#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 19, 2024; 4:19 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Mardones-hidalgo M., Trampe T., Oster S., Elliott M., Urbina H.R., Schmitt I., & Piepenbring M. 2017. Phylogeny of the order Phyllachorales (Ascomycota, Sordariomycetes): among and within order relationships based on five molecular loci. Persoonia, 39: 74-90. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S19724] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=79; TAXLABELS Aniptodera_chesapeakensis Balansia_henningsiana Bionectria_ochroleuca Bombardia_bombarda Buergenerula_spartinae Calosphaeria_pulchella Camarops_amorpha Camarops_microspora Camarops_tubulina Camarops_ustulinoides 'Camarotella costaricensis MM-149' 'Camarotella costaricensis MM-21' 'Camarotella sp. MM-27' Cercophora_coprophila Chaetosphaerella_phaeostroma Chrysoporthe_cubensis Coccodiella_miconiae Coccodiella_miconiicola 'Coccodiella sp. MM-165' Cocoicola_californica_F59034 Cocoicola_californica_F59038 Cordyceps_cardinalis Cryphonectria_parasitica Cryptosporella_hypodermia Diaporthe_eres Diatrype_disciformis Eutypa_lata Falcocladium_multivesiculatum Falcocladium_sphaeropedunculatum Gelasinospora_tetrasperma Glomerella_cingulata Gnomonia_gnomon Graphium_penicillioides Halosphaeria_appendiculata Hypocrea_lutea Kylindria_peruamazonensis Lasiosphaeria_ovina Leotia_lubrica Melanospora_tiffanii Melanospora_zamiae Microascus_trigonosporus Monilochaetes_infuscans Ophioceras_dolichostomum Ophioceras_leptosporum Ophiocordyceps_irangiensis Ophiodothella_vaccinii Ophiostoma_piliferum Ophiostoma_stenoceras Papulosa_amerospora Phyllachora_graminis_TH544 'Phyllachora sp.3 MM-134' 'Phyllachora sp.3 MM-78' 'Phyllachora sp.3 MM-98' Polystigma_amygdalinum 'Polystigma pusillum MM-113' 'Polystigma pusillum MM-19' 'Polystigma sp. MM-163' Pseudohalonectria_lignicola Roumegueriella_rufula Serenomyces_phoenicis_PLM314 Serenomyces_phoenicis_PLM315 Sordaria_fimicola Sordaria_macrospora Sphaerodothis_acrocomiae Sphaerostilbella_berkeleyana 'Telimena bicincta MM-133' 'Telimena canafistulae MM-13' Telimena_engleri_TH551 Telimena_leeae_TH549 'Telimena picramniae MM-05' 'Telimena sp.3 MM-92' 'Telimena sp.4 MM-88' Telimena_zanthoxylicola_TH550 Togninia_vibratilis Tolypocladium_capitatum Tolypocladium_japonicum Valsa_ambiens Verticillium_dahliae Xylaria_acuta ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa2; DIMENSIONS NTAX=53; TAXLABELS Camarops_microspora_CBS649.92 Camarops_ustulinoides_DEH_2164 'Camarotella costaricensis MM-21' 'Camarotella costaricensis MM-149' 'Camarotella sp MM-27' Coccodiella_melastomatum_CMU78543 Coccodiella_miconiae_ppMP1342 Coccodiella_miconiicola_TH571 'Coccodiella sp MM-165' Coccodiella_toledoi_U78544 Cocoicola_californica_F59034 Cocoicola_californica_F59038 Phyllachora_graminis_AF064051 Phyllachora_graminis_AF257111 Phyllachora_graminis_DAOM240981 'Phyllachora graminis MM-166' Phyllachora_graminis_RoKi3084 Phyllachora_leeae_TH549 Phyllachora_maydis_BPI893231 'Phyllachora picramniae MM-05' 'Phyllachora sp.1 MM-130' 'Phyllachora sp.2 MM-128' 'Phyllachora sp.2 MM-129' 'Phyllachora sp.3 MM-135' 'Phyllachora sp.3 MM-78' 'Phyllachora sp.3 MM-98' 'Phyllachora sp.3 SO-07' Phyllachora_sp.4_RMB1061 'Polystigma pusillum MM-113' 'Polystigma pusillum MM-147' 'Polystigma pusillum MM-19' 'Polystigma sp. MM-163' Serenomyces_phoenicis_PLM314 Serenomyces_phoenicis_PLM315 'Telimena aequatoriensis SO-05' 'Telimena bicincta MM-108' 'Telimena bicincta MM-133' 'Telimena canafistulae MM-13' 'Telimena engleri MM-159' 'Telimena engleri MM-153' 'Telimena engleri SO-09' Telimena_engleri_TH551 'Telimena sp.2 MM-143' 'Telimena sp.2 MM-144' 'Telimena sp.3 MM-92' 'Telimena sp.4 MM-88' 'Telimena sp.5 MM-47' 'Telimena sp.6 SO-14' 'Telimena sp.6 SO-21' 'Telimena sp.6 SO-22' 'Telimena ulei SO-12' Telimena_ulei_TH574 Telimena_zanthoxylicola_TH550 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M37832] TITLE Phylogenetic_relationships_in_Phyllachorales; LINK TAXA = Taxa2; DIMENSIONS NCHAR=2728; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1840 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1920 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1990 2000 2010 2020 2030 2040 2050 2060 2070 2080 2090 2100 2110 2120 2130 2140 2150 2160 2170 2180 2190 2200 2210 2220 2230 2240 2250 2260 2270 2280 2290 2300 2310 2320 2330 2340 2350 2360 2370 2380 2390 2400 2410 2420 2430 2440 2450 2460 2470 2480 2490 2500 2510 2520 2530 2540 2550 2560 2570 2580 2590 2600 2610 