#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 20, 2024; 6:05 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Spangler R., Zaitchik B., Russo E., & Kellogg E. 1999. Andropogoneae evolution and generic limits in Sorghum (Poaceae) using ndhF sequences. Systematic Botany, 24(2): 267-281. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S402] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=48; TAXLABELS Andropogon_gerardii Apluda_mutica Arundinella_hirta Arundinella_nepalensis Bothriochloa_bladhii Capillipedium_parviflorum Chionachne_koenigii Chrysopogon_fulvus Chrysopogon_gryllus Cleistachne_sorghoides Coelorachis_selloana Coix_aquatica Coix_lacrymajobi Cymbopogon_commutatus Cymbopogon_flexuosus Cymbopogon_jwarancusa Cymbopogon_pospischilii Danthoniopsis_dinteri Dichanthium_aristatum Elionurus_muticus Heteropogon_contortus Hyparrhenia_hirta Ischaemum_afrum Ischaemum_santapaui Microstegium_nudum Microstegium_vimineum Miscanthus_japonicus Panicum_virgatum Phacelurus_digitatus Rattraya_petiolata Schizachyrium_scoparium Setaria_viridis Sorghastrum_nutans Sorghum_angustum Sorghum_arundinaceum Sorghum_bicolor Sorghum_bulbosum Sorghum_halepense Sorghum_laxiflorum Sorghum_leiocladum Sorghum_macrospermum Sorghum_nitidum Sorghum_stipoideum Sorghum_timorense Sorghum_versicolor Thysanolaena_maxima Tripsacum_dactyloides Zea_mays ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M2096] TITLE aligned_ndhF; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=2124; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Andropogon_gerardii 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Chrysopogon_fulvus 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Cymbopogon_pospischilii 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Danthoniopsis_dinteri 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Elionurus_muticus 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Heteropogon_contortus 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Hyparrhenia_hirta 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Ischaemum_afrum 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Ischaemum_santapaui 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Microstegium_vimineum 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Miscanthus_japonicus 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Panicum_virgatum 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Phacelurus_digitatus 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Rattraya_petiolata 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Schizachyrium_scoparium 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Setaria_viridis 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Sorghum_angustum 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Sorghum_arundinaceum 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Sorghum_bicolor 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Sorghum_bulbosum 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Sorghum_halepense 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Sorghum_laxiflorum 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Sorghum_leiocladum 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Sorghum_macrospermum 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Sorghum_nitidum 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Sorghum_stipoideum 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Sorghum_timorense 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Sorghum_versicolor 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Thysanolaena_maxima 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Tripsacum_dactyloides 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Sorghum_laxiflorum, 11 Sorghum_halepense, 12 Sorghum_bulbosum, 13 Sorghum_angustum, 14 Sorghastrum_nutans, 15 Setaria_viridis, 16 Schizachyrium_scoparium, 17 Rattraya_petiolata, 18 Phacelurus_digitatus, 19 Panicum_virgatum, 20 Miscanthus_japonicus, 21 Microstegium_vimineum, 22 Microstegium_nudum, 23 Ischaemum_santapaui, 24 Ischaemum_afrum, 25 Hyparrhenia_hirta, 26 Heteropogon_contortus, 27 Elionurus_muticus, 28 Dichanthium_aristatum, 29 Danthoniopsis_dinteri, 30 Cymbopogon_commutatus, 31 Cymbopogon_pospischilii, 32 Cymbopogon_jwarancusa, 33 Cymbopogon_flexuosus, 34 Coix_lacrymajobi, 35 Coix_aquatica, 36 Coelorachis_selloana, 37 Cleistachne_sorghoides, 38 Chrysopogon_gryllus, 39 Chrysopogon_fulvus, 40 Chionachne_koenigii, 41 Capillipedium_parviflorum, 42 Bothriochloa_bladhii, 43 Arundinella_nepalensis, 44 Arundinella_hirta, 45 Apluda_mutica, 46 Andropogon_gerardii, 47 Zea_mays, 48 Sorghum_bicolor; TREE Fig._4 = [&R] ((((((((((((((48,11,6),37),((10,7),8)),((((13,12),(5,4)),9),3),22,20),((((((46,25),16),(((42,28),41),26)),(((33,32),31),30)Cymbopogon),(35,34)Coix),14)),(39,38)Chrysopogon,23),24),(((47,1),27),40)),((45,18),21)),36),(44,43)Arundinella),((19,15),17)),29),2); END;