#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 25, 2024; 7:16 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Bradshaw M. 2019. Phylogeny and taxonomy of powdery mildew on Viburnum species. Mycologia, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S25050] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=53; TAXLABELS 'Erysiphe aquilegiae Ex._Aquilegia_sp._Argentina_LC009883.1' 'Erysiphe aquilegiae Ex._Clematis_apiifolia_Japan_LC009938.1' 'Erysiphe chloranthi Ex._Chloranthus_serratus_Japan_LC009931.1' 'Erysiphe diervillae Ex._Weigela_hortensis_Japan_LC010087.1' 'Erysiphe euphorbiae Ex._Chamaesyce_nutans_Japan_LC010073.1' 'Erysiphe glycines Ex._Amphicarpaea_edgeworthii_Japan_LC009910.1' 'Erysiphe glycines Ex._Desmodium_lanum_Japan_LC009948.1LC009947.1' 'Erysiphe huayinensis Ex._Isodon_trichocarpus_Japan_LC010080.1' 'Erysiphe huayinensis Ex._Isodon_umbrosus_var._leucanthus_f._kameba_Japan_LC010072.1' 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_opulus_subsp._calvescens_China_MN431597' 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_opulus_subsp._calvescens_China_MN431598' 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_opulus_subsp._calvescens_China_MN431599' 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_opulus_subsp._calvescens_China_MN431600' 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_sargentii_South_Korea_MN431601' 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_sargentii_South_Korea_MN431602' 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_sargentii_South_Korea_MN431603' 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_sargentii_South_Korea_MN431605' 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_sargentii_South_Korea_MN431607' 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_sargentii_South_Korea_MN431609' 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_sargentii_South_Korea_MN431610' 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_sargentii_South_Korea_MN431611' 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_sargentii_South_Korea_MN431612' 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_sargentii_South_Korea_MN431613' 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_sargentii_South_Korea_MN431616' 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_sargentii_South_Korea_MN431617' 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_sargentii|Russia_LC010033.1' 'Erysiphe ornata var._europaea_Ex._Betula_pubescens_Ukraine_LC010035.1' 'Erysiphe ornata var._europaea_Ex._Betula_pubescens_Ukraine_LC010037.1' 'Erysiphe ornata var._ornata_Ex._Betula_pubescens_Ukraine_LC010032.1' 'Erysiphe ornata var._ornata_Ex._Betula_pubescens_Ukraine_LC010034.1' 'Erysiphe ornata var._ornata_Ex._Betula_pubescens_Ukraine_LC010036.1' 'Erysiphe penicillata Ex._Alnus_incana_Germany_LC009987.1' 'Erysiphe pseudoviburni Ex._Viburnum_odoratissimum_var._awabuk_South_Korea_MN431595' 'Erysiphe pseudoviburni Ex._Viburnum_odoratissimum_var._awabuk_South_Korea_MN431596' 'Erysiphe pseudoviburni Ex._Viburnum_sieboldii_Japan_LC009904' 'Erysiphe sedi Ex._Sedum_pallescens_Russia_LC010047.1' 'Erysiphe sedi Ex._Sedum_sp._Russia_LC010046.1' 'Erysiphe viburni Ex._Viburnum_carlesii_Germany_MN431620' 'Erysiphe viburni Ex._Viburnum_edule_USA_MN431627' 'Erysiphe viburni Ex._Viburnum_lantana_Germany_MN431618' 'Erysiphe viburni Ex._Viburnum_opulus_Germany_MN431619' 'Erysiphe viburni Ex._Viburnum_opulus_Germany_MN431621' 'Erysiphe viburni Ex._Viburnum_opulus_USA_MN431624' 'Erysiphe viburni Ex._Viburnum_opulus_USA_MN431625' 'Erysiphe viburni Ex._Viburnum_opulus_USA_MN431626' 'Erysiphe viburni Ex._Viburnum_tinus_Russia_MN431623' 'Erysiphe viburni-plicati Ex._Viburnum_plicatum_Japan_AB863612.1' 'Erysiphe viburni-plicati Ex._Viburnum_plicatum_var._plicatum_f._glabrum_Japan_AB863613.1' 'Erysiphe viburniphila Ex._Viburnum_edule_USA_MN431632' 'Erysiphe viburniphila Ex._Viburnum_tinus_Switzerland_MN431628' 'Erysiphe viburniphila Ex._Viburnum_tinus_USA_MN431629' 'Erysiphe viburniphila Ex._Viburnum_tinus_USA_MN431630' 'Erysiphe viburniphila Ex._Viburnum_tinus_USA_MN431631' ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M53212] TITLE Powdery_Mildew_on_Viburnum_53x1408; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=1408; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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'Erysiphe aquilegiae Ex._Clematis_apiifolia_Japan_LC009938.1' 