#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 20, 2024; 11:33 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Mardulyn P., Milinkovitch M., & Pasteels J. 1997. Phylogenetic analyses of DNA and allozyme data suggest that Gonioctena leaf beetles (Coleoptera; Chrysomelidae) experienced convergent evolution in their history of host-plant family shifts. Systematic Biology, 46(4): 722-747. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S381] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=35; TAXLABELS Chrysomela_tremula Gonioctena_fornicata Gonioctena_fornicata_a Gonioctena_fornicata_b Gonioctena_holdausi Gonioctena_intermedia Gonioctena_interposita_1 Gonioctena_interposita_2 Gonioctena_interpositus_1 Gonioctena_interpositus_2 Gonioctena_kamikawai Gonioctena_linnaeana Gonioctena_nigroplagiata Gonioctena_occidentalis Gonioctena_olivacea Gonioctena_olivacea_1 Gonioctena_olivacea_2 Gonioctena_olivacea_3 Gonioctena_pallida_1 Gonioctena_pallida_2 Gonioctena_pallida_3 Gonioctena_quinquepunctata Gonioctena_quinquepunctata_1 Gonioctena_quinquepunctata_2 Gonioctena_quinquepunctata_3 Gonioctena_rubripennis Gonioctena_rufipes Gonioctena_tredecimmaculata Gonioctena_variabilis Gonioctena_variabilis_1 Gonioctena_variabilis_2 Gonioctena_viminalis Gonioctena_viminalis_1 Gonioctena_viminalis_2 Oreina_cacaliae ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa2; DIMENSIONS NTAX=22; TAXLABELS Chrysomela_tremula Gonioctena_fornicata Gonioctena_holdausi Gonioctena_intermedia Gonioctena_interpositus_1 Gonioctena_interpositus_2 Gonioctena_linnaeana Gonioctena_olivacea_1 Gonioctena_olivacea_2 Gonioctena_olivacea_3 Gonioctena_pallida_1 Gonioctena_pallida_2 Gonioctena_pallida_3 Gonioctena_quinquepunctata_1 Gonioctena_quinquepunctata_2 Gonioctena_quinquepunctata_3 Gonioctena_rufipes Gonioctena_variabilis_1 Gonioctena_variabilis_2 Gonioctena_viminalis_1 Gonioctena_viminalis_2 Oreina_cacaliae ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa3; DIMENSIONS NTAX=21; TAXLABELS Chrysomela_tremula Gonioctena_fornicata_a Gonioctena_fornicata_b Gonioctena_holdausi Gonioctena_intermedia Gonioctena_interposita_1 Gonioctena_interposita_2 Gonioctena_kamikawai Gonioctena_linnaeana Gonioctena_nigroplagiata Gonioctena_occidentalis Gonioctena_olivacea Gonioctena_pallida_1 Gonioctena_pallida_2 Gonioctena_quinquepunctata Gonioctena_rubripennis Gonioctena_rufipes Gonioctena_tredecimmaculata Gonioctena_variabilis Gonioctena_viminalis Oreina_cacaliae ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa4; DIMENSIONS NTAX=21; TAXLABELS Chrysomela_tremula Gonioctena_fornicata_a Gonioctena_fornicata_b Gonioctena_holdausi Gonioctena_intermedia Gonioctena_interposita_1 Gonioctena_interposita_2 Gonioctena_kamikawai Gonioctena_linnaeana Gonioctena_nigroplagiata Gonioctena_occidentalis Gonioctena_olivacea Gonioctena_pallida_1 Gonioctena_pallida_2 Gonioctena_quinquepunctata Gonioctena_rubripennis Gonioctena_rufipes Gonioctena_tredecimmaculata Gonioctena_variabilis Gonioctena_viminalis Oreina_cacaliae ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M2677] TITLE 16S_Alignment_3; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=495; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Chrysomela_tremula AGACCTAATA-TTTTAGCTCCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTTGATTTGAACTCTAAAAAAAAATAACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTAATCTTATAATC--ACTAAATTTGGATCAAATATTCATTAATTAATGTTAAATTATAAAAAAAGTTAAATTAATTTTTTAATCACCCCAACTAAATAAATACCTAAATTAATAAAATTAATTCTAAATATAATAA-TTTA-TTTATATATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATGAAATTTAAGCTTTTTAACTTAAATATAAAATTCTAATAAAATTAAATAAAGACAGTTATTTTTTTATCCAACCC-TTCATTCCAGCTTTCAATTAAAAAACTATTGATTATGCTACCTTAGCACGGTTAAAATACCGCGGCCATTC-AAT-TCTCATTGGGCAGGCTAGACTTTAAAT???????CCACCCCCA Gonioctena_fornicata_a AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTATTATATAAAAAAAGTTAATTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAAAAAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAACTTTA-TTTTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAACAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTCTAATTAAGAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCCTTCAAAT-TTTCAGCGGGCAGGTCAGACCTTAAATTATAATCCCAACCACA Gonioctena_fornicata_b AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTATTATATAAAAAAAGTTAATTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAAAAAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAACTTTA-TTTTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAACAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTCTAATTAAGAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCCTTCAAAT-TTTCAGCGGGCAGGTCAGACCTTAAATTATAATCCCAACCACA Gonioctena_holdausi AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAAAATTGGATCAATAACTCATAAATTAATGGTATATTACAAAAAAAGTTAAATAAATTTTTTAATCGCCCCAATCAAATTATAAATCAAATTTAATACATAAATTCTAAAATAAAAAA-TATA-AATTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATTTAACTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTTTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTCAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAATATTTCAGTGGGCAGGCCAGACCTAAAATTA?????CCACCCAAA Gonioctena_intermedia AGACCTAATT-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAACTATTGGATCAATAACTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTACTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTAT-AAAAAAAATTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TATA-TTCTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTGTATTATAATCCCCCCCACA Gonioctena_interposita_1 AGACCTAATC-TTTCAGCTTCTGCACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAACTGGATCAATGATTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTACTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTAT-AGAAAAAATTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TTTA-TACTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGCTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCCCCCACA Gonioctena_interposita_2 AGACCTAATC-TTTCAGCTTCTGCACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAACTGGATCAATGATTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTACTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTAT-AGAAAAAATTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TTTA-TACTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGCTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCCCCCACA Gonioctena_kamikawai AGACCTAATA-TTTCAGCTTCTACACCAAAAATTTACTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATTATTGGATCAAGAAATCATAAATTAATGAATAATTACAAAAAAAGTTAATTAAATTTTTCAATCACCCCAATCAAATTATAAATCAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATATAAAA-TATA-ATATATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTCAATTATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTCAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAATATATCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTAAATTCCCACCCAAA Gonioctena_linnaeana AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATAAACTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATCAAAAAAAAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTATATTACAAAAAAAGTTTATCATATTTTTCAATCACCCCAATCAAATTATAGATCAAATTTAATAATTAAATTCTAAAATAAAAAA-TATG-TACTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATTTAAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAACAGAGACAGTTATTTTTTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAATAATTCAGTGGGCAGGCCAGACCTAAAATTAAAT??CAACCCAAA Gonioctena_nigroplagiata AGACCTAATT-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATAAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTGTAATC--AAAATAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTAATTATACAAAAAAAGTTTATTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTAT-AAAAAAAATTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAA-TTTATTTTTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGCTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCCTTCAAAT-CTTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAA?????????CCCCACACA Gonioctena_occidentalis AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAAAATTGGATCAATAATTCATAAATCAATGTTATATTACAAAAAAAGTTAAATAAATTTTTTAATCGCCCCAATCAAATTATAAATCAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAA-TATA-AACTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATTTAACTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTTTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTCAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAATATTTCAGTGGGCAGGCCAGACCT-AAATTA?????CCACCCAAC Gonioctena_olivacea ?GACCCAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAACTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAAAATTGGATCAATAAATCATACATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTAATTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAAAAAAAATGAATAAAAAAATACTAAAATAAAAAA-TTTA-TTTTAAAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATATTAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCCTTTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCACCAACA Gonioctena_pallida_1 ?GACCTAATA-TTTCAGCTTCTACACCAAAAATTAACTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAACTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTACTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTAT-AGAAAAAATTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TTTA-TACTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCCCCCACA Gonioctena_pallida_2 ?GACCTAATA-TTTCAGCTTCTACACCAAAAATTAACTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAACTGGATCAATGATTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTACTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTAT-AGAAAAAATTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TTTA-TACTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCCCCCACA Gonioctena_quinquepunctata ?CACCTAATT-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCT?ATAATC--AAAATAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTAATAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTAT-AAAAAAAATTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TATA-ATTTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTATATTATAATCCCCCCCACA Gonioctena_rubripennis AGACCTAATA-TCCTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAAAATTGGATCAATAATTCATAAATTTATGTTACTATATAAAAAAAGTTAATTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAATTAAATTTAATAATTAAATTCTAAAATAAAAAA-TTTA-AATTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACTAAACTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTATACAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAAAATTTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTAAATTCCCACCCAAA Gonioctena_rufipes ???CCTAATA-TTTCAGCTTCTGCACCGAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTATATCTTATAATC-AAAAAAAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTATTATACAAAAAAAGTTAATAATATTTTTCAATCGCCCCAATCAAATTATAAATTAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAA-TAAA-AACTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTCAATTTAATTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTACTTTTTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCA?GGCCATTTAAATAATTCAGTGGG???GCCAGACCTAAA?TTAAATTCCGACCCAAA Gonioctena_tredecimmaculata ????CTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATAAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTGTAATC--AAAATAATTGGATCAATAATTCATAAATCAATGTTACTATATAATAAAAGTTTTCTAAATTTCACAATCACCCCAATTAAATTATAAACTAAATTTAATAATTAAATTCTAAAATACAAAA-TATA-AATTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACTAAACTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTATATAGAGACAGCTATTTTCTTATCTAACCT-TTCATTCCAGATTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAAT-CTTCAGTGGGCAGGTCGGACCTTAAATC??????CCACCCACA Gonioctena_variabilis AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAATTGGATCAATTATTCATATAAATATGTAATAATACAAAAAAAGTTTAATAAATTTTTCAATCACCCCAATCAAATTAT-AAAATAAATAAATAAATAAATACTAAAATATAAAA-TTAAATTTTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAAAATTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTATAATAAAATTAAATAGAGACAGTCATTTTCTTATATAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCCCACACA Gonioctena_viminalis AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAAAATTGGATCAATAATTCATAAATCAATGTTATATTACAAAAAAAGTTAAATAAATTTTTTAATCGCCCCAATCAAATTATAAATCAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAA-TATA-AATTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATTTAACTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTTTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTCAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAATATTTCAGTGGGCAGGCCAGACCTAAAATTAACATCCCACCCAAA Oreina_cacaliae AGACCTAATATTTTTAGCTTCTACACCAAAAATTTATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTTAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAATATTGGATCATATACTCATAAATTAATGTTTTAAAATAAAAAAAGTTAAATAAATTTTTCAATCACCCCAATTAAATTATTCAATAAAATAAATAAATAAATACTAAAATATATTT-TTTA-TTAAATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATTAAATTTAACAGAGACAGCTATTTTCTTATCCAACCT-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAAA-TCTCAGTGGGCAGGTTAGACCTTAAATTATC???ACACCCACA ; END; BEGIN SETS; CHARSET sequence (CHARACTERS = 16S_Alignment_3) = 1-486; CHARSET 12s (CHARACTERS = 16S_Alignment_3) = ; CHARSET 1stpos (CHARACTERS = 16S_Alignment_3) = ; CHARSET gaps (CHARACTERS = 16S_Alignment_3) = 487-495; CHARSET COII (CHARACTERS = 16S_Alignment_3) = ; CHARSET 16s (CHARACTERS = 16S_Alignment_3) = 1-495; CHARSET 2ndpos (CHARACTERS = 16S_Alignment_3) = ; CHARSET 3rdpos (CHARACTERS = 16S_Alignment_3) = ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M3975] TITLE Appendix_2; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=1406; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 890 900 910 920 930 940 950 960 