#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 24, 2024; 13:41 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: De luca D., Sarno D., Piredda R., & Kooistra W. 2019. A multigene phylogeny to infer the evolutionary history of Chaetocerotaceae (Bacillariophyta). Molecular Phylogenetics and Evolution, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S24825] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=100; TAXLABELS Bacteriastrum_elegans_Na25A3 Bacteriastrum_furcatum_2_Na8A3 Bacteriastrum_hyalinum_Na10B1 Bacteriastrum_jadranum_Na19C1 Bacteriastrum_jadranum_Na19C3 Bacteriastrum_mediterraneum_Na1C4 Bacteriastrum_mediterraneum_Na29B3 Bacteriastrum_parallelum_newLA2 Chaetoceros_affinis_Na49A2 Chaetoceros_anastomosans_Na14C2 Chaetoceros_anastomosans_Na14C3 Chaetoceros_brevis_1_Na7B1 Chaetoceros_brevis_2_Na7C2 Chaetoceros_brevis_3_Ch9B3 Chaetoceros_cf._convolutus_Ch5C4 Chaetoceros_cf._convolutus_L7B6 Chaetoceros_cf._decipiens_El6B1 Chaetoceros_cf._lorenzianus_El1A4 Chaetoceros_cf._pseudodichaeta_EL1C1 Chaetoceros_cf._tortissimus_Na18C4 Chaetoceros_cf._tortissimus_Na28B3 Chaetoceros_cf._vixvisibilis_Na25C3 Chaetoceros_cf._vixvisibilis_Na28A4 Chaetoceros_cinctus_Ch3C4 Chaetoceros_circinalis_Na15C2 Chaetoceros_constrictus_Ch12C1 Chaetoceros_contortus_Ch12A4 Chaetoceros_contortus_cf._var._contortus_Na31B2 Chaetoceros_costatus_Na1A3 Chaetoceros_costatus_Ro1B1 Chaetoceros_costatus_Ro2A2 Chaetoceros_curvisetus_1_Na10C1 Chaetoceros_curvisetus_1_Ro3B2 Chaetoceros_curvisetus_2a_Na1C1 Chaetoceros_curvisetus_2b_Ch5B1 Chaetoceros_curvisetus_2c_El6A2 Chaetoceros_curvisetus_3_El4A2 Chaetoceros_curvisetus_3_Na3C4 Chaetoceros_danicus_Na9B4 Chaetoceros_debilis_2_MM24A3 Chaetoceros_debilis_2_MM24C3 Chaetoceros_debilis_3_Ch1A1 Chaetoceros_debilis_3_Ch9A3 Chaetoceros_decipiens_Na28A2 Chaetoceros_diadema_1_Ch4A1 Chaetoceros_diadema_1_Na13B1 Chaetoceros_diadema_2_Ch5C1 Chaetoceros_dichatoensis_Ch1B3 Chaetoceros_didymus_1_Ch6A3 Chaetoceros_didymus_2_Na20B4 Chaetoceros_diversus_1_Na23B1 Chaetoceros_diversus_1_Na3C1 Chaetoceros_diversus_1_Na50B2 Chaetoceros_diversus_1_Na5B2 Chaetoceros_eibenii_Ch8C3 Chaetoceros_eibenii_Ro1B2 Chaetoceros_elegans_Ch12A1 Chaetoceros_lauderi_Na13A4 Chaetoceros_lauderi_Na2A1 Chaetoceros_lauderi_Na34C3 Chaetoceros_lauderi_Na36A1 Chaetoceros_lorenzianus_1_Ch11C1 Chaetoceros_lorenzianus_1_Ch4C3 Chaetoceros_lorenzianus_2_Ch11A1 Chaetoceros_lorenzianus_2_Ch13B4 Chaetoceros_lorenzianus_2_Ch4A3 Chaetoceros_lorenzianus_2_Ch4C4 Chaetoceros_peruvianus_1_newEA1 Chaetoceros_peruvianus_2_Ch11B4 Chaetoceros_protuberans_Ch8C2 Chaetoceros_pseudocurvisetus_Na13C4 Chaetoceros_radicans_Ch10A3 Chaetoceros_radicans_Ch11A4 Chaetoceros_rostratus_Na1C3 Chaetoceros_rostratus_newDA3 Chaetoceros_rotosporus_Na22B1 Chaetoceros_rotosporus_Na23A1 Chaetoceros_socialis_Na33B1 Chaetoceros_sp._Clade_Na11C3_Na11C3 Chaetoceros_sp._Clade_Na11C3_Na43A1 Chaetoceros_sp._Clade_Na12A3_Na9A3 Chaetoceros_sp._Clade_Na13C2_Na13C2 Chaetoceros_sp._Clade_Na17B2_Na17B2 Chaetoceros_sp._Clade_Na26B1_Na26B1 Chaetoceros_sp._Clade_Na28A1_Na28A1 Chaetoceros_sp._Clade_Va7D2_Na43A4 Chaetoceros_sp._Clade_Va7D2_Na44B3 Chaetoceros_sporotruncatus_Ch2A4 Chaetoceros_sporotruncatus_Ch9C4 Chaetoceros_tenuissimus_Na26A1 Chaetoceros_tenuissimus_Na36B4 Chaetoceros_tenuissimus_Na44A1 Chaetoceros_teres_Ch13B2 Chaetoceros_teres_Ch5A1 Chaetoceros_throndsenii_Na45B3 Chaetoceros_tortissimus_Na25A2 Detonula_confervacea_CCMP353 Hydrosera_sp._CYTX025 Terpsinoe_musica_NHOP43 Thalassiosira_pseudonana_CCMP1335 ; 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Chaetoceros_brevis_1_Na7B1 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Chaetoceros_cf._vixvisibilis_Na25C3 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Chaetoceros_radicans_Ch10A3 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Chaetoceros_sp._Clade_Na11C3_Na11C3 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Chaetoceros_sporotruncatus_Ch2A4 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Chaetoceros_sporotruncatus_Ch9C4 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Chaetoceros_tortissimus_Na25A2 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Chaetoceros_cf._convolutus_Ch5C4 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Chaetoceros_cf._tortissimus_Na18C4 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Chaetoceros_cf._tortissimus_Na28B3 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Chaetoceros_contortus_Ch12A4 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Chaetoceros_lorenzianus_2_Ch4A3 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Chaetoceros_radicans_Ch10A3 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Hydrosera_sp._CYTX025 