#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 20, 2024; 4:01 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Kamath A., Levin R., & Miller J. 2009. Do multiple tortoises equal a hare? The utility of nine noncoding plastid regions for species-level phylogenetics in tribe Lycieae (Solanaceae). Systematic Botany, 34(4): 796-804. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S2256] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=15; TAXLABELS Atropa_belladonna Lycium_americanum Lycium_cestroides Lycium_chanar Lycium_chilense Lycium_cinereum Lycium_ferocissimum Lycium_hirsutum Lycium_nodosum Lycium_parishii Lycium_shockleyi Lycium_villosum Nolana_coelestis Nolana_werdermannii Phrodus_microphyllus ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa2; DIMENSIONS NTAX=25; TAXLABELS Atropa_belladonna Lycium_americanum Lycium_andersonii Lycium_californicum Lycium_cestroides Lycium_chanar Lycium_chilense Lycium_chinense Lycium_ciliatum Lycium_cinereum Lycium_cuneatum Lycium_ferocissimum Lycium_hirsutum Lycium_nodosum Lycium_oxycarpum Lycium_parishii Lycium_puberulum Lycium_pumilum Lycium_rachidocladum Lycium_shockleyi Lycium_tenue Lycium_villosum Nolana_coelestis Nolana_werdermannii Phrodus_microphyllus ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M3922] TITLE 25_taxa_6_cpDNA_spacers_plus_indels; LINK TAXA = Taxa2; DIMENSIONS NCHAR=5261; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Lycium_andersonii 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Lycium_californicum 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Lycium_cestroides 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Lycium_chanar 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Lycium_ciliatum 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Lycium_ferocissimum 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Lycium_hirsutum 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Lycium_oxycarpum 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Lycium_parishii 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Lycium_pumilum 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Lycium_tenue 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Lycium_villosum 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Nolana_werdermannii 