#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 25, 2024; 20:56 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Le pechon T., He H., Zhang L., Zhou X., Gao X., & Zhang L. 2015. Using a multilocus phylogeny to test morphology-based classifications of Polystichum (Dryopteridaceae), one of the largest fern genera. BMC Evolutionary Biology, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S18607] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=177; TAXLABELS Arachniodes_denticulata_Kromer2550 Arachniodes_standishii_Zhang3468 Cyrtomium_caryotideum_LBZ5847 Cyrtomium_grossum_LJM028Kun Cyrtomium_hemionitis_LJM012Kun Cyrtomium_macrophyllum_LBZ5771 Cyrtomium_omeiense_LBZ5957 'Cyrtomium urophyllum LuSG/J28' Dryopteris_bissetiana_Moran Dryopteris_chinensis_Zhang2399 Dryopteris_scottii_RBC_202 Phanerophlebia_nobilis_Rothfels_5 Phanerophlebia_umbonata_Yatskievych_16 Polystichum_acanthophyllum_LBZHE64 Polystichum_acutipinnulum_LBZHE5401 Polystichum_alcicorne_HE919 Polystichum_alcicorne_LBZ816 'Polystichum alcicorne SGLu/EM33' Polystichum_alfaroi_Barrington_1978 Polystichum_ammifolium_TLP1216 Polystichum_ammifolium_TLP1226 Polystichum_ammifolium_TLP1229 Polystichum_andersonii_Sessa_39 Polystichum_atkinsonii_LBZ4735 Polystichum_attenuatum_DJM4942 Polystichum_auriculum_LBZHE5014 Polystichum_bakerianum_HG065 Polystichum_balansae_TNS771175 Polystichum_biaristatum_DJM4739 Polystichum_bifidum_351LBZHE5012 Polystichum_bonseyi_Driscoll319 Polystichum_braunii_TNS765677 Polystichum_californicum_87005918A Polystichum_caruifolium_LBZCL4795 Polystichum_castaneum_HG091 Polystichum_cf._sinense_HG004 Polystichum_chingiae_LBZHE4921 'Polystichum christii SGLu/H13' Polystichum_chunii_LBZHE586 Polystichum_concinnum_Kluge1441 Polystichum_craspedosorum_TNS764000 Polystichum_craspedosorum_ZZM568 Polystichum_crinigerum_LBZHE4847 Polystichum_cyclolobum_LBZ704 Polystichum_cystostegia_P20465 Polystichum_deltodon_He933 Polystichum_deltodon_LBZ4737 Polystichum_deltodon_LBZ4749 Polystichum_deltodon_LBZHE94 Polystichum_dielsii_LBZHE447 Polystichum_discretum_LBZHE4774 Polystichum_dracomontanum_Roux2715 Polystichum_duthiei_HG087 Polystichum_ekmanii_Wieczorek_215 Polystichum_erosum_LBZ4775 Polystichum_falcatilobum_LBZ4757 Polystichum_fallax_WeltP20472 Polystichum_fibrillosopaleaceum_TNS769191 Polystichum_fimbriatum_LBZHE773 Polystichum_formosanum_Ranker2073 Polystichum_formosanum_TNS763920 Polystichum_fraxinellum_LJM002 Polystichum_frigidicola_HG071 Polystichum_glaciale_FWL1395 Polystichum_gracilipes_var._gemmiferum_TNS776367 Polystichum_grandifrons_LBZHE5025 Polystichum_grandifrons_TNS771415 Polystichum_haleakalense_Driscoll301 Polystichum_hancockii_TNS763908 Polystichum_hecatopterum_LBZ5717 Polystichum_hecatopterum_Zls.n. 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TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M35285] TITLE Polystichum_3218_characters_and_4_DNA_markers; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=3218; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Arachniodes_denticulata_Kromer2550 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Polystichum_auriculum_LBZHE5014 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Polystichum_californicum_87005918A 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'Polystichum christii SGLu/H13' 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Polystichum_chunii_LBZHE586 