#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 20, 2024; 0:06 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Maruyama M., Steiner F., Stauffer C., Akino T., Crozier R., & Schlick-steiner B. 2008. A DNA and morphology based phylogenetic framework of the ant genus Lasius with hypotheses for the evolution of social parasitism and fungiculture. BMC Evolutionary Biology, null. 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Lasius_arizonicus_012 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Lasius_fuji_001 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Lasius_neglectus_020 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; END; BEGIN SETS; CHARSET 1st_position_CO1 (CHARACTERS = Lasius_COI_16S) = 385 387 389 391 393 395 397 399 401 403 405 407 409 411 413 415 417 419 421 423 425 427 429 431 433 435 437 439 441 443 445 447 449 451 453 455 457 459 461 463 465 467 469 471 473 475 477 479 481 483 485 487 489 491 493 495 497 499 501 503 505 507 509 511 513 515 517 519 521 523 525 527 529 531 533 535 537 539 541 543 545 547 549 551 553 555 557 559 561 1 3 5 7 9 11 13 15 17 19 21 23 25 27 29 31 33 35 37 39 41 43 45 47 49 51 53 55 57 59 61 63 65 67 69 71 73 75 77 79 81 83 85 87 89 91 93 95 97 99 101 103 105 107 109 111 113 115 117 119 121 123 125 127 129 131 133 135 137 139 141 143 145 147 149 151 153 155 157 159 161 163 165 167 169 171 173 175 177 179 181 183 185 187 189 191 193 195 197 199 201 203 205 207 209 211 213 215 217 219 221 223 225 227 229 231 233 235 237 239 241 243 245 247 249 251 253 255 257 259 261 263 265 267 269 271 273 275 277 279 281 283 285 287 289 291 293 295 297 299 301 303 305 307 309 311 313 315 317 319 321 323 325 327 329 331 333 335 337 339 341 343 345 347 349 351 353 355 357 359 361 363 365 367 369 371 373 375 377 379 381 383; CHARSET 3rd_position_CO1 (CHARACTERS = Lasius_COI_16S) = 563-843; CHARSET 2nd_position_CO1 (CHARACTERS = Lasius_COI_16S) = 2 4 6 8 10 12 14 16 18 20 22 24 26 28 30 32 34 36 38 40 42 44 46 48 50 52 54 56 58 60 62 64 66 68 70 72 74 76 78 80 82 84 86 88 90 92 94 96 98 100 102 104 106 108 110 112 114 116 118 120 122 124 126 128 130 132 134 136 138 140 142 144 146 148 150 152 154 156 158 160 162 164 166 168 170 172 174 176 178 180 182 184 186 188 190 192 194 196 198 200 202 204 206 208 210 212 214 216 218 220 222 224 226 228 230 232 234 236 238 240 242 244 246 248 250 252 254 256 258 260 262 264 266 268 270 272 274 276 278 280 282 284 286 288 290 292 294 296 298 300 302 304 306 308 310 312 314 316 318 320 322 324 326 328 330 332 334 336 338 340 342 344 346 348 350 352 354 356 358 360 362 364 366 368 370 372 374 376 378 380 382 384 386 388 390 392 394 396 398 400 402 404 406 408 410 412 414 416 418 420 422 424 426 428 430 432 434 436 438 440 442 444 446 448 450 452 454 456 458 460 462 464 466 468 470 472 474 476 478 480 482 484 486 488 490 492 494 496 498 500 502 504 506 508 510 512 514 516 518 520 522 524 526 528 530 532 534 536 538 540 542 544 546 548 550 552 554 556 558 560 562; CHARSET 16S (CHARACTERS = Lasius_COI_16S) = 844-1265; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = Lasius_COI_16S) = N: 1-1265; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = Lasius_COI_16S) = N: 1-1265; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M3550] TITLE Lasius; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=64; FORMAT DATATYPE=Standard SYMBOLS= "0 1 2 3 4" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 ] [ . . . . . . ] Formica_japonica 0000000000000000000000?0000000004000010001201200????002121012014 Lasius_alienus_021 1100110000112001010011000111100010000010111010011110101120102201 Lasius_arizonicus_012 11100001441021120100101000011101?0000011111104110001002011101111 Lasius_austriacus_027 1100110000101000010011000111100010000010111020011110101120102201 Lasius_brunneus_025 1100110000122000010011000111100010000010101004011110101120102201 Lasius_capitatus_044 0020110100110012101101011111100000001111112004110010102020101211 Lasius_capitatus_047 0020110100110012101101011111100000001111112004110010102020101211 Lasius_capitatus_058 0020110100110012101101011111100000001111112004110010102020101211 Lasius_capitatus_062 0020110100110012101101011111100000001111112004110010102020101211 Lasius_emarginatus_041 110011000010100001001100011110001000001011{01}022011110101120102201 Lasius_flavus_022 1100011111112002000000000111100010000010120004011000101110101111 Lasius_flavus_038 1100011111112002000000000111100010000010120004011000101110101111 Lasius_flavus_045 1100011111112002000000000111100010000010120004011000101110101111 