#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 25, 2024; 15:57 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Simon A., Goffinet B., Magain N., & Serusiaux E. 2018. High diversity, high insular endemism and recent origin in the lichen genus Sticta (lichenized Ascomycota, Peltigerales) in Madagascar and the Mascarenes. Molecular Phylogenetics and Evolution, 122: 15-28. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S20682] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=220; TAXLABELS Coccocarpia_domingensis Coccocarpia_erythroxyli Collema_auriforme Collema_callopismum Collema_conglomeratum Collema_curtisporum Collema_flaccidum Collema_fragile Collema_fragrans Collema_furfuraceum Collema_multipartitum Collema_parvum Collema_polycarpon Collema_tenax Collema_undulatum Degelia_durietzii Degelia_gayana Degelia_plumbea Erioderma_verruculosum Fuscoderma_amphibolum Fuscoderma_applanatum Fuscopannaria_ahlneri Fuscopannaria_mediterranea Fuscopannaria_praetermissa Lecidea_atrobrunnea Lecidea_auriculata Lecidea_berengeriana Lecidea_confluens Lecidea_cyrtidia Lecidea_diapensiae Lecidea_floridensis Lecidea_fuscoatra_589 Lecidea_fuscoatra_6860 Lecidea_fuscoatra_L02894 Lecidea_fuscoatra_var_grisella Lecidea_laboriosa Lecidea_lapicida Lecidea_nylanderi Lecidea_roseotincta Lecidea_silacea_1368 Lecidea_silacea_6865 Lecidea_sp_040326 Lecidea_sp_7695 Lecidea_tessellata Lecidea_turgidula Lecidoma_demissum Leciophysma_finmarkicum Leciophysma_furfurascens Leioderma_erythrocarpum Leptochidium_albociliatum_29087 Leptogium_austroamericanum Leptogium_brebissonii Leptogium_burnetiae Leptogium_corticola Leptogium_cyanescens Leptogium_diffractum Leptogium_furfuraceum Leptogium_gelatinosum Leptogium_imbricatum Leptogium_magnussonii Leptogium_microphylloides Leptogium_phyllocarpum Leptogium_plicatile Leptogium_pseudofurfuraceum Leptogium_pulvinatum Leptogium_saturninum Leptogium_schraderi Leptogium_subaridum Leptogium_tenuissimum Leptogium_turgidum Lobaria_amplissima Lobaria_hallii Lobaria_immixta Lobaria_linita Lobaria_macaronesica Lobaria_meridionalis Lobaria_oregana Lobaria_orientalis Lobaria_pseudoglaberrima Lobaria_pseudopulmonaria Lobaria_pulmonaria Lobaria_quercizans Lobaria_retigera Lobaria_sachalinensis Lobaria_scrobiculata Lobaria_virens Lobariella_pallida Massalongia_carnosa Nephroma_antarcticum Nephroma_arcticum Nephroma_bellum Nephroma_parile Nephroma_resupinatum Pannaria_conoplea Pannaria_rubiginella Pannaria_rubiginosa Pannaria_sp Parmeliella_appalachensis Parmeliella_sp Parmeliella_triptophylla Peltigera_aphthosa Peltigera_britannica Peltigera_canina_009205 Peltigera_cinnamomea Peltigera_continentalis Peltigera_degenii Peltigera_didactyla Peltigera_didactyla_var_extenuata Peltigera_elisabethae Peltigera_extenuata Peltigera_horizontalis Peltigera_hydrothyria Peltigera_hymenina Peltigera_kristinssonii Peltigera_laciniata Peltigera_lambinonii Peltigera_leucophlebia Peltigera_malacea Peltigera_membranacea Peltigera_monticola Peltigera_neckeri Peltigera_neopolydactyla Peltigera_occidentalis Peltigera_polydactyloides Peltigera_polydactylon Peltigera_ponojensis Peltigera_praetextata Peltigera_pulverulenta Peltigera_retifoveata Peltigera_rufescens Peltigera_scabrosa Peltigera_sp Peltigera_venosa Physma_byrsaeum Physma_pseudoisidiatum Physma_radians Placynthium_flabellosum Placynthium_nigrum Polychidium_muscicola Protopannaria_pezizoides Pseudocyphella_rainierensis Pseudocyphellaria_anomala Pseudocyphellaria_argyracea Pseudocyphellaria_aurata Pseudocyphellaria_berberina Pseudocyphellaria_cf_intricata Pseudocyphellaria_citrina_LG688 Pseudocyphellaria_clathrata Pseudocyphellaria_coriifolia Pseudocyphellaria_divulsa Pseudocyphellaria_endochrysea Pseudocyphellaria_freycinetii Pseudocyphellaria_hirsuta Pseudocyphellaria_intricata Pseudocyphellaria_lechleri Pseudocyphellaria_mallota Pseudocyphellaria_obvoluta Pseudocyphellaria_perpetua Pseudocyphellaria_pilosella Pseudocyphellaria_sp_5295 Psoroma_hypnorum Ramalodium_succulentum Solorina_crocea Solorina_saccata_2087 Solorina_saccata_4823 Staurolemma_omphalarioides Staurolemma_sp Staurolemma_weberi Sticta_ainoae_UCONN4149 Sticta_ambavillaria_LG992 Sticta_atlantica_LG3858 Sticta_beauvoisii_1242 Sticta_beauvoisii_LG3303 Sticta_canariensis_LG1333 Sticta_caperata_LG624 Sticta_carolinensis_LG3302 Sticta_caulescens Sticta_damaecornis Sticta_dichotoma_LG1005 Sticta_duplolimbata_LG1040 Sticta_filix_2 Sticta_fuliginosa_980W1A Sticta_fuliginosa_LG795 Sticta_gaudichaldia Sticta_hypochra_1 Sticta_hypochra_2 Sticta_limbata_LG2230 Sticta_macrophylla_LG946 Sticta_plumbea_LG1031 Sticta_sp_LG1017 Sticta_sp_LG1109 Sticta_sp_LG3450 Sticta_sp_LG4059 Sticta_sp_LG4062 Sticta_sp_LG4074 Sticta_sp_LG4077 Sticta_sp_LG4082 Sticta_sp_LG4084 Sticta_sp_LG4092 Sticta_sp_LG4107 Sticta_sp_LG4109 Sticta_sp_LG4110 Sticta_sp_LG4117 Sticta_sp_LG800 Sticta_sp_LG991 Sticta_sp_UCONN4018 Sticta_sp_UCONN4038 Sticta_sp_UCONN4076 Sticta_sp_UCONN4094 Sticta_sp_UCONN4102 Sticta_sp_UCONN4116 Sticta_sp_UCONN4128 Sticta_sp_UCONN4139 Sticta_stipitata_LG1253 Sticta_sublimbata_LG1038 Sticta_sublimbata_LG885 Sticta_sylvatica_LG3536 Sticta_umbilicariaeformis_LG925 Sticta_variabilis_LG3451 Sticta_weigelii ; 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TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M40351] TITLE 'Sticta 3-loci (mtSSU, nuLSU, RPB1)'; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=2906; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Collema_auriforme 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Collema_callopismum 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Collema_conglomeratum 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Collema_curtisporum 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Collema_flaccidum 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Collema_fragile 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Collema_fragrans 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Collema_multipartitum 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Collema_parvum GCCTAACGGCTGAACCAGCAACTTGGAGGAATGATA------------TA-TAAAACATATGCGATTTATTTGTATAAAGTTCTAGATAGAATTATGATAATGACATTGTCTATCTATAAGTCTTGGCCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGCAAGACGTTAAAGACTAGTGTTATTCATCTTTAATAGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGTAAATCAAGCCTT------------GGGACTAATTTAACTAGAGTTAGATGTAAAGGTGCCCAAACGTACTGTTGTGTTTAGAGATGAAATTCTTTTATACCAGATTATTGGCACGGGTTTAGGCGAAAGCATCACCTTATGTAATAACTGACGTTGAGGGACGAAGGCTTTGTCGCGAACAGGATTAGAGACCCTGGTAGTCTAAGCAGTAAATGATGAGTGTCATAGGTTAAATA--GTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCAAGAGTAATATGGCAACATTGAAATTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAATCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTAGATAATCCACAAAAAACCTTACCACAATTTGAAT------ATATTACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTCAGTTAATGTCGTGAGATTGTGGTTGGTTCCGCTAAATTAACGTAAACCCTCATTTATTTTAAGTTCTCTATATTAAAAGGGGACAAGTCATC??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGGAGATGGTTTGCCATAACTGTGGGAAATTACTCGTCGACGAAGTGAGCCACTTCTCGT-CGGCGCAGCAATACTTGCGCATTAGAGCCATCCAGCATTCGCTGACGCGCTTCGTTACCGTGATCCTAAGAGACGCTTCGACGCAATTTGGCGGCTGTGTAAACCAAAGATGGTCTGCGAAACCGCGGTTGTGCCGGAGGAAGACGGCACAGATAAGTTGAAGGAACCAAAGCATGACCATGGTGGATGTGGCAACGTGCAGCCAGAAGTCCGTCGAGAGGGTCTGAAGCTGACCGGAACCTGGAAAGCTCAGAAGGGTGATGAGGAGAATGAGGGACAACAGCCGGAGAAGAAACCTATCACGCCCCAGATGGCACTTCATATTTTCCACCATATTTCTACGGATGAAATTAAGAGAATGGGCCTGAGTAATGATTATGCACGCCCTGAGTGGATGATCATTACCGTACTCCCGGTGCCGCCGCCACCAGTGCGACCCAGCATCTCCATGGATGGAGGAACAGGGCCGCGTGGTGAGGATGAATTGACTTACAAACTTGGA{AG}ACATCATACGTGCAAACGGCAACGTAAGACGATGCGAAACGGAAGGCTCCCCAGCTCATGTG???