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Polystichum_deltodon_He933 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Polystichum_duthiei_HG087 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Polystichum_formosanum_TNS763920 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Polystichum_hancockii_TNS763908 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Polystichum_kungianum_HEYang016 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'Polystichum lepidocaulon NYBG570/76' 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Polystichum_mayebarae_TNS765125 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Polystichum_platyphyllum_Barrington_2099 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Polystichum_semifertile_LBZHE4903 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Polystichum_talamancanum_Barrington299 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GGTGTCCAATGAGATGAAGGTTCATTCGGTAG------------------------------AACGAATGAAAAGAATGATAACAGCTTATCACAATTTCACGATTATC-----AGTTTCCAACCTTAAATTCTGAAAACT----ATTTGGAA-TATCCTT------CTGCGATTTAATAGATTACGAAGTTTCCTAC----------TCCGATTTGCAGAATGCTT-----GCAATCCCCCACCCCAATC-----TTTTGGATAAAAGAAGGAGTGTATTC-----CTCATTTCAAAGATTTTCTATTGTCTTGTTATATACATACAGCTAATATGTATGTGTATCAACCGAAGGACCTATCTAGATTGCTTAACAGA-----TAGATCTTGTTCACGTC-----------CGAAGGGG-------AGCCAACTAAAT---------------------CAACAGGGGGGG????????????????TACGCCCCCGAATACAAGACCAAAGATACCGATATCTTAGCAGCCTTCAGAATGACCCCACGACCCGGAGTACCGGCTGAGGAAGCCGGAGCAGCGGTAGCTGCGGAATCCTCCACGGGTACGTGGACCACTGTATGGACAGATGGGTTGACCAGTCTTGACCGTTACAAGGGCCGATGCTACGACATCGAACCCGTCGCCGGGGAAGAAAACCAATATATCGCGTATGTAGCTTATCCCTTGGATCTATTCGAAGAAGGTTCCGTCACCAATTTGTTCACCTCTATTGTAGGTAATGTTTTTGGATTCAAGGCTCTACGCGCTTTACGCTTGGAAGATCTTCGAATTCCTCCTGCTTATTCCAAAACTTTCATCGGACCGCCTCACGGCATTCAGGTCGAAAGGGATAAACTGAACAAATATGGACGTCCTTTATTGGGATGTACAATCAAGCCAAAATTAGGTCTGTCTGCAAAAAATTATGGTAGAGCCGTCTACGAATGCCTTCGCGGCGGACTTGATTTCACAAAAGATGATGAAAA-TGTGAATTCTCAGCCATTCATGCGTTGGAGAGATCGCTTCCTATTCGTAGCAGAAGCTCTTTTCAAATCCCAGGCTGAAACAGGAGAAATCAAGGGGCATTACTTAAATGCTACTGCAGGTACATGTGAAGAAATGATGAAGAGAGCTGTTTTTGCTAGA-----GAGTTGGGTGCGCCAATTGTCATGCATGACTACCTGACCGGAGGGTTTACCGCAAATACCAGCTTAGCTTATTATTGTAGAGACAATGGGCTGCTTCTCCATATTCACCGTGCGATGCATGCTGTGATCGATAGGCAACGAAACCACGGTATGCATTTTCGTGTATTGGCCAAAGCATTACGCATGTCCGGTGGGGATCATGTACACGCCGGAACTGTAGTAGGTAAACTAGAGGGGGAACGGGAAGTAACCCTGGGTTTCGTCGATTTACTTCGCGACGATTACATTGAAAAAGATCGTAGTCGTGGTGTCTATTTCACACAAGATTGGGTATCTATGCCGGGTGTACTCCCCGTAGCTTCGGGGGGTATCCACGTCTGGCACATGCCTGCTCTAACCGAAATCTTCGGGGACGACTCCGTGTTACAGTTCGGCGGAGGAACCTTGGGACATCCTTGGGGAAACGCACCTGGTGCGGTAGCCAACCGAGTCGCATTAGAAGC???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????----------------------------???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????----???????????????????????????????-----??????????????????????????????????????????-???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????-----?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Polystichum_yuanum_ZHUHEsn