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Terpsinoe_musica_NHOP43 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Bacteriastrum_mediterraneum_Na29B3 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Chaetoceros_anastomosans_Na14C3 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Chaetoceros_cf._convolutus_Ch5C4 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Chaetoceros_contortus_Ch12A4 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Chaetoceros_decipiens_Na28A2 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Chaetoceros_dichatoensis_Ch1B3 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Chaetoceros_eibenii_Ro1B2 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Chaetoceros_lauderi_Na34C3 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Chaetoceros_radicans_Ch10A3 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Chaetoceros_rotosporus_Na22B1 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Chaetoceros_sporotruncatus_Ch2A4 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Chaetoceros_tenuissimus_Na44A1 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Chaetoceros_throndsenii_Na45B3 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Terpsinoe_musica_NHOP43 GCATGTCTAAGTATAAA---TACTTCTACCGTGAAA-CTGCAAATGGCTCATTATATCAGTTATAGTTTATTTGATAATCCC-TTACTACTTGGATATCCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACATGCGTTGCTACCAGACTGTTTTCGGAATGGTAGTGCTTATTAGATTGAAACCAACCTGCCTTGGCAGTGCTCTGGTGATTCATGATAACT-TTGCGAATTGCACGGCGTTA-AGCTGGCAATGGATCATTCAAGTTTCTGCCCTATCAGCTTG-GATGGTAGTGTATTGGACTACCATGGCTTTAACGGGTAACGGATAATTAGGGTTTGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAGACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGTAAATTACCCAATCCTGATACAGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATGCTGGGCCT--CTATAGGTCTGGCAATTGGAATGAGAACAATTTAAATCCCTTAACAAGGATCAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAATTTCTGG-TTGATGGGATGGACCCGACACTATGTGTGGGTGTTTTCATCATTGTCAGCCATCTTTGGAGTGAACTCATGTGGCATTGAGTTGTCGTGTGGG-GGATGTCTATCGTTTACTGTGAACAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGC-TTATGCCATTGAATACATTAGCATGGAATAATGAGATAGGACCCTGGTA--CTATTTTGTTGGTTTGTGCACCAAGGTAATGATTAACAGGAACAG-TTGTGGGTATTCGTATTCAGCAGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTGCGGAAGACGAACTACTGCGAAAGCATTTACCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGATCGAAGATGATTAGATACCATCGTAGTCTCAACCATAAACTATGCCATCTCAGGATCGACGAGTG--TTACTAGAACCTCGCCGGCACTGTATGAGAAATCAAAGTCTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGAAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTCAATTTGACTCAACACGGGAAAACTTACCAGGTCCAGACATGCTTAGGATTGACAGGTCGA-AGCTCTTTCTTGATTGTATGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGTGATTTGTCTGGTTAATTCCGTTAACGAACGAGACCTCAGCCTGCTAAATAATATCGTCAATGACTAGTCATTGTCAGGTATTTCTTAGAGGGACATGGAGTTACCAAGCTCCAGGAAGACTGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTCCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATGTATTCAACAAGTGTAAAACCTTGGCTGAGAAG-CCTGGGAAATCTTGTGAACGTGCATCGTGATAGGGATAGATTATTGCAATTATTAATCTTGAACGAGGAATTCCTAGTAAATGCAGATCATCAATCTGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCACCTAA----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TACTGGGATGCTTCATACGCAGTAAAAATAACTGACATTCTTGCATTATTCCGTATCACACCACAACCAGGTGTAGATCCAGTAGAAGCTGCAGCAGCAGTAGCAGGTGAATCTTCAACAGCAACTTGGACAGTTGTTTGGACAGATTTATTAACTGCTTGTGACCGTTACCGTGCTAAAGCTTACCGTGTAGATCCAGTTCCTAATACAACAGATCAATATTTTGCTTTTATTGCTTATGAATGTGATTTATTTGAAGAAGGTTCATTAGCAAACTTAACAGCATCAATTATTGGTAACGTTTTTGGTTTTAAAGCAGTTTCTGCTTTACGTTTAGAAGATATGCGTCTTCCACATTCATACTTAAAAACGTTCCAAGGTCCTGCAACAGGTGTTATTGTTGAACGTGAACGTTTAAACAAATATGGTACACCTCTATTAGGTGCTACTGTAAAACCTAAGTTAGGTTTATCTGGTAAAAACTATGGTCGTGTAGTTTATGAAGGTTTAAAAGGCGGTTTAGACTTCTTAAAAGATGATGAAAACATTAACTCTCAACCATTTATGCGTTGGAGAGAACGTTTCTTATACTGTATAGAAGGTATTAACCGTGCTTCTGCTGCAACAGGTGAAATTAAAGGTTCATACTTTAACGTAACTGCTGGAACTATGAACGAAGTTTACACTCGTGCAGAATATGCGAAACAAACAGGTACAGTAATTATTATGATTGACTTAGTACTTGGTTATACAGCAATCCAAAGTGCAGCAGTCTGGGCTCGTGAAAACGATTTAATTTTACATTTACACCGTGCGGGCAACTCTACATATGCTCGTCAAAAAAATCATGGTATTAACTTCCGTGTTATTTGTAAATGGATGCGTATGGCTGGTGTAGACCACATTCATGCTGGTACAGTAGTTGGTAAATTAGAGGGTGACCCTTTAATGATTAAAGGTTTCTATGATACTTTATTAAAAACATCTTTAGAAGTTAACTTACCGTACGGTTTCTTCTTCGAAATGGACTGGGCTAGCTTACGTAAGTGTCTACCTGTTGCTTCAGGTGGTATTCACTGTGGTCAAATGCACCAACTAGTACACTACTTAGGTGATGACGTAGTATTACAATTTGGTGGTGGTACAATTGGTCACCCTGATGGTATTCAAGCAGGTGCTACAGCAAACCGTGTTGCTTTAGAATCAATGATTTTAGCTCGTAATGAAGGTGCTGACTACTTTAACCAAGAAGTTGGTCCTCAAATTTTACGTGACGCAGCTAAAACATGTGGTCCTTTACAAACAGCTTTA---------------------------------------------------------------ATGTTCCCTACATTATTAACAGCAACTACTTGTTATATTATTGCATTTATCGCAGCTCCTCCAGTAGATATTGATGGTATTCGTGAGCCTGTAGCTGGTTCTTTATTATATGGTAACAACATCATTACTGGTGCAGTTATCCCTAGTTCAAATGCTATTGGTATGCACTTCTACCCAATTTGGGAAGCAGCTTCTATTGATGAATGGTTATACAATGGTGGTCCTTACCAATTAATCGTATTACACTTCTTATTAGGTGTTGCAGCTTACATGGGTCGTGAGTGGGAATTAAGCTACCGTTTAGGTATGCGTCCATGGATTTTCGTTGCATTCTCTGCTCCAGTAGCAGCAGCATCAGCGGTATTCTTAATCTATCCTCTTGGTCAAGGTTCTTTCTCTGATGGTATGCCTTTAGGTATCTCTGGTACTTTCAACTTTATGATAGTATTCCAAGCTGAACACAACATCTTAATGCACCCATTCCACATGGCTGGTGTTGCTGGTGTATTTGGTGGTTCTTTATTCAGTGCTATGCACGGTTCATTAGTAACTTCTAGTTTAATCCGTGAAACTACTGAAAACGAATCTACTAACTACGGTTACAAGTTTGGTCAAGAAGAAGAAACATACAACATCGTAGCAGCACATGGTTACTTTGGTCGTTTAATCTTCCAATACGCATCATTCAACAACTCTCGTGCTTTACACTTCTTCTTAGCTTTATGGCCAGTTCTAGGTATCTGGTTAACTGCTATGGGTATTAGTACTATGGCATTCAACTTAAACGGTTTCAACTTCAACCAATCTGTTGTTGATTCTCAAGGTCGTGTAATTAACACATGGGCTGAC------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------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Thalassiosira_pseudonana_CCMP1335 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------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ ; END; BEGIN TREES; TITLE Chaetocerotaceae_MLT_mtDNA; LINK TAXA = Taxa7; TRANSLATE 1 Chaetoceros_eibenii_Ch8C3, 2 Chaetoceros_contortus_Ch12A4, 3 Chaetoceros_cf._convolutus_Ch5C4, 4 Chaetoceros_danicus_Na9B4, 5 Chaetoceros_lauderi_Na2A1, 6 Chaetoceros_lauderi_Na13A4, 7 Chaetoceros_brevis_1_Na7B1, 8 Chaetoceros_radicans_Ch11A4, 9 Chaetoceros_radicans_Ch10A3, 10 Chaetoceros_cf._tortissimus_Na28B3, 11 Chaetoceros_tenuissimus_Na44A1, 12 Chaetoceros_cinctus_Ch3C4, 13 Chaetoceros_socialis_Na33B1, 14 Chaetoceros_dichatoensis_Ch1B3, 15 Chaetoceros_tortissimus_Na25A2, 16 Chaetoceros_pseudocurvisetus_Na13C4, 17 Chaetoceros_curvisetus_1_Na10C1, 18 Chaetoceros_curvisetus_3_Na3C4, 19 Chaetoceros_curvisetus_2b_Ch5B1, 20 Chaetoceros_costatus_Ro1B1, 21 Chaetoceros_curvisetus_2c_El6A2, 22 Chaetoceros_curvisetus_3_El4A2, 23 Chaetoceros_debilis_3_Ch9A3, 24 Chaetoceros_debilis_3_Ch1A1, 25 Chaetoceros_debilis_2_MM24C3, 26 Chaetoceros_diadema_1_Ch4A1, 27 Chaetoceros_diadema_2_Ch5C1, 28 Chaetoceros_diadema_1_Na13B1, 29 Chaetoceros_diversus_1_Na5B2, 30 Chaetoceros_rotosporus_Na23A1, 31 Chaetoceros_rotosporus_Na22B1, 32 Chaetoceros_sp._Clade_Va7D2_Na44B3, 33 Chaetoceros_sp._Clade_Na28A1_Na28A1, 34 Chaetoceros_cf._vixvisibilis_Na28A4, 35 Chaetoceros_cf._vixvisibilis_Na25C3, 36 Chaetoceros_throndsenii_Na45B3, 37 Chaetoceros_anastomosans_Na14C3, 38 Chaetoceros_anastomosans_Na14C2, 39 Chaetoceros_sp._Clade_Na11C3_Na43A1, 40 Chaetoceros_sp._Clade_Na26B1_Na26B1, 41 Chaetoceros_lorenzianus_1_Ch11C1, 42 Chaetoceros_decipiens_Na28A2, 43 Chaetoceros_cf._decipiens_El6B1, 44 Chaetoceros_lorenzianus_2_Ch4A3, 45 Chaetoceros_lorenzianus_2_Ch4C4, 46 Chaetoceros_lorenzianus_1_Ch4C3, 47 Chaetoceros_cf._lorenzianus_El1A4, 48 Chaetoceros_protuberans_Ch8C2, 49 Bacteriastrum_hyalinum_Na10B1, 50 Bacteriastrum_parallelum_newLA2, 51 Bacteriastrum_mediterraneum_Na29B3, 52 Bacteriastrum_mediterraneum_Na1C4; TREE Fig._A.3 = [&R] ((((1:0.30975783,2:0.92384272):0.13693862,(3:0.27336263,4:0.45104426):1.0232035):0.17626938,(((((5:1.0E-6,6:1.0E-6):0.67795656,7:0.63164342):1.0E-6,((8:1.0E-6,9:1.0E-6):0.31972231,(((10:0.57198093,11:0.14909039):0.28739944,(12:0.31355503,(13:0.21605687,14:0.11817364):0.09134273):0.08192868):0.06100009,(15:0.40571524,((16:0.65911454,(17:0.19154952,(18:0.30818798,(((19:0.10973361,20:0.07718081):0.06492016,21:0.13844501):0.34856971,22:0.36820598):0.0201455):0.15210978):0.07214932):0.4905029,((23:1.0E-6,24:1.0E-6):0.14296593,25:0.05985746):0.29181247):0.02689849):0.19633262):0.01495411):0.12017192):0.05020575,((26:0.08184092,(27:0.2537513,28:0.13132569):0.0463896):0.43495726,(29:0.6715968,((30:1.0E-6,31:0.00523646):0.48613647,((32:0.49642073,((33:0.43338233,((34:1.0E-6,35:1.0E-6):0.32644415,(36:0.6294723,(37:1.0E-6,38:1.0E-6):0.38568534):0.16600405):0.06569728):0.07228107,(39:0.06604807,40:0.15840888):0.13250962):0.06221389):0.16619332,((41:0.4274854,((42:0.02510205,43:0.1228564):0.33438254,(44:0.0109691,45:1.0E-6):0.10219317):0.10587342):0.03934351,(46:1.0E-6,47:1.0E-6):0.61177274):0.14337608):0.1171789):0.0141156):0.05272248):0.10142034):0.05454592,48:0.58651152):0.10937118):0.46392622,(49:0.30848417,(50:0.43279973,(51:1.0E-6,52:1.0E-6):0.50336151):0.50696899):0.46392622); END; BEGIN TREES; TITLE Chaetocerotaceae_MLT; LINK TAXA = Taxa3; TRANSLATE 1 Bacteriastrum_hyalinum_Na10B1, 2 Bacteriastrum_mediterraneum_Na1C4, 3 Bacteriastrum_mediterraneum_Na29B3, 4 Bacteriastrum_jadranum_Na19C3, 5 Bacteriastrum_jadranum_Na19C1, 6 Bacteriastrum_furcatum_2_Na8A3, 7 Bacteriastrum_elegans_Na25A3, 8 Bacteriastrum_parallelum_newLA2, 9 Chaetoceros_protuberans_Ch8C2, 10 Chaetoceros_didymus_2_Na20B4, 11 Chaetoceros_didymus_1_Ch6A3, 12 