATCAACCGTTCGTTATGCGCGACCGATGGCTTTGACGGGTAACGGGGAATCAGTGTTCGATTCCGGAGAGGCAGCCTGAGAGACGGCTACC-ACGTCCAAGGACGGCAGCAGGCACGCAAATTACCCAATCCCAGCAACTGGGGGAGGTAGTGACGAAATCTAACGATGCGGGCGCCCTTTCTGGGGCCCCGCAATCGGAATGGGCACTTTCTAAACAACCTGTTGAGAACCTACTGAAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTTCAGCAGCATCTATTAAAGTTGCTGCGG-TTAAAAGGCTCGCAGTTGAATGTCAGTATCGAGCGCAGGTCAGGTGGACGTTGGGGTGTGAGATCCAAAGG---TT--GGTGTGCTCTGTCAATG--CCTGGCGGCGTGTG-CCTTC--CTTCTC-ACATACCCCCGTCCGTGACAAGCCTCCTCGCTTGT--GTACATATCGG-AATCGATCAAT-GGAG-TGTGGTTCGTGCTTGGCGTGGCTT---GT--GGTTCGCGGTGCTTTCGCTTGGGGGCCACGTTGAGCTCCTTCGGTT---TTATGGTCACCTTGAGTAAATCAGAGTGCTCAAAGCAGTCGTAGGGGCCTTGCGCCCTGTG-AACAGTCTTGACGGACTGACTTGGTTTTGCATGGCATGTCGGAAGACGACGTCGT------------GTGCTGGCTCAGAG-A--TTGATCAGTG---GTAAAA--GC-CAGC-----CTC------GACGTACTGATTAAGAGGGACTGTCGAGGGCATTGGTATTGCGGGGCGAGAGGTGAAATTCTATGACCCCCGCAAGACCTCCTGAAGCGAAAGCGTCTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCATGAACGAAAGTTAGAGGATCGAAGGCGATCAGATACCGCCCTAGTTCTAACCCTAAACGATGCCAACCATCAATCCGCGCGTAGCACCCT-TCTTAACGGGCTCGGCGGGCAGCTCCCCACTCACGGGAAACCAGAGTCTCTGGGTTCCGGGGGGAGTCTGGTTGCAAAGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAAGGCACCACCAGGCGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGCCATCTCACC-AGGCCAGCACTCTTGTATGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTCGATTCAGTGGATGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATCTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGACTCTCCCCTGCTAACTAGTCGGTTGGATCTTGCTCGGTGA-GTTGCGCACCGAGT--T-CACTCAC-GG-GCGTGGGTTGCGCGCGTGTGGCTGGCTTCGGTTGGTCATGCGTGT--GTGGCTTGCTGTTCGTGGGCCTCGGACCGC-----GCACTCCAAGTCC-GCCGCTTATGC--T-ATAACTCTTCTTAGAGGGATTCACGGTTCTGAAGCCGTCAGAGACTGAGAGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGCTCTGGGCTGCACGCGCGCTACAATGCCGGGCACAGCAGGTCTTTTCCCTGCTCCGTCAGGAGCGGG-TAATCCTCTGAA-AGCCAGT----TT--------GTAC------TCGTGTCTGA--CACGAAAGGCGTGCTTGGG-CCTGGGACTTGCAATTCTTT-CCCACAAACGAGGAATGCCTAGTAGCGGCGGG-TCACTGAGCCCGCTGTGACTCAGTCCCTGCCCTTTGTACA-CACCGCCCGTCGCTACTACCGATT-GGGTGTACCAGTGAGAGCCTTGGA-CTGGCGTCCA??????????????? 'Jesogammarus (Jesogammarus) hebeiensis' ATATCCCGAAG--GCGTGAGC-----CTTGTGTTCGC---------------GCTCTGACGGATGCTTTTATTAGACCAAACCGCTGAGGGCTTCGGCGTATGTGGTGCCA--TGCTTGACTCGTGCTA-TGGTGACTCTGAATAACC-----TCTTGGACAAGCGCACGTACCCCTCTTTTGAGTGGGACGGCGCTGCCACTTTCGAGTGTCTGCCTTATCAGCTATCAACCGTTCGTTATGCGCGACCGATGGCTTTGACGGGTAACGGGGAATCAGTGTTCGATTCCGGAGAGGCAGCCTGAGAGACGGCTACC-ACGTCCAAGGACGGCAGCAGGCACGCAAATTACCCAATCCCAGCAACTGGGGGAGGTAGTGACGAAATCTAACGATGCGGGCGCCCTTTCTGGGGCCCCGCAATCGGAATGGGCACTTTCTAAACAACCTGTTGAGAACCTACTGAAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTTCAGCAGCATCTATTAAAGTTGCTGCGG-TTAAAAGGCTCGCAGTTGAATGTCAGTATCGAGCGCAGGTCAGGTGGACGTTGGGGTGTGAGATCCAAAGG---TT-GG-TGTGCTCTGTCTACG--CCTCTCGGCGTGTG-CCTTC--CTTCTC-ACATACCCCCGTCCGTGACAAGCCTCCTCGCTTGT--GTACATATCGG-AATCGATCAAT-GGAG-TGTGGTTCGTGCTTGGCGCGGCTTCGTGT--GGTTCGCGGTGCTTTCGCTTGGGGGCCACGTTAAGCTCCTTCGGTT---TTATGGTCACCTTGAGTAAATCAGAGTGCTCAAAGCAGTCGTAAGGGCCTTGCGCCCTGTG-AACAGTCTTGACGGACTGACTTGGTTTTGCATGGCATGTCGGAAGACGACGTCGT------------GTGCTGGCTCAGAG-A--TTGATCAGTG---GTAAAA--GC-CAGC-----CTC------GACGTACTGATTAAGAGGGACTGTCGAGGGCATTGGTATTGCGGGGCGAGAGGTGAAATTCTATGACCCCCGCAAGACCTCCTGAAGCGAAAGCGTCTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCATGAACGAAAGTTAGAGGATCGAAGGCGATCAGATACCGCCCTAGTTCTAACCCTAAACGATGCCAACCATCAATCCGCGCGTAGCACCCT-TCTTAACGGGCTCGGCGGGCAGCTCCCCACTCACGGGAAACCAGAGTCTCTGGGTTCCGGGGGGAGTCTGGTTGCAAAGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAAGGCACCACCAGGCGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGCCATCTCACC-AGGCCAGCACTCTTGTATGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTCGATTCAGTGGATGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATCTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGACTCTCCCCTGCTAACTAGTCGGTTGGATCTTGCTCGGTGA-GTTGCGCACCGGGT--T-CACTCGC-GG-GCGTGGGTTGCGCGCGTGTGGCTGGCTTCGGCTGGTCATGCGTGT--GTGGCTTGCTGTTCGTGAGCCTCGGACCGC-----GCACTCCAAGTCC-GCCGCTTATGC--T-ATAACTCTTCTTAGAGGGATTCACGGTTCTGAAGCCGTCAGAGACTGAGAGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGCTCTGGGCTGCACGCGCGCTACAATGCCGGGCACAGCAGGTCTTTTCCCTGCTCCGTCAGGAGCGGG-TAATCCTCTGAA-AGCCAGT----TT--------GTAC------TCGTGTCTGA--CACGAAAGGCGTGCTTGGG-CCTGGGACTTGCAATTCTTT-CCCACAAACGAGGAATGCCTAGTAGCGGCGGG-TCACTGAGCCCGCTGTGACTCAGTCCCTGCCCTTTGTACA-CACCGCCCGTCGCTACTACCGATT-GGGTGTACCAGTGAGAGCCTTGGA-CTGGCGTCCGTA????????????? Platorchestia_japonica ?????????????????????????CAACTCATATCCCGAGGTGCGCAA---GCACCGACGGAAGCACTTATTAGACCAATATGCTCGGCGTTTGAGTG--TGAGGC------GTCGCCGCTCGCATAAATGGTGACTCTGGATAATTA-----CCTGGACGAGCGCACGTATCTGTTC---AAGCAGAACGGCGCCGCCTCTTTCGAGTGTCTGCCTTATCAGCCATCAATCGCTCGTTATGTGCGAACGATGGCCTTGACGGGTAACGGGGAATCAGTGTTCGATTCCGGAGAGGCAGCCTGAGAAACGGCTACC-ACGTCTAAGGACGGCAGCAGGCACGCAAATTACCCAATCCCAGAACTCTGGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACGATGTGGGCGCTCCTTCTGGGGCCCCACAATCGGAATGAGTATGTCTTAAATAACCTGTCGAGAACCCACTGAAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTTCAGTAGCATCTATTAAAGTTGCTGCGG-TTAAAAGGCTCGCAGTTG------------GAGC-CA---CTGGTGT---