#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 19, 2024; 15:22 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Wang W., Chen Z., Liu Y., Li R., & Li J. 2007. Phylogenetic and Biogeographic Diversification of Berberidaceae in the Northern Hemisphere. Systematic Botany, null. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1859] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=8; TAXLABELS Achlys_triphylla Bongardia_chrysogonum Diphylleia_cymosa Diphylleia_grayi Diphylleia_sinensis Dysosma_versipellis Podophyllum_peltatum Sinopodophyllum_hexandrum ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa2; DIMENSIONS NTAX=32; TAXLABELS Achlys_japonica Achlys_triphylla Akebia_quinata Berberis_thunbergii Bongardia_chrysogonum Caulophyllum_robustum Caulophyllum_thalictroides Cocculus_trilobus Coptis_chinensis Diphylleia_cymosa Diphylleia_grayi Diphylleia_sinensis Dysosma_versipellis Epimedium_alpinum Epimedium_koreanum Epimedium_wushanense Gymnospermium_microrrhynchum Hydrastis_canadensis Jeffersonia_diphylla Leontice_leontopetalum Mahonia_bealei Mahonia_japonica Menispermum_dauricum Nandina_domestica Plagiorhega_dubia Podophyllum_peltatum Ranzania_japonica Sinofranchetia_chinensis Sinopodophyllum_hexandrum Thalictrum_javanicum Tinomiscium_petiolare Vancouveria_hexandra ; END; BEGIN CHARACTERS; [! 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Diphylleia_cymosa 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Diphylleia_grayi 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Achlys_triphylla CTTGCT------CATGGTTTAAATAGATCAGTTCTTTATGAACCTATTGAAACTTCAGGT---------TATGACAATAAATCCAGTTCACTAATTGTGAAACGTTTAATTACCCGAATGTATCAGCAGAAGCATTTTATTCTTTTT------GATAATGATTCTATAAAAAATAAATTTGTTGATCAT------AAGAATCATTTTGATTCGAAAATGATATCAGAGGGTTTTTCTGCCGTTGTGGAAACTTCATTCTCACTGCGATTAGTATCTGTCCTAGACGGGAAA---GAAATCCCAAAATATCGTAATTGTAATTTACGATCAATTCATTCAATATTTCCCTTTTTAGAGGATAATTTATCACATTTAAATCATGTATTAGATATACTAATACCCTACCCCACCCATCTTGAACTTTTGGTTCAACCCCTCCGCTGTTGGATCCAGGATACCCCCTCTTTGCATTTATTGCGATTCTTTTTCTATGAGTATCATAATTGGAATAATCTTATTACT---------CAAAATAATCAA------TACACTTCCTTTTTTTCA---AACGAGAATCAAAGAATTTTCTTGTTCCTATATAATTTTCATGTATATGAATGCGAATCCATATTTGTTTTTCTCCGTAAACAATCCGCTCACTTACGATTAACATCTTATAGATCTTTTATTGAGCGAACACTTTTTTATGGAAAAATAGAAAATTTTTTAGTAGTTTTTCGTAATGATTTTCAGACCAACCTCTGGGTGTTCAAGGATCTTTTTGTGCATTATGTCAGATATCAAGGGAAAGCTATTCTGGCTTCAAAGGGAAATCAACTTCTGATGAAAAAATGGAAGTATTACTTTGTAAATTTCTGGCAATGTCATTTTTACTTGTGGTCTCAATCGGATAGGCTTCGTATAAACCAATTATCCAATTATTCCCTCGATTTTCTGCGCCATCTTTCAAGTGTATGGCTGAAGCCTTCTGTG------GTAAGGAGTCAAATGTTGGAAAATTCATTTATTATAGATATTTCTATTAATAAATTTGACACTATAGTCCCAATAATTCCCTTGATGGGGTCATTGGCTAAAGCGAAATTTTGTAACACATCGGGGCATCCTATTAGTAAGTCGGCTCGGGCAGATTCTTCGGATTCTGATATTATCGATAGATTTGGGCGGATATGCAGAAATCTTTTTCATTATTATAGTGGATCCACCAAAAAAAATACTTTGTATCGGGTAAAGTATATAGGATTCAAAGCGGGTGTTAAAGATTACAAATTGACTTATTATACTCCTGACTATGTAACTAAAGATACTGATATCTTGGCAGCATTTCGAGTAACTCCTCAACCTGGAGTTCCACCCGAAGAAGCAGGGGCCGCTGTAGCTGCCGAATCTTCTACAGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGACTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTACCACATCGAGCCTGTTGCTGGAGAAGAGAATCAATATATTTGTTATGTAGCCTATCCTTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCTATTGTGGGTAATGTATTTGGGTTCAAAGCGCTGCGCGCTCTACGTCTGGAAGATTTGCGAATTCCTGTTGCTTATGTTAAAACTTTCCAAGGCCCGCCTCACGGCATCCAAGTTGAGAGAGATAAATTGAACAAATATGGTCGTCCTTTATTAGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGATTATCCGCTAAGAACTATGGTAGAGCGGTTTATGAATGTCTCCGCGGTGGGCTTGATTTTACCAAGGATGATGAGAACGTGAACT?CCAGCCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCCTATTTTGTGCCGAAGC{AT}ATTTATAAATCACAGGCGGAAACAGGCGAAATCAAAGGACATTACTTGAATGCTACTGCGGGTACATGCGAAGAAATGATGAAAAGGGCTGTATTTGCCAGAGAATTAGGAGTACCCATCGTAATGCACGACTACTTAACGGG{GT}GGATTCACTGCAAATACTACCTTGGCTCATTATTGCCGAGATAATGGTCTACTTCTTCACATCCACCGCGC{AG}ATGCACGCAGTTATTGATAGACAGAAGAA?CATGGTATACATTTCCGTGTACTAGCTAAAGCGTTACGTATGTCTGGGGGAGACCATATCCACGCGGGTACCGTAGTAGGTAAACTGGAAGGAGAAAGAGAGATCACCTTGGGCTTTGTTGATTTATTACGTGATGATTTGATTGAAAAAGACCGAAGTCGCGGTATTTATTTCACTCAAGACTGGGTCTCTCTACC{AT}GGCGTTCT{GT}CCCGTGGCTTCAGGGGGTATTCACGTTTGGCATATGCCTGCTCTGACCGAGATCTTTGGGGATGATTCCGTACTACAGTTCGGCGGAGGAACTTTAGGACACCCTTGGGGAAATGCACC{AG}GGTGCTGTAGCTAATCGAGTAGCTCTAGAAGCGTGTGTACAAGCTCGTAATGAGGGACGCGATCTTGCTCGTGAAGGTAATGAAATTATCCGTGAGGCTTGCAAATGGAGCCCTGAATTAGCTGCTGCTTGTGAGGTATGGAAGGAGATCAAATTTGAATTTGAAGCAATGGATACTTTGTAA Akebia_quinata 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Berberis_thunbergii CTTGCTCATGATCATGGTTTAAATGGATCGATTCTTTATGATTCTATCGATAATTTAGGT---------TATGACAATAAATTCAGTTCACTGATTGTGAAACGTTTAATTACTCGAATGTATCAACAGAAGCCTTTGGTTATTTTT------GATAATGATTCTCAACAACATAAATTTTTGGATCAT------AAGAATCATTTTTATTCTCAAATGATATCAGAGGGCTGTGCAATCATTGTGGAAATTCCATTTTCATTGCAACTAATATCTTCCCTAGAAGGGAAAAAAGAAATAGCAAAATCTAAA------AATTTACGATCAATTCATTCAGCATTTCCCTTTTTAGAGGATAAATTATCGCATTTAAATCATGTATTAGATATACTAATACCCCACCCCATCCATCTGGAACTTTTGATTCAACCCCTTCGCTGTTGGATACAAGATATCCCCGCTTTGCATTTATTGCGATTCTTTCTTTACGAGTTTCAGAATTGGAATAATCTTATTACT---------CAAAAACAGAAA------TATATTTCTGTTTTTTCA---AACGAGAATAGAAGATTATTCTTGTTCCTATATAATTTTCATGTATATGAATGCGAATCGATATTCCCCTTTCTCCGTAAACAATCTGCTCATTTACGATCAACATCTTCTAGCGCCTTTCTTGAGAGAACACATTTTTTTGGAAAAATAGAACATTTTTTGGTAGTTTTTCGTAATGATTTTCACACCATCCTCTGGGTTTTCAAGGACTTTTTCATGCATTATGTCAGATATCAAGGAAAAGCTATTCTGGCTTTAAAGGGAACTCCTCTTCTGATGAATAAATGGAAGTATTACCTTATAAATCTCTGGCAATATAATTTCGACTTGTGGTCTCAACCAGATAGGATTCATATAAACCAATTATACAACCATTCCCTCGATTTTTTGGGCCATCTTTCAAGTGTACGACTAAAGCCTTCTGTG------GTTAGGAGTCAAATGGTAGAAAATTCATTTATTATAGATATTGCTATAAAAAAGTTTGATACTATAGTCCCAATAATTACTTTGATTGGATCATTGGCTAACTCGAAATTTTGTAACGCATCAGGGCATCCCATTAGTAAGTCGGCTCGGACCGATTCATCGGATTCTGATATTATCGATAGATTTGGGCGGATATGCAGAAATCTTTCTCATTATTATAGTGGATCCTCAAAAAAAAAGAGTTTGTATCGAGTAAAGTATATC?????CAAAGCGGGTGTTAAAGATTACAAATTGAATTATTATACTCCTGAATATGTAACCAAAGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCCGGAGTTCCACCGGAAGAAGCAGGGGCCGCTGTAGCTGCCGAATCTTCTACGGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGACTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTACCACATTGAGCCCGTTGCTGGAGAAGACAATCAATATATTTGTTATGTAGCCTATCCTTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACCTCTATTGTGGGTAATGTTTTTGGGTTCAAAGCGCTGCGCGCTCTACGTCTGGAGGATCTGCGAATTCCTACTGCTTATGTTAAAACTTTCCAAGGCCCGCCTCATGGCATCCAAGTTGAGAGAGATAAATTGAACAAGTATGGTCGTCCCCTATTAGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGATTATCCGCTAAGAACTATGGTAGAGCGGTTTATGAATGTCTCCGTGGTGGACTTGATTTTACCAAGGATGATGAAAACGTGAACTCCCAACCATTTATGCGTTGGCGCGA?CGTTTCCTATTTTGTGCCGAAGCACTTTATAAAGCACAGGCTGAAACAGGTGAAATCCAAGGACATTACTTGAATGCTACTGCGGGTACATGCGAAGATATGATGAAAAGGGCTGTATTTGCCAGAGAGTTGGGAGTACCCATCGTAATGCATGACTACTTAACGGGGGGGTTCACTGCAAATACTACCTTGGCTCATTATTGCCGAGATAATGGTCTACTTCTTCACATCCACCGCGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAGAATCATGGTATGCATTTCCGTGTACTAGCTAAAGCGTTACGTATGTCTGGTGGAGATCATATTCACGCCGGTACCGTAGTAGGTAAACTGGAAGGAGAAAGAGAGATCACCTTGGGTTTTGTTGATTTATTGCGTGATGATTTTATTGAAAAAGACCGAAGTCGCGGTATTTATTTCACTCAAGATTGGGTCTCTCTACCAGGTGTTCTGCCCGTGGCATCAGGGGGTATTCACGTTTGGCATATGCCTGCTCTGACCGAAATCTTTGGGGATGATTCCGTACTACAGTTCGGTGGAGGAACTTTAGGACACCCTTGGGGAAATGCACCGGGTGCCGTAGCTAATCGAGTAGCTCTAGAAGCGTGTGTACAAGCTCGTAATGAAGGACGTGATCTTGCTCGTGAAGGTAATGAAATTATCCGTGAGGCTTGCAAATGGAGCCCTGAACTAGCTGCTGCTTGTGAGGTCTGGAAGGAGATC????????????????????????????????? Bongardia_chrysogonum CTTGCTCATGATTATGGTTTAAATAGATCGGTTCTTTATGAACCTATCGAAAATTTAGGT---------TATGACAATAAATTCAGTTCACTAATAGCGAAACGTTTAATTACTCGAATGTATCAGCAGAAGCATTTGATTCTTTTC------GATCACGATTCTAACCAAAATCAATTTGTTGATCAT------AAGAAGAATTTTTATTCTAAAATGATATCGGAGGGTTTTGCAGTCATAGTGGAAATTCCATTCTCACTGCAATTAGTATCTTCCCTAGAAGGGAAA---GAAATAGCAAAATCTCAT------AATTTACGATCAATTCATTCAACATTTCCCTTTTTAGAGGATAAATTATCACATTTAAATTATGTGTTAGATATACTAATACCCTATCCCATTCATCTTGAACTTTTGGTTCAACCCCTTCGCTCTTGGATACAGGATACTCCCTCTTTGCATTTATTGCGATTCTTTCTCTACGAGTATCAGAATTGGAATAATTTTATTACT---------CAAAAAAAGAAA------TACACTTCCCTTGATTCA---AACAAGAATCAAAGATTATTCTTGTTCCTATATAATTTTCATGTATATGAATGCGAATCCCTATTCGTTTTTCTCCGTAAACAATCTACTCATTTACGATCAACATCTTATAGATCTTTTCGTCAGCGAACATATTTTTATGTAAAAATAGAAACCTTGTTAGTAGTTTTTCGTAATGATTTTCAGACCATCCTCTGGTTGTTCAAGGATCCTTTCATACATTATGTCAGATATCAAGGAAAATCTATTCTGACTTCAAAAGGAACTCCACTTTTGATGAAAAAATGGAAGTATTATCTGGTTAATTTATGGCAATGCAATTTTGACTTGTGGTCTCAACCGGATAGGATTCATATAAACCAATTATCCAATCATCCCCTCTTTTTTCTGGGGCATCTTTCAAGTGTACAACTAAATCCTTCTGTG------GTAAGGAGTCAAATGTTAGAAAATTCATTTATTATAGATATTGCTATTAATAAGTTTGACGCAATAGTCCCAATAAATCCTTTGATTGAGTCATTGGCTAAAGCGAAATTTTGTAACGTATCGGGGCATCCTATTAGTAAGCCGGCTCGGGCAGATTCCGCGGATTCTGATATTATCGATAGATTTGGGCGGATATGTAGAAATATTTTTCATTATTATAGTGGATCCGCAAAAAAAAATAGTTTGTATCGAGTAAAGTATATCGGATTCAAAGCGGGTGTTAAAGATTACAAATTGACTTATTATACTCCTGAATATGTAACCAAAGATACTGATATCTTGGCGGCATTCCGAGTAACGCCTCAACCTGGAGTTCCACCTGAAGAAGCAGGGGCCGCAGTAGCTGCCGAATCTTCTACAGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGACTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTACCACATCGAGCCTGTTGCTGGAGAAGACAACCAATATATTTGTTATGTAGCCTATCCTTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCTATTGTGGGTAATGTCTTTGGGTTCAAAGCGCTGCGCGCTCTACGTCTGGAGGATCTCCGCATTCCTCCTGCTTATGTTAAAACTTTCCAAGGCCCGCCTCATGGCATCCAGGTTGAGAGAGATAAATTGAACAAGTATGGTCGTCCTCTATTAGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGATTATCCGCTAAGAACTACGGTAGAGCGGTTTATGAATGTCTCCGCGGTGGACTTGATTTTACCAAGGATGATGAGAACGTGAACTCCCAGCCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCCTATTTTGTGCCGAAGCAATTTATAAATCACAGGCGGAAACAGGTGAAATCAAAGGACATTACTTGAATGCTACTGCGGGTACATGCGAAGAAATGATCAAAAGGGCTGTATTTGCCAGAGAATTGGGAGTACCCATCGTAATGCATGACTACTTAACGGGGGGATTCACTGCAAATACTAGCTTAGCTCATTATTGCCGAGATAATGGTCTACTTCTTCACATTCACCGCGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAGAACCATGGTATGCATTTCCGTGTACTAGCTAAAGCGTTACGTATGTCTGGTGGAGACCATATTCACGCGGGTACTGTAGTAGGTAAACTGGAAGGGGAAAGAGAAATCACTCTGGGCTTTGTTGATTTATTACGTGATGATTTTATTGAAAAAGACCGAAGTCGCGGTATTTATTTCACCCAAGATTGGGTCTCTCTACCAGGTGTTTTGCCCGTGGCTTCCGGGGGTATTCACGTTTGGCACATGCCTGCTCTGACCGAGATCTTTGGAGATGATTCCGTACTACAGTTCGGTGGAGGAACTTTAGGACACCCTTGGGGAAATGCACCAGGTGCTGTAGCTAATCGAGTCGCTCTGGAAGCGTGTGTACAAGCTCGTAATGAGGGACGTGATCTTGCTCGTGAAGGTAATGAAATTATCCGTGAGGCTTGCAAATGGAGCCCTGAACTAGCTGCTGCTTGTGAGGTATGGAAGGAGATTAAATTTGAATTTGAAGCAATGGATACTTTGTAA Caulophyllum_robustum 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Caulophyllum_thalictroides 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Cocculus_trilobus 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Coptis_chinensis 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Diphylleia_cymosa 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Dysosma_versipellis 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Epimedium_alpinum 