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 1370 1380 1390 1400 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Chrysomela_tremula ACATATTTTAGAGCT-AAATCATTTTAATTAATTAATTTAAATTACTGTCAAATCCTTATTCAAATTACTTTAAAAGTAACCATCCCAAAATTTTA-TTATAGTAACCCATTTCTTCTTACTAATAAACTACACCTTGATCTGATTTT-TTTTATTATAATAAATCTTGAATATTTAAATTCTAATAAAATATTCAAACTACGACGATATGTAAACTAATATAGTAAGTGAATTAAATCGTGGATTATCAATCACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTTGAGAATATACCTTATACTAATTTAGTCTATAAA-AATACATTTTAACCCAACAGACCTAATA-TTTTAGCTCCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTTGATTTGAACTCTAAAAAAAAATAACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTAATCTTATAATC--ACTAAATTTGGATCAAATATTCATTAATTAATGTTAAATTATAAAAAAAGTTAAATTAATTTTTTAATCACCCCAACTAAATAAATACCTAAATTAATAAAATTAATTCTAAATATAATAA-TTTA-TTTATATATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATGAAATTTAAGCTTTTTAACTTAAATATAAAATTCTAATAAAATTAAATAAAGACAGTTATTTTTTTATCCAACCC-TTCATTCCAGCTTTCAATTAAAAAACTATTGATTATGCTACCTTAGCACGGTTAAAATACCGCGGCCATTC-AAT-TCTCATTGGGCAGGCTAGACTTTAAAT???????CCACCCCCACTTTTTTTAGAAATCCCAACATGAAAAACTTTGATACTACAAGATAGAACCTCCCCTTTAATAGAACAACTTTCATATTTTCATGATCATACCTTAATAATCCTAATAATCATCACAGTATTAGTATCTCAATTAATAATCTCCTTATTTCTAAATAAATTTTCCCACCGTTTCTTATTAGAAGGTCAAATAATTGAAGTAATTTGAACAATTTTACCTACACTTATTTTAATTTTGATTGCAATTCCCTCTTTACGATTAATTTATGTCCTAGATGAAGTTAATAGCCCTTTAGTCACAATCAAAACAATTGGGCATCAATGATATTGATCCTACGAATACTCTGACTTCAAAAATATTGAATTTGATTCTTACATAACTCCAATTAATGAATTAAATAAATTTAATTTTCGTCTTTTAGATGTAGATAACCGTGTTATTATCCCATTTGAATCCCAAATTCGTATATTAATTACTGCTGCTGATGTAGTTCATTCATGAACTATCCCTTCTTTAGGAGTAAAAATTGATGCAATACCTGGCCGATTAAATC Gonioctena_fornicata_a GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATAAATTAATTAAAATTACCTTCAAATCCAAATTCATATTACTTTAAAAATAATAATCTTCAATTATTT-TTAATGTAACCCATTTCTTCTTTTATATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTATTATCAAAATTCTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAATTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGTTTTATAA-ATTACATTTAAAACCAACAGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTATTATATAAAAAAAGTTAATTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAAAAAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAACTTTA-TTTTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAACAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTCTAATTAAGAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCCTTCAAAT-TTTCAGCGGGCAGGTCAGACCTTAAATTATAATCCCAACCACACTTTTTTTAGAAATTTCTACATGAAAAACTTTAATACTACAAGATAGAGCTTCACCTTTAATAGAACAATTAGCTTACTTTCATGACCATGCTCTAATAATTTTAGTTATTATTACTGTATTAGTAGGACAATTAATAGTAACCCTTTTTTTTAATAAATTTACACATCGTTATTTATTAGAAGGTCAAATAATTGAAATTATTTGAACTATTTTACCAACATTAACATTAATTTTTATTGCTATTCCTTCTTTACGATTAATTTACATTTTAGATGAAATTAATAATCCAATAATCACAATTAAAACTATTGGACATCAATGATATTGATCTTATGAATATTCTGATTTTAAAAATATTGAATTTGATTCTTACATATTACCAACTAGAGAATTAAATAAATTTAATTTTCGCCTATTAGATGTAGATAATCGAATTGTAGTACCTTTTGAATCCCAAATTCGAATATTAGTAACTGCTGCAGACGTAATTCATTCATGAACAATTCCTTCACTAGGAGTAAAAATTGATGCAACCCCTGGACGACTAAATC Gonioctena_fornicata_b GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATAAATTAATTAAAATTACCTTCAAATCCAAATTCATATTACTTTAAAAATAATAATCTTCAATTATTT-TTAATGTAACCCATTTCTTCTTTTATATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTATTATCAAAATTCTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAATTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGTTTTATAA-ATTACATTTAAAACCAACAGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTATTATATAAAAAAAGTTAATTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAAAAAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAACTTTA-TTTTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAACAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTCTAATTAAGAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCCTTCAAAT-TTTCAGCGGGCAGGTCAGACCTTAAATTATAATCCCAACCACACTTTTTTTAGAAATTTCTACATGAAAAACTTTAATACTACAAGATAGAGCTTCACCTTTAATAGAACAATTAGCTTACTTTCATGACCATGCTCTAATAATTTTAGTTATTATTACTGTATTAGTAGGACAATTAATAGTAACCCTTTTTTTTAATAAATTTACACATCGTTATTTATTAGAAGGTCAAATAATTGAAATTATTTGAACTATTTTACCAACATTAACATTAATTTTTATTGCTATTCCTTCTTTACGATTAATTTACATTTTAGATGAAATTAATAATCCAATAATCACAATTAAAACTATTGGACATCAATGATATTGATCTTATGAATATTCTGATTTTAAAAATATTGAATTTGATTCTTACATATTACCAACTAGAGAATTAAATAAATTTAATTTTCGCCTATTAGATGTAGATAATCGAATTGTAGTACCTTTTGAATCCCAAATTCGAATATTAGTAACTGCTGCAGACGTAATTCATTCATGAACAATTCCTTCACTAGGAGTAAAAATTGATGCAACCCCTGGACGACTAAATC Gonioctena_holdausi GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATATTTCCCAATTTTAA-TTATTGTAACCCATTTCTACTTTCATATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTATTATAATAAATTTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAACTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGACTGTCAATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAACTTTCAAGAACATAACTAATACTAACTTAGCTTAAACA-AATACACTTATAACCAACAGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAAAATTGGATCAATAACTCATAAATTAATGGTATATTACAAAAAAAGTTAAATAAATTTTTTAATCGCCCCAATCAAATTATAAATCAAATTTAATACATAAATTCTAAAATAAAAAA-TATA-AATTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATTTAACTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTTTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTCAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAATATTTCAGTGGGCAGGCCAGACCTAAAATTA?????CCACCCAAACTTTTTTTAGAAATTTCTACATGAAAAACTTTAATACTCCAAGATAGAGCTTCCCCATTAATAGAGCAATTAGCTTATTTTCATGATCATGCTTTAATAATTTTAGTTATTATTACAGTTTTAGTTGGACAATTATTAATAACATTATTTTTTAATAAATTCTCACACCGATATCTCTTAGAGGGACAATTAATTGAAATTATTTGAACAATTTTACCAACTTTAACTCTTATTTTTATTGCTATTCCATCTTTACGATTAATTTATATTCTAGACGAAGTTAATAATCCTATAATTACCATTAAAACTATTGGACATCAATGATATTGATCATATGAATATTCTGATTTTAAAAACATTGAATTTGATTCTTATATACTACCAACCAAAGAATTAAATACTTTTAATTTTCGACTTTTAGATGTAGACAATCGAATTGTTGTACCATTTGAATCCCAAATTCGAATATTGGTATCTGCTGCAGATGTAATTCATTCTTGAACTATTCCATCATTAGGGGTTAAAATTGATGCAACTCCTGGACGATTAAATC Gonioctena_intermedia GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAACAAATTAATTAAAATTACTCTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATAATCTTAAATTATAT-TTATTGTAACCCATTTCTTCTTTATCATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATAAAAATTCTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAATTAATAAACAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGCTTTTAAA-ATTACATTTAAAACCAACAGACCTAATT-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAACTATTGGATCAATAACTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTACTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAAAAAAA-TTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TATA-TTCTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTGTATTATAATCCCCCCCACACTTTTTTTAGAAATTGCTACATGAAAAACATTAATACTTCAGGATAGGGCTTCCCCTTTAATAGAACAATTAGCTTATTTCCATGACCATGCTTTAATAATTTTAGTTATTATTACAGTATTAGTAGGTCAACTAATAACAACTTTATTTTTTAATAAATTTACTCATCGATATTTATTAGAAGGTCAATTAATTGAAATTATTTGAACAATTTTACCTACATTAACATTAATTTTTATTGCTATTCCTTCTTTACGATTAATTTATATTTTAGATGAAGTTAATAACCCTATAATTACCATTAAAACTATTGGACACCAATGATACTGATCCTATGAATATTCCGACTTCAAAAATATTGAATTCGATTCTTATATACTACCAACTATAGAGTTAAATAAATTTAACTTTCGTTTATTAGATGTAGATAATCGAATCGTTATTCCCTTCGAATCACAAATTCGAATATTGGTAACTGCAGCTGATGTCATTCACTCCTGAACTATCCCTTCTTTAGGTGTTAAAATTGATGCTACCCCAGGTCGATTAAACC Gonioctena_interposita_1 ACATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAACAAAATAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATAATCTTAAATTATAT-TTAATGTAACCCATTTCTTCTTTTCCATATACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATAAAAATTCTTGAATATTATAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAATTAACAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTATTACTAATTTAGTTTTTAAA-ATTACACTTAAAACCAACAGACCTAATC-TTTCAGCTTCTGCACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAACTGGATCAATGATTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTACTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAGAAAAAA-TTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TTTA-TACTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGCTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCCCCCACACTTTTTTTAGAAATTGCTACATGAAAAACATTAATACTTCAAGATAGGGCATCCCCTTTAATAGAACAATTAGCTTATTTCCATGATCATGCTTTAATAATTT?AGTTATTATCACAGTATTAGTAGGCCAATTAATAGCAGCTTTATTTTTCAATAAATTTACCCATCGGTATTTATTAGAGGGTCAAATAATTGAAATTATTTGAACAATTTTACCTACATTAACTTTAATTTTTATTGCTATTCCTTCTTTACGATTAATCTATATTTTAGATGAAGTTAATAACCCTATAATTACCATTAAAACTATTGGACATCAATGATACTGATCTTATGAATATTCAGATTTTAAAAATATTGAATTTGATTCCTATATACTCCCAACTGCAGAATTAAATAAATTTAATTTTCGTTTATTAGATGTGGATAATCGAATTGTTATCCCCTTTGAATCACAAATTCGGATACTGGTAACTGCAGCTGATGTAATTCACTCATGAACAATCCCTTCTTTAGGGGTAAAAATTGATGCTACACCAGGACGATTAAATC Gonioctena_interposita_2 ACATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAACAAAATAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATAATCTTAAATTATAT-TTAATGTAACCCATTTCTTCTTTTCCATATACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATAAAAATTCTTGAATATTATAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAATTAACAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTATTACTAATTTAGTTTTTAAA-ATTACACTTAAAACCAACAGACCTAATC-TTTCAGCTTCTGCACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAACTGGATCAATGATTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTACTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAGAAAAAA-TTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TTTA-TACTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGCTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCCCCCACACTTTTTTTAGAAATTGCTACATGAAAAACATTAATACTTCAAGATAGGGCATCCCCTTTAATAGAACAATTAGCTTATTTCCATGATCATGCTTTAATAATTTTAGTTATTATCACAGTATTAGTAGGCCAATTAATAGCAGCTTTATTTTTCAATAAATTTACCCATCGGTATTTATTAGAGGGTCAAATAATTGAAATTATTTGAACAATTTTACCTACATTAACTTTAATTTTTATTGCTATTCCTTCTTTACGATTAATCTATATTTTAGATGAAGTTAATAACCCTATAATTACCATTAAAACTATTGGACATCAATGATACTGATCTTATGAATATTCAGATTTCAAAAATATTGAATTTGATTCATATATACTCCCAACTGCAGAATTAAATAAATTTAATTTTCGTTTATTAGATGTGGATAATCGAATTATTATCCCCTTTGAATCACAAATTCGGATACTAGTAACTGCAGCTGATGTAATTCACTCATGAACAATCCCTTCTTTAGGAGTAAAAATTGATGCTACACCAGGACGATTAAATC Gonioctena_kamikawai GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTTATATTACTTTAAAAATAATAATCCTTAATTTTTT-TTAATGTAACCCATTTCTTCTTCTGTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTATTATAATAAATCTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATACTCAAATTACGACGATATGTAAGCTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCAATTATAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGCATAATAA-TATACATTTAAAACCAACAGACCTAATA-TTTCAGCTTCTACACCAAAAATTTACTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATTATTGGATCAAGAAATCATAAATTAATGAATAATTACAAAAAAAGTTAATTAAATTTTTCAATCACCCCAATCAAATTATAAATCAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATATAAAA-TATA-ATATATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTCAATTATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTCAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAATATATCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTAAATTCCCACCCAAACTTTTTTTAGAAATTTCTACATGAAAAACTTTAATACTCCAAGATAGAGCTTCTCCATTAATAGAGCAATTAGCCTATTTTCACGATCATGCTTTAATAATTTTAGTTATTATTACTGTATTAGTTGGACAATTAATAATAACATTATTTTTTAATAAATTTACACATCGTAATTTATTAGAAGGACAAATAATTGAAATTATTTGAACAGTTTTACCTACGTTAACTCTTATTTTTATCGCAATTCCCTCTCTTCGATTAATTTATATTTTAGATGAAGTTAATAATCCAATAATTACTATCAAAACAATTGGTCATCAATGATACTGATCCTATGAATACTCAGATTTTAAAAATATTGAATTTGATTCATACATACTCCCTACTAATGAATTAAAAAATTTTAATTTCCGGCTACTTGATGTCGACAATCGAATTGTTATTCCATTTGAATCCCAAATCCGAATATTAGTAACTGCTGCAGATGTAATTCATTCTTGAACAATCCCATCTTTAGGAGTAAAAATTGACGCAACTCCAGGACGTCTAAACC Gonioctena_linnaeana GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAAATAATTAATCAATATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTACTTTAAAAATAATAATCCCTAATTTTAA-TTAATGTAACCCATTTCTACTTTTTTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTATAATAATAAATCTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAACTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCAATTATAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAACTTAG-TCAAATA-AATACATTTATAACCACCAGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATAAACTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATCAAAAAAAAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTATATTACAAAAAAAGTTTATCATATTTTTCAATCACCCCAATCAAATTATAGATCAAATTTAATAATTAAATTCTAAAATAAAAAA-TATG-TACTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATTTAAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAACAGAGACAGTTATTTTTTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAATAATTCAGTGGGCAGGCCAGACCTAAAATTAAAT??CAACCCAAACTTTTTTTAGAAATTTCTACATGAAAAACTTTAATACTTCAAGACAGAGCTTCCCCACTAATAGAACAATTAGCTTATTTTCACGATCATGCTCTAATAATTCTAGTAATCATTACAGTTCTAGTTGGACAATTAATAATAACATTATTTTTTAATAAATTTACCCATCGATATCTTTTAGAGGGTCAAATAATTGAAATTATTTGAACAATTCTACCAACTTTAACATTAATCTTTATTGCTATCCCATCTTTACGATTAATTTATATTTTAGATGAAGTTAATAACCCTATAATTACTATTAAAACTATTGGACATCAATGATACTGATCATATGAGTATTCAGATTTCAAAAATATTGAATTTGATTCTTACATATTACCAACTAAAGAATTAAATAATTTTAATTTTCGACTTCTAGATGTAGATAACCGAATTGTTGTACCATTTGAATCTCAAATTCGAATATTAGTAAGTGCAGCAGACGTTATTCACTCCTGAACTATCCCATCTTTAGGAGTTAAAATTGATGCCACTCCTGGGCGACTTAATC Gonioctena_nigroplagiata GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAAT?ATAATCCTAAATTATTTATTAATGTAACCCATTTCTTCTTTCTTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATTAAAATTTTTAAATATTAAAATTCTTATAAAATATTTAAATTACGATGATATGTAAATTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCAATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGCTTAATAA-ATTACATTTATAAACAACAGACCTAATT-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATAAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTGTAATC--AAAATAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTAATTATACAAAAAAAGTTTATTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAAAAAAA-TTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAA-TTTATTTTTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGCTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCCTTCAAAT-CTTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAA?????????CCCCACACACTTTTTTTAGAAATTGCAACATGAAAAACCCTTATACTCCAAGATAGAGCTTCCCCCTTAATAGAACAATTAGCTTATTTTCACGATCATGCTTTAATAATTTTAGTTATTATTACAGTTTTAGTTGGACAATTAATAATAACTTTAATTTTTAATAAATTTACACATCGTTACTTACTTGAAGGTCAATTAATTGAAATTATTTGAACTATTTTACCAACATTAACATTAATTTTTATTGCTATTCCTTCTTTACGATTAATTTATATTTTAGATGAAATTAATAATCCAATAATTACAATTAAAACTATTGGGCATCAATGATATTGATCTTATGAATATTCAGACTTCAAAAATATCGAATTTGATTCATATATATTACCAACTAGAGAATTAAATAAATATAACTTTCGTCTTTTAGATGTAGACAACCGAGTAATTGTTCCTTTTGAATCTCAAATTCGAATATTAGTTACAGCAGCTGATGTTATTCATTCGTGAACAATTCCATCCTTAGGAGTAAAAATTGATGCGACACCTGGTCGATTAAATC