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GAACGTAATGCTCATAACTTCCCTCTAGACCTAGCTGCTATCGAAGCTCCATCTACAAATGGATAAGATCCCAGTCTAGTCTATAGGAGGTTTTGAAAAGAAAGGAGCAATAATCATTTTCTTGTTCTATCAAGAGGGTGCTATTGCTCCTTTCTTTTTTTCTTTTTATATTATAAATTTACTAGTATTTTACTTACATAGACTTTTT-GTTTACATTATAGAAAAAGAAGGAGAGGGTATTTTCCTGCATTTATTCATGATTGAGTATTCTATTTTGATTTTGTATTTATTTAAAATTGTAGAAATATAACTTGTTCCTTTTGTTGCTAATGTTACT-----------ATTTCATTTCAAAAAAAAAATATATATAATTTTGACTTCATATTCTTATCTTT-----------------GAAATAAGAAATAAGATAAATA-TTTCGAACTTTAATCTTTTGTTTTCTAATTTAAATAATGTAAAAATGGAATGTAAGTAGGCGAGGGGGCGGATGTAGCCACTCATAATAGCCTATGAATAAGCAATCGTCGAGATTGAGTAAGCTATTTTAGTTTAGTAATGATTCAAATGGATCACTAACAATAAAAAGTTGTTCAAATAGGAATTTGAAGTTGAAGGTTCATTATTTTAGATTTGAGTTTAGAGTCTTAG-TTTTTTTTATTTAACCTGGGGCTTTCCTATATTTTATGCTTTCCTCGAATTGAACTCTTGTAAATAAACCGTTCTATACTCAATTAAGG-----AATAGAGTTCAAAAAGTTTTTGTTTTCATTGTTTAATCAGCTATTTCC------TTTTTATTTTATAAATCTAAAACAAAAAATGGATTTTAAAGACCAAATAGAAAGAAAAAAAACCTATTTTGCATTACTCAAAATTGACAATTAGTCATACAGAATTTCATTAAGCAATTTTATCTATTGGGTTAAGGGCAAGATATACATGGGGGTCTATATAATAATTCAGAGAAAATAAAAAGGTTTCAAAATAGAATCAATTAGTTTCAATGAGTTCTTAACTTTCACTAAAGATTTTTATATATGTTCTTCTATAGATATGGAAATATAATGTAAATATATAA---------TTTTTTTTAATTGAATTCTGCAAATAGGTCGATGGGGAAAATAAAACTCCCCACCTTGGAATAGAAATTATCTTTATTTTTTTGTCAAC-AAAAAAGTTATTATTCAGT-------AAATAGAGGATTTCCTAATTCAATTATTTTATATATCAATCAGAAAAGCGAAGAGAGTTCTATTACGTATTGATTGGTGAGCTAATCAATATC-------AAATATGAAAGGGAAATCGTTAAATTATGCAATTATTATCTAA----------------------------TTGAATAATTTTTTCAAGTTGATTCAAATTGTTCTAACGTTTTATTACTTATTTATTTTTGTTTGGCGTACAAAAAAACTTTTTGAATTCCCGGTAGAAAGAGATTTCGCTAATGAAAAAGCCTTTAATGCTACCCAATATCCCTTCCTTTTCCAAATAGATGTCGAAGTGCGTTTTTTTGGAACTGCCATTTAGAAATTAAAAAATTACTCATTGTTATAGCTGGATGTGAAAGACATCTATTGTTCAAAACGAATTCTTTTTACTACTATTTATTTTCGAGCTAATAGTGTCCTCCTCAAATAAAACATTATCGAGATAGGCAAAAGATATGTGAAAATTGCATAATACTGGAAATA----TGGAAATAAAAAAAGAAGTCCAATATGTGTG-TTTTTTTTTTCAAGTTTTTCTATTCCATAAAACATTCAGAATCGTAAAAAAGAAAAGGTTCTCTATTGACTGGTATCTTTATTTCACAATTTCACA-----TTCTTTTTGATTCAAAAAATCTATACCTATAGAATTTGCTAATCGGCTGTTCTGTAGAAATGACGAAATAAAATTAGTTGAACTT-------------------------------AAAAATACTCGATTTCTATTTATGGTTCCACATTTCATTTACATGCAATAAAATACCTCGAGAGGTTTAAAGATACGAACCTCATTTTTACTTCAGGAAATGAAAAACTTGAATCCCC-------GTTCGATTCACTGCTCAAACTTGGATAAAAAATAGGCCTATTTCAAAGGAGACTAGTAATTAATCCCTTTCATATCATTTGACCAATTGTAACTTCTTGATTTCAATAGTTGAAGTATTTAGCAAAGACTC--------AGAATAAGTAAGAATAGAAAATTAGATTTAAGTTTTAAATTAGTTTAAGTTAGTCCATATTTTGACTTTTTATTGACTACTTTCAAAAGAGGTAAGATCCGGTGAATCGGAAACAATTAATTAAGAATTAAAAACTTACTAAGTGATCACTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAACAAAAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTTCTGAAAACAAACAAAGGTTCAGAAAAAAA-GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTATTCTAACAAATGGAGTGAAATGCGTTGGTAGAGGAATCTTTACATCGAAACTTCAGAAAGAAAAAGAATGAAGTGAAGGATAAACATATATACATACGTATTGAATACTATATCAAATGATTAATGACGACCCGAATCCGTATTTTTT-CTATAAAAAATAGAAGAATTGGTGTGAATCGATTCTACATTGAAGAAAGAATCGAATATTCATTGATCAAATCATTCACTCCATA-----GTCTGATAGATCTTTTGAAAAACTGATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCGTTCTACATGTCAATACCGGCAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAAAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCCAAAAAGACTATTTCACTCCCCAACTATTTATCCGACCCCCTTTCCTTAGCGATTCCAAACTCCTTATCTTTCTCATTCACTCTATTCTTTTATAAATGGATTTGAGCGTAAATGGCTTTCTCTTATCACAAGTCTTGTGATATATATGATACCCATAGAAATGAACATCTTTGAGCAAGGAATCTCTAGTTGAATGATTCCCGATCAATACAATATCATTACTCATACTGAAACTTACAAAGTCATCTTTTTGAAGATCGAAGAAATTCCCCGGCTTTGATAAAATTTTTTAATCTACTTTTGTCCTTTTAATTGACATAGACCCCAGTTCTCTAATAAAATGAGGATACTCCATTGGGAATAGCCGGGATAGCTCAGATGCTCTAACCTCTGAGCTAAGCGGGCCCACATAACAGAAATCTTATATGCATAGTAATTGACTAAACTACTGGAATTGGAATCTTAGTTATTAACTATTCAATATTATATTGAATATTCTAGAACATAAGGATTAATATAGCGATATAGAATTTCGATTTATCACAA------------TTCTAATACTAATATTATTAAATAGTGATTGGAAATATTGGTAATATTCTTTTATTTTCATTTTCAATTTGAATGGGAAATATTCTTTTTCATTTCTTTTTTTGGCATTTGAAATAGTTTTTATTATAGTTCTATATTTGATTCTATATCATATATATCTCTCATTCTATATTTATATTTATTTCAAATTCTAATTGTTTAATGGAATAGTTAGTTATAACTAATGAGACATTCCTCCGCTTTCAGGAGAAAGTGAAGATAAAAAACAAGAATCGATCGTTCAAGTATTCCAAATTGAATGGCAAAATGACAGGAAGAGAGACATATGGATGGGGTATATATCCATCTATATTGAATTGCGGATTCCGAAATGATAAAATCATTTTTGATTGGACAAAAAAAGGTCTCCTATAGAAG-----TAAGAAAATCAAAGAGGAGAAAACACGTTTTCGAGATAGGAATCGGTATCTAATGAATTCAATGGTTCCAATATAAATGAAAGAAAAAGAATAAGGAATGACATCACAACGAGATCCTAATCTCAAAACAAAAAGAAAGGGGGATATGGCGATTCTTTTTTATCTCCGGATCGGGTATTTCTGAAGTACAAAGGGGGTTATATCATCTCATGGCGGA--------TTGGCGAATTATTGGGCCGAGCTGGATTTGAACCAGCGTAGACATATTGCCAACGAATTTACAGTCCGTCCCCATTAACCACTCGGGCATCGACCCAGGAAGAATCAATTTTAGACTTATTGGTAATCCATGATCAACTTCCTTTCGTAATACCCTACCCCCAGGGGAATTCGAATCCCCGCTGCCTCCTTGAAAGAGAGATGTCCTAAACCACTAGACGATGGGGGCCCGCTTGACCAACGGCCATCATACTATGATCATAGTATGATCAGTTTTTTGAAATTGTCAATATAATCGAA---------CGATTCTAT-CCGAGGGATCTTTCCCCCTT-TCAGAATTGCATAGAATTTTTTTTTATTCGTCATTGAGGAATTATTCATTAGAATCGCTATTAGAAATCTAGTCGTAGTATTTTTTTATTTTTGAATTATTTCAATTGAATTTATTTCTATTATTTTAGTTTAGATTATTTAGTATTTCGAATTTTATTTAGAATTTACTTTTTTTATTTAGAAATTTCTAAATAAAAAAA-GTAATAAATACAAAAAATAGAAATAATAAGGAAGAGTAGGATTTTTTCAGGGAATGATTGGTCCGTCAGAAAAGGAAAAAGGTGTGAAATTCTATTTTTTTTAACTTTCATTTGATTCATTGTTAAAACGAGATATCCTTATCTCCCTCCCACCAAGACAGGAACTTAACAAACGAGAAATCTAGTAAGCGGGATCAAGCGGAAAATTCTTTTTTCTCCAAGAATTTAGTTCAGGAGACAAGTAGAATCTCTTCATTCCATGATTCGATGAAATATCTTGAATTTTATGTTGAATTGCTAGGTGTATGTAC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Lycium_americanum 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Lycium_cestroides 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Lycium_chilense 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Lycium_ferocissimum 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Lycium_nodosum 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Nolana_coelestis 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Phrodus_microphyllus