#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 26, 2024; 21:09 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Wahlberg N., & Wheat C. 2008. Genomic outposts serve the phylogenomic pioneers: designing novel nuclear markers for genomic DNA extractions of Lepidoptera. Systematic Biology, 57(2): 231-242. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1987] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=58; TAXLABELS Altinote_stratonice Amathusia_phidippus Anaea_troglodyta Anartia_amathea Anetia_briarea Apatura_iris Aporia_crataegi Archaeoprepona_demoph Argynnis_paphia Biblis_hyperia Bicyclus_anynana Brintesia_sp._B01 Caligo_telamonius Calinaga_buddha Callicore_tolima Catonephele_numilia Celastrina_sp._EW28_1 Charaxes_castor Chitoria_chrysolora Cyrestis_thyodamas Danaus_plexippus Elymnias_casiphone Erebia_oeme Euphaedra_herberti Euxanthe_eurinome Greta_oto Haetera_piera Hamadryas_februa Hamearis_sp._84_13 Heliconius_hecale Heteronympha_merope Historis_odius Hypanartia_paullus Junonia_oenone Kallima_paralekta Lethe_minerva Libythea_celtis Libytheana_terena Limenitis_reducta Maniola_jurtina Marpesia_eleuchea Melanitis_leda Melitaea_cinxia Methona_themisto Morpho_peleides Mynes_geoffroyi Neptis_ida Nymphalis_polychloros Palla_decius Papilio_glaucus Pararge_aegeria Parthenos_sylvia Pseudergolis_wedah Smyrna_blomfildia Stibochiona_nicea Taygetis_laches Vagrans_egista Zethera_incerta ; END; BEGIN CHARACTERS; [! 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Anaea_troglodyta 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Kallima_paralekta 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Marpesia_eleuchea 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Palla_decius 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(CHARACTERS = Phylogenomics_Nymphalidae) = 5608 5881 5884 5887 5890 5893 5896 5899 5902 5905 5908 5911 5914 5917 5920 5923 5926 5929 5932 5935 5938 5941 5611 5944 5947 5614 5617 5620 5623 5626 5629 5632 5635 5638 5641 5644 5647 5650 5653 5656 5950 5953 5956 5959 5962 5965 5968 5971 5974 5977 5980 6163 6166 6169 6172 6175 6178 5983 5986 6181 5659 6184 6187 5989 5992 5662 5995 6190 6193 5998 5665 6001 6196 6199 5668 6202 5578 5671 5581 6205 6208 5584 5674 5587 6211 6214 5590 5677 5593 5596 6217 6220 6223 5599 6226 5680 6229 5602 5605 6232 5683 6235 6238 5686 6241 6244 5689 6247 5692 6250 6253 5695 6256 6259 5698 6262 5701 6265 6268 5704 6271 6274 5707 5710 5713 6277 5716 6280 5719 6283 6286 5722 6289 5725 5728 5731 6292 5734 6295 5737 6298 6301 5740 6304 5743 5746 6307 6310 5749 5752 5755 5758 5761 5764 5767 5770 5773 5776 5779 5782 5785 5788 5791 5794 5797 5800 5803 5806 5809 5812 5815 5818 5821 5824 5827 5830 5833 5836 5839 5842 5845 5848 5851 5854 5857 5860 5863 5866 5869 5872 5875 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7741; CHARSET ArgKin1 (CHARACTERS = Phylogenomics_Nymphalidae) = 370 373 376 379 382 385 388 1 4 7 10 13 16 19 22 25 28 31 34 37 40 43 46 49 52 55 58 61 64 67 70 73 76 79 82 85 88 91 94 97 100 103 106 109 112 115 118 121 124 127 130 133 136 139 142 145 148 151 154 157 160 163 166 169 172 175 178 181 184 187 190 193 196 199 202 205 208 211 214 217 220 223 226 229 232 235 238 241 244 247 250 253 256 259 262 265 352 355 358 361 268 271 274 277 364 367 280 283 286 391 394 397 400 403 406 409 412 415 418 421 424 427 430 433 436 439 442 445 448 451 454 457 460 289 292 295 298 301 304 307 310 313 316 319 322 325 328 331 334 337 340 343 346 349 463 466 469 472 475 478 481 484 487 490 493 496 499 502 505 508 511 514 517 520 523 526 529 532 535 538 541 544 547 550 553 556 559 562 565 568 571 574 577 580 583 586 589 592 595; CHARSET COI3 (CHARACTERS = Phylogenomics_Nymphalidae) = 1529 1532 1535 1538 1541 1544 1547 1550 1553 1556 1559 1562 1565 1568 1571 1574 1577 1580 1583 1586 1589 1592 1595 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6530 6533 6536 6539 6542 6545 6548 6551 6554 6311 6314 6317 6320 6323 6326 6329 6332 6335 6338 6341 6344 6347; CHARSET MDH (CHARACTERS = Phylogenomics_Nymphalidae) = 5578-6310; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = Phylogenomics_Nymphalidae) = N: 1-8114; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = Phylogenomics_Nymphalidae) = N: 1-8114; END; BEGIN TREES; TITLE Tb8881; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Zethera_incerta, 2 Vagrans_egista, 3 Taygetis_laches, 4 Stibochiona_nicea, 5 Smyrna_blomfildia, 6 Pseudergolis_wedah, 7 Parthenos_sylvia, 8 Pararge_aegeria, 9 Papilio_glaucus, 10 Palla_decius, 11 Nymphalis_polychloros, 12 Neptis_ida, 13 Mynes_geoffroyi, 14 Morpho_peleides, 15 Methona_themisto, 16 Melitaea_cinxia, 17 Melanitis_leda, 18 Marpesia_eleuchea, 19 Maniola_jurtina, 20 Limenitis_reducta, 21 Libytheana_terena, 22 Libythea_celtis, 23 Lethe_minerva, 24 Kallima_paralekta, 25 Junonia_oenone, 26 Hypanartia_paullus, 27 Historis_odius, 28 Heteronympha_merope, 29 Heliconius_hecale, 30 Hamearis_sp._84_13, 31 Hamadryas_februa, 32 Haetera_piera, 33 Greta_oto, 34 Euxanthe_eurinome, 35 Euphaedra_herberti, 36 Erebia_oeme, 37 Elymnias_casiphone, 38 Danaus_plexippus, 39 Cyrestis_thyodamas, 40 Chitoria_chrysolora, 41 Charaxes_castor, 42 Celastrina_sp._EW28_1, 43 Catonephele_numilia, 44 Callicore_tolima, 45 Calinaga_buddha, 46 Caligo_telamonius, 47 Brintesia_sp._B01, 48 Bicyclus_anynana, 49 Biblis_hyperia, 50 Argynnis_paphia, 51 Archaeoprepona_demoph, 52 Aporia_crataegi, 53 Apatura_iris, 54 Anetia_briarea, 55 Anartia_amathea, 56 Anaea_troglodyta, 57 Amathusia_phidippus, 58 Altinote_stratonice; TREE Fig._2 = [&R] (9,(52,((42,30),(((22,21),((38,54),(33,15))),((((56,(51,((41,34),10))),(((((57,37),17),32,1),(46,14)),((((47,(36,19)),3),28),((23,48),8)))),45),((((58,29),(50,2)),(((35,20),12),7)),((((39,18),(((((55,25),24),16),(((11,26),13),5)),27)),((((49,44),31),43),(53,40))),(4,6)))))))); END;