#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 26, 2024; 15:31 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Panek M., Fer T., Mracek J., & Tomsovsky M. 2016. Evolutionary relationships within the Phytophthora cactorum species complex in Europe. Fungal Biology, 120: 836-851. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S18545] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=30; TAXLABELS Phytophthora_cactorum_109 Phytophthora_cactorum_112 Phytophthora_cactorum_125 Phytophthora_cactorum_216 Phytophthora_cactorum_275 Phytophthora_cactorum_291 Phytophthora_cactorum_292 Phytophthora_cactorum_414 Phytophthora_cactorum_416 Phytophthora_cactorum_426 Phytophthora_cactorum_450 Phytophthora_cactorum_549 Phytophthora_cactorum_578 Phytophthora_cactorum_605 Phytophthora_cactorum_634 Phytophthora_cactorum_66 Phytophthora_cactorum_67 Phytophthora_cactorum_78 Phytophthora_cactorum_8698B Phytophthora_cactorum_8698C Phytophthora_cactorum_CBS111725 Phytophthora_cactorum_M5632 Phytophthora_cactorum_M5654 Phytophthora_cactorum_P13 Phytophthora_cactorum_P74 Phytophthora_cactorum_P91_04 Phytophthora_cactorum_PD20018446_2 Phytophthora_cactorum_PS719 Phytophthora_cactorum_Ph8 Phytophthora_xpelgrandis_JA_337 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M37440] TITLE 'Phytophthora cactorum complex DNA + AFLP'; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=1953; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Phytophthora_cactorum_414 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Phytophthora_cactorum_66 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Phytophthora_cactorum_P13 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; END; BEGIN TREES; TITLE Phytophthora_cactorum_complex_30x1953; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Phytophthora_cactorum_109, 2 Phytophthora_cactorum_112, 3 Phytophthora_cactorum_125, 4 Phytophthora_cactorum_216, 5 Phytophthora_cactorum_275, 6 Phytophthora_cactorum_291, 7 Phytophthora_cactorum_292, 8 Phytophthora_cactorum_414, 9 Phytophthora_cactorum_416, 10 Phytophthora_cactorum_426, 11 Phytophthora_cactorum_450, 12 Phytophthora_cactorum_549, 13 Phytophthora_cactorum_578, 14 Phytophthora_cactorum_605, 15 Phytophthora_cactorum_634, 16 Phytophthora_cactorum_66, 17 Phytophthora_cactorum_67, 18 Phytophthora_cactorum_78, 19 Phytophthora_cactorum_8698B, 20 Phytophthora_cactorum_8698C, 21 Phytophthora_cactorum_CBS111725, 22 Phytophthora_xpelgrandis_JA_337, 23 Phytophthora_cactorum_M5632, 24 Phytophthora_cactorum_M5654, 25 Phytophthora_cactorum_P13, 26 Phytophthora_cactorum_P74, 27 Phytophthora_cactorum_P91_04, 28 Phytophthora_cactorum_PD20018446_2, 29 Phytophthora_cactorum_PS719, 30 Phytophthora_cactorum_Ph8; TREE PAUP_1 = [&R] (22:0.036174,(25:1.0E-8,(((12:1.0E-8,18:1.0E-8):5.31E-4,(28:5.27E-4,((13:5.19E-4,(29:5.19E-4,(21:1.0E-8,24:1.0E-8):1.0E-8):1.0E-8):0.001039,(23:5.19E-4,(11:1.0E-8,(3:1.0E-8,(1:1.0E-8,2:1.0E-8):1.0E-8):1.0E-8):1.0E-8):1.0E-8):2.18066E-8):0.001563):0.004097,(8:8.94E-4,(9:1.0E-8,(30:1.0E-8,(26:0.001054,(((15:1.0E-8,19:1.0E-8):0.0,(20:1.0E-8,(16:1.0E-8,(4:0.002119,10:1.0E-8):0.0):0.002105):5.34425E-6):5.27E-4,((5:5.29E-4,(6:1.0E-8,17:1.0E-8):5.29E-4):5.26E-4,(7:1.0E-8,(14:5.25E-4,27:5.37E-4):4.4E-4):8.24315E-5):5.26E-4):6.91E-4):0.0):0.0):0.0):0.001568):0.005983):0.036174); END;