#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 23, 2024; 10:03 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Silva-filho A.G., Sá M., Komura D.L., Delgat L., Baseia I.G., Marinho P., Moncalvo J., Roy M., & Wartchow F. 2020. Novelties in Lactifluus (Russulaceae) subg. gymnocarpi: one section delimited, sect. Panuoidei emended, three novel species and one new record from tropical forest of Brazil. Mycologia, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S26818] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=57; TAXLABELS Lactifluus_aff._phlebonemus_EDC12023_Cameroon 'Lactifluus albocinctus AV99211_Zimbabwe' 'Lactifluus albomembranaceus EDC12046_Cameroon' 'Lactifluus brunellus TH9130_Guyana' 'Lactifluus bruneoviolascens AV13038_Italy' 'Lactifluus brunnescens AV05083_Malawi' 'Lactifluus caribaeus JP_Fiard_827_B_Martinique' 'Lactifluus caribaeus PAMMart12090_Martinique' 'Lactifluus carmineus AV99099_Zimbabwe' 'Lactifluus castaneibadius CLMART06019_Martinique' Lactifluus_cf._murinipes_LD15020_Martinique Lactifluus_cf._murinipes_LD15054_Martinique Lactifluus_cf._nebulosus_LD15059_Martinique Lactifluus_cf._nebulosus_LD15061_Martinique Lactifluus_cf._tanzanicus_AV11017_Tanzania 'Lactifluus chiapanensis VMB4374_AMexico' 'Lactifluus clarkeae MN2004002_Australia2' 'Lactifluus coccolobae OKM2740_Puerto_Rico' 'Lactifluus denigricans EDC11218_Tanzania' 'Lactifluus flammans JD941_Congo' 'Lactifluus flocktonae JET1006_Australia' 'Lactifluus foetens ADK2840_Benin' 'Lactifluus foetens ADK3688_Benin' 'Lactifluus guadeloupensis RCGuad11023_Guadeloupe' 'Lactifluus gutulatus DLK_2042' 'Lactifluus gymnocarpus EDC12047_Cameroon' 'Lactifluus kigomaensis AV11006_Tanzania' 'Lactifluus lepus DLK_1854' 'Lactifluus lepus RCGuad05029_Guadeloupe' 'Lactifluus lepus RCGuad08042_Guadeloupe' 'Lactifluus longivelutinus XHW1565_China' 'Lactifluus luteolus AV05253_North_America' 'Lactifluus mamoratus LD15066_Martinique' 'Lactifluus nonpiscis AV11137_Togo' 'Lactifluus nonpiscis BB3171_Zambia' 'Lactifluus panuoides CL_GUAD06045_Guadeloupe' 'Lactifluus panuoides DN_Pegler_3133_Guadeloupe' 'Lactifluus panuoides Dennis_109_A' 'Lactifluus panuoides G128_KJ786647' 'Lactifluus panuoides RCGuy10024_French_Guiana' 'Lactifluus panuoides TH7460_Guyana' Lactifluus_piperogalactus_FW110.2012 'Lactifluus piperogalactus FW22_2017' 'Lactifluus putidus LD_15034_Martinique' 'Lactifluus putidus LD_15039_Martinique' 'Lactifluus rubrobrunnescens EH7194_Indonesia' 'Lactifluus rubroviolascens EDC12051_Cameroon' 'Lactifluus sp G3185_French_Guiana' 'Lactifluus sp JLC06031001_French_Guiana' 'Lactifluus sp KW392_Thailand' 'Lactifluus sp PGK13130_New_Caledonia' 'Lactifluus sp REH9398_Australia' Lactifluus_spathuliformis_DLK116 Lactifluus_spathuliformis_DLK1891 'Lactifluus sphatuliformis DLK_346' 'Lactifluus subclarkeae REH9231_Australia' 'Lactifluus tanzanicus TS1277_Tanzania' ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M57780] TITLE Lactifluus; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=2001; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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'Lactifluus caribaeus PAMMart12090_Martinique' 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'Lactifluus carmineus AV99099_Zimbabwe' 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'Lactifluus clarkeae MN2004002_Australia2' 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'Lactifluus coccolobae OKM2740_Puerto_Rico' 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'Lactifluus denigricans EDC11218_Tanzania' 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'Lactifluus flammans JD941_Congo' 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'Lactifluus longivelutinus XHW1565_China' 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'Lactifluus nonpiscis BB3171_Zambia' 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'Lactifluus panuoides RCGuy10024_French_Guiana' 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'Lactifluus panuoides TH7460_Guyana' 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Lactifluus_piperogalactus_FW110.2012 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'Lactifluus piperogalactus FW22_2017' 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'Lactifluus putidus LD_15034_Martinique' 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'Lactifluus