#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on April 25, 2024; 6:53 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Sede S., Zuloaga F., & Morrone O. 2009. Phylogenetic Studies in the Paniceae (Poaceae-Panicoideae): Ocellochloa, a new genus from the New World. Systematic Botany, 34(4): 684-692. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S9951] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=140; TAXLABELS Acroceras_zizanioides Altoparadisium_chapadense Andropogon_gerardii Anthaenantia_lanata Anthaenantiopsis_rojasiana Apochloa_euprepes Apochloa_subtiramulosa Arthropogon_villosus Arundinella_hirta Axonopus_anceps Bothriochloa_bladhii Canastra_lanceolata Cenchrus_ciliaris Chaetium_bromoides Chasmanthium_laxum_sessiliflorum Chionachne_koenigii Cymbopogon_flexuosus Cyphonanthus_discrepans Danthoniopsis_dinteri Dichanthelium_acuminatum Dichanthelium_clandestinum Dichanthelium_cumbucana Dichanthelium_koolauense Dichanthelium_sabulorum Digitaria_setigera Echinochloa_colona Echinolaena_inflexa Echinolaena_minarum Echinolaena_minarum_b Echinolaena_standleyi Eriochloa_punctata Homolepis_glutinosa Hopia_obtusa Hymenachne_donacifolia Hymenachne_grumosa Hymenachne_pernambucense Ichnanthus_pallens Lasiacis_sorghoidea Megathyrsus_maximus Melinis_repens Mesosetum_chaseae Moorochloa_eruciformis Ophiochloa_hydrolithica Oplismenopsis_najada Oplismenus_hirtellus Otachyrium_versicolor Panicum_adenophorum Panicum_anceps Panicum_antidotale Panicum_aquaticum Panicum_bergii Panicum_biglandulare Panicum_caricoides Panicum_cervicatum Panicum_chapadense Panicum_chloroleucum Panicum_claytonii Panicum_crateriferum Panicum_cyanescens Panicum_dichotomiflorum Panicum_elephantipes Panicum_fauriei Panicum_gouinii Panicum_hylaeicum Panicum_irregulare Panicum_latissimum Panicum_mertensii Panicum_miliaceum Panicum_millegrana Panicum_mistasypus Panicum_nephelophilum Panicum_olyroides Panicum_parvifolium Panicum_pedersenii Panicum_petersonii Panicum_piauiense Panicum_pilosum Panicum_prionitis Panicum_pulchellum Panicum_pulchellum_b Panicum_racemosum Panicum_repens Panicum_rigidulum Panicum_rude Panicum_rude_b Panicum_rudgei Panicum_schwackeanum Panicum_sellowii Panicum_stenodes Panicum_stoloniferum Panicum_stoloniferum_b Panicum_stramineum Panicum_tenerum Panicum_trichanthum Panicum_tricholaenoides Panicum_tuerckheimii Panicum_validum Panicum_venezuelae Panicum_venezuelae_b Panicum_verrucosum Panicum_virgatum Panicum_wettsteinii Parodiophyllochloa_cordovensis Parodiophyllochloa_missiona Parodiophyllochloa_ovulifera Parodiophyllochloa_penicillata Paspalidium_geminatum Paspalum_arundinellum Paspalum_conjugatum Paspalum_glaziovii Paspalum_remotum Paspalum_vaginatum Pennisetum_alopecuroides Pennisetum_setaceum Phacelurus_digitatus Phanopyrum_gymnocarpon Plagiantha_tenella Pseudechinolaena_polystachya Renvoizea_sacciolepoidea Renvoizea_trinii Sacciolepis_indica