2620 2630 2640 2650 2660 2670 2680 2690 2700 2710 2720 2730 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Camarops_microspora_CBS649.92 TCCTTATGCCGCTGGTACTGGTGACGAGGGCCAGACCCGTGAGCTCTGCACCCTGGGTGTTCGGCAGCTCATCGTGCCATCAACAGGACACAACTGGTCTGAGGCCCGTTACCAGGAGATCATCGACGTCCAACTTCATCAAGAAGGTCGGCTACAACCCCAAGACGGTCCCTTCGTGCCCATCTCGGGTTTCAACGGCGAATGCTGAGCAGTCCAAGAACTGCCCCTGGTACAAGGGCTGGGAGAAGGAGGACAAGTCCCGGCCCCTTCTCGAGGCCATCGATGCCATCGACCCCCCCAAGCGTCCCAACAAGCCGCTGCGCCTGCCGCTGCAGGATGTGTACAAGATCGGTGGTATTGGACTGTGCCGGTCGGCCGTATCGAGACCGGTATCCTCAAGGCCGGTCACCTTCTCCCCCCAACGTGACCACTGAAGTCAAGTCGGTCATGCACCACGAGCAGCTGTCGAGCCCCGGGCGTCGGCTTCAACGTGTGTCGGTCAAGGATATCCGCCGTGGCAACGTCTGCGGTGACTCCAAGAACGACCCGCCCGGGCTCTCCTTCACGGCCCAGGTCATCGTCCTCAACCACCCTGGTCAGGTGCCGGTTACGCCCCCGTGCTCGACTGCCACACGGCCCACAGCCTGCAAGTTCGCCGAGCTCCTGGAAAGATCGACCGCCGTACCGGCAAGTCGGTCGAGGCCAGCCCCAAGTTCGTCAAGTCTGGTGATGCCGTCGTCCCCTCCAAGCCATGTGCGTTGA??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????-----CGTTGCATCGACCAGCAGAAGCACTTTACGCTCGCGCTGGGCATCAAACATACGATGCTACGAGTGCCTTGAAGTACTCCTTGCCACGGGAAACTGGGGCGAAAGAAAGCCATGAGTTCAACGCTGGTGTGTCGCAGGTCTTGAACAGATATACCTTTGCGTCCACTCTTTCCCATCTGCGACGCACGAACACGCTTGGACGCGACGGCAAGATCGCCAAGCCACGGCAACTGCACACACTCATTGGGGCTTGGTTTGTAAACTCCCGAGGGTCAGGCCTGCTCGTCAAGAATTTGTCATGTGCTATGTAGCTGATCATCGACTTTTTGCGAGCATGGAAGTCTTGGAGGAGTACGAGGCTACGGTACCCCAACGCTCTTTGTCAACGGGACTGGGTTGGAGTCCACCAAGACCCAAGCATCTCGTGCAGGTCCGTAAGAATGTCATCTCATTGAGGTGTCTCTGTGACATCCCCGCGAGTTCAAGATTTTTCGACGCGGCCGTGTCATGAGACCGCTTTTGTGGTGGAGCAGGAGGATAAGGCATCGAGAAGGGCAAGCTCATTCTGAACAAACCATATTAAGGAACTTGGCCCTGATTACTGGGTGGAAGGGCTTAATCTGGCGTTTTGAGTACCTCGACGCGAAGAGGAGGAAACAGCTATGATCTGTATGACTCGGATCTCTGCGCATTAAATCAGTTATCGTTTATTTGATAGCACCTTACTACATGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAACCCCGGAGGGGTGTATTTATTAGATTAAAAACCAATCTCCGGGGCTGGTGATAATAACTTCTCATCGCACGGCCTTGCGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTTTTCGACGGCTGGGTCTTGGCCAGCCATGGTGACAACGGGTAACGGTTAGGGCTTGAGGAGACCTGAGCGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGCGCAAAAATGCCGACACAGGTAGTGACGATAAATACTGATTTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCGCGTATATTGTTGTTTTAAAAAAGTTGAAGGGCCTGGCTGGTCCGCCCGTGTACTGGTCCCCGGGCCTTTCCCTCTGGGGAGATGCCCTTCACTGGGTGTGTCGGGGAATTTACCGTGAAAAAATCAGATCAAGGCCTATGCTCGAATGATTAGCATGGAATAATGAGGACTTTTGGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTTTGAAGACTGCGAAAGC?TTTAGGATGTTTTCATTAAGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGATTAGGGATCGGACGATGTTATTTTTTGACTCGTTCGGCACCTTACGATAAATCAAA Camarops_ustulinoides_DEH_2164 TCCTCATGCTGCCGGTACTGGTGACGAGGGCCAGACCCGCGAGCCCTGCACCCTGGGTGTGAAGCAGCTCATCGTGCCATCAACAGGACACAACTGGTCCGAGGCCCGTTACCAGGAGATCATCGACCTCCAACTTCATCAAGAAGGTCGGCTACAACCCCAAGTCCGTCCTTTCGTCCCCATCTCGGGTTTCAACGGCGAATGCTGAGCAGTCCAAGAACTGCCCCTGGTACAAGGGCTGGGAGAAGGAGGACAAGTCCCGGCCCCTCCTCGAGGCCATCGACGCCATCGACCCTCCCAAGCGTCCCAACAAGCCCCTCCGTCTCCCCCTGCAGGATGTCTACAAGATCGGCGGTATTGGACTGTGCCGGTCGGCCGTATCGAGACTGGTATCCTCAAGGCCGGTCACCTTCTCCCCCCAACGTCACCACTGAAGTCAAGTCCGTCATGCACCACGAGCAGCTGTCGAGTCCCGGGTGTCGGCTTCAACGTGTCTCGGTCAAGGATATCCGCCGTGGCAACGTCTGCGGTGACTCCAAGAGCGACCCTCCCCGGCTTTCCTTCACCGCCCAGGTCATCGTCCTCAACCACCCTGGCCAGGTGCCGGCTACGCCCCCGTGCTCGACTGCCACACTGCCCACAGCCTGCAAGTTCGCCGAGCTGCTCGAAAGATCGACCGCCGTACCGGCAAGTCTGTCGAGGCCAGCCC--------------------------------------------------------------------------------CATTATAAGACTCGAAATCGCGAAGTTGCTTCGGCGGGCGGCTCCTGGCGGCGTAGCCCGTAGGCGCCCGCCGAGGAAACACTCTTTAACGTCTCTTCTGAGTTAAAAATCAGTTAAAACTTTCAACAACGGATCGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCGCCAGTATTCTGGCGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCACCCCCAAGCTCCGCTTGGTGTTGGGGCCCTACGTGCGCCGTAGGCCCCGAATTGGCGGGCCGCCGCGATCCCGAGCGTAGTACTCGCTCAGGCGTGCGGCGGGTGCGTGAAATTGACCTC-----------------------------------TACATCGTTGCATTGACCAGCAGAAACACTTCACACTCGCGCTGGGCATCAAACATACGATGCTACGGGTGCCTTGAAGTACTCCTTGCAACAGGAAACTGGGGTGAAAAAAAGCCATGAGCTCAACGCTGGCGTTTCCCAGGTGTTGAACAGATATACCTTCGCATCCACTTTGTCCCACCTGCGACGTACAAACACCCTTGGACGCGACGGCAAGATTGCTAAGCCACGACAGTTGCACACACGCATTGGGGCTTGGTTTGTAAACCCCTGAGGGCCAGGCTTGCTTGTCAAGAATCTTTCATGTGCTATGTGGCGGATAATCGATTTCTCGCGAGCATGGAAGTCTTGGAGGAGTACGAAGCTTCGGTACCCCAACGCTATTTGTGAACGGAACTGGGTCGGCGTCCATCAAGATCCAAGCACCTCGTGCAGGTCCGAAAGAACGTCATCTCATTGAGGTGTCTCTGCGATATCCCCGCGAGTTCAAGATTTTTCGACGCGGGCGTGTCATGCGACCCCTCTTGTCGTAGAGCAGGAGGATAAGGTGTTGAGAAGGGCAAACTCATTCTAAACAAATCACATCAAGGAACTTGGCCCCGATTATTGGGTGGAAGGGCCTAGTCTGGTGTCTCGAGTATCTCGATGCGAAGAGGAGGAAACGTCCATGATCTGCATGACGCAGATTTCTGCGCATTAAATCAGTTATCGTTTATTTGATAGTACCTTACTACATGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAATCCCGAAGGGGTGTATTTATTAGATTAAAAACCAATCTTCGGGGCTGGTGATAATAACTTCTCATCGCACGGCCTTGTGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTTTTCGACGGCTGGGTCTTGGCCAGCCATGGTGACAACGGGTAACGGTTAGGGCTTGAGGAGACCTGAGCGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGCGCAAAAATGCCGACACAGGTAGTGACGATAAATACTGATTTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCGCGTATATTGTTGTTTTAAAAAAGTTGAAGGGCCTGGCTGGTCCGCCCGTGTACTGGTCCCCGGGCCTTTCCCTCTGGGGAGATGCCCTTCACTGGGTGTGCCGGGGAATTTACCGTGAAAAAATCAGATCAAGGCCTATGCTCGAATGATTAGCATGGAATAATGAGGACTTTTGGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTTTGAAGACTGCGAAAGCATTTAGGATGTTTTCATTAAGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGATTAGGGATCGGACGATGTTATTTTTTGACTCGTTCGGCACCTTACGATAAATCAAA 'Camarotella costaricensis MM-21' --------------------------AGCGCCAGACGCGTGA--CCTGCACCATGTGT---CAGCAGCTCATCGTGCATC--ACA---GACAAGTGGTCCCAGC---GCGTACGAGAAATCATCGACGTCCAACTTCATCAAGAAGGTCGGATACAACCCCAAGACTGTCCCTTCGTCCCCATTTCCGGTTTCAACGGCGAATGCTTAGGCCTCAACCAACTTCCCCTGGTACAAGGGATGGGAGAAGGAGCCGAAGTCCCGGCCCCTTCTTGAGGCATTCGACGCCATTGAAGCCCCCAAGCTTCCTAACAAGCCTCTTCTCTTCCCCCTTCAAGAAGTTTACAGGATCGGCGGTATCGGACGGTGCCCGTCGGCCGTATCGAGACTGGTGTCCTCAAGCCCGGTCACCTTCTCCGGCCAACGTGACCACTGAAATCAAGTCGGTCATGCACCACGAGCAGCTACGGAGTCCCTGGTGTGGGCTTCAACGTTTCGGTGAAAGGAAAATCCGTCGTGGCAACGTTGCCGGTGACCCCAAGAACGACCCCCCCGGGAGTTCCTTCCCCCCCCCGGTCTTCATTTTAGACCCCCCCGGCCAGCGGCAGGGTTCGCTCCCCTTCTGGGTTTCCACGACGGCCACAGCCACCCAGCTCCCCGAGTCTTAGACACCA-CCGCCACCGTTTGGGTAAGGAGCCTGACAACGAGCCCAAATTCATGAGGAAACTCGAAGCAGGTTTCCCTGGTAAGACCAGGTGGTCGAAAGGTCTCCTGGTGAACCAGCGGAGGGCATTACCAAACTCTATACTGTGAAGTTGCCTCGGCAAATTGCTTT-----------------AGCATTTGCCATGGCC---GTCTTTTTATGACACTCTGAATAGGAAAATGAATACAACTTTCAACAACGGATCGGCTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGGTATGTAATGTGAATTGCAGAACTCAGTGAACCATCGAATCTTTGAACGCACATCGCGCCCGCTAGTATTCTGGCGGGCATGTCTGTCCGAGCGTCATGTCACCCTCAAGCACAGCTTGGGTTAGGGGTCTTACGGCTACCGTAAGCCCTGAAATGGCAGTCTACTACCTTCCCGGGCGCATTACAC-CTTGTATGCAGTACTTCTTTATTGAATTGACCTCGGGTCAGGAGGAAATACCCGCTGAACTTAAGCATA--TTTTAGGGGGTAAGAATGGGGAGAGGTTCCCCTCTTCGTTTGGGGCGGGCGGTGGACGGCGCAAGAAAAGTGGATGACTCCCTTGGCGGACAGGAACTGGGGTGAAAGAAGTCGATGAGCTCAACGCCGGTGTCTCCCAGGTGCTCAACCGATACACCTTTGCGTCGACACTTTCTCACTTGCGACGTACCAACACCCTCGGGCGTGACGGCAAGATTGCCAAACCACGCCAGCTCCACACACGCACTGGGGCTTGGTGTGCAGACACCGGAAGGGAGGCGTGTCTCGTGAAGAACCTGTCATGTGCTATGTCGCTGATTATTGACTTCTCGCGCGCATGGAGGTTCTGGAGGAGTACGAGCCTGCGATACCCCAATGCTCTTCGTGAACGGAACTGGGTCGGAGTGCATCAAGACCCAAGCACCTTGTCCGGGACCGCAAGAATGTGATTTCCTTGAAGTGTCTCTGCGACATCCTCGGGAATTCAAAGATTTCTGACGCGGTCGTGTCATGAGGCCCTTGTTGTGGTGGAAGCAAAGGAGAAGGTGTGGAAGAAGGGCGGCCATTCCTTAACAAAACACATCAGGGAGCTTGGCCAAGACTACTGGCTGGAGCGGACTACTCGGGCGGTTCGAGTACCTTAGACCGAAGGAGGAGACAGGCCATGGATCTGCATGTCGCAGACCTCTGCGCATT-AATCAGTTATCGTATATTTGATAGTGCCTTTCTACATGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAATCCCGCGGGGGTGTGTTTATTAGATTAAAAACCAATCCTCGGGGCTGGTGATGATAACCTTTCATCGCATGGGCTTGTGCCCGGATGGTTTCATTCAAATTTCTGCCCTTTTCGACGGTTGGGTCTTGGCCAGCCGTGGTGACAACGGGTAACGGTTAGGGCTCGAGGAGACCTGAGCGGCGAATACATCCAAGGAAGGCAGCAGCGCAAAAATGCCGATTCAGGCAGCGACAAGAAATACTGATTTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCACGTATATTGTTGTTTTAAAAAAGTTGAAGGGCCTGGCCGGTCTGCCCATGCACTGGTCCCTGGGCCTTTCCCCCTGGGGAGATGCCCCTTTACGGGTGTGTCGGGAGATTTACTCTGAATAAATTAGATCAGGGCATATGCTCGAATATCTAGCATGGAATAACGAGGACTTTTGGTTTCTAGGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTTTGAAGACTGCGAAAGCATTTAGGATGTTTTCATTAAGAACGAAAGTCAGGGGATCAAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTGACCATAAACTATGCCGATCAGGGATTGGACGGTGTTAAT-TTTGACCCGTTCAGCACCTGCGAGAA--TCAG- 'Camarotella costaricensis MM-149' 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'Camarotella sp MM-27' 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Coccodiella_melastomatum_CMU78543 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Coccodiella_miconiae_ppMP1342 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Coccodiella_miconiicola_TH571 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'Coccodiella sp MM-165' 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Coccodiella_toledoi_U78544 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Phyllachora_leeae_TH549 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Phyllachora_maydis_BPI893231 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'Phyllachora picramniae MM-05' 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'Phyllachora sp.1 