#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 24, 2024; 23:21 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Tsutsumi C., Zhang X., & Kato M. 2007. Molecular phylogeny of Davalliaceae and implications for the classification. Systematic Botany, null. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1867] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=44; TAXLABELS Araiostegia_faberiana Araiostegia_hymenophylloides Araiostegia_parvipinnula Araiostegia_perdurans Araiostegia_pulchra Araiostegia_yunnanensis Arthropteris_beckleri Davallia_aff_mariesii Davallia_chaerophylloides Davallia_corniculata Davallia_denticulata_P Davallia_denticulata_S Davallia_divaricata Davallia_embolostegia Davallia_epiphylla Davallia_fejeensis Davallia_formosana Davallia_griffithiana Davallia_mariesii Davallia_mariesii_var_stenolepis Davallia_petelotii Davallia_plumosa Davallia_pyxidata Davallia_solida_NC Davallia_solida_WS Davallia_tasmani Davallia_trichomanoides Davallia_tyermanii Davallodes_borneense Davallodes_burbidgei Davallodes_gymnocarpum Humata_aff_parvula Humata_aff_polypodioides Humata_banksii Humata_heterophylla Humata_melanophlebia Humata_parvula Humata_polypodioides Humata_vestita Oleandra_wallichii Paradavallodes_multidentatum Scyphularia_pentaphylla Scyphularia_pycnocarpa Scyphularia_triphylla ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M3720] TITLE Davalliaceae_070412; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=4937; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Araiostegia_faberiana 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Araiostegia_hymenophylloides 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Araiostegia_parvipinnula 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Araiostegia_perdurans 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Araiostegia_pulchra 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Araiostegia_yunnanensis 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Arthropteris_beckleri 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Davallia_chaerophylloides 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Davallia_corniculata 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Davallia_denticulata_P 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Davallia_denticulata_S 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Davallia_divaricata 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Davallia_embolostegia 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Davallia_epiphylla 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Davallia_fejeensis 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Davallia_formosana 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Davallia_griffithiana 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Davallia_mariesii 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Davallia_petelotii 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Davallia_plumosa 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Davallia_pyxidata 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Davallia_trichomanoides 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Davallia_tyermanii 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Davallodes_borneense 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Davallodes_burbidgei 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Davallodes_gymnocarpum 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Humata_heterophylla 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Humata_melanophlebia 