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'Erysiphe diervillae Ex._Weigela_hortensis_Japan_LC010087.1' 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'Erysiphe euphorbiae Ex._Chamaesyce_nutans_Japan_LC010073.1' 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'Erysiphe huayinensis Ex._Isodon_trichocarpus_Japan_LC010080.1' 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'Erysiphe huayinensis Ex._Isodon_umbrosus_var._leucanthus_f._kameba_Japan_LC010072.1' 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'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_sargentii_South_Korea_MN431611' 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'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_sargentii_South_Korea_MN431617' 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'Erysiphe ornata var._europaea_Ex._Betula_pubescens_Ukraine_LC010035.1' 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'Erysiphe ornata var._europaea_Ex._Betula_pubescens_Ukraine_LC010037.1' 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'Erysiphe ornata var._ornata_Ex._Betula_pubescens_Ukraine_LC010032.1' 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'Erysiphe ornata var._ornata_Ex._Betula_pubescens_Ukraine_LC010034.1' 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'Erysiphe ornata var._ornata_Ex._Betula_pubescens_Ukraine_LC010036.1' 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'Erysiphe penicillata Ex._Alnus_incana_Germany_LC009987.1' 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'Erysiphe pseudoviburni Ex._Viburnum_odoratissimum_var._awabuk_South_Korea_MN431595' 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'Erysiphe pseudoviburni Ex._Viburnum_odoratissimum_var._awabuk_South_Korea_MN431596' 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'Erysiphe pseudoviburni Ex._Viburnum_sieboldii_Japan_LC009904' 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'Erysiphe sedi Ex._Sedum_pallescens_Russia_LC010047.1' 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'Erysiphe viburni Ex._Viburnum_carlesii_Germany_MN431620' 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'Erysiphe viburni Ex._Viburnum_edule_USA_MN431627' 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'Erysiphe viburni Ex._Viburnum_lantana_Germany_MN431618' 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'Erysiphe viburni Ex._Viburnum_opulus_Germany_MN431619' 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'Erysiphe viburni Ex._Viburnum_opulus_USA_MN431625' 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'Erysiphe viburni Ex._Viburnum_tinus_Russia_MN431623' 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'Erysiphe viburni-plicati Ex._Viburnum_plicatum_var._plicatum_f._glabrum_Japan_AB863613.1' 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'Erysiphe viburniphila Ex._Viburnum_edule_USA_MN431632' 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'Erysiphe viburniphila Ex._Viburnum_tinus_Switzerland_MN431628' 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'Erysiphe viburniphila Ex._Viburnum_tinus_USA_MN431629' 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'Erysiphe viburniphila Ex._Viburnum_tinus_USA_MN431630' 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'Erysiphe viburniphila Ex._Viburnum_tinus_USA_MN431631' ???AAGTA-AAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTACAGAGCGTGAGACTCA-GTCG-?AGCATC-TGCTGCGTGCTGGGTCGACCCTCCCACCCGTGTCGA-TTTATATCTTGTTGCTTTGGCGGGCCGGGCTACGTCGGCGCTGTTCGTGAGGAC-TGGCGTCGG---CCGCCCACCGGC--TTCGGCTGGAGCGTGTCCGCCAAAGACCCAAAC--CAAACTC--ATGTTG-TC-TTTGCAGTC-TAAGTTTTA----TTCTTGAATTGAAAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTTAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCC-CCTTGGCATTCCGAGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCAT-AACA-CCCCCTCCAGCTGCCTTTGT--GTGGTTGCGGTGTTGGGGCACGTCGCG--GTGCGGCGGCCCTTAAAGACAGTGGCGGTCCCGGCGTGGGCTCTACGCGTAGTAA-CTTGCTTCTC-GCGACAGAGTGACGACGGT-GGCTTGCCA--AAAGCCC-----AAATTGT-------TCCAGTC------ACAT-GGA--TCACAGGTTGACCTCGAATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAAGCATATCAATAAGCGGAGGAAAAGAAACCAACCGGG-ATTACCTCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGTAACAGCTCAAATTTGAAATCTGGCTCCTTTGGAGTCCGAGTTGTAATTTGTAGAAGATGCTTTGGGTTGTGGGTTCGGCCTAAGTTCCTTGGAACAGGACGTCATAGAGGGTGAGAATCCCGTATGTGGCCGAGGCCTGCGCCTGTGTAAAGCTCTTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCAAAATGGGTGGTAAATTTCATCTAAAGCTAAATATGGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCAACCAGACTTGGACGCTGCCGATCACCTCGAGTTCTCTCGAGTGCACTCGACAGTGTACAGGCCAGCATCGGTTCGGGTGGCTGGATAAAGGCCGTAGGAACGTAGCTCCCTTCGGGGAGTGTTATAGCCTACGGTGCCATGCAGCCCAGCCGGACCGAGGACCGCGCCTTCGGGCTA???