Setaria_lachnea Setaria_macrostachya Setaria_palmifolia Setaria_viridis Sorghum_bicolor Steinchisma_decipiens Steinchisma_hians Steinchisma_laxa Steinchisma_spathellosa Stenotaphrum_secundatum Streptostachys_asperifolia Streptostachys_ramosa Tatianyx_arnacites Thysanolaena_maxima Urochloa_acuminata Urochloa_plantaginea Zea_mays Zeugites_pittieri Zuloagaea_bulbosa ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M4298] TITLE Paniceae_ndhF; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=2061; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Apochloa_subtiramulosa 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Bothriochloa_bladhii 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Canastra_lanceolata 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Cenchrus_ciliaris 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Chasmanthium_laxum_sessiliflorum 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Chionachne_koenigii 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Cymbopogon_flexuosus 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Cyphonanthus_discrepans 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Danthoniopsis_dinteri 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Dichanthelium_acuminatum ??????????????????????????????????????????????????TCGTCGCATATGGGCTTTTCCTAGTATTTTACTCTTAAGTATAGCTCTGGTATTCTCAGTTCACCTGTCTATTCAACAAATAAATGGAAGTTCTATCTATCAATATCTATGGTCTTGGACCATCAATAATGATTTTTCCTTAGAATTTGGATACTTGATCGACCCCCTTACGTCTATTATGTTACTACTAATTACTACTGTAGGAATCTTGGTTCTTATTTATAGTGACGGTTATATGTCTCACGATGAAGGATATTTGAGATTTTTTGTTTATATAAGTTTTTTTAATACTGCCATGTTGGGATTGGTTACTAGTTCCAATTTGATACAAATTTATTTTTTTTGGGAACTTGTCGGAATGTGTTCCTATTTATTGATAGGCTTCTGGTTTACACGGCCAATTGCAGCGAGTGCTTGCCAAAAAGC???????????????????????????TGGTCTGTTATTAGGAATTTTAGGTTTTTTTTGGATAACGGGTAGTTTAGAGTTTCGGGATTTGTTCAAAATAGCTAATAACTGGATTCCTAATAATGGGGTTAATTCCTTACTTACTACTTTGTGTGCTTTTTTATTATTCCTTGGTGCAGTTGCAAAATCTGCACAATTCCCTCTTCACGTATGGTTACCCGATGCTATGGAAGGACCCACTCCCATTTCGGCTCTTATACACGCAGCAACTATGGTTGCTGCGGGGATTTTTCTTCTAGCTCGACTTCTTCCTCTTTTCATATCCCTACCCTTGATAATGAGTTTTATTTCTTTAGTAGGTACAATAACGCTCTTCTTAGGAGCCACTTTAGCTCTTGCTCAGAGAGATATTAAAAGAAGCTTAGCCTATTCTACAATGTCTCAATTGGGTTATATGATGTTAGCTCTAGGTATAGGTTCTTATCAAGCTGCTTTATTCCATTTGATCACTCATGCTTATTCGAAAGCTTTATTGTTCTTAGGATCCGGATCCGTTATTCATTCAATGGAACCTCTTGTTGGATATTCACCAGATAAAAGTCAGAATATGGTTCTTATGGGTGGTTTAAGAAAATACGTTCCAATTACAAGAACTGCTTTTTTATGTGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCACCTCTTGCTTGCTTCTGGTCCAAAGATGAAATCCTTAGTAATAGTTGGTTGTATTCACCCTTTTTTGGAATTATAGCCTCTTTTACTGCAGGATTAACTGCATTTTATATGTTTCGGATATATTTACTTACTTTTGATGGGTATTTGCGTGTTCATTTTCAAAATTACAGCAGTACTAAAGAAGGTTCGTTGTATTCAATATCCTTATGGGGAAAAGGCATATCCAAAGGACTTAATAGGAATTTTGTTTTATCAACAATGAAGAGTAGAGTTTCTTTTTTTTCACAAAATACACC??????CAAAATTCCTGGTAATACAAGAAATAAGATAGGATCCTTTAGTACTCCC??????TTTGGGGCTAAAAACACTTTTGTTTATCCTCATGAAACGGGAAATACTATGCAATTTCCTCTTCTTATATTACTGCTTTTTACTTTGTTCATTGGATCCATAGGAATTCATTTTGATAATGGAATAAAGCGTAATGGAATATCGGAGTTAACCATATTATCAAAGTGGCTAACTCCTTCAATAAACTTTTTCCAGGAAAGTTCTAATTCTTCCATAAATTCATATGAATTTCTCACTAATGCAATTTCTTCTGTAAGTTTAGCAATTTTTGGTCTATTCATAGCATATATCTTCTATGGATCTACTTATTCTTTTTTTCAGAATTTAAATTTTCTAAATTCCCTTGT??????AAAAAGGAATCCAAAAAAGAACTTTTTGGATGAAGTAAAAAAAAATATATACAGTTGGTCATATAATCGTGGTTATATAGATGTTTTCTATACTAGGGTCTTTATCTTGGGTATAAGAAGATTAGCTGAACTAACGCATTTTTTCGATAAGAGTGTCATTGATGGAATTACCAATGGAGTA Dichanthelium_clandestinum 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Dichanthelium_koolauense 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Eriochloa_punctata 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Homolepis_glutinosa 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Hopia_obtusa 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Hymenachne_donacifolia 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Hymenachne_grumosa 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Hymenachne_pernambucense 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Ichnanthus_pallens 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Lasiacis_sorghoidea 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Megathyrsus_maximus 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Melinis_repens 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Mesosetum_chaseae 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Moorochloa_eruciformis 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Ophiochloa_hydrolithica 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Oplismenopsis_najada 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Otachyrium_versicolor 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Panicum_adenophorum 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Panicum_antidotale 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Panicum_aquaticum 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Panicum_bergii 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Panicum_biglandulare 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Panicum_caricoides 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Panicum_cervicatum 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Panicum_chapadense 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Panicum_chloroleucum 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Panicum_claytonii 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Panicum_crateriferum 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Panicum_cyanescens 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Panicum_dichotomiflorum 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Panicum_elephantipes 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Panicum_fauriei 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Panicum_gouinii 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Panicum_hylaeicum 