MM-130' ---------------------CGACGAG-GCCAGACTCGTGA------TACACCTGGTGT--AGCAGCTCAT----GTCGCATCATGACACAAGTG--TCCGAGCCCGTTAC--AGAGATCATCAACCTCCTCCTTCATCAAAAAGGTCGGCTACAACCCCAAGACTGTGCCTTCGTGCCCATCTCCGGCTTCAACGGAGAATGCTTCTGCTTCTGCGAACTGTCCCTGGTACAGGGGCTGGGAAAAGGAGACCAAGGCCGGGCCGCTTCTCGAGGCCATCGACGCCATTGAGCCGCCCAAGCGACCGAACAA-CCTCTCCGTCTGCCTCTTCAGGATGTTTACAAGATTGGTGGTATTGGACAGTTCCCGTCGGCCGTATCGAGACTGGTGTCCTGAAGCCTGGTCACTTTCGCCCTCCAACGTTACCACTGAAGTCAAGTCCGTCATGCACCACGAGCAGCTGCTGAGTTTTTTATGTTGGTTTCATCGTGTCTCCGTCAAAGAGGTCCTTCGTGGCAAGGTTGCCGGCGCCTCCAAGACCGATCCTCCCGGGAGTTCTTAAACCGGGCAGGGCATCGTTCTAAATCATCCTGTTCATGGGCCGGCTCCGCAGCTTTCCTGGAGTTGGAGGTTCCCTAGGGCGT-CAAGTTGCCTG----CTGATGGACGTTCTCTCTCCTAGTTGCAAGTCGGCTGCGCCGAGAACCGGGCT-----------GTAAGGCGGCCGTCCGCACCTGGTACTGCAATCAGAAAGGTCTCCTGGTAAACCAGCGGAGGGCATATAG----------CCGTGAAGTTGCCTCGGCGTATAGCCCCGGGAGG-----------GGTGTACGTCGGTGCTACAGCCT------------CTAGGGATAGGAAACAGTAAAACCTTTAACAACGGATCGGCTCTAGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAATAATGTGAATTGCAGAACTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCATATTGCACTACTTGGTATTCTAGGTAGTATATCTATTCGAGCGTCTTTGAACCTTAGGTGTTTACCTAACGATCGAGGATTACGTCTTATGTAGCCTTGAAAATGACAGAGCTATT-CACTTTGGTAGGAGTA--------AAGGATGAAAGAAATAGTTAAATTGACCTCGGATTAGGTAGGGATACCCGCTGAACTTAAGCATACCTATCGCTGC-TCGACCAGAACAAGCACTTTTCCTT-GACCTGGGTATCAAGCCAGCGCA-GGACCAATGCCCTCAAGTACTCTTGGCCACGGGAAACTGGGGCGAAAAAAGTCCATGCAGGCGACGCCGGCGTG-CCCAGGTGCTCAACCGGTACACATTTGCCTCGACGCTCTCGCATCTGCGGCGCACCAACACCCTTGGCCGCGACGGCAAGATTGCCAAACCACGCCAGCTGCACACACGCACTTGGGGGGCCTCGGTAACCGCCCCGAGACAAGGGCCGCTGGGTAAGAAATTTTG-----------------TCAATGGTGTCCGGTTGC-----AGGCGGTGGAGGAACCGGGGCCCGAATCCCCCCAATTTCCTTTTTTCAGGTGGGTGGGGGGCCGCCGGCCAACACCA--------AGTTTGCTCT-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GTAGAGGGGG------------------------AG----CTATGCGTCAAGTGGGGGAAAACTTTATTTTTTTTCCCTTAAAAGAGGAAAAGGCGGGGAAATTCTAGAGCT-TTACATGCTAAAAACCCCGAAGGGGGGTGTTTATTAGATTCAAAACCAATCTCCGGGGCTGGTGATAATAACTTCTCATCGCACGGCCTTGCGCGGGGAGGGGTTCATTCAAATTTCTCCCCTTTTCGATGGCTGGGTCTTGGCCAGCCATGGTGATAACGGGTAACGGTAGGGCCTCGAAGAAACTTGAGCGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGCGCAAAAATCCCGATTCAGGTAGTGACAATACATACTGATTTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAACAATTGCAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTGCGCGTATATTGTTGTTTTAAAAAAGTTGAAGGGCCTGGCTGGTCCGCCCGTGCACTGGTTCCTGGGCCTTTCCCACTGGGGAGATGCCCTTTACTGGGTGTGTCGAGGAATTTACTCTGAACAAATCAGATCAAGGCCTTTGCTTGAATGTCTAGCATGGAATAATAAGGACTTTTGGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGACAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTTTGAAGACTGCGAAAGCATTTAGGATGTTATCAATAATAATTTTGCTTCCCCCCCAAAAAAAAAAAAGGTAGAGTTTTTTTTAAAATATTCCTCCCCCCCAAAAAAAAAAAAGGGGAAGTTTTGTTCTAATCTTTTTCTCGCC---AAAAAGA----- 'Phyllachora sp.2 MM-128' 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'Phyllachora sp.2 MM-129' 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'Phyllachora sp.3 MM-135' 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'Phyllachora sp.3 MM-78' 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'Phyllachora sp.3 MM-98' 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'Phyllachora sp.3 SO-07' 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Serenomyces_phoenicis_PLM315 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'Telimena engleri MM-159' 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'Telimena engleri MM-153' 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'Telimena engleri SO-09' 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Telimena_engleri_TH551 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'Telimena sp.2 MM-143' 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'Telimena sp.2 MM-144' 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'Telimena sp.3 MM-92' TTCTCATGCTGCCGGCACTGGTGACGAGGGTCAGACTCGTGAGCGCTGCACCCTGGGTGTGAAGCAGCTCATCGTGCCATCAACAGGACACAAGT-GTCCGAGGCTCGTTACCAGGAGATCATCGACCTCCAACTTCATCAAGAAGGTCGGATACAACCCCAAGACTGTGCCTTTGTCCCCATCTCGGGCTTCAACGGCGAATGCTGAGGCCTCCAAGAACTGCCCCTGGTACAAGGGCTGGGAGAAGGAGACCAAGGGCGGGCCCCTCCTCGAGGCCATTGACGCCATTGAGCCCCCCAAGCGTCCCAAGAAGCCCCTCCGCCTGCCCCTCCAGGACGTCTACAAGATCGGTGGTATTGGACAGTACCTGTCGGCCGTATCGAGACTGGTGTCCTCAAGCCCGGTCACCTTCTCCCTCCAACGTCACCACTGAAGTCAAGTCCGTCATGCACCACGAGCAGCTGTCGAGTCCCGGGTGTCGGCTTCAACGTGTCTCCGTCAAGGAAATCCGCCGTGGCAACGTTGCCGGTGACTCCAAGAACGACCCGCCAGGGTGTTCTTTCACCGCCCAAGTCATCGTCCTGAACCACCCTGTTCAGGTGCCGGCTACGCCCCCGTCCTCGACTGCCACACCGCTCATAGCCTGCAAGTTCGCCGAGCTCCAGGAAAGATCGA-CGCCGTACCGGTAAGGCTACTGAGACCAGCCCCAACTATATCAAGTCTGGCGACGCT-TCGTCCCCTCCAAGCCATGTGCGTGGAAAGGTTTTC--GTACTTGGACCGGGAGCGTTAACAAACCTGTACCTGTGAAGTTGCTTCGGCGGGCGGTCCCGGGAGGCGCAGCCCGCGGGTGCCCGCCGAGCGCAACCTCTTTTCAGGCCTCTCTGAGCGACGAATGAATCAAAACTTTCAACAACGGATCGGCTCGGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAACCCAGCGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCGGGAGCATTCTCCCGGGCATACCTGTTCGAGCGTCATTTCACCCTCGCGCCCGGCGCGGTGTTGGGGCCCTGCGGCTTGCGCAGGCCCTGAAATGGCGGGCCGCCAGGACGCCCAGCGCAGTACTCGCTGGGGTGTCCGGGGCGCTCGTGAAATTGACCTCGGATCAGGTAGGAGTACCCGCTGAACTTAAGCATATACAAGGTGGATCAAGCGAGGACAAGCACTTCTCGCTCACGCTCGGCATCAAGCCCAACAACATACCAACGCTCTCAAGTACTCCTCGCCACTGGAAACTGGGGCGAAAGAAGTCGATGAGCTCCACGCCGGTGTGTCGCAGGTGCTGAACCGCTACACCTTCGCGTCGACGCTGTCTCATTTGCGGCGAACGAACACGCTCGGACGAGACGGCAAGATCGCGAAACCGCGCCAGCTGCACACACGCACTGGGGACTGGTCTGCAAACGCCCGAAGGCCAGGCGTGCTCGTCAAGAACCTGTCATGTGTTACGTCTCGGATTGTCGAGTTCCGGCGCGCATGGAGGTTTTGGAGGAGTACGAGGTTGCGGTACCCGAACGCTCTTCGTCAACGGCTCTGGGTGGGCGTGCATCAAGATCCAAGCAGCTGGTCCGTCCTCGGAAGAGCGTCATTAGTTTCGAGGTTTTCTGCGACATCCCCGCGAGTTCAAGATTTTTCGACGCGGACGTGTGATGAGGCCTCTGTTGTCGTGGAGCAGGAAGACGAGGGGTGCAAAAGGGCCAACTGATCCTCAACAAACCACATCAAGGAGGTCGGCCGCGGCTACTGGCCTGGGAAGGCCAGTCGGGCGTCTCGAGTACCTGGACGCGAAGAGGAGGAAACGGCCATGATCTGCATGACACGGATTTTTGCGCATTAAATCAGTTATTGTTTATCTGATAGTACCTTACTACTTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAACCCCGGAGGGGCGTACTATTTAGATAAAAAACCAATCTTCGGGGCTGGTGATAATAACTTCTCATCGCACGGCCTTGCGC-GGCGATGGTTCATCCAAATTTCTGCCCTTTTCGATGGCTGGGTCTTGGCCAGCCATGGTGACAACGGGTAACGGTTAGGGCTCGAGGAGACCTGAGCGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGCGCAAAAATCCCGACGCAGGTAGTGACAATAAATACTGATTTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCGCGTATATTGTTGTTTTAAAAAAGTTGAAGGGCCCGGCCGGTCCGCCCGTGCACTGGCCCCCGGGTCTTTCCCTCTGGGGAGATGCCCTTTACTGGGCGTGCCGGGGAATTTACCGTGAATAAATTGGATCAAGGCCTATGCTCGAACATGCAGCATGGAATAATGAGGATTTTTTGTTTCTGGGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGACAGTCCGGGGGTCCCGTATTCAATTGTTGAAGGTGAAATTCTTTTGAAGACTGCGAAAGCATTCAGGATGTTTTCATTAAGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGATTAGGGATCGGGCGGTGTTATTTTTTGACCCGCTCGGCACCTTACGAAAAATCAAA 'Telimena sp.4 MM-88' 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'Telimena sp.5 MM-47' 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'Telimena sp.6 SO-14' 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'Telimena sp.6 SO-21' 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Telimena_zanthoxylicola_TH550 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Balansia_henningsiana 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Bionectria_ochroleuca 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Calosphaeria_pulchella 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Camarops_tubulina 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Camarops_ustulinoides 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Glomerella_cingulata 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Graphium_penicillioides 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Halosphaeria_appendiculata 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Hypocrea_lutea 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Kylindria_peruamazonensis 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Lasiosphaeria_ovina 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Leotia_lubrica 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Ophiostoma_stenoceras 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Papulosa_amerospora 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Telimena_leeae_TH549 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'Telimena picramniae MM-05' 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Togninia_vibratilis 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Verticillium_dahliae ??????????????????????AGGGATTGCCTTAGGGCGAGTGAAGCGGCAACAGCTCTTTGAAATCTGGCTCCGGTCCGAGTTGTGTAGAGGATGTTCGAGGTTCCTTCCGAGTTCCCTGGAACGGGCCATAGAGGGTGAGAGCCCCGGGTAGGAACCATGCTCATGTGAAGCTCTCGACGAGTCGAGTAGGGGAATGCTGCTCTAAATGGGAGGTATACTCCTTCCAAGGCTAAATACCGGTTAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACAAAAGAGAGTCAAACAGCACGTGAAATTGTTAAAAGGGAACTCGCTACCAGGGTTCGTTCAACCAGGTCCTGACCTGGGGCACTCCGCCGGCCAGGCCAGCATCAGTTTCCGGGGGG?CAAAGGCGGGAATGTGGCTCTCCGGGAGTGTTATAGTCGCGCATACCCTCGGGGGGCTGAGGTACGCGCTCAAGGAAATGGTAGTGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCGCGAGTGCCCGGGCGTAAAACCCCAGCGCGGAATGAAAGTGAACGTAGGTGAGAGCTTGGCGCATCACCGACCGATCCTGATGTCCTCGGACGGATTTGAGTGAGAGCATATAGGGTTGGACCCGAAAGAAGATGAACTATGCGTGTGTAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAACATG?GCATGGGGGCGAAAGACTAATCGAATCTTCTGGTAGCTGGTTTCCGCACCATTGTTCGTCGCATGAATCAGGAGCTCATCTCAAGCGTTGCGTCGAATCTAACCGACAGTTCAGCCTCTCTCGGCGTCAAACCCCAGACGTTGTCTAATGGTCTCAAATACTCCTAGCTACAGGAATTGGGGAGAAAGAAGGCTGCGAGCTCAACGCTGGTGTGTCCCAGGTCTTGAACCGGTACACTTCGCATCAACCTTGTCGCATTTGCGGCGGACGAACACGCCCATCGGCAGAGATGGCAAAATCGCCAAACCTAGACAACTCCACAACACTCACTGGGGTTTGGTGTGAAACGCCAGAAGGCAGGCTTGCGGTCTTGTCAAGAACCTATCCTTATGTGCTATGTCAGCGTCGGACGCCAGCAGAGCCCATCATTGATTACATGATCCAGCGTGGTATGGAAGGGAAGAGTACGAGCCGCTTAGTCCCAACGCACCAATTCCTCAACGGTGTTGGGTGTTCATCAAGACCCCGCGTGCTTCCCCGACGTTCAGGGCACGTCGCAATGTCATATCTCGAAGTGTCTCTGGTCCGCGACATTCGCGCGAGTTCAAGATTTCTCCGACGCTGGTCGAGTCATGGACCGGTCTTGTTGTTGAGCAG??????AGCACGGTGCCGTACCCAGGGCTCGCTCGTACTCAGAAGGATCTCGTATGCGGGACCAGCAAAACCCATAACCCAGAAGACAAGATCACGTGGCAAACCTTACAGCGGCAATCGAATACTTGACGCTGAGGAAGAAGAGACATCGATGATTTGCATGACCCTGAGATCTAGATACCGATTGCGCAAATTGAAGAGGATCCGAAGGGCAATCGCCGCCTACGAACAAAGATCGCCAAAACGACCATATGTACACCCACTGCGAGATCCATCCGAGTATGATTCTGGGAATCTGGCCAGTATA???????????????????TTACAAAGCGAAACTGCGAATGGCTCATTATATAAGTTATCGTTTATTTGATAGTACCTTACTACATGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTGAAAATCCCGACTTCGGGGATGTATTTATTAGATACAAAACCAATGTTCGGGGCTCTCTGGTGATGATAACTTCTATCGCACGGCCCCGCGCGATGGTTCATTCAAATTTCTTCCCTATTTCGATGCTACGGTATTGTCCTAGCATGGTTGCAACGGGTGACGGATTAGGGCTCGACCCCGGAGAACCTGAGAAACGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGCGCAAAACCCAATCCCGACTCGGGGAGGTAGTGACGATAAATACCGATACAGGGCTCTTGGAATGAGTACAATTCAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAGTTGTTTTAAAAAGCTAGTAGAAGGTCGGCCGGGCCTCACCGCGTGCACTGGTTGGCCGGGGCTTCCCTTCTGCGGAACCGCATCTCCTTCACTGGGGGTGTCGGTTTACTTGAAAAAATTAGAGTCAGGCCTATGCTCGAATACATTAGCATGGAATAATGTAGGACGGGTCTTATTTCGGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGAGGGGGCATCAGTATTCAATCGTCAGAGGTGAAATTCTTTTGAAGACTGCGAAAGCATTTGAGGATGTTTTCATTTAGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGACGGTGTTATTTCTTGACCCGTTCGGCACCTTACGAAAATCAAAGTGCTTGGGCTCCAGGGGGAG Xylaria_acuta ?????????????????CCAACAGGGATTGCCCTAGGGCGAGTGAAGCGGCAACAGCTCTTTGAAATCTGGCCTTGGTCCGAGTTGTGTAGAGGATGTTTTGGGTGCCTTCCGAGTTCCCTGGAACGGGCCTTAGAGGGTGAGAGCCCCGGGTTGGACCTAAGCCTCTGTAAAGCTTTCGACGAGTCGAGTAGGGGAATGCTGCTCTAAATGGGAGGTAAATTTCTTCTAAAGCTAAATATTGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACAAAAGAGGGTTAAATAGCACGTGAAATTGTTGAAAGGGAATTTGCGACCAGTTCCTAATCATCCGGTGTTTCACCGGTGCACTTCGCTAGGTTAGGCCAGCATCGGTTTCCGGGGGGATAAAAGCGGGAACGTAGCTCCTCGGGAGTGTTATATCTGCAAATACCCTACAGGGACCGAGGACCGCGCTTAAGGAAATGGTCGCGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCGCGAGTGTTTGGGTGTTAAACCCTCACGCGTAATGAAAGTGAACGGAGGTGAGAGCCCGGTGCATCATCGACCGATCCTGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTAAGAGCATAACTGTTCGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCGTGGATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATCTGCGCATGGGGGCGAAAGACTTATCGAACCATCTAGTAGCTGGTTAC????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CGCCGGCGTTTCGCAGGTGTTGAACAGATACACTTCGCATCTACGCTGTCACATTTGCGAAGAACAAATACTCCAGTTGGCAGAGATGGTAAGCTTGCCAAACCACGGCAGCTTCACAACACCCACTGGGGTCTGGTCTGAGACGCCTGAGGGCAGGCTTGTGGTTTAGTCAAAAACCTGTCACTATGTGCTCTATCAGCGTGGGACGTCGACGGAACCTATTATAGAATATATGATTTCGCGAAATATGGAGGGGAAGAGTATGAACCTCTAAGCCCACATGCACGAATTCCTCAACGGATCTGGATATCCACCAAGATCCAAAGCTCTTCAGGGATGTTCAACAATTGAACGAATCAGATTCCGGGAAGTATCCCTGATTCGGGATATTCGCGCGAATTTAAAATTTTTCACATGCTGGCCGTGTCATGGGCCCTTGTTGTGGTTGAGAA??????????????????????????????????????????????????????TTTCAGAATGACCAAGGGCCG?????????????????????????????????????????????????ACCTGACGCAGAATCAAA??????????????????????????????????????????????????????????????CTGAACGAGCAATAAGCGACTAAAGACAAAGATGAATCCGACTACCATACGTACACCCATTGTGAAATTCACCCAAGTATGCTTCTTGGTATTTGGCCAGCATATTCCTTTCCCCGATCATAATTATACGGCGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTTTATTTGATAGTACCTTACTACTTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAATCCCGACTCACGGGATGTATTTATTAGATTAAAAACCAATGCTCGGGGCTTTCTGGTGATAATAACTTCTATCGCATGGCCTTGCGCGATGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATTTCGATGGCAGGGTCTTGGCCTGCCATGGTTACAACGGGTAACGGATTAGGGCTCGACCCCGGAGAACCTGAGAAACGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGCGCAAAACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAGTTGTTTTAAAAAGCTAGTTGAAGGCTGGCCGGGCCTCACCGCGTGCACTGGTTGGCCGGGCCTTTCCCTCTGGGGAGCCCTATGCCCTTCACTGGGTGTAGTGTTTTACTTGAAAAAATTAGAGTCAGGCCTATGCTCGAATACATCAGCATGGAATAATATAGGACGGGTTCTATTTTGGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGAGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTTTGAAGACTGCGAAAGCATTTGAGGATGTTTTCATTAAGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGACGATGTTATTTTTTGACTCGTTCGGCACCTTACGAAAATCAAAGTTTTTGGGTTCTGGGGGGAG ; END; BEGIN TREES; TITLE Phylogenetic_relationships_in_Phyllachorales_Bayesian; LINK TAXA = Taxa2; TRANSLATE 1 Camarops_microspora_CBS649.92, 2 