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Collema_polycarpon 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Collema_tenax GCCTAACGGCTGAACCAGCAACTTGGAGGAATGATAGCTAAAGCTAAACGTAAATACAGATTCGATTTACTCGTATAAAGTTCTAGATAGGATTATGATAATGACATTGTCTATCTATATGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGCAAGACGTAAAAGACTAGTGTTATTCATCTTTAATAGGTTTAAAGCGTACCTAGACGGTAAATAAAGCCTT-----------GGGGACTAATTTAACTAGAGTTAGATGTAAGGGTGCATAAACGTACTGTTGAGTGTAGAGATGAAATTCTGTTATACCAGATTATTGGCACGGGTTTAGGCGAAAGCATCGCCTTATGTAATAACTGACGTTGAGGGACGAAGGCTTTGTCGCGAACAGGATTAGGTACCCCAGTAGTCTTAGCAGAAAATGATGAGTGTCATAGGTTAAATA--GTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCAAGAGTAATTTGGCAACATTGGAATTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTAGATATTCCACCAAAAACCTTACCACAATTTGAAT---------TTACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTCAGTTAATGTCGTGAGATTATGGTTAGTTCCATTAAATTAACGTAAACCCTTATTTATTTTAAGTACGCTAGATTAAAAGGGGACAC??????TTGCCTCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAGCAGCTCAA-CTTGAAATCCGGCCCCGCCGGGGCCCGAGTTGTAATTTGGAGAGGGCGCTTCGGGCGCGGCGCCGGTCCAAGTGCCTTGGAACAGGACGTCGCAGAGGGTGAGAACCCCGTCCGCGGCCGTGCCCCCGTGAAGCCCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCCAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATACCGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTCACCCCCAGACCGGCGACCACCCG-TGCCGGGGCACCCGCCCGCAGGCCAGCACGGGTTCGGGCGGCGGGAGAAAGCGCCCGGGAATGTAGCTCCCGGGGTGCCTTATAGCCCGGGCGGCCATGCCGCCCGCCCCGAGGACCGCGCTCCGGCCAGGGTGCTGGCGTAATGGGGGCGAGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTACGCGAGTGTTTGTCAAACGCGCGGAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGAGCCCCGGGGCGCACCATCGACCGATCCGGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTACGAGCGTAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGCATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACCATCTAGTAGCTGGTTCCTGCCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGTAACGCGTTCAGTTTTATGAGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCCTTGGGGGTGAAACACCCTTAACCTATTCTCAAACTTTCAATATGTAAGAAGTCCCTGTTGCTTCGGTGAACGGGGACGCGCGAATGCACCGTTACTAGTGGGCCATTTTTGGTAAGCAGAACTGGCGATGCGGGATGAACCGAACGCGGGGTTAAGGTGCCGGAATGCACGCTCATCAGACACCACAAAAGATGTCAATTCATCCGGACAGCCGGACGGTGGCCATGGAAGCCGGAACCCGCTAAGGAGTGCGTAACAGCTCACCGGCCGAATGAATTGGCTCTGAAAATGGATGGCGCTCAAGCGTGCTAC--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Collema_undulatum GCCTAACGGCTGAACCAGCAACTTGGAGGAATGATAGCTAAAACTAAATGTTAATACATATTCGATTTATTCGTATAAAGTTCTAGATAGAATTATGATAATGACATTGTCTATCTATAAGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGCAAGACGTAAAAGACTAGTGTTATTCATCTTTAATAGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGTAAATAAAGCCTA-----------CGGGACTAATTTAACTAGAGTTAGATGTAAGGGTGCATAAACGTACTGTTGAGTGTAGAGATGAAATTCTTTTATACCAGATTATTGGCACGGGTTTAGGCGAAAGCATCGCCTTATGTAATAACTGACGTTGAGGGACGAAGGCTTTGTCGCGAACAGGATTAGATACCCCAGTAGTCTAAGCAGAAAATGATGAGTGTCATAGGTTAAATATTGTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCAAGAGTAATTTGGCAACATTGGAATTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTAGATAATCCACAAAAAACCTTACCACAATTTGAAT---------TTACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTCAGTTAATGTCGTGAGATTATGGTTAGTTCCATTAAATTAACGTAAACCCTTATTTATTTT??????????????????????????????????????????????????????????????????TCAAACTGGAAATCCGACCCCTGGGGGGCCCGAGTTGTAATTTGCAGAGGGCGCTTCGGGCGCGGCGCCGGTCCAAGTTCCTTGGAACAGGACGTCAGAGAGGGTGAGAATCCCGTCTGCGGCCCACCCCGGGTGAAGCCCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCCAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATACCGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACCTTGAAAAGGGAGTCAAACAGCACGTGAAATTGTTGAAAGCGAAGCGCTTGCCGCCAGACCGGCGCTCACCCG-TGGCGGGGCACTCGCCCGCAGGCCAGCACGGGTTCGGGCGGCGGGAGAAAGGGCCCGGGAATGTAGCTCCCGGGGTGCGTTATAGCCCGGGCCGCCATGCCGCCCGCCCCGAGGACCGCGCTTCGGCCAGGGTGCTGGCGTAATGGCGGCAAGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTACGCGAGTGTTTGTCAAAGGCGCGGAATGAAAGTGAACGCCGGTGGGACCCCCGGGGCGCACCATCGACCGATCCCGATGTCTTCGGACGGATTTGAGTACGAGCGTAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGGATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGCATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACCATCTAGTAGCTGGTTCCTGTCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGTAACGAATTCAGTTTTATGAGGTAGAGCGAATGATTAGAGGCCTTGGGGTTGAAACAACCTTAACCTATTCTCAAACTTCAAATATGTAAGAAGCCCTTGTTCCTTCGCTGAACGTGGGCACTCGAATGCACCGTTACTAGTGGGCCATTTTTGGTAAGCAGAACTGGCGATGCGGGATGAACCGAACGCGGGGTTAAGGTGCCGGAATGTACGCTCATCAGACACCACAAAAGATGTCAATTCATCTGGACAGCCGGACGGTGGCCATGGAAGCCGGAACCCGCTAAGGAGTGCGTAACAGCTCACCGGCCGAATGAATTGGCTCTGAAAATGGATGGCGCTCAAGCGTGCTAC--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Degelia_durietzii 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Degelia_gayana 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Erioderma_verruculosum 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Fuscoderma_applanatum 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Fuscopannaria_mediterranea 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Fuscopannaria_praetermissa 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Lecidea_atrobrunnea 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Lecidea_auriculata 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Lecidea_berengeriana 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Lecidea_confluens 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Lecidea_cyrtidia 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Lecidea_diapensiae 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Lecidea_fuscoatra_589 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Lecidea_fuscoatra_var_grisella 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Lecidea_laboriosa 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Lecidea_lapicida 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Lecidea_nylanderi 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Lecidea_roseotincta 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Lecidea_silacea_1368 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Lecidea_silacea_6865 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Lecidea_sp_040326 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Lecidea_sp_7695 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Lecidea_tessellata 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Lecidea_turgidula 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Lecidoma_demissum 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Leciophysma_finmarkicum 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Leciophysma_furfurascens GCCTAACGGCTGAACCAGCAACTTGGAGGAAGGATAGCAATAGCTAATTGTTTTTACAATATCGATTTAATCGACTAAAATTCTAGGTAGATTTATGATGATGACATTATCTATCTATGTGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGCAACACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATCTTTAATAGGTTTAAAGCGTACCTAGACGGTAATTATAGCCT-------AAATC-AGGTACTTCTTTACTAGAGTTATATGTAAGGGTGTATTAAAGTACTGTTGGGTGTAGAGATGAAATTCGTTGATACCAGATAATTGGCACAGGTATAGGCGAAAGCATCACTTTATGTAATAACTGACGTTGACGGACGAAGGCTATGTCGCGAACAGGATTAGATACCCCAGTAGTCTTAGCAGAAAATTATGAGTGTCATAGGTTAGAT---GTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCAAGAGTAATTTGGCAACATTGGAACTGAAATCATTAGACCGTGTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATGATCCGCAAAGAACCTTACCACAATTTGAATGATTTATTTTTACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTCAGTTAATGTCGTGAGATATTGGTTAATTCCATTAAATTAACGTAAACCCGCATCTTTTTTGAGTTCGCTATAATAACAGGGGACAAGTCATCTTGCCTCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAACAGCTCAAATTTGAAATCTGGCTCCTGGGGGGTCCGAGTTGTAATTTGCAGAGGGTGTTTCGGGCGCGGTGCCGGTCTAAGTCCCTTGGAACAGGGCGTCATAGAGGGTGAGAATCCCGTCTGCGACTAACCCCATGTGAAACCCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCAAAATGGGTGGTAAATTTCATCTAAAGCTAAATACCGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCGACCAGACCGGCGATCATCCG-TGGCGGTGCACTCGCCCGGAGGCCAGCATCGGTTGGGGCGGCGGGACAAAGCGCCTGGGAATGTAGCTTCTGGGGAGCCTTATAGCCCAGGTGGCCATGCCGCCCGCCCCGAGGACCGCGCTTCGGCTA-GATGCTGCT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AGAAATTACTGGAGACTGTTTGTCACAATTGTGGCAAGATACTAGTTGATGAAGTTAGTCATCCCTCAA-GGGGTGACTTAT---TGA-TTTTAGAGCAATCCAGCATTTGCGGACGCTCTACGGTACCGAGATCCGAAGCGACGGTTCGACGCAATTTGGCGACTTTGTAAACCAAAAATGACATGTGAAACTGCGGCTTCAGCAGATGATGATAATATAGAAAAGTCGAAAGAACCCAAGCACGACCATGGTGGTTGTGGTAACATTCAACCAGAGGTTCGTCGAGAGGGCCTGAGGTTGAATGGTACGTGGAAAGCGCAGAAAGGAGACGAAGAAAACGAAGGTCAGCAGCCCGAGAAGAAGCCGATAACGCCACAAATGGCGCTCAACATCTTTCGTCATATATCCAATGAAGAGATCAAGAAGATGGGGTTGAGTAACGATTACGCACGGCCAGAGTGGATGATCATTACCGTTCTTCCTGTGCCGCCACCTCCAGTCCGACCAAGTATCTCTGTGGACGGGGGAAATGGAATGCGCGGTGAGGACGATTTAACTTACAAACTTGGCGACATCATTCGGGCAAATGGCAACGTACGGCGCTGCGAAACTGAAGGCTCCCCTGCACACGTA???