Chaetoceros_eibenii_Ro1B2, 13 Chaetoceros_eibenii_Ch8C3, 14 Chaetoceros_cf._pseudodichaeta_EL1C1, 15 Chaetoceros_danicus_Na9B4, 16 Chaetoceros_cf._convolutus_Ch5C4, 17 Chaetoceros_cf._convolutus_L7B6, 18 Chaetoceros_peruvianus_2_Ch11B4, 19 Chaetoceros_rostratus_Na1C3, 20 Chaetoceros_rostratus_newDA3, 21 Chaetoceros_peruvianus_1_newEA1, 22 Chaetoceros_contortus_Ch12A4, 23 Chaetoceros_contortus_cf._var._contortus_Na31B2, 24 Chaetoceros_tortissimus_Na25A2, 25 Chaetoceros_cf._tortissimus_Na28B3, 26 Chaetoceros_cf._tortissimus_Na18C4, 27 Chaetoceros_curvisetus_1_Ro3B2, 28 Chaetoceros_curvisetus_1_Na10C1, 29 Chaetoceros_curvisetus_3_El4A2, 30 Chaetoceros_curvisetus_3_Na3C4, 31 Chaetoceros_pseudocurvisetus_Na13C4, 32 Chaetoceros_curvisetus_2c_El6A2, 33 Chaetoceros_curvisetus_2a_Na1C1, 34 Chaetoceros_curvisetus_2b_Ch5B1, 35 Chaetoceros_debilis_2_MM24A3, 36 Chaetoceros_debilis_2_MM24C3, 37 Chaetoceros_debilis_3_Ch9A3, 38 Chaetoceros_debilis_3_Ch1A1, 39 Chaetoceros_tenuissimus_Na26A1, 40 Chaetoceros_tenuissimus_Na44A1, 41 Chaetoceros_cinctus_Ch3C4, 42 Chaetoceros_radicans_Ch11A4, 43 Chaetoceros_radicans_Ch10A3, 44 Chaetoceros_dichatoensis_Ch1B3, 45 Chaetoceros_sporotruncatus_Ch9C4, 46 Chaetoceros_sporotruncatus_Ch2A4, 47 Chaetoceros_socialis_Na33B1, 48 Chaetoceros_costatus_Na1A3, 49 Chaetoceros_costatus_Ro1B1, 50 Chaetoceros_costatus_Ro2A2, 51 Chaetoceros_brevis_3_Ch9B3, 52 Chaetoceros_brevis_2_Na7C2, 53 Chaetoceros_brevis_1_Na7B1, 54 Chaetoceros_teres_Ch5A1, 55 Chaetoceros_teres_Ch13B2, 56 Chaetoceros_lauderi_Na34C3, 57 Chaetoceros_lauderi_Na13A4, 58 Chaetoceros_lauderi_Na2A1, 59 Chaetoceros_sp._Clade_Na13C2_Na13C2, 60 Chaetoceros_circinalis_Na15C2, 61 Chaetoceros_sp._Clade_Na17B2_Na17B2, 62 Chaetoceros_sp._Clade_Na12A3_Na9A3, 63 Chaetoceros_diversus_1_Na23B1, 64 Chaetoceros_diversus_1_Na50B2, 65 Chaetoceros_diversus_1_Na5B2, 66 Chaetoceros_diversus_1_Na3C1, 67 Chaetoceros_affinis_Na49A2, 68 Chaetoceros_throndsenii_Na45B3, 69 Chaetoceros_elegans_Ch12A1, 70 Chaetoceros_lorenzianus_2_Ch11A1, 71 Chaetoceros_lorenzianus_2_Ch4A3, 72 Chaetoceros_lorenzianus_2_Ch4C4, 73 Chaetoceros_lorenzianus_2_Ch13B4, 74 Chaetoceros_cf._decipiens_El6B1, 75 Chaetoceros_decipiens_Na28A2, 76 Chaetoceros_lorenzianus_1_Ch11C1, 77 Chaetoceros_lorenzianus_1_Ch4C3, 78 Chaetoceros_sp._Clade_Va7D2_Na44B3, 79 Chaetoceros_sp._Clade_Va7D2_Na43A4, 80 Chaetoceros_sp._Clade_Na28A1_Na28A1, 81 Chaetoceros_anastomosans_Na14C2, 82 Chaetoceros_anastomosans_Na14C3, 83 Chaetoceros_cf._vixvisibilis_Na25C3, 84 Chaetoceros_cf._vixvisibilis_Na28A4, 85 Chaetoceros_sp._Clade_Na26B1_Na26B1, 86 Chaetoceros_sp._Clade_Na11C3_Na11C3, 87 Chaetoceros_sp._Clade_Na11C3_Na43A1, 88 Chaetoceros_constrictus_Ch12C1, 89 Chaetoceros_rotosporus_Na22B1, 90 Chaetoceros_rotosporus_Na23A1, 91 Chaetoceros_diadema_1_Ch4A1, 92 Chaetoceros_diadema_1_Na13B1, 93 Chaetoceros_diadema_2_Ch5C1, 94 Hydrosera_sp._CYTX025, 95 Terpsinoe_musica_NHOP43, 96 Detonula_confervacea_CCMP353, 97 Thalassiosira_pseudonana_CCMP1335; TREE Fig._A.1 = [&R] (((1:0.02201043,(((2:1.0E-6,3:1.0E-6):0.01512832,(((4:5.0365E-4,5:1.0E-6):0.00505816,6:0.00215471):0.01902769,7:0.02764035):0.01771731):0.00666001,8:0.03800278):0.05292522):0.10147976,(((9:0.06329307,(10:0.00693005,11:0.00765694):0.03547084):0.04439542,((12:4.4342E-4,13:1.0E-6):0.01875368,(14:0.02035592,(((15:0.00836495,16:0.00781385):0.00684257,17:0.00495117):0.00849457,(18:0.00271141,((19:1.0E-6,20:9.6252E-4):0.00529744,21:0.00354254):0.00132875):0.00802437):0.03269909):0.01280726):0.00471076):0.02201494,((22:0.00112227,23:0.00475148):0.0573616,(((((24:0.02481905,(25:1.0E-6,26:4.5211E-4):0.02699683):0.10428324,((((27:1.0E-6,28:1.0E-6):0.03070962,((29:0.01058219,30:0.03177334):0.00711522,31:0.01849148):0.00419999):0.0072626,(32:0.01007182,(33:1.0E-6,34:0.01200067):0.00922304):0.03076519):0.03041581,((35:1.0E-6,36:9.176E-4):0.02040371,(37:1.0E-6,38:1.0E-6):0.00690172):0.24444346):0.01041189):0.05416071,((39:4.5687E-4,40:4.5162E-4):0.12329317,(((41:0.06475278,(42:1.0E-6,43:4.4684E-4):0.04030191):0.02938591,((44:0.00342753,(45:1.0E-6,46:1.0E-6):0.00421658):0.02205115,47:0.02109229):0.00792057):0.03304983,(48:1.0E-6,(49:4.428E-4,50:1.0E-6):4.4255E-4):0.04966064):0.01185218):0.03260881):0.01316668,((51:0.01111346,(52:0.00921113,53:0.01010817):0.00120868):0.03427578,((54:8.876E-4,55:1.0E-6):0.00785856,(56:4.4325E-4,(57:1.0E-6,58:8.8679E-4):1.0E-6):0.01459397):0.03791481):0.03091491):0.01717641,((59:0.03048594,((60:0.03527805,(61:0.0200153,62:0.00677797):0.010659):0.00859977,((63:1.0E-6,(64:0.00107859,(65:4.487E-4,66:8.9916E-4):4.4793E-4):4.4897E-4):0.00944838,67:0.00736114):0.0105416):0.01909916):0.02420762,(((68:0.04510924,((69:0.01989175,((70:4.8272E-4,((71:1.0E-6,72:1.0E-6):1.0E-6,73:1.0E-6):4.8485E-4):0.00727373,(74:0.00255921,75:0.00283788):0.00451719):0.00606939):0.00654308,(76:1.0E-6,77:1.0E-6):0.01545205):0.01722835):0.00901687,((78:8.7233E-4,79:1.0E-6):0.01982491,(80:0.01409732,((81:1.0E-6,82:4.9109E-4):0.00654274,((83:4.9276E-4,84:1.0E-6):0.00885275,(85:0.00392697,(86:1.0E-6,87:1.0E-6):5.3252E-4):0.01109492):0.00391717):0.01014815):0.01043032):0.04707646):0.01014368,(88:0.03667805,((89:1.0E-6,90:1.0E-6):0.01311604,((91:0.0013367,92:1.0E-6):0.00332229,93:0.00117476):0.00868192):0.02061969):0.00649121):0.00272991):0.04421756):0.00399579):0.00657423):0.01204459):0.01859029,((94:0.12321262,95:0.11376556):0.02536582,(96:0.02245691,97:0.03835552):0.07313299):0.01859029); 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Chaetoceros_decipiens_Na28A2, 27 Chaetoceros_cf._decipiens_El6B1, 28 Chaetoceros_lorenzianus_2_Ch11A1, 29 Chaetoceros_lorenzianus_2_Ch13B4, 30 Chaetoceros_lorenzianus_2_Ch4A3, 31 Chaetoceros_lorenzianus_2_Ch4C4, 32 Chaetoceros_elegans_Ch12A1, 33 Chaetoceros_lorenzianus_1_Ch11C1, 34 Chaetoceros_lorenzianus_1_Ch4C3, 35 Chaetoceros_cf._lorenzianus_El1A4, 36 Chaetoceros_throndsenii_Na45B3, 37 Chaetoceros_diadema_1_Ch4A1, 38 Chaetoceros_diadema_1_Na13B1, 39 Chaetoceros_diadema_2_Ch5C1, 40 Chaetoceros_rotosporus_Na22B1, 41 Chaetoceros_rotosporus_Na23A1, 42 Chaetoceros_brevis_1_Na7B1, 43 Chaetoceros_brevis_2_Na7C2, 44 Chaetoceros_brevis_3_Ch9B3, 45 Chaetoceros_lauderi_Na13A4, 46 Chaetoceros_lauderi_Na2A1, 47 Chaetoceros_lauderi_Na34C3, 48 Chaetoceros_lauderi_Na36A1, 49 Chaetoceros_teres_Ch13B2, 50 Chaetoceros_teres_Ch5A1, 51 Chaetoceros_cf._tortissimus_Na18C4, 52 Chaetoceros_cf._tortissimus_Na28B3, 53 Chaetoceros_tortissimus_Na25A2, 54 Chaetoceros_curvisetus_1_Na10C1, 55 Chaetoceros_curvisetus_1_Ro3B2, 56 Chaetoceros_curvisetus_3_El4A2, 57 Chaetoceros_curvisetus_3_Na3C4, 58 Chaetoceros_pseudocurvisetus_Na13C4, 59 Chaetoceros_curvisetus_2a_Na1C1, 60 Chaetoceros_curvisetus_2b_Ch5B1, 61 Chaetoceros_curvisetus_2c_El6A2, 62 Chaetoceros_debilis_2_MM24A3, 63 Chaetoceros_debilis_2_MM24C3, 64 Chaetoceros_debilis_3_Ch1A1, 65 Chaetoceros_debilis_3_Ch9A3, 66 Chaetoceros_cinctus_Ch3C4, 67 Chaetoceros_radicans_Ch10A3, 68 Chaetoceros_radicans_Ch11A4, 69 Chaetoceros_dichatoensis_Ch1B3, 70 Chaetoceros_sporotruncatus_Ch2A4, 71 Chaetoceros_sporotruncatus_Ch9C4, 72 Chaetoceros_socialis_Na33B1, 73 Chaetoceros_costatus_Na1A3, 74 Chaetoceros_costatus_Ro1B1, 75 Chaetoceros_costatus_Ro2A2, 76 Chaetoceros_tenuissimus_Na26A1, 77 Chaetoceros_tenuissimus_Na36B4, 78 Chaetoceros_tenuissimus_Na44A1, 79 Chaetoceros_contortus_cf._var._contortus_Na31B2, 80 Chaetoceros_contortus_Ch12A4, 81 Chaetoceros_cf._convolutus_Ch5C4, 82 Chaetoceros_danicus_Na9B4, 83 Chaetoceros_cf._convolutus_L7B6, 84 Chaetoceros_peruvianus_1_newEA1, 85 Chaetoceros_peruvianus_2_Ch11B4, 86 Chaetoceros_rostratus_Na1C3, 87 Chaetoceros_rostratus_newDA3, 88 Chaetoceros_cf._pseudodichaeta_EL1C1, 89 Chaetoceros_eibenii_Ch8C3, 90 Chaetoceros_eibenii_Ro1B2, 91 Chaetoceros_didymus_1_Ch6A3, 92 Chaetoceros_didymus_2_Na20B4, 93 Chaetoceros_protuberans_Ch8C2, 94 Detonula_confervacea_CCMP353, 95 Thalassiosira_pseudonana_CCMP1335, 96 Hydrosera_sp._CYTX025, 97 Terpsinoe_musica_NHOP43, 98 Bacteriastrum_parallelum_newLA2, 99 Bacteriastrum_mediterraneum_Na1C4, 100 Bacteriastrum_mediterraneum_Na29B3; TREE Fig._A.4 = [&R] (1,(2,(3,4)),(((5,(((((((6,(7,((8,9),10))),(11,(12,13))),14),((((15,16),((17,18),((19,20),21))),22),(23,24)),25,(((((26,27),(28,(29,30,31))),32),(33,(34,35))),36),(((37,38),39),(40,41))),((((42,43),44),((45,46,47,48),(49,50))),(((((51,52),53),(((54,55),(56,57),58),((59,60),61))),((62,63),(64,65))),((((66,(67,68)),((69,(70,71)),72)),(73,(74,75))),((76,77),78)))),(79,80)),((((((81,82),83),((84,85),(86,87))),88),(89,90)),((91,92),93))),((94,95),(96,97)))),98),(99,100))); END; BEGIN TREES; TITLE Chaetocerotaceae_Concatenated_MLT; LINK TAXA = Taxa2; TRANSLATE 1 Bacteriastrum_elegans_Na25A3, 2 Bacteriastrum_furcatum_2_Na8A3, 3 Bacteriastrum_jadranum_Na19C1, 4 Bacteriastrum_jadranum_Na19C3, 5 Bacteriastrum_hyalinum_Na10B1, 6 Chaetoceros_affinis_Na49A2, 7 Chaetoceros_diversus_1_Na23B1, 8 Chaetoceros_diversus_1_Na3C1, 9 Chaetoceros_diversus_1_Na5B2, 10 Chaetoceros_diversus_1_Na50B2, 11 Chaetoceros_circinalis_Na15C2, 12 Chaetoceros_sp._Clade_Na12A3_Na9A3, 13 Chaetoceros_sp._Clade_Na17B2_Na17B2, 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Chaetoceros_rotosporus_Na23A1, 42 Chaetoceros_brevis_1_Na7B1, 43 Chaetoceros_brevis_2_Na7C2, 44 Chaetoceros_brevis_3_Ch9B3, 45 Chaetoceros_lauderi_Na13A4, 46 Chaetoceros_lauderi_Na2A1, 47 Chaetoceros_lauderi_Na34C3, 48 Chaetoceros_lauderi_Na36A1, 49 Chaetoceros_teres_Ch13B2, 50 Chaetoceros_teres_Ch5A1, 51 Chaetoceros_cf._tortissimus_Na18C4, 52 Chaetoceros_cf._tortissimus_Na28B3, 53 Chaetoceros_tortissimus_Na25A2, 54 Chaetoceros_curvisetus_1_Na10C1, 55 Chaetoceros_curvisetus_1_Ro3B2, 56 Chaetoceros_curvisetus_3_El4A2, 57 Chaetoceros_curvisetus_3_Na3C4, 58 Chaetoceros_pseudocurvisetus_Na13C4, 59 Chaetoceros_curvisetus_2a_Na1C1, 60 Chaetoceros_curvisetus_2b_Ch5B1, 61 Chaetoceros_curvisetus_2c_El6A2, 62 Chaetoceros_debilis_2_MM24A3, 63 Chaetoceros_debilis_2_MM24C3, 64 Chaetoceros_debilis_3_Ch1A1, 65 Chaetoceros_debilis_3_Ch9A3, 66 Chaetoceros_cinctus_Ch3C4, 67 Chaetoceros_radicans_Ch10A3, 68 Chaetoceros_radicans_Ch11A4, 69 Chaetoceros_dichatoensis_Ch1B3, 70 Chaetoceros_sporotruncatus_Ch2A4, 71 Chaetoceros_sporotruncatus_Ch9C4, 72 Chaetoceros_socialis_Na33B1, 73 Chaetoceros_costatus_Na1A3, 74 Chaetoceros_costatus_Ro1B1, 75 Chaetoceros_costatus_Ro2A2, 76 Chaetoceros_tenuissimus_Na26A1, 77 Chaetoceros_tenuissimus_Na44A1, 78 Chaetoceros_tenuissimus_Na36B4, 79 Chaetoceros_contortus_cf._var._contortus_Na31B2, 80 Chaetoceros_contortus_Ch12A4, 81 Chaetoceros_cf._convolutus_Ch5C4, 82 Chaetoceros_danicus_Na9B4, 83 Chaetoceros_cf._convolutus_L7B6, 84 Chaetoceros_peruvianus_1_newEA1, 85 Chaetoceros_rostratus_Na1C3, 86 Chaetoceros_rostratus_newDA3, 87 Chaetoceros_peruvianus_2_Ch11B4, 88 Chaetoceros_cf._pseudodichaeta_EL1C1, 89 Chaetoceros_eibenii_Ch8C3, 90 Chaetoceros_eibenii_Ro1B2, 91 Chaetoceros_didymus_1_Ch6A3, 92 Chaetoceros_didymus_2_Na20B4, 93 Chaetoceros_protuberans_Ch8C2, 94 Detonula_confervacea_CCMP353, 95 Thalassiosira_pseudonana_CCMP1335, 96 Hydrosera_sp._CYTX025, 97 Terpsinoe_musica_NHOP43, 98 Bacteriastrum_parallelum_newLA2, 99 Bacteriastrum_mediterraneum_Na1C4, 100 Bacteriastrum_mediterraneum_Na29B3; TREE Fig._3 = [&R] (1:0.0320168562,(2:0.0046466924,(3:2.2866E-6,4:5.140533E-4):0.0062321345):0.0186480513,(((5:0.0273910932,((((((((6:0.0063365863,(7:2.2087E-6,((8:6.29494E-4,9:3.153165E-4):3.154751E-4,10:4.855104E-4):3.158189E-4):0.0098459438):0.0127190203,(11:0.0293666801,(12:0.0192040899,13:0.0189203961):0.0091178001):0.0072849878):0.0144010333,14:0.0307413309):0.0203452485,((((((15:7.300939E-4,16:1.923069E-4):0.0178467045,((17:3.262528E-4,18:2.0105E-6):0.0154937307,((19:0.0021499222,20:0.001955595):0.0020356465,21:0.0062761638):0.0127822975):0.0070398424):0.0079062346,22:0.0204732249):0.0086774158,(23:0.0037860319,24:0.0016681514):0.0223391231):0.037680256,(((((25:0.002869286,26:0.0054343481):0.0071275472,(27:3.275688E-4,((28:2.6502E-6,29:8.4857E-4):2.008E-6,30:2.6197E-6):3.654386E-4):0.0123705532):0.0044036312,31:0.0165918587):0.0112262018,(32:0.0084308035,(33:0.0045094664,34:0.0236633874):0.0083556132):0.0126533097):0.0164663299,35:0.0548571796):0.0061086506):0.0066493748,(36:0.0405029736,(((37:0.0065805395,38:0.0060861593):0.0053352531,39:0.0082217633):0.0200616182,(40:4.441684E-4,41:2.9008E-6):0.02084472):0.0138462653):0.0074543746):0.0029406121):0.041814447,((((42:0.0125025297,43:0.0096012736):0.0012619402,44:0.0117980841):0.0339163034,(((45:2.0211E-6,46:5.469173E-4):2.3881E-6,(47:2.093E-6,48:2.1628E-6):5.446385E-4):0.0225550513,(49:2.6502E-6,50:6.40153E-4):0.0170180904):0.0286398935):0.0266155468,(((((51:4.495725E-4,52:2.0928E-6):0.0337207206,53:0.0315667688):0.0689720898,(((54:2.262E-6,55:2.6502E-6):0.0294643921,((56:0.0209373018,57:0.0278930419):0.0098842734,58:0.02395874):0.0029645784):0.0052515241,((59:2.4585E-6,60:0.0121767024):0.0085766383,61:0.0119450046):0.0264468562):0.0245011375):0.0097558447,((62:2.8632E-6,63:7.474441E-4):0.0177188254,(64:2.9008E-6,65:2.222911E-4):0.0056937769):0.1472312624):0.0339051717,((((66:0.0554556316,(67:2.162394E-4,68:2.9008E-6):0.0340668399):0.0204344789,((69:0.0044716456,(70:2.4437E-6,71:2.539E-6):0.0039789815):0.0270732984,72:0.0214977365):0.0068150861):0.0239007148,(73:0.0015568545,(74:3.186541E-4,75:2.9473E-6):0.001629631):0.0446000588):0.0131590309,((76:5.049847E-4,77:0.0013354157):0.0015905024,78:2.0135E-6):0.0883027712):0.0233224826):0.0071044441):0.0178878834):0.0069838664,(79:0.0150904563,80:0.0060117798):0.0694353162):0.006116023,((((((81:0.0244713213,82:0.0109082185):0.0114052511,83:0.0281076105):0.0114688942,((84:0.0157411253,(85:3.054753E-4,86:7.185571E-4):0.0152627745):0.0029360066,87:0.0093542499):0.0211198879):0.0304141599,88:0.0571925689):0.0227762441,(89:8.823852E-4,90:0.0010026989):0.0413479752):0.0090194743,((91:0.0082574865,92:0.0065220137):0.0365630398,93:0.0577986633):0.0349396873):0.0201099014):0.0102021108,((94:0.0413409253,95:0.0360874859):0.0847554284,(96:0.1802028516,97:0.1430450407):0.0471614307):0.0313417267):0.0764444408):0.04197664,98:0.0405673651):0.0059466404,(99:2.0105E-6,100:2.1534E-6):0.0241280688):0.0208114296); END; BEGIN