Camarops_ustulinoides_DEH_2164, 3 'Camarotella costaricensis MM-149', 4 'Camarotella costaricensis MM-21', 5 'Camarotella sp MM-27', 6 Coccodiella_melastomatum_CMU78543, 7 Coccodiella_miconiae_ppMP1342, 8 Coccodiella_miconiicola_TH571, 9 'Coccodiella sp MM-165', 10 Coccodiella_toledoi_U78544, 11 Cocoicola_californica_F59034, 12 Cocoicola_californica_F59038, 13 'Telimena canafistulae MM-13', 14 'Telimena engleri MM-153', 15 'Telimena engleri MM-159', 16 Telimena_engleri_TH551, 17 Phyllachora_graminis_AF064051, 18 Phyllachora_graminis_AF257111, 19 Phyllachora_graminis_DAOM240981, 20 'Phyllachora graminis MM-166', 21 Phyllachora_graminis_RoKi3084, 22 Phyllachora_leeae_TH549, 23 Phyllachora_maydis_BPI893231, 24 'Phyllachora picramniae MM-05', 25 'Phyllachora sp.2 MM-128', 26 'Phyllachora sp.2 MM-129', 27 'Phyllachora sp.1 MM-130', 28 'Telimena bicincta MM-133', 29 'Phyllachora sp.3 MM-135', 30 'Telimena sp.2 MM-143', 31 'Telimena sp.2 MM-144', 32 'Telimena sp.5 MM-47', 33 'Phyllachora sp.3 MM-78', 34 'Telimena sp.4 MM-88', 35 'Telimena sp.3 MM-92', 36 'Phyllachora sp.3 MM-98', 37 Phyllachora_sp.4_RMB1061, 38 Telimena_ulei_TH574, 39 Telimena_zanthoxylicola_TH550, 40 'Polystigma pusillum MM-113', 41 'Polystigma pusillum MM-147', 42 'Polystigma pusillum MM-19', 43 'Polystigma sp. MM-163', 44 'Telimena ulei SO-12', 45 'Telimena sp.6 SO-14', 46 'Telimena sp.6 SO-21', 47 'Telimena sp.6 SO-22', 48 'Telimena aequatoriensis SO-05', 49 'Phyllachora sp.3 SO-07', 50 'Telimena engleri SO-09', 51 Serenomyces_phoenicis_PLM314, 52 Serenomyces_phoenicis_PLM315, 53 'Telimena bicincta MM-108'; TREE Fig._3 = [&R] (2:0.03340213,1:0.04351601,((((((3:0.07689458,4:0.04522836):0.1171656,5:0.1172902):0.07615881,(((6:0.003575418,(9:0.06030939,10:0.01363476):0.01561928):0.01160564,8:0.008613581):0.02885816,7:0.01379533):0.05089048):0.02317282,(((((17:0.005752844,(((18:0.003961808,20:0.04137879):0.0343412,19:0.03190432):0.08583555,23:0.06766286):0.01932362):0.007931178,21:0.003497977):0.00708531,43:0.05990224):0.01348354,(27:0.2977802,37:0.1058218):0.03053853):0.03225804,(25:0.1217226,26:0.07498356):0.1765536):0.01686315):0.007741097,((29:0.2107673,((33:0.1021147,36:0.05332573):0.04683072,49:0.09528944):0.03291736):0.01583573,(40:0.1222367,(41:0.09388658,42:0.06373997):0.05468408):0.0737175):0.02656561):0.01550192,(((11:0.08546179,12:0.06262387):0.04763194,(51:0.04649585,52:0.09079505):0.04872104):0.0816475,((((((13:0.0876896,34:0.08653837):0.01088153,(22:0.003643228,39:0.008301406):0.008045697):0.01021138,((((14:0.004629441,50:0.01275901):0.001148057,15:0.003461827):0.006256197,16:0.02112818):0.01309325,(45:9.985954E-4,(46:0.002231298,47:0.004650912):0.001135683):0.04699462):0.01431518):0.003143664,(32:0.1379885,48:0.02688349):0.004192693):0.001900822,((24:0.1544087,(28:0.08694972,53:0.04856277):0.006393073):0.04794712,((30:0.06600059,31:0.02076927):0.03172877,35:0.02275991):0.03697763):0.006311596):0.0233442,(38:0.003530046,44:0.03462852):0.02462117):0.02575806):0.01111652):0.06718818); END; BEGIN TREES; TITLE Phyllachorales_in_Sordariomycetes_MaxLik; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 'Telimena picramniae MM-05', 2 'Polystigma pusillum MM-113', 3 'Telimena canafistulae MM-13', 4 'Telimena bicincta MM-133', 5 'Phyllachora sp.3 MM-134', 6 'Camarotella costaricensis MM-149', 7 'Polystigma sp. MM-163', 8 'Coccodiella sp. MM-165', 9 'Polystigma pusillum MM-19', 10 'Camarotella costaricensis MM-21', 11 'Camarotella sp. MM-27', 12 'Phyllachora sp.3 MM-78', 13 'Telimena sp.4 MM-88', 14 'Telimena sp.3 MM-92', 15 'Phyllachora sp.3 MM-98', 16 Aniptodera_chesapeakensis, 17 Balansia_henningsiana, 18 Bionectria_ochroleuca, 19 Bombardia_bombarda, 20 Buergenerula_spartinae, 21 Calosphaeria_pulchella, 22 Camarops_amorpha, 23 Camarops_microspora, 24 Camarops_tubulina, 25 Camarops_ustulinoides, 26 Cercophora_coprophila, 27 Chaetosphaerella_phaeostroma, 28 Chrysoporthe_cubensis, 29 Coccodiella_miconiae, 30 Coccodiella_miconiicola, 31 Cordyceps_cardinalis, 32 Ophiocordyceps_irangiensis, 33 Tolypocladium_japonicum, 34 Cryphonectria_parasitica, 35 Cryptosporella_hypodermia, 36 Diaporthe_eres, 37 Diatrype_disciformis, 38 Tolypocladium_capitatum, 39 Eutypa_lata, 40 Cocoicola_californica_F59034, 41 Cocoicola_californica_F59038, 42 Falcocladium_multivesiculatum, 43 Falcocladium_sphaeropedunculatum, 44 Gelasinospora_tetrasperma, 45 Glomerella_cingulata, 46 Gnomonia_gnomon, 47 Graphium_penicillioides, 48 Halosphaeria_appendiculata, 49 Hypocrea_lutea, 50 Kylindria_peruamazonensis, 