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Leptogium_austroamericanum 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Leptogium_brebissonii 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Leptogium_burnetiae 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Leptogium_corticola 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Leptogium_cyanescens 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Leptogium_gelatinosum 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Leptogium_imbricatum 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Leptogium_magnussonii 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Leptogium_microphylloides 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Leptogium_phyllocarpum 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Leptogium_plicatile 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Leptogium_pseudofurfuraceum 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Leptogium_pulvinatum 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Leptogium_saturninum 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Leptogium_schraderi 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Leptogium_subaridum 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Leptogium_tenuissimum 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Leptogium_turgidum GCCTAACGGCTGAACCAGCAACTTGGAGGAATGATA------------TAGTAAAACATATGCAATTTATTTGTATAAAGTTCTAGATAGAATTATGATAATGACATTGTCTATCTATAAGTCTTGGCCAAATTACGTGCCAGCAGCCGCGGCAAGACGTTAAAGACTAGTGTTATTCATCTTTAATAGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGTAAATCAAGCCTT------------GGGACTAATTTAACTAGAGTTAGATGTAAAGGTGCCCAAACGTACTGTTGTGTTTAGAGATAAAATTCTTTTATACCAGATTATTGGCACGGGTTTAGGCGAAAGCATCACCTTATGTAATAACTGACGTTGAGGGACGAAGGCTTTGTCGCGAACAGGATTAGAGACCCTGGTAGTCTAAGCAGTAAATGATGAGTGTCATAGGTTAAATA--GTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCAAGAGTAATATGGCAACATTGAAATTGAAATCATTAGACCGCTTCTGAAATCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATAATCCACAAAGAACCTTACCACAATTTGAAT------ATATTACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTCAGTTAATGTCGTGAGATTGT????????????????????????????????????????????????????????????????????????TTGCCTCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAACAGCTCAAATTTGAAATCCGGCCCCGGTGGGGCCCGAGTTGTAATTTGCAGAGGGAGCTTCGGGCGCGGCGCCGGTCTAAGTTCCTTGGAACAGGACGTCATAGAGGGTGAGAATCCCGTATGCGATCCACCCCGGGTGAAGCCCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGTGGTAAATTTCATCTAAAGCTAAATACCGGCCGGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGCACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCCGCCAGACCGGCGCTCACCCG-TGGCGGGGCACTCGCCCGCAGGCCAGCACGGGTTCGGGCGGCGGGAGAAAGGGCCCGGGAATGTAGCTCCCGGGGTGCCTTATAGCCCGGGCCGCCATGCCGCCCGCCCCGAGGACCGCGCTTCGGCTAGGGTGCTGGCGTAATGGCGGCAAGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTACGCGAGTGTTTGTCAAAGGCGCGGAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGAGTCCCGGGGCGCACCATCGACCGATCCAGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTACGAGCGTAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCG?TTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGCATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACCATCTAGTAGCTGGTTCCTGTCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGTAACGTTTTCAGTTTTATGAGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCCTTGGGGTTGAAACAACCTTAACCTATTCTCAAACTTTAAATATGTAAGAAGTCCTTGTTTCTTCGCTGAACGTGGACATTTGAATGCACCGTTACTAGTGGGCCATTTTTGGTAAGCAGAACTGGCGATGCGGGATGAACCGAACGCGAGGTTAAGGTGCCGGAATGTACGCTCATCAGACACCACAAAAGATGTCAATTCATCTGGACAGCCGGACGGTGGCCATGGAAGCCGGAACCCGCTAAGGAGTGCGTAACAGCTCACCGGCCGAATGAATTGGCTCTGAAAATGGATGGCGCTCAAGCGTGCTAC--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Lobaria_amplissima GCCTAACGGCTGAACCAGCAACTTGGAGGAATGAAAGCGAAAGCT{AT}ATTGCTTATGTAGTTACTACTTTGTAGTTTAAAATTCTAGATAGAATTATGATGATGACATTATCTATCTATTAGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAAAAGACAAGTGTTATTCATCTTTATTGGGTTTAAAGAGTACCAAGACGGTTAATAAAGCCCAATACATGAACACGGGGACACATTAACTAGAGTTATATGAAAGGAAGCACTAAAGTACTGTTGAGTGTAGAGATAAAATTCTATCATACCAGATAA-AGGCACAGATTTATGCGAAGGCATCTTCTTATGTAATAACTGACGTTGTAGGACGAAGGCTTTTAAGTGAAGAGGATTAGAGACCCTTGTAATCTAAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGGTTTAATA--GTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCAAGAGTAATTTGGCAACATTGGAACTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTAGATGATACACAAAAAACCTTACCACAATTTGAATTAAAGATATTTACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTCAGTTAATGTCGTGAGATTTTGGTTAGTTCCATAAAATTAACGTAAACCCTCGTTTATTTAAAATT-AATTGATTAAAAGGGGACAAGTCATC???????????????????????????????????????TTTGAAATCTGACCCCCCCGGGGCCTGAGTTGTAATTTGTAGAGGGTGCTTCGGGCGCGGCGCCGGTCTAAGTTTCTTGGAACAGAACGTCGCAGAGGGTGAGAATCCCGTACGTGACCAAGCCCGTGTGAAGCCCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCAAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCCAGAGACCGATAGCGGACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCGACCAGACCGGCGATCAGCCGTCAGCGGTGCACTCGCCTCCCGGCCAGCATCGGTTTGGGCGGCGGGATAAAAGTCCCGGGAATGTAGCTTCCGGGGAGTCTTATAGCCCGGGTCGCAATGCCGCCCGCCCCGAGGACCGCGCTTCGGCTAGGATGCTGGCGTAATGGTCGCAAGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTATGCGAGTGTTTGTCAAAGGCGCGGAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGAACCCGACGGCGCACCATCGACCGATCCTGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTATGAGCATAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCCGGATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATCTAGGCATAGGGGCGAAAGACCAATCGAACCATCTAGTAGCTGGTTCCTGTCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGTAACGTTTTCAGTTTTATGAGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCCTTGGGGCTGAAACAGCCTTAACCTATTCTCAAACTTTAAATATGTAAGAAGTCCTTGTTACTTAGTTGAACGTGGACATTTGAATGCACCGTTACTAGTGGGCCATTTTTGGTAAGCAGAACTGGCGATGCGGGATGAACCGAACGCGAGGTTAAGGTGCCGGAATGCACGCTCATCAGACACCACAAAAAGTGTCAATTCATCCAGACAGCCGGACGGTGGCCATGGAAGTCGGAATCCGCTAAGGAGTGTGTAACAACTCACCGGCCGAATGAATTGGCCTTGAAAATGGATGGCGCTCAAGCGTGCTACAAAAGCTGCTGGAAACAGTTTGCCACAACTGCGGCAAGATCTTGGTAGACGAAGTTAGTCATCCATCAT-GGGATGATGGATCTTTGGTTTGTAGAGCAATCCAGCATTTGCAGACGCTCTACGTTTTCGAGACCCAAAGCGGCGATTCGATGCAATATGGCGGCTATGCAAAGCCAAAATGGTATGCGATACAGCTGCTGCAACAGAAGATGAAAACATCGACAAGTCAAAGGAACCAAAGCATGATCACGGTGGCTGCGGGAACGTGCAGCCGGAGGTCCGTCGAGAGGGAATGAAATTAAACGGGACTTGGAAGCCTCAGAAAGGGGACGAGGAGAATGAAGGGCAACAGCCTGAGAAGAAGCCAATCACGCCCCAAATGGCGCTTAACATCTTCCGCCACATATCAGACGATGAAATTCGCAAAATGGGTCTAAGTTCTGATTACGCGCGTCCTGAATGGATGATCATTACAGTTCTCCCGGTCCCTCCACCCCCAGTCCGACCAAGCATTTCAGTAGATGGCGGCAATGGGATGCGAGGCGAAGATGATTTAACGTATAAACTGGGCGATATCATTCGTGCAAGCGGGAATGTGCGAACCTGCGAAGCCGAGGGGTCACCTGCACATGTT???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Lobaria_hallii ??????CGGCTGAA-CAGCAAC-TGGAGGAATGAAGGCAATAGCCGATTGCTAATGTAGTTACTACTTGGTAGTTTAAAATTCTAGGTAGAATTATGATGATGACATTATCTATCTATAAGTCTTGACCAAAATACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACAAGTGTTATTCATCTTTATTAGGTTTAAAGAGTACCAAGACGGTTAATAAAGCCCAATA-ATGAACAAGGGGACACATTAACTAGAGTTATATGAAAGGAAGCTCTAAGGTACTGTTGAGTGTAGAGATAAAATTCAGTCATACCAGATAAGCGGCACAGATTAATGCGAAGGCATCTTCTTATGTAATAACTGACGTTGTAGGACGAAGGCTTTGAAGTGAAGAGGATTAGATACCCTTGTAATTTAAGCAGAAAATGATGAGTGTCATAGGTTTAATAGAGTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCAAGAGTAATTTGGCAACATTGGAACTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAGACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTAGATGATACACAAAAAACCTTACCACAATTTGAATTAAAGATATTTACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTCAGTTAATGTCGTGAGATTTTGGTTAGTTCCATAAAATTAACGTAAACCCTCGTTTATTTAAAATTCAATGGATT-AAAGGGGACAGTCTC?????????????????????????????????????????TTTGAAATCTGACTCCGCGGGAGCCCGAGTTGTAATTTGGAGAGGGCGCTTCGGGCGCGGCGCCGGTCTAAGTTCCTTGGAACAGGACGTCGCAGAGGGTGAGAATCCCGTACGCGACCAAGCCCATGTGAAGCCCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCCAAACGGGTGGTAAATTTCATCTAAAGCTAAATATTGGCCAGAGACCGATAGCGGACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTCAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCAATCAGACCGGCGATCAGCCGTCCGCGGTGCACGCGCCCCCCGGCCAGCATCGGTTTGGGCGGCGGGACAAAAGGCTCGGGAACGTAGCTTCTGGGGAGTCTTATAGCCCGGGTCGCAATGCCGCCCGCCCCGAGGACCGCGCTTCGGCTAGGATGCTGGCGTAATGGTTGCAAGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTATGCGAGTGTGTGTCAAAGGCGCGGAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGAACCCGACGGCGCACCATCGACCGATCCAGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTATGAGCATAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCCGGATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATCTAGGCATAGGGGCGAAAGACCAATCGAACCATCTAGTAGCTGGTTCCTGTCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGTAACGTGTTCAGTTTTATGAGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCCTTGGGGCTGCAACAGCCTTAACCTATTCTCAAACTTTAAATATGTAAGAAGTCCTTGTTGCTTAGTTGAACGTGGACATTTGAATGCACCGTTACTAGTGGGCCATTTTTGGTAAGCAGAACTGGCGATGCGGGATGAACCGAACGCGAGGTTAAGGTGCCGGAATGCACGCTCATCAGACACCACAAAAAGTGTCAATTCATCCAGACAGCCGGACGGTGGCCATGGAAGTCGGAATCCGCTAAGGAGTGTGTAACAACTCACCGGCCGAATGAATTGGCCTTGAAAATGGATGGCGCTCAAGCGTGCTAC???????GCTGGAAACAGTTTGCCATAACTGTGGCAAGATCTTGGTAGACGAAGTTAGTCATCCCTCAT-GGGATGATGGATCTTTAGCTTTTAGAGTAATTCAGCATTTGCAGACGCTCTACGTTATCGAGACCCAAAGCGGCGATTCGATGCGATATGGCGACTATGCAAAACTAAGATGGTTTGCGAAACGGCTGTTGCAACAGAAGATGATAACATGGATAAGTCAAAGGAACCAAAGCATGATCACGGGGGCTGTGGGAACGTTCAGCCCGAGGTCCGTCGAGAGGGAATGAAACTAAACGGGACTTGGAAGCCTCAAAAAGGGGACGAGGAGAATGAAGGGCAACAGCCTGAGAAGAAGCCAATAACGCCTCAAATGGCACTTAATATCTTCCGCCACATATCGGACGACGACATTCGAAGAATGGGTCTAAGTATTGCATATGCACGCCCTGAATGGATGATCATTACAGTCCTCCCTGTCCCTCCACCTCCAGTCCGGCCGAGCATTTCAGTAGATGGCGGCAACGGGATGCGAGGCGAAGACGATTTAACGTATAAACTTGGCGATATCATTCGTGCAAGCGGGAATGTGCGAACCTGCGAAGCAGAGGGCTCACCTGCGCAT??