TTGGTATATG-GAGCAGCTGGACGTT-GGTTGCCTTCGTGCCGTC--CTGCTAGTCTGC--TCCTGACTCTATGGCACTGAA-----TATGGGAAAAACCCTCTCTGGTTTGGGCGTCTGATCAGAGTGTTCGGGCCGGAGGTGTGCTT-GGGGAG-GCCCGCGTGCCGAA--CCGTGT--TTTTGTGCTCGCCTCTGTGCTCTTACTTGGAGGGGGTGACTTCTGTGTCACCTTGAGTAAATCATGGTGCTCACAGCAGTCGTGCGGGCCTTGTGCCCTGTG-AACAGTCTATGCGGACTGAATTGGTTTTGCAAGGCATGACGAAACATGACGTCGCTGCTGGTCGCGAGTGTGGGGTGCGGGCGTGTGCGCAAGTGCGCGTCCGTTTGCTCAGCGGTTGCCCAGTAGTGACGTAATGATCAATGGAGACGGTAGCTGGCATTGGTATTGCGCGGCGAGAGGTGAAATTCTGCGACCCCCGCAAGACCTCCTAAAGCGAAGGCGTCTGCCAAGGACGTGTTCACCAATCATGAACGAAAGTCAGAGGATCGAAGGCGATCAGATACCGCCCTAGTTCTGACCCTAAACGATGCCAACCATCAATCCGCGTG-AGCACCCTATCT-AACGGGCTCGGCGGGCAGCTCCCTTCTTCCGGGAAACCAGAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTCTGGTTGCAAAGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAAGGCACCACCAGGCGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGCCATCTTACC-AGGCCAGCACTCTGGCATGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTCGATTCAGTGGACGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATCTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGACTCTCCTCTGCTAAATAGTCGGCTGGATCTTGAATTGCTGAGTTGCTCATTGCCTCGTTCGCGCGTGTCTGCGCTCCC-GCGTTTTGC-GGTCGTGTCCTTGCCTTTGCCTTCACGGGCGGGTGTCTTTG--GCACTCCAAGTCCGTCGGC-TCACGCCCGCTGTTGCGGGTTGTGTGGTACAAGTTCTTCTTAGAGAGATTGACGGCTCTGAAGCCGTACGAGAATGAGAGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTCAGATGCCCTGGGCCGCACGCGCGCTACAATGCTGGACACAGCAGGTCTAGC--CTGCTCCGAGAGGAGCGGG-TAACCCTGTCAAAGTCCTGAGTTGTG--TATCGAGCACCACACTTCGTGGT----GCAT--TGGGCGTGCTTGGG-CCTGGGGCTTGCAATTCTTT-CCCACAAACAAGGAATGCCTTGTAGTGGCGAG-TCACTGAGCTCGCTGTGACTCAGTCCCTGCCCTTTGTACA-CACCGCCCGTCGCTACTACCGATT-GGGTGTACCAGTGAGAACCTTGGA-CTGGCGTCCGA?????????????? Sinogammarus_chuanhui_GZ ATATCCCGAAG--GCGGTGGTT-GTGCTTGCTTGTCTTGCTCT-TCCGC--TGCTCTGACGGATGCTTTTATTAGACCAAGCCGCTGAGGACTTGAGAGC-TTCGCTCTCC--TGTCTGACTCGTGTAA-TGGTGACTCTGGATAACCAA------TTGACAAGCGCACGTACTCCTCTTCTGAGCGAGACGGCGCTGCCACTTTCGAGTGTCTGCCTTATCAGCTATCAACCGTTCGTTATGCGCGACCGATGGCTTTGACGGGTAACGGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGAGAGGCAGCCTGAGAGACGGCTACC-ACGTCCAAGGACGGCAGCAGGCACGCAAATTACCCAATCCCAGCAAATGGGGGAGGTAGTGACGAAATCTAACGATGCGGGCGCCCTTTCTGGGGCCCCGCAATCGGAATGGGCACTTTCTAAACAACCTGTTGAGAACCTACTGAAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTTCAGCAGCATCTATTAAAGTTGCTGCGG-TTAAAAGGCTCGCAGTTGAATGTCTGTATCGAGCGCAGGTCAGGTGGACGTTGGGGCGTG-GAAGTACGGGCAGTT-GGATGTCCGGAGGGCTCC--GTGCCCAACGGC--TCCTTCGGCTTTTCCACACACCCCCGTCCGTGACAAGCCTCCTCGCTCG--GGTACATAACGGGAATCGGTTAAACGGAG-TGTGGTCGGAGGTTGAGGTGCGTGGCTTC