putidus LD_15039_Martinique' 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'Lactifluus sp G3185_French_Guiana' 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'Lactifluus sp KW392_Thailand' 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'Lactifluus sp PGK13130_New_Caledonia' 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'Lactifluus sp REH9398_Australia' 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Lactifluus_spathuliformis_DLK116 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Lactifluus_spathuliformis_DLK1891 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'Lactifluus sphatuliformis DLK_346' 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'Lactifluus subclarkeae REH9231_Australia' 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'Lactifluus tanzanicus TS1277_Tanzania' ?????????????TAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTATCG-TA-CAAC---G-AGAGG----CACC--GAGGCTGTCGCTGACCTCTT------------CACAAAGTCGTGCACGCCTCGAGTGTTTCTCA-CCCATC-----C--ATCTCTTACC-CCCCTTGTGCATCGCC-GCGTGGG--CTCCGT------------------------AAAAGGGGCTCACGTTTTT----------CACACAAACGACT-------GGT-A-GTT-G-TAGAATGTCTTCAT--TCTTTGC--A---ATCAGTATGCAAT--------C-AATACAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCATCTTGCGCCCCTTGGCATTCCGAGGGGCACACCCGTTTGAGTGTCGTGAAATATTCTCAACCTTCACCGTTTTTTTTTTGTTTTAAAAATC-G-GGGGAAGGCTTGGAC-TTTGGAGGTTCATTGCTGGTCTCTAT-----TCTGAACCCAGCTCCTCTTAAATGGATTAGTGAGG--TC-C-C-CTT--TG--TCAA-TCCT-TGGGC--G--TGAT-AAGCT--TGA-TTC-TACGTCC--TCGGGTTTTTGGCAC---CTTCTCT-CTGGCCTTGCTTCTAAT-C-GTC-CTC-------GAGT-TGAC-------------------CTGTGAACTTGGGG-AAACCC--------C-CCTCTTTTGACCTCAAATC-GGGTG-AGACTACCCGCTGAACTT??????????TGTGTCCCGCAGAAACACCGGAAGGCCAAGCGTGCGGTTTGGTGAAGAA-CTT--GGCCCTAATGGCGACAATCTCCGTCGGATCATTGTCAGGCCCCATAATCGACTTTCTGGAAGAGTGGGGTCTGGAGTCCCTAGAAGAGAATGCACATTCATCGACGATCACGACGAAAGTGTTCGTTAACGGTGTTTGGATGGGCGTCCATCGTGATCCAACCAACCTTATTGAGACCCTGAAAAAGCTTCGTCGCAAGGACGATGTCCACCCAGAGGTCTCTATTGTACGCGACATTCGGGAGAGAGA{AG}CTTCGATTATACACGGACCCAGGACGTGTTTGCCGACCCTTGTTCATCGTCGAGGCCCAACAGCTTGTCTTACAGAAGAAGCACGTGAGATGGCTCAATCAGGGTAGTACAGATGACGGTGAAGAATTCAAGTGGCAACATCTGGCTAAATCAGGAGTTATCGAGATGCTGGACGCGGAAGAAGAGGAAACCGTGATGATTTGCATGACCCCAGAGGACCTGGAGACACC{AG}CGTCTTCAAGGACGAGGACCGCAATCT------GGCCAGAAAAATGATGCGAATGATGCCGATTTTGACCCGGCAGCTCGACTGAAACCTACCTTAGGAAAGAGCGCACCTCACGAATGGACCCACTGCGAGATTCATCCCAGCATGATCTTGGGAATTTGCGCTAGCATTATTCCGTTCCCTGATCATAATCAAGTACGTCTCGTCATCCCGATCCTTCTACCCTAGTTCTCGTATTCTCGTGCTAA{CT}ACGA-C-AACAGTCCCCTCGTAACACATATCAATC{AG}GCCATGGGCAA????????????--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ; END; BEGIN TREES; TITLE Lactifluus; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Lactifluus_aff._phlebonemus_EDC12023_Cameroon, 2 'Lactifluus albocinctus AV99211_Zimbabwe', 3 'Lactifluus albomembranaceus EDC12046_Cameroon', 4 'Lactifluus brunellus TH9130_Guyana', 5 'Lactifluus bruneoviolascens AV13038_Italy', 6 'Lactifluus brunnescens AV05083_Malawi', 7 'Lactifluus caribaeus JP_Fiard_827_B_Martinique', 8 'Lactifluus caribaeus PAMMart12090_Martinique', 9 'Lactifluus carmineus AV99099_Zimbabwe', 10 'Lactifluus castaneibadius CLMART06019_Martinique', 11 Lactifluus_cf._murinipes_LD15020_Martinique, 12 Lactifluus_cf._murinipes_LD15054_Martinique, 13 Lactifluus_cf._nebulosus_LD15059_Martinique, 14 Lactifluus_cf._nebulosus_LD15061_Martinique, 15 Lactifluus_cf._tanzanicus_AV11017_Tanzania, 16 'Lactifluus chiapanensis VMB4374_AMexico', 17 'Lactifluus clarkeae MN2004002_Australia2', 18 'Lactifluus coccolobae OKM2740_Puerto_Rico', 19 'Lactifluus denigricans EDC11218_Tanzania', 20 'Lactifluus flammans 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piperogalactus FW22_2017', 44 'Lactifluus putidus LD_15034_Martinique', 45 'Lactifluus putidus LD_15039_Martinique', 46 'Lactifluus rubrobrunnescens EH7194_Indonesia', 47 'Lactifluus rubroviolascens EDC12051_Cameroon', 48 Lactifluus_spathuliformis_DLK116, 49 Lactifluus_spathuliformis_DLK1891, 50 'Lactifluus sp G3185_French_Guiana', 51 'Lactifluus sphatuliformis DLK_346', 52 'Lactifluus sp JLC06031001_French_Guiana', 53 'Lactifluus sp KW392_Thailand', 54 'Lactifluus sp PGK13130_New_Caledonia', 55 'Lactifluus sp REH9398_Australia', 56 'Lactifluus subclarkeae REH9231_Australia', 57 'Lactifluus tanzanicus TS1277_Tanzania'; TREE PAUP_1 = [&R] 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