#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on March 29, 2024; 5:48 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Koziak A., Cheng K., & Thorn R. 2007. Phylogenetic analyses of Nematoctonus and Hohenbuehelia (Pleurotaceae). Canadian Journal of Botany, 85. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1864] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=48; TAXLABELS Cantharocybe_gruberi Hohenbuehelia_angustata_EF409718 Hohenbuehelia_angustata_EF409719 Hohenbuehelia_angustata_EF409720 Hohenbuehelia_auriscalpium Hohenbuehelia_grisea_EF409756 Hohenbuehelia_grisea_EF409760 Hohenbuehelia_mastrucata_EF409735 Hohenbuehelia_mastrucata_EF409737 Hohenbuehelia_petalodes_AF139956 Hohenbuehelia_petalodes_EF409730 Hohenbuehelia_petalodes_EF409731 Hohenbuehelia_pinacearum_EF409722 Hohenbuehelia_portegna_AF139959 Hohenbuehelia_sp._RGT_010810_02 Hohenbuehelia_sp._RGT_940206_01 Hohenbuehelia_tremula Hohenbuehelia_unguicularis Nematoctonus_concurrens Nematoctonus_geogenius Nematoctonus_leiosporus_EF409738 Nematoctonus_leiosporus_EF409739 Nematoctonus_leiosporus_EF409741 Nematoctonus_pachysporus_EF409745 Nematoctonus_pachysporus_EF409746 Nematoctonus_pachysporus_EF409749 Nematoctonus_pachysporus_EF409750 Nematoctonus_pachysporus_EF409752 Nematoctonus_pachysporus_EF409753 Nematoctonus_pachysporus_EF409754 Nematoctonus_robustus_EF409758 Nematoctonus_robustus_EF409762 Nematoctonus_robustus_T014a_AF139952 'Nematoctonus sp. LC-03-016 DQ402531' Nematoctonus_subreniformis_EF409763 Nematoctonus_subreniformis_EF409764 Nematoctonus_tylosporus Pleurotus_abieticola Pleurotus_calyptratus Pleurotus_cystidiosus Pleurotus_djamor Pleurotus_eryngii Pleurotus_levis Pleurotus_ostreatus Pleurotus_tuberregium Resupinatus_porosus Tricholoma_matsutake Tricholoma_myomyces ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa2; DIMENSIONS NTAX=78; TAXLABELS Cantharocybe_gruberi Hohenbuehelia_angustata_EF409719 Hohenbuehelia_angustata_EF409720 Hohenbuehelia_angustata_T_091_EF409718 Hohenbuehelia_auriscalpium Hohenbuehelia_cf_atrolucida_AF042602 Hohenbuehelia_grisea_AF139955 Hohenbuehelia_grisea_AY265835 Hohenbuehelia_grisea_EF409756 Hohenbuehelia_grisea_EF409760 Hohenbuehelia_mastrucata_T_023a_EF409734 Hohenbuehelia_mastrucata_T_023b_EF409735 Hohenbuehelia_mastrucata_T_025a_EF409736 Hohenbuehelia_mastrucata_T_025b_EF409737 Hohenbuehelia_petalodes_AF139956 Hohenbuehelia_petalodes_DQ071723 Hohenbuehelia_petalodes_EF409729 Hohenbuehelia_petalodes_EF409730 Hohenbuehelia_petalodes_EF409731 Hohenbuehelia_pinacearum_EF409722 Hohenbuehelia_portegna_AF139959 Hohenbuehelia_sp._AY329598 Hohenbuehelia_sp._AY534112 Hohenbuehelia_sp._N_leptosposporus_EF409743 Hohenbuehelia_sp._UAMH5317_2_AF139960 Hohenbuehelia_tremula_DQ182504 Hohenbuehelia_tremula_EF409728 Hohenbuehelia_tristis_AF042601 Hohenbuehelia_tristis_AF135171 Hohenbuehelia_unguicularis_EF409721 Nematoctonus_concurrens_T183a_EF409723 Nematoctonus_concurrens_T183b_EF409724 Nematoctonus_geogenius_04RGTSN_513a_EF409732 Nematoctonus_geogenius_04RGTSN_513b_EF409733 Nematoctonus_geogenius_T019a_EF409726 Nematoctonus_geogenius_T019b_EF409727 Nematoctonus_leiosporus_T111_EF409738 Nematoctonus_leiosporus_T148a_EF409739 Nematoctonus_leiosporus_T148b_EF409740 Nematoctonus_leiosporus_T154a_EF409741 Nematoctonus_leiosporus_T154b_EF409742 Nematoctonus_pachysporus_01RGTSN_508a_EF409746 Nematoctonus_pachysporus_01RGTSN_508b_EF409747 Nematoctonus_pachysporus_01RGTSN_525_EF409748 Nematoctonus_pachysporus_01RGTSN_532_EF409753 Nematoctonus_pachysporus_01RGTSN_600_EF409749 Nematoctonus_pachysporus_02RGTSN_322a_EF409754 Nematoctonus_pachysporus_02RGTSN_322b_EF409755 Nematoctonus_pachysporus_04RGTSN_580_EF409750 Nematoctonus_pachysporus_T018a_EF409744 