GGTGTCCAATGAGATGAAGGTTCATTCGGTAG------------------------------AACGAATGAAAAGAATGATAACAGCTTCTCACAATTTCACGATTATC-----AGTTTCCAACCTTAAATTCTGAAAACT----ATTTGGGAATATCCTT------CTGCGATTTAATAGATTACGAAGTTTCCTAC----------TCCGATTTGCAGAATGCTT-----GCAATCCCCCACCCCAATC-----TTTTGGATAAAAGAAGGAGTGTATTC-----CTCATTTCAAAGATTTTCTATTGTCTTGTTATATACATACAGCTAATATGTATGTGTATCAACCGAAGGACCTATCTAGATTGCTTAACAGA-----TAGATCTTGTTCACGTC-----------CGGAGGGGG------AGCCAACTAAAT-------CAACCCAACTAAATCAGCAGGGGGGGTTATCGATTGACCTATTACACCCCCGAATACAAGACCAAAGATACCGATATCTTAGCAGCCTTCAGAATGACCCCACAACCCGGAGTACCGGCTGAGGAAGCCGGAGCTGCGGTAGCTGCGGAATCCTCCACGGGTACGTGGACCACTGTATGGACAGATGGGTTGACCAGTCTTGACCGTTACAAGGGCCGATGCTACGACATCGAACCCGTCGCCGGGGAAGAAAACCAATATATCGCGTATGTAGCTTATCCCTTGGATCTATTCGAAGAAGGTTCCGTCACCAATTTGTTCACCTCTATTGTAGGTAATGTTTTCGGATTTAAGGCTCTACGCGCTTTACGCTTGGAAGATCTTCGAATTCCTCCTGCTTATTCCAAAACTTTCATCGGACCGCCTCACGGTATTCAGGTCGAAAGGGATAAACTGAACAAATATGGACGTCCTTTATTGGGATGTACAATCAAACCAAAATTAGGTCTGTCTGCTAAAAATTATGGTAGAGCCGTCTACGAATGCCTTCGCGGCGGACTTGATTTTACAAAAGATGATGAAAA-TGTGAATTCTCAGCCATTCATGCGTTGGAGAGATCGCTTCCTATTCGTAGCAGAAGCTCTTTTCAAATCCCAGGCTGAAACAGGAGAAATCAAGGGGCATTACTTAAATGCTACTGCAGGTACGTGTGAGGAAATGTTGAAGAGAGCTGTTTTTGCTAGA-----GAGTTGGGTGCACCAATTGTCATGCATGACTACCTGACCGGAGGGTTTACCGCAAATACCAGCTTAGCTTATTACTGTAGAGACAATGGGCTGCTTCTTCATATTCACCGTGCGATGCATGCTGTGATCGATAGGCAACGAAATCACGGTATGCATTTTCGTGTATTGGCCAAAGCATTACGCATGTCCGGTGGGGATCATGTACATGCCGGAACTGTAGTAGGTAAACTAGAGGGGGAACGGGAAGTAACCCTGGGTTTCGTCGATTTACTTCGCGACGATTACATTGAAAAAGATCGTAGTCGTGGTATCTATTTCACACAAGATTGGGTATCTATGCCGGGTGTACTCCCCGTAGCTTCGGGGGGTATCCACGTCTGGCACATGCCTGCTCTAACCGAAATCTTCGGGGACGACTCCGTATTACAGTTCGGTGGAGGAACCTTGGGACATCCTTGGGGAAACGCACCTGGTGCGGTAGCTAACCGAGTCGCATTAGAAGCTCGAAAAAA-TTAATCAGAAAAATTGGAGG-----TCTCTGCAACGGAAAACTAAGCAAAGGA----CTTGAG-ATGATGAAATTCAATAAGCAGATTACTTAGGAAGTGGCAAAA-TTTTTTGATCTAG---CTTGTTCCTTTTTT--GGGGCAAAAATTAA----ATCATAATAA-TTTACTTCATAGAAATATTCT---ACTTCTGAGCAAATTAATTTAGTACA-------------------------------TGAAGTATCTGAATTACCTGTCCACATCACTTCAACTAAATTC-GTACCGAGGG-----------------ATTATCTATTTATTATTATTGCTTCCATTGAGACGATCCTT-CGGCTTCTCTAAAGTTGGATGACTTGATTTGAAATCCC-----------GGC-TTCTTCAAATTGGCAATTTAGCTAGATTCCGAT-----GGGGGAAGGGAAAATAATCTTTGATTAATCAAATGAATTTCGGGCGATCAGACGAGATAGGTACAGAGACTCGACGGGGGCCATTCGAACGAGCGATTTGTTAGTTA----CTAGTTCTCGGAAGAACTGAATATGGAACTA-----TTTTGTTTGACTAACTGCATGAGGTAAATTGGATAAATATAA-GACTGAGACTTAG------TAAAGGTAAA--------GAAATAAATTTTTACTTTTTTTTGTTTGAACTTGGACGTAAATCCCTCGGTTTGGGGACAGCATTCAGTCACAAAATCACGACAATTTATTCTCCATTACTT-----------------------AGTAATAAAACACTAAGAAGACTCTCTTTACTACA------------------------TGTTAATCCACATTTTTCTATCTTATCTATTGT---------GGAATCCCA---CTTCATTTCGACGAAAACTGTTAAACAAATGAGCCGGTAGCGAAAAACAATACTTTCGCGAATGGAGGTAGAGTCCCATTCTACGCACCTAAT----AGGAGTAA-GAAGTA--------------GCGGCGCAAGTTGCAGTAGAACGAAAATCCGTTGGTTTTTCAAGACCGTGAGGGTTCGACTCCCTCTATCCCCAACGAGACAATTTAGTTAACCCATTTTCAGGTTGTTTGGATCCACATAATTTGTT-CAGAAACAAAATATGGAAACCACTTCAATCTATTTTCCGTGT----AGTCTTTCGAAAACGATTTGCAAGTGAGCCATTCAGGC-TTTTAATATGCCTGAATGGCTCAACCTAGTCCCCCTC------------ATAATTTATTGGC-----TACAAGCGATATT-----GTATTAAACATATCGATAAAAGCGAGATCAACGATTT-----------------------------GAC----------------------------TAGGTAAAAAA-CTAGAGTTGAGAAATATACTTAACTGATTTCTAGC-----TAACTTTTATCCGTAAA ; END; BEGIN TREES; TITLE Polystichum_RAxML_bipartitions_BS; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Polystichum_xiphophyllum_LBZ636, 2 Polystichum_jiucaipingense_LBZ700, 3 Polystichum_cyclolobum_LBZ704, 4 Polystichum_pseudoxiphophyllum_LBZ707, 5 Polystichum_fimbriatum_LBZHE773, 6 Polystichum_atkinsonii_LBZ4735, 7 Polystichum_falcatilobum_LBZ4757, 8 Polystichum_deltodon_LBZ4749, 9 Polystichum_deltodon_LBZ4737, 10 Polystichum_stenophylum_LBZ4727, 11 Polystichum_tenuius_ZL160, 12 Polystichum_sp._LBZHE39, 13 Polystichum_longispinosum_LBZ4786, 14 Polystichum_submarginale_LBZ4793, 15 Polystichum_revolutum_LBZCL4773, 16 Polystichum_discretum_LBZHE4774, 