#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 27, 2024; 4:21 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Wayne R., Geffen E., Girman D., Koepfli K., Lau L., & Marshall C. 1997. Molecular systematics of the Canidae. Systematic Biology, 46(4): 622-653. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S379] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=25; TAXLABELS Atelocynus_microtis Canis_adustus Canis_aureus Canis_latrans Canis_lupus Canis_mesomelas_S Canis_mesomelas_T Canis_simensis Cerdocyon_thous Chrysocyon_brachyurus Cuon_alpinus Fennecus_zerda Lycalopex_vetulus Lycaon_pictus Nyctereutes_procyonoides Otocyon_megalotis Phoca_vitulina Pseudalopex_culpaeus Pseudalopex_griseus Pseudalopex_gymnocercus Pseudalopex_sechurae Speothos_venaticus Urocyon_cinereoargenteus Vulpes_macrotis Vulpes_vulpes ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M2580] TITLE Appendix_1; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=2001; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Canis_mesomelas_T 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Canis_simensis ATGACCAACA??CGAAAAACCCACCCACTAGCCAAAATTGTTAATAACTCATTCATTGACCTCCCAGCGCCATCTAACATCTCTGCTTGATGGAATTTCGGATCCTTACTAGGAGTATGCTTGATTCTACAGATTCTAACAGGTTTATTTTTAGCTATACACTATACATCGGACACAGCCACAGCTTTCTCATCAGTCACTCACATCTGTCGAGATGTTAACTACGGCTGAATTATCCGCTATATACATGCAAATGGCGCTTCCATGTTCTTTATCTGTCTATTCATACATGTGGGACGAGGCCTATACTACGGATCCTATGTATTCATAGAAACATGAAACATTGGAATTGTACTACTATTCGCAACCATAGCCACAGCATTCATAGGTTATGTAACTCCTCCACATATTAAACCCGAGTGATATTTCCTATTTGCCTACGCTATCCTACGATCCATCCCTAATAAGCTAGGAGGCGTACTCGCCCTAGTATTCTCTATCCTAATCCTAGCATTCATTCCATTCCTCCACACATCCAAACAACGCAGCATAATATTTCGACCTCTCAGTCAATGCCTATTCTGACTTCTAGTCGCTGATCTTCTCACCTTAACATGAATCGGAGGACAACCAGTAGAACACCCCTTTATCATTATCGGCCAAGTCGCCTCAGTTCTATACTTTACTATCTTATTGATTCTAATACCAACTATTAGCGTTATCGAAAACTTCTGATTCTTCGGGCATCCTGAAGTTTACATTCTTATCCTGCCCGGATTCGGAATAATTTCTCACATTGTCACTTACTACTCAGGGAAAAAAGAGCCTTTCGGCTATATAGGAATAGTGTGGGCAATAATATCTATTGGGTTTTTAGGCTTTATCGTATGAGCTCACCATATGTTTACCGTGGGAATAGACGTAGACACACGAGCATACTTCACATCCGCCACTATAATTATTGCTATTCCAACAGGGGTAAAAGTATTTAGTTGACTAGCAACACTTCACGGAGGCAATATTAAATGATCTCCAGCTATACTATGGGCTTTAGGGTTTATTTTTCTATTTACAGTCGGCGGGTTAACAGGAATTGTCCTAGCTAATTCGTCCTTAGACATCGTCCTTCATGACACATATTATGTTGTAGCTCATTTCCACTATGTGCTTTCAATGGGAGCAGTTTTTGCCATTATGGGGGGATTTGCCCACTGATTCCCTTTATTCTCAGGTTATACTCTTAACGATACTTGAGCAAAAATTCACTTTACAATTATGTTTGTGGGAGTAAATATAACTTTCTTCCCTCAACATTTCATGGCGTACCCATTTCAACTCGGATTACAGGACGCAACCTCCCCTATTATAGAGGAGCTACTTCATTTTCATGACCATACATTAATAATTGTATTCTTAATCAGTTCTTTAATTCTCTACATCATTTCACTAATATTGACTACAAAATTAACTCATACAAGCACAATAGACGCACAAGAAGTAGAAACAGTATGGACTATCCTACCCGCCATTATCCTAATCCTAATCGCTCTACCTTCCCTCCGAATCCTTTATATAATAGACGAAATTAATAACCCCTCATTAACTGTAAAAACGATAGGCCACCAATGATACTGAAGCTATGAATATACTGATTATGAAGACCTAAACTTTGACTCCTACATAATCCCAACACAAGAATTAAAGCCAGGAGAACTCCGACTATTAGAAGTAGACAACCGAGTTGTCCTCCCAATAGAAATAACCATTCGAATACTTATCTCTTCAGAAGACGTTCTGCATTCGTGAGCTGTTCCATCACTAGGTCTAAAAACTGACGCCATTCCAGGACGACTAAACCAAACCACCCTTATAGCTACACGACCAGGACTGTATTATGGCCAGTGTTCTGAAATCTGCGGATCTAACCATAGCTTTATGCCCATCGTTCTTGAAATAGTCCCCCTATCTTACTTTGAAACCTGATCTGCCTTAATAGTATAA Cerdocyon_thous ATGACCAACATTCGAAAAACCCACCCACTAGCTAAAATTGTTAACAACTCATTTATTGACCTCCCAGCACCATCTAATATTTCCGCTTGATGAAACTTCGGATCCTTGCTAGGAGTATGCTTGATTCTACAGATTGCAACAGGTTTATTCTTAGCTATGCACTATACATCGGACACAGCCACAGCCTTTTCATCAGTCACTCACATCTGCCGAGATGTTAATTACGGCTGAATTATCCGCTACATACATGCAAATGGTGCCTCCATATTCTTTATCTGTCTGTTCATACATGTAGGACGAGGTCTGTACTATGGATCATATGTATTCATAGAAACATGAAATATTGGAGTCGTACTATTATTTGCAACTATAGCCACAGCATTCATGGGCTATGTAACCCCTCCACATATTAAACCCGAATGATATTTCCTATTTGCCTACGCTATCCTACGGTCTATCCCTAACAAACTAGGAGGTGTACTAGCCCTAGTATTCTCCATTCTGATCCTAGCACTCATTCCCCTTTTCCACACATCCAAGCAACGTAGCATAATATTCCGACCCCTTAGCCAATGCCTATTCTGACTTTTAACCGCTGATCTTCTTACTTTAACATGAATTGGAGGACAGCCAGTAGAACACCCCTTTATCATTATTGGACAAATCGCCTCCATCCTATACTTTACTATCTTATTGATTCTAATACCAACGATCAGCATTATCGAAAATTTCTGATTCTTCGGACATCCTGAAGTTTATATCCTAATTTTACCTGGATTTGGAATGATCTCTCATATTGTTACTTACTACTCAGGGAAAAAAGAACCTTTTGGTTACATAGGAATAGTATGAGCAATAATATCTATTGGGTTCTTAGGCTTCATTGTATGAGCTCACCATATATTTACTGTAGGAATAGATGTGGACACACGGGCATACTTTACATCTGCTACTATGATTATTGCTATCCCAACAGGAGTAAAAGCATTTAGTTGATTAGCAACACTTCATGGAGGCAATATTAAATGATCCCCAGCCATGCTATGAGCACTAGGGTTTATTTTTCTATTTACAGTAGGCGGATTAACAGGAATCGTCCTAGCTAATTCGTCCTTAGACATTGTTCTTCATGATACATATTATGTTGTAGCCCATTTCCACTACGTACTTTCAATAGGAGCAGTATTTGCCATTATAGGTGGATTTGCCCACTGGTTTCCTCTATTCTCAGGCTATACTCTTAACGACACCTGAGCAAAGATTCATTTTACAATTATATTTGTAGGAGTAAATATAACTTTCTTCCCTCAACACTTTATGGCGTACCCCTTTCAACTCGGATTACAGGACGCAACCTCCCCTATCATAGAGGAGCTACTTCATTTCCATGACCATACATTAATAATCGTATTCTTAATTAGCTCTCTAGTTCTCTATATTATTTCATTAATACTAACTACAAAATTAACTCACACAAGCACAATAGACGCACAAGAAGTAGAAACAGTATGAACTATTCTACCAGCCATTATCCTAGTCCTGATTGCACTACCTTCTCTCCGAATCCTCTATATAATAGACGAAATTAACAACCCATCACTAACCGTAAAAACAATAGGCCACCAATGATACTGAAGTTATGAGTACACCGACTATGAAGATTTAAACTTTGACTCTTACATGATCCCAACACAAGAACTAAAACCAGGAGAACTCCGACTATTAGAAGTAGACAACCGAGTTGTCCTTCCAATAGAAATAACAGTTCGAATACTTATCTCCTCAGAAGACGTTTTACACTCATGAGCTGTTCCATCACTAGGTCTAAAAACTGACGCTATTCCAGGACGACTAAATCAAACTACTCTCATAGCCATACGACCAGGACTATATTATGGTCAATGCTCTGAAATCTGCGGATCCAACCACAGCTTTATACCTATTGTCCTCGAAATAGTTCCCTTATCCTACTTTGAAACCTGATCAGCCTTAATGGTATAA Chrysocyon_brachyurus ??GACCAACATTCGAAAAACCCATCCATTAGTTAAAATTATTAATAACTCATTCATTGACCTCCCAGCACCATCTAACATCTCCACTTGATGAAATTTCGGATCCTTGCTAGGGGTATGCTTAATTCTACAGATTCTAACAGGTTTATTTTTAGCTATACACTACACATCGGATACTGCCACAGCCTTTTCATCAGTTACTCACATCTGCCGAGACGTTAACTATGGCTGAATTATCCGCTACATACATGCGAACGGCGCCTCTATATTCTTTATCTGCTTATTTATACATGTGGGACGAGGCCTATACTATGGATCTTATATATTCATAGAAACATGAAACATCGGAGTCGTACTGTTACTCGCAACTATAGCTACAGCATTCATAGGCTATGTA???CCTCCACATATTAAACCCGAATGGTATTTCCTATTCGCCTACGCTATCCTACGATCCATTCCTAATAAACTAGGAGGTGTACTCGCCCTAGTATTCTCTATTCTAATCCTAATATTCGTTCCCCTTCTCCACACATCTAAACAACACAGCATAATATTTCGACCGCTCAGCCAATGCCTATTTTGACTTCTAACTGCCGATCTCCTTACTCTAACATGAATCGGAGGGCAACCAGTAGAACACCCCTTCATTATCATTGGGCAAATCGCTTCTATCCTATACTTTACCATCTTATTGATTCTAATACCAACAATCAGCATTATCGAAAATTTTTGATTTTTCGGACATCCTGAGGTTTATATCCTAATCCTACCTGGATTCGGAATGATCTCTCATATTGTCACTTATTATTCAGGGAAAAAAGAACCCTTTGGTTATATGGGAATAGTATGGGCAATAATATCTATTGGATTTCTAGGCTTTATTGTATGAGCTCACCACATATTTACCGTAGGAATAGATGTAGACACGCGAGCATACTTCACATCTGCCACTATAATTATTGCTATTCCAACAGGAGTGAAAGTATTTAGTTGATTGGCAACACTTCACGGAGGTAACATTAAATGATCCCCAGCCATGCTATGGGCCCTAGGGTTTATTTTTCTATTCACAGTGGGTGGATTAACAGGAATTGTCCTGGCCAACTCGTCTTTAGATATTGTTCTTCATGATACATACTACGTTGTAGCCCATTTTCACTACGTGCTTTCAATAGGAGCAGTATTTGCCATCATGGGTGGATTTGCTCATTGATTTCCCTTATTCTCAGGCTACACCCTTAATGACACCTGAGCAAAAATTCACTTTACAATTATGTTTGTAGGGGTAAATATAACCTTTTTCCCTCAACACTTCATGGCGTACCCCTTTCAACTCGGATTACAGGACGCAACCTCCCCTATTATAGAAGAGCTACTCCACTTCCATGATCATACATTGATAATTGTGTTTCTAATCAGTTCCCTGGTTCTCTACATTATTTCCTCAATATTAACTACAAAACTAACTCATACAAGCACGATAGACGCACAAGAGGTAGAAACAGTATGAACTATCCTACCAGCCATCATCCTAGTCCTAATCGCGTTACCTTCCCTCCGAATCCTGTATATAATAGACGAAACTAACAACCCCTCTTTAACGGTGAAAACAATAGGTCATCAATGATATTGAAGCTATGAATATACTGACTACGAAGACTTAAACTTTGACTCTTACATGATCCCAACACAAGAACTAAAACCAGGAGAACTACGACTACTAGAAGTAGACAACCGAGTTGTTCTCCCAATAGAGATAACTATCCGAATACTTATCTCATCAGAAGACGTATTACATTCATGAGCTGTTCCATCACTAGGCTTAAAAACTGACGCTATCCCAGGACGACTGAATCAAACTACCCTTATAGCTATACGACCAGGGCTATACTATGGCCAATGCTCTGAAATCTGCGGATCTAATCACAGCTTTATACCTATTGTTCTTGAAATAGTCCCCTTATCATACTTTGAAACCTGATCTGCCCTAATAGTATAA Cuon_alpinus ATGACCAACATTCGAAAAGCCCACCCACTAGCTAAAATTGTTAATAACTCATTCATTGACCTCCCAGCACCATCTAACATCTCCGCTTGATGGAACTTCGGATCCTTACTAGGAGTATGCCTGATTCTACAGATTCTAACAGGTTTATTTCTAGCTATACACTATACATCAGACACAGCCACAGCCTTTTCATCAGTCACCCACATCTGTCGAGACGTTAACTACGGCTGAATTATCCGCTATATACATGCAAATGGCGCTTCTATATTCTTTATCTGCCTATTTATACACGTAGGACGAGGCCTATATTATGGGTCCTATGTATTCATAGAAACATGAAACATTGGAATTGTTCTGCTATTTGCAACTATAGCCACAGCATTCATAGGCTACGTA??????CCACATATCAAACCTGAATGATACTTCCTATTTGCCTATGCTATCCTACGATCCATCCCTAATAAACTAGGAGGTGTACTCGCTCTAGTATTCTCCATTCTAATCCTGGCATTTATTCCCTTCCTCCACACATCCAAGCAACGAAGCATAATATTTCGGCCTCTCAGCCAATGCCTATTCTGACTTCTAGTCGCCGACCTTCTCACTTTAACATGAATCGGAGGACAGCCAGTAGAACACCCCTTTATCATTATTGGACAAATCGCCTCAGTTCTATATTTTATCATCCTATTGATTCTAATACCAATAATCAGCGTTATCGAAAATTTCTGATTTTTCGGACACCCTGAAGTTTACATTCTTATTCTACCCGGATTCGGAATAATCTCTCACATCGTCACCTATTACTCAGGGAAAAAAGAGCCTTTCGGCTATATAGGAATGGTATGGGCAATAATATCTATCGGGTTCTTAGGCTTCATCGTATGAGCTCACCATATGTTTACCGTAGGAATAGACGTAGACACACGAGCATACTTCACATCCGCTACAATAATCATCGCTATTCCAACAGGAGTAAAAGTATTCAGTTGGTTGGCAACACTTCACGGAGGTAATATTAAATGGTCCCCAGCTATACTGTGAGCTTTAGGGTTTATTTTTCTATTTACAGTGGGTGGATTAACAGGTATTGTCCTAGCTAACTCGTCCCTAGATATCGTTCTTCATGATACATACTATGTTGTAGCTCATTTTCACTACGTGCTTTCAATGGGAGCAGTATTTGCTATTATGGGCGGATTTGCCCATTGATTCCCCTTATTCTCAGGTTACACTCTTAATGACACTTGAGCAAAAATTCACTTTACAATTATGTTTGTAGGAGTAAATATAACTTTCTTCCCCCAACATTTCATGGCGTACCCTTTTCAACTCGGATTACAGGACGCAACCTCCCCTATTATAGAGGAACTACTTCATTTTCATGACCACACACTAATAATTGTATTCTTAATCAGCTCTTTAGTTCTTTATATCATCTCATTAATATTGACTACAAAATTAACTCATACAAGCACAATAGACGCACAAGAAGTAGAAACAGTATGAACTATTCTACCCGCCATTATCCTAATCTTAATCGCACTACCTTCTCTCCGAATCCTTTATATGATAGACGAAATTAATAATCCCTCCTTAACCGTAAAAACAATAGGCCACCAATGATACTGAAGTTATGAATATACTGACTATGAAGACTTAAACTTTGACTCTTACATAATCCCAACACAAGAACTAAAGCCAGGAGAACTACGACTATTAGAAGTAGACAACCGAGTTGTTCTCCCAATAGAAATAACTATCCGAATGCTTATCTCATCAGAAGACGTTTTACACTCATGAGCTGTCCCATCACTAGGCTTAAAGACTGACGCTATTCCAGGACGACTAAACCAAACTACCCTTATAGCCATACGACCAGGACTATATTATGGTCAATGCTCCGAAATCTGCGGATCTAATCATAGCTTTATGCCTATTGTTCTTGAAATAGTCCCCTTATCTTACTTCGAAGCCTGATCTGCCCTAATAGTATAA