Nematoctonus_pachysporus_T018b_EF409745 Nematoctonus_pachysporus_T020a_EF409751 Nematoctonus_pachysporus_T020b_EF409752 Nematoctonus_robustus_01RGTSN_523_EF409761 Nematoctonus_robustus_01RGTSN_526_EF409762 Nematoctonus_robustus_03RGTSN_519_EF409757 Nematoctonus_robustus_03RGTSN_522a_EF409758 Nematoctonus_robustus_03RGTSN_571_EF409759 Nematoctonus_robustus_T_014a_2_AF139952 Nematoctonus_robustus_U51978 Nematoctonus_sp_AY261169 Nematoctonus_sp_AY261170 Nematoctonus_spLC_03_016_DQ402531 Nematoctonus_subreniformis_T137_EF409763 Nematoctonus_subreniformis_T138a_EF409764 Nematoctonus_subreniformis_T138b_EF409765 Nematoctonus_tylosporus Pleurotus_abieticola Pleurotus_calyptratus Pleurotus_cystidiosus Pleurotus_djamo Pleurotus_eryngii Pleurotus_levis Pleurotus_ostreatus Pleurotus_tuberregium Resupinatus_porosus Tricholoma_matsutake Tricholoma_myomyces ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M3712] TITLE 'Table 1, full matrix'; LINK TAXA = Taxa2; DIMENSIONS NCHAR=1924; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1930] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .] Cantharocybe_gruberi ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TTTTGGCCTACAAAAAA-CCTTATACAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCATTGAACGCACCTTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTTGAGTGTCATTAAATTATCAACCT--C-TTT---GGCTT---T?AAAGGT-CAATC-AGGCTTGGAT-GTGGGGG--TTTGCGGGCTTTTC-----ATAAAAGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCGGATTC--TTTTGCAGAGATCAGCATTCCCGGTGTGATAAAAATATCAATGCCGCGCTGTGAG------GC-GGGATCTG---CT----------------TCTAA--CATGGTCCCTTTGCTGGGACAGCTCTTTGACGATTTGACCTCAAATCAGGTAGGACTACCCGCTGAACTTAAGCATATCAATAAGCGACTTAAGCATATCAATAAGCGGAGGAAAAGAAACTAACAAGGATTCCCCTAGTAACTGCGAGTGAAGCGGGAAAAGCTCAAATTTGTAATC{CT}GGC-AGTC{CT}TTGCGGCTGTCCGAGTTGTAAACTAGAGAAGTGCTATCCGCGCTGGACCGTGTACAAGTCTCCTGGAATGGAGCGTCACAGAGGGTGAGAATCCCGTCTTTGACACGGACTGCCAGGGCTTTTGCGATGCGCTCTCGAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGC---TCAAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAACGCTTGAAGTCAGTCGCGTCGGCCAGGGATCAGCCTTGCATTTTTTGCTGGGTGCACTTCCTGGTTTTGACGGGTCAGCATCGATTTTGACCGCTGGATAAAGGTCAGGGGAATGTGGCATCTTCGGATGTG-TTATAGCCCCTGATCGCATACAGCGGTCGGGATCGAGGAACTCAGCACGCCGCAAGGCCGGGGTTTCGACCCACGTATCGTGCTTAGGATGCTGGCAAAATGGCTTTAATCGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATGCCTGCGAGTGTTTGGGTGGAAAACCCGAGCGCGCAATGAAAGTGAAAGTTGAGACCTCTGTCGTGGAGGGCATCGACGCCCGGACCTGACCTTTTGTGACGGATCCGCGGTGGAGCATGTATGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGTAGCGATTCTGACGTGCAAATCGATCGTCGAATTTGGGTATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACCATCTAGTAGCTGGTTCCTGCCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGAAAC??????????????????????????????????????????????????????????????????????? Hohenbuehelia_angustata_EF409719 ?????????????????????????????????TCCGTAGG-TGAACCTGCGGAAGGATCATTATGGTATTC-AC--C-TGCGATGCTG-TTG----CTGGCTCC--TT-GTGGGCAT-GTGCACGC-TTCGT-AA-GTTAATTTC--AACCACCTGTGAACCTTTTGTAGT---CTTGGG----------TGACGCTATAA-ATCAAAG--G--AA--ACTTTG--------GATTTGAATGTTGCTGGC-TTGTAAAAAGGTCGGC-TTCATTCTA-CA-GCAGAGCCC-------GGGT--ACTA-TG--CTTT----ACACACCCCA--TTGTATG-T-CACAGAATG----------TAATTCA--AGGGCTTCAATGCCTT-TAAA-CTTAATACAACTTTCAGCAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCCCTTTGGTATTCCGAAGGGCATGCCTGTTTGAGTGTCATTAAATTCTCAACCTT---AGAA--GGCTT---TGT--CTT-TTCTA-AGGCTTGGAT-GTGG-AG--GTTGCGGGC---TT-----TTC-AAGTCGGCTCCTCTGAAATGCATTAGCTGGG-T--TTGCGCCT---TCAGCC-TATTGGTGTGAT-A-ATTATCTACGCCT---CTTGGGTCGTGAGC-GTGTA-TA-AATC------TTTCCAGCT-TCTAA-CCGT-----CCGCAA--GGACAATAC-TTGACCATTTGACCTCAAATCAGGTAGGATTACCCGCTGA---------------------ACTTAAGCATATCAATAAGCGGAGGAAAAGAAACTAACAAGGATTCCCCTAGTAACTGCGAGTGAAGCGGGAAAAGCTCAAATTTGTAATCTGGC-GGTC--TTGGGCCGTCCGAATTGTAAACTAGAGAAGCGTTATCCGCGCTGGACCGTGTACAAGTCCCCTGGAATGGGGCGTCATAGAGGGTGAGAATCCCGTCTTTGACACGGACTACCAGGGC-TTTGTGATGCGCTCTCAAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGC---TCAAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGCTGAAAGGGAAACGCTTGAAGTCAGTCGCGTTGGCTAGGGATCAGCCTTAC-TCT--GGTGGGGTGTATTTCCTTG--TCGACGGGTCAGCATCAGTTTTGGTTGCTGGATAAAGGCCAGGGGAATGTGGCACCTTCGGGTGTG-TTATAGCCCTTGGTCAGATACAGTGGCTGGGACTGAGGAACTCAGCACGC-GCAAG---------------------CTGTGCTTAGGATGCTGGCAAAATG???