Gonioctena_occidentalis GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCACATTCATATTACTTTAAAAATAATAATCCTTAATTTTAA-TTAATGTAACCCATTTCTACTTTCTTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTATTATAATAAATTTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAACTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGACTGTCAATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAACTTTCAAGAACATAACTAATATTAACTCAGCTTAAATA-AATACACTTATAACCAACAGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAAAATTGGATCAATAATTCATAAATCAATGTTATATTACAAAAAAAGTTAAATAAATTTTTTAATCGCCCCAATCAAATTATAAATCAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAA-TATA-AACTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATTTAACTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTTTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTCAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAATATTTCAGTGGGCAGGCCAGACCT-AAATTA?????CCACCCAACCTTTTTTTAGAAATTTCTACATGAAAAACTTTAATACTCCAAGATAGGGCTTCTCCATTAATAGAACAATTAGCTTATTTTCATGATCATGCTTTAATAATTTTAGTTATTATTACAGTCTTAGTTGGACAATTAATAATAACATTATTTTTTAATAAATTTTCACACCGATATCTTTTAGAAGGACAATTAATTGAAATTATTTGAACAATTCTACCAACTTTAACCCTTATTTTTATTGCTATCCCATCTTTACGATTAATTTATATTCTAGATGAAATTAATAATCCTATAATTACTATTAAAACTATCGGGCATCAATGATATTGATCATACGAATATTCTGATTTTAAAAATATTGAATTTGATTCTTATATATTACCAACTAAAGAATTAAATAATTTTAACTTTCGACTTTTAGATGTAGATAATCGAATTGTTGTACCATTTGAATCCCAAATCCGCATATTAGTATCTGCAGCAGATGTAATCCATTCTTGAACTATTCCATCCTTGGGAGTTAAAATTGATGCAACTCCTGGACGATTAAATC Gonioctena_olivacea GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATTATATTTTAAAAATAAAAATCTAAAATTATAT-TTAATGTAACCCATTTCTACTTTTTTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATTAAAAATCTTGAATATTATAATTCTTATAAAATATTC-AATTACGATGATATGTAAATTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGACTATCGATTACAGAACAAGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTAAAGAACATAACTATTACTAATCTAGCATTATAA-ATTACATTTATAACCCAC?GACCCAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAACTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAAAATTGGATCAATAAATCATACATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTAATTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAAAAAAAATGAATAAAAAAATACTAAAATAAAAAA-TTTA-TTTTAAAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATATTAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCCTTTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCACCAACACTTTTTTTAGAAATTTCTACCTGAAAAACTTTAATACTTCAAGATAGGGCATCTCCTTTAATAGAACAGCTAGCTTATTTCCATGACCATGCATTAATAATTTTAGTTATTATTACTGTATTAGTTGGACAATTAATGATAACTTTATTTTTTAATAAATTTACTCATCGATATTTACTAGAAGGACAATTAATTGAAATTATTTGAACTATTCTACCAACACTAACGCTTATTTTTATTGCTATCCCATCTTTACGATTAATCTATATTTTAGATGAAATTAACAATCCAATAATTACAATTAAAACTATTGGACATCAATGGTACTGATCATATGAATACTCTGATTTTAAAAATATCGAATTTGATTCATATATAATACCAACCTCAGAATTAAATAAATTCAATTTTCGTCTTTTAGACGTTGATAATCGAGTAGTAGTACCTTTTGAATCTCAAATTCGAATATTAGTAACTGCGGCAGATGTAATTCACTCATGAACAATTCCATCTTTAGGAGTAAAAATTGATGCAACTCCAGGACGATTAAATC Gonioctena_pallida_1 ACATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAACAAAATAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATAATCTTAAATTATAT-TTAATGTAACCCATTTCTTCTTTTCCATATACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATAAAAATTCTTGAATATTATAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAATTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTATTACTAATTTAGTTTTTAAA-ATTACACTTAAAACCAAC?GACCTAATA-TTTCAGCTTCTACACCAAAAATTAACTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAACTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTACTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAGAAAAAA-TTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TTTA-TACTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCCCCCACACTTTTTTTAGAAATTGCTACATGAAAAACATTAATACTTCAAGATAGGGCATCCCCTTTAATAGAACAATTAGCTTATTTCCATGATCATGCTTTAATAATTTTAGTTATTATTACAGTATTAGTAAGCCAATTAATAACAGCTTTATTTTTCAATAAATTTACCCATCGATATTTACTAGAGGGTCAAATAATTGAAATTATTTGAACAATTTTACCTACATTAACCTTAATTTTTATTGCTATTCCTTCTTTACGCTTAATCTATATTTTAGATGAAGTTAATAACCCTATAATTACCATTAAAACTATTGGACATCAATGATACTGATCTTATGAATATTCAGATTTCAAAAATATTGAATTTGATTCTTATATACTTCCAACTGTAGAATTAAATAAATTTAATTTTCGTTTATTAGATGTAGATAATCGAATTATTATTCCATTTGAATCACAAATTCGAATACTGGTAACTGCAGCTGATGTAATTCACTCATGAACAATCCCTTCTTTAGGAGTAAAAATTGATGCTACACCAGGACGATTGAA?? Gonioctena_pallida_2 ACATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAACAAAATAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATAATCTTAAATTATAT-TTAATGTAACCCATTTCTTCTTTTCCATATACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATAAAAATTCTTGAATATTATAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAATTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTATTACTAATTTAGTTTTTAAA-ATTACACTTAAAACCAAC?GACCTAATA-TTTCAGCTTCTACACCAAAAATTAACTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAACTGGATCAATGATTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTACTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAGAAAAAA-TTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TTTA-TACTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCCCCCACACTTTTTTTAGAAATTGCTACATGAAAAACATTAATACTTCAAGATAGGGCATCCCCTTTAATAGAACAATTAGCTTATTTCCATGATCATGCTTTAATAATT??????ATTATTACAGTATTAGTAGGCCAATTAATAGCAGCTTTATTTTTCAATAAATTTACCCATCGATATTTACTAGAGGGTCAAATAATTGAAATTATTTGAACAATTTTACCTACATTAACCTTAATTTTTATTGCTATTCCTTCTTTACGCTTAATCTATATTTTAGATGAAGTTAATAACCCTATAATTACCATTAAAACTATTGGACATCAATGATACTGATCTTATGAATATTCAGATTTCAAAAATATTGAATTTGATTCCTATATACTCCCAACTGCAGAATTAAATAAATTTAATTTTCGTTTATTAGATGTGGATAATCGAATT{AG}TTATTCCCTTTGAATCACAAATTCGAATACTGGTAACTGCAGCTGACGTAATTCACTCATGGACAATCCCTTCTTTAGGAGTAAAAATTGATGCTACACCAGGACGATTAAATC Gonioctena_quinquepunctata GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATAAATTAATTAAAATTACTCTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATAATCTTAAATTATAT-TTATTGTAACCCATTTCTTCTTTCCCATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATAAAAATTCTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAATTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGCTTTTAAA-ATTACATTTAAAACCAAC?CACCTAATT-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCT?ATAATC--AAAATAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTAATAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAAAAAAA-TTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TATA-ATTTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTATATTATAATCCCCCCCACACTTTTTTTAGAAATTGCTACATGAAAAACATTAATTCTCCAAGATAGGGCTTCCCCTTTAATAGAACAATTAGCTTATTTCCATGACCATGCTTTAATAATTTTAGTTATTATTACAGTATTAGTAGGTCAATTAATAGTAACTTTATTTTTTAATAAATTTACTCATCGATATTTATTAGAAGGTCAATTAATTGAGATTATTTGAACAATTTTACCAACATTAACATTAATTTTTATTGCTATTCCTTCTTTACGATTAATTTATATTTTAGATGAAGTTAATAACCCGATAATTACCATTAAAACTATTGGACACCAATGATATTGATCCTATGAATATTCTGACTTCAAGAATATTGAATTCGACTCTTACATACTACCAACCGCAGAATTAAATAAATTTAATTTTCGTTTATTAGATGTAGATAACCGAATTGTTATCCCCTTCGAATCACAAATCCGAATATTAGTAACTGCTGCTGATGTAATTCACTCTTGAACTATCCCTTCTTTAGGTGTAAAAATTGATGCAACCCCGGGTCGGTTAAATC Gonioctena_rubripennis GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATAATCCTAAATTTTTT-TTATTGTAACCCATTTCTTCTTTTTTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTATTATAGTAAATTTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGATGATATGTAAACTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGACTATCAATTATAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGTTTTTAAT-AATACATTTAGAACCAACAGACCTAATA-TCCTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAAAATTGGATCAATAATTCATAAATTTATGTTACTATATAAAAAAAGTTAATTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAATTAAATTTAATAATTAAATTCTAAAATAAAAAA-TTTA-AATTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACTAAACTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTATACAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAAAATTTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTAAATTCCCACCCAAACTTTTTTTAGAAATTTCTACATGAAAAACTTTAATACTACAAGATAGAGCATCACCCCTTATAGAACAATTAGCTTATTTTCACGATCATGCCCTTATAATTTTAGTTATTATTACTGTATTAGTGGGTCAATTAATATTAACCTTATTTTATAATAAATTTACCCATCGAAATTTATTAGAAGGACAAATAATTGAAATTATTTGAACAATTTTACCAACATTAACTCTTATCTTTATTGCTATTCCATCATTACGATTAATTTATATTTTAGATGAAGTTAATAATCCAATAATTACTATTAAAACAATTGGACATCAATGATATTGATCATATGAATATTCAGATTTCAAAAATATTGAATTTGATTCTTATATATTACCAACAAGAGAACTTAATAAATTTAATTTTCGGCTATTAGATGTTGATAATCGAATTGTAATTCCATTTGAATCACAAATTCGTATATTAGTAACTGCTGCCGATGTAATTCACTCTTGAACTATTCCATCTTTAGGAGTAAAAATTGATGCTACTCCTGGTCGTCTAAATC Gonioctena_rufipes ACATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCTTATTATTTTAAAAATAATAATCCCTAATTATTA-TTATTGTAACCCATTTCTACTTTTTTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTATGATAATAAATTTCGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGCAAACTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTGTCAATTATAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTGATACTAAATTAGCCTAAATA-AATACGCTTATAACCAAC???CCTAATA-TTTCAGCTTCTGCACCGAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTATATCTTATAATC-AAAAAAAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTATTATACAAAAAAAGTTAATAATATTTTTCAATCGCCCCAATCAAATTATAAATTAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAA-TAAA-AACTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTCAATTTAATTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTACTTTTTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCA?GGCCATTTAAATAATTCAGTGGG???GCCAGACCTAAA?TTAAATTCCGACCCAAACTTTTTTTAGAAATTTCTACATGAAAAACTTTAATACTCCAAGATAGGGCTTCCCCATTAATAGAACAATTAGCATACTTTCATGATCACGCTTTAATAATTTTAGTTATTATTACAGTCTTAGTTGGACAATTAATAGTAACATTATTTTTCAATAAATTCACCCATCGATACCTTTTAGAAGGACAATTAATTGAAATTATTTGAACAATTTTACCAACCCTAACACTTATTTTTATTGCTATTCCATCATTACGATTAATTTATATTTTAGATGAAGTTAATAATCCTATAATTACCATTAAAACCATTGGTCATCAATGATACTGATCATATGAATATTCTGATTTCAAAAATATTGAATTTGATTCTTATATACTACCAACTCAAGAATTAAATAATTTTAACTTTCGGCTATTAGATGTTGATAATCGAATTATTGTACCTTTTGAATCCCAAATTCGAATATTGGTATCTGCAGCAGATGTAATTCATTCTTGAACTATTCCATCATTAGGTGTTAAAATTGATGCAACTCCTGGACGACTAAATC Gonioctena_tredecimmaculata GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATGAATTTATTAAAATTACCCTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATAATCCCTAAATTTAT-TTATTGTAACCCATTTCTTCTTTTTTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-CTTTATTCTAATACATCTTGAATATTTAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAACTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCAATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGCTTTAATATAATACATTTATAACCAAA????CTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATAAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTGTAATC--AAAATAATTGGATCAATAATTCATAAATCAATGTTACTATATAATAAAAGTTTTCTAAATTTCACAATCACCCCAATTAAATTATAAACTAAATTTAATAATTAAATTCTAAAATACAAAA-TATA-AATTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACTAAACTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTATATAGAGACAGCTATTTTCTTATCTAACCT-TTCATTCCAGATTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAAT-CTTCAGTGGGCAGGTCGGACCTTAAATC??????CCACCCACACTTTTTTTAGAAATTGCAACATGAAAAACCTTAATACTTCAAGATAGGGCATCTCCATTAATAGAACAATTAGCTTACTTTCATGACCATGCTTTAATAATTCTAGTTATTATTACAGTATTAGTTGGTCAATTAATAATAACATTATTTTTTAATAAATTTACCCATCGAAATTTATTAGAAGGACAAATGATTGAAATTATTTGAACTATTTTACCTACACTAACTCTAATTTTTATTGCTATCCCCTCCTTACGACTAATTTATATTCTTGATGAAGTAAATAATCCAATAATTACTATTAAAACTATCGGGCACCAATGATACTGATCTTACGAATATTCCGATTTTAAAAATATTGAATTTGATTCGTATATATTACCAACTACAGAATTAAATAAATTTAATTTCCGCCTATTAGATGTAGATAACCGAATTGTAATCCCATTTGAGTCTCAAATTCGTATATTAGTAACTGCTGCAGATGTTATTCACTCTTGAACTATCCCATCATTAGGAGTAAAAATTGATGCTATACCAGGCCGCCTTAATC Gonioctena_variabilis GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATCAACTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATTTTATATTACAAATAAAAATCCTAAATTATAT-TTAATGTAACCCATTTCTTCTTTTTTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATAAAAAATCTTGAATATTATTATTCTTATAAAATATTCAAATTACGATGATATGTAAATTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTATAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGTTATTTAA-ATTACATTTATAACCAACAGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAATTGGATCAATTATTCATATAAATATGTAATAATACAAAAAAAGTTTAATAAATTTTTCAATCACCCCAATCAAATTATAAAATAAA-TAAATAAATAAATACTAAAATATAAAA-TTAAATTTTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAAAATTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTATAATAAAATTAAATAGAGACAGTCATTTTCTTATATAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCCCACACACTTTTTTTAGAAATTTCTACATGAAAAACTTTAATATTACAAGATAGGGCATCTCCCTTAATAGAACAATTAGCATATTTTCATGATCATGCATTAATAATTTTAGTTATTATTACTGTACTTGTAGGACAATTAATAATAACTTTATTTTTCAATAAATTTACTCATCGATATTTATTAGAAGGTCAAATAATTGAAATTATTTGAACTATTCTACCAACATTAACACTAATTTTTATTGCAATTCCGTCATTACGTTTAATTTATATTTTAGATGAAATTAATAACCCAATAATTACTATTAAAACTATTGGACACCAATGATATTGATCTTATGAATATTCTGATTTTAAAAATATTGAATTTGATTCATATATACTACCAACCATAGAATTAAATAAATTTAATTTTCGTTTATTAGATGTAGATAATCGAGTAGTTGTACCATTTGAATCACAGATTCGAATATTAGTTACTGCAGCAGATGTAATTCACTCTTGAACAATCCCGTCATTAGGAGTCAAAATTGATGCTACCCCTGGACGATTGAATC Gonioctena_viminalis GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATCAATTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTACTTTAAAAATAATATTTCCTAATTTTAG-TTACTGTAACCCATTTCTACTTTTGTATAAACTACACCTTGATCT?ATTTA-TTTTATTATAGTAAATTTCGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAACTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGACTGTCAATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAACTTTCAAGAACATAGCTAATACTAACTTAGTCTAAATA-AATACACTTATAACCAACAGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAAAATTGGATCAATAATTCATAAATCAATGTTATATTACAAAAAAAGTTAAATAAATTTTTTAATCGCCCCAATCAAATTATAAATCAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAA-TATA-AATTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATTTAACTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTTTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTCAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAATATTTCAGTGGGCAGGCCAGACCTAAAATTAACATCCCACCCAAACTTTTTTTAGAAATTTCTACATGAAAAACTTTAATACTCCAAGATAGAGCTTCCCCATTAATAGAGCAATTAGCCTATTTTCATGATCATGCTTTAATAATTTTAGTTATTATTACAGTTTTAGTTGGACAATTAATAATAACATTATTTTTTAATAAATTTTCACATCGATACCTTTTAGAAGGGCAATTAATTGAAATTATTTGAACAGTTTTACCAACTTTAACCCTTATTTTTATTGCTATTCCATCTTTACGATTAATTTATATTCTAGACGAAGTTAATAATCCTATAATTACTATTAAAACTATTGGGCATCAATGATATTGATCATATGAATATTCTGATTTCAAAAACATTGAATTTGATTCTTATATATTACCAACCAAAGAATTAAATAATTTTAATTTTCGACTTTTAGATGTAGATAATCGAATTGTTGTACCATTTGAATCCCAAATTCGCATATTAGTATCTGCTGCAGATGTAATTCATTCTTGAACTATCCCATCCTTAGGAGTTAAAATTGATGCAACCCCTGGACGGTTAAATC Oreina_cacaliae ACATATTTTAGAGCTAAAATCAATTTAATTAATTAATTAAATTTACTCTCAAATCCAAATTCATATTATTTTATAAATAATAATCCTTAAATAATT-TTATTGTAACCCATTTCTTCTTTTTTATAAACTGCACCTTGATCTGATTTATTTTTATTATAAAAAATCTTGAATATTATTATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATACAAACTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCAATTATAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGCATATAAA-AATACATTTAAAACAAACAGACCTAATATTTTTAGCTTCTACACCAAAAATTTATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTTAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAATATTGGATCATATACTCATAAATTAATGTTTTAAAATAAAAAAAGTTAAATAAATTTTTCAATCACCCCAATTAAATTATTCAATAAAATAAATAAATAAATACTAAAATATATTT-TTTA-TTAAATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATTAAATTTAACAGAGACAGCTATTTTCTTATCCAACCT-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAAA-TCTCAGTGGGCAGGTTAGACCTTAAATTATC???ACACCCACACTTTTTTTAGAAATGATAACATGAAAAAATATTACATTACAAGATAGTGCCTCACCTTTGATAGAACAATTAAATTACTTCCATGACCATACTTTAATGATTTTGTTAATTATTACAGTTTTAGTTGCCCAACTAATAATTAGTTTATTTTACAATAAATTTACACATCGATATTTATTAGAAGGACAAATTATTGAAATTATCTGAACTATTTTACCTACTTTAACCTTAATTTTTATTGCTATTCCTTCCTTACGATTAATTTATATCTTAGATGAAATTAATAATCCTATAATTACAATTAAAACTATTGGACATCAATGATATTGATCATATGAATATTCAGATTTTAAAAATATTGAATTCGATTCTTACATAATTCCTACTAATGAATTAAAAATTTTTAATTTTCGTCTTTTAGATGTTGATAATCGAATTATTGCCCCATTCCAATCACAAATCCGTATATTAATTACGGCTACAGATGTTATCCACTCATGGACAATCCCTTCTTTGGGAGTTAAAATTGATGCTACCCCTGGACGTTTAAATC ; END; BEGIN SETS; CHARSET 2ndpos (CHARACTERS = Appendix_2) = 1056 1059 1062 1065 1068 867 870 873 876 879 882 885 888 891 894 897 900 903 906 909 912 915 918 921 924 927 930 933 1263 936 1266 939 1269 942 945 948 1272 951 1275 1278 954 1281 957 960 963 966 969 972 975 978 981 984 987 990 993 996 999 1002 1005 1008 1011 1014 1017 1020 1023 1026 1029 1032 1035 1038 1041 1044 1047 1050 1053 1179 1182 1185 1188 1191 1194 1197 1200 1203 1206 1209 1212 1215 1218 1221 1224 1227 1230 1233 1236 1239 1242 1245 1248 1251 1254 1257 1260 1284 1287 1290 1293 1296 1299 1302 1305 1308 1311 1314 1317 1320 1323 1326 1329 1332 1335 1338 1341 1344 1347 1350 1353 1356 1359 1362 1365 1368 1371 1374 1377 1380 1383 1386 1389 1392 1395 1398 1401 1404 1071 1074 1077 1080 1083 1086 1089 1092 1095 1098 1101 1104 1107 1110 1113 1116 1119 1122 1125 1128 1131 1134 1137 1140 1143 1146 1149 1152 1155 1158 1161 1164 1167 1170 1173 1176; CHARSET 16s (CHARACTERS = Appendix_2) = 359-853; CHARSET 3rdpos (CHARACTERS = Appendix_2) = 1177 1180 1183 1186 1189 1192 1195 1198 1201 1204 1207 1210 1213 1216 1219 1222 1225 1228 1231 1234 1237 1240 1243 1246 1249 1252 1255 1258 1261 1264 1267 1270 1273 1276 1279 1282 1285 1288 1291 1294 1297 1300 1303 1306 1309 1312 1315 1318 1321 1324 868 1327 1330 871 1333 874 1336 1339 877 1342 880 1345 883 1348 1351 886 1354 889 1357 1360 892 1363 895 1366 1369 898 1372 901 1375 904 1378 1381 907 1384 1387 910 1390 913 1393 916 1396 1399 919 1402 922 1405 925 928 931 934 937 940 943 946 949 952 955 958 961 964 967 970 973 976 979 982 985 988 991 994 997 1000 1003 1006 1009 1012 1015 1018 1021 1024 1027 1030 1033 1036 1039 1042 1045 1048 1051 1054 1057 1060 1063 1066 1069 1072 1075 1078 1081 1084 1087 1090 1093 1096 1099 1102 1105 1108 1111 1114 1117 1120 1123 1126 1129 1132 1135 1138 1141 1144 1147 1150 1153 1156 1159 1162 1165 1168 1171 1174; CHARSET 12s (CHARACTERS = Appendix_2) = 1-358; CHARSET gaps (CHARACTERS = Appendix_2) = 353-358 845-853; CHARSET sequence (CHARACTERS = Appendix_2) = 1-352 359-844 854-1406; CHARSET COII (CHARACTERS = Appendix_2) = 854-1406; CHARSET 1stpos (CHARACTERS = Appendix_2) = 866 869 872 875 878 881 884 887 890 893 896 899 902 905 908 911 914 917 920 923 926 929 932 935 938 941 1169 944 1172 947 1175 950 1178 953 1181 1184 956 1187 1190 959 1193 962 1196 1199 965 1202 968 1205 1208 971 1211 974 977 980 1214 983 1217 1220 986 1223 989 1226 1229 992 1232 1235 995 1238 998 1241 1001 1244 1247 1004 1250 1007 1253 1256 1010 1259 1013 1262 1265 1016 1268 1271 1019 1274 1022 1277 1280 1025 1283 1028 1286 1289 1031 1292 1295 1034 1298 1037 1301 1304 1040 1043 1046 1049 1307 1052 1055 1058 1310 1313 1316 1319 1322 1325 1328 1331 1334 1337 1340 1343 1346 1349 1352 1355 1358 1361 1364 1367 1370 1373 1376 1379 1382 1385 1388 1391 1394 1397 1400 1403 1406 1061 1064 1067 1070 1073 1076 1079 1082 1085 1088 1091 1094 1097 1100 1103 1106 1109 1112 1115 1118 1121 1124 1127 1130 1133 1136 1139 1142 1145 1148 1151 1154 1157 1160 1163 1166; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M2627] TITLE 16S_Alignment_4; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=495; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Chrysomela_tremula AGACCTAATA-TTTTAGCTCCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTTGATTTGAACTCTAAAAAAAAATAACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTAATCTTATAATC--ACTAAATTTGGATCAAATATTCATTAATTAATGTTAAATTATAAAAAAAGTTAAATTAATTTTTTAATCACCCCAACTAAATAAATACCTAAATTAATAAAATTAATTCTAAATATAATAA-TTTA-TTTATATATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATGAAATTTAAGCTTTTTAACTTAAATATAAAATTCTAATAAAATTAAATAAAGACAGTTATTTTTTTATCCAACCC-TTCATTCCAGCTTTCAATTAAAAAACTATTGATTATGCTACCTTAGCACGGTTAAAATACCGCGGCCATTC-AAT-TCTCATTGGGCAGGCTAGACTTTAAAT???????CCACCCCCA Gonioctena_fornicata_a AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTATTATATAAAAAAAGTTAATTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAAAAAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAACTTTA-TTTTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAACAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTCTAATTAAGAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCCTTCAAAT-TTTCAGCGGGCAGGTCAGACCTTAAATTATAATCCCAACCACA Gonioctena_fornicata_b AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTATTATATAAAAAAAGTTAATTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAAAAAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAACTTTA-TTTTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAACAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTCTAATTAAGAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCCTTCAAAT-TTTCAGCGGGCAGGTCAGACCTTAAATTATAATCCCAACCACA Gonioctena_holdausi AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAAAATTGGATCAATAACTCATAAATTAATGGTATATTACAAAAAAAGTTAAATAAATTTTTTAATCGCCCCAATCAAATTATAAATCAAATTTAATACATAAATTCTAAAATAAAAAA-TATA-AATTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATTTAACTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTTTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTCAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAATATTTCAGTGGGCAGGCCAGACCTAAAATTA?????CCACCCAAA Gonioctena_intermedia AGACCTAATT-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAACTATTGGATCAATAACTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTACTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAA-AAAAAATTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TATA-TTCTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTGTATTATAATCCCCCCCACA Gonioctena_interposita_1 AGACCTAATC-TTTCAGCTTCTGCACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAACTGGATCAATGATTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTACTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAG-AAAAAATTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TTTA-TACTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGCTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCCCCCACA Gonioctena_interposita_2 AGACCTAATC-TTTCAGCTTCTGCACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAACTGGATCAATGATTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTACTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAG-AAAAAATTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TTTA-TACTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGCTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCCCCCACA Gonioctena_kamikawai AGACCTAATA-TTTCAGCTTCTACACCAAAAATTTACTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATTATTGGATCAAGAAATCATAAATTAATGAATAATTACAAAAAAAGTTAATTAAATTTTTCAATCACCCCAATCAAATTATAAATCAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATATAAAA-TATA-ATATATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTCAATTATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTCAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAATATATCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTAAATTCCCACCCAAA Gonioctena_linnaeana AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATAAACTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATCAAAAAAAAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTATATTACAAAAAAAGTTTATCATATTTTTCAATCACCCCAATCAAATTATAGATCAAATTTAATAATTAAATTCTAAAATAAAAAA-TATG-TACTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATTTAAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAACAGAGACAGTTATTTTTTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAATAATTCAGTGGGCAGGCCAGACCTAAAATTAAAT??CAACCCAAA Gonioctena_nigroplagiata AGACCTAATT-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATAAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTGTAATC--AAAATAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTAATTATACAAAAAAAGTTTATTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAA-AAAAAATTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAA-TTTATTTTTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGCTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCCTTCAAAT-CTTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAA?????????CCCCACACA Gonioctena_occidentalis AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAAAATTGGATCAATAATTCATAAATCAATGTTATATTACAAAAAAAGTTAAATAAATTTTTTAATCGCCCCAATCAAATTATAAATCAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAA-TATA-AACTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATTTAACTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTTTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTCAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAATATTTCAGTGGGCAGGCCAGACCT-AAATTA?????CCACCCAAC Gonioctena_olivacea ?GACCCAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAACTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAAAATTGGATCAATAAATCATACATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTAATTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAAAAAAAATGAATAAAAAAATACTAAAATAAAAAA-TTTA-TTTTAAAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATATTAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCCTTTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCACCAACA Gonioctena_pallida_1 ?GACCTAATA-TTTCAGCTTCTACACCAAAAATTAACTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAACTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTACTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAG-AAAAAATTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TTTA-TACTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCCCCCACA Gonioctena_pallida_2 ?GACCTAATA-TTTCAGCTTCTACACCAAAAATTAACTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAACTGGATCAATGATTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTACTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAG-AAAAAATTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TTTA-TACTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCCCCCACA Gonioctena_quinquepunctata ?CACCTAATT-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCT?ATAATC--AAAATAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTAATAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAA-AAAAAATTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TATA-ATTTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTATATTATAATCCCCCCCACA Gonioctena_rubripennis AGACCTAATA-TCCTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAAAATTGGATCAATAATTCATAAATTTATGTTACTATATAAAAAAAGTTAATTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAATTAAATTTAATAATTAAATTCTAAAATAAAAAA-TTTA-AATTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACTAAACTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTATACAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAAAATTTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTAAATTCCCACCCAAA Gonioctena_rufipes ???CCTAATA-TTTCAGCTTCTGCACCGAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTATATCTTATAATC-AAAAAAAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTATTATACAAAAAAAGTTAATAATATTTTTCAATCGCCCCAATCAAATTATAAATTAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAA-TAAA-AACTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTCAATTTAATTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTACTTTTTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCA?GGCCATTTAAATAATTCAGTGGG???GCCAGACCTAAA?TTAAATTCCGACCCAAA Gonioctena_tredecimmaculata ????CTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATAAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTGTAATC--AAAATAATTGGATCAATAATTCATAAATCAATGTTACTATATAATAAAAGTTTTCTAAATTTCACAATCACCCCAATTAAATTATAAACTAAATTTAATAATTAAATTCTAAAATACAAAA-TATA-AATTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACTAAACTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTATATAGAGACAGCTATTTTCTTATCTAACCT-TTCATTCCAGATTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAAT-CTTCAGTGGGCAGGTCGGACCTTAAATC??????CCACCCACA Gonioctena_variabilis AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAATTGGATCAATTATTCATATAAATATGTAATAATACAAAAAAAGTTTAATAAATTTTTCAATCACCCCAATCAAATTATAA-AATAAATAAATAAATAAATACTAAAATATAAAA-TTAAATTTTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAAAATTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTATAATAAAATTAAATAGAGACAGTCATTTTCTTATATAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCCCACACA Gonioctena_viminalis AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAAAATTGGATCAATAATTCATAAATCAATGTTATATTACAAAAAAAGTTAAATAAATTTTTTAATCGCCCCAATCAAATTATAAATCAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAA-TATA-AATTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATTTAACTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTTTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTCAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAATATTTCAGTGGGCAGGCCAGACCTAAAATTAACATCCCACCCAAA Oreina_cacaliae AGACCTAATATTTTTAGCTTCTACACCAAAAATTTATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTTAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAATATTGGATCATATACTCATAAATTAATGTTTTAAAATAAAAAAAGTTAAATAAATTTTTCAATCACCCCAATTAAATTATTCAATAAAATAAATAAATAAATACTAAAATATATTT-TTTA-TTAAATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATTAAATTTAACAGAGACAGCTATTTTCTTATCCAACCT-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAAA-TCTCAGTGGGCAGGTTAGACCTTAAATTATC???ACACCCACA ; END; BEGIN SETS; CHARSET COII (CHARACTERS = 16S_Alignment_4) = ; CHARSET 3rdpos (CHARACTERS = 16S_Alignment_4) = ; CHARSET 12s (CHARACTERS = 16S_Alignment_4) = ; CHARSET 16s (CHARACTERS = 16S_Alignment_4) = 1-495; CHARSET 1stpos (CHARACTERS = 16S_Alignment_4) = ; CHARSET sequence (CHARACTERS = 16S_Alignment_4) = 1-486; CHARSET gaps (CHARACTERS = 16S_Alignment_4) = 487-495; CHARSET 2ndpos (CHARACTERS = 16S_Alignment_4) = ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M3977] TITLE 12S; LINK TAXA = Taxa4; DIMENSIONS NCHAR=358; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Chrysomela_tremula ACATATTTTAGAGCT-AAATCATTTTAATTAATTAATTTAAATTACTGTCAAATCCTTATTCAAATTACTTTAAAAGTAACCATCCCAAAATTTTA-TTATAGTAACCCATTTCTTCTTACTAATAAACTACACCTTGATCTGATTTT-TTTTATTATAATAAATCTTGAATATTTAAATTCTAATAAAATATTCAAACTACGACGATATGTAAACTAATATAGTAAGTGAATTAAATCGTGGATTATCAATCACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTTGAGAATATACCTTATACTAATTTAGTCTATAAA-AATACATTTTAACCCAAC Gonioctena_fornicata_a GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATAAATTAATTAAAATTACCTTCAAATCCAAATTCATATTACTTTAAAAATAATAATCTTCAATTATTT-TTAATGTAACCCATTTCTTCTTTTATATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTATTATCAAAATTCTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAATTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGTTTTATAA-ATTACATTTAAAACCAAC Gonioctena_fornicata_b GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATAAATTAATTAAAATTACCTTCAAATCCAAATTCATATTACTTTAAAAATAATAATCTTCAATTATTT-TTAATGTAACCCATTTCTTCTTTTATATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTATTATCAAAATTCTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAATTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGTTTTATAA-ATTACATTTAAAACCAAC Gonioctena_holdausi GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATATTTCCCAATTTTAA-TTATTGTAACCCATTTCTACTTTCATATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTATTATAATAAATTTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAACTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGACTGTCAATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAACTTTCAAGAACATAACTAATACTAACTTAGCTTAAACA-AATACACTTATAACCAAC Gonioctena_intermedia GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAACAAATTAATTAAAATTACTCTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATAATCTTAAATTATAT-TTATTGTAACCCATTTCTTCTTTATCATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATAAAAATTCTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAATTAATAAACAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGCTTTTAAA-ATTACATTTAAAACCAAC Gonioctena_interposita_1 ACATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAACAAAATAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATAATCTTAAATTATAT-TTAATGTAACCCATTTCTTCTTTTCCATATACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATAAAAATTCTTGAATATTATAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAATTAACAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTATTACTAATTTAGTTTTTAAA-ATTACACTTAAAACCAAC Gonioctena_interposita_2 ACATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAACAAAATAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATAATCTTAAATTATAT-TTAATGTAACCCATTTCTTCTTTTCCATATACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATAAAAATTCTTGAATATTATAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAATTAACAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTATTACTAATTTAGTTTTTAAA-ATTACACTTAAAACCAAC Gonioctena_kamikawai GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTTATATTACTTTAAAAATAATAATCCTTAATTTTTT-TTAATGTAACCCATTTCTTCTTCTGTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTATTATAATAAATCTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATACTCAAATTACGACGATATGTAAGCTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCAATTATAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGCATAATAA-TATACATTTAAAACCAAC Gonioctena_linnaeana GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAAATAATTAATCAATATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTACTTTAAAAATAATAATCCCTAATTTTAA-TTAATGTAACCCATTTCTACTTTTTTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTATAATAATAAATCTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAACTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCAATTATAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAACTTAG-TCAAATA-AATACATTTATAACCACC Gonioctena_nigroplagiata GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAAT?ATAATCCTAAATTATTTATTAATGTAACCCATTTCTTCTTTCTTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATTAAAATTTTTAAATATTAAAATTCTTATAAAATATTTAAATTACGATGATATGTAAATTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCAATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGCTTAATAA-ATTACATTTATAAACAAC Gonioctena_occidentalis GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCACATTCATATTACTTTAAAAATAATAATCCTTAATTTTAA-TTAATGTAACCCATTTCTACTTTCTTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTATTATAATAAATTTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAACTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGACTGTCAATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAACTTTCAAGAACATAACTAATATTAACTCAGCTTAAATA-AATACACTTATAACCAAC Gonioctena_olivacea GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATTATATTTTAAAAATAAAAATCTAAAATTATAT-TTAATGTAACCCATTTCTACTTTTTTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATTAAAAATCTTGAATATTATAATTCTTATAAAATATTC-AATTACGATGATATGTAAATTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGACTATCGATTACAGAACAAGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTAAAGAACATAACTATTACTAATCTAGCATTATAA-ATTACATTTATAACCCAC Gonioctena_pallida_1 ACATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAACAAAATAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATAATCTTAAATTATAT-TTAATGTAACCCATTTCTTCTTTTCCATATACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATAAAAATTCTTGAATATTATAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAATTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTATTACTAATTTAGTTTTTAAA-ATTACACTTAAAACCAAC Gonioctena_pallida_2 ACATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAACAAAATAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATAATCTTAAATTATAT-TTAATGTAACCCATTTCTTCTTTTCCATATACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATAAAAATTCTTGAATATTATAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAATTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTATTACTAATTTAGTTTTTAAA-ATTACACTTAAAACCAAC Gonioctena_quinquepunctata GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATAAATTAATTAAAATTACTCTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATAATCTTAAATTATAT-TTATTGTAACCCATTTCTTCTTTCCCATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATAAAAATTCTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAATTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGCTTTTAAA-ATTACATTTAAAACCAAC Gonioctena_rubripennis GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATAATCCTAAATTTTTT-TTATTGTAACCCATTTCTTCTTTTTTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTATTATAGTAAATTTTGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGATGATATGTAAACTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGACTATCAATTATAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGTTTTTAAT-AATACATTTAGAACCAAC Gonioctena_rufipes ACATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCTTATTATTTTAAAAATAATAATCCCTAATTATTA-TTATTGTAACCCATTTCTACTTTTTTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTATGATAATAAATTTCGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGCAAACTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTGTCAATTATAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTGATACTAAATTAGCCTAAATA-AATACGCTTATAACCAAC Gonioctena_tredecimmaculata GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATTAATGAATTTATTAAAATTACCCTCAAATCCAAATTCATATTATTTTAAAAATAATAATCCCTAAATTTAT-TTATTGTAACCCATTTCTTCTTTTTTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-CTTTATTCTAATACATCTTGAATATTTAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAACTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCAATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGCTTTAATATAATACATTTATAACCAAA Gonioctena_variabilis GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATCAACTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATTTTATATTACAAATAAAAATCCTAAATTATAT-TTAATGTAACCCATTTCTTCTTTTTTATAAACTACACCTTGATCTGATTTA-TTTTTTTATAAAAAATCTTGAATATTATTATTCTTATAAAATATTCAAATTACGATGATATGTAAATTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCGATTATAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGTTATTTAA-ATTACATTTATAACCAAC Gonioctena_viminalis GCATATTTTAGAGCTAAAATCAAATCAATTAATTAATTAAAATTACTTTCAAATCCAAATTCATATTACTTTAAAAATAATATTTCCTAATTTTAG-TTACTGTAACCCATTTCTACTTTTGTATAAACTACACCTTGATCT?ATTTA-TTTTATTATAGTAAATTTCGAATATTAAAATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATGTAAACTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGACTGTCAATTACAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAACTTTCAAGAACATAGCTAATACTAACTTAGTCTAAATA-AATACACTTATAACCAAC Oreina_cacaliae ACATATTTTAGAGCTAAAATCAATTTAATTAATTAATTAAATTTACTCTCAAATCCAAATTCATATTATTTTATAAATAATAATCCTTAAATAATT-TTATTGTAACCCATTTCTTCTTTTTTATAAACTGCACCTTGATCTGATTTATTTTTATTATAAAAAATCTTGAATATTATTATTCTTATAAAATATTCAAATTACGACGATATACAAACTAATAAAAAAAGTAAATTAAATCGTGGATTATCAATTATAGAACAGGTTCCTCTGAATAGACTAAAATACCGCCAAAATCTTTAATTTTCAAGAACATAACTAATACTAATTTAGCATATAAA-AATACATTTAAAACAAAC ; END; BEGIN SETS; CHARSET 2ndpos (CHARACTERS = 12S) = ; CHARSET 3rdpos (CHARACTERS = 12S) = ; CHARSET gaps (CHARACTERS = 12S) = 353-358; CHARSET 1stpos (CHARACTERS = 12S) = ; CHARSET sequence (CHARACTERS = 12S) = 1-352; CHARSET COII (CHARACTERS = 12S) = ; CHARSET 16s (CHARACTERS = 12S) = ; CHARSET 12s (CHARACTERS = 12S) = 1-358; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M2581] TITLE Appendix_1; LINK TAXA = Taxa2; DIMENSIONS NCHAR=17; FORMAT DATATYPE=Standard SYMBOLS= "0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 A B C D E F G H J K L" MISSING=? GAP= -; CHARSTATELABELS 1 PP / nu mn hij h ghij nv k ef qt l or ors rs r lm p bd acd n m d, 2 FDH / ae e d cd cdg dgk di b fhj dg, 3 'MDH-2' / b a d e fh h fg f i k c, 4 'MDH-1' / f fm e dhi fl i cf fk bf j d h g dh di hi, 5 'a-PGD' / ab abg j gj a fm ci c cg cdhk e gl g ag, 6 IDH / dk k il l nq jnq pr a g ej j jo jm c bg f, 7 PGM / i np ab b bdf f c n mn jnq no h ij jln j jn bf, 8 'AAT-1' / bdk dj oq p mo n r e eh h hi f g ch hj d j o, 9 TPI / af fh h q mq gko n b bd eg ci f g, 10 LGG / de def fj fh i fi f c b, 11 FUM / b f ef k jk hkm e il d chj g j h hk hj hjk, 12 LA / g gm im m imo bc ab b n lp klp lo hln j a cde o c mo ln, 13 AK / fjn j lo f h c e m km g abd fj, 14 ArgK / d df c ce b a, 15 'AAT-2' / jn j jm e de a b ce gh h egh i fk glm m g eg eh gm, 16 PGI / mr r j ij ef gj a c n kn oq o p l deh e, 17 DDH / b bc g eg eh j d e ef, ; MATRIX Chrysomela_tremula H1ACCFDEA8AFA5DE7 Gonioctena_fornicata F78AADBC771D74BD0 Gonioctena_holdausi 82152866347860775 Gonioctena_intermedia E7397C7B768C72A86 Gonioctena_interpositus_1 C7609A7A768L739C7 Gonioctena_interpositus_2 D7708BA9768L729C7 Gonioctena_linnaeana 65234644545740553 Gonioctena_olivacea_1 23110212221221220 Gonioctena_olivacea_2 32110312231320131 Gonioctena_olivacea_3 43110312222421221 Gonioctena_pallida_1 A7488A98750B829A6 Gonioctena_pallida_2 B7588A99760B829B6 Gonioctena_pallida_3 C7408A79750B729B6 Gonioctena_quinquepunctata_1 97306977738972886 Gonioctena_quinquepunctata_2 97366987838982896 Gonioctena_quinquepunctata_3 97377977838A72896 Gonioctena_rufipes 76245755646850664 Gonioctena_variabilis_1 00000000000000000 Gonioctena_variabilis_2 11001101111110110 Gonioctena_viminalis_1 52122423343530342 Gonioctena_viminalis_2 54123533444630442 Oreina_cacaliae G89BBECD959E92CE8 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M3976] TITLE COII; LINK TAXA = Taxa3; DIMENSIONS NCHAR=553; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 550 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Chrysomela_tremula