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Lobaria_immixta 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Lobaria_linita 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Lobaria_macaronesica 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Lobaria_meridionalis 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Lobaria_oregana 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Lobaria_orientalis 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Lobaria_pseudoglaberrima 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Lobaria_pseudopulmonaria 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Lobaria_pulmonaria 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Lobaria_quercizans 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Lobaria_retigera 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Lobaria_sachalinensis 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Lobaria_scrobiculata 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Lobaria_virens 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Lobariella_pallida 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Massalongia_carnosa 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Pannaria_conoplea 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Pannaria_rubiginella 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Peltigera_horizontalis 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Peltigera_hydrothyria 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Peltigera_kristinssonii 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Peltigera_lambinonii 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Peltigera_neckeri 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Physma_byrsaeum 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Physma_pseudoisidiatum 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Physma_radians 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Placynthium_flabellosum 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Placynthium_nigrum GCCTAACGGCTGAACCAGCAACTTGGAGGAAAGATAGCGAAAGCTAATTGT----ACAAGCTCGATTTACTCGGATAAAATTCTAGATAGGATTATGATAATGACATTACCTATCTATAGGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAAAAGACTAGTGTTATTCATCTTAAATAGGTTTAAAGCGTACCTAGACGGTTAATCAAGCCTA-----------TGGGACTAATTAAACTAGAGTTTTATGTAAGGGTGCATTAAGGTACTGTTGAGTGTAGAGATGAAATTCTGTCATACCAGATTATTGGCACGGGTTTAGGCGAAAGCATCACCTTATGTAATAACTGACGTTGACGGACGAAGGCTTTATCGCTAACAGGATTAGATACCCCAGTAGTCTAAGCAGAAAATGATGAGTGTCATAGGTTGAAGATAGTCTATAAATGAAAGTGTAAGCACTCCACCTCAAGAGTAATTTGGCAACATTGGAACTGAAATCATTAGACCGTGTTTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTAGATGCCACGCAAAAAACCTTACCACAATTTGAATGGAAAA----CACAAGCGCTGCACGGCTGTTTTTAGTTAATGTCGTGAGACTTTGGTTCGTTCCATTAAATTAACGTAAACCCTTATTTATTTTAAGTTCGCTAGATTAACAGGGGACAAGTCATC????????????????????????????AACAGCTCAAATTTGAAATCCGGCCCTTCCGGGGCTCGAGTTGTAATTTGGAGAGGGCGTTTCGGGTGCGGGTCCGGTTTAAGTTCCTTGGAACAGGACGTCATAGAGGGTGAGAATCCCGTCTGGAACCCAGCCCATGTGAAACCCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCCAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATACCGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGAAAAGAGAGTCAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCCACCAGACCGGCGATCAGCCG-TGGCGGTGCACTCGCCCGGAGGCCAGCATCGGTTCGCGCGGCGGGACAAAGGGCCGGGGAACGTAGCTTCCGGGGAGTCTTACAGCCCCGGCCGGCATGCCGCCCGCGCCGAGGACCGCGCTCCGGCTAGGATGCTGGCGTAATGGTTGCAAGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATTTATGCGAGTGTTTGTCAAACGCGCGGAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGAACCCCGGGGTGCACCATCGACCGATCCAGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTACGAGCATAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGTATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACCATCTAGTAGCTGGTTCCTGCCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGTAACGTTTTCAGTTTTATGAGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCCTTGGGGTTGCAACAACCTTAACCTATTCTCAAACTTTAAATATGTAAGAAGTCCTTGTTGCTTCGCTGAACGTGGACAATTGAATGCACCGTTACTAGTGGGCCATTTTTGGTAAGCAGAACTGGCGATGCGGGATGAACCGAACGCGAGGTTAAGGTGCCGGAATGCACGCTCATCAGACACCACAAAAGATGTCCATTCATCCAGACAGCCGGACGGTGGCCATGGAAGCCGGAACCCGCTAAGGAGTGCGTAACAGCTCACCGGCCGAATGAATGGGCTCTGAAAATGGATGGCGCTCAAGCGTGCTACAGAAACTTTTAGAGACAGTATGCCACAATTGTGGCAAAATACTAGCCGATGAAGTCAGTTATCTCCGCT-TGTGTAACATGACTTTAAACTTTAGAGCAATCCAGCATTTGCTGATGCTCTCCGTTACCGAGACCCAAAAAGGCGTTTTGACGCGATTTGGCGTATATGTAAACCAAAGATGGTTTGCGAAACTGCCAATACAGCCGAAAATGATAATATGGAAAAAACGAAAGAACCTAAGCATGATCATGGTGGCTGTGGAAACGTACAGCCAGAGGTTCGTCGAGAAGGTCTTAGGCTGAACGGTACATGGAAAGCTCAAAAGGGTGATGAGGAGAATGAGGGTCAACAGCCCGAGAAGAAGCCAATCACGCCTCAAATGGCTCTTAATATATTCCGACATATTTCAACGGACGAAATAAAGAAAATGGGTCTAAGCACTGATTATGCTCGTCCAGAATGGATGATCATCACTGTCCTTCCAGTACCGCCGCCTCCAGTCCGACCAAGTATATCTGTAGATGGAGGAAATGGGATGCGGGGCGAGGACGATCTTACTTACAAGCTAGGCGACATCAT??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Polychidium_muscicola ???????????????CAGCAACTTGGAGGAATGAAGGCAATAGCTTAATGCTAGTGTAGTATCGACCCTGTCGAATAAAATTCTAGGTAGAGTTATGATAATGACATTATCTATCTATGTGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAAAAGACTAGTGTTATTCATGATTAATAGGTTTAAAGAGTACCTAGACGGTTAATGAAGCCC-------CTAAA-GGGTACATATTAACTAGAGTTATATGAAAGGGAGCTTTGAGGTACTGTTGAGTGTAGAGATGAAATTCGTTGATACCAGATGATTGGCACGGATCTATGCGAAGGCATCTCCTTATGTAATAACTGACGTTGAAGGACGAAGGCTTTGAAGTGAAGAGGATTAGATACCCTAGTAATCTAAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGGTTGAATAATGTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCAAGAGTAATTTGGCAACATTGGAACTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTAGACAGTCCGCAAAAAACCTTACCACAATTTGAATAATTAATATTTACAAGCGTTGCACGGCTGTCTTCAGTTAATGTCGTGAGATTTTGGTTAGTTCCATTAAATTAACGTAAACCCTTATTTATTTTAAGTTCACTATATTAAGAGGGGACAGTC????TTGCCTCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAACAGCTCAAATTTGAAATCTGACCCCTTCGGGGCCCGAGTTGTAATTTGTAGAGGGTGTTTCGGGCGCGATGCCGGTCTAAGTTCCTTGGAACAGGACGTCACAGAGGGTGAGAATCCCGTATGTGACCAAGCCCATGTGAAACCCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCAAAATGGGTGGTAAATTTCATCTAAAGCTAAATACTGGCCAGAGACCGATAGCGAACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCGATCAGACTGGCGATCAGCCGTTAGCGGTGCACTCGCCCGCAGGCCAGCATCGGTTTGGGCGGTGGGATAAATGACCCGGGAATGTGGCTTCTGGGGAGTGTTATAGCCCGGGTCGCAATGCCGCCAGCCCCGAGGACCGCGCTTCGGCTAGGATGCTGGCGTAATGGTCGCAAGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTATGCGAGTGTTTGTTAAAGGCGCGGAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGAACCCGACGGCGCACCATCGACCGATCCAGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTACGAGCATAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGGATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCGAATCTGGGTATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACCATCTGA???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ACTTGAGACAGTTTGTCACAACTGTGGCAAGATTCTTGTAGATGAAGTTAGTCATCCCT-AT-GGGATGATTGATCTTTTGATTCCAGAGCAATCCAGCATTTGCGGACGCTCTACGGTATCGAGACCCTAAACGGCGATTTGATGCGATATGGCGGCTTTGCAAACCAAAAATGATCTGCGAAACTTTGGAAGGAACAGAAGATGATAGCATGGACAAGCTGAAAGAACAAAAACATGATCACGGCGGCTGTGGGAACATTCAGCCCGAGGTTCGACGGGAAGGGCTGAGGCTAAACGGCACCTGGAAGGCTCAGAAAGGGGATGAAGAGAACGAGGGTCAACAGCCGGAGAAAAAGCCAATAACGCCGGGAATGGCTCTTAATATCTTCCGGCATATCTCCACAGAAGAAATTTCGAAAATGGGTCTAAGCAACGATTACGCCCGTCCGGAGTGGATGATCATCACAGTTCTTCCTGTGCCACCTCCTCCAGTCCGGCCGAGCATCTCAGTAGACGGAGGTAACGGGATGCGGGGTGAGGACGATCTAACTTACAAACTCGGCGACATCATTCGAGCAAATGGCAATGTTCGAAAATGTGAGATAGAAGGCTCACCAGCACATGTC???