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Resupinatus_porosus ???????????????????????????????????????????????????????????CATTATTGAATTC-AC--CCTGTG--GTCG-CTGTTGTCTGGCTTG-CTCTGCGAGCAT-GTGCACGCGGTCACAAATATTC-------AATCACCTGTGAACTTTTTGTAG-ATTTGAGAG---------------------TTTCAATC--AAGGA--AACTTG--------GATGTGGGGCTTGTCGGC-------------------TCGTTCGACTGCTCTTGACTC-----TCAAGT---CTA-TGT-CTTT----ACAAACTCT---GTATAAG-T-TATAGAATG----------TATTGAT--GGGCTTTCAAAGCCTT-TAA-TCTAAATACAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCCTTTGGTATTCCGAAGGGTATGCCTGTTTGAGTGTCATTAATTTCTCAAC-TT-C-AACC--AGCTTGC-------TGGTCTTG-AAGCTTGGAT-ATGG-AG--TTTGCGGGC---TT-----TTCGAAGTCGGCTTCTCTTAAATGCATTAGCAGAGTCTGCTGTG------CCAGC--TCTTGGTGTGAT-A-ATTATCTACGCCT----{GT}GTAGTT---GCACATTTATTG-------------ACCCGCT-TCTAA-TCGT-----CTCTTGCGAGACAATACAATGACTATTTGACCTCAAATCAAGTAGGACTACCCCCTGA---------------------ACTTAAGCATATCA--------------------------------------------------------------CTCAAATTTAAAATCTGGC-AGCT--TC--GCTGTCCGAGTTGTAATCTACAGAAG?GTTATCCGTGCTGGACCGTGTACAAGTCTCCTGGAATGGAGTGTCATACAGGGTGAGAATCCCGTCTTTGACACGGACTCCCAGTAC-ATTGTGATGCGCTCTCAAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGC---TCAAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAACGCTTGAAGTCAGTCGCGTTGTCTAAGAATCAACCTGAT-T----CATCAGGCGTACTTCTTAG--TTGACGGGTCAGCATCAGTTTTGACCATTGGAAAAAGGTTGAAGGAATGTGGCATCTTCGGATGTG-TTATAGCCTTCGATTGTATACAGTGGTTGGGACTGAGGAACTCAGCACGCCGAAAGGCCGGGGCATTGCTCACGT--ACGTGCTTAGGATGCTGGCATAATGGCTTTAATCGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATGCCTGCGAGTGTTTGGGTGGTAAACCCGAGCGCGCAATGAAAGTGAAAGTTGAGATCTCTGTCGTGGAGAGCATCGACGCCCGGTCCAGACCTTTTGTGACGGTGCCGCGGTAGAGCATGTATGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGTAGCGATTCTGACGTGCAAATCGATCGTCGAATTTGGGTATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACCATCTAGTAGCTGGTTCCTGCCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGAAACTCATTATCAGATTTATGTGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCCTTGGGGTTGAAACAACCTTAACCTATTCTC Tricholoma_matsutake ????????????????????????????????????????????????????????????????TTGAATAAAGC--TTGGTTAGGTTG-TCG----CTGGCTCT--CC--GGGGCAT-GTGCACGC-CTGAC----GCCAATCTTTTCACCACCTGTGCACATTTTGTAG---GCTTGGA----------TAAATATGT---CTCGAGG-----AA--GCTC----------GGTTTGAGGACTGCCGTGCTGCAA--AAGCCAGGCTTTCCTTGTATTT-------TTC-------CAGC---CTA-TGCATTTTATT-ATACACTC-----GGTATG-T-CATGGAATG----------TTATTTG-GTTGGCTTAATTGCCAG-TAAA-CCTTATACAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCGAGGAGCATGCCTGTTTGAGTGTCATGAAATTCTCAACCTTTTC------AGCTT---TTT--GT--TGAAT-AGGCTTGGATTTTGGGAGTTGTTGCAGGC---TGC----TCAGAAGTCTGCTCTCCTTAAATGTATTAGCGGGGCCCTTGTTGTCT-----AGC--ATTTGGTGTGAT-A-ATTATCTACGCCA----TTGTG-----AACAATGTAATA------------GGTCGGCT-TCTAA-TCGT----CTCGTAAAGAGACAATCT-CTGACATTTTGACCTCAAATCAGGTAGGACTACCCGCTGA---------------------ACTTAAGCATATCAATAAGCGGAGGAAAAGAAACTAACAAGGATTCCCCTAGTAACTGCGAGTGAAGCGGGAAAAGCTCAAATTTAAAATCTGAT-GGTCTTTATGGCCTTCCGAGTTGTAATCTAGAGAAGTGCTATCCGCGCTGGACCGTGTACAAGTCTCCTGGAACGGAGCGTCATAGAGGGTGAGAATCCCGTCTTTGCCACGGACTACCAGGGCTTATGTGATGCGCTCTCAAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGC---TCTAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGA--GAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAACGCTTGAAGTCAGTCGCGTTTACCAGGAATCAGCCTTGCTTTT--TGCTTGGCGCACTTTCTGG--TTAACGGGTCAGCATCAATTTTGATCGGTGGATAAAGGTCAGGAGAAGGTGGCATCTTCGGATGTGTTTATAGCTCTTGGTCGCATACATCGGTTGGGATTGAGGAACTCAGCACGCCGCACG----GGGTGTTTACACACGTTACGTGCTTAG??