17 Polystichum_chunii_LBZHE586, 18 Polystichum_dielsii_LBZHE447, 19 Polystichum_deltodon_LBZHE94, 20 Polystichum_otophorum_LBZHE6, 21 Polystichum_acanthophyllum_LBZHE64, 22 Polystichum_nepalense_LBZHE4928, 23 Polystichum_pycnopterum_LBZHE4938, 24 Polystichum_mucronifolium_LBZHE4912, 25 Polystichum_thomsonii_LBZHE4824, 26 Polystichum_manmiense_LBZHE4911, 27 Polystichum_semifertile_LBZHE4903, 28 Polystichum_grandifrons_LBZHE5025, 29 Polystichum_chingiae_LBZHE4921, 30 Polystichum_subfimbriatum_LBZHE4837, 31 Polystichum_crinigerum_LBZHE4847, 32 Polystichum_alcicorne_LBZ816, 33 Polystichum_caruifolium_LBZCL4795, 34 Polystichum_polyblepharum_LBZ5298, 35 Polystichum_setiferum_Zhang5296, 36 Polystichum_mucronifolium_LBZHE4922, 37 Polystichum_attenuatum_DJM4942, 38 Polystichum_biaristatum_DJM4739, 39 Polystichum_deltodon_He933, 40 Polystichum_cf._sinense_HG004, 41 Polystichum_stenophyllum_HG006, 42 Polystichum_bakerianum_HG065, 43 Polystichum_nigrum_HG066, 44 Polystichum_frigidicola_HG071, 45 Polystichum_duthiei_HG087, 46 Polystichum_lachenense_HG090, 47 Polystichum_castaneum_HG091, 48 Polystichum_moupinense_HG118, 49 Polystichum_acutipinnulum_LBZHE5401, 50 'Polystichum sinotsus-simense LBZHE5690', 51 Polystichum_tenuius_LBZHE5691, 52 'Polystichum tsus-simense HE1024', 53 Polystichum_latilepis_LZZZ1083, 54 Polystichum_rigens_LZZZ1082, 55 Polystichum_herbaceum_LZZZ1012, 56 Polystichum_yuanum_ZHUHEsn, 57 Polystichum_hookerianum_LBZ5394, 58 Polystichum_weimingii_LBZ5985, 59 Polystichum_parvipinnulum_s.c.22959, 60 Polystichum_sozanense_LBZ23670, 61 Cyrtomium_macrophyllum_LBZ5771, 62 Cyrtomium_caryotideum_LBZ5847, 63 Cyrtomium_omeiense_LBZ5957, 64 'Cyrtomium urophyllum LuSG/J28', 65 Cyrtomium_grossum_LJM028Kun, 66 Cyrtomium_hemionitis_LJM012Kun, 67 Polystichum_lachenense_FWL1403, 68 Polystichum_thomsonii_FWL1391, 69 Polystichum_glaciale_FWL1395, 70 Polystichum_californicum_87005918A, 71 Polystichum_imbricans__20110803, 72 Polystichum_munitum_Pud_21B_20050024, 73 Polystichum_maevaranense_Rakotovao2344, 74 Polystichum_incongruum_Roux5414, 75 Polystichum_incongruum_Roux5448, 76 Polystichum_luctuosum_Roux5494, 77 Polystichum_sinense_Roux5535, 78 Polystichum_ammifolium_TLP1216, 79 Polystichum_ammifolium_TLP1226, 80 Polystichum_ammifolium_TLP1229, 81 Polystichum_wilsonii_TLP1225, 82 Polystichum_wilsonii_TLP1227, 83 Polystichum_balansae_TNS771175, 84 Polystichum_braunii_TNS765677, 85 Polystichum_craspedosorum_TNS764000, 86 Polystichum_scariosum_TNS764380, 87 Polystichum_fibrillosopaleaceum_TNS769191, 88 Polystichum_formosanum_TNS763920, 89 Polystichum_gracilipes_var._gemmiferum_TNS776367, 90 Polystichum_grandifrons_TNS771415, 91 Polystichum_hancockii_TNS763908, 92 Polystichum_hookerianum_TNS771431, 93 Polystichum_igaense_TNS763928, 94 Polystichum_lachenense_TNS766487, 95 Polystichum_lepidocaulon_TNS764341, 96 Polystichum_lonchitis_TNS743763, 97 Polystichum_longifrons_TNS774851, 98 Polystichum_makinoi_TNS764342, 99 Polystichum_microchlamys_var._azumiense_TNS765798, 100 Polystichum_neolobatum_TNS743679, 101 Polystichum_obae_TNS766461, 102 Polystichum_otomasui_TNS762702, 103 Polystichum_ovatopaleaceum_TNS9508214, 104 Polystichum_piceopaleaceum_TNS763912, 105 Polystichum_polyblepharum_TNS762608, 106 Polystichum_pseudomakinoi_TNS763861, 107 Polystichum_retrosopaleaceum_TNS9508176, 108 Polystichum_rigens_TNS764383, 109 Polystichum_tagawanum_TNS9508172, 110 Polystichum_tripteron_TNS763162, 