TREES; TITLE Chaetocerotaceae_Concatenated_Bayesian; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Bacteriastrum_elegans_Na25A3, 2 Bacteriastrum_furcatum_2_Na8A3, 3 Bacteriastrum_hyalinum_Na10B1, 4 Bacteriastrum_jadranum_Na19C1, 5 Bacteriastrum_jadranum_Na19C3, 6 Bacteriastrum_mediterraneum_Na1C4, 7 Bacteriastrum_mediterraneum_Na29B3, 8 Bacteriastrum_parallelum_newLA2, 9 Chaetoceros_affinis_Na49A2, 10 Chaetoceros_anastomosans_Na14C2, 11 Chaetoceros_anastomosans_Na14C3, 12 Chaetoceros_brevis_1_Na7B1, 13 Chaetoceros_brevis_2_Na7C2, 14 Chaetoceros_brevis_3_Ch9B3, 15 Chaetoceros_cf._convolutus_Ch5C4, 16 Chaetoceros_cf._convolutus_L7B6, 17 Chaetoceros_cf._pseudodichaeta_EL1C1, 18 Chaetoceros_cf._tortissimus_Na18C4, 19 Chaetoceros_cf._tortissimus_Na28B3, 20 Chaetoceros_cf._vixvisibilis_Na25C3, 21 Chaetoceros_cf._vixvisibilis_Na28A4, 22 Chaetoceros_cinctus_Ch3C4, 23 Chaetoceros_circinalis_Na15C2, 24 Chaetoceros_constrictus_Ch12C1, 25 Chaetoceros_contortus_cf._var._contortus_Na31B2, 26 Chaetoceros_contortus_Ch12A4, 27 Chaetoceros_costatus_Na1A3, 28 Chaetoceros_costatus_Ro1B1, 29 Chaetoceros_curvisetus_1_Na10C1, 30 Chaetoceros_curvisetus_1_Ro3B2, 31 Chaetoceros_curvisetus_2a_Na1C1, 32 Chaetoceros_curvisetus_2b_Ch5B1, 33 Chaetoceros_curvisetus_2c_El6A2, 34 Chaetoceros_curvisetus_3_El4A2, 35 Chaetoceros_curvisetus_3_Na3C4, 36 Chaetoceros_danicus_Na9B4, 37 Chaetoceros_debilis_2_MM24A3, 38 Chaetoceros_debilis_2_MM24C3, 39 Chaetoceros_debilis_3_Ch1A1, 40 Chaetoceros_debilis_3_Ch9A3, 41 Chaetoceros_decipiens_Na28A2, 42 Chaetoceros_diadema_1_Ch4A1, 43 Chaetoceros_diadema_1_Na13B1, 44 Chaetoceros_diadema_2_Ch5C1, 45 Chaetoceros_dichatoensis_Ch1B3, 46 Chaetoceros_didymus_1_Ch6A3, 47 Chaetoceros_didymus_2_Na20B4, 48 Chaetoceros_diversus_1_Na23B1, 49 Chaetoceros_diversus_1_Na3C1, 50 Chaetoceros_diversus_1_Na5B2, 51 Chaetoceros_eibenii_Ch8C3, 52 Chaetoceros_eibenii_Ro1B2, 53 Chaetoceros_elegans_Ch12A1, 54 Chaetoceros_lauderi_Na13A4, 55 Chaetoceros_lauderi_Na2A1, 56 Chaetoceros_lauderi_Na34C3, 57 Chaetoceros_lorenzianus_1_Ch11C1, 58 Chaetoceros_lorenzianus_1_Ch4C3, 59 Chaetoceros_lorenzianus_2_Ch11A1, 60 Chaetoceros_lorenzianus_2_Ch13B4, 61 Chaetoceros_lorenzianus_2_Ch4A3, 62 Chaetoceros_lorenzianus_2_Ch4C4, 63 Chaetoceros_peruvianus_1_newEA1, 64 Chaetoceros_peruvianus_2_Ch11B4, 65 Chaetoceros_protuberans_Ch8C2, 66 Chaetoceros_pseudocurvisetus_Na13C4, 67 Chaetoceros_radicans_Ch10A3, 68 Chaetoceros_radicans_Ch11A4, 69 Chaetoceros_rostratus_Na1C3, 70 Chaetoceros_rostratus_newDA3, 71 Chaetoceros_rotosporus_Na22B1, 72 Chaetoceros_rotosporus_Na23A1, 73 Chaetoceros_socialis_Na33B1, 74 Chaetoceros_sp._Clade_Na11C3_Na11C3, 75 Chaetoceros_sp._Clade_Na11C3_Na43A1, 76 Chaetoceros_sp._Clade_Na12A3_Na9A3, 77 Chaetoceros_sp._Clade_Na13C2_Na13C2, 78 Chaetoceros_sp._Clade_Na17B2_Na17B2, 79 Chaetoceros_sp._Clade_Na26B1_Na26B1, 80 Chaetoceros_sp._Clade_Na28A1_Na28A1, 81 Chaetoceros_sp._Clade_Va7D2_Na43A4, 82 Chaetoceros_sp._Clade_Va7D2_Na44B3, 83 Chaetoceros_sporotruncatus_Ch2A4, 84 Chaetoceros_sporotruncatus_Ch9C4, 85 Chaetoceros_tenuissimus_Na26A1, 86 Chaetoceros_tenuissimus_Na44A1, 87 Chaetoceros_teres_Ch13B2, 88 Chaetoceros_teres_Ch5A1, 89 Chaetoceros_throndsenii_Na45B3, 90 Chaetoceros_tortissimus_Na25A2, 91 Detonula_confervacea_CCMP353, 92 Hydrosera_sp._CYTX025, 93 Terpsinoe_musica_NHOP43, 94 Thalassiosira_pseudonana_CCMP1335, 95 Chaetoceros_cf._decipiens_El6B1, 96 Chaetoceros_costatus_Ro2A2, 97 Chaetoceros_diversus_1_Na50B2, 98 Chaetoceros_cf._lorenzianus_El1A4, 99 Chaetoceros_lauderi_Na36A1, 100 Chaetoceros_tenuissimus_Na36B4; TREE Fig._3 = [&R] 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END; BEGIN TREES; TITLE Chaetocerotaceae_MLT_plastid; LINK TAXA = Taxa5; TRANSLATE 1 Chaetoceros_contortus_Ch12A4, 2 Chaetoceros_contortus_cf._var._contortus_Na31B2, 3 Chaetoceros_cinctus_Ch3C4, 4 Chaetoceros_dichatoensis_Ch1B3, 5 Chaetoceros_sporotruncatus_Ch2A4, 6 Chaetoceros_sporotruncatus_Ch9C4, 7 Chaetoceros_radicans_Ch11A4, 8 Chaetoceros_radicans_Ch10A3, 9 Chaetoceros_socialis_Na33B1, 10 Chaetoceros_costatus_Na1A3, 11 Chaetoceros_costatus_Ro1B1, 12 Chaetoceros_costatus_Ro2A2, 13 Chaetoceros_throndsenii_Na45B3, 14 Chaetoceros_rotosporus_Na22B1, 15 Chaetoceros_rotosporus_Na23A1, 16 Chaetoceros_sp._Clade_Na13C2_Na13C2, 17 Chaetoceros_affinis_Na49A2, 18 Chaetoceros_diversus_1_Na5B2, 19 Chaetoceros_diversus_1_Na3C1, 20 Chaetoceros_diversus_1_Na50B2, 21 Chaetoceros_diversus_1_Na23B1, 22 Chaetoceros_sp._Clade_Va7D2_Na43A4, 23 Chaetoceros_sp._Clade_Na28A1_Na28A1, 24 Chaetoceros_sp._Clade_Va7D2_Na44B3, 25 Chaetoceros_sp._Clade_Na26B1_Na26B1, 26 Chaetoceros_sp._Clade_Na11C3_Na11C3, 