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Tricholoma_myomyces TCATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTATG--TGAACTGCGGAAGGATCATTATGGAATAA-GC--TTGGTTGGGTTG-TTG----CTGGCTCT--TA--GGAGTAT-GTGCACGC-CTAAC----ACCAACTTT--TACCACCTGTGCACCTTCTGTAG---ACCTGGA----------------TAAACTCTCGAGG-----AA--ACTC----------GGTTTGAGGACTGCTG----TGCG--CAAGCCGGCTTTCCTTGTA---------ATTC-------CGGT---CTA-TG---TTTTTATATATACCCCTACCAGTATG-T-CTCAGAATGT---------TTGTTGT--TGGGCTTGAATGCCTT-TAAA-CTTAATACAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCGAGGAGCATGCCTGTTTGAGTGTCATGAAATTCTCAACCTTTTC------AACTT---TTTCTGT--TGATC-AGGCTTGGAT-GTGGGAG--TATGCGGGC---TTC----TCAGAAGTCGGCTCTCCTGAAATGCATTAGCGGGACCTTTGTTGCCT-----GGC---TTTGGTGTGAT-A-ATTATCTACGCCA----TTGTG--AAGAGCAGCTTTATAAAGGA------GGTTCAGCT-TCTAA-TCGT----CTCTTTTCGAGACAACTT-CTGACAATTTGACCTCAAATCAGGTAG--------------------------------------------------------------------------------CCCTAGTAACTGCGAGTGAAGCGGGAAAAGCTCAAATTTAAAATCTGAG-GGTCTTTATGGCCTTCCGAGTTGTAATCTAGAGAAGTGCTATCCGCGCTGGACCGTGTACAAGTCTCCTGGAACGGAGCGTCATAGAGGGTGAGAATCCCGTCTTTGACACGGACTACCAGGGCTTATGTGATGCGCTCTCAAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGC---TCTAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAACGCTTGAAGTCAGTCGCATTGGCCAGGGATCAACCTTGC-TTT--TCCTTGGTGTATTTTCTGG--TTAATGGGTCAGCATCAATTTTGATCGGTGGAAAAAGATCAAGGGAATGTGGCATCTTCGGATGTG-TTATAGCCTTTGGTTGTATACATCGGTTGGGATTGAGGAACTCAGCACGCCGCAAGGCCGGGTTTTTAACCACGT--ACGTGCTTAG??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = 'Table 1, full matrix') = N: 1-1924; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = 'Table 1, full matrix') = N: 1-1924; END; BEGIN CHARACTERS; [! 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Hohenbuehelia_unguicularis 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Pleurotus_calyptratus 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Pleurotus_cystidiosus 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Pleurotus_djamor TCCGTAGG-TGAAC-TGCGGAAGGATCATTAATGAATTC-AG--CTTTTGAAGTTGTTTG----CTGGTCTC--TA--GGGACATTGTGCACGC-TTCATTAGTTTCCACTTC--ATACCCCTGTGCACCTTTGATAG-AT-TTCGGT----------TTCGGTTATCCTTTG------GTTAT--TTCTTT----------CTTAATTGAGAAAGGCCTTTGG------------TTTCCTTAAACG------ACTT--------------CTA-TA--CTATA---CCACACACCAA-ATGTATGTT-TTATTAATGAATGGGTTTATAATAAA--CAAGGCCATGAGCCTT-ATAAACTTAATACAACTTTCAACAACGGATCTCTTG---CTC-----------------------------TAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCCCTTTGGTATTCCGAAGGGCATGCCTGTTTGAGTGTCATTAAATTCTCAAACTCTAT------GACTT---TAT---TGTTGTAG-CTGTTTGGATTGCTGGGG--GTTGCTGGCGTCTTCT---TTTGAAGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCGGGACT--TTGTTGCC---TCTGC--GCATAGTGTGATAA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AATAAGCGGAGGAAAAGAAACTAACAAGGATTCCCCTAGTAACTGCGAGTGAAGCGGGAAAAGCTCAAATTTAAAATCTGGT-GGTC--TTTGGCCATCCGAATTGTAATCTAGAGAAGTGTTATCCGCGCTGGACCGTGTACAAGTCTCCTGGAATGGAGCGTCATAGAGGGTGAGAATCCCGTCTTTGACACGGACTACCAGGGC-TTTGTGATACACTCTCAACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGC---TCAAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAACGCTTGAAGTCAGTCGCGTCTCTCAGAAATCAACCTTAC-TTT--TGTATGGTGTACTTTCTGA--TAGATGGGTCAGCATCAGTTTTGGTTGCTGGACAAAGGTTAGAGAAATGTGGCATCTTCGGGTGTG-TTATAGTCTCTAATCATATACAGTGGCTGGGACTGAGGAACTCAGCACGCCGTAAGGCCGGGGCTTTTGCTCACGT-TCGTGCTTAG Pleurotus_eryngii