51 Lasiosphaeria_ovina, 52 Leotia_lubrica, 53 Melanospora_tiffanii, 54 Melanospora_zamiae, 55 Microascus_trigonosporus, 56 Monilochaetes_infuscans, 57 Ophioceras_dolichostomum, 58 Ophioceras_leptosporum, 59 Ophiodothella_vaccinii, 60 Ophiostoma_piliferum, 61 Ophiostoma_stenoceras, 62 Serenomyces_phoenicis_PLM314, 63 Serenomyces_phoenicis_PLM315, 64 Papulosa_amerospora, 65 Telimena_engleri_TH551, 66 Phyllachora_graminis_TH544, 67 Telimena_leeae_TH549, 68 Telimena_zanthoxylicola_TH550, 69 Polystigma_amygdalinum, 70 Pseudohalonectria_lignicola, 71 Roumegueriella_rufula, 72 Sordaria_fimicola, 73 Sordaria_macrospora, 74 Sphaerodothis_acrocomiae, 75 Sphaerostilbella_berkeleyana, 76 Togninia_vibratilis, 77 Valsa_ambiens, 78 Verticillium_dahliae, 79 Xylaria_acuta; TREE Fig._2 = [&R] ((((((64:0.10594797932560811,((60:0.024077751000627926,61:0.005544052516567287)100:0.0703958832628648,(70:0.16580721366223375,(20:0.046251760022570074,(57:0.058604126540135235,58:0.08762212635191845)100:0.08875983196935164)87:0.014827445438255177)99:0.04079900616299748)40:0.015528687361113647)70:0.02277469170649032,((((46:0.034848986113722245,35:0.027642841629288564)100:0.056345425758246956,(34:0.028715205895136518,28:0.03224949170961592)100:0.033302106798670635)100:0.031193180890787736,(77:0.034263297192659366,36:0.08161530726469031)97:0.034512317895293756)100:0.06735686894313664,(76:0.08540755656428838,21:0.12133577353518739)93:0.026209539341017128)98:0.023394746902024217)94:0.0236714598825398,(((51:0.08623797652351763,(44:0.015993305720422242,(73:0.009274353497296802,72:0.006681819781896478)97:0.008045192159442714)100:0.06281246965284981)33:0.011110143041830162,(19:0.08173964558631772,26:0.10933735212390228)29:0.012295510990103925)95:0.03098952010972817,((((((((67:0.027058472767657098,68:0.042771061069837836)45:0.005783432291720812,(3:0.09556236437049144,(65:0.04100946698704996,13:0.1045189898455071)32:0.003762262546691955)9:2.04164515391618E-6)26:0.002973369398089777,(1:0.07302882387447054,4:0.20427458453447636)63:0.03197163487583707)73:0.018306676971739766,14:0.0795283941031723)100:0.11559187200052917,(9:0.19343614256460137,2:0.0960514284276418)100:0.2376650797147458)52:0.01441125247928715,((((10:0.045236549185434474,6:0.09535638417197799)100:0.1830800946637584,11:0.20888021351733255)94:0.05834683500691311,(8:0.09946399319407305,(30:0.11469077717043195,29:0.04225682983235258)56:0.012683751514265646)99:0.051366898580188614)100:0.046974318892076934,(66:0.08963127084697523,(7:0.07861978913052271,((15:0.032435963617408616,5:0.016252837461017414)95:0.0076043240593219015,12:0.01603867909043699)100:0.2861751415603705)48:0.020618070606797736)76:0.01690430430005549)85:0.02702495685850654)96:0.040253212747789015,((41:0.06696115123807636,40:0.011846877385512695)100:0.06812995109712681,(63:0.4754380444121368,62:0.22125417480464402)100:0.13975166731830932)100:0.12879411869364776)64:0.022176224735721287,((25:0.02225194876861834,24:0.025407649928026008)100:0.022646162702839513,(23:0.028741904164130576,22:0.030119794535864393)90:0.012652961474815714)100:0.05690171826778893)67:0.014151374655553843)100:0.04354092998962777)94:0.02077659585159683,(((47:0.11008121265329225,(55:0.10556081364116617,(16:0.10686298415448076,48:0.061517730576969104)100:0.09989563050211142)93:0.01795218191127767)100:0.057212934739306,(50:0.08610279769882369,(45:0.06763199049404431,(78:0.15947806317577745,56:0.06012477325612381)34:0.009373263458584434)47:0.01257339879905843)100:0.07374523692612608)52:0.018779585796817034,(((43:0.0263162058936548,42:0.014057719422483088)100:0.2072201811477353,(27:0.17471499852914,(54:0.0064681738929451265,53:0.01643333604605075)100:0.24458944012812894)100:0.030356637336245985)100:0.059652023846388985,((18:0.08967090568638504,71:0.09779607833631149)100:0.04756233708688987,(((49:0.053633716621454955,75:0.06497521101571657)100:0.03864666342725161,(17:0.06920887778646148,(74:0.09455211706578048,31:0.07887818509600257)35:0.00381061925069842)40:0.017180588922020217)38:0.011931450720063061,(32:0.1585812346617494,(38:0.016638120588398825,33:0.026197167954073834)99:0.028295852399854743)91:0.019798688652415762)72:0.021097481776215968)84:0.03486113942644935)58:0.011873914748495423)99:0.06058261715769546)74:0.03131086742802473,(79:0.0856128301153345,((39:0.026067857799308817,37:0.03546577032798514)87:0.03594657736623809,(59:0.008752080103009435,69:0.15276953991648565)43:0.03376711231665426)36:0.025592054305415963)79:0.05936198042579798):0.13092240814835593,52:0.13092240814835593); END;