#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 27, 2024; 8:02 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Grubisha L., Trappe J., Molina R., & Spatafora J. 2002. Biology of the ectomycorrhizal genus Rhizopogon. VI. Re-examination of infrageneric relationships inferred from phylogenetic analyses of ITS sequences. Mycologia, 94(4): 607-619. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S831] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=54; TAXLABELS Chroogomphus_vinicolor Gomphidius_glutinosus Rhizopogon_burlinghamii Rhizopogon_colossus Rhizopogon_diabolicus Rhizopogon_ellenae_AHS66137 Rhizopogon_ellenae_JMT17476 Rhizopogon_evadens_AHS65484 Rhizopogon_evadens_JMT12321 Rhizopogon_evadens_JMT16402 Rhizopogon_fuscorubens Rhizopogon_hawkerae Rhizopogon_luteolus Rhizopogon_occidentalis_JMT17564 Rhizopogon_occidentalis_LCG211 Rhizopogon_ochraceisporus_AHS5963 Rhizopogon_ochraceisporus_JMT17916 Rhizopogon_ochraceisporus_JMT17944 Rhizopogon_ochraceorubens_AHS59643 Rhizopogon_ochraceorubens_JMT1912 Rhizopogon_parksii_JMT17679 Rhizopogon_parksii_JMT19446 Rhizopogon_parvulus Rhizopogon_rogersii Rhizopogon_roseolus Rhizopogon_semireticulatus_JMT17562 Rhizopogon_semireticulatus_JMT7899 Rhizopogon_spnov Rhizopogon_subcaerulescens Rhizopogon_subgelatinosus Rhizopogon_subpurpurascens_AHS65669 Rhizopogon_subpurpurascens_JMT19168 Rhizopogon_subsalmonius Rhizopogon_sucossus Rhizopogon_villescens Rhizopogon_villosulus_AHS59143 Rhizopogon_villosulus_JMT19466 Rhizopogon_vinicolor_JMT17899 Rhizopogon_vinicolor_JMT19383 Rhizopogon_vinicolor_JMT20787 Rhizopogon_vulgaris_JMT17998 Rhizopogon_vulgaris_JMT19154 Rhizopogon_zelleri Suillus_americanus Suillus_brevipes Suillus_caerulescens Suillus_cavipes Suillus_granulatus Suillus_grevillei Suillus_lakei Suillus_luteus Suillus_sinuspaulianus Suillus_tomentosus Truncocolumella_citrina ; END; BEGIN CHARACTERS; [! 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ITS) = N: 1-933; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = ITS) = N: 1-933; END; BEGIN TREES; TITLE Tb6137; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Rhizopogon_semireticulatus_JMT7899, 2 Rhizopogon_semireticulatus_JMT17562, 3 Rhizopogon_subgelatinosus, 4 Rhizopogon_subpurpurascens_JMT19168, 5 Rhizopogon_subpurpurascens_AHS65669, 6 Rhizopogon_ellenae_JMT17476, 7 Rhizopogon_ellenae_AHS66137, 8 Rhizopogon_subcaerulescens, 9 Rhizopogon_ochraceisporus_JMT17944, 10 Rhizopogon_ochraceisporus_JMT17916, 11 Rhizopogon_ochraceisporus_AHS5963, 12 Rhizopogon_vinicolor_JMT20787, 13 Rhizopogon_vinicolor_JMT17899, 14 Rhizopogon_parvulus, 15 Rhizopogon_diabolicus, 16 Rhizopogon_villescens, 17 Rhizopogon_zelleri, 18 Rhizopogon_vinicolor_JMT19383, 19 Rhizopogon_spnov, 20 Rhizopogon_rogersii, 21 Rhizopogon_villosulus_JMT19466, 22 Rhizopogon_villosulus_AHS59143, 23 Rhizopogon_parksii_JMT19446, 24 Rhizopogon_parksii_JMT17679, 25 Rhizopogon_hawkerae, 26 Rhizopogon_colossus, 27 Rhizopogon_vulgaris_JMT19154, 28 Rhizopogon_vulgaris_JMT17998, 29 Rhizopogon_roseolus, 30 Rhizopogon_burlinghamii, 31 Rhizopogon_luteolus, 32 Rhizopogon_sucossus, 33 Rhizopogon_occidentalis_JMT17564, 34 Rhizopogon_occidentalis_LCG211, 35 Rhizopogon_ochraceorubens_AHS59643, 36 Rhizopogon_ochraceorubens_JMT1912, 37 Rhizopogon_fuscorubens, 38 Rhizopogon_subsalmonius, 39 Rhizopogon_evadens_JMT12321, 40 Rhizopogon_evadens_JMT16402, 41 Rhizopogon_evadens_AHS65484, 42 Truncocolumella_citrina, 43 Gomphidius_glutinosus, 44 Chroogomphus_vinicolor, 45 Suillus_sinuspaulianus, 46 Suillus_lakei, 47 Suillus_caerulescens, 48 Suillus_cavipes, 49 Suillus_grevillei, 50 Suillus_granulatus, 51 Suillus_americanus, 52 Suillus_tomentosus, 53 Suillus_luteus, 54 Suillus_brevipes; TREE Fig._2 = [&R] (((((((((54,53),(52,49)),(50,(47,46))),45),48),51)Suillus,((((41,(40,39)),38)Rhizopogon_subg._Versicolores,(37,(((36,35),(34,33)),(32,31)))Rhizopogon_subg._Rhizopogon),((((30,29),(28,27))Rhizopogon_subg._Roseolus,((((((26,21),20),(25,(22,16))),17),(24,23)),(19,(18,(((15,14),13,(12,11)),(10,9)))))Rhizopogon_subg._Villosuli),((8,(3,1)),(7,6,2),(5,4))Rhizopogon_subg._Amylopogon))Rhizopogon),42),43,44); END;