TCCGTAGG-TGAAC-TGCGGAAGGATCATTAATGAATTC-AC----TATGGAGTTG-TTG----CTGGCCTC--TA--GGGGCAT-GTGCACGC-TTCACTA--GTC--TTTC--AACCACCTGTGAACTTTTGATAG-ATCTGTGAA-----------------GTCGTCTCCAAGTCGTTAG--ACTTGGTTTGCTGGGATGTAAACGT-------------------------CTCGGTGTGACT------ACGC--------AGT---CTA-TTTACTTA----TAACACCCCAA-ATGTATG-T-CTACGAATG----------TCATTTA--AAGGGCCTTGTGCCTA-TAAACCATAATACAACTTTCAACAACGGATCTCTTG---CTC-----------------------------TAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTTGAGTGTCATTAAATTCTCAAACTC----------ACTCTGGTTTTTCCAATTGTG-ATGTTTGGATTGTTGGGG--GCTGCTGGC---CT-----TGACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCAGGACTTCTCATTGCC---TCTGC-------GCATGAT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ATCAATAAGCGGAGGAAAAGAAACTAACAAGGATTCCCCTAGTAACTGCGAGTGAAGCGGGAAAAGCTCAAATTTAAAATCTGGT-GGTC--TTTGGCCATCCGAGTTGTAATCTAGAGAAGTGTTATCCGCGCTGGACCGTGTACAAGTCCCCTGGAATGGGGCGTCATAGAGGGTGAGAATCCCGTCTTTGACACGGACTACCAGGGC-TTTGTGATGCACTCTCAAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGC---TCAAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAACGCTTGAAGTCAGTCGCGTCTGCCAGGGATCAACCTTAC-TTT--TGTGAGGCGTACTTCCTGG--TTGATGGGTCAGCATCAGTTTTGGTTGCTGGATAAAGGTCAGAGAAATGTGGCA-CTTCGGGTGTG-TTATAGTCTTTGATCAGATACAGTGGCTGGGACTGAGGAACTCAGCG--CCGCAAGG--------------------CTGT-CTTAG Pleurotus_levis TCCGTAGG-TGAAC-TGCGGAAGGATCATTAATGAATTC-GC--T-CTTGAAGTTG-TTG----CTGGCCTC--TA--GGGGCAT-GTGCACGC-TTCATCAGTACCA-TTC---AACCACCTGTGCACCTTTGATAG-ATTCGCGAA--------------GTCGTCTGCGGATAG--G--------------------GGTTTGC-----------------------------CCCTTTTTAGTG-GCTGACTTT------GCGGT---CTA-----TATT----ACACACTCTTACATGTATGTT-TTATGAATG----------TCATTACTTTGGGCCATG-TGCCTA-TAAACC-TAATACAACTTTCAACAACGGATCTCTTG---CTC-----------------------------TAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTTGAGTGTCATTAAATTCTCAAATCT---ACAA--AGCTT---TTGTGA----TGTA-GAATTTGGATTGCTGGGG--GCTGCTGGC---TCGT---AACAGAGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCAGGACT--TTATTGCC---TCTGC--GCATGGTGTGATAA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ATCAATAAGCGGAGGAAAAGAAACTAACAAGGATTCCCCTAGTAACTGCGAGTGAAGCGGGAAAAGCTCAAATTTAAAATCTGGT-GGTC--TTTGGCCATCCGAGTTGTAATCTAGAGAAGTGTTATCCGCGCTGGACCGTGTACAAGTCCCCTGGAATGGGGCGTCATAGAGGGTGAGAATCCCGTCTTTGACACGGACTACCAGGGC-TTTGTGATGCACTCTCAAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGC---TCAAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAACGCTTGAAGTCAGTCGCGTCAGCCAGGGATCAACCTTAC-TTT--TGTGAGGTGTACTTCCTGG--TTGATGGGTCAGCATCAGTTTTGGTCGCTGGACAAAGGTTAGAGAAATGTGGCACCCTCGGGTGTG-TTATAGTCTTTGATCATATACAGTGGCTGGGACTGAGGAACTCAGCACGCCGCAAGGCCGGGGTTCGCCCACGT---TCGTGCTTAG Pleurotus_ostreatus ????????????ACCTGCGGAAGGATCATTAATGAATTC-AC----TATGGAGTTG-TTG----CTGGCCTC--TA--GGGGCAT-GTGCACGC-TTCACTA--GTC--TTTC--AACCACCTGTGAACTTTTGATAG-ATCTGTGAA--------------GTCGTCTTTCAAGTC--GTCAG--ACTTGGTGTGCTGGGATTTAAACGT-------------------------CTCGGTGTGACA------ACGC--------AGT---CTA-TTTACTTA----ACACACCCCAA-ATGTATG-T-CTACGAATG----------TCATTTA--ATGGGCCTTGTGCCTA-TAAACCATAATACAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTTGAGTGTCATTAAATTCTCAAACTC---------ACTTTGGTTTTTTCCAATTGTG-ATGTTTGGATTGTTGGGG--GCTGCTGGC---CT-----TGACAGGTCGGCTCCTCTTAAATGCATTAGCAGGACTTCTCATTGCC---TCTGC--GCATGATGTGAT-A-ATTATCACT-------CATCAATAGCACGC-ATGAATAG-----------AGTCCAGCTCTCTAA-TCGT-----CCGCAA--GGACAAT---TTGACAATTTGACCTCAAATCAGGTAGGACTACCCGCTGA---------------------ACTTAAGCATATCAATAAGCGGAGGAAAAGAAACTAACAAGGATTCCCCTAGTAACTGCGAGTGAAGCGGGAAAAGCTCAAATTTAAAATCTGGT-GGTC--TTTGGCCATCCGAGTTGTAATCTAGAGAAGTGTTATCCGCGCTGGACCGTGTACAAGTCCCCTGGAATGGGGCGTCATAGAGGGTGAGAATCCCGTCTTTGACACGGACTACCAGGGC-TTTGTGATGCACTCTCAAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGC---TCAAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAACGCTTGAAGTCAGTCGCGTCTGCCAGGGATCAACCTTAC-TTT--TGTGAGGCGTACTTCCTGG--TTGATGGGTCAGCATCAGTTTTGGTCGCTGGATAAAGGTCAGAGAAATGTGGCACCTTCGGGTGTG-TTATAGTCTTTGATCAGATACAGTGGCTGGGACTGAGGAACTCAGCG--CCGCAAGG--------------------CTGT-CTTAG Pleurotus_tuberregium ?????????????CCTGCGGAAGGATCATTAATGAATTC-AC--T-CTTGAAGCTG-TTG----CTGGCCTC--T--AGGGGCAT-GTGCACGC-TTCATCA--GTCC-ATTC--AACCACCTGTGCACTTTTTGTAG-ATTATTGAA-----------------GTCATCTCTCAG--G--TC--ATCAGT--------GACTTGGATGTCGGGAGGTTCTTA------------TACCTTCTG----GCTGACTCT-------CAGTGATCTA-----ATTT----ACACACCCTAA-ATGTATG-T-TAATGAATGT-------CTTTATCTT--TGGGCCATG-TGCCTA-TAAACCT-AA?ACAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTTGAGTGTCATTAAATTCTCAACCTA---TAAA--GGCTTTTGTTGAAGTCATTATA--GGCTTGGATTGTTGGGG--GCTGCTGGC---TT-----GTCAGAGTCAGCTCTCCTTAAATGCATTAGCAGGACT--CTATTGCC---TCTGC--GCATGGTGTGAT-A-ATTATCTACATCA------------GTTGC-ATGTAATA---CTATAATGTGTCCAGCTCTCTAA-TCGT-----CTTC----GGACAATT?-TTGAACATTTGACCTCAAATCAGGTAGGACTACCCGCTGA---------------------ACTTAAGCAT--CAATAAGCGGAGGAAAAGAAACTAACAAGGATTCCCCTAGTAACTGCGAGTGAAGCGGGAAAAGCTCAAATTTAAAATCTGGT-GGTC--TTTGGCCATCCGAGTTGTAATCTAGAGAAGTGTTATCCGCGCTGGACCGTGTACAAGTCTCCTGGAATGGGGCGTCATAGAGGGTGAGAATCCCGTCTTTGACACGGACTACCAGGGC-TTTGTGATGCACTCTCAAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGC---TCAAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGA?ACGCTTGAAGTCAGTCGCGTCAGCCAGGGATCAACCTTAC-TCTTCTGTGGGGTGTACTTCCTGG--TTGATGGGTCAGCATCAGTTTTG?CT?CTGGATAAAG?TCAGGGAAATGTGGCACCTCCGGGTGTG-TTATAGTCTCTGATCAGATACAGTGGCTGGGACTGAGGAACTCAGCACCCCGCAAGGCCGGGGTTCGCCCACGT---TCGTGCTTAG Resupinatus_porosus ??????????????????????????CATTATTGAATTC-AC--CCTGTG--GTCG-CTGTTGTCTGGCTTG-CTCTGCGAGCAT-GTGCACGCGGTCACAAATATTC-------AATCACCTGTGAACTTTTTGTAG-ATTTGAGAG---------------------TTTCAATC--AAGGA--AACTTG--------GATGTGGGGCTTGTCGGC-------------------TCGTTCGACTGCTCTTGACTC-----TCAAGT---CTA-TGT-CTTT----ACAAACTCT---GTATAAG-T-TATAGAATG----------TATTGAT--GGGCTTTCAAAGCCTT-TAA-TCTAAATACAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCACCCTTTGGTATTCCGAAGGGTATGCCTGTTTGAGTGTCATTAATTTCTCAAC-TT-C-AACC--AGCTTGC-------TGGTCTTG-AAGCTTGGAT-ATGG-AG--TTTGCGGGC---TT-----TTCGAAGTCGGCTTCTCTTAAATGCATTAGCAGAGTCTGCTGTG------CCAGC--TCTTGGTGTGAT-A-ATTATCTACGCCT----{GT}GTAGTT---GCACATTTATTG-------------ACCCGCT-TCTAA-TCGT-----CTCTTGCGAGACAATACAATGACTATTTGACCTCAAATCAAGTAGGACTACCCCCTGA---------------------ACTTAAGCATATCA--------------------------------------------------------------CTCAAATTTAAAATCTGGC-AGCT--TC--GCTGTCCGAGTTGTAATCTACAGAAG?GTTATCCGTGCTGGACCGTGTACAAGTCTCCTGGAATGGAGTGTCATACAGGGTGAGAATCCCGTCTTTGACACGGACTCCCAGTAC-ATTGTGATGCGCTCTCAAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGC---TCAAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAACGCTTGAAGTCAGTCGCGTTGTCTAAGAATCAACCTGAT-T----CATCAGGCGTACTTCTTAG--TTGACGGGTCAGCATCAGTTTTGACCATTGGAAAAAGGTTGAAGGAATGTGGCATCTTCGGATGTG-TTATAGCCTTCGATTGTATACAGTGGTTGGGACTGAGGAACTCAGCACGCCGAAAGGCCGGGGCATTGCTCACGT--ACGTGCTTAG Tricholoma_matsutake ???????????????????????????????TTGAATAAAGC--TTGGTTAGGTTG-TCG----CTGGCTCT--CC--GGGGCAT-GTGCACGC-CTGAC----GCCAATCTTTTCACCACCTGTGCACATTTTGTAG---GCTTGGA----------TAAATATGT---CTCGAGG-----AA--GCTC----------GGTTTGAGGACTGCCGTGCTGCAA--AAGCCAGGCTTTCCTTGTATTT-------TTC-------CAGC---CTA-TGCATTTTATT-ATACACTC-----GGTATG-T-CATGGAATG----------TTATTTG-GTTGGCTTAATTGCCAG-TAAA-CCTTATACAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCGAGGAGCATGCCTGTTTGAGTGTCATGAAATTCTCAACCTTTTC------AGCTT---TTT--GT--TGAAT-AGGCTTGGATTTTGGGAGTTGTTGCAGGC---TGC----TCAGAAGTCTGCTCTCCTTAAATGTATTAGCGGGGCCCTTGTTGTCT-----AGC--ATTTGGTGTGAT-A-ATTATCTACGCCA----TTGTG-----AACAATGTAATA------------GGTCGGCT-TCTAA-TCGT----CTCGTAAAGAGACAATCT-CTGACATTTTGACCTCAAATCAGGTAGGACTACCCGCTGA---------------------ACTTAAGCATATCAATAAGCGGAGGAAAAGAAACTAACAAGGATTCCCCTAGTAACTGCGAGTGAAGCGGGAAAAGCTCAAATTTAAAATCTGAT-GGTCTTTATGGCCTTCCGAGTTGTAATCTAGAGAAGTGCTATCCGCGCTGGACCGTGTACAAGTCTCCTGGAACGGAGCGTCATAGAGGGTGAGAATCCCGTCTTTGCCACGGACTACCAGGGCTTATGTGATGCGCTCTCAAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGC---TCTAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGA--GAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAACGCTTGAAGTCAGTCGCGTTTACCAGGAATCAGCCTTGCTTTT--TGCTTGGCGCACTTTCTGG--TTAACGGGTCAGCATCAATTTTGATCGGTGGATAAAGGTCAGGAGAAGGTGGCATCTTCGGATGTGTTTATAGCTCTTGGTCGCATACATCGGTTGGGATTGAGGAACTCAGCACGCCGCACG----GGGTGTTTACACACGTTACGTGCTTAG