111 'Polystichum tsus-simense TNS762664', 112 Polystichum_mayebarae_TNS765125, 113 Polystichum_yaeyamense_TNS759286, 114 Polystichum_haleakalense_Driscoll301, 115 Polystichum_bonseyi_Driscoll319, 116 Polystichum_hillebrandii_Driscoll315, 117 Polystichum_fallax_WeltP20472, 118 Polystichum_proliferum_P020471, 119 Polystichum_cystostegia_P20465, 120 Polystichum_oculatum_P20327, 121 Polystichum_wawranum_P020311, 122 Polystichum_vestitum_P20468, 123 Polystichum_moorei_P020475, 124 Polystichum_formosanum_Ranker2073, 125 Polystichum_pycnopterum_LuB11, 126 Polystichum_makinoi_LuC61, 127 Polystichum_setiferum_P20478, 128 Polystichum_andersonii_Sessa_39, 129 Polystichum_munitum_Sessa_34, 130 Polystichum_lonchitis_Zika18981, 131 Polystichum_lentum_WELT_P20477, 132 Polystichum_speciosissimum_Little297, 133 Polystichum_transkeiense_Roux2493, 134 Polystichum_macleaii_Roux2561, 135 Polystichum_dracomontanum_Roux2715, 136 Polystichum_alfaroi_Barrington_1978, 137 Polystichum_concinnum_Kluge1441, 138 Polystichum_ekmanii_Wieczorek_215, 139 Polystichum_lepidotum_McHenry1094, 140 Polystichum_maximum_McHenry1084, 141 Polystichum_mohrioides_Connolly2, 142 Polystichum_montevidense_Sundue621, 143 Polystichum_muricatum_Little349, 144 Polystichum_platyphyllum_Barrington_2099, 145 Polystichum_polyphyllum_McHenry1051, 146 Polystichum_talamancanum_Barrington299, 147 Polystichum_parvipunnulum_Knapp3516, 148 Polystichum_bifidum_351LBZHE5012, 149 Polystichum_auriculum_LBZHE5014, 150 Polystichum_alcicorne_HE919, 151 Polystichum_tenuius_LBZHE6206, 152 Polystichum_tonkinense_LBZ473, 153 Polystichum_craspedosorum_ZZM568, 154 Polystichum_yaanense_LBZ4745, 155 Polystichum_erosum_LBZ4775, 156 Polystichum_jiulaodongense_LBZ4771, 157 'Polystichum christii SGLu/H13', 158 'Polystichum alcicorne SGLu/EM33', 159 'Polystichum xichouense SG Lu/J30', 160 Polystichum_minimum_LJM047, 161 Polystichum_fraxinellum_LJM002, 162 Polystichum_tenuius_SGLu_J29, 163 Polystichum_putuoense_ZhangBY03, 164 Polystichum_lepidocaulon_LJM181, 165 'Polystichum lepidocaulon NYBG570/76', 166 Polystichum_kungianum_HEYang016, 167 Polystichum_hubeiense_XCZhang3341, 168 Polystichum_hubeiense_ZLZZM1044, 169 Polystichum_hecatopterum_Zls.n., 170 Polystichum_hecatopterum_LBZ5717, 171 Dryopteris_chinensis_Zhang2399, 172 Dryopteris_scottii_RBC_202, 173 Dryopteris_bissetiana_Moran, 174 Arachniodes_denticulata_Kromer2550, 175 Arachniodes_standishii_Zhang3468, 176 Phanerophlebia_nobilis_Rothfels_5, 177 Phanerophlebia_umbonata_Yatskievych_16; TREE tree_1 = [&R] 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END; BEGIN TREES; TITLE Polystichum_Bayesian; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Polystichum_xiphophyllum_LBZ636, 2 Polystichum_jiucaipingense_LBZ700, 3 Polystichum_cyclolobum_LBZ704, 4 Polystichum_pseudoxiphophyllum_LBZ707, 5 Polystichum_fimbriatum_LBZHE773, 6 Polystichum_atkinsonii_LBZ4735, 7 Polystichum_falcatilobum_LBZ4757, 8 Polystichum_deltodon_LBZ4749, 9 Polystichum_deltodon_LBZ4737, 10 Polystichum_stenophylum_LBZ4727, 11 Polystichum_tenuius_ZL160, 12 Polystichum_sp._LBZHE39, 13 Polystichum_longispinosum_LBZ4786, 14 Polystichum_submarginale_LBZ4793, 15 Polystichum_revolutum_LBZCL4773, 16 Polystichum_discretum_LBZHE4774, 17 Polystichum_chunii_LBZHE586, 18 Polystichum_dielsii_LBZHE447, 19 Polystichum_deltodon_LBZHE94, 20 Polystichum_otophorum_LBZHE6, 21 Polystichum_acanthophyllum_LBZHE64, 22 Polystichum_nepalense_LBZHE4928, 