CTTTTTTTAGAAATCCCAACATGAAAAACTTTGATACTACAAGATAGAACCTCCCCTTTAATAGAACAACTTTCATATTTTCATGATCATACCTTAATAATCCTAATAATCATCACAGTATTAGTATCTCAATTAATAATCTCCTTATTTCTAAATAAATTTTCCCACCGTTTCTTATTAGAAGGTCAAATAATTGAAGTAATTTGAACAATTTTACCTACACTTATTTTAATTTTGATTGCAATTCCCTCTTTACGATTAATTTATGTCCTAGATGAAGTTAATAGCCCTTTAGTCACAATCAAAACAATTGGGCATCAATGATATTGATCCTACGAATACTCTGACTTCAAAAATATTGAATTTGATTCTTACATAACTCCAATTAATGAATTAAATAAATTTAATTTTCGTCTTTTAGATGTAGATAACCGTGTTATTATCCCATTTGAATCCCAAATTCGTATATTAATTACTGCTGCTGATGTAGTTCATTCATGAACTATCCCTTCTTTAGGAGTAAAAATTGATGCAATACCTGGCCGATTAAATC Gonioctena_fornicata_a CTTTTTTTAGAAATTTCTACATGAAAAACTTTAATACTACAAGATAGAGCTTCACCTTTAATAGAACAATTAGCTTACTTTCATGACCATGCTCTAATAATTTTAGTTATTATTACTGTATTAGTAGGACAATTAATAGTAACCCTTTTTTTTAATAAATTTACACATCGTTATTTATTAGAAGGTCAAATAATTGAAATTATTTGAACTATTTTACCAACATTAACATTAATTTTTATTGCTATTCCTTCTTTACGATTAATTTACATTTTAGATGAAATTAATAATCCAATAATCACAATTAAAACTATTGGACATCAATGATATTGATCTTATGAATATTCTGATTTTAAAAATATTGAATTTGATTCTTACATATTACCAACTAGAGAATTAAATAAATTTAATTTTCGCCTATTAGATGTAGATAATCGAATTGTAGTACCTTTTGAATCCCAAATTCGAATATTAGTAACTGCTGCAGACGTAATTCATTCATGAACAATTCCTTCACTAGGAGTAAAAATTGATGCAACCCCTGGACGACTAAATC Gonioctena_fornicata_b CTTTTTTTAGAAATTTCTACATGAAAAACTTTAATACTACAAGATAGAGCTTCACCTTTAATAGAACAATTAGCTTACTTTCATGACCATGCTCTAATAATTTTAGTTATTATTACTGTATTAGTAGGACAATTAATAGTAACCCTTTTTTTTAATAAATTTACACATCGTTATTTATTAGAAGGTCAAATAATTGAAATTATTTGAACTATTTTACCAACATTAACATTAATTTTTATTGCTATTCCTTCTTTACGATTAATTTACATTTTAGATGAAATTAATAATCCAATAATCACAATTAAAACTATTGGACATCAATGATATTGATCTTATGAATATTCTGATTTTAAAAATATTGAATTTGATTCTTACATATTACCAACTAGAGAATTAAATAAATTTAATTTTCGCCTATTAGATGTAGATAATCGAATTGTAGTACCTTTTGAATCCCAAATTCGAATATTAGTAACTGCTGCAGACGTAATTCATTCATGAACAATTCCTTCACTAGGAGTAAAAATTGATGCAACCCCTGGACGACTAAATC Gonioctena_holdausi CTTTTTTTAGAAATTTCTACATGAAAAACTTTAATACTCCAAGATAGAGCTTCCCCATTAATAGAGCAATTAGCTTATTTTCATGATCATGCTTTAATAATTTTAGTTATTATTACAGTTTTAGTTGGACAATTATTAATAACATTATTTTTTAATAAATTCTCACACCGATATCTCTTAGAGGGACAATTAATTGAAATTATTTGAACAATTTTACCAACTTTAACTCTTATTTTTATTGCTATTCCATCTTTACGATTAATTTATATTCTAGACGAAGTTAATAATCCTATAATTACCATTAAAACTATTGGACATCAATGATATTGATCATATGAATATTCTGATTTTAAAAACATTGAATTTGATTCTTATATACTACCAACCAAAGAATTAAATACTTTTAATTTTCGACTTTTAGATGTAGACAATCGAATTGTTGTACCATTTGAATCCCAAATTCGAATATTGGTATCTGCTGCAGATGTAATTCATTCTTGAACTATTCCATCATTAGGGGTTAAAATTGATGCAACTCCTGGACGATTAAATC Gonioctena_intermedia CTTTTTTTAGAAATTGCTACATGAAAAACATTAATACTTCAGGATAGGGCTTCCCCTTTAATAGAACAATTAGCTTATTTCCATGACCATGCTTTAATAATTTTAGTTATTATTACAGTATTAGTAGGTCAACTAATAACAACTTTATTTTTTAATAAATTTACTCATCGATATTTATTAGAAGGTCAATTAATTGAAATTATTTGAACAATTTTACCTACATTAACATTAATTTTTATTGCTATTCCTTCTTTACGATTAATTTATATTTTAGATGAAGTTAATAACCCTATAATTACCATTAAAACTATTGGACACCAATGATACTGATCCTATGAATATTCCGACTTCAAAAATATTGAATTCGATTCTTATATACTACCAACTATAGAGTTAAATAAATTTAACTTTCGTTTATTAGATGTAGATAATCGAATCGTTATTCCCTTCGAATCACAAATTCGAATATTGGTAACTGCAGCTGATGTCATTCACTCCTGAACTATCCCTTCTTTAGGTGTTAAAATTGATGCTACCCCAGGTCGATTAAACC Gonioctena_interposita_1 CTTTTTTTAGAAATTGCTACATGAAAAACATTAATACTTCAAGATAGGGCATCCCCTTTAATAGAACAATTAGCTTATTTCCATGATCATGCTTTAATAATTT?AGTTATTATCACAGTATTAGTAGGCCAATTAATAGCAGCTTTATTTTTCAATAAATTTACCCATCGGTATTTATTAGAGGGTCAAATAATTGAAATTATTTGAACAATTTTACCTACATTAACTTTAATTTTTATTGCTATTCCTTCTTTACGATTAATCTATATTTTAGATGAAGTTAATAACCCTATAATTACCATTAAAACTATTGGACATCAATGATACTGATCTTATGAATATTCAGATTTTAAAAATATTGAATTTGATTCCTATATACTCCCAACTGCAGAATTAAATAAATTTAATTTTCGTTTATTAGATGTGGATAATCGAATTGTTATCCCCTTTGAATCACAAATTCGGATACTGGTAACTGCAGCTGATGTAATTCACTCATGAACAATCCCTTCTTTAGGGGTAAAAATTGATGCTACACCAGGACGATTAAATC Gonioctena_interposita_2 CTTTTTTTAGAAATTGCTACATGAAAAACATTAATACTTCAAGATAGGGCATCCCCTTTAATAGAACAATTAGCTTATTTCCATGATCATGCTTTAATAATTTTAGTTATTATCACAGTATTAGTAGGCCAATTAATAGCAGCTTTATTTTTCAATAAATTTACCCATCGGTATTTATTAGAGGGTCAAATAATTGAAATTATTTGAACAATTTTACCTACATTAACTTTAATTTTTATTGCTATTCCTTCTTTACGATTAATCTATATTTTAGATGAAGTTAATAACCCTATAATTACCATTAAAACTATTGGACATCAATGATACTGATCTTATGAATATTCAGATTTCAAAAATATTGAATTTGATTCATATATACTCCCAACTGCAGAATTAAATAAATTTAATTTTCGTTTATTAGATGTGGATAATCGAATTATTATCCCCTTTGAATCACAAATTCGGATACTAGTAACTGCAGCTGATGTAATTCACTCATGAACAATCCCTTCTTTAGGAGTAAAAATTGATGCTACACCAGGACGATTAAATC Gonioctena_kamikawai CTTTTTTTAGAAATTTCTACATGAAAAACTTTAATACTCCAAGATAGAGCTTCTCCATTAATAGAGCAATTAGCCTATTTTCACGATCATGCTTTAATAATTTTAGTTATTATTACTGTATTAGTTGGACAATTAATAATAACATTATTTTTTAATAAATTTACACATCGTAATTTATTAGAAGGACAAATAATTGAAATTATTTGAACAGTTTTACCTACGTTAACTCTTATTTTTATCGCAATTCCCTCTCTTCGATTAATTTATATTTTAGATGAAGTTAATAATCCAATAATTACTATCAAAACAATTGGTCATCAATGATACTGATCCTATGAATACTCAGATTTTAAAAATATTGAATTTGATTCATACATACTCCCTACTAATGAATTAAAAAATTTTAATTTCCGGCTACTTGATGTCGACAATCGAATTGTTATTCCATTTGAATCCCAAATCCGAATATTAGTAACTGCTGCAGATGTAATTCATTCTTGAACAATCCCATCTTTAGGAGTAAAAATTGACGCAACTCCAGGACGTCTAAACC Gonioctena_linnaeana CTTTTTTTAGAAATTTCTACATGAAAAACTTTAATACTTCAAGACAGAGCTTCCCCACTAATAGAACAATTAGCTTATTTTCACGATCATGCTCTAATAATTCTAGTAATCATTACAGTTCTAGTTGGACAATTAATAATAACATTATTTTTTAATAAATTTACCCATCGATATCTTTTAGAGGGTCAAATAATTGAAATTATTTGAACAATTCTACCAACTTTAACATTAATCTTTATTGCTATCCCATCTTTACGATTAATTTATATTTTAGATGAAGTTAATAACCCTATAATTACTATTAAAACTATTGGACATCAATGATACTGATCATATGAGTATTCAGATTTCAAAAATATTGAATTTGATTCTTACATATTACCAACTAAAGAATTAAATAATTTTAATTTTCGACTTCTAGATGTAGATAACCGAATTGTTGTACCATTTGAATCTCAAATTCGAATATTAGTAAGTGCAGCAGACGTTATTCACTCCTGAACTATCCCATCTTTAGGAGTTAAAATTGATGCCACTCCTGGGCGACTTAATC Gonioctena_nigroplagiata CTTTTTTTAGAAATTGCAACATGAAAAACCCTTATACTCCAAGATAGAGCTTCCCCCTTAATAGAACAATTAGCTTATTTTCACGATCATGCTTTAATAATTTTAGTTATTATTACAGTTTTAGTTGGACAATTAATAATAACTTTAATTTTTAATAAATTTACACATCGTTACTTACTTGAAGGTCAATTAATTGAAATTATTTGAACTATTTTACCAACATTAACATTAATTTTTATTGCTATTCCTTCTTTACGATTAATTTATATTTTAGATGAAATTAATAATCCAATAATTACAATTAAAACTATTGGGCATCAATGATATTGATCTTATGAATATTCAGACTTCAAAAATATCGAATTTGATTCATATATATTACCAACTAGAGAATTAAATAAATATAACTTTCGTCTTTTAGATGTAGACAACCGAGTAATTGTTCCTTTTGAATCTCAAATTCGAATATTAGTTACAGCAGCTGATGTTATTCATTCGTGAACAATTCCATCCTTAGGAGTAAAAATTGATGCGACACCTGGTCGATTAAATC Gonioctena_occidentalis CTTTTTTTAGAAATTTCTACATGAAAAACTTTAATACTCCAAGATAGGGCTTCTCCATTAATAGAACAATTAGCTTATTTTCATGATCATGCTTTAATAATTTTAGTTATTATTACAGTCTTAGTTGGACAATTAATAATAACATTATTTTTTAATAAATTTTCACACCGATATCTTTTAGAAGGACAATTAATTGAAATTATTTGAACAATTCTACCAACTTTAACCCTTATTTTTATTGCTATCCCATCTTTACGATTAATTTATATTCTAGATGAAATTAATAATCCTATAATTACTATTAAAACTATCGGGCATCAATGATATTGATCATACGAATATTCTGATTTTAAAAATATTGAATTTGATTCTTATATATTACCAACTAAAGAATTAAATAATTTTAACTTTCGACTTTTAGATGTAGATAATCGAATTGTTGTACCATTTGAATCCCAAATCCGCATATTAGTATCTGCAGCAGATGTAATCCATTCTTGAACTATTCCATCCTTGGGAGTTAAAATTGATGCAACTCCTGGACGATTAAATC Gonioctena_olivacea CTTTTTTTAGAAATTTCTACCTGAAAAACTTTAATACTTCAAGATAGGGCATCTCCTTTAATAGAACAGCTAGCTTATTTCCATGACCATGCATTAATAATTTTAGTTATTATTACTGTATTAGTTGGACAATTAATGATAACTTTATTTTTTAATAAATTTACTCATCGATATTTACTAGAAGGACAATTAATTGAAATTATTTGAACTATTCTACCAACACTAACGCTTATTTTTATTGCTATCCCATCTTTACGATTAATCTATATTTTAGATGAAATTAACAATCCAATAATTACAATTAAAACTATTGGACATCAATGGTACTGATCATATGAATACTCTGATTTTAAAAATATCGAATTTGATTCATATATAATACCAACCTCAGAATTAAATAAATTCAATTTTCGTCTTTTAGACGTTGATAATCGAGTAGTAGTACCTTTTGAATCTCAAATTCGAATATTAGTAACTGCGGCAGATGTAATTCACTCATGAACAATTCCATCTTTAGGAGTAAAAATTGATGCAACTCCAGGACGATTAAATC Gonioctena_pallida_1 CTTTTTTTAGAAATTGCTACATGAAAAACATTAATACTTCAAGATAGGGCATCCCCTTTAATAGAACAATTAGCTTATTTCCATGATCATGCTTTAATAATTTTAGTTATTATTACAGTATTAGTAAGCCAATTAATAACAGCTTTATTTTTCAATAAATTTACCCATCGATATTTACTAGAGGGTCAAATAATTGAAATTATTTGAACAATTTTACCTACATTAACCTTAATTTTTATTGCTATTCCTTCTTTACGCTTAATCTATATTTTAGATGAAGTTAATAACCCTATAATTACCATTAAAACTATTGGACATCAATGATACTGATCTTATGAATATTCAGATTTCAAAAATATTGAATTTGATTCTTATATACTTCCAACTGTAGAATTAAATAAATTTAATTTTCGTTTATTAGATGTAGATAATCGAATTATTATTCCATTTGAATCACAAATTCGAATACTGGTAACTGCAGCTGATGTAATTCACTCATGAACAATCCCTTCTTTAGGAGTAAAAATTGATGCTACACCAGGACGATTGAA?? Gonioctena_pallida_2 CTTTTTTTAGAAATTGCTACATGAAAAACATTAATACTTCAAGATAGGGCATCCCCTTTAATAGAACAATTAGCTTATTTCCATGATCATGCTTTAATAATT??????ATTATTACAGTATTAGTAGGCCAATTAATAGCAGCTTTATTTTTCAATAAATTTACCCATCGATATTTACTAGAGGGTCAAATAATTGAAATTATTTGAACAATTTTACCTACATTAACCTTAATTTTTATTGCTATTCCTTCTTTACGCTTAATCTATATTTTAGATGAAGTTAATAACCCTATAATTACCATTAAAACTATTGGACATCAATGATACTGATCTTATGAATATTCAGATTTCAAAAATATTGAATTTGATTCCTATATACTCCCAACTGCAGAATTAAATAAATTTAATTTTCGTTTATTAGATGTGGATAATCGAATT{AG}TTATTCCCTTTGAATCACAAATTCGAATACTGGTAACTGCAGCTGACGTAATTCACTCATGGACAATCCCTTCTTTAGGAGTAAAAATTGATGCTACACCAGGACGATTAAATC Gonioctena_quinquepunctata CTTTTTTTAGAAATTGCTACATGAAAAACATTAATTCTCCAAGATAGGGCTTCCCCTTTAATAGAACAATTAGCTTATTTCCATGACCATGCTTTAATAATTTTAGTTATTATTACAGTATTAGTAGGTCAATTAATAGTAACTTTATTTTTTAATAAATTTACTCATCGATATTTATTAGAAGGTCAATTAATTGAGATTATTTGAACAATTTTACCAACATTAACATTAATTTTTATTGCTATTCCTTCTTTACGATTAATTTATATTTTAGATGAAGTTAATAACCCGATAATTACCATTAAAACTATTGGACACCAATGATATTGATCCTATGAATATTCTGACTTCAAGAATATTGAATTCGACTCTTACATACTACCAACCGCAGAATTAAATAAATTTAATTTTCGTTTATTAGATGTAGATAACCGAATTGTTATCCCCTTCGAATCACAAATCCGAATATTAGTAACTGCTGCTGATGTAATTCACTCTTGAACTATCCCTTCTTTAGGTGTAAAAATTGATGCAACCCCGGGTCGGTTAAATC Gonioctena_rubripennis CTTTTTTTAGAAATTTCTACATGAAAAACTTTAATACTACAAGATAGAGCATCACCCCTTATAGAACAATTAGCTTATTTTCACGATCATGCCCTTATAATTTTAGTTATTATTACTGTATTAGTGGGTCAATTAATATTAACCTTATTTTATAATAAATTTACCCATCGAAATTTATTAGAAGGACAAATAATTGAAATTATTTGAACAATTTTACCAACATTAACTCTTATCTTTATTGCTATTCCATCATTACGATTAATTTATATTTTAGATGAAGTTAATAATCCAATAATTACTATTAAAACAATTGGACATCAATGATATTGATCATATGAATATTCAGATTTCAAAAATATTGAATTTGATTCTTATATATTACCAACAAGAGAACTTAATAAATTTAATTTTCGGCTATTAGATGTTGATAATCGAATTGTAATTCCATTTGAATCACAAATTCGTATATTAGTAACTGCTGCCGATGTAATTCACTCTTGAACTATTCCATCTTTAGGAGTAAAAATTGATGCTACTCCTGGTCGTCTAAATC Gonioctena_rufipes CTTTTTTTAGAAATTTCTACATGAAAAACTTTAATACTCCAAGATAGGGCTTCCCCATTAATAGAACAATTAGCATACTTTCATGATCACGCTTTAATAATTTTAGTTATTATTACAGTCTTAGTTGGACAATTAATAGTAACATTATTTTTCAATAAATTCACCCATCGATACCTTTTAGAAGGACAATTAATTGAAATTATTTGAACAATTTTACCAACCCTAACACTTATTTTTATTGCTATTCCATCATTACGATTAATTTATATTTTAGATGAAGTTAATAATCCTATAATTACCATTAAAACCATTGGTCATCAATGATACTGATCATATGAATATTCTGATTTCAAAAATATTGAATTTGATTCTTATATACTACCAACTCAAGAATTAAATAATTTTAACTTTCGGCTATTAGATGTTGATAATCGAATTATTGTACCTTTTGAATCCCAAATTCGAATATTGGTATCTGCAGCAGATGTAATTCATTCTTGAACTATTCCATCATTAGGTGTTAAAATTGATGCAACTCCTGGACGACTAAATC Gonioctena_tredecimmaculata CTTTTTTTAGAAATTGCAACATGAAAAACCTTAATACTTCAAGATAGGGCATCTCCATTAATAGAACAATTAGCTTACTTTCATGACCATGCTTTAATAATTCTAGTTATTATTACAGTATTAGTTGGTCAATTAATAATAACATTATTTTTTAATAAATTTACCCATCGAAATTTATTAGAAGGACAAATGATTGAAATTATTTGAACTATTTTACCTACACTAACTCTAATTTTTATTGCTATCCCCTCCTTACGACTAATTTATATTCTTGATGAAGTAAATAATCCAATAATTACTATTAAAACTATCGGGCACCAATGATACTGATCTTACGAATATTCCGATTTTAAAAATATTGAATTTGATTCGTATATATTACCAACTACAGAATTAAATAAATTTAATTTCCGCCTATTAGATGTAGATAACCGAATTGTAATCCCATTTGAGTCTCAAATTCGTATATTAGTAACTGCTGCAGATGTTATTCACTCTTGAACTATCCCATCATTAGGAGTAAAAATTGATGCTATACCAGGCCGCCTTAATC Gonioctena_variabilis CTTTTTTTAGAAATTTCTACATGAAAAACTTTAATATTACAAGATAGGGCATCTCCCTTAATAGAACAATTAGCATATTTTCATGATCATGCATTAATAATTTTAGTTATTATTACTGTACTTGTAGGACAATTAATAATAACTTTATTTTTCAATAAATTTACTCATCGATATTTATTAGAAGGTCAAATAATTGAAATTATTTGAACTATTCTACCAACATTAACACTAATTTTTATTGCAATTCCGTCATTACGTTTAATTTATATTTTAGATGAAATTAATAACCCAATAATTACTATTAAAACTATTGGACACCAATGATATTGATCTTATGAATATTCTGATTTTAAAAATATTGAATTTGATTCATATATACTACCAACCATAGAATTAAATAAATTTAATTTTCGTTTATTAGATGTAGATAATCGAGTAGTTGTACCATTTGAATCACAGATTCGAATATTAGTTACTGCAGCAGATGTAATTCACTCTTGAACAATCCCGTCATTAGGAGTCAAAATTGATGCTACCCCTGGACGATTGAATC Gonioctena_viminalis CTTTTTTTAGAAATTTCTACATGAAAAACTTTAATACTCCAAGATAGAGCTTCCCCATTAATAGAGCAATTAGCCTATTTTCATGATCATGCTTTAATAATTTTAGTTATTATTACAGTTTTAGTTGGACAATTAATAATAACATTATTTTTTAATAAATTTTCACATCGATACCTTTTAGAAGGGCAATTAATTGAAATTATTTGAACAGTTTTACCAACTTTAACCCTTATTTTTATTGCTATTCCATCTTTACGATTAATTTATATTCTAGACGAAGTTAATAATCCTATAATTACTATTAAAACTATTGGGCATCAATGATATTGATCATATGAATATTCTGATTTCAAAAACATTGAATTTGATTCTTATATATTACCAACCAAAGAATTAAATAATTTTAATTTTCGACTTTTAGATGTAGATAATCGAATTGTTGTACCATTTGAATCCCAAATTCGCATATTAGTATCTGCTGCAGATGTAATTCATTCTTGAACTATCCCATCCTTAGGAGTTAAAATTGATGCAACCCCTGGACGGTTAAATC Oreina_cacaliae CTTTTTTTAGAAATGATAACATGAAAAAATATTACATTACAAGATAGTGCCTCACCTTTGATAGAACAATTAAATTACTTCCATGACCATACTTTAATGATTTTGTTAATTATTACAGTTTTAGTTGCCCAACTAATAATTAGTTTATTTTACAATAAATTTACACATCGATATTTATTAGAAGGACAAATTATTGAAATTATCTGAACTATTTTACCTACTTTAACCTTAATTTTTATTGCTATTCCTTCCTTACGATTAATTTATATCTTAGATGAAATTAATAATCCTATAATTACAATTAAAACTATTGGACATCAATGATATTGATCATATGAATATTCAGATTTTAAAAATATTGAATTCGATTCTTACATAATTCCTACTAATGAATTAAAAATTTTTAATTTTCGTCTTTTAGATGTTGATAATCGAATTATTGCCCCATTCCAATCACAAATCCGTATATTAATTACGGCTACAGATGTTATCCACTCATGGACAATCCCTTCTTTGGGAGTTAAAATTGATGCTACCCCTGGACGTTTAAATC ; END; BEGIN SETS; CHARSET gaps (CHARACTERS = COII) = ; CHARSET sequence (CHARACTERS = COII) = 1-553; CHARSET 2ndpos (CHARACTERS = COII) = 14 326 329 332 335 338 341 344 347 350 353 356 359 362 365 368 371 374 377 380 383 386 389 392 395 398 401 404 407 410 413 416 419 422 425 428 431 434 437 440 443 446 449 17 20 23 26 29 32 35 38 41 44 47 50 53 56 59 62 65 68 71 74 77 80 83 86 89 92 95 98 101 104 107 110 113 116 119 122 125 128 131 134 137 140 143 146 149 152 155 158 161 164 167 170 173 176 179 182 185 188 191 194 197 200 203 206 209 212 215 218 221 224 227 230 233 236 239 242 245 248 251 254 257 260 263 266 269 272 275 278 281 284 287 290 293 296 299 302 305 308 311 314 317 320 323 452 455 458 461 464 467 470 473 476 479 482 485 488 491 494 497 500 503 506 509 512 515 518 521 524 527 530 533 536 539 542 545 548 551; CHARSET 1stpos (CHARACTERS = COII) = 13 16 19 22 25 28 31 34 37 40 43 46 49 52 55 58 61 64 67 70 73 76 79 82 85 88 91 94 97 100 340 103 106 343 109 346 112 349 352 115 355 118 358 361 121 364 124 367 370 127 373 130 376 379 133 382 385 388 391 394 397 136 400 403 139 406 142 409 412 145 415 148 418 421 151 424 154 427 430 157 433 160 436 163 439 442 166 445 169 448 451 172 454 175 457 178 460 463 181 466 469 184 472 187 475 478 190 481 484 193 196 199 487 490 493 496 499 502 505 508 511 514 517 520 523 526 529 532 535 538 541 544 547 550 553 202 205 208 211 214 217 220 223 226 229 232 235 238 241 244 247 250 253 256 259 262 265 268 271 274 277 280 283 286 289 292 295 298 301 304 307 310 313 316 319 322 325 328 331 334 337; CHARSET 16s (CHARACTERS = COII) = ; CHARSET COII (CHARACTERS = COII) = 1-553; CHARSET 12s (CHARACTERS = COII) = ; CHARSET 3rdpos (CHARACTERS = COII) = 