Tricholoma_myomyces TCCGTATG--TGAACTGCGGAAGGATCATTATGGAATAA-GC--TTGGTTGGGTTG-TTG----CTGGCTCT--TA--GGAGTAT-GTGCACGC-CTAAC----ACCAACTTT--TACCACCTGTGCACCTTCTGTAG---ACCTGGA----------------TAAACTCTCGAGG-----AA--ACTC----------GGTTTGAGGACTGCTG----TGCG--CAAGCCGGCTTTCCTTGTA---------ATTC-------CGGT---CTA-TG---TTTTTATATATACCCCTACCAGTATG-T-CTCAGAATGT---------TTGTTGT--TGGGCTTGAATGCCTT-TAAA-CTTAATACAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCGAGGAGCATGCCTGTTTGAGTGTCATGAAATTCTCAACCTTTTC------AACTT---TTTCTGT--TGATC-AGGCTTGGAT-GTGGGAG--TATGCGGGC---TTC----TCAGAAGTCGGCTCTCCTGAAATGCATTAGCGGGACCTTTGTTGCCT-----GGC---TTTGGTGTGAT-A-ATTATCTACGCCA----TTGTG--AAGAGCAGCTTTATAAAGGA------GGTTCAGCT-TCTAA-TCGT----CTCTTTTCGAGACAACTT-CTGACAATTTGACCTCAAATCAGGTAG--------------------------------------------------------------------------------CCCTAGTAACTGCGAGTGAAGCGGGAAAAGCTCAAATTTAAAATCTGAG-GGTCTTTATGGCCTTCCGAGTTGTAATCTAGAGAAGTGCTATCCGCGCTGGACCGTGTACAAGTCTCCTGGAACGGAGCGTCATAGAGGGTGAGAATCCCGTCTTTGACACGGACTACCAGGGCTTATGTGATGCGCTCTCAAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGC---TCTAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAACGCTTGAAGTCAGTCGCATTGGCCAGGGATCAACCTTGC-TTT--TCCTTGGTGTATTTTCTGG--TTAATGGGTCAGCATCAATTTTGATCGGTGGAAAAAGATCAAGGGAATGTGGCATCTTCGGATGTG-TTATAGCCTTTGGTTGTATACATCGGTTGGGATTGAGGAACTCAGCACGCCGCAAGGCCGGGTTTTTAACCACGT--ACGTGCTTAG ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = Table_1._ITS_and_nLSU_rDNA) = N: 1-1456; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = Table_1._ITS_and_nLSU_rDNA) = N: 1-1456; END; BEGIN TREES; TITLE Tb8553; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Tricholoma_myomyces, 2 Tricholoma_matsutake, 3 Resupinatus_porosus, 4 Pleurotus_tuberregium, 5 Pleurotus_ostreatus, 6 Pleurotus_levis, 7 Pleurotus_eryngii, 8 Pleurotus_djamor, 9 Pleurotus_cystidiosus, 10 Pleurotus_calyptratus, 11 Pleurotus_abieticola, 12 Nematoctonus_tylosporus, 13 Nematoctonus_subreniformis_EF409764, 14 Nematoctonus_subreniformis_EF409763, 15 'Nematoctonus sp. LC-03-016 DQ402531', 16 Nematoctonus_robustus_T014a_AF139952, 17 Nematoctonus_robustus_EF409762, 18 Nematoctonus_robustus_EF409758, 19 Nematoctonus_pachysporus_EF409754, 20 Nematoctonus_pachysporus_EF409753, 21 Nematoctonus_pachysporus_EF409752, 22 Nematoctonus_pachysporus_EF409750, 23 Nematoctonus_pachysporus_EF409749, 24 Nematoctonus_pachysporus_EF409746, 25 Nematoctonus_pachysporus_EF409745, 26 Nematoctonus_leiosporus_EF409741, 27 Nematoctonus_leiosporus_EF409739, 28 Nematoctonus_leiosporus_EF409738, 29 Nematoctonus_geogenius, 30 Nematoctonus_concurrens, 31 Hohenbuehelia_unguicularis, 32 Hohenbuehelia_tremula, 33 Hohenbuehelia_sp._RGT_940206_01, 34 Hohenbuehelia_sp._RGT_010810_02, 35 Hohenbuehelia_portegna_AF139959, 36 Hohenbuehelia_pinacearum_EF409722, 37 Hohenbuehelia_petalodes_EF409731, 38 Hohenbuehelia_petalodes_EF409730, 39 Hohenbuehelia_petalodes_AF139956, 40 Hohenbuehelia_mastrucata_EF409737, 41 Hohenbuehelia_mastrucata_EF409735, 42 Hohenbuehelia_grisea_EF409760, 43 Hohenbuehelia_grisea_EF409756, 44 Hohenbuehelia_auriscalpium, 45 Hohenbuehelia_angustata_EF409720, 46 Hohenbuehelia_angustata_EF409719, 47 Hohenbuehelia_angustata_EF409718, 48 Cantharocybe_gruberi; TREE Fig._2 = [&R] (((3,(((31,36)Nematoctonus_brevisporus,((((((19,21,20),((22,25),(23,24)))Nematoctonus_pachysporus,(40,41)'Nematoctonus hamatus - Hohenbuehelia