#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 25, 2024; 6:52 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Nguyen H., & Seifert K. 2008. Description and DNA barcoding of three new species of Leohumicola from South Africa and the United States. Persoonia, 21: 57-69. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S2130] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=49; TAXLABELS Leohumicola_atra_DAOM239515 Leohumicola_atra_DAOM239535 Leohumicola_incrustata_DAOM239498 Leohumicola_incrustata_DAOM239500 Leohumicola_incrustata_DAOM239501 Leohumicola_incrustata_DAOM239502 Leohumicola_incrustata_DAOM239503 Leohumicola_incrustata_DAOM239504 Leohumicola_incrustata_DAOM239505 Leohumicola_incrustata_DAOM239517 Leohumicola_incrustata_HNLHM101 Leohumicola_incrustata_HNLHM103 Leohumicola_incrustata_HNLHM107 Leohumicola_incrustata_HNLHM91 Leohumicola_incrustata_HNLHM92 Leohumicola_lenta_DAOM231149 Leohumicola_levissima_DAOM239506 Leohumicola_levissima_DAOM239507 Leohumicola_levissima_DAOM239508 Leohumicola_levissima_DAOM239509 Leohumicola_levissima_DAOM239510 Leohumicola_levissima_DAOM239511 Leohumicola_levissima_DAOM239512 Leohumicola_levissima_DAOM239513 Leohumicola_levissima_DAOM239514 Leohumicola_levissima_HNLHM144 Leohumicola_levissima_HNLHM145 Leohumicola_levissima_HNLHM152 Leohumicola_levissima_HNLHM2 Leohumicola_levissima_HNLHM21 Leohumicola_levissima_HNLHM2b Leohumicola_levissima_HNLHM4 Leohumicola_levissima_HNLHM41 Leohumicola_levissima_HNLHM42 Leohumicola_levissima_HNLHM47 Leohumicola_minima_DAOM232587 Leohumicola_sp_DAOM231148 Leohumicola_sp_DAOM239516 Leohumicola_terminalis_DAOM231145 Leohumicola_verrucosa_DAOM226889 Leohumicola_verrucosa_DAOM230085 Leohumicola_verrucosa_DAOM231141 Leohumicola_verrucosa_DAOM231142 Leohumicola_verrucosa_DAOM231143 Leohumicola_verrucosa_DAOM231144 Leohumicola_verrucosa_DAOM231147 Leohumicola_verrucosa_DAOM239497 Leohumicola_verrucosa_DAOM239536 Leohumicola_verrucosa_HNLHM117 ; 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TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M3546] TITLE COX1; LINK TAXA = Taxa2; DIMENSIONS NCHAR=628; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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CATTACAG-AGTTCGCGCCCTTATGGGTAGATCT-CCCACCCTGTGCTAT-CGTCCCTGTGTTGCTTTGGCGGGCCGCTGGGCTCGACCCGGCCGCCGGCTCCGGCTGGCGCGCGCCCGCCAGAGG-CTCTACAACTCTTG-ATGTTTGTGATGTCCGAGTACTATAC-AATAGTTAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGCGAATTGCAGAATTCAGTGAGTCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTGTGGCATTCCGCAGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAA-CCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGCCTGGCCCGTTGCGGCCGGTCCTAAAATCAGTGGCGGTGCCGCCTGGCTCTAAGCGTAGTAATGC-TCTCGCTCTAGGGT-CCGGTGGTCGCTGGCCAG-AACCCC--AACTTCTATGGTTG ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = ITS) = N: 1-486; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = ITS) = N: 1-486; END; BEGIN TREES; TITLE Tb9212; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Leohumicola_verrucosa_DAOM239497, 2 Leohumicola_levissima_HNLHM2, 3 Leohumicola_levissima_HNLHM2b, 4 Leohumicola_levissima_DAOM239506, 5 Leohumicola_levissima_HNLHM4, 6 Leohumicola_levissima_DAOM239507, 7 Leohumicola_levissima_DAOM239508, 8 Leohumicola_atra_DAOM239515, 9 Leohumicola_levissima_HNLHM21, 10 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