354 357 360 363 366 369 372 375 378 381 384 387 390 393 396 399 402 405 408 411 414 417 420 423 426 429 432 15 435 438 18 21 441 24 444 27 30 447 33 450 36 39 453 42 456 45 48 51 54 57 60 63 66 69 72 75 78 81 459 84 87 90 462 93 465 96 99 468 102 105 108 111 471 114 117 474 120 123 477 126 480 129 483 132 135 486 138 489 141 492 144 147 495 150 498 153 156 501 159 162 504 165 507 168 171 510 174 177 513 180 516 183 186 519 189 192 522 195 525 198 201 528 204 207 531 210 534 213 216 219 537 222 540 225 228 543 231 234 546 237 549 240 243 552 246 249 252 255 258 261 264 267 270 273 276 279 282 285 288 291 294 297 300 303 306 309 312 315 318 321 324 327 330 333 336 339 342 345 348 351; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M2746] TITLE 16S_Alignment_1; LINK TAXA = Taxa3; DIMENSIONS NCHAR=495; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Chrysomela_tremula AGACCTAATA-TTTTAGCTCCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTTGATTTGAACTCTAAAAAAAAATAACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTAATCTTATAATC--ACTAAATTTGGATCAAATATTCATTAATTAATGTTAAATTATAAAAAAAGTTAAATTAATTTTTTAATCACCCCAACTAAATAAATACCTAAATTAATAAAATTAATTCTAAATATAATAA-TTTA-TTTATATATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATGAAATTTAAGCTTTTTAACTTAAATATAAAATTCTAATAAAATTAAATAAAGACAGTTATTTTTTTATCCAACCC-TTCATTCCAGCTTTCAATTAAAAAACTATTGATTATGCTACCTTAGCACGGTTAAAATACCGCGGCCATTC-AAT-TCTCATTGGGCAGGCTAGACTTTAAAT???????CCACCCCCA Gonioctena_fornicata_a AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTATTATATAAAAAAAGTTAATTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAAAAAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAACTTTA-TTTTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAACAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTCTAATTAAGAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCCTTCAAAT-TTTCAGCGGGCAGGTCAGACCTTAAATTATAATCCCAACCACA Gonioctena_fornicata_b AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTATTATATAAAAAAAGTTAATTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAAAAAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAACTTTA-TTTTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAACAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTCTAATTAAGAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCCTTCAAAT-TTTCAGCGGGCAGGTCAGACCTTAAATTATAATCCCAACCACA Gonioctena_holdausi AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAAAATTGGATCAATAACTCATAAATTAATGGTATATTACAAAAAAAGTTAAATAAATTTTTTAATCGCCCCAATCAAATTATAAATCAAATTTAATACATAAATTCTAAAATAAAAAA-TATA-AATTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATTTAACTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTTTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTCAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAATATTTCAGTGGGCAGGCCAGACCTAAAATTA?????CCACCCAAA Gonioctena_intermedia AGACCTAATT-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAACTATTGGATCAATAACTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTACTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAAAAAAA-TTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TATA-TTCTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTGTATTATAATCCCCCCCACA Gonioctena_interposita_1 AGACCTAATC-TTTCAGCTTCTGCACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAACTGGATCAATGATTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTACTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAGAAAAAA-TTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TTTA-TACTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGCTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCCCCCACA Gonioctena_interposita_2 AGACCTAATC-TTTCAGCTTCTGCACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAACTGGATCAATGATTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTACTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAGAAAAAA-TTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TTTA-TACTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGCTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCCCCCACA Gonioctena_kamikawai AGACCTAATA-TTTCAGCTTCTACACCAAAAATTTACTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATTATTGGATCAAGAAATCATAAATTAATGAATAATTACAAAAAAAGTTAATTAAATTTTTCAATCACCCCAATCAAATTATAAATCAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATATAAAA-TATA-ATATATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTCAATTATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTCAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAATATATCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTAAATTCCCACCCAAA Gonioctena_linnaeana AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATAAACTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATCAAAAAAAAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTATATTACAAAAAAAGTTTATCATATTTTTCAATCACCCCAATCAAATTATAGATCAAATTTAATAATTAAATTCTAAAATAAAAAA-TATG-TACTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATTTAAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAACAGAGACAGTTATTTTTTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAATAATTCAGTGGGCAGGCCAGACCTAAAATTAAAT??CAACCCAAA Gonioctena_nigroplagiata AGACCTAATT-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATAAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTGTAATC--AAAATAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTAATTATACAAAAAAAGTTTATTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAAAAAAA-TTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAA-TTTATTTTTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGCTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCCTTCAAAT-CTTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAA?????????CCCCACACA Gonioctena_occidentalis AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAAAATTGGATCAATAATTCATAAATCAATGTTATATTACAAAAAAAGTTAAATAAATTTTTTAATCGCCCCAATCAAATTATAAATCAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAA-TATA-AACTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATTTAACTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTTTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTCAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAATATTTCAGTGGGCAGGCCAGACCT-AAATTA?????CCACCCAAC Gonioctena_olivacea ?GACCCAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAACTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAAAATTGGATCAATAAATCATACATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTAATTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAAAAAAAATGAATAAAAAAATACTAAAATAAAAAA-TTTA-TTTTAAAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATATTAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCCTTTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCACCAACA Gonioctena_pallida_1 ?GACCTAATA-TTTCAGCTTCTACACCAAAAATTAACTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAACTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTACTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAGAAAAAA-TTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TTTA-TACTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCCCCCACA Gonioctena_pallida_2 ?GACCTAATA-TTTCAGCTTCTACACCAAAAATTAACTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAACTGGATCAATGATTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTACTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAGAAAAAA-TTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TTTA-TACTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCCCCCACA Gonioctena_quinquepunctata ?CACCTAATT-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCT?ATAATC--AAAATAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTAATAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAAAAAAA-TTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TATA-ATTTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTATATTATAATCCCCCCCACA Gonioctena_rubripennis AGACCTAATA-TCCTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAAAATTGGATCAATAATTCATAAATTTATGTTACTATATAAAAAAAGTTAATTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAATTAAATTTAATAATTAAATTCTAAAATAAAAAA-TTTA-AATTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACTAAACTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTATACAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAAAATTTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTAAATTCCCACCCAAA Gonioctena_rufipes ???CCTAATA-TTTCAGCTTCTGCACCGAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTATATCTTATAATC-AAAAAAAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTATTATACAAAAAAAGTTAATAATATTTTTCAATCGCCCCAATCAAATTATAAATTAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAA-TAAA-AACTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTCAATTTAATTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTACTTTTTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCA?GGCCATTTAAATAATTCAGTGGG???GCCAGACCTAAA?TTAAATTCCGACCCAAA Gonioctena_tredecimmaculata ????CTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATAAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTGTAATC--AAAATAATTGGATCAATAATTCATAAATCAATGTTACTATATAATAAAAGTTTTCTAAATTTCACAATCACCCCAATTAAATTATAAACTAAATTTAATAATTAAATTCTAAAATACAAAA-TATA-AATTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACTAAACTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTATATAGAGACAGCTATTTTCTTATCTAACCT-TTCATTCCAGATTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAAT-CTTCAGTGGGCAGGTCGGACCTTAAATC??????CCACCCACA Gonioctena_variabilis AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAATTGGATCAATTATTCATATAAATATGTAATAATACAAAAAAAGTTTAATAAATTTTTCAATCACCCCAATCAAATTATAAAATAAA-TAAATAAATAAATACTAAAATATAAAA-TTAAATTTTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAAAATTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTATAATAAAATTAAATAGAGACAGTCATTTTCTTATATAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCCCACACA Gonioctena_viminalis AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAAAATTGGATCAATAATTCATAAATCAATGTTATATTACAAAAAAAGTTAAATAAATTTTTTAATCGCCCCAATCAAATTATAAATCAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAA-TATA-AATTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATTTAACTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTTTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTCAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAATATTTCAGTGGGCAGGCCAGACCTAAAATTAACATCCCACCCAAA Oreina_cacaliae AGACCTAATATTTTTAGCTTCTACACCAAAAATTTATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTTAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAATATTGGATCATATACTCATAAATTAATGTTTTAAAATAAAAAAAGTTAAATAAATTTTTCAATCACCCCAATTAAATTATTCAATAAAATAAATAAATAAATACTAAAATATATTT-TTTA-TTAAATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATTAAATTTAACAGAGACAGCTATTTTCTTATCCAACCT-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAAA-TCTCAGTGGGCAGGTTAGACCTTAAATTATC???ACACCCACA ; END; BEGIN SETS; CHARSET sequence (CHARACTERS = 16S_Alignment_1) = 1-486; CHARSET 3rdpos (CHARACTERS = 16S_Alignment_1) = ; CHARSET gaps (CHARACTERS = 16S_Alignment_1) = 487-495; CHARSET 1stpos (CHARACTERS = 16S_Alignment_1) = ; CHARSET 12s (CHARACTERS = 16S_Alignment_1) = ; CHARSET 16s (CHARACTERS = 16S_Alignment_1) = 1-495; CHARSET COII (CHARACTERS = 16S_Alignment_1) = ; CHARSET 2ndpos (CHARACTERS = 16S_Alignment_1) = ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M3974] TITLE 16S_Alignment_2; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=495; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? GAP= -; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Chrysomela_tremula AGACCTAATA-TTTTAGCTCCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTTGATTTGAACTCTAAAAAAAAATAACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTAATCTTATAATC--ACTAAATTTGGATCAAATATTCATTAATTAATGTTAAATTATAAAAAAAGTTAAATTAATTTTTTAATCACCCCAACTAAATAAATACCTAAATTAATAAAATTAATTCTAAATATAATAA-TTTA-TTTATATATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATGAAATTTAAGCTTTTTAACTTAAATATAAAATTCTAATAAAATTAAATAAAGACAGTTATTTTTTTATCCAACCC-TTCATTCCAGCTTTCAATTAAAAAACTATTGATTATGCTACCTTAGCACGGTTAAAATACCGCGGCCATTC-AAT-TCTCATTGGGCAGGCTAGACTTTAAAT???????CCACCCCCA Gonioctena_fornicata_a AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTATTATATAAAAAAAGTTAATTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAAAAAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAACTTTA-TTTTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAACAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTCTAATTAAGAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCCTTCAAAT-TTTCAGCGGGCAGGTCAGACCTTAAATTATAATCCCAACCACA Gonioctena_fornicata_b AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTATTATATAAAAAAAGTTAATTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAAAAAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAACTTTA-TTTTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAACAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTCTAATTAAGAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCCTTCAAAT-TTTCAGCGGGCAGGTCAGACCTTAAATTATAATCCCAACCACA Gonioctena_holdausi AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAAAATTGGATCAATAACTCATAAATTAATGGTATATTACAAAAAAAGTTAAATAAATTTTTTAATCGCCCCAATCAAATTATAAATCAAATTTAATACATAAATTCTAAAATAAAAAA-TATA-AATTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATTTAACTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTTTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTCAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAATATTTCAGTGGGCAGGCCAGACCTAAAATTA?????CCACCCAAA Gonioctena_intermedia AGACCTAATT-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAACTATTGGATCAATAACTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTACTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAA-AAAAATTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TATA-TTCTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTGTATTATAATCCCCCCCACA Gonioctena_interposita_1 AGACCTAATC-TTTCAGCTTCTGCACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAACTGGATCAATGATTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTACTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAGA-AAAAATTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TTTA-TACTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGCTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCCCCCACA Gonioctena_interposita_2 AGACCTAATC-TTTCAGCTTCTGCACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAACTGGATCAATGATTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTACTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAGA-AAAAATTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TTTA-TACTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGCTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCCCCCACA Gonioctena_kamikawai AGACCTAATA-TTTCAGCTTCTACACCAAAAATTTACTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATTATTGGATCAAGAAATCATAAATTAATGAATAATTACAAAAAAAGTTAATTAAATTTTTCAATCACCCCAATCAAATTATAAATCAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATATAAAA-TATA-ATATATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTCAATTATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTCAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAATATATCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTAAATTCCCACCCAAA Gonioctena_linnaeana AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATAAACTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATCAAAAAAAAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTATATTACAAAAAAAGTTTATCATATTTTTCAATCACCCCAATCAAATTATAGATCAAATTTAATAATTAAATTCTAAAATAAAAAA-TATG-TACTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATTTAAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAACAGAGACAGTTATTTTTTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAATAATTCAGTGGGCAGGCCAGACCTAAAATTAAAT??CAACCCAAA Gonioctena_nigroplagiata AGACCTAATT-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATAAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTGTAATC--AAAATAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTAATTATACAAAAAAAGTTTATTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAA-AAAAATTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAA-TTTATTTTTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGCTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCCTTCAAAT-CTTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAA?????????CCCCACACA Gonioctena_occidentalis AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAAAATTGGATCAATAATTCATAAATCAATGTTATATTACAAAAAAAGTTAAATAAATTTTTTAATCGCCCCAATCAAATTATAAATCAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAA-TATA-AACTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATTTAACTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTTTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTCAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAATATTTCAGTGGGCAGGCCAGACCT-AAATTA?????CCACCCAAC Gonioctena_olivacea ?GACCCAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAACTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAAAATTGGATCAATAAATCATACATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTAATTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAAAAAAAATGAATAAAAAAATACTAAAATAAAAAA-TTTA-TTTTAAAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATATTAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCCTTTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCACCAACA Gonioctena_pallida_1 ?GACCTAATA-TTTCAGCTTCTACACCAAAAATTAACTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAACTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTACTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAGA-AAAAATTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TTTA-TACTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCCCCCACA Gonioctena_pallida_2 ?GACCTAATA-TTTCAGCTTCTACACCAAAAATTAACTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAACTGGATCAATGATTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTACTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAGA-AAAAATTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TTTA-TACTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCCCCCACA Gonioctena_quinquepunctata ?CACCTAATT-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCT?ATAATC--AAAATAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTAAAATACAAAAAAAGTTTAATAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAA-AAAAATTAATAAATAAATACTAAAATAAAAAA-TATA-ATTTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAATTTAAATAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTATATTATAATCCCCCCCACA Gonioctena_rubripennis AGACCTAATA-TCCTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAAAATTGGATCAATAATTCATAAATTTATGTTACTATATAAAAAAAGTTAATTAAATTTTTTAATCACCCCAATTAAATTATAAATTAAATTTAATAATTAAATTCTAAAATAAAAAA-TTTA-AATTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACTAAACTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTATACAGAGACAGTTATTTTCTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAAAATTTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTAAATTCCCACCCAAA Gonioctena_rufipes ???CCTAATA-TTTCAGCTTCTGCACCGAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATTTGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTATATCTTATAATC-AAAAAAAATTGGATCAATAATTCATAAATTAATGTTATTATACAAAAAAAGTTAATAATATTTTTCAATCGCCCCAATCAAATTATAAATTAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAA-TAAA-AACTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTCAATTTAATTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTACTTTTTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCA?GGCCATTTAAATAATTCAGTGGG???GCCAGACCTAAA?TTAAATTCCGACCCAAA Gonioctena_tredecimmaculata ????CTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATAAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTGTAATC--AAAATAATTGGATCAATAATTCATAAATCAATGTTACTATATAATAAAAGTTTTCTAAATTTCACAATCACCCCAATTAAATTATAAACTAAATTTAATAATTAAATTCTAAAATACAAAA-TATA-AATTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAACTAAACTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTATATAGAGACAGCTATTTTCTTATCTAACCT-TTCATTCCAGATTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAAT-CTTCAGTGGGCAGGTCGGACCTTAAATC??????CCACCCACA Gonioctena_variabilis AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAATAATTGGATCAATTATTCATATAAATATGTAATAATACAAAAAAAGTTTAATAAATTTTTCAATCACCCCAATCAAATTATAAA-ATAAATAAATAAATAAATACTAAAATATAAAA-TTAAATTTTATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAAAATTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTATAATAAAATTAAATAGAGACAGTCATTTTCTTATATAACCC-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTCAAAT-ACTCAGTGGGCAGGCCAGACCTTAAATTATAATCCCCCACACA Gonioctena_viminalis AGACCTAATA-TTTTAGCTTCTACACCAAAAATTAATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTCAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAAAATTGGATCAATAATTCATAAATCAATGTTATATTACAAAAAAAGTTAAATAAATTTTTTAATCGCCCCAATCAAATTATAAATCAAATTTAATAAATAAATTCTAAAATAAAAAA-TATA-AATTATAATAAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATTTAACTTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATAAAATTAAATAGAGACAGTTATTTTTTTATCTAACCC-TTCATTCCAGCTTTCAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAATATTTCAGTGGGCAGGCCAGACCTAAAATTAACATCCCACCCAAA Oreina_cacaliae AGACCTAATATTTTTAGCTTCTACACCAAAAATTTATTTTAATCCAACATCGAGGTCGCAATCTTTTTTTTTAATATGAACTTTCTAAAAAAATTACGCTGTTATCCCTAAGGTAATTTTATCTTATAATC--AAAAATATTGGATCATATACTCATAAATTAATGTTTTAAAATAAAAAAAGTTAAATAAATTTTTCAATCACCCCAATTAAATTATTCAATAAAATAAATAAATAAATACTAAAATATATTT-TTTA-TTAAATAATTAAACTCTATAGGGTCTTCTCGTCTTTTAATAATAATTAAGCTTTTTAACTTAAAAATAAAATTCTAATTAAATTTAACAGAGACAGCTATTTTCTTATCCAACCT-TTCATTCCAGTTTTTAATTAAAAAACTAATGATTATGCTACCTTAGCACGGTCAAAATACCACGGCCATTTAAAA-TCTCAGTGGGCAGGTTAGACCTTAAATTATC???ACACCCACA ; END; BEGIN SETS; CHARSET 16s (CHARACTERS = 16S_Alignment_2) = 1-495; CHARSET 3rdpos (CHARACTERS = 16S_Alignment_2) = ; CHARSET 1stpos (CHARACTERS = 16S_Alignment_2) = ; CHARSET gaps (CHARACTERS = 16S_Alignment_2) = 487-495; CHARSET COII (CHARACTERS = 16S_Alignment_2) = ; CHARSET 2ndpos (CHARACTERS = 16S_Alignment_2) = ; CHARSET 12s (CHARACTERS = 16S_Alignment_2) = ; CHARSET sequence (CHARACTERS = 16S_Alignment_2) = 1-486; END; BEGIN TREES; TITLE Tb5212; LINK TAXA = Taxa2; TRANSLATE 1 Chrysomela_tremula, 2 Oreina_cacaliae, 3 Gonioctena_fornicata, 4 Gonioctena_intermedia, 5 Gonioctena_interpositus_2, 6 Gonioctena_interpositus_1, 7 Gonioctena_pallida_3, 8 Gonioctena_pallida_2, 9 Gonioctena_pallida_1, 10 Gonioctena_quinquepunctata_3, 11 Gonioctena_quinquepunctata_2, 12 Gonioctena_quinquepunctata_1, 13 Gonioctena_holdausi, 14 Gonioctena_rufipes, 15 Gonioctena_linnaeana, 16 Gonioctena_viminalis_2, 17 Gonioctena_viminalis_1, 18 Gonioctena_olivacea_3, 19 Gonioctena_olivacea_2, 20 Gonioctena_olivacea_1, 21 Gonioctena_variabilis_2, 22 Gonioctena_variabilis_1; TREE Fig._1 = [&R] (((((((17,16),13),15),14),(((20,18),19),(22,21))),((((12,(11,10)),4),((9,8),7),6,5),3)),(2,1)); END; BEGIN TREES; TITLE Tb5207; LINK TAXA = Taxa3; TRANSLATE 1 Gonioctena_viminalis, 2 Gonioctena_olivacea, 3 Gonioctena_rufipes, 4 Gonioctena_linnaeana, 5 Gonioctena_variabilis, 6 Gonioctena_fornicata_a, 7 Gonioctena_fornicata_b, 8 Gonioctena_occidentalis, 9 Gonioctena_interposita_1, 10 Gonioctena_interposita_2, 11 Gonioctena_intermedia, 12 Gonioctena_quinquepunctata, 13 Gonioctena_holdausi, 14 Gonioctena_pallida_1, 15 Gonioctena_pallida_2, 16 Gonioctena_tredecimmaculata, 17 Gonioctena_nigroplagiata, 18 Gonioctena_kamikawai, 19 Gonioctena_rubripennis, 20 Oreina_cacaliae, 21 Chrysomela_tremula; TREE Fig._2c = [&R] ((((((1,8),13),(3,4)),18,(16,19)),2,5,(((9,10),14,15),(11,12)),17,(6,7)),(20,21)); END; BEGIN TREES; TITLE Tb5211; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Gonioctena_viminalis, 2 Gonioctena_olivacea, 3 Gonioctena_rufipes, 4 Gonioctena_linnaeana, 5 Gonioctena_variabilis, 6 Gonioctena_fornicata_a, 7 Gonioctena_fornicata_b, 8 Gonioctena_occidentalis, 9 Gonioctena_interposita_1, 10 Gonioctena_interposita_2, 11 Gonioctena_intermedia, 12 Gonioctena_quinquepunctata, 13 Gonioctena_holdausi, 14 Gonioctena_pallida_1, 15 Gonioctena_pallida_2, 16 Gonioctena_tredecimmaculata, 17 Gonioctena_nigroplagiata, 18 Gonioctena_kamikawai, 19 Gonioctena_rubripennis, 20 Oreina_cacaliae, 21 Chrysomela_tremula, 22 Gonioctena_fornicata, 23 Gonioctena_interpositus_2, 24 Gonioctena_interpositus_1, 25 Gonioctena_pallida_3, 26 Gonioctena_quinquepunctata_3, 27 Gonioctena_quinquepunctata_2, 28 Gonioctena_quinquepunctata_1, 29 Gonioctena_viminalis_2, 30 Gonioctena_viminalis_1, 31 Gonioctena_olivacea_3, 32 Gonioctena_olivacea_2, 33 Gonioctena_olivacea_1, 34 Gonioctena_variabilis_2, 35 Gonioctena_variabilis_1; TREE Fig._5 = [&R] ((((((1,13),8),3,4),18,(16,19)),(((2,5),(((9,10),(14,15)),(11,12))),(6,7),17)),(20,21)); END; BEGIN TREES; TITLE Tb5209; LINK TAXA = Taxa3; TRANSLATE 1 Gonioctena_viminalis, 2 Gonioctena_olivacea, 3 Gonioctena_rufipes, 4 Gonioctena_linnaeana, 5 Gonioctena_variabilis, 6 Gonioctena_fornicata_a, 7 Gonioctena_fornicata_b, 8 Gonioctena_occidentalis, 9 Gonioctena_interposita_1, 10 Gonioctena_interposita_2, 11 Gonioctena_intermedia, 12 Gonioctena_quinquepunctata, 13 Gonioctena_holdausi, 14 Gonioctena_pallida_1, 15 Gonioctena_pallida_2, 16 Gonioctena_tredecimmaculata, 17 Gonioctena_nigroplagiata, 18 Gonioctena_kamikawai, 19 Gonioctena_rubripennis, 20 Oreina_cacaliae, 21 Chrysomela_tremula; TREE Fig._2a = [&R] ((((((((((1,13),8),3),4),((18,16),19)),2),(5,((((9,10),14),15),(11,12)))),(6,7)),17),(20,21)); END; BEGIN TREES; TITLE Tb5208; LINK TAXA = Taxa4; TRANSLATE 1 Gonioctena_olivacea, 2 Gonioctena_rufipes, 3 Gonioctena_linnaeana, 4 Gonioctena_variabilis, 5 Gonioctena_fornicata_a, 6 Gonioctena_fornicata_b, 7 Gonioctena_occidentalis, 8 Gonioctena_interposita_1, 9 Gonioctena_interposita_2, 10 Gonioctena_intermedia, 11 Gonioctena_quinquepunctata, 12 Gonioctena_holdausi, 13 Gonioctena_pallida_1, 14 Gonioctena_pallida_2, 15 Gonioctena_tredecimmaculata, 16 Gonioctena_nigroplagiata, 17 Gonioctena_kamikawai, 18 Gonioctena_rubripennis, 19 Oreina_cacaliae, 20 Chrysomela_tremula, 21 Gonioctena_viminalis; TREE Fig._2b = [&R] ((17,((((((21,12),7),2),3),15),((4,1),((((8,9),13,14),(10,11)),(5,6)),16,18))),(19,20)); END; BEGIN TREES; TITLE Tb5206; LINK TAXA = Taxa3; TRANSLATE 1 Gonioctena_viminalis, 2 Gonioctena_olivacea, 3 Gonioctena_rufipes, 4 Gonioctena_linnaeana, 5 Gonioctena_variabilis, 6 Gonioctena_fornicata_a, 7 Gonioctena_fornicata_b, 8 Gonioctena_occidentalis, 9 Gonioctena_interposita_1, 10 Gonioctena_interposita_2, 11 Gonioctena_intermedia, 12 Gonioctena_quinquepunctata, 13 Gonioctena_holdausi, 14 Gonioctena_pallida_1, 15 Gonioctena_pallida_2, 16 Gonioctena_tredecimmaculata, 17 Gonioctena_nigroplagiata, 18 Gonioctena_kamikawai, 19 Gonioctena_rubripennis, 20 Oreina_cacaliae, 21 Chrysomela_tremula; TREE Fig._2d = [&R] (((((((1,13),8),3),4),18,(16,19)),((((5,2),((((9,10)Gonioctena_interposita,14),15),(11,12))),17),(6,7)Gonioctena_Spartomena)),(20,21)); END; BEGIN TREES; TITLE Tb5210; LINK TAXA = Taxa3; TRANSLATE 1 Gonioctena_viminalis, 2 Gonioctena_olivacea, 3 Gonioctena_rufipes, 4 Gonioctena_linnaeana, 5 Gonioctena_variabilis, 6 Gonioctena_fornicata_a, 7 Gonioctena_fornicata_b, 8 Gonioctena_occidentalis, 9 Gonioctena_interposita_1, 10 Gonioctena_interposita_2, 11 Gonioctena_intermedia, 12 Gonioctena_quinquepunctata, 13 Gonioctena_holdausi, 14 Gonioctena_pallida_1, 15 Gonioctena_pallida_2, 16 Gonioctena_tredecimmaculata, 17 Gonioctena_nigroplagiata, 18 Gonioctena_kamikawai, 19 Gonioctena_rubripennis, 20 Oreina_cacaliae, 21 Chrysomela_tremula; TREE Fig._4 = [&R] (((18,(((((1,13),8),3),4)Gonioctena_Gonioctena,(16,19))),((5,2),((9,10,(14,15)Gonioctena_pallida),(11,12))Gonioctena_Goniomena,17,(6,7)Gonioctena_fornicata))Gonioctena,(20,21))Chrysomelidae; END;