Lasius_fuji_001 0020110100110012101101011111100000001111011004110010102120101221 Lasius_fuji_034 0020110100110012101101011111100000001111011004110010102120101221 Lasius_fuliginosus_024 0020110100110012101101011111100000001111011004110010102120101221 Lasius_fuliginosus_070 0020110100110012101101011111100000001111011004110010102120101221 Lasius_hayashi_046 1100110000111000010011000111100010000010111022011110101120102201 Lasius_hayashi_054 1100110000111000010011000111100010000010111022011110101120102201 Lasius_interjectus_013 11100001441021120100101000011101?0000011111104110001001011101111 Lasius_japonicus_019 1100110000101000010011000111100010000010111022011110101120102201 Lasius_japonicus_037 1100110000101000010011000111100010000010111022011110101120102201 Lasius_japonicus_055 1100110000101000010011000111100010000010111022011110101120102201 Lasius_japonicus_076 1100110000101000010011000111100010000010111022011110101120102201 Lasius_latipes_120 11100001441021120100101000011101?0000011111104110001002011101111 Lasius_mixtus_030 111000011111200000100000111110000000011111{01}021110000001120101121 Lasius_nearcticus_014 1110011111112002000000000111100010000010120004011000101110101{01}10 Lasius_neglectus_020 1100110000111000010011000111100010000010111022011110101120102201 Lasius_niger_026 1100110000101000010011000111100010000010111022011110101120102201 Lasius_nipponensis_033 0020110100110012001101011111100000001111112004110010102120101211 Lasius_nipponensis_063 0020110100110012001101011111100000001111112004110010102120101211 Lasius_nipponensis_064 0020110100110012001101011111100000001111112004110010102120101211 Lasius_nipponensis_067 0020110100110012001101011111100000001111112004110010102120101211 Lasius_orientalis_004 0020110100111112101101011111100000001111021111110010102020101221 Lasius_orientalis_060 0020110100111112101101011111100000001111021111110010102020101221 Lasius_pallitarsis_015 1120000100110000000001000111100010000010112022011110101120102001 Lasius_platythorax_028 1100110000101000010011000111100010000010111022011110101120102201 Lasius_productus_018 1100110000112000010011000111100010000010111022011110101120102201 Lasius_reginae_023 111100011110200201001000001111100111001?0120041100001010?1102111 Lasius_sakagamii_029 1100110000100000010011000111100010000010000022011110101120102201 Lasius_sakagamii_056 1100110000100000010011000111100010000010000022011110101120102201 Lasius_sp_3_040 1100110000101000010011000111100010000010001022011110101120102201 Lasius_spathepus_032 002011010012111210110101111110000000111111{12}121110010102030101221 Lasius_spathepus_074 002011010012111210110101111110000000111111{12}121110010102030101221 Lasius_spathepus_077 0020110100121112101101011111100000001111111121110010102030101221 Lasius_umbratus_006 1110000111111100001000001111100000000111111020110000001120101121 Myrmecocystus_menduxs 0000000011120000000000?001000000?0000000012022011110011??01?1?0? Myrmecocystus_mimicus 0000000011120000000000?001000000?0000000012022011110011??01?1?0? ; END; BEGIN SETS; CHARSET morphology (CHARACTERS = Lasius) = 1-64; END; BEGIN TREES; TITLE Tb9219; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Formica_japonica, 2 Lasius_alienus_021, 3 Lasius_arizonicus_012, 4 Lasius_austriacus_027, 5 Lasius_brunneus_025, 6 Lasius_capitatus_044, 7 Lasius_capitatus_047, 8 Lasius_capitatus_058, 9 Lasius_capitatus_062, 10 Lasius_emarginatus_041, 11 Lasius_flavus_022, 12 Lasius_flavus_038, 13 Lasius_flavus_045, 14 Lasius_fuji_001, 15 Lasius_fuji_034, 16 Lasius_fuliginosus_024, 17 Lasius_fuliginosus_070, 18 Lasius_hayashi_046, 19 Lasius_hayashi_054, 20 Lasius_interjectus_013, 21 Lasius_japonicus_019, 22 Lasius_japonicus_037, 23 Lasius_japonicus_055, 24 Lasius_japonicus_076, 25 Lasius_latipes_120, 26 Lasius_mixtus_030, 27 Lasius_nearcticus_014, 28 Lasius_neglectus_020, 29 Lasius_niger_026, 30 Lasius_nipponensis_033, 31 Lasius_nipponensis_063, 32 Lasius_nipponensis_064, 33 Lasius_nipponensis_067, 34 Lasius_orientalis_004, 35 Lasius_orientalis_060, 36 Lasius_pallitarsis_015, 37 Lasius_platythorax_028, 38 Lasius_productus_018, 39 Lasius_reginae_023, 40 Lasius_sakagamii_029, 41 Lasius_sakagamii_056, 42 Lasius_sp_3_040, 43 Lasius_spathepus_032, 44 Lasius_spathepus_074, 45 Lasius_spathepus_077, 46 Lasius_umbratus_006, 47 Myrmecocystus_menduxs, 48 Myrmecocystus_mimicus; TREE Fig._2 = [&R] (1,((47,48),((((((14,(16,17)),15),((34,35),(43,44,45)),((30,31,32,33),(6,((7,9),8)))),((38,(((((21,23,24),29,37,22),10),2),(((40,41),42),(18,19)))),((28,4),5))),(27,(11,(12,13)))),(((46,26),(((3,20),25),39)),36)))); END;