Fennecus_zerda 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Nyctereutes_procyonoides 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Otocyon_megalotis 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Phoca_vitulina 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Vulpes_macrotis ????????????CGAAAGACTCACCCACTAGCTAAAATCGTTAACGATTCATTCATTGACCTCCCCGCACCATCCAACATTTCTGCCTGATGAAACTTCGGATCCCTCCTAGGTGTCTGCCTCATTCTACAGATTATAACAGGCCTATTTCTAGCCATACACTACACATCCGATACAGCTACTGCTTTTTCATCAGTTACACACATTTGCCGAGACGTTAACTACGGCTGAATTATTCGCTACATACATGCAAATGGAGCATCTATATTCTTCATTTGTCTGTTCATGCACGTGGGACGAGGCTTATATTATGGATCCTACGTATTCATAGAAACATGAAACATCGGAATTGTCTTACTATTCGCAACCATAGCCACAGCATTTATAGGTTACGTAACCCCTCCACATATCAAACCCGAGTGATACTTCCTATTCGCCTACGCTATTCTCCGGTCTATCCCTAACAAACTAGGGGGAGTCCTCGCCCTAGTATTCTCCATCCTAATCTTAGCACTCATCCCTCACCTCCATACCTCAAAACAACGCGGAATAATATTCCGACCCCTCAGTCAATGCCTATTCTGACTCCTAACCGCAGACCTCCTCACCTTAACCTGAATTGGAGGACAGCCAGTAGAACACCCCTTTATCATCATCGGCCAAATCGCCTCTATCCTATACTTTGCTATCTTATTGATTCTAATGCCAACCATTAGCATTATTGAAAATTTTTGATTCTTCGGACACCCCGAGGTCTATATTTTAATCTTGCCTGGGTTTGGTATAATCTCCCACATCGTCACTTACTATTCAGGGAAAAAAGAACCCTTTGGTTATATAGGAATGGTATGAGCAATAATGTCTATCGGATTTTTAGGCTTTATCGTGTGAGCCCATCACATATTCACTGTAGGAATAGACGTGGATACACGAGCATACTTCACGTCCGCCACTATAATCATTGCCATTCCTACAGGGGTTAAAGCATTCAGCTGATTAGCAACACTTCACGGGGGCAATATTAAATGATCTCCAGCCATGCTATGAGCTCTAGGGTTTATTTTTCCATTCACGGTAGGTGGGCTAACGGGCATCGTTTTAGCCAACTCGTCCCTGGACATCGTTCTCCATGACACGTACTACGTTGTAGCCCACTTCCACTACGTACTCTCAATGGGAGCAGTATTTGCTATTATAGGCGGATTTGCCCACTGATTCCCCCTATTCTC?GGCTACACCCTAAATGACACCTGAGCAAAAATCCATTTTACAATCATATTCGTAGGGGTGAACATGACCTTCTTCCCTCAACACTTCATGGCGTACCCTTTTCAACTCGGATTACAGGACGCAACCTCCCCTATTATAGAGGAGTTACTTCATTTTCATGATCATACCCTAATAATTGTATTCTTAATCAGCTCATTAGTTCTTTATATTATTACCTTAATATTAACCACCAAGCTAACTCATACAAGTACAATAGACGCACAAGAGGTAGAAACAGTCTGAACAATTCTACCAGCCATTATCCTAATCCTAATCGCTCTGCCCTCTCTACGGATTCTCTACATAATAGATGAAATTAATAACCCATCACTAACTGTAAAAACAATAGGCCACCAATGATATTGAAGCTACGAATACACTGACTACGAAGACCTAAACTTTGACTCCTACATAATTCCCACACAAGAATTAAAACCAGGGGAGCTTCGACTATTAGAAGTTGATAACCGAGTTGTTCTCCCAATAGAAATAACCGTCCGAATACTTATCTCTTCAGAAGACGTATTACACTCATGAGCCGTTCCATCACTAGGCTTAAAAACTGATGCCATCCCAGGACGATTAAATCAAACTACCCTAATAGCGATACGACCAGGGCTATATTACGGCCAATGCTCTGAAATTTGCGGATCCAACCACAGCTTCATACCAATTGTTCTTGAAATAGTCCCACTGTCCTACTTCGAAACCTGATCTGCCTTAATGGTTTAA