23 Polystichum_pycnopterum_LBZHE4938, 24 Polystichum_mucronifolium_LBZHE4912, 25 Polystichum_thomsonii_LBZHE4824, 26 Polystichum_manmiense_LBZHE4911, 27 Polystichum_semifertile_LBZHE4903, 28 Polystichum_grandifrons_LBZHE5025, 29 Polystichum_chingiae_LBZHE4921, 30 Polystichum_subfimbriatum_LBZHE4837, 31 Polystichum_crinigerum_LBZHE4847, 32 Polystichum_alcicorne_LBZ816, 33 Polystichum_caruifolium_LBZCL4795, 34 Polystichum_polyblepharum_LBZ5298, 35 Polystichum_setiferum_Zhang5296, 36 Polystichum_mucronifolium_LBZHE4922, 37 Polystichum_attenuatum_DJM4942, 38 Polystichum_biaristatum_DJM4739, 39 Polystichum_deltodon_He933, 40 Polystichum_cf._sinense_HG004, 41 Polystichum_stenophyllum_HG006, 42 Polystichum_bakerianum_HG065, 43 Polystichum_nigrum_HG066, 44 Polystichum_frigidicola_HG071, 45 Polystichum_duthiei_HG087, 46 Polystichum_lachenense_HG090, 47 Polystichum_castaneum_HG091, 48 Polystichum_moupinense_HG118, 49 Polystichum_acutipinnulum_LBZHE5401, 50 'Polystichum sinotsus-simense LBZHE5690', 51 Polystichum_tenuius_LBZHE5691, 52 'Polystichum tsus-simense HE1024', 53 Polystichum_latilepis_LZZZ1083, 54 Polystichum_rigens_LZZZ1082, 55 Polystichum_herbaceum_LZZZ1012, 56 Polystichum_yuanum_ZHUHEsn, 57 Polystichum_hookerianum_LBZ5394, 58 Polystichum_weimingii_LBZ5985, 59 Polystichum_parvipinnulum_s.c.22959, 60 Polystichum_sozanense_LBZ23670, 61 Cyrtomium_macrophyllum_LBZ5771, 62 Cyrtomium_caryotideum_LBZ5847, 63 Cyrtomium_omeiense_LBZ5957, 64 'Cyrtomium urophyllum LuSG/J28', 65 Cyrtomium_grossum_LJM028Kun, 66 Cyrtomium_hemionitis_LJM012Kun, 67 Polystichum_lachenense_FWL1403, 68 Polystichum_thomsonii_FWL1391, 69 Polystichum_glaciale_FWL1395, 70 Polystichum_californicum_87005918A, 71 Polystichum_imbricans__20110803, 72 Polystichum_munitum_Pud_21B_20050024, 73 Polystichum_maevaranense_Rakotovao2344, 74 Polystichum_incongruum_Roux5414, 75 Polystichum_incongruum_Roux5448, 76 Polystichum_luctuosum_Roux5494, 77 Polystichum_sinense_Roux5535, 78 Polystichum_ammifolium_TLP1216, 79 Polystichum_ammifolium_TLP1226, 80 Polystichum_ammifolium_TLP1229, 81 Polystichum_wilsonii_TLP1225, 82 Polystichum_wilsonii_TLP1227, 83 Polystichum_balansae_TNS771175, 84 Polystichum_braunii_TNS765677, 85 Polystichum_craspedosorum_TNS764000, 86 Polystichum_scariosum_TNS764380, 87 Polystichum_fibrillosopaleaceum_TNS769191, 88 Polystichum_formosanum_TNS763920, 89 Polystichum_gracilipes_var._gemmiferum_TNS776367, 90 Polystichum_grandifrons_TNS771415, 91 Polystichum_hancockii_TNS763908, 92 Polystichum_hookerianum_TNS771431, 93 Polystichum_igaense_TNS763928, 94 Polystichum_lachenense_TNS766487, 95 Polystichum_lepidocaulon_TNS764341, 96 Polystichum_lonchitis_TNS743763, 97 Polystichum_longifrons_TNS774851, 98 Polystichum_makinoi_TNS764342, 99 Polystichum_microchlamys_var._azumiense_TNS765798, 100 Polystichum_neolobatum_TNS743679, 101 Polystichum_obae_TNS766461, 102 Polystichum_otomasui_TNS762702, 103 Polystichum_ovatopaleaceum_TNS9508214, 104 Polystichum_piceopaleaceum_TNS763912, 105 Polystichum_polyblepharum_TNS762608, 106 Polystichum_pseudomakinoi_TNS763861, 107 Polystichum_retrosopaleaceum_TNS9508176, 108 Polystichum_rigens_TNS764383, 109 Polystichum_tagawanum_TNS9508172, 110 Polystichum_tripteron_TNS763162, 111 'Polystichum tsus-simense TNS762664', 112 Polystichum_mayebarae_TNS765125, 113 Polystichum_yaeyamense_TNS759286, 114 Polystichum_haleakalense_Driscoll301, 115 Polystichum_bonseyi_Driscoll319, 116 Polystichum_hillebrandii_Driscoll315, 117 Polystichum_fallax_WeltP20472, 118 Polystichum_proliferum_P020471, 119 Polystichum_cystostegia_P20465, 120 Polystichum_oculatum_P20327, 121 Polystichum_wawranum_P020311, 122 Polystichum_vestitum_P20468, 123 Polystichum_moorei_P020475, 124 Polystichum_formosanum_Ranker2073, 125 Polystichum_pycnopterum_LuB11, 126 Polystichum_makinoi_LuC61, 127 Polystichum_setiferum_P20478, 128 Polystichum_andersonii_Sessa_39, 129 Polystichum_munitum_Sessa_34, 130 Polystichum_lonchitis_Zika18981, 131 Polystichum_lentum_WELT_P20477, 132 Polystichum_speciosissimum_Little297, 133 Polystichum_transkeiense_Roux2493, 134 Polystichum_macleaii_Roux2561, 135 Polystichum_dracomontanum_Roux2715, 136 Polystichum_alfaroi_Barrington_1978, 137 Polystichum_concinnum_Kluge1441, 138 Polystichum_ekmanii_Wieczorek_215, 139 Polystichum_lepidotum_McHenry1094, 140 Polystichum_maximum_McHenry1084, 141 Polystichum_mohrioides_Connolly2, 142 Polystichum_montevidense_Sundue621, 143 Polystichum_muricatum_Little349, 144 Polystichum_platyphyllum_Barrington_2099, 145 Polystichum_polyphyllum_McHenry1051, 146 Polystichum_talamancanum_Barrington299, 147 Polystichum_parvipunnulum_Knapp3516, 148 Polystichum_bifidum_351LBZHE5012, 149 Polystichum_auriculum_LBZHE5014, 150 Polystichum_alcicorne_HE919, 151 Polystichum_tenuius_LBZHE6206, 152 Polystichum_tonkinense_LBZ473, 153 Polystichum_craspedosorum_ZZM568, 154 Polystichum_yaanense_LBZ4745, 155 Polystichum_erosum_LBZ4775, 156 Polystichum_jiulaodongense_LBZ4771, 157 'Polystichum christii SGLu/H13', 158 'Polystichum alcicorne SGLu/EM33', 159 'Polystichum xichouense SG Lu/J30', 160 Polystichum_minimum_LJM047, 161 Polystichum_fraxinellum_LJM002, 162 Polystichum_tenuius_SGLu_J29, 163 Polystichum_putuoense_ZhangBY03, 164 Polystichum_lepidocaulon_LJM181, 165 'Polystichum lepidocaulon NYBG570/76', 166 Polystichum_kungianum_HEYang016, 167 Polystichum_hubeiense_XCZhang3341, 168 Polystichum_hubeiense_ZLZZM1044, 169 Polystichum_hecatopterum_Zls.n., 170 Polystichum_hecatopterum_LBZ5717, 171 Dryopteris_chinensis_Zhang2399, 172 Dryopteris_scottii_RBC_202, 173 Dryopteris_bissetiana_Moran, 174 Arachniodes_denticulata_Kromer2550, 175 Arachniodes_standishii_Zhang3468, 176 Phanerophlebia_nobilis_Rothfels_5, 177 Phanerophlebia_umbonata_Yatskievych_16; TREE con_50_majrule = [&R] ((172:0.01658452,(171:0.0136359,173:0.01450767):0.01256523):0.0096551,((174:0.02552339,175:0.03076309):0.008451754,(((176:0.00259505,177:0.002758902):0.01439423,((65:0.003006094,66:0.003211329):0.001554409,(63:0.00208097,(64:0.003626051,(61:0.001935334,62:0.002980485):0.001921517):0.001641225):9.303235E-4):0.01300075):0.004280117,(((85:5.950961E-4,153:8.743911E-4):0.004463723,((154:0.006945364,(167:9.103456E-4,168:0.004123324):0.004945547):0.002333211,(155:2.468097E-4,156:0.001498507,166:0.001188299):0.007602385):0.00207036):0.007736991,((163:0.001394625,(95:0.001589253,(164:7.631506E-4,165:0.00194274):0.001581642):0.00127206):0.01678049,(((113:0.003489291,(91:6.54911E-4,110:0.008396345):0.001414393):0.009891525,((57:5.908936E-4,92:0.001448979):0.009701767,((7:0.01179702,83:0.002716002):0.007722829,(88:0.001809633,124:7.324065E-4):0.01425851):0.003703878):0.001367522):0.001326218,((18:0.001386439,(14:0.00595257,(56:9.771522E-4,(8:2.40722E-4,9:7.491892E-4,19:0.001290806,39:5.815192E-4):0.005501859):0.001414874):6.706356E-4):0.00222149,(152:0.005226012,(33:6.144346E-4,(149