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????- ; END; BEGIN TREES; TITLE Powdery_Mildew_on_Viburnum_53x1408_PM_Beast; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 'Erysiphe aquilegiae Ex._Aquilegia_sp._Argentina_LC009883.1', 2 'Erysiphe aquilegiae Ex._Clematis_apiifolia_Japan_LC009938.1', 3 'Erysiphe chloranthi Ex._Chloranthus_serratus_Japan_LC009931.1', 4 'Erysiphe diervillae Ex._Weigela_hortensis_Japan_LC010087.1', 5 'Erysiphe euphorbiae Ex._Chamaesyce_nutans_Japan_LC010073.1', 6 'Erysiphe glycines Ex._Amphicarpaea_edgeworthii_Japan_LC009910.1', 7 'Erysiphe glycines Ex._Desmodium_lanum_Japan_LC009948.1LC009947.1', 8 'Erysiphe huayinensis Ex._Isodon_trichocarpus_Japan_LC010080.1', 9 'Erysiphe huayinensis Ex._Isodon_umbrosus_var._leucanthus_f._kameba_Japan_LC010072.1', 10 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_opulus_subsp._calvescens_China_MN431597', 11 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_opulus_subsp._calvescens_China_MN431598', 12 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_opulus_subsp._calvescens_China_MN431599', 13 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_opulus_subsp._calvescens_China_MN431600', 14 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_sargentii_South_Korea_MN431601', 15 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_sargentii_South_Korea_MN431602', 16 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_sargentii_South_Korea_MN431603', 17 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_sargentii_South_Korea_MN431605', 18 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_sargentii_South_Korea_MN431607', 19 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_sargentii_South_Korea_MN431609', 20 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_sargentii_South_Korea_MN431616', 21 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_sargentii_South_Korea_MN431610', 22 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_sargentii_South_Korea_MN431611', 23 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_sargentii_South_Korea_MN431612', 24 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_sargentii_South_Korea_MN431613', 25 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_sargentii_South_Korea_MN431617', 26 'Erysiphe miranda Ex._Viburnum_sargentii|Russia_LC010033.1', 27 'Erysiphe ornata var._europaea_Ex._Betula_pubescens_Ukraine_LC010035.1', 28 'Erysiphe ornata var._europaea_Ex._Betula_pubescens_Ukraine_LC010037.1', 29 'Erysiphe ornata var._ornata_Ex._Betula_pubescens_Ukraine_LC010032.1', 30 'Erysiphe ornata var._ornata_Ex._Betula_pubescens_Ukraine_LC010034.1', 31 'Erysiphe ornata var._ornata_Ex._Betula_pubescens_Ukraine_LC010036.1', 32 'Erysiphe penicillata Ex._Alnus_incana_Germany_LC009987.1', 33 'Erysiphe pseudoviburni Ex._Viburnum_sieboldii_Japan_LC009904', 34 'Erysiphe sedi Ex._Sedum_pallescens_Russia_LC010047.1', 35 'Erysiphe sedi Ex._Sedum_sp._Russia_LC010046.1', 36 'Erysiphe viburni-plicati Ex._Viburnum_plicatum_Japan_AB863612.1', 37 'Erysiphe viburni-plicati Ex._Viburnum_plicatum_var._plicatum_f._glabrum_Japan_AB863613.1', 38 'Erysiphe pseudoviburni Ex._Viburnum_odoratissimum_var._awabuk_South_Korea_MN431596', 39 'Erysiphe pseudoviburni Ex._Viburnum_odoratissimum_var._awabuk_South_Korea_MN431595', 40 'Erysiphe viburni Ex._Viburnum_opulus_USA_MN431624', 41 'Erysiphe viburni Ex._Viburnum_opulus_Germany_MN431621', 42 'Erysiphe viburni Ex._Viburnum_edule_USA_MN431627', 43 'Erysiphe viburni Ex._Viburnum_opulus_USA_MN431626', 44 'Erysiphe viburni Ex._Viburnum_opulus_Germany_MN431619', 45 'Erysiphe viburni Ex._Viburnum_carlesii_Germany_MN431620', 46 'Erysiphe viburni Ex._Viburnum_lantana_Germany_MN431618', 47 'Erysiphe viburni Ex._Viburnum_opulus_USA_MN431625', 48 'Erysiphe viburni Ex._Viburnum_tinus_Russia_MN431623', 49 'Erysiphe viburniphila Ex._Viburnum_edule_USA_MN431632', 50 'Erysiphe viburniphila Ex._Viburnum_tinus_Switzerland_MN431628', 51 'Erysiphe viburniphila Ex._Viburnum_tinus_USA_MN431629', 52 'Erysiphe viburniphila Ex._Viburnum_tinus_USA_MN431630', 53 'Erysiphe viburniphila Ex._Viburnum_tinus_USA_MN431631'; TREE TREE1 = [&R] 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