mastrucata'),((34,(((26,27),28)Nematoctonus_leiosporus,((((45,47),((37,38),32),46),(39,44)),29))),12)),(((14,13)Nematoctonus_subreniformis,(30,15)),33)),(((17,(16,42)),(18,43))Nematoctonus_robustus,35)))'Nematoctonus-Hohenbuehelia',(4,((((10,8),(7,(11,5))),9),6))Pleurotus)Pleurotaceae_s._str.),48)Pleurotaceae,(1,2)); END; BEGIN TREES; TITLE Tb8554; LINK TAXA = Taxa2; TRANSLATE 1 Nematoctonus_pachysporus_02RGTSN_322b_EF409755, 2 Nematoctonus_pachysporus_02RGTSN_322a_EF409754, 3 Nematoctonus_pachysporus_01RGTSN_600_EF409749, 4 Nematoctonus_pachysporus_01RGTSN_532_EF409753, 5 Nematoctonus_pachysporus_01RGTSN_525_EF409748, 6 Nematoctonus_pachysporus_01RGTSN_508b_EF409747, 7 Nematoctonus_pachysporus_01RGTSN_508a_EF409746, 8 Nematoctonus_leiosporus_T154b_EF409742, 9 Nematoctonus_leiosporus_T154a_EF409741, 10 Nematoctonus_leiosporus_T148b_EF409740, 11 Nematoctonus_leiosporus_T148a_EF409739, 12 Nematoctonus_leiosporus_T111_EF409738, 13 Nematoctonus_geogenius_T019b_EF409727, 14 Nematoctonus_geogenius_T019a_EF409726, 15 Nematoctonus_geogenius_04RGTSN_513b_EF409733, 16 Nematoctonus_geogenius_04RGTSN_513a_EF409732, 17 Nematoctonus_concurrens_T183b_EF409724, 18 Nematoctonus_concurrens_T183a_EF409723, 19 Hohenbuehelia_unguicularis_EF409721, 20 Hohenbuehelia_tristis_AF135171, 21 Hohenbuehelia_tristis_AF042601, 22 Hohenbuehelia_tremula_EF409728, 23 Hohenbuehelia_tremula_DQ182504, 24 Hohenbuehelia_sp._UAMH5317_2_AF139960, 25 Hohenbuehelia_sp._N_leptosposporus_EF409743, 26 Hohenbuehelia_sp._AY534112, 27 Hohenbuehelia_sp._AY329598, 28 Hohenbuehelia_portegna_AF139959, 29 Hohenbuehelia_pinacearum_EF409722, 30 Hohenbuehelia_petalodes_EF409731, 31 Hohenbuehelia_petalodes_EF409730, 32 Hohenbuehelia_petalodes_EF409729, 33 Hohenbuehelia_petalodes_DQ071723, 34 Hohenbuehelia_petalodes_AF139956, 35 Hohenbuehelia_mastrucata_T_025b_EF409737, 36 Hohenbuehelia_mastrucata_T_025a_EF409736, 37 Hohenbuehelia_mastrucata_T_023b_EF409735, 38 Hohenbuehelia_mastrucata_T_023a_EF409734, 39 Hohenbuehelia_grisea_EF409760, 40 Hohenbuehelia_grisea_EF409756, 41 Hohenbuehelia_grisea_AY265835, 42 Hohenbuehelia_grisea_AF139955, 43 Hohenbuehelia_cf_atrolucida_AF042602, 44 Hohenbuehelia_auriscalpium, 45 Tricholoma_myomyces, 46 Tricholoma_matsutake, 47 Resupinatus_porosus, 48 Pleurotus_tuberregium, 49 Pleurotus_ostreatus, 50 Pleurotus_levis, 51 Pleurotus_eryngii, 52 Pleurotus_djamo, 53 Pleurotus_cystidiosus, 54 Pleurotus_calyptratus, 55 Pleurotus_abieticola, 56 Nematoctonus_tylosporus, 57 Nematoctonus_subreniformis_T138b_EF409765, 58 Nematoctonus_subreniformis_T138a_EF409764, 59 Nematoctonus_subreniformis_T137_EF409763, 60 Nematoctonus_spLC_03_016_DQ402531, 61 Nematoctonus_sp_AY261170, 62 Nematoctonus_sp_AY261169, 63 Nematoctonus_robustus_U51978, 64 Nematoctonus_robustus_T_014a_2_AF139952, 65 Nematoctonus_robustus_03RGTSN_571_EF409759, 66 Nematoctonus_robustus_03RGTSN_522a_EF409758, 67 Nematoctonus_robustus_03RGTSN_519_EF409757, 68 Nematoctonus_robustus_01RGTSN_526_EF409762, 69 Nematoctonus_robustus_01RGTSN_523_EF409761, 70 Nematoctonus_pachysporus_T020b_EF409752, 71 Nematoctonus_pachysporus_T020a_EF409751, 72 Nematoctonus_pachysporus_T018b_EF409745, 73 Nematoctonus_pachysporus_T018a_EF409744, 74 Nematoctonus_pachysporus_04RGTSN_580_EF409750, 75 Hohenbuehelia_angustata_T_091_EF409718, 76 Hohenbuehelia_angustata_EF409720, 77 Hohenbuehelia_angustata_EF409719, 78 Cantharocybe_gruberi; TREE NJ = [&R] (((78,47),((((((((((((((((77,((31,15),(30,16))),(22,61)),(76,75)),62),((44,(34,32)),(14,13))),(12,((11,10),(9,8)))),33),25),56),43),(((38,37),(36,35)),(((((7,5),6),3),(74,(73,72))),(4,(2,(1,(71,70))))))),((((42,((((((41,(26,63)),(27,23)),39),69),68),64)),28),(((18,17),60),(59,(58,57)))),24)),(((40,(67,65)),66),20)),(29,19)),21),(((((55,49),51),(53,50)),(54,52)),48))),(46,45)); END;