:2.516828E-4,(148:5.967561E-4,157:8.505577E-4):5.876712E-4):0.002679494):0.001317222,((150:9.001925E-4,(32:0.001685578,158:0.002078845):5.747762E-4):0.002701062,((160:0.001241818,161:7.225651E-4):0.002778088,(11:2.351921E-4,51:2.951974E-4,151:3.011327E-4,159:0.001248424,162:4.871209E-4):0.002715701):7.52091E-4):5.844279E-4):0.005404856):0.003336594):0.004560852):0.001071641):0.00746984,((3:0.004872754,100:0.003235415,(21:0.002277676,116:0.003359219):0.001717919,(108:6.128892E-4,(53:2.43461E-4,54:2.482036E-4):5.569879E-4):0.004617213,((52:0.003323463,(15:9.234477E-4,(1:2.351179E-4,(4:0.001291046,20:2.964838E-4):6.008089E-4):5.674314E-4):6.896922E-4):0.001729931,(50:0.001345183,55:6.708141E-4,76:2.510263E-4,111:6.146747E-4,112:0.002230949):0.003236733):0.004093665):0.008647319,(((96:7.196532E-4,130:7.997172E-4):0.00411865,(138:0.01114581,(132:0.002054429,139:0.001896124,(136:0.001992993,(143:0.002743381,(137:9.018119E-4,146:0.001977771):0.001452504):0.001445405):0.002570236,(145:0.004019578,(140:0.005239239,(142:5.1739E-4,144:0.003905232):0.004429492):0.00539727):0.001616339):0.001773212):0.004075335):6.93638E-4,(84:0.001268154,117:0.00440987,118:7.431302E-4,122:0.002547094,123:0.003078642,128:0.00125439,(16:4.217815E-4,58:0.001094763):0.009674398,(35:9.504126E-4,127:3.843023E-4):0.006898698,(99:0.003235007,141:0.002542321):0.00155917,(119:7.93058E-4,(120:0.0026581,121:0.001312774):0.001317406):0.001902822,(71:0.004346944,(70:2.393486E-4,72:3.060537E-4,129:0.001755176):0.003052482):0.002071079,((74:2.527677E-4,75:5.6801E-4):0.002678299,(135:9.749524E-4,(133:0.001496607,134:0.002615144):0.003284625):0.001217666):0.003261281,((30:0.005184351,(93:0.00147449,(87:6.015945E-4,97:5.992774E-4):0.00321186,(34:5.817329E-4,60:3.095303E-4,101:0.003500094,147:4.677111E-4,(59:2.599711E-4,105:6.075846E-4):5.429007E-4):0.002196079):0.002940927):5.502328E-4,(107:0.006598368,(((103:0.004134309,106:6.114644E-4):0.002697138,(73:0.001882287,(79:6.063841E-4,(78:2.439267E-4,80:9.40312E-4):5.829675E-4):0.003660125):0.001706653):0.003123978,(5:0.003424186,(102:6.158348E-4,109:0.001437302):0.001356363,(49:0.003102536,((40:2.443448E-4,44:2.608303E-4,114:0.001214429,115:5.039881E-4):0.002891405,(126:0.002089544,(77:2.417137E-4,81:2.380978E-4,82:2.375005E-4,98:0.005070631,104:0.001495903):0.00147192):0.001159425):0.001099795):0.001152166):0.001288821):0.001384913):0.001046045):0.001454417,(((22:6.504477E-4,26:0.003082395):0.006719036,((24:2.724247E-4,36:3.022902E-4):0.002617803,(86:0.009684136,((131:0.008683396,(17:3.034172E-4,37:0.00119068):0.003243302):0.003700723,(38:0.003370474,(27:0.003502609,(23:0.003083009,125:0.005822465):0.001292799):9.12579E-4):0.001239246):0.001296776):9.753289E-4):0.004114051):0.003492886,(42:0.003354576,(68:0.001319379,(2:2.434345E-4,25:2.390795E-4):5.592221E-4):0.007219269,(12:0.003680988,(13:0.004418218,31:0.005437656):6.802128E-4,(28:0.001356025,90:0.001439003):0.002838871,(29:0.007854153,(69:0.001592547,(45:0.001177935,46:3.07993E-4):7.410106E-4):0.005910323):0.001034426,((169:0.001783233,170:0.001304728):0.009215862,((89:0.001361569,(6:3.145239E-4,10:6.916516E-4,41:6.2488E-4):0.001253945):0.002067886,((43:9.142706E-4,47:5.76645E-4):0.001118852,(48:0.003204463,(67:6.24972E-4,94:6.010848E-4):0.00135867):0.001272259):0.001054584):0.001743448):6.752468E-4):5.835184E-4):5.98202E-4):0.001820955):0.003982713):0.001529282):0.004142581):0.03439669):0.0096551); END;