GAACGTAATGCTCATAACTTCCCTCTAGACCTAGCTGCTATCGAAGCTCCATCTACAAATGGATAAGATCCCAGTCTAGTCTATAGGAGGTTTTGAAAAGAAAGGAGCAATAATCATTTTCTTGTTCTATCAAGAAGGTGCTATTGCTCCTTTCTTTTTTTCTTTTTATATTATTAATTTACCAGTATTTTACTTATATAGACTTTTTGGTTTACATTATAGAAAAAGAAGGAGAGGGTATTTGCCTGCATTTATTCATGATTGAGTATTCTATTTTGATTTTGTATTTATTTTAAATTGTAGAAATATAACTTGTTCCTCTTGTTGCTAATGTTACTATATCTTTTTTATTTCATTTCTAAAAAAAA-----TCTAATTTTGACTTCATATTCTTA----------------------GAAATAAGAAAGAAGAGA--TATTTTCGAACTTTAATCTTTTGTTTTCGAATTTAAATAATGTAAAAATGGAATGTAAGTACGCGAGGGGGCGGATGTAGCCACTCATAATAGCCTATGAATAAGCAATCGTCGAGATTGAGGAAGCTATTTTAGTTTAGTAATGAGTCAAATGGATCAATAACCAAAAAAGGTTGTTCAAATAGGAATTTGAAGTTGAAGGTTCATTATTTTAGATTTGAGTTTAGAGTCTTAG-TTTTTTTTATTTAACCTGGGACTTTCCTATATTTTAGGCTTGCCTCGAATTGAACTCTTGTAACTAAATCGTTCTATACTCAATTAAGG-----AATAGAGTTCAAAAAGTTTTTGTTTTCATTGTTTAATCAGCTATTTCCTATTGATTTTTTTTTCAGAAATCTAAAACAAAAAATGGATTTTGAAGACAAAATAGAAAG-AAAAGAACCTATTTTGCATCACTCAAAATTGACAATTAGTGATACAGAATTTCATTAAGCAATTTTATCTATTGGGTTAAGGGCAA--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAGATAT-----------GGAAATATAGAA---TTTTTTTCTTTTTTAATTGAATTCTGCAAATAGGTCGATGGGGAAAATCAAACTCCCCACCTTGGAATAGAAATGATCTTTATTCTTTTGTAAAC-AAAAAAATTATTATTCAGT-------AAATAGAGGATTTCCTAATTCAATTATTTTATATATCAATCAGAAAAGCGAAGAGAGTTCCATTACGTATT-----GTGAGCTAATCAATATC-------AAATATGAAAGGGAAATCGTTAAATTATTCAATTAGATAATAA-----TTGATTGAATAATTTAAGAATAATTGAATTCTTTTTTCAAGTTGATTCAAATTATTCTAACGTTTTATTACTTATTTATTTTTGTTTGGCGTACAAAAAAACTTTTTGAATTCCCGGTAGAAAGAGATTTCGCTAACGAAAAAGCCTTTAATGCTACCCAATATCCCTTCTTTTTCCAAATAGATGTCGAAGTGCGTTTTTTTGGAACTGCCATTTAGAAATTAAAAAATTACTCATTGTTATAGCTGGATGTGAAAGACATCTATTCTTCAAAACGAATTCTTTTTACTACTATTTATTTTCGAGCTAATAGTGTCCTCCTCAAATAAAACATTATCGAGATAGGAAAAAGATATGTGAAAATTGCATAATACTGGACATAATACTGGAAATAAAAAAAGAAGGCCAATATGCG---TTTTTTTTTTCCAGTTTTTCTATTCCATAAAACATTCAGAATCGTAAAAAAGAAAAGGTTCTCTATTGAC----ATCTTTATTT--------CACATTCTTTTCTTTTTGATTCAGAAAATCTATACCTATAGAATTTGCTAATTGGCTGTTCTGTAGAAATGAAGAAATGAAATTAGTTGAACTTAAT------AAAAAAGAAAATAAAGAATCCAAAAAATACTCGATTTCTATTTATGGTTCCACATTTCATTTACATGCAATAAAATACCTCGAGAGGTTTAAAGATAAGAACCCCATTTTTACTTCAGGAAATGAAAAACCGGAATCCCC-------GTTCAATTTACTGGTAAAACCTGGGG-AAAAATGGGCCTATTTCAAAGGAGACCAGTAATTAATCCCTTTCATATCATTTGACCCATTGTAACTTCTTGATTTCAATAGTTGAAGTATTTAGCAAAGACTC--------AGAATAAGTAAGAATAGAAAATTCGATTTAAGTTTTAAATTAGTTTAAGTTAGTCCATATTTTTACTTTTTATTGACGCCTTTCAAAAGAGGTAAGATCCGGTGAATCGGAAACAATTAATTAAG---------CTTACTAAGTGATCACTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAACAAAAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTTCTGAAAACAAACAAAGGTTCAGAAAAAAA-GGATAGGTGCAGAGACTCAATGGAAGCTATTCTAACAAATGGAGTTAAATGCGTTGGTAGAGGAATCTTTACATCGAAACTTCAGAAAGAAAAAGAATGAAGTGAAGGATAAACGTATATACATACGTATTGAATACTCTATCAAATGATTAATGACGACCCGAATCCGTATTTTTT-CTATAAAAAATAGAAGAATTGGTGTGAATCGATTCTACATTGAAGAAAGAATCGAATATTCATTGATCAAATCATTCACTCCATA-----GTCTGATAGATCTTTTGAAGAACTGATTAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGGCAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGACTTTAAAAATCGTGAGGGTTCAAGTCCCTCTATCCCCAAAAAGACTATTTCACTCCCCAACTATTTATCCGACCCCCTTTCCTTAGCGGTTCCAAATTCCTTATCTTTCTCATTCACTCTATTCTTTTAGAAATGGATTTGAGCGTAAATGGCTTTTTCTTATCACAAGTCTTGTGATATATATGATACACATAGAAATGAACATCTTTGAGCAAGGAATCCCTAGTTGAATGATTCCCGATCAATACAATATCATTACTCATACTAAAACTTACAAAGTCATCTTTTTGAAGATCGAAGAAATTCCCCGGCTTTGATAAAATTTTTTAATCGACTTTTGCCCTTTTAATTGACATAGACCCCAGTTCTCTAATAAAATGAGGATACTACATTGGGAATAGCCGGGATAGCTCAGATGCTCTAACCTCTGAGCTAAGCGGGCCCACATAACAGAAATCTTATATGCATAGTAATTGACTAAACTACTGGAATTGGAATCTTAGTTATTAACTATTCAATATTATATTGAATATTCTAGAACATAAGGATTAATATAGCGATATAGAATTTCGATTTATCACAATTCTAATACCAATTCTAATACTAATATTATTAAATAGTGATTGTAAATATTGTTAATATTCTTTTATTTTCATTTTCAATTTGAATGGTAAATATTCTTTTTCATTTCTTTTTTTGGCATTTGAAATCCTTTTTATTACAGTTC-----------------------------------------TATATTTATTTCAAATTCTAATTGTTTAATGGAATGGTTAGTTATAACTAATGAGACATTCCTCCCCCTTCAGGCGAAAGTGAAGATAAAAAACAAGAATCGATCGTTCAAGTATTCCAAATTGAATGTCAAAATTACAGGAAGAGAGACATATGGATGGGGTATATATCCATCTATATTGAATTGCGGATTCCGAAATGATAAAATCATTTTTGATTGGACAAAAAAAGGTCTCCTATAGAAGATAGTTAAGAAAATCAACGAGGAGAAAACACGTTTTCGAGATAGGAATCGGTATCTAATGAATTCAATGGTTCCAGTATAAATGAAAGAAAAAGAAAAAGGAATGACATCACAACGAGATCCTAATCTCAAAACAAAAAGAAAGGGGGATATGGCGATTCTTTTTTATCTCCGGATCGGGTATTTCTGAAGTACAAAGGGGGTTATATCATCTCAT--------GGCGAATTGGCGAATTATTGGGCCGAGCTGGATTTGAACCAGCGTAGACATATTGCCAACGAATTTACAGTCCGTCCCCATTAACCGCTCGGGCATCGACCCAGGAAGAATCAATTTTAGACTTATTGGTAATCCATGATCAACTTCCTTTCGTAGTACCCTACCCCCAGGGGAATTCGAATCCCCGCTGCCTCCTTGAAAGAGAGATGTCCTAAACCACTAGACGATGGGGGCCTGCTTGACCAACGGCCATCATACTATGATCATAGTATGATCAGTTTTTTGAAATTGTCAATATAATCGAAATAATCGAATGATTCTAT-CCGAGGGATCTTTCCCCCTT-TCAGAATTGCATAGAATTCTTTTTTATTCGTCATTGATGAATTATTCATTAGAACCGCCATTAGAAATCTAGTAGTAGTATTTTTTGATTTTGGAATTATTTCAATTGAATTTATTTTGATTATTTTAGTTTAGATTATTTAGTATTTCGAATTTTATTTCGAATTTGCTTTTTTTAGTTAGAAATTTGTAAATAAAAAAAAGTAATAAATACAAAAAATAGAAATAATAAGGAAGAGTCGGATTTTTTCAGGGAATGATTGGTCCGTCAGAAAAGGAAAAAGGTGTGAAATTCGCTTTCTTT-CACTTTCATTTGATTCATTGTTAAGACGAGATATCCTTATCTCCCTCCCACCAAGACAGGAAATTAACAAACGAGAAATCTAGTAAGCGGGATCAAGCAGAAAATTCTTTTTTCTCCAAGAATTTAGTTCAGGAGACAAGTAGAATCTCTTCATTCCATGATTCGATGAAATATCTTGAATTTTATGTTGAATTGCTAGGTGTATGTAC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; END; BEGIN SETS; CHARSET Indel_2 (CHARACTERS = 15_taxa_9_cpDNA_spacers_plus_indels) = 8409; CHARSET trnT_trnL (CHARACTERS = 15_taxa_9_cpDNA_spacers_plus_indels) = 3321-4073; CHARSET trnV_ndhC (CHARACTERS = 15_taxa_9_cpDNA_spacers_plus_indels) = 