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Epimedium_koreanum 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Jeffersonia_diphylla 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Leontice_leontopetalum 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Mahonia_bealei 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Mahonia_japonica 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Menispermum_dauricum 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Plagiorhega_dubia 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Podophyllum_peltatum 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Ranzania_japonica 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Sinopodophyllum_hexandrum CTCGCTCATGATCATGGGTTAAATAGATCGGTTCTTTATGAACCTATCGAAAATTTAGGT---------TATGACAATAAATCCAGTTCACTAATTGCGAAACGTTTAATTACTCAAATGTATCAACAGAAGCGTTTGATTCTTTTTCATTTTGATAATGATTCTAACCAAAATAAATTTGTTGATCAT------AAGAAGAATTTTTATTCTAAAAAAATATCAGAGGGTTTTGCAGTCATTGTGGAAATTCCATTTTCACTACGATTAGTAGCTTCCCCAGAAGGGAAA---GAGATAGCAAAATCTCAT------AATTTACGATCAATTCATTCAACATTTCCTTTTTTAGAGGATAAATTAGTACATTTAAATCATGTGTTAGATATACTAATACCCTACCCCATCCATCTGGAACTTTTGGTTCAACCTCTTCGCTGTTGGATACAGGATACCCCCTCTTTGCATTTATTGCGATTCTATCTCTACGAATATCATAATTGGAATAATCTTATTACT---CTTACTCAAAAAAATAAA------TACACTTCCCCTTTTTCA---AACGAGAATCAAAGATTTTTCTTGTTCCTATATAATTTTCATGTATATGAATGCGAATCCGTATTTGTTTTTCTCCGTAAACAATCTGCTCATTTACGACCAGCATCTTATAGATCTTTTCTTGAGCGAACATATTTTTATCGAAAAATAGAAAAATTTTTAGCAGTTTTTCGTAATGATTTTCAGACCATCCTCTGGGTGTTCAAGGATCCTTTCATGCATTATGTCCGATATCAAGGAAAATCGATTCTGGCTTCAAAAGGAACTCCCCTTCTGATGAAAAAATGGAAGTATTACCTTGTAAATTTCTGGCAATGTAATTTTGACTTCTGGTCTCAACCGGATAGGATTTCTATAAACCAATTGTCCAAGCATTCCCTCGATTTTCTGGGCCATCTTTCAAGTGTACGGCTAAAGCCTTATGTG------ATAAGGAGTCAACTGTTAGAAAATTCATTTATTATAGATATTGCTATTAATAAGTTTGACACTATAGTCCCAATAATTCCTTTGGTTGGGTCATTGGCTAAAGCAAAATTTTGTAACGTATCGGGGCATCCTATTAGTAAGCCGGCTTGGGCGGATTCTGCGGATTCTGATATTATCGATAGATTTGGGCGGATATGCAGAAATCTTTTTCATTATTTTAGTGGATCCACTAAAATAAATAGTTTGTATCGGGTAAAGTATATTGGATTCAAAGCGGGTGTTAAAGATTACAAATTGACTTATTATACTCCTGACTATGTAACCAAGGATACTGATATCTTGGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAGCCTGGAGTTCCACCTGAAGAAGCAGGGGCCGCTGTAGCTGCCGAATCTTCTACAGGTACATGGACAACCGTGTGGACCGATGGACTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTACCACATCGAGCCTGTTGCTGGAGAAGACAATCAATATATTTGTTATGTAGCCTATCCTTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACGAATATGTTTACTTCTATTGTAGGTAATGTATTTGGGTTCAAAGCGCTGCGCGCTCTACGTCTGGAGGATCTGCGAATTCTTGTTGCTTATGTTAAAACTTTCCAAGGTCCGCCTCATGGCATCCAAGTTGAGAGAGATAAATTGAACAAGTATGGTCGTCCTCTATTAGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGATTATCTGCTAAGAACTACGGTAGAGCGGTTTATGAATGTCTCCGTGGTGGACTTGATTTTACCAAGGATGATGAAAACGTGAACTCCCAGCCATTTATGCGTTGGAGAGATCGTTTCCTATTTTGTGCCGAAGCAATTTTTAAATCACAGCCGGAAACAGGTGAAATCAAAGGACATTACTTGAATGCTACTGCGGGTACATGCGAAGAGATGATGAAAAGGGCTATATTTGCCAGAGAATTGGGAGTACCCATCGTAATGCATGACTACTTAACGGGGGGATTCACTGCAAATACTAGTTTGGCTCATTATTGCCGAGATAATGGTCTACTTCTTCACATCCACCGCGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAGAATCATGGTATACATTTCCGCGTACTAGCTAAAGCGCTACGTATGTCTGGTGGAGACCATATTCACGCGGGTACTGTAGTAGGTAAACTTGAAGGGGAAAGAGAGATCACCCTGGGCTTTGTTGATTTATTACGTGATGATTTTATTGAAAAAGACCGAAGTCGCGGTATTTATTTCACTCAAGACTGGGTCTCTCTACCAGGTGTTCTGCCCGTGGCTTCAGGAGGTATTCACGTTTGGCATATGCCCGCTCTGACCGAGATCTTTGGGGATGATTCCGTACTACAGTTCGGTGGAGGAACTTTAGGACACCCTTGGGGAAATGCACCGGGTGCTGTAGCTAATCGAGTAGCTCTAGAAGCGTGTGTACAAGCTCGTAATGAAGGACGTGATCTTGCTCGCCAAGGTAATGAAATTATCCGTGAGGCTTGCAAATGGAGCCCTGAACTAGCTGCTGCTTGTGAGGTATGGAAGGAGATCAAATTTGAATTTGAAGCAATGGATACTTTGTAA Thalictrum_javanicum 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Tinomiscium_petiolare CTTGCTCATGATTATAGTTTAACTAGAGCGATTCTGTACGAACCTGTGGAAAATTTCGGT---------TATGACAATAAATCTAGTTCACTAATTGTAAAACGTTTAATTACTCGAATGTATCAACAGAATCATTTGATTCTTTCT------TTTAATGATTCTAAAAAAAATAAATTTTGGGGGTAC------AAGAATCGTTTTGATTCTCAAATCATATCAGAGGTATTTGCCGTCATTGTGGAAATTCCATTCTCGCTGCGATTAGTATCCTCCCTAGAAGGGAAA---GAAATAGCCAAATCACAT------AATTTAAGATCTATTCATTCACTATTTCCATTTTTAGAGGATCAATTTTTACATTTAAATCATGTATTAGATATACTAATACCCCACCCCATCCATTTTGAACTCTTGGTTCAAACCCTTCGCTGTTGGATACAAGATGCCGTTTCTTTGCATTTATTGCGATTCTTTTTCTACGAGTATCATAATTGGAATAGGCTTATTACT---------CAAAAAAATAAA------TCCATTTCTGTTTTTTCAAAAAAAGAAAATCAAAGATTATTCTTGTTCCTATATAATTCTCATGTATATGAATGCGAATCCATATTAGTTTTTTTCCGTAAACAATCTTTTTATTTACGATTAACATCTTCTAGAGCCTTTCTGGAGCGAACCCATTTCTATGGAAAAATGGAACATCTTGTAGTAGTTTTTCAAAACGATTTTCAGTTTATCCTATGGTTGTTCAGGGAGCCTTTCATGCATTATGTCAGATATCGAGGAAAATCCATTCTGGGTTCAAAGGGGACCCTTCTTCTGATGAATAAATGGAACTATTACCTTGTAAATTTCTGGCAATGTAATTTTGACTTGTGGTCTCAACTGGATAGGATTTATATAACCCAATTAGCCAATCATTACTTCGATTTTTTGGACTATCTTTCAAGTGTACGACTAAATACTTCGGTA------GTAAGGAGTCAAATGTTAGATAATTCATTTATTATGGATATTGCGATTAAGAAGTTCGATAGTATAGTTCCAATTATTTCTTTGATTGGATCATTGGCTAAAGCGAAATTTTGTAACGTATCAGGGCATCCCATTAGTAAGCCGGCTCGGGCCGATTCATCAGATTCTGATATTATCGATAGATTTGGGCGAATATACAAAAATCTTTCTCATTATTACAGCGGATCCTCAAAAAAAAATAGTTTGTATCGAATAAAGTATATAGGATTCAAAGCTGGTGTTAAAGATTACAAATTGACTTATTATACTCCTGACTATGTACCCAAAGATACTGATACGCTAGCAGCATTCCGAGTAACTCCTCAACCTGGAGTTCCGCCTGAAGAAGCGGGGGCTGCGGTAGCTGCCGAATCTTCTACAGGTACATGGACAACTGTGTGGACCGATGGACTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTACGACATTGAGCCCGTTGCTGGGGAAGAAAATCAATATATTTGTTATGTAGCTTACCCCTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTCTGTTACTAATATGTTTACTTCCATTGTGGGTAATGTTTTTGGGTTCAAAGCGCTACGCGCTCTACGTCTGGAGGATCTGCGAGTTCCTACTGCTTATATTAAAACTTTCCAAGGCCCGCCTCATGGCATCCAAGTTGAGAGAGATAAATTGAACAAGTATGGTCGTCCCCTATTGGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGATTATCCGCTAAGAACTACGGTAGAGCAGTTTATGAATGTCTCCGCGGTGGACTTGATTTTACCAAGGATGATGAGAACGTGAACTCCCAACCATTTATGCGTTGGAGAGACCGTTTCCTATTTTGTGCCGAAGCACTTTATAAAGCACAGGCCGAAACAGGTGAAATCAAAGGACATTACTTGAATGCTACGGCCGGTACATGCGAAGAAATGATCAAAAGGGCTGTATTTGCCAGAGAGTTGGGGGTCCCTATTGTAATGCATGACTACTTAACGGGAGGATTCACTGCGAATACTAGCTTGGCTCATTATTGCCGAGATAATGGTCTACTTCTTCACATCCACCGCGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAGAATCATGGTATGCATTTCCGTGTATTAGCTAAAGCGTTACGTATGTCCGGTGGAGATCATATTCACGCTGGTACCGTAGTAGGTAAACTGGAGGGGGAAAGAGAAATCACCTTGGGCTTTGTTGATTTACTACGCGATGATTTTATTGAAAAAGACCGCAGTCGCGGTATTTATTTCACTCAAGATTGGGTCTCTTTACCAGGTGTTCTGCCTGTGGCTTCAGGGGGTATTCACGTTTGGCATATGCCTGCTCTGACCGAGATCTTTGGAGATGATTCCGTACTACAGTTCGGTGGAGGAACTTTAGGACACCCTTGGGGAAATGCACCGGGTGCTGTAGCTAATCGAGTAGCTCTAGAAGCGTGTGTACAAGCTCGTAATGAAGGACGTGATCTTGCTCGTGAAGGTAATGAAATTATCCGTGAGGCTAGCAAATGGAGCCCTGAACTAGCTGCTGCTTGTGAGGTATGGAAGGAGATTAAATTCGAATTTGAAGCAATGGATACTTTGTAA Vancouveria_hexandra CTTGCTCATGATCATGGTTTAAATAGATCGATTCTTTCTGAACCTCTCGAAAATTTAGGT---------TATGACAATAAATCCAGTTCACTAATTTCGAAACGTTTAATTACTCGAATGTATCAACAGAAGCATTTGATTATCTTT------GATAATAATTTTAACCAAAATACATTTCGTGATCAGAATCAGAAGAAGCATTTTTATGATAAAATGATATCAGAGGGTTTTTCACTCATTGTGGAAATTCCATTCCCTCTGCGATTAGTACCCTCCCTAGAAGCGAAA---GAAATAGCAAAATCTCAT------AATTTACGATCAATTCATTCAACATTTCCCTTTTTAGAGGATAAATTATCACATTTAAATAATGCCTTAGATATACTAATACCCTACCCCATCCATCTGGAACTCTTGATTCAAACCCTTCGCTCTTGGATACAGGATACCCCCGCTTTGCATTTATTACGATTCTTTCTCTACGAGTCTCAGAATTCGAATAATCTGATTACT---------CAAAAAAAAATC------AATATTTCGCATTTTTCA---AATCAGAATCAAAGATTTTTCTTGTTCCTATATAATTTTCATATATATGAATGCGAATCCATATTCGTTTTTCTCCGTAAACAATCTGTTCATTTACGATCAAGGTCGTATAGAGTCCTTCTTGAGCGAACACATTTTTATCGAAAAATAGACAAGTTTTTCGTCATTTTTCATAAAAATTTTCAGACCACCTTATGGTTGTTCAAGGATCCTTTCATGAATTATGTCAGATATCAAAGAAAAGCCATTCTGGCTTCAAAAGGAACACCTCTTCTGATAAAAAAATGGAAGTATTACCTTGTCAATTTTTGGCAAGGTTATTTTGACTTGTGGCCTCAACCAGATAGAATTCAAATAAACCAATTCTCCAAGCACTCCCTCGATTTTCTGGGCCATCTTTCAAGTTTACGGCTAAAGCCTTGTGTGGTTGTGGTAAGGAGTCAAATGTTAGAAAATTCATTTATTATAGATGTTTCTATTAATACGTTTGATACTATAGTCCCCACAATTCCTTTGATAGGAGCATTGGCTAAAGCGAAATTTTGTAACGTATCGGGGCATCCTATTAGTAAGCCGGCTTGGGCGGATTCTGCGGATTCTGATATTATCGATAGATTTGGGCGTATATGCAGAAATCTTTTTCATTTTTTTAGTGGATCTGCAGAAAAAAATACTTTGTTTCGAGTAAAGTACATCGGATTCAAAGCGGGTGCTAAAGATTACAAATTGAATTATTATACTCCTGACTATGTAACGAAGGATACTGATATTTTGGCAGCATTCCGCGTCACTCCTCAACCTGGAGTTCCACCTGAAGAAGCAGGGGCAGCTGTAGCTGCCGAATCTTCTACAGGTACATGGACAACCGTGTGGACCGATGGACTTACCAGTCTTGATCGTTACAAAGGACGATGCTACCACATTGAGCCTGTTGCTGGAGAAGACAATCAATATATTTGTTATGTAGCCTATCCTTTAGACCTTTTTGAAGAGGGTTCTGTTACTAACATGTTTACTTCTATTGTGGGTAATGTATTTGGGTTCAAAGCGCTGCGCGCTCTACGTCTGGAGGATCTGCGAATTCCTGTTGCTTATGTTAAAACTTTCCAAGGCCCGCCTCATGGTATCCAAGTTGAGAGAGATAAATTGAACAAGTATGGTCGTCCTCTATTAGGATGTACTATTAAACCAAAATTGGGATTATCCGCTAAGAACTATGGTAGAGCGGTTTATGAATGTCTCCGCGGTGGGCTTGATTTTACCAAGGATGATGAGAACGTGAACTCCCAGCCATTTATGCGTTGGAGAGATCGTTTCCTATTTTGTGCCGAAGCTCTTTATAAAGCACAGGGGGAAACAGGTGAAATCAAAGGACATTACTTGAATGCTACTGCAGGTACGTGCGAAGAAATGATGAAAAGGGCTGTATTTGCCAGAGAATTAGGCGTACCCATCGTAATGCATGACTACTTAACGGGGGGATTCACTGCAAATACTAGCCTGTCTCATTATTGCCGAGATAATGGTCTACTTCTTCACATCCACCGTGCAATGCATGCAGTTATTGATAGACAGAAGAACCATGGTATACATTTCCGTGTACTAGCTAAAGCCTTACGTATGTCTGGTGGAGATCATATTCACTCAGGTACCGTAGTAGGTAAACTGGAAGGGGAAAGAGAGATCACCCTGGGCTTTGTTGATTTATTACGTGATGATTTTATTGAAAAAGACCGAAGTCGTGGTATTTATTTCACTCAAGATTGGGTCTCTCTACCAGGTGTTCTGCCCGTGGCTTCCGGCGGTATTCACGTTTGGCATATGCCTGCTCTGACCGAGATCTTTGGGGATGATTCCGTATTACAGTTCGGTGGAGGAACTTTAGGACACCCTTGGGGAAATGCACCAGGTGCTGTAGCTAATCGAGTAGCTCTAGAAGCGTGTGTACAAGCTCGTAATGAGGGACGTGATCTTGCTCGTGAAGGTAATGAAATTATCC???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = Matrix_1_matK) = N: 1-2661; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = Matrix_1_matK) = N: 1-2661; END; BEGIN TREES; TITLE Tb8544; LINK TAXA = Taxa2; TRANSLATE 1 Sinofranchetia_chinensis, 2 Akebia_quinata, 3 Leontice_leontopetalum, 4 Epimedium_alpinum, 5 Diphylleia_grayi, 6 Achlys_japonica, 7 Vancouveria_hexandra, 8 Tinomiscium_petiolare, 9 Thalictrum_javanicum, 10 Sinopodophyllum_hexandrum, 11 Ranzania_japonica, 12 Podophyllum_peltatum, 13 Plagiorhega_dubia, 14 Nandina_domestica, 15 Menispermum_dauricum, 16 Mahonia_japonica, 17 Mahonia_bealei, 18 Jeffersonia_diphylla, 19 Hydrastis_canadensis, 20 Gymnospermium_microrrhynchum, 21 Epimedium_wushanense, 22 Epimedium_koreanum, 23 Dysosma_versipellis, 24 Diphylleia_sinensis, 25 Diphylleia_cymosa, 26 Coptis_chinensis, 27 Cocculus_trilobus, 28 Caulophyllum_thalictroides, 29 Caulophyllum_robustum, 30 Bongardia_chrysogonum, 31 Berberis_thunbergii, 32 Achlys_triphylla; TREE Fig._2_RR = [&R] ((2,1),((((((((32,6),((25,5),24,23,(12,10))),30),(((22,4),21),7)),(18,13)),((((31,16),17),11),(((29,28),(20,3)),14))),((26,9),19)),((27,8),15))); END; BEGIN TREES; TITLE Tb8545; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Diphylleia_grayi, 2 Diphylleia_sinensis, 3 Diphylleia_cymosa, 4 Dysosma_versipellis, 5 Podophyllum_peltatum, 6 Sinopodophyllum_hexandrum, 7 Bongardia_chrysogonum, 8 Achlys_triphylla; TREE Fig._3 = [&R] (8,7,(((6,5),4),(3,(2,1)))); END;