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Protopannaria_pezizoides 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Pseudocyphella_rainierensis 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Pseudocyphellaria_anomala 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Pseudocyphellaria_aurata 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Pseudocyphellaria_cf_intricata 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Pseudocyphellaria_coriifolia 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Pseudocyphellaria_divulsa GCCTAACGGCTGAACCAGCAACTTGGAGGAATGAGGGCAATAGCTGACTGCTAATGTAGTTACTACTTGGTAGTTTAAATTTCTAGGTAGAATTATGATGATGACATTATCTATCTATAAGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATCTTTATTAGGTTTAAAGAGTACCAAGACGGTTAATAAAGCCCAATACATGAACACGGGGACACATTGACTAGAGTTATATGAAAGGAAGCTCTAAGGTACTGTTGAGTGTAGAGATGAAATTCTTTGATACCAGATGAGTGGCACAGATTTATGCGAAGGCATCTTCTTATGTAATAACTGACGTTGTAGGACGAAGGCTTTGAAGTGAACAGGATTAGATACCC-AGTAATCTAAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGGTTAATTTAGGTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCAAGAGTAATTTGGCAACATTGGAACTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTAGATGACCCACAAAAAACCTTACCACAATTTGAATTAAAGATATTTACAAGCGCTGCACGGCTGTCTACAGTTAATGTCGTGAGACTTTGGTTAGTTCCATAAAATTAACGTAAGCCCTCATTTTTTTAAAGTTCGCTATATGAACAGGGGACAAGTCATCTTGCCTCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAACAGCTCAAATTTGAAATCTGACCCCTTCGGGGCCCGAGTTGTAATTTGTAGAGGGTGTTTCGGGCGCGGCGCCGGTTTAAGTTCCTTGGAACAGGACGTCATAGAGGGTGAGAATCCCGTATGTGACTAAGCCCATGTGAAGCCCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCAAAATGGGTGGTAAATTTCATCTAAAGCTAAATATTGGCCAGAGACCGATAGCGGACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTCAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCGATCAGACCGGTGATCAACCGTCAGCGGTGCACTCGCCCTCCGGCCAGCATCGGTTTGGGCGGTGGGATAAAAGTTCCGGGAATGTAGCTTCCGGGGAGTCTTATAGCCTGGTTCGTCATGCTGCCCGCCCCGAGGACCGCGCTTCGGCTAGGATGCTGGCGTAATGGTCGCAAGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTATGCGAGTGTTTGTCAAAGGCGCGGAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGAACCCTCGGGCGCACCATCGACCGATCCAGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTACGAGCATAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCCGGATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATCTAGGCATAGGGGCGAAAGACCAATCGAACC??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Pseudocyphellaria_endochrysea GCCTAACGGCTGAACCAGCAACTTGGAGGAATGAGAGCAATAGCTGATTGCTAATGCAGTTACTACTTGGTAGTTTAAATTTCTGGGTAGAGTTATGATGATGACATTCTCTA--TAGAGGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACAAGTGTTATTCATCTTTATTGGGTTTAAAGCGTACCAAGACGGTTAATAATGCCTAATAAATTAAAAAGGGGACACATTAACTAGAGTTATATGAAAAGAAGCACGAAGGTACTGTTGAGTGTAGAGATGAAATTCTTTGATACCAGATGATTGGCACAGATTTATGCGAAGGCATCTTCTTATGTAATAACTGACGTTGTAGGACGAAGGCTTTGAAGTGA{AC}CAGGATTAGCT?CCCTATTAATCTAAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGGTTGAA{GT}ACAGTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCAAGAGTAATTTGGCAACATTGGAACTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTAGATGATCCACAAAAAACCTTACCACAATTTGAATTAAAGATATTTACAAGCGCTGCACGGCTGTCTACAGTTAATGTCGTGAGATTTTGGTTAGTTCCATAAAATTAACGTAAACCCTTATTTATTTAAAGTA???????????????????????????TTGCCTCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCATCAGCTCAAATTTGAAATCCGACCCCGTTGGGGCCTGAGTTGTAATTTGCAGAGGGTGTTTCGGGCGCGGCGCCGGTCTAAGTTCCTTGGAACAGGACGTCATAGAGGGTGAGAATCCCGTCTGCGACCAAGCCCGTGTGAAACCCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCCAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATACGGGCCAGAGACCGATAGCGAACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTCAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCCATCAGACCGGCGATCAGCCGTCCGCGGCGCACGCGCCCTCCGGCCAGCATCGGTTTGGGCGGCGGGAGAACAGTCCCGGGAACGTACCTCCCGGGGAGTCTTATAGCCCGGGGCGGCATGCCGCCCGCTCCGAGGACCGCGCTTCGGCTAGGATGCTGGCGTAATGGCGGCAAGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCGATGCGAGTGTTTGTCAAAGGCGCGGAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGAACCCGACGGCGCACCATCGACCGATCCGGAAGTCTTCGGATGGATTTGAGTACGAGCATCGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCCGGATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATCTAGGCATAGGGGCGAAAGACCAATCGAACCATCTAG????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Pseudocyphellaria_freycinetii GCCTAACGGCTGAACCAGCAACTTGGAGGAATGAAGGCAATAGCCGACTGCCAATGTAGTTACTACTTGGTAGTTTAAATTTCTAGGTAGAATTATGATGATGACATTATCTATCTATATGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACGAGTGTTATTCATCTTTATTAGGTTTAAAGGGTACCAAGACGGTTAATAAAGCCCAATACATGAACACGGGGACTCATTGACTAGAGTTATATGAAAGGAAGCTCTAAGGTACTGTTGAGTGTAGAGATGAAATTCTTTGATACCAGATGAGTGGCACAGATTTATGCGAAGGCATCTTCTTATGTAATAACTGACGTTGTAGGACGAAGGCTTTGAAGTGAACAGGATTAGATACCCCAGTAATCTAAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGGTTAATT---GTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCAAGAGTAATTTGGCAACATTGGAACTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTAGATGATCCACAAAAAACCTTACCACAATTTGAATTAAAGATATATACAAGCGCTGCACGGCTGTTTACAGTTAA???CGTGAGGCTTTGGTTAGTTCCATAAAATTAACGTGATCCCTCATTTATTT?AAGTT???????????????????????????TTGCCTCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAACAGCTCAAATTTGAAATCTGACCCCTTGGGGGCCCGAGTTGTAATTTGTAGAGGGTGTTTCGGGCGCGGCGCCGGTCTAAGTTCCTTGGAACAGGACGTCACAGAGGGTGAGAATCCCGTATGCGACTAAGCCCATGTGAAGCCCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCAAAATGGGTGGTAAATTTCATCTAAAGCTAAATATTGGCCAGAGACCGATAGCGGACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTCAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCAATCAGACCGGTGATCAGCCGTCCGCGGTGCACTCGTCCCCCGGCCAGCATCGGTTTGGGCGGTGGGATAAAAGGCCCGGGAATGTAGCTTCTGGGGAGTCTTATAGCCCGGGTCGTCATGCTGCCCGCCCCGAGGACCGCGCTTCGGCTAGGATGCTGGCGTAATGGTTGCAAGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTATGCGAGTGTTTGTCAAAGGCGCGGAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGAACCCTCGGGCGCACCATCGACCGATCCAGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTACGAGCATAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCCGGATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATCTAGGCATAGGGGCGAAAGACCAATCGAACCATCTAG????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Pseudocyphellaria_hirsuta GCCTAACGGCTGAACCAGCAACTTGGAGGAATGAAAGCAATTGCTGATTGCTAATGTAATTACTACTAAGTAGTTTAAATTTCTAGATAGAATTATGATGATGACATTATCTATCTATATGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATCTTTATTAGGTTTAAAGAGTACCAAGACGGTTAATAAAGCCCAATACATGAGCACGGGGACACATTGACTAGAGTTATATGAAAGGAAGCTCTTAGGTACTGTTGAGTGGAGAGTTGAAATTCTTTCATACCAGATGAGTGGCACAGATTTATGCGAAGGCATCTTCTTATGTAATAACTGACGTTGTAGGACGAAGGCTTTGAAGTGAACGGGATTAGTTACCCCAGTAATCTAAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGGTTAAAT---GTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCAAGAGTAATTTGGCAACATTGAAACTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTAGATGATACACAAAAAACCTTACCA-CATT--GATTAAAGATATATACAAGCGCTGCACGGCTGTCTTCAGTTAATGTCGTGAGACTGTGGTTAGTTCCATTAAATTAACGTAAACCCTCATTTATTTAAAGTTC??????????????????????????TTGCCTCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAACAGCTCAAATTTGAAATCTGACCCCCCCGGGGCCCGAGTTGTAATTTGCAGAGGGTGCTTCGGGCGCGGCGCCGGTCTAAGTTCCTTGGAACAGGACGTCGTAGAGGGTGAGAATCCCGTATGCGACCAAGCCCGTGTGAAGCCCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCAAAACGGGTGGTAAATTTCATCTAAGGCTAAATACCGGCCAGAGACCGATAGCGGACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTCAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCGATCAGACCGGCGATCAGCCGTCCGCGGTGCACTCGCCCTCCGGCCAGCATCGGTCTGGGCGGCGGGAGAAAAGTCCCGGGAACGTAGCTCCTGGGGAGTCTTATAGCCCGGGTCGCCATGCCGCCCGCCCCGAGGACCGCGCTTCGGCTAGGATGCTGGCGTAATGGTCGCAAGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTATGCGAGTGTTTGTCAAAGGCGCGGAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGAACCCGACGGCGCACCATCGACCGATCCAAATGTCTTCGGATGGATTTTAGTACGAGCATAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCCGGATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATCTAGGCATAGGGGCGAAAGACCAATCGAACCATCTAG????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Pseudocyphellaria_intricata GCCTAACGGCTGAACCAGCAACTTGGAGGAAAGAAAGCAATTGCTGATTACTGGTGTAATTACTACTTAGTAGTTTAAATTTCGAGGTAGAATA-TGATGATGACATTTTCTATTTTTATGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACGAGTGTTATTCATCTTTATTAGGTTTAAAGGGTACCAAGACGGTTAATAAAGCCCAATATATTAAAACGGGGACATATTGACTAGAGTTATATGAAAGGAAGCTCTAAGGTACTGTTGAGTGTAGAGATGAAATTCTGTCATACCAGATGAGTGGCACAGATTTATGCGAAGGCATCTTCTTATGTAATAACTGACGTTGTAGGACGAAGGCTTTGAAGTGAACAGGATTAGATACCCCAGTAATCTTAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGGTTAATT---GTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCAAGAGTAATTTGGCAACATTGGAACTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTATTTAATTAGATGATCCACAAAAAACCTTACCACAATTTGAAGTGAAGATATTTACAAGCGTTGCACGGCTGTCTACAGTTAATGTCGTGAGATTTTGGTTAGTTCCATAAAATTAACGTAATCCCTCATTTATTTAAAGTTCGCTATATTAATAGGG???????????TTGCCTCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAACAGCTCAAATTTGAAATCTGACCCCCTCGGGGCCCGAGTTGTAATTTGTAGAGGGTGTTTCGGGCGCGGCGCCGGTCCAAGTTCCTTGGAACAGGACGTCACAGAGGGTGAGAATCCCGTACGTGACCAAGCCCATGTGAAGCCCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCCAAATGGGTGGTAAATTTCATCTAAAGCTAAATATTGGCCAGAGACCGATAGCGGACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTCAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCAATCAGACCGGCGATCAGCCGTCAGCGGTGCACGCGCCCTCCGGCCAGCATCGGTTTGGGCGGCGGGAAAAAAGGCCCGGGAATGTAGCTTCCGGGGAGTCTTATAGCCCGGGTCGGCATGCCGCCCGCCCCGAGGACCGCGCTTCGGCTAGGATGCTGGCGTAATGGTTGCAAGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTATGCGAGTGTTTGTCAAAGGCGCGGAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGAACCCGACGGCGCACCATCGACCGATCCAGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTACGAGCATAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCCGGATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAA???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Pseudocyphellaria_lechleri GCCTAACGGCTGAACCAGCAACTTGGAGGAAAGAAAGCAATTGCTGATTACGAATGTAATTACTACTTAGTAGTTTAAATTTCGAGGTAGAATC-TGATGATGACATTTTCTATCTTTATGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACGAGTGTTATTCATCTTTATTAGGTTTAAAGGGTACCAAGACGGTTAATAAAGCCCAATATATTAAAACGGGGACACATTGACTAGAGTTATATGAAAGGAAGCTCGAAGGTACTGTTGAGTGTAGAGATGAAATTCTGTCATACCAGATGAGTGGCACAGATTTAGGCGAAGGCATCTTCTTATGTAATAACTGACGTTGTAGGACGAAGGCTTTGAAGTGAACAGGATTAGATACCCCAGTAATCTTAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGGTTAATCAAAGTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCAAGAGTAATTTGGCAACATTGGAACTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTAGATGATCCACAAAGAACCTTACCACAATTTGAAGTGAAGATATTTACAAGCGTTGCACGGCTGT{CT}TACAGTTAATGTCGTGAGATTTTGGTTAGTTCCATAAAATTAACGTAAACCCTCATTTATTTAAAGTT???????????????????????????TTGCCTCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAACAGCTCAAATTTGAAATCTGACCCCCTCGGGGCCCGAGTTGTAATTTGTAGAGGGTGTTTCGGGCGCGGCGCCGGTCTAAGTTCCTTGGAACAGGACGTCACAGAGGGTGAGAATCCCGTATGTGACCAAGCCCATGTGAAGCCCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCAAAATGGGTGGTAAATTTCATCTAAAGCTAAATATTGGCCAGAGACCGATAGCGGACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTCAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCAATCAGACCGGCGATCAGCCGTCAGCGGTGCACTCGCCCTCCGGCCAGCATCGGTTTGGGCGGCGGGAGAAAAGTCCCGGGAATGTAGCTTCCGGGGAGTCTTATAGCCCGGGTCGGCATGCCGCCCGCCCCGAGGACCGCGCTTCGGCTAGGATGCTGGCATAATGGTTGCAAGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTATGCGAGTGTTTGTCAAAGGCGCGGAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGAACCCGACGGCGCACCATCGACCGATCCAGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTACGAGCATAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCCGGATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATCTAGGCATAGGGGCGAAAGACCAATCGAACCATCTAG????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Pseudocyphellaria_mallota GCCTAACGGCTGAACCAGCAACTTGGAGGAATGAAAGCAATTGCTGATTGCTAATGTAATTACTACTTAGTAGTTTAAATTTCTAGATAGAATTATGATGATGACATTATCTATCTATATGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATCTTTATTAGGTTTAAAGAGTACCAAGACGGTTAATAAAGCCCAATACATGAGCACGGGGACACATTGACTAGAGTTATATGAAAGGAAGCTCTAAGGTACTGTTGAGTGGAGAGTTGAAATTCTTTCATACCAGATGAGTGGCACAGATTTATGCGAAGGCATCTTCTTATGTAATAACTGACGTTGTAGGACGAAGGCTTTGAAGTGAACGGGATTAGTTACCCCAGTAATCTAAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGGTTAAATAGCGTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCAAGAGTAATTTGGCAACATTGAAACTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTAGATGATACACAAAAAACCTTACCA-CATT--GATTAAAGATATATACAAGCGCTGCACGGCTGTCTTCAGTTAATGTCGTGAGACTGTGGTTAGTTCCATTAAATTAACGTAAACCCTCATTTATTTAAAGTACAAAATACAAATAGGG???????????TTGCCTCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAGCAGCTCAAATTTGAAATCTGACCCCCCCGGGGCCCGAGTTGTAATTTGCAGAGGGTGCTTCGGGCGCGGCGCCGGTCTAAGTTCCTTGGAACAGGACGTCGTAGAGGGTGAGAATCCCGTATGCGACCAAGCCCATGTGAAGTCCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCAAAACGGGTGGTAAATTTCATCTAAAGCTAAATACCGGCCAGAGACCGATAGCGGACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTCAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCGATCAGACCGGCGATCAGCCGCCCGCGGTGCACTCGCCCCCCGGCCAGCATCGGTCTGGGCGGCGGGAGAAAAGTCCCGGGAACGTAGCTTCCGGGGAGTCTTATAGCCCGGGTCGCCATGCCGCCCGCCCCGAGGACCGCGCTTCGGCTAGGATGCTGGCGTAATGGTCGCAAGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTATGCGAGTGTTTGTCAAAGGCGCGGAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGAACCCGACGGCGCACCATCGACCGATCCAGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTACGAGCATAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCCGGATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATCTAGGCATAGGGGCGAAAGACCAATCGAACCATCTAG????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Pseudocyphellaria_obvoluta GCCTAACGGCTGAACCAGCAACTTGGAGGAATGAAAGCAATTGCTGATTGCTAATGTAATTACTACTAAGTAGTTTAAATTTCTAGGTAGAATTATGATGATGACATTATCTATCTATATGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATCTTTATTAGGTTTAAAGAGTACCAAGACGGTTAATAAAGCCCAATACATGAGCACGGGGACACATTGACTAGAGTTATATGAAAGGAAGCTCTAAGGTACTGTTGAGTGGAGAGTTGAAATTCTTTCATACCAGATGAGTGGCACAGATTTATGCGAAGGCATCTTCTTATGTAATAACTGACGTTGTAGGACGAAGGCTTTGAAGTGAACGGGATTAGTTACCCCAGTAATCTAAGCAGAAAATGATGAATGTCATAGGTTAAAT---GTCTATAAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCAAGAGTAATTTGGCAACATTGAAACTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTAGATGATACACAAAAAACCTTACCACCATT--GATTAAAGATATATACAAGCGCTGCACGGCTGTCTTCAGTTAATGTCGTGAGACTGTGGTTAGTTCCATAAAATTAACGTAAACCCTCATTTATTTAGAGTTCGAAATATA??????????????????TTGCCTCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAACAGCTCAAATTTGAAATCTGACCCCCCCGGGGCCCGAGTTGTAATTTGCAGAGGGTGCTTCGGGCGCGGCGCCGGTCTAAGTTCCTTGGAACAGGACGTCGTAGAGGGTGAGAATCCCGTATGCGACCAAGCCCAGGTGAAGTCCTTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCAAAACGGGTGGTAAATTTCATCTAAAGCTAAATACCGGCCAGAGACCGATAGCGGACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGAAAAGAGAGTCAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCGATCAGACCGGCGATCAGCCGTCCGCGGTGCACTCGCCCTCCGGCCAGCATCGGTCTGGGCGGCGGGAGAAAAGTCCCGGGAACGTAGCTTCCGGGGAGTCTTATAGCCCGGGTCGCCATGCCGCCCGCCCCGAGGACCGCGCTTCGGCTAGGATGCTGGCGTAATGGTCGCAAGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTATGCGAGTGTTTGTCAAAGGCGCGGAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGAACCCGACGGCGCACCATCGACCGATCCAGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTACGAGCATAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCCGGATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATCTAGGCATAGGGGCGAAAGACCAATCGAACCATCTAG????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Pseudocyphellaria_perpetua 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Pseudocyphellaria_pilosella 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Pseudocyphellaria_sp_5295 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Psoroma_hypnorum 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Ramalodium_succulentum ??????CGGCTGAACCAGCAACTTGGAAGAAGGATAGCAATAGCTAGCTGTTTTTACAACATCGATTTTTTCGACTAAAATTCTAGGTAGATTTTTTATAATGACATTATCTATCTATGTGTCTTGACCAAAATACGTGCCAGCAGTCGCGGTAAGACGTAGAAGACTAGCGTCATTCATCTTTAATAGGTTTAAAGCGTACCTAGACGGTAAATATAGCCT-------AAAAA-AGGTACTTTTTTACTAGAGTTATATGTAAGAGTGTATTAAAGTACTGTTGAGTTTAGAGATAAAATTCTTTTACACCAGATAATTGGCACAGGTATTGGCGAAAGCATCACTTTATGTAATAACTGACGTTGACAGACGAAGGCTATGTCGCGAACAGGATTAGATACCCTAGTAGTCTTAGCAGAAAATTATGAATGTCACAGGTTAGAT---GCCTATAAATGAAAATGTAAGCATTCCACCTCAAGAGTAATTTGGCAACATTGGAACTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAATCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATAATCCGCAAAAAACCTTACCACATTTTGAA-----TTTTTTTACAAGTGTTGCACGGCTGTCTTCAGTTAATGTCGTGAGATTATGGTTTACTCCATATAATTAACGTAAACCCTTGTCTTTTTTGAGTTCGGTATATTTAAAGGGGACAAGTCATC????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GTG-TTCGGGGGCGATGCGG--TCTAAGTCCTTGGAACAGGGCGTCATAGAGGGTGAGAATCCCGTCTGCGATT-ACCCCGGGAGAAGCCCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCCAAATGGGTGGTAAATTTCATCTAAAGCTAAATACCGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTAAAAGGGAAGCGCTTGCGACCAGACCGGTGATCATCCG-TAGCGGTGCACTCGCCCGGAGGCCAGTATCGGTTCAGACGGCGGGACAAAGGGCCCGGGAATGTAGCTTCCGGGGAGTCTTATAGCCCGAGCTGCCATGCCGCCGC--CCGAGGA-CGCGCTTCGGCGAGATTGCTGGCGTAATGGTCGCAAGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTACCATCCATGCGAGTGTTTGTCAAAGGCGCGGAATGAAAGTAAACGGAGTGAGAACCCCGCGGGCGCATCATCGACCGATCCAGATGTTTTCGGATGGATTTGAGTATGAGCATGGCTGGTGG-ACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCGAATTTGGGTATAGGGGCGAAA???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AAAAATTGCTGGAGACAGTCTGTCATAATTGTGGCAAGATACTGGTTGATGAAGTTAGTCATCCTTCGA-GGGATGATCTATTTTTTA-TTTTAGAGCAATCCGGCATTTGCTGACGCTCTCCGTTATCGGGATCCAAAGCGACGGTTTGATGCAATTTGGCGGCTTTGTAAGCCCAAAATGATCTGTGAAACGGCAGCTGCCACAGACGATGATAATATAGAAAAGTCGAAAGAATCCAAACATGATCATGGTGGTTGTGGCAATATTCAGCCCGAGGTTCGTCGAGAGGGCCTTAGGCTGAACGGTACTTGGAAAGCACAAAAGGGAGATGAAGAAAATGAAGGGCAGCAACCAGAGAAAAAGCCGATAACGCCGCAAATGGCGCTTAATATTTTTCGTCATATAAGCAACGACGAGATAAAGAAGATGGGATTGAGTAATGACTATGCCCGCCCCGAGTGGATGATCATTACCGTTCTTCCTGTTCCGCCACCTCCTGTCCGACCAAGTATCTCCGTAGACGGGGGAAATGGGATGCGTGGAGAGGATGACCTAACTTACAAGCTTGGAGACATCAT??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Solorina_crocea 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Solorina_saccata_4823 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Staurolemma_omphalarioides 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Staurolemma_sp 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Staurolemma_weberi 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; END; BEGIN TREES; TITLE Sticta_MrBayes; LINK TAXA = Taxa2; TRANSLATE 1 Pseudocyphellaria_citrina_LG688, 2 Sticta_stipitata_LG1253, 3 Sticta_ainoae_UCONN4149, 4 Sticta_hypochra_2, 5 Sticta_sp_LG1017, 6 Sticta_hypochra_1, 7 Sticta_gaudichaldia, 8 Sticta_caulescens, 9 Sticta_plumbea_LG1031, 10 Sticta_macrophylla_LG3452, 11 Sticta_macrophylla_LG946, 12 Sticta_macrophylla_LG3445, 13 Sticta_sp_LG4064, 14 Sticta_sp_LG4074, 15 Sticta_sp_LG4082, 16 Sticta_sp_LG4111, 17 Sticta_sp_LG4110, 18 Sticta_sp_LG4083, 19 Sticta_sp_LG4112, 20 Sticta_sp_LG4109, 21 Sticta_sp_LG4117, 22 Sticta_sp_UCONN4123, 23 Sticta_sp_UCONN4115, 24 Sticta_sp_UCONN4070, 25 Sticta_sp_UCONN4111, 26 Sticta_sp_LG4084, 27 Sticta_sp_UCONN4120, 28 Sticta_sp_UCONN4094, 29 Sticta_sp_LG4063, 30 Sticta_sp_UCONN4137, 31 Sticta_caperata_LG624, 32 Sticta_caperata_LG962, 33 Sticta_caperata_LG4069, 34 Sticta_sp_LG801, 35 Sticta_sp_UCONN4018, 36 Sticta_sp_LG4099, 37 Sticta_sp_UCONN4102, 38 Sticta_sp_UCONN4096, 39 Sticta_sp_UCONN4038, 40 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Sticta_canariensis_LG1333, 84 Sticta_duplolimbata_LG1040, 85 Sticta_ambavillaria_LG992, 86 Sticta_umbilicariaeformis_LG925, 87 Sticta_duplolimbata_LG919, 88 Sticta_atlantica_LG3858, 89 Sticta_sublimbata_LG1038, 90 Sticta_canariensis_LG3741, 91 Sticta_sublimbata_LG885, 92 Sticta_beauvoisii_LG3303, 93 Sticta_carolinensis_LG3302, 94 Sticta_fuliginosa_LG795, 95 Sticta_sylvatica_LG3536, 96 Sticta_limbata_LG2230, 97 Sticta_filix_2; TREE 'Fig. 2 (not shown)' = [&R] (1:0.06278844,(((((5:0.00784537,(9:0.002733565,(10:5.025067E-4,11:4.592866E-4,12:4.95782E-4):0.001459118):0.002302687):0.005500904,((31:4.944744E-4,32:1.949138E-4,33:3.092754E-4):0.003317217,(34:7.182905E-4,(35:0.001100202,36:2.081411E-4):9.142009E-4):0.001284599):0.003162951):0.001017923,(((37:3.133663E-4,(38:5.039282E-4,39:5.356598E-4):0.002278083):0.002184623,((((40:0.001128963,41:2.947191E-4,((42:5.179104E-4,47:2.783646E-4):8.094697E-4,((43:5.437064E-4,44:2.154004E-4):9.982471E-4,45:2.238085E-4,46:2.085648E-4):5.236578E-4):0.001875487):5.690074E-4,(48:8.931196E-4,(49:0.001209313,(50:2.117116E-4,(51:5.155962E-4,(52:2.037064E-4,53:2.046491E-4):4.719922E-4):4.945153E-4):8.998636E-4):0.001907554):0.00127406):9.009029E-4,(54:0.003150547,55:9.311964E-4):0.00208147):0.001244829,(56:2.096459E-4,57:2.033605E-4,58:8.631009E-4):0.00191915):6.851883E-4):6.326108E-4,((59:0.00128541,60:9.853826E-4):0.001944617,((((61:2.047274E-4,62:4.998547E-4):4.650519E-4,81:4.647121E-4):0.001215735,(63:2.45503E-4,64:2.134019E-4):0.002040377):0.001722038,(65:2.087355E-4,66:4.898284E-4):8.417413E-4):0.001125166):6.474116E-4):0.004010309):0.002047849,(((13:5.146653E-4,14:0.001113106):4.877307E-4,(15:8.245152E-4,16:2.029125E-4):5.147845E-4):0.00387075,((17:0.001547605,18:5.258707E-4):0.001660444,(((19:3.026376E-4,20:4.988819E-4):9.859153E-4,21:5.021958E-4,22:2.180855E-4,(25:8.438687E-4,(28:5.39064E-4,29:2.073129E-4,30:5.032708E-4):9.939463E-4):5.953206E-4):0.001364256,(23:2.25814E-4,(24:5.182598E-4,(26:5.344794E-4,27:2.075543E-4):4.902784E-4):4.9218E-4):8.966512E-4):8.216617E-4):0.002835886):0.005246127):0.001950322,((67:4.862198E-4,68:2.086905E-4,69:2.013535E-4):0.001776928,(70:7.106228E-4,71:3.142366E-4,72:2.082871E-4,73:2.00586E-4,74:2.176684E-4):0.00138969):0.00962639):0.003287686,(((((2:0.003867437,(77:3.808076E-4,78:4.440148E-4):8.301792E-4):0.002977078,76:0.004680882):0.002440814,((79:0.002077209,80:0.001398811):0.001956063,97:0.002586305):0.002109552):0.003846116,(((83:8.366708E-4,90:8.486332E-4):0.007718961,((89:0.001058462,91:8.951121E-4):0.00308989,(92:0.001134821,93:8.113062E-4):0.002927424):0.008175534):0.001103786,(((84:4.701509E-4,87:7.638275E-4):0.01191324,95:0.01138698):0.004942603,(85:0.004379173,(86:0.008950593,(94:0.001686904,96:0.001497596):0.01151401):0.002051253,88:0.02004313):0.004062199):0.003311508):0.004709967):0.001712794,((3:0.001631232,75:9.02289E-4,82:3.686657E-4):0.005058672,((4:0.002000781,7:0.002107444):0.003593351,(6:0.001843291,8:0.001658543):0.001486359):0.009162822):0.003639269):0.00209705); END; BEGIN TREES; TITLE Sticta_RAxML; LINK TAXA = Taxa2; TRANSLATE 1 Pseudocyphellaria_citrina_LG688, 2 Sticta_stipitata_LG1253, 3 Sticta_ainoae_UCONN4149, 4 Sticta_hypochra_2, 5 Sticta_sp_LG1017, 6 Sticta_hypochra_1, 7 Sticta_gaudichaldia, 8 Sticta_caulescens, 9 Sticta_plumbea_LG1031, 10 Sticta_macrophylla_LG3452, 11 Sticta_macrophylla_LG946, 12 Sticta_macrophylla_LG3445, 13 Sticta_sp_LG4064, 14 Sticta_sp_LG4074, 15 Sticta_sp_LG4082, 16 Sticta_sp_LG4111, 17 Sticta_sp_LG4110, 18 Sticta_sp_LG4083, 19 Sticta_sp_LG4112, 20 Sticta_sp_LG4109, 21 Sticta_sp_LG4117, 22 Sticta_sp_UCONN4123, 23 Sticta_sp_UCONN4115, 24 Sticta_sp_UCONN4070, 25 Sticta_sp_UCONN4111, 26 Sticta_sp_LG4084, 27 Sticta_sp_UCONN4120, 28 Sticta_sp_UCONN4094, 29 Sticta_sp_LG4063, 30 Sticta_sp_UCONN4137, 31 Sticta_caperata_LG624, 32 Sticta_caperata_LG962, 33 Sticta_caperata_LG4069, 34 Sticta_sp_LG801, 35 Sticta_sp_UCONN4018, 36 Sticta_sp_LG4099, 37 Sticta_sp_UCONN4102, 38 Sticta_sp_UCONN4096, 39 Sticta_sp_UCONN4038, 40 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END; BEGIN TREES; TITLE Sticta_BEAST; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Coccocarpia_domingensis, 2 Coccocarpia_erythroxyli, 3 Collema_auriforme, 4 Collema_callopismum, 5 Collema_conglomeratum, 6 Collema_curtisporum, 7 Collema_flaccidum, 8 Collema_fragile, 9 Collema_fragrans, 10 Collema_furfuraceum, 11 Collema_multipartitum, 12 Collema_parvum, 13 Collema_polycarpon, 14 Collema_tenax, 15 Collema_undulatum, 16 Degelia_durietzii, 17 Degelia_gayana, 18 Degelia_plumbea, 19 Erioderma_verruculosum, 20 Fuscoderma_amphibolum, 21 Fuscoderma_applanatum, 22 Fuscopannaria_ahlneri, 23 Fuscopannaria_mediterranea, 24 Fuscopannaria_praetermissa, 25 Lecidea_atrobrunnea, 26 Lecidea_auriculata, 27 Lecidea_berengeriana, 28 Lecidea_confluens, 29 Lecidea_cyrtidia, 30 Lecidea_diapensiae, 31 Lecidea_floridensis, 32 Lecidea_fuscoatra_589, 33 Lecidea_fuscoatra_6860, 34 Lecidea_fuscoatra_L02894, 35 Lecidea_fuscoatra_var_grisella, 36 Lecidea_laboriosa, 37 Lecidea_lapicida, 38 Lecidea_nylanderi, 39 Lecidea_roseotincta, 40 Lecidea_silacea_1368, 41 Lecidea_silacea_6865, 42 Lecidea_sp_040326, 43 Lecidea_sp_7695, 44 Lecidea_tessellata, 45 Lecidea_turgidula, 46 Lecidoma_demissum, 47 Leciophysma_finmarkicum, 48 Leciophysma_furfurascens, 49 Leioderma_erythrocarpum, 50 Leptochidium_albociliatum_29087, 51 Leptogium_austroamericanum, 52 Leptogium_brebissonii, 53 Leptogium_burnetiae, 54 Leptogium_corticola, 55 Leptogium_cyanescens, 56 Leptogium_diffractum, 57 Leptogium_furfuraceum, 58 Leptogium_gelatinosum, 59 Leptogium_imbricatum, 60 Leptogium_magnussonii, 61 Leptogium_microphylloides, 62 Leptogium_phyllocarpum, 63 Leptogium_plicatile, 64 Leptogium_pseudofurfuraceum, 65 Leptogium_pulvinatum, 66 Leptogium_saturninum, 67 Leptogium_schraderi, 68 Leptogium_subaridum, 69 Leptogium_tenuissimum, 70 Leptogium_turgidum, 71 Lobaria_amplissima, 72 Lobaria_hallii, 73 Lobaria_immixta, 74 Lobaria_linita, 75 Lobaria_macaronesica, 76 Lobaria_meridionalis, 77 Lobaria_oregana, 78 Lobaria_orientalis, 79 Lobaria_pseudoglaberrima, 80 Lobaria_pseudopulmonaria, 81 Lobaria_pulmonaria, 82 Lobaria_quercizans, 83 Lobaria_retigera, 84 Lobaria_sachalinensis, 85 Lobaria_scrobiculata, 86 Lobaria_virens, 87 Lobariella_pallida, 88 Massalongia_carnosa, 89 Nephroma_antarcticum, 90 Nephroma_arcticum, 91 Nephroma_bellum, 92 Nephroma_parile, 93 Nephroma_resupinatum, 94 Pannaria_conoplea, 95 Pannaria_rubiginella, 96 Pannaria_rubiginosa, 97 Pannaria_sp, 98 