--GGTTGCGTGCTTCTTCTTTC--GGCTGCG-TTAAGCTCCATCGGTT---TCACGGTCACCTTGAGTAAATCAGAGTGCTCAAAGCAGTCGTAGGGGCCTTGCGCCCTGTG-AACAGTCTTGACGGACTGACTTGGTTTTGCATGGCATGTCGGAAGACGACGTCGT------------GTGCTGGCTCAGAGGA--TAAATCAGTG---GTACAA--GC-CAGC-----CTC------GACGTAATGATTAAAAGGGACGGTCGAGGGCATTGGTATTGCGAGGCGAGAGGTGAAATTCTGTGACCCCCGCAAGACCTCCTGAAGCGAAAGCGTCTGCCAAGGACGTTTTCATTAATCATGAACGAAAGTTAGAGGATCGAAGGCGATCAGATACCGCCCTAGTTCTAACCCTAAACGATGCCAACCATCAATCCGCGCGTAGCACCCT-TCTTAACGGGCTCGGCGGGCAGCTCCCCACTCACGGGAAACCAGAGCCTCTGGGTTCCGGGGGGAGTCTGGTTGCAAAGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAAGGCACCACCAGGCGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGCCATCTCACC-AGGCCAGCACTCTTGTACGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTCGATTCAGTGGATGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATCTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGACTCTCCCCTGCTAACTAGTCGGTTGGATCTTGATCAGCGG-GTTGCGTGCCGAGT--AACTCTCGC-TGTGCGTGGTTCGTAGCG-----TGGCCTCACGGCTT--GTTACGGCC---TCGCGTGGTGTTGGAT-GCCTTGGATCACACT--GCACCCCAAGTCC-GCCGCTTATGC--T-ATAACTCTTCTTAGAGGGATTCACGGCACTGAAGCCGTAAGAGACTGAGAGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGCTCTGGGCCGCACGCGCGCTACAATGCCGGGCACAGCAGGTGTTTCTCCTTCTCCGACAGGAGCGGG-TAACCCTCTGAA-AGCCAGTGTTCTT--GCAAGTGCTTCCTCCCTCGTGGAGTT-GCAC-AGAGGCGTGCTTGGG-CCTGGGACTTGCAATTCTTT-CCCACCAACGAGGAATGCCTAGTAGCGGCGGG-TCACTGAGCCCGCTGTGACTCAGTCCCTGCCCTTTGTACA-CACCGCCCGTCGCTACTACCGATT-GGGTGTACCAGTGAGAGCCTTGGA-CTGGCGTCCGGTGTTGCTCGCAAGA ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = Gammarus_18SrDNA) = N: 1-2064; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = Gammarus_18SrDNA) = N: 1-2064; END; BEGIN TREES; TITLE Tb8516; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Gammarus_pseudolimnaeus_IL, 2 Gammarus_pexus, 3 Gammarus_pengi, 4 Gammarus_nipponensis, 5 Gammarus_nekkensis_HB1, 6 Gammarus_nekkensis_BJ2, 7 Gammarus_nekkensis_BJ1, 8 Gammarus_montanus, 9 Gammarus_minus_IL, 10 Gammarus_martensi, 11 Gammarus_madidus, 12 Gammarus_locusta_CA, 13 Gammarus_liui, 14 Gammarus_lichuanensis_HB2, 15 Gammarus_lichuanensis_HB1, 16 Gammarus_lacustris_QH1, 17 Gammarus_lacustris_NA, 18 Gammarus_lacustris_BJ1, 19 Gammarus_koreanus, 20 Gammarus_kangdingensis, 21 Gammarus_gregoryi, 22 Gammarus_gonggaensis_BX2, 23 Gammarus_gonggaensis_BX1, 24 Gammarus_glabratus, 25 Gammarus_fossarum_PO, 26 Gammarus_fasciatus_MN, 27 Gammarus_emeiensis, 28 Gammarus_elevatus, 29 Gammarus_electrus, 30 Gammarus_decorosus, 31 Gammarus_curvativus, 32 Gammarus_crinicornis, 33 