#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on March 29, 2024; 0:50 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Leveille-bourret E., Donadio S., Gilmour C.N., & Starr J.R. 2015. Rhodoscirpus (Cyperaceae: Scirpeae), a new South American sedge genus supported by molecular, morphological, anatomical and embryological data. Taxon, 64(5): 931-944. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S18774] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=43; TAXLABELS Amphiscirpus_nevadensis_STA2141 Amphiscirpus_nevadensis_STA2213 Blysmus_rufus_STA1913 Calliscirpus_brachythrix_STA2134 Calliscirpus_criniger_STA1899 Carex_acicularis_STA84_AY242012S2 Carex_blanda_STA183_AY241983 Carex_capitata_STA395_DQ115119 Carex_siderosticta_STA733_DQ998892 Carex_stipata_STA1808_AY757375 Dulichium_arundinaceum_STA154_STA2469 Eleocharis_acicularis_d484 Eriophorum_angustifolium_subsp_angustifolium_STA1777_STA2547 Eriophorum_russeolum_subsp_russeolum_STA1793_STA2562 Eriophorum_vaginatum_subsp_spissum_STA1804_STA2607 Eriophorum_virginicum_STA1807_STA2608 Eriophorum_viridicarinatum_STA1779 Erioscirpus_comosus_STA2092 Fimbristylis_ovata_STA328 Khaosokia_caricoides_STA387 Phylloscirpus_deserticola_STA2101 Phylloscirpus_deserticola_STA2146 Scirpus_ancistrochaetus_dS035 Scirpus_asper_Argentina_STA2173 Scirpus_asper_Argentina_STA2174 Scirpus_asper_Chile_STA2065 Scirpus_asper_Chile_STA2708 Scirpus_asper_Chile_STA2709 Scirpus_asper_Peru_STA2706 Scirpus_cyperinus_STA1773 Scirpus_divaricatus_dS014_STA2703 Scirpus_hattorianus_STA1984_STA2566 Scirpus_maximowiczii_STA1919 Scirpus_microcarpus_STA1976_STA2570 Scirpus_pendulus_STA1978_STA2569 Scirpus_polyphyllus_dS050 Scirpus_polystachyus_STA349 Scirpus_radicans_STA1915 Scirpus_wichurae_dS003 Trichophorum_alpinum_STA1815 Trichophorum_cespitosum_STA1819 Zameioscirpus_atacamensis_STA2105_2143 Zameioscirpus_muticus_STA2062 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M34946] TITLE 'Rhodoscirpus matK + ndhF + ETS + matK_gaps + ETS_gaps'; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=3355; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Trichophorum_alpinum_STA1815 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; END; BEGIN SETS; CHARSET plastid (CHARACTERS = 'Rhodoscirpus matK + ndhF + ETS + matK_gaps + ETS_gaps') = 1-2555 3304-3316; CHARSET matK_gaps (CHARACTERS = 'Rhodoscirpus matK + ndhF + ETS + matK_gaps + ETS_gaps') = 3304-3316; CHARSET ndhF (CHARACTERS = 'Rhodoscirpus matK + ndhF + ETS + matK_gaps + ETS_gaps') = 1330-2555; CHARSET nuclear (CHARACTERS = 'Rhodoscirpus matK + ndhF + ETS + matK_gaps + ETS_gaps') = 2556-3303 3317-3355; CHARSET matK (CHARACTERS = 'Rhodoscirpus matK + ndhF + ETS + matK_gaps + ETS_gaps') = 1-1329; CHARSET ETS (CHARACTERS = 'Rhodoscirpus matK + ndhF + ETS + matK_gaps + ETS_gaps') = 2556-3303; CHARSET ETS_gaps (CHARACTERS = 'Rhodoscirpus matK + ndhF + ETS + matK_gaps + ETS_gaps') = 3317-3355; END; BEGIN TREES; TITLE Rhodoscirpus_parsBoot; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Eleocharis_acicularis_d484, 2 Erioscirpus_comosus_STA2092, 3 Fimbristylis_ovata_STA328, 4 Blysmus_rufus_STA1913, 5 Dulichium_arundinaceum_STA154_STA2469, 6 Khaosokia_caricoides_STA387, 7 Carex_acicularis_STA84_AY242012S2, 8 Carex_blanda_STA183_AY241983, 9 Carex_capitata_STA395_DQ115119, 10 Carex_siderosticta_STA733_DQ998892, 11 Carex_stipata_STA1808_AY757375, 12 Calliscirpus_brachythrix_STA2134, 13 Calliscirpus_criniger_STA1899, 14 Trichophorum_alpinum_STA1815, 15 Trichophorum_cespitosum_STA1819, 16 Amphiscirpus_nevadensis_STA2141, 17 Amphiscirpus_nevadensis_STA2213, 18 Phylloscirpus_deserticola_STA2101, 19 Phylloscirpus_deserticola_STA2146, 20 Scirpus_asper_Argentina_STA2173, 21 Scirpus_asper_Argentina_STA2174, 22 Scirpus_asper_Peru_STA2706, 23 Scirpus_asper_Chile_STA2065, 24 Scirpus_asper_Chile_STA2708, 25 Scirpus_asper_Chile_STA2709, 26 Zameioscirpus_atacamensis_STA2105_2143, 27 Zameioscirpus_muticus_STA2062, 28 Scirpus_ancistrochaetus_dS035, 29 Scirpus_cyperinus_STA1773, 30 Scirpus_divaricatus_dS014_STA2703, 31 Scirpus_hattorianus_STA1984_STA2566, 32 Scirpus_maximowiczii_STA1919, 33 Scirpus_microcarpus_STA1976_STA2570, 34 Scirpus_pendulus_STA1978_STA2569, 35 Scirpus_polyphyllus_dS050, 36 Scirpus_polystachyus_STA349, 37 Scirpus_radicans_STA1915, 38 Scirpus_wichurae_dS003, 39 Eriophorum_angustifolium_subsp_angustifolium_STA1777_STA2547, 40 Eriophorum_russeolum_subsp_russeolum_STA1793_STA2562, 41 Eriophorum_vaginatum_subsp_spissum_STA1804_STA2607, 42 Eriophorum_virginicum_STA1807_STA2608, 43 Eriophorum_viridicarinatum_STA1779; TREE PAUP_1 = [&R] (((1,3)100,2)0,((4,5)100,(6,((((((7,8)76,9)97,11)100,10)100,(14,15)100)69,(12,13)100,(((16,17)100,((18,19)100,((20,21)85,22,23,24,25)99)100,(26,27)100)93,(((((28,31,35)92,33)71,(29,(36,38)61)79,32,37,(((39,43)73,(40,41)53)100,42)83)76,34)77,30)99)90)84)56)100)0; END;