Parmeliella_appalachensis, 99 Parmeliella_sp, 100 Parmeliella_triptophylla, 101 Peltigera_aphthosa, 102 Peltigera_britannica, 103 Peltigera_canina_009205, 104 Peltigera_cinnamomea, 105 Peltigera_continentalis, 106 Peltigera_degenii, 107 Peltigera_didactyla, 108 Peltigera_didactyla_var_extenuata, 109 Peltigera_elisabethae, 110 Peltigera_extenuata, 111 Peltigera_horizontalis, 112 Peltigera_hydrothyria, 113 Peltigera_hymenina, 114 Peltigera_kristinssonii, 115 Peltigera_laciniata, 116 Peltigera_lambinonii, 117 Peltigera_leucophlebia, 118 Peltigera_malacea, 119 Peltigera_membranacea, 120 Peltigera_monticola, 121 Peltigera_neckeri, 122 Peltigera_neopolydactyla, 123 Peltigera_occidentalis, 124 Peltigera_polydactyloides, 125 Peltigera_polydactylon, 126 Peltigera_ponojensis, 127 Peltigera_praetextata, 128 Peltigera_pulverulenta, 129 Peltigera_retifoveata, 130 Peltigera_rufescens, 131 Peltigera_scabrosa, 132 Peltigera_sp, 133 Peltigera_venosa, 134 Physma_byrsaeum, 135 Physma_pseudoisidiatum, 136 Physma_radians, 137 Placynthium_flabellosum, 138 Placynthium_nigrum, 139 Polychidium_muscicola, 140 Protopannaria_pezizoides, 141 Pseudocyphella_rainierensis, 142 Pseudocyphellaria_anomala, 143 Pseudocyphellaria_argyracea, 144 Pseudocyphellaria_aurata, 145 Pseudocyphellaria_berberina, 146 Pseudocyphellaria_cf_intricata, 147 Pseudocyphellaria_citrina_LG688, 148 Pseudocyphellaria_clathrata, 149 Pseudocyphellaria_coriifolia, 150 Pseudocyphellaria_divulsa, 151 Pseudocyphellaria_endochrysea, 152 Pseudocyphellaria_freycinetii, 153 Pseudocyphellaria_hirsuta, 154 Pseudocyphellaria_intricata, 155 Pseudocyphellaria_lechleri, 156 Pseudocyphellaria_mallota, 157 Pseudocyphellaria_obvoluta, 158 Pseudocyphellaria_perpetua, 159 Pseudocyphellaria_pilosella, 160 Pseudocyphellaria_sp_5295, 161 Psoroma_hypnorum, 162 Ramalodium_succulentum, 163 Solorina_crocea, 164 Solorina_saccata_2087, 165 Solorina_saccata_4823, 166 Staurolemma_omphalarioides, 167 Staurolemma_sp, 168 Staurolemma_weberi, 169 Sticta_ainoae_UCONN4149, 170 Sticta_ambavillaria_LG992, 171 Sticta_atlantica_LG3858, 172 Sticta_beauvoisii_1242, 173 Sticta_beauvoisii_LG3303, 174 Sticta_canariensis_LG1333, 175 Sticta_caperata_LG624, 176 Sticta_carolinensis_LG3302, 177 Sticta_caulescens, 178 Sticta_damaecornis, 179 Sticta_dichotoma_LG1005, 180 Sticta_duplolimbata_LG1040, 181 Sticta_filix_2, 182 Sticta_fuliginosa_980W1A, 183 Sticta_fuliginosa_LG795, 184 Sticta_gaudichaldia, 185 Sticta_hypochra_1, 186 Sticta_hypochra_2, 187 Sticta_limbata_LG2230, 188 Sticta_macrophylla_LG946, 189 Sticta_plumbea_LG1031, 190 Sticta_sp_LG1017, 191 Sticta_sp_LG1109, 192 Sticta_sp_LG3450, 193 Sticta_sp_LG4059, 194 Sticta_sp_LG4062, 195 Sticta_sp_LG4074, 196 Sticta_sp_LG4077, 197 Sticta_sp_LG4082, 198 Sticta_sp_LG4084, 199 Sticta_sp_LG4092, 200 Sticta_sp_LG4107, 201 Sticta_sp_LG4109, 202 Sticta_sp_LG4110, 203 Sticta_sp_LG4117, 204 Sticta_sp_LG800, 205 Sticta_sp_LG991, 206 Sticta_sp_UCONN4018, 207 Sticta_sp_UCONN4038, 208 Sticta_sp_UCONN4076, 209 Sticta_sp_UCONN4094, 210 Sticta_sp_UCONN4102, 211 Sticta_sp_UCONN4116, 212 Sticta_sp_UCONN4128, 213 Sticta_sp_UCONN4139, 214 Sticta_stipitata_LG1253, 215 Sticta_sublimbata_LG1038, 216 Sticta_sublimbata_LG885, 217 Sticta_sylvatica_LG3536, 218 Sticta_umbilicariaeformis_LG925, 219 Sticta_variabilis_LG3451, 220 Sticta_weigelii; TREE Fig._3 = [&R] ((((45:76.182622,((39:25.324139,38:25.324139):41.609829,((43:29.10405,31:29.10405):17.136534,29:46.240584):20.693383):9.248655):25.423015,((44:43.564116,(((((33:3.617604,(35:0.983145,34:0.983145):2.634459):1.527537,32:5.145141):9.562491,((40:2.73369,41:2.73369):8.364058,28:11.097748):3.609884):4.976128,(36:9.845399,37:9.845399):9.838361):10.940876,(42:23.85289,(25:5.641564,26:5.641564):18.211326):6.771747):12.939479):26.174898,(46:31.221694,30:31.221694):38.51732):31.866624):11.944708,27:113.550346):42.757936,((((88:10.878832,139:10.878832):28.688481,50:39.567313):68.166944,((((151:18.177819,145:18.177819):32.024805,(((((146:6.868847,143:6.868847):11.893152,(150:13.365915,152:13.365915):5.396084):15.532759,(((147:3.718434,149:3.718434):2.80115,159:6.519584):8.360406,(160:8.883865,(155:6.613175,(154:3.375946,158:3.375946):3.237229):2.270691):5.996124):19.414769):3.910932,((144:6.493608,148:6.493608):11.446662,((156:4.511345,153:4.511345):2.992595,157:7.50394):10.43633):20.265421):7.204786,(((((((84:3.766796,((73:0.456345,75:0.456345):1.811099,81:2.267444):1.499353):1.534239,(78:0.540363,76:0.540363):4.760673):1.684457,80:6.985492):3.528093,(74:7.883548,142:7.883548):2.630038):3.878557,83:14.392143):18.789352,((85:12.854558,77:12.854558):13.775586,((141:15.669475,72:15.669475):8.801764,((87:11.911489,79:11.911489):3.913472,((71:4.629211,86:4.629211):3.551914,82:8.181125):7.643836):8.646278):2.158905):6.551351):8.862417,(((((180:6.205227,217:6.205227):5.28927,(182:9.977267,((170:6.350046,((183:0.694043,187:0.694043):4.91516,218:5.609203):0.740843):1.166353,171:7.516399):2.460868):1.517229):1.536177,(((((172:0.237697,173:0.237697):0.475657,176:0.713354):1.666931,(215:0.417906,216:0.417906):1.962379):5.925165,220:8.30545):2.100801,174:10.406251):2.624423):2.049357,(((177:2.060909,(185:1.768866,184:1.768866):0.292043):0.89605,186:2.956958):7.489867,178:10.446825):4.633206):2.149261,((169:12.795342,((179:1.901194,192:1.901194):8.70851,(((((190:0.975746,189:0.975746):1.098109,188:2.073855):3.729892,(206:1.920515,175:1.920515):3.883232):1.347141,((((212:1.966407,((194:0.667083,219:0.667083):0.453965,211:1.121048):0.845359):0.492344,((208:0.350078,205:0.350078):1.274315,204:1.624393):0.834358):1.236287,(191:3.058514,(207:1.538156,210:1.538156):1.520358):0.636524):0.720252,(213:3.139016,((196:1.367409,193:1.367409):1.175343,(200:0.94664,199:0.94664):1.596112):0.596264):1.276273):2.735598):1.531408,((((209:0.690672,(201:0.116958,203:0.116958):0.573715):0.992859,198:1.683531):0.494431,202:2.177962):1.94543,(195:1.012482,197:1.012482):3.11091):4.558904):1.927409):2.185637):2.28592,(214:8.344773,181:8.344773):6.736489):2.14803):24.81462):3.366564):4.792148):40.97459,((164:0.432835,165:0.432835):56.784073,(163:51.85268,((((((126:2.496086,120:2.496086):5.949967,((((130:2.644229,115:2.644229):3.003788,(116:3.629462,(110:0.860998,108:0.860998):2.768464):2.018554):1.319535,((((103:0.728632,127:0.728632):1.8942,104:2.622832):2.47889,(119:3.729174,106:3.729174):1.372548):0.09297,107:5.194692):1.77286):0.46865,(114:0.552619,105:0.552619):6.883582):1.009852):3.068581,(129:5.432475,132:5.432475):6.08216):3.845253,((109:1.455603,111:1.455603):9.549208,(124:0.753591,121:0.753591):10.25122):4.355076):7.388423,(((122:3.956879,131:3.956879):5.779313,(125:5.766646,(123:3.268169,(128:0.99441,113:0.99441):2.273758):2.498477):3.969546):8.243612,(117:12.865703,(118:1.515054,(102:0.777921,101:0.777921):0.737133):11.350649):5.114101):4.768506):5.9678,(133:18.848441,112:18.848441):9.867669):23.13657):5.364228):33.960306):6.109384,((((91:9.757811,92:9.757811):21.871265,90:31.629076):10.379222,89:42.008298):24.046394,93:66.054691):31.231907):10.447658):40.214646,((1:42.251606,2:42.251606):90.020566,(((((((24:4.923982,22:4.923982):6.593896,23:11.517878):14.354033,140:25.871911):5.666946,(47:9.755098,48:9.755098):21.78376):32.745517,(((161:32.946316,(20:5.641292,21:5.641292):27.305024):13.092592,(136:17.428178,(135:7.377347,134:7.377347):10.050831):28.610729):9.891321,((((94:1.469811,96:1.469811):3.467656,97:4.937467):6.326355,95:11.263822):32.820538,(162:32.153418,(166:13.52708,(167:9.61318,168:9.61318):3.9139):18.626338):11.930942):11.845868):8.354146):40.512033,((((99:12.21456,98:12.21456):18.744691,100:30.95925):18.007903,18:48.967153):14.994113,((17:32.707495,19:32.707495):12.932614,(16:22.282373,49:22.282373):23.357736):18.321158):40.835141):22.885148,((137:22.069749,138:22.069749):85.194821,(56:79.785341,((((((7:12.628833,10:12.628833):7.571504,6:20.200336):23.597445,((66:10.997481,53:10.997481):25.518294,((57:7.251292,64:7.251292):22.724495,(((55:17.396894,54:17.396894):1.746496,(51:12.07786,62:12.07786):7.06553):3.177362,52:22.320751):7.655035):6.539989):7.282006):10.421857,14:54.219638):7.214922,(4:46.386597,11:46.386597):15.047962):4.218054,(((13:13.384771,(15:10.249403,3:10.249403):3.135368):4.146956,8:17.531728):26.197679,((((((9:0.486599,61:0.486599):0.553655,5:1.040254):6.258863,((60:1.867937,68:1.867937):3.163624,69:5.031561):2.2675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END;