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Panicum_irregulare 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Panicum_latissimum 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Panicum_mertensii 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Panicum_miliaceum 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Panicum_millegrana 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Panicum_mistasypus 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Panicum_nephelophilum 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Panicum_sellowii 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Panicum_stenodes 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Panicum_stoloniferum 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Panicum_stoloniferum_b 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Panicum_stramineum 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Panicum_tenerum 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Panicum_trichanthum 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Panicum_tricholaenoides 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Panicum_tuerckheimii 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Panicum_verrucosum 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Paspalum_arundinellum 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Paspalum_vaginatum 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Pennisetum_alopecuroides 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Pennisetum_setaceum 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Phacelurus_digitatus 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Phanopyrum_gymnocarpon 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Renvoizea_sacciolepoidea 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Renvoizea_trinii 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Sacciolepis_indica 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Setaria_lachnea ATGTCAATGGGATTTGGACTTTTTATTATTCCGACAGCAACAAAAAATCTTCGTCGCATATGGGCTTTTCCTAGTATTTTACTCTTAAGTATAGCTCTGGTATTCTCAGTTCACCTGTCTATTCAACAAATAAATGGAAGTTCCATCTATCAATATCTATGGTCTTGGACCATCAATAACGATTTTTCTTTAGAATTTGGATACTTGATCGACCCCCTTACGTCTATTATGTTAATACTAATTACTACTGTAGGAATCTTGGTTCTTATTTATAGTGACGATTATATGTCTCACGATGAAGGATATTTGAGATTTTTTGTTTATATAAGTTTTTTTACTACTGCCATGTTGGGGTTGGTTACTAGTTCCAATTTGATACAAATTTATTTTTTTTGGGAACTTGTCGGAATGTGTTCCTATTTATTGATAGGCTTTTGGTTTACACGGCCAATTGCAGCGAGGGCTTGCCAAAAAGCTTTTGTAACTAAT?GTGTAGGGGATTTTGGTCTGTTATTAGGAATCTTAGGTTTTTTTTGGATAACGGGTAGTTTAGAGTTTCGAGATTTGTTCAAAATAGCTAATAACTGGATTCCTAATAATGGGATTAATTCCTTACTTACTACTTTGTGTGCTTTTTTATTATTCCTTGGTGCAGTTGCAAAATCCGCACAATTCCCTCTTCACGTATGGTTACCCGATGCTATGGAAGGACCCACTCCCATTTCGGCT?TTATACACGCAGCAACTATGGTTGCTGCGGGGATTTTTCTTGTAGCTCGACTTTTTCCTCTTTTCATATCCCTACCCTTGATAATGAGTTTTATTTCTTTAGTAGGTACAATAACACTCTTCTTAGGAGCCACTTTAGCTCTTGCTCAGAGAGATATTAAAAGAAGCTTAGCCTATTCTACAATGTCTCAATTGGGTTATATGATGTTAGCTCTCGGTATAGGTTCTTATGAAGCTGCTTTATTCCATTTGATCACTCATGCTTATTCGAAAGCTTTATTGTTCTTAGGATCCGGATCCGTTATTCATTCAATGGAACCTCTTGTTGGATATTCACCAGATAAAAGTCAGAATATGGTTCTTATGGGTGGTTTAAGAAAATACGTTCCAATTACAAGAACTACTTTTTTATGTGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCACCTCTTGCTTGCTTCTGGTCCAAAGATGAAATCCTTAGTAATAGCTGGTTGTATTCACCTTTTTTTGGAATAATAGCCTCTTTTACTGCAGGATTAACTGCATTTTATATGTTTCGGATATATTTACTTACTTTTGATGGGTATTTGCGTGTTCATTTTCAAAATTACAGCAGTACTAAAGAAGGTTCGTTGTATTCAATATCCTTATGGGGAAAAGGCATATCCAAAGGAGTCAATAGAGATTTTGTTTTATCAACAATGAAGGGTGGAGTTTCTTTTTTTTCACAAAATATACC??????CAAAATTCCTGGTAATACAAGAAATAAGATAGGATCCTTTAGTACTCCC??????TTTGGGGCTAAAAACACTTTTGTCTATCCTCATGAAACGGGAAATACTATGCTATTTCCTCTTCTTATATTACTGCTTTTTACTTTGTTCATTGGATCCATAGGAATCCATTTTGATAATGGAATAAAGGGTAATGGAATATCGGAATTAACCATATTATCAAAGTGGCTAACTCCTTCAATAAACTTTTTCCAGGAAAGTTCTAATTCTTCCATAAATTCATATGAATTTCTCATTAATGCAATTTCTTCTGTAAGTTTAGCAATTCTTGGTCTATTCATAGCATATATCTTCTATGGATCTACTTATTCTTTTTTTCAGAATTTGAATTTTCTAAATTCCCTTGT??????AAAAGGGAATCCAAAAAAAAACTTTTTGGATCAAGTAAAAGAAAAGATATACAGCTGGTCATATAATCGTGGTTATATAGATGTTTTCTATACTAGGGTCTTTATCTTGGGTATAAGAAGATTAGCCGAACTAACGAATTTTTTCGATAAGGGTGTTATTGATGGAATTATCAATGGAGTA Setaria_macrostachya 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Setaria_palmifolia ATGTCAATGGGATTTGGACTTTTTCTTATTCCGACAGCAACAAAAAATCTTCGTCGCATATGGGCTTTTCCTAGTATTTTACTCTTAAGTATAGCTCTGGTATTCTCAGTTCACCTGTCTATTCAACAAATAAATGGAAGTTCTATCTATCAATATCTATGGTCTTGGACCATCAATAACGATTTTTCTTTAGAATTTGGATACTTGATCGACCCCCTTACGTCTATTATGTTAATACTAATTACTACTGTAGGAATCTTGGTTCTTATTTATAGTGACGATTATATGTCTCACGATGAAGGATATTTGAGATTTTTTGTTTATATAAGTTTTTTTAATACTGCCATGTTGGGATTGGTTACTAGTTCCAATTTGATACAAATTTATTTTTTTTGGGAACTTGTCGGAATGTGTTCCTATTTATTGATAGGCTTTTGGTTTACACGGCCAATTGCAGCGAGTGCTTGCCAAAA?GCTTTTGTAACTAATCGTGTAAGGGATTT?GGTCTGTTATTACGAATTTTAGGTTTTTTTTGGATAACGGGTAGTTTAAAGTTTCGGGATTTGTTCAAAATAGCTAATAACTGGATTCCTAATAATGGGATTAATTCTTTACTTACTACTTTGTGTGCTTTTTTATTATTCCTTGGTGCAGTTGCAAAATCCGCACAATTCCCTCTTCACGTATGGTTACCCGATGCTATGGAAGGACCCACTCCCATTTCGGCTCTTATACACGCAGCAACTATGGTTGCTGCGGGGATTTTTCTTCTAGCTCGACTTCTTCCTCTTTTCATATCCCTACCCTTAATAATGAGTTTTATTTCTTTAGTAGGTACAATAACACTCTTCTTAGGAGCCACTTTAGCTCTTGCTCAGAGAGATATTAAAAAAAGCTTAGCCTATTCTACAATGTCTCAATTGGGTTATATGATGTTAGCTCTCGGTATAGGTTCTTATGAAGCTGCTTTATTCCATTTGATCACTCATGCTTATTCGAAAGCTTTATTGTTCTTAGGATCCGGATCCGTTATTCATTCAATGGAACCTCTTGTTGGATATTCACCAGATAAAAGTCAGAATATGGTTCTTATGGGTGGTTTAAGAAAATACGTTCCAATTACAAGAACTACTTTTTTATGTGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCACCTCTTGCTTGCTTCTGGTCCAAAGATGAAATCCTTAGTAATAGCTGGTTGTATTCACCTTTTTTTGGAATAATAGCCTCTTTTACTGCAGGATTAACAGCATTTTATATGTTTCGGATAT?TTTACTTACTTTTGATGGGTATTTGCGTGTTCATTTTCAGAATTACAGCAGTACTAAAAAAGGTTCGTTGTATTCAATATCCTTATGGGGAAAAGGCATATCCAAAGGA?TCAATAGAGATTTGATTTTATCAGCAATGAAGGGTGGAGTTTCTTTTTTTTCACAAAATATACC??????CAAAATTCCTGGTAATACAAGAAAAAAGATAGGATCCTTTAGTACTTCC??????TTTGGGGCTAAAAACACTTTTGTCTATCCTCATGAAACGGGAAATACTATGCTATTTCCTCTTCTTATATTACTGCTTTTTACTTTGTTCATTGGATCCATAGGAATCCATTTTGATAATGGAATAAAGGTTAATGGAATATCGGAGTTAACCATATTATCAAAGTGGCTAACTCCTTCAATAAACTTTTTTGAGGAAAGTTCGAATTCTTCCATAAATTCATATGAATTTCTCATTAATGCAATTTCTTCTGTAAGTTTAGCAATTCTTGGTCTATTCATAGCATATATCTTCTATGGATCTACTTATTCTTTTTTTCAGAATTTGAATTTTCTAAATTCCCTTTT??????ACAAGGGAATCCAAAAAAAAACTTTATGGATCAAGTAAAAGAAAAGATATACAGCTGGTCATATAATCGTGGTTATATAGATGTTTTCTATACTAGGGTCTTTATCTTGGGTATAAGAAGATTAGCCGAACTAACAAATTTTTTCGATAAGGGTGTTATTGATGGAATTATCAATGGAGTA Setaria_viridis ATGTCAATGGGATTTGGACTTTTTCTTATTCCGACAGCAACAAAAAATCTTCGTCGCATATGGGCTTTTCCTAGTATTTTACTCTTAAGTATAGCTCTGGTATTCTCAGTTCACCTGTCTATTCAACAAATAAATGGAAGTTCTATCTATCAATATCTATGGTCTTGGACCATCAATAACGATTTTTCTTTAGAATTTGGATACTTGATCGACCCCCTTACGTCTATTATGTTAATACTAATTACTACTGTAGGAATCTTGGTTCTTATTTATAGTGACGATTATATGTCTCACGATGAAGGATATTTGAGATTTTTTGTTTATATAAGTTTTTTTAATACTGCCATGTTGGGGTTGGTTACTAGTTCCAATTTGATACAAATTTATTTTTTTTGGGAACTTGTCGGAATGTGTTCCTATTTATTGATAGGCTTTTGGTTTACACGGCCAATTGCAGCGAGTGCTTGCCAAAAAGCTTTTGTAACTAATCGTGTAGGGGATTTTGGTCTGTTATTAGGAATTTTAGGTTTTTTTTGGATAACGGGTAGTTTAGAGTTTCGGGATTTGTTCAAAATAGCTAATAACTGGATTCCTAATAATGGGATTAATTCCTTACTTACTACTTTGTGTGCTTTTTTATTATTCCTTGGTGCAGTTGCAAAATCCGCACAATTCCCTCTTCACGTATGGTTACCCGATGCTATGGAAGGACCCACTCCCATTTCGGCTCTTATACACGCAGCAACTATGGTTGCTGC???AGTTTTTCTTGTAGCTCGACTTTTTCCTCTTTTCATATCCCTACCCTTGATAATGAATTTTATTTCTTTAGTAGGTACAGTAACACTCTTCTTAGGAGCCACTTTAGCTCTTGCTCAGAGAGATATTAAAAGAAGCTTAGCCTATTCTACAATGTCTCAATTGGGTTATATGATGTTAGCTCTCGGTATAGGTTCTTATGAAGCTGCTTTATTCCATTTGATCACTCATGCTTATTCGAAAGCTTTATTGTTCTTAGGATCTGGATCCGTTATTCATTCAATGGAACCTCTTGTTGGATATTCACCAGATAAAAGTCAGAATATGGTTCTTATGGGTGGTTTAAGAAAATACGTTCCAATTACAAGAACTACTTTTTTATGTGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCACCTCTTGCTTGCTTCTGGTCCAAAGATGAAATCCTTAGTAATAGCTGGTTGTATTCACCCTTTTTTGGAATAATAGCCTCTTTTACTGCAGGATTAACTGCATTTTATATGTTTCGGATATATTTACTTACTTTTGATGGGTATTTGCGTGTTCATTTTCAAAATTACAGCAGTACTAAAGAGGGTTCGTTGTATTCAATATCCTTATGGGGAAAAAGCATATCCAAAGGAGTCAATAGAGATTTTGTTTTATCAACAATGAAGGGTGGAGTTTCTTTTTTTTCACAAAATATACC??????CCAAATTCCTGGTAATACAAGAAATAAGATAGGATCCTTTAGTACTCCC??????TTTGGGGCTAAAAACACTTTTGTCTATCCTCATGAAACGGGAAATACTATGCTATTTCCTCTTCTTATATTACTGCTTTTTACTTTGTTCATTGGATCTATAGGAATCCATTTTGATAATGGAATAAAGGGTAATGAAATATCGGAGTTAACCATATTATCAAAGTGGCTAACTCCTTCAATAAACTTGTTCCAGGAAAGTTCTAATTCTTCCATAAATTCATATGAATTTCTCATTAATGCAATTTCTTCTGTAAGTTTAGCAATTCTTGGTCTATTCATAGCATATATCTTCTATGGATCTACTTATTCTTTTTTTCAGAATTTGAATTTTCTAAATTCCCTTGT??????AAAAGGGAATCCAAAAAAGACTTTTTTGGATCAAGTAAAAGAAAAGATATACAGCTGGTCATATAATCGTGGTTATATAGATGTTTTCTATACTAGGGTCTTTATCTTGGGTACAAGAAGATTAGCCGAACTAACGAATTTTTTCGATAAGAGTGTTATTGATGGAATTATCAATGGAGTA Sorghum_bicolor 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Steinchisma_decipiens 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Steinchisma_hians 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Urochloa_acuminata ATGTCAATGGGATTTGGACTTTTTCTTATTCCGACAGCAACAAAAAATCTTCGTCGCATATGGGCTTTTCCTAGTