#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on March 28, 2024; 16:58 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Goldblatt P., Rodriguez A., Powell M., Davies T., Manning J., Bank M., & Savolainen V. 2008. Iridaceae 'Out of Australasia'? Phylogeny, biogeography, and divergence time based on plastid DNA sequences. Systematic Botany, null. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1972] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=83; TAXLABELS Ainea_conzattii Alophia_veracruzana Anomatheca_laxa Aristea_coerulea Babiana_sp. Belamcanda_chinensis Bobartia_gladiata Calydorea_pallens Calydorea_sp._MP Chasmanthe_aethiopica Cipura_campanulata Cobana_sp._MP Crocosmia_mathewsiana Crocus_pulchellus Cyanixia_socotrana Cypella_aquatilis Cypella_mexicana Cypella_rosei Devia_xeromorpha Dierama_robustum Dietes_robinsoniana Diplarrhena_latifolia Doryanthes_palmeri Duthiastrum_linifolium Eleutherine_latifolia Ennealophus_euryandrus Ferraria_uncinata Fosteria_sp._MP Freesia_alba Geissorhiza_heterostyla Gelasine_elongata Geosiris_aphylla Gladiolus_guienzii Herbertia_pulchella Hesperantha_pseudopilosa Hesperoxiphion_peruvianum Iris_unguicularis Isophysis_tasmanica Ixia_latifolia Ixiolirion_tataricum Klattia_flava Lapeirousia_neglecta Libertia_ixioides Melasphaerula_ramosa Micranthus_junceus Moraea_namaquamontana Nemastylis_geminif Nemastylis_sp._MP Nemastylis_tenuis Neomarica_northiana Nivenia_corymbosa Olsynium_filifolium Onira_unguiculata Orthrosanthus_chimboracensis Pardanthopsis_dichotoma Patersonia_glabrata Pillansia_templemannii Radinosiphon_New Radinosiphon_leptostachya Romulea_monadelpha Savannosiphon_euryphyllus Sessilanthera_MP Sisyrinchium_micranthum Solenomelus_pedunculatus Sparaxis_variegata Syringodea_bifucata Syringodea_unifolia Thereianthus_racemosus Tigridia_alp_ssp_alp Tigridia_alp_ssp_obt Tigridia_flammea_MP Tigridia_orthantha_MP Tigridia_pavonia Tigridia_philipp_MP1 Tigridia_seleriana_MP Trimezia_martinicensis Tritonia_disticha Tritoniopsis_unguicularis Watsonia_angusta Witsenia_maura Xenoscapa_fistulosa Zephyra_elegans Zygotritonia_spp. ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M3000] TITLE Iridaceae; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=6701; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Alophia_veracruzana 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Babiana_sp. 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Crocus_pulchellus 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Cypella_mexicana 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Doryanthes_palmeri 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Ennealophus_euryandrus 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Ferraria_uncinata 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Freesia_alba 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Gladiolus_guienzii 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Hesperantha_pseudopilosa 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Hesperoxiphion_peruvianum 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Iris_unguicularis 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Isophysis_tasmanica 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Ixia_latifolia 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Klattia_flava 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Libertia_ixioides 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Melasphaerula_ramosa 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Neomarica_northiana 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Onira_unguiculata 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Orthrosanthus_chimboracensis 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Patersonia_glabrata 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Pillansia_templemannii 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Radinosiphon_leptostachya 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Sisyrinchium_micranthum 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Tigridia_flammea_MP 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Tigridia_philipp_MP1 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Tritonia_disticha 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Witsenia_maura 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Zygotritonia_spp. 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; END; BEGIN SETS; CHARSET rps16_only (CHARACTERS = Iridaceae) = 5526-5877 5888-5904 5912-6432 6442-6649; CHARSET trnL_F_only (CHARACTERS = Iridaceae) = 2085-2524 2551-2882 2907-2935 2944-3324 3329-3371 3378-3393; CHARSET matK_only (CHARACTERS = Iridaceae) = 3498-5197 5228-5451; CHARSET rps4_only (CHARACTERS = Iridaceae) = 1438-2040; CHARSET rbcL_only (CHARACTERS = Iridaceae) = 21-1355; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = Iridaceae) = N: 1-6701; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = Iridaceae) = N: 1-6701; END; BEGIN TREES; TITLE Tb8825; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Zygotritonia_spp., 2 Zephyra_elegans, 3 Xenoscapa_fistulosa, 4 Witsenia_maura, 5 Watsonia_angusta, 6 Tritoniopsis_unguicularis, 7 Tritonia_disticha, 8 Trimezia_martinicensis, 9 Tigridia_seleriana_MP, 10 Tigridia_philipp_MP1, 11 Tigridia_orthantha_MP, 12 Tigridia_flammea_MP, 13 Tigridia_alp_ssp_obt, 14 Tigridia_alp_ssp_alp, 15 Tigridia_pavonia, 16 Thereianthus_racemosus, 17 Syringodea_unifolia, 18 Syringodea_bifucata, 19 Sparaxis_variegata, 20 Solenomelus_pedunculatus, 21 Sisyrinchium_micranthum, 22 Sessilanthera_MP, 23 Savannosiphon_euryphyllus, 24 Romulea_monadelpha, 25 Radinosiphon_leptostachya, 26 Radinosiphon_New, 27 Pillansia_templemannii, 28 Patersonia_glabrata, 29 Pardanthopsis_dichotoma, 30 Orthrosanthus_chimboracensis, 31 Onira_unguiculata, 32 Olsynium_filifolium, 33 Nivenia_corymbosa, 34 Neomarica_northiana, 35 Nemastylis_tenuis, 36 Nemastylis_sp._MP, 37 Nemastylis_geminif, 38 Moraea_namaquamontana, 39 Micranthus_junceus, 40 Melasphaerula_ramosa, 41 Libertia_ixioides, 42 Lapeirousia_neglecta, 43 Klattia_flava, 44 Ixiolirion_tataricum, 45 Ixia_latifolia, 46 Isophysis_tasmanica, 47 Iris_unguicularis, 48 Hesperoxiphion_peruvianum, 49 Hesperantha_pseudopilosa, 50 Herbertia_pulchella, 51 Gladiolus_guienzii, 52 Geosiris_aphylla, 53 Gelasine_elongata, 54 Geissorhiza_heterostyla, 55 Freesia_alba, 56 Fosteria_sp._MP, 57 Ferraria_uncinata, 58 Ennealophus_euryandrus, 59 Eleutherine_latifolia, 60 Duthiastrum_linifolium, 61 Doryanthes_palmeri, 62 Diplarrhena_latifolia, 63 Dietes_robinsoniana, 64 Dierama_robustum, 65 Devia_xeromorpha, 66 Cypella_rosei, 67 Cypella_mexicana, 68 Cypella_aquatilis, 69 Cyanixia_socotrana, 70 Crocus_pulchellus, 71 Crocosmia_mathewsiana, 72 Cobana_sp._MP, 73 Cipura_campanulata, 74 Chasmanthe_aethiopica, 75 Calydorea_sp._MP, 76 Calydorea_pallens, 77 Bobartia_gladiata, 78 Belamcanda_chinensis, 79 Babiana_sp., 80 Aristea_coerulea, 81 Anomatheca_laxa, 82 Alophia_veracruzana, 83 Ainea_conzattii; TREE Fig._1 = [&R] (10,(((((((83,56),22),((11,9),15)),((((14,13),12),75),36)),72),((((((((((((((((((((17,18),70),24),25),(((79,74),((64,(45,7)),(60,19))),(54,49))),((((81,55),(71,65)),3),6)),(51,40)),(((69,23),42),((39,16),(27,5)))),((43,4),33)),80),52),28),(46,(61,(44,2)))),62),(((77,(57,38)),63),(47,(78,29)))),((41,30),((32,21),20))),(34,8)),(((67,66),73),(((37,35),76),(68,(50,31))))),82),((59,53),48))),58)); END;