Vulpes_vulpes ATGACCAACACCCGAAAGACTCACCCACTAGCTAAAATTGTCAACAACTCATTCATCGACCTTCCCGCACCATCAAATATCTCTGCCTGATGGAACTTGGGTCCCCTGCTAGGTGTATGCCTTATTCTACAGATTGTAACAGGTCTATTTTTAGCCATACACTATACATCAGACACAGCTACTGCCTTTTCATCAGTCACTCACATCTGCCGAGACGTTAACTATGGCTGAATTATCCGTTACATACATGCAAATGGAGCCTCCATATTCTTCATCTGCCTCTTTATGCACGTAGGACGAGGCTTATACTATGGCTCCTATGTATTCATAGAAACATGAAATATTGGAATTATCCTCCTGTTTGCAACCATAGCCACAGCATTCATAGGCTACGTCACTCCCCCACATATCAAACCCGAATGGTACTTCCTATTTGCCTATGCTATTCTCCGGTCCATCCCTAATAAACTAGGAGGAGTCCTAGCTCTAGTGTTCTCAATCCTAATCTTAGCACTTATCCCCCACCTACACACCTCAAAACAACGTGGAATAATATTCCGACCCCTTAGTCAATGCCTATTCTGACTTCTAACCGCAGACCTCCTCACCTTAACTTGAATTGGAGGGCAGCCGGTAGAACACCCCTTTATCATCATTGGCCAAATTGCCTCCATCCTATATTTTGCTATCTTATTGATTCTAATGCCAACCATTAGCATTATCGAAAACTTTTGATTCTTCGGACATCCTGAAGTCTACATTTTAATCTTGCCTGGGTTTGGTATAATCTCCCACATCGTCACCTACTATTCAGGAAAGAAAGAGCCCTTTGGTTACATGGGAATGGTATGAGCAATAATGTCTATCGGATTCTTAGGCTTTATCGTATGAGCTCACCACATATTCACTGTAGGAATAGACGTAGATACACGAGCATACTTCACGTCTGCTACCATAATCATTGCCATTCCTACAGGGGTTAAAGCATTCAGCTGATTAGCAACACTTCACGGGGGCAATATTAAATGATCTCCGGCCATACTATGAGCTCTAGGGTTTATTTTTCCATTTACAGTAGGTGGGCTAACGGGCATCGTTTTAGCCAACTCATCCTTAGATATCGTTCTTCATGACACGTACTACGTCGTAGCTCACTTCCACTACGTTCTCTCAATAGGAGCAGTATTTGCTATCATAGGCGGGTTTGCCCACTGATTCCCCCTATTCTCAGGTTATACTCTAAATGACACCTGAGCGAAAATCCACTTTACAATTATATTTGTAGGGGTGAACATAACTTTCTTCCCTCAACACTTCATGGCGTACCCTTTTCAACTCGGATTACAGGACGCGACCTCCCCTATTATAGAGGAGCTACTTCATTTTCATGATCATACCCTAATAATCGTATTCTTAATCAGCTCATTAGTTCTTTACATTATTACTTTAATACTAACTACCAAGCTAACCCATACAAGTACAATAGACGCGCAAGAGGTAGAAACAGTCTGAACCATCCTACCAGCCATTATCCTAATCCTGATTGCTCTTCCTTCTCTACGAATTCTCTACATAATGGATGAAATTAATAACCCATCACTAACCGTAAAAACAATAGGCCATCAATGATACTGAAGCTACGAGTACACTGACTATGAAGATCTGAACTTTGACTCCTACATGATTCCTACACAAGAATTAAAACCAGGAGAACTCCGACTATTAGAAGTCGACAACCGAGTCGTTCTCCCAATGGAAATAACTGTCCGAATACTTATTTCTTCAGAAGACGTATTGCACTCATGAGCCGTTCCATCACTAGGCTTAAAAACTGATGCCATCCCAGGACGATTAAATCAAACTACCCTAATAGCGATGCGACCAGGGCTATACTACGGCCAATGCTCTGAAATTTGCGGATCCAACCACAGCTTCATACCGATTGTTCTTGAAATAGTCCCACTGTCCTACTTCGAAACCTGATCTGCTGTAATGGTTTAA ; END; BEGIN TREES; TITLE