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Humata_parvula 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Humata_polypodioides 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Humata_vestita 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Oleandra_wallichii 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Paradavallodes_multidentatum 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Scyphularia_pentaphylla 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Scyphularia_triphylla CCAACTCCCCTGAAAGAATCATTTGAAATCCCTTAATGGTTTCCGATAAACTGACGTATTTACCCGGAGATCCGGTGAAAACTTCCGCTACAAAAAAAGGTTGTGACAAGAAACGTTCTATTTTTCGAGCCCTAGCTACCGTCTGTCGATCCTCTTCAGATAACTCGTCTAGTCCGGGAATAGCTATAATATCTTGAAGTTCCTTGTAACGTTGCAGAGTCTGCTTAACCCCCTGTGCCGTCTCATAGTGTTCCTCACCTACAATCCAAGGCTGTAACATAGTCGAGGTTGAATCCAGCGGGTCTACGGCTGGGTAAATACCTTTTGCTGCTAATCCCCTTGAAAGTACAGTAGTAGCGTCTAAATGTGCAGATGTCGTGGCGGGAGCCGGGTCGGTCAAATCATCCGCAGGCACGTAAACAGCTTGAATGGAAGTTATTGATCCTTCCTTGGTAGAAGTAATTCTTTCCTGCAATGATCCCATTTCTGTACCGAGGGTCGGTTGATAACCTACGGCGGAAGGCATCCTACCCAGTAACGCCGAGACCTCTGATCCCGCCTGAACAAAGCGAAAAATATTGTCAATAAATAGCAGTACATCTTGTTTGTTAACATCTCGGAAGTATTCTGCCATTGTTAGAGCAGTTGATCCAACTCTCATACGAGCTCCCGGTGGTTCATTCATCTGACCATAAACCAAAGCTACTTTTGATTCAGAAATATTTTGTTCATTAATAACTTTTGATTCCTTCATTTCCATGTAAAGGTCATTACCTTCACGTGTGCGTTCTCCTACCCCGCCAGATACTGATACACCTCCATGAGCTTTCGCAATATTATTAATTGATTCCATGATAGGGACCGTCTTTCCAACTCCAGCCCCACCAAATAACCCGATTTTCCCGCCTCTACGATACGGAGCCAAAAGATCCACAACTTTTATACCCGTTTCGAAAATCGATAATTTGGTATCTAACTGGGTAAATGCCGGGGCGGGCCTGTGAATTGGAAATGTCGTACCACTTTGAACGGGACCCAAATTGTCTACAGGTTCACCGAGGACGTTGGATATTCGGCCAAGAGTAGTTTCACCAACGGGAACACTGAGGGGAGCGCCCGTATCAACAGCACCCATACCTCTCATCAAACCGTCTGTAGCACTCATAGCTACGGCTCTTACTTCATTATTCCCTAATAGTTGTTGGACCTCACAAGTAACATCGATTTGCTGACCAGCTGAATTTTGCCCCCTGACTACTAGTGAGTTGTAGATATTAGGCATCTCCCCTGGGGAGGAAGCCACATCCAAAACTGGTCCAATGATCTGAGTGATGTAACCCACATTTTTCTCCACCAATTCAGAAATCTCAAAAGAGAGGCAACTGGTTTTCATAACTATACTATCTCGGTGTATTATCTCTATTTGATTATTGAATCGGTAGAAATATTTTGTATCTT-ATCGTTGAGTGGTCCATGGCTGAGGAG----AAGTCAACTGTTCCCCTCCC-----ACTCACTTCCCTCTATTTAAATATGTTTTGTAGATGTAGCTATAGATAAATTAGGTCTGCACCGAGGATGAAGCAGACTCCTTCT-----AT-TGTTTCGTATACGATCG-CAAAACT------GATAAAATGTGCG------CCCTATCC------ATTGGA-TATTGATTATTAGGGTATGCGTTTTGCTTCCTTTACTTTTTC-TTCTTT---TTATTTTT-CAAATAAAATTGACCATTAAACG-GAGGGATTGGCAATTATGCAATTTGTGTTCCACTGAATAGTCTAACCACCAAGAGATTCCCTAGTCAATGTATCGAAATGACACAAAGCGCTGCTTCCTAAGCAGTTTTTGCAATAAAACAGATTGATTAGTTGCACCCTGCAGTAGGCGCGATATAAAATGATAATGTTCCATGCTTGAAATGGATTTTTGACAGGTATAAGTATCACGCGTGGGTTGAACTA-------TCCACTTTGCGTTTCACGTCGAAAAGCTTTACCTATGCCGAGCAGATCTCATATTTGCAAGATTTATTAATTGAGTCATAGGGAGGAACAAACCAATGTCACCACAAACGGAGACTAAAGCAGGTGTTGGATTCAAAGCTGGTGTCAAAGATTATCGATTGACTTATTACACCCCTGAATACAAGACCAAAGATACCGATATCTTAGCAGCATTTCGAATGACCCCACAACCTGGAGTACCAGCTGAGGAAGCTGGAGCTGCGGTAGCTGCAGAATCCTCCACAGGTACGTGGACCACTGTATGGACAGATGGGTTGACCAGCCTTGACCGTTACAAGGGCCGATGCTACGACATCGAACCCGTCGCTGGAGAAGAAAACCAGTATATCGCGTATGTAGCTTATCCTTTGGATCTATTTGAAGAAGGTTCTGTGACCAACTTATTCACCTCCATAGTAGGTAATGTCTTTGGATTTAAGGCTCTACGCGCTCTACGCTTGGAAGACATTCGAGTTCCTCCCGCTTATTCTAAAACTTTCATGGGACCGCCTCATGGTATTCAGGTTGAAAGGGATAAACTGAACAAATATGGACGCCCTTTATTGGGATGTACAATCAAGCCAAAATTAGGCCTGTCCGCTAAAAATTATGGTAGAGCCGTTTACGAATGCCTTCGTGGTGGACTTGATTTCACAAAAGATGATGAAAATGTGAATTCGCAGCCATTCATGCGTTGGAGAGATCGCTTCCTATTCGTGGCGGAAGCCCTTTTCAAATCCCAGGCTGAAACAGGGGAAATTAAAGGCCATTACTTAAATGCTACTGCAGGTACATCTGAAGAGATGTTGAAAAGAGCTGTTTTTGCTAGAGAGTTGGGTGCACCAATTGTCATGCATGACTACCTGACCGGAGGGTTTACCGCAAATACCAGCTTAGCTCATTATTGCAGAGATAATGGACTGCTTCTTCATATTCACCGCGCGATGCATGCTGTAATCGATAGGCAGCGAAATCATGGTATGCATTTTCGTGTATTGGCCAAAGCGTTACGCATGTCCGGCGGGGATCATATACACGCTGGAACTGTAGTAGGCAAACTAGAAGGGGAACGAGAAGTCACCCTCGGTTTCGTCGATTTACTTCGCGACGATTACATTGAAAAAGATCGTAGCCGTGGTATCTATTTCACGCAAGATTGGGTATCTATGCCAGGTGTAATTCCCGTAGCTTCGGGGGGTATTCACGTTTGGCACATGCCTGCTCTAACCGAAATCTTTGGGGACGATGCCGTATTACAGTTTGGCGGAGGAACCTTAGGACATCCTTGGGGAAATGCGCCAGGTGCGGTAGCTAACCGAGTTGCATTAGAAGCTTGCGTACAGGCTCGTAATGAAGGTCGTGACCTCGCCCGCGAAGGTAATGAGATTATTCGTGAAGCCAGTAAGTGGAGTCCAGAATTGGCTGCCGCATGCGAGATATGGAAAGCCATCAAATTTGAATTTGATACAATTGATACGTTGTAAATAGATTGAAACTTTCATAACTAT------TTGCTATCGGTATCTGCTCCGCAACAG----TTGTGAGACAGAT----CAGGAGTATCGGTAAGGAGTTA--ACCTCCGCCATACTCCTAGTCTAATAAGCAATACAGAAGAAAGTTGGTTAATTTATG-----ATGGAAACTAGGAAACACATAGTCTCAAAATGGGAATTTGAGGGTTCGACTCCCCACCAACTAATATTGAA---------------------------------------------------CCCTACGGCTCA----TTTCTATTAGAATCATTTTTATATTGTTTAGTTTCACAGCATATTGCCTCGTTTATTT-CGTTGGATAATAGAAATCGAACACTTACAATACGATTGATTT-----------------GATAGATAACTAGTCAATTATCAATTATTTATTGGATCACCAAACTTGGATTTGGTCCCGATTTATT--------------GATACCTAGGAAAGAA------AAGTTCGTAATATCATAA-----------GAAATCTATTTCTTC----CCCGGGTTAAAAGGAAACAACAGATGCGGAGATTCTTACGTCTGTAACAAATTGGTTTGAGGATAAACGCAAATTTGGTGGATTGATTGGAGCTTTCCTCGAAGAAGCTACCAGAGG---CTCTATTTCAAATGAAAGAGAGAGAGAGAAGCGGATAAGTGTTAACACGAATAGAGGATTACGGGCTCGATGTGATAATTGCGGAAACATGCTTTATGTTAAATATTTGAAACAGAATAAAAGTGTTTGTGAAGAACGCGGTTATCATCTCCCAATGAATAGTATGGAAAGGATCGAACTCTTGGTTGATCGTAACACATGGATTCCTATGGATGAAAACATGACTACAAAAGATGTTTTAGATTTTTCCGACGAGGATTCTCACCAGAATCGTGTAGCTATTTCTCAAGAAAAGACAGGTCTAACTGACGCTGTTCAAACAGGTATAGGATATCTAAATGGAACACTTATTGCGCTTGGTGCTATGGACTTCCACTTCATGGGAGGAAGTATGGGTTCCGTTGTGGGTGAAAAGATAACTCGCCTAATTGAATATGCTACGGCTAAGTCTTTGCCACTGGTTCTAATTTGTGCCTCTGGGGGAGCGCGTATGCAAGAAGGAACGTTGAGCTTGATGCAGATGGCTAAAATATCTTCTGCCTTACAAATTCATCAAGTTCGAAAAAAATTGCTTCATATATCGATTCTTACTTATCCAACCACTGGAGGCGTCACTGCCAGTTTTGGCATGTTGGGGGATATAATCATTGCCGAGTCCAAAGCGTATACAGCATTCGCTGGTAAAAGGGTAATTGAACAGACATCGCGCCAAAAGATACCTGAGGGCT ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = Davalliaceae_070412) = N: 1-4937; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = Davalliaceae_070412) = N: 1-4937; END; BEGIN TREES; TITLE Tb8571; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Scyphularia_pycnocarpa, 2 Scyphularia_pentaphylla, 3 Davallia_tasmani, 4 Davallia_pyxidata, 5 Davallia_solida_NC, 6 Davallia_fejeensis, 7 Davallia_solida_WS, 8 Araiostegia_faberiana, 9 Araiostegia_parvipinnula, 10 Araiostegia_perdurans, 11 Davallia_trichomanoides, 12 Davallia_petelotii, 13 Davallia_griffithiana, 14 Davallia_tyermanii, 15 Davallia_aff_mariesii, 16 Davallia_mariesii, 17 Davallia_mariesii_var_stenolepis, 18 Davallia_formosana, 19 Davallia_divaricata, 20 Davallia_epiphylla, 21 Davallia_denticulata_P, 22 Davallia_denticulata_S, 23 Davallia_embolostegia, 24 Oleandra_wallichii, 25 Davallia_chaerophylloides, 26 Davallia_plumosa, 27 Paradavallodes_multidentatum, 28 Araiostegia_yunnanensis, 29 Araiostegia_hymenophylloides, 30 Araiostegia_pulchra, 31 Davallodes_borneense, 32 Davallodes_burbidgei, 33 Davallodes_gymnocarpum, 34 Humata_heterophylla, 35 Humata_aff_polypodioides, 36 Humata_polypodioides, 37 Davallia_corniculata, 38 Humata_parvula, 39 Humata_aff_parvula, 40 Humata_melanophlebia, 41 Humata_banksii, 42 Humata_vestita, 43 Scyphularia_triphylla, 44 Arthropteris_beckleri; TREE Fig._1 = [&R] ((44,24),(((((23,(22,21),20),25),(19,18)),((((((17,16),((15,14),13)),(12,11)),(((((7,6,5),4),3),((2,1),26)),43)),((((42,(41,40)),(39,38)),37),((36,35),34))),((10,9),8))),((((33,32),(31,29)),28),(30,27)))); END;