Gammarus_craspedotrichus, 34 Gammarus_comosus, 35 Gammarus_brevipodus, 36 Gammarus_bousfieldi, 37 Gammarus_accretus, 38 Gammarus_abstrusus, 39 Gammarus_pulex_NL, 40 Gammarus_qiani, 41 Gammarus_riparius, 42 Gammarus_roeseli, 43 Gammarus_shanxiensis, 44 Gammarus_shenmuensis, 45 Gammarus_sichuanensis, 46 Gammarus_sinuolatus, 47 Gammarus_sp1, 48 Gammarus_sp2, 49 Gammarus_sp3, 50 Gammarus_sp4, 51 Gammarus_sp5, 52 Gammarus_sp6, 53 Gammarus_stalagmiticus, 54 Gammarus_takesensis, 55 Gammarus_taliensis, 56 Gammarus_tastiensis, 57 Gammarus_tigrinus, 58 Gammarus_translucidus, 59 Gammarus_troglophicus_IL, 60 Sinogammarus_chuanhui_GZ, 61 Sinogammarus_chuanhui_SC, 62 'Jesogammars (Annanogammarus) debilis', 63 'Jesogammarus (Jesogammarus) hebeiensis', 64 Platorchestia_japonica, 65 Crangonyx_pseudogracilis, 66 Dikerogammarus_villosus_GM; TREE Gammarus_28S = [&R] (64,((((((((((21,31),47),((38,46),(22,((24,27),23)))),(((39,52),25),42)),(((48,((5,49),(6,7),50)),58),(((((((((30,44,16),2),((11,18),17)),55),28),8),53),(56,54)),29),((((43,13),10),(51,3)),20),(41,(15,14)),(34,((33,37),61,60)),(4,19),45,40)),35),(9,((36,(1,59)),(26,57)))),12),32),66),(63,62),65); END; BEGIN TREES; TITLE Tb8515; LINK TAXA = Taxa3; TRANSLATE 1 Dikerogammarus_villosus, 2 Crangonyx_pseudogracilis, 3 Crangonyx_forbesi, 4 Platorchestia_japonica, 5 'Jesogammarus (Jesogammarus) hebeiensis', 6 'Jesogammarus (Annanogammarus) debilis', 7 Sinogammarus_chuanhui_GZ, 8 Gammarus_troglophilus_LO, 9 Gammarus_troglophicus_IL, 10 Gammarus_tigrinus, 11 Gammarus_takesensis, 12 Gammarus_sp6, 13 Gammarus_sp5, 14 Gammarus_sp4, 15 Gammarus_sp3, 16 Gammarus_sp2, 17 Gammarus_sp1, 18 Gammarus_sinuolatus, 19 Gammarus_salinus, 20 Gammarus_roeseli, 21 Gammarus_qiani, 22 Gammarus_pulex_NL, 23 Gammarus_pulex_SC, 24 Gammarus_pulex_GM, 25 Gammarus_pseudolimnaeus_IL, 26 Gammarus_oceanicus, 27 Gammarus_nipponensis, 28 Gammarus_nekkensis_HB1, 29 Gammarus_nekkensis_BJ2, 30 Gammarus_mucronatus, 31 Gammarus_montanus, 32 Gammarus_minus_IL, 33 Gammarus_martensi, 34 Gammarus_locusta_FR, 35 Gammarus_locusta_CA, 36 Gammarus_locusta_BS, 37 Gammarus_lichuanensis_HB1, 38 Gammarus_lacustris_WA, 39 Gammarus_lacustris_VI, 40 Gammarus_lacustris_HV, 41 Gammarus_lacustris_BK, 42 Gammarus_lacustris_BJ1, 43 Gammarus_koreanus, 44 Gammarus_kangdingensis, 45 Gammarus_gregoryi, 46 Gammarus_gonngaensis_BX2, 47 Gammarus_gonggaensis_BX1, 48 Gammarus_glabratus, 49 Gammarus_fossarum_PO, 50 Gammarus_fasciatus_WA, 51 Gammarus_fasciatus_MN, 52 Gammarus_emeiensis, 53 