Tb5200; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Phoca_vitulina, 2 Urocyon_cinereoargenteus, 3 Nyctereutes_procyonoides, 4 Vulpes_macrotis, 5 Vulpes_vulpes, 6 Fennecus_zerda, 7 Otocyon_megalotis, 8 Pseudalopex_griseus, 9 Pseudalopex_culpaeus, 10 Lycalopex_vetulus, 11 Pseudalopex_gymnocercus, 12 Pseudalopex_sechurae, 13 Atelocynus_microtis, 14 Cerdocyon_thous, 15 Canis_adustus, 16 Speothos_venaticus, 17 Chrysocyon_brachyurus, 18 Lycaon_pictus, 19 Cuon_alpinus, 20 Canis_mesomelas_T, 21 Canis_mesomelas_S, 22 Canis_aureus, 23 Canis_simensis, 24 Canis_latrans, 25 Canis_lupus; TREE Fig._2b = [&R] (1,(2,(3,(7,(((5,4)Vulpes,6),(((16,17),(18,(15,(((21,20)Canis_mesomelas,(((24,25),23),22)),19)))),(((8,(11,(12,(9,10)))),13),14))))))Canidae); END; BEGIN TREES; TITLE Tb5199; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Phoca_vitulina, 2 Urocyon_cinereoargenteus, 3 Nyctereutes_procyonoides, 4 Vulpes_macrotis, 5 Vulpes_vulpes, 6 Fennecus_zerda, 7 Otocyon_megalotis, 8 Pseudalopex_griseus, 9 Pseudalopex_culpaeus, 10 Lycalopex_vetulus, 11 Pseudalopex_gymnocercus, 12 Pseudalopex_sechurae, 13 Atelocynus_microtis, 14 Cerdocyon_thous, 15 Canis_adustus, 16 Speothos_venaticus, 17 Chrysocyon_brachyurus, 18 Lycaon_pictus, 19 Cuon_alpinus, 20 Canis_mesomelas_T, 21 Canis_mesomelas_S, 22 Canis_aureus, 23 Canis_simensis, 24 Canis_latrans, 25 Canis_lupus; TREE Fig._2a = [&R] (1,2,(3,((7,(6,(5,4))),(((((16,17),18),((((25,(24,23)),22),(21,20)),19)),15),(14,(((8,((9,10),11)),12),13)))))); END; BEGIN TREES; TITLE Tb5201; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Phoca_vitulina, 2 Urocyon_cinereoargenteus, 3 Nyctereutes_procyonoides, 4 Vulpes_macrotis, 5 Vulpes_vulpes, 6 Fennecus_zerda, 7 Otocyon_megalotis, 8 Pseudalopex_griseus, 9 Pseudalopex_culpaeus, 10 Lycalopex_vetulus, 11 Pseudalopex_gymnocercus, 12 Pseudalopex_sechurae, 13 Atelocynus_microtis, 14 Cerdocyon_thous, 15 Canis_adustus, 16 Speothos_venaticus, 17 Chrysocyon_brachyurus, 18 Lycaon_pictus, 19 Cuon_alpinus, 20 Canis_mesomelas_T, 21 Canis_mesomelas_S, 22 Canis_aureus, 23 Canis_simensis, 24 Canis_latrans, 25 Canis_lupus; TREE Fig._2c = [&R] (1,(2,((7,3),(((5,4),6),((16,17),((18,(15,((((24,25),23),22),(19,(21,20))))),((12,(((10,9),11),8)),(14,13)))))))); END;