5233-6365; CHARSET Indel_7 (CHARACTERS = 15_taxa_9_cpDNA_spacers_plus_indels) = 8414; CHARSET Indel_9 (CHARACTERS = 15_taxa_9_cpDNA_spacers_plus_indels) = 8416; CHARSET trnQ_rps16 (CHARACTERS = 15_taxa_9_cpDNA_spacers_plus_indels) = 6366-7611; CHARSET rpl32_ndhF (CHARACTERS = 15_taxa_9_cpDNA_spacers_plus_indels) = 1566-2416; CHARSET Indel_8 (CHARACTERS = 15_taxa_9_cpDNA_spacers_plus_indels) = 8415; CHARSET trnL_trnF (CHARACTERS = 15_taxa_9_cpDNA_spacers_plus_indels) = 2417-3320; CHARSET Indel_3 (CHARACTERS = 15_taxa_9_cpDNA_spacers_plus_indels) = 8410; CHARSET Indel_5 (CHARACTERS = 15_taxa_9_cpDNA_spacers_plus_indels) = 8412; CHARSET Indel_4 (CHARACTERS = 15_taxa_9_cpDNA_spacers_plus_indels) = 8411; CHARSET Indel_10 (CHARACTERS = 15_taxa_9_cpDNA_spacers_plus_indels) = 8417; CHARSET trnL_rpl32 (CHARACTERS = 15_taxa_9_cpDNA_spacers_plus_indels) = 522-1565; CHARSET rps16_trnK (CHARACTERS = 15_taxa_9_cpDNA_spacers_plus_indels) = 7612-8407; CHARSET trnH_psbA (CHARACTERS = 15_taxa_9_cpDNA_spacers_plus_indels) = 1-521; CHARSET Indel_6 (CHARACTERS = 15_taxa_9_cpDNA_spacers_plus_indels) = 8413; CHARSET trnD_trnT (CHARACTERS = 15_taxa_9_cpDNA_spacers_plus_indels) = 4074-5232; CHARSET Indel_1 (CHARACTERS = 15_taxa_9_cpDNA_spacers_plus_indels) = 8408; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = 15_taxa_9_cpDNA_spacers_plus_indels) = N: 1-8417; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = 15_taxa_9_cpDNA_spacers_plus_indels) = N: 1-8417; END; BEGIN TREES; TITLE Tb9515; LINK TAXA = Taxa2; TRANSLATE 1 Atropa_belladonna, 2 Nolana_werdermannii, 3 Nolana_coelestis, 4 Lycium_americanum, 5 Lycium_andersonii, 6 Lycium_californicum, 7 Lycium_cestroides, 8 Lycium_chanar, 9 Lycium_chilense, 10 Lycium_ciliatum, 11 Lycium_cinereum, 12 Lycium_cuneatum, 13 Lycium_ferocissimum, 14 Lycium_hirsutum, 15 Lycium_nodosum, 16 Lycium_oxycarpum, 17 Lycium_parishii, 18 Lycium_puberulum, 19 Lycium_pumilum, 20 Lycium_rachidocladum, 21 Lycium_chinense, 22 Lycium_shockleyi, 23 Lycium_tenue, 24 Lycium_villosum, 25 Phrodus_microphyllus; TREE Fig._3A = [&R] (1,((2,3),((18,22),(((16,19,23,13,11),(21,(14,24))),(25,((12,8),7,15,((9,10),((17,5,6),(4,20))))))))); END; BEGIN TREES; TITLE Tb9516; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Atropa_belladonna, 2 Nolana_werdermannii, 3 Nolana_coelestis, 4 Lycium_americanum, 5 Lycium_cestroides, 6 Lycium_chanar, 7 Lycium_chilense, 8 Lycium_cinereum, 9 Lycium_ferocissimum, 10 Lycium_hirsutum, 11 Lycium_nodosum, 12 Lycium_parishii, 13 Lycium_shockleyi, 14 Lycium_villosum, 15 Phrodus_microphyllus; TREE Fig._3B = [&R] (1,((2,3),(13,(((14,10),(9,8)),(15,(5,6,11,(7,(4,12)))))))); END;