27 Chaetoceros_sp._Clade_Na11C3_Na43A1, 28 Chaetoceros_cf._vixvisibilis_Na25C3, 29 Chaetoceros_anastomosans_Na14C2, 30 Chaetoceros_anastomosans_Na14C3, 31 Chaetoceros_circinalis_Na15C2, 32 Chaetoceros_sp._Clade_Na17B2_Na17B2, 33 Chaetoceros_sp._Clade_Na12A3_Na9A3, 34 Chaetoceros_lorenzianus_1_Ch11C1, 35 Chaetoceros_lorenzianus_1_Ch4C3, 36 Chaetoceros_cf._lorenzianus_El1A4, 37 Chaetoceros_elegans_Ch12A1, 38 Chaetoceros_cf._decipiens_El6B1, 39 Chaetoceros_decipiens_Na28A2, 40 Chaetoceros_lorenzianus_2_Ch4C4, 41 Chaetoceros_lorenzianus_2_Ch4A3, 42 Chaetoceros_lorenzianus_2_Ch11A1, 43 Chaetoceros_lorenzianus_2_Ch13B4, 44 Chaetoceros_constrictus_Ch12C1, 45 Chaetoceros_diadema_1_Ch4A1, 46 Chaetoceros_diadema_1_Na13B1, 47 Chaetoceros_diadema_2_Ch5C1, 48 Chaetoceros_eibenii_Ch8C3, 49 Chaetoceros_eibenii_Ro1B2, 50 Chaetoceros_didymus_2_Na20B4, 51 Chaetoceros_didymus_1_Ch6A3, 52 Chaetoceros_protuberans_Ch8C2, 53 Chaetoceros_cf._convolutus_L7B6, 54 Chaetoceros_cf._convolutus_Ch5C4, 55 Chaetoceros_peruvianus_2_Ch11B4, 56 Chaetoceros_rostratus_Na1C3, 57 Chaetoceros_rostratus_newDA3, 58 Chaetoceros_peruvianus_1_newEA1, 59 Chaetoceros_cf._pseudodichaeta_EL1C1, 60 Bacteriastrum_mediterraneum_Na29B3, 61 Bacteriastrum_jadranum_Na19C1, 62 Bacteriastrum_elegans_Na25A3, 63 Bacteriastrum_furcatum_2_Na8A3, 64 Bacteriastrum_jadranum_Na19C3, 65 Chaetoceros_tenuissimus_Na44A1, 66 Chaetoceros_tenuissimus_Na36B4, 67 Chaetoceros_tenuissimus_Na26A1, 68 Chaetoceros_curvisetus_2b_Ch5B1, 69 Chaetoceros_curvisetus_3_El4A2, 70 Chaetoceros_curvisetus_3_Na3C4, 71 Chaetoceros_cf._tortissimus_Na28B3, 72 Chaetoceros_tortissimus_Na25A2, 73 Chaetoceros_cf._tortissimus_Na18C4, 74 Chaetoceros_curvisetus_2c_El6A2, 75 Chaetoceros_curvisetus_2a_Na1C1, 76 Chaetoceros_pseudocurvisetus_Na13C4, 77 Chaetoceros_curvisetus_1_Na10C1, 78 Chaetoceros_curvisetus_1_Ro3B2, 79 Chaetoceros_debilis_2_MM24A3, 80 Chaetoceros_debilis_3_Ch9A3, 81 Chaetoceros_debilis_3_Ch1A1, 82 Chaetoceros_debilis_2_MM24C3, 83 Chaetoceros_teres_Ch13B2, 84 Chaetoceros_teres_Ch5A1, 85 Chaetoceros_lauderi_Na2A1, 86 Chaetoceros_lauderi_Na36A1, 87 Chaetoceros_lauderi_Na34C3, 88 Chaetoceros_lauderi_Na13A4, 89 Chaetoceros_brevis_2_Na7C2, 90 Chaetoceros_brevis_1_Na7B1, 91 Terpsinoe_musica_NHOP43, 92 Hydrosera_sp._CYTX025, 93 Detonula_confervacea_CCMP353, 94 Thalassiosira_pseudonana_CCMP1335; TREE Fig._A.2 = [&R] (((1:0.00877816,2:0.01956118):0.04245465,((((3:0.00417957,((4:0.00341783,(5:1.0E-6,6:1.0E-6):0.00186465):0.01846588,(7:1.0E-6,8:1.0E-6):0.01244071):0.00368337):0.00114089,9:0.01115164):0.0054325,(10:0.00207469,(11:1.0E-6,12:1.0E-6):0.00241223):0.01049635):0.00635057,(((13:0.03479244,((((14:1.0E-6,15:1.0E-6):0.01111409,(((16:0.01403786,((17:1.0E-6,(18:1.0E-6,(19:1.0E-6,(20:1.0E-6,21:1.0E-6):1.0E-6):1.0E-6):1.0E-6):0.00942996,((22:0.00940091,(23:0.00193027,24:0.00182397):1.0E-6):0.00886501,(((25:0.00700309,(26:0.00772889,27:0.0015399):0.00171511):0.00736947,28:0.009463):0.00949185,(29:0.00149181,30:1.0E-6):0.01002574):0.00343494):0.01349018):0.00122763):0.00248697,31:0.00881996):0.00163408,32:0.00822975):0.00639225):0.00414798,33:0.01825145):0.00337892,(((34:1.0E-6,35:1.0E-6):0.01560528,(36:0.02081486,(37:0.00464276,((38:9.2075E-4,39:5.6363E-4):0.00100916,(40:1.0E-6,(41:1.0E-6,(42:1.0E-6,43:1.0E-6):1.0E-6):1.0E-6):0.00948813):0.0014719):0.00853985):0.00318018):0.00536929,(44:0.01839309,(45:1.0E-6,(46:0.00209546,47:1.0E-6):0.00323863):0.00719525):0.00676748):0.00253481):0.00769063):0.0130051,(((48:0.00198822,49:4.4754E-4):0.0517382,(50:1.0E-6,(51:0.00165562,52:0.0304758):0.00153277):3.9453E-4):0.0073981,((((53:0.03938376,54:0.04082347):0.01005707,(55:0.0180181,((56:6.5319E-4,57:1.0E-6):0.02435834,58:0.01775498):0.00360085):0.03919184):0.01434815,59:0.11969204):0.03146605,(60:0.02169493,(61:0.00657217,(62:0.02681466,(63:0.00310022,64:0.00352237):0.00134349):0.00404701):0.01511134):0.03065502):0.00327334):0.00556951):0.00947399,((65:9.5352E-4,(66:4.7216E-4,67:4.6905E-4):4.4711E-4):0.0149167,(((((68:1.0E-6,(69:0.01595348,70:0.0089716):0.00518142):0.00264009,((71:0.02692394,72:0.02317628):0.00657279,((73:0.00412267,74:0.00503176):0.00261107,75:0.00320155):0.0092894):6.8495E-4):0.00112362,(76:0.00958463,(77:1.0E-6,78:1.0E-6):0.01189869):0.00192018):0.00694316,(((79:0.01711174,80:2.3629E-4):2.3323E-4,81:1.0E-6):2.6546E-4,82:0.00437312):0.01891826):0.00395178,((83:1.0E-6,84:1.0E-6):0.01913361,(((85:1.0E-6,(86:1.0E-6,87:1.0E-6):1.0E-6):1.0E-6,88:1.0E-6):0.01685522,(89:0.00246297,90:0.01586094):0.00747552):0.00462844):0.00819076):0.00709691):0.00267405):0.00435756):0.00536892):0.02994291,((91:0.09798246,92:0.18690943):0.0571768,(93:0.03368575,94:0.0145202):0.04291753):0.02994291); END;