Gammarus_duebeni_SC3, 54 Gammarus_duebeni_SC2, 55 Gammarus_duebeni_SC1, 56 Gammarus_duebeni_MA, 57 Gammarus_curvativus, 58 Gammarus_crinicornis, 59 Gammarus_comosus, 60 Gammarus_bousfieldi, 61 Gammarus_balcanicus, 62 Gammarus_annulatus, 63 Gammarus_aequicauda, 64 Gammarus_abstrusus; TREE Gammarus_18S = [&R] (4,(((((((28,((61,11),((41,40,39,38,42),31)),27,44,33,59,57,64,(((52,48),47),46),17,((16,15,29),14),18,21,13,7,37),43),((((((30,62),((50,10),51)),60),(8,(9,25))),(((26,19,36),35),(56,(55,(54,53))))),32)),((49,((12,24,22),23)),20)),((34,63),(45,58))),1),(6,5)),(3,2)); END; BEGIN TREES; TITLE Tb8517; LINK TAXA = Taxa2; TRANSLATE 1 Gammarus_abstrusus, 2 Gammarus_accretus, 3 Gammarus_aequicauda, 4 Gammarus_annulatus, 5 Gammarus_balcanicus, 6 Gammarus_bousfieldi, 7 Gammarus_comosus, 8 Gammarus_craspedotrichus, 9 Gammarus_crinicornis, 10 Gammarus_curvativus, 11 Gammarus_decorosus, 12 Gammarus_duebeni_MA, 13 Gammarus_electrus, 14 Gammarus_emeiensis, 15 Gammarus_fasciatus_MN, 16 Gammarus_fasciatus_WA, 17 Gammarus_fossarum_PO, 18 Gammarus_glabratus, 19 Gammarus_gonggaensis_BX1, 20 Gammarus_gonggaensis_BX2, 21 Gammarus_gregoryi, 22 Gammarus_kangdingensis, 23 Gammarus_koreanus, 24 Gammarus_lacustris_BJ1, 25 Gammarus_lacustris_BJ2, 26 Gammarus_lacustris_BK, 27 Gammarus_lacustris_HV, 28 Gammarus_lacustris_NA, 29 Gammarus_lacustris_QH1, 30 Gammarus_lacustris_VI, 31 Gammarus_lacustris_WA, 32 Gammarus_lichuanensis_HB1, 33 Gammarus_lichuanensis_HB2, 34 Gammarus_locusta_CA, 35 Gammarus_locusta_FR, 36 Gammarus_martensi, 37 Gammarus_minus_IL, 38 Gammarus_montanus, 39 Gammarus_mucronatus, 40 Gammarus_nekkensis_BJ1, 41 Gammarus_nekkensis_BJ2, 42 Gammarus_nekkensis_HB1, 43 Gammarus_nipponensis, 44 Gammarus_oceanicus, 45 Gammarus_pexus, 46 Gammarus_pseudolimnaeus_IL, 47 Gammarus_pulex_NL, 48 Gammarus_qiani, 49 Gammarus_riparius, 50 Gammarus_roeseli, 51 Gammarus_sichuanensis, 52 Gammarus_sinuolatus, 53 Gammarus_sp1, 54 Gammarus_sp2, 55 Gammarus_sp3, 56 Gammarus_sp4, 57 Gammarus_sp5, 58 Gammarus_sp6, 59 Gammarus_stalagmiticus, 60 Gammarus_takesensis, 61 Gammarus_taliensis, 62 Gammarus_tastiensis, 63 Gammarus_tigrinus, 64 Gammarus_translucidus, 65 Gammarus_troglophicus_IL, 66 Sinogammarus_chuanhui_GZ, 67 Sinogammarus_chuanhui_SC, 68 'Jesogammarus (Annanogammarus) debilis', 69 'Jesogammarus (Jesogammarus) hebeiensis', 70 Dikerogammarus_villosus, 71 Crangonyx_pseudogracilis, 72 Platorchestia_japonica; TREE Gammarus_Mt = [&R] (72,71,((68,69),(70,((((2,8),(7,((64,66),67))),(((((((((3,9),35),(34,44)),12),(((4,39),((15,16),63)),50)),(((5,60),62),((((11,61),((((24,25),26),(27,(30,31))),29)),28),54),38)),((10,53),21)),(((6,(46,65)),37),((1,((14,(19,20)),18)),52),((13,(43,(23,45))),(42,(40,41),55,56,59)))),((((17,47),58),(49,(32,33))),(((22,57),36),51)))),48)))); END; BEGIN TREES; TITLE Tb8514; LINK TAXA = Taxa4; TRANSLATE 1 Dikerogammarus_villosus, 2 Crangonyx_pseudogracilis, 3 Sinogammarus_chuanhui_SC, 4 Sinogammarus_chuanhui_GZ, 5 Platorchestia_japonica, 6 'Jesogammarus (Jesogammarus) hebeiensis', 7 'Jesogammarus (Annanogammarus) debilis', 8 Gammarus_troglophicus_IL, 9 Gammarus_translucidus, 10 Gammarus_tigrinus, 11 Gammarus_tastiensis, 12 Gammarus_taliensis, 13 Gammarus_takesensis, 14 Gammarus_stalagmiticus, 15 Gammarus_sp6, 16 Gammarus_sp5, 17 Gammarus_sp4, 18 Gammarus_sp3, 19 Gammarus_sp2, 20 Gammarus_sp1, 21 Gammarus_sinuolatus, 22 Gammarus_sichuanensis, 23 Gammarus_roeseli, 24 Gammarus_riparius, 25 Gammarus_qiani, 26 Gammarus_pulex_NL, 27 Gammarus_pseudolimnaeus_IL, 28 Gammarus_pexus, 29 Gammarus_oceanicus, 30 Gammarus_nipponensis, 31 Gammarus_nekkensis_BJ2, 32 Gammarus_nekkensis_BJ1, 33 Gammarus_nekkensis_HB1, 34 Gammarus_mucronatus, 35 Gammarus_montanus, 36 Gammarus_minus_IL, 37 Gammarus_martensi, 38 Gammarus_locusta_FR, 39 Gammarus_locusta_CA, 40 Gammarus_lichuanensis_HB2, 41 Gammarus_lichuanensis_HB1, 42 Gammarus_lacustris_WA, 43 Gammarus_lacustris_VI, 44 Gammarus_lacustris_QH1, 45 Gammarus_lacustris_NA, 46 Gammarus_lacustris_HV, 47 Gammarus_lacustris_BK, 48 Gammarus_lacustris_BJ2, 49 Gammarus_lacustris_BJ1, 50 Gammarus_koreanus, 51 Gammarus_kangdingensis, 52 Gammarus_gregoryi, 53 Gammarus_gonggaensis_BX2, 54 Gammarus_gonggaensis_BX1, 55 Gammarus_glabratus, 56 Gammarus_fossarum_PO, 57 Gammarus_fasciatus_WA, 58 Gammarus_fasciatus_MN, 59 Gammarus_emeiensis, 60 Gammarus_electrus, 61 Gammarus_duebeni_MA, 62 Gammarus_decorosus, 63 Gammarus_curvativus, 64 Gammarus_crinicornis, 65 Gammarus_craspedotrichus, 66 Gammarus_comosus, 67 Gammarus_bousfieldi, 68 Gammarus_balcanicus, 69 Gammarus_annulatus, 70 Gammarus_aequicauda, 71 Gammarus_accretus, 72 Gammarus_abstrusus; TREE Gammarus_Combine = [&R] (5,(2,((7,6),(1,(((((((((((71,65),3),66,4),9),(25,(24,(41,40)))),(((60,(30,50)),(33,((32,31),(18,17)))),(((51,16),37),22))),(((63,52),20),((72,(((59,55),54),53)),21))),(((((70,64),38),(39,29)),61),((67,(27,8)),36))),((56,(26,15)),23)),(((68,13),11),(((((62,12),((((49,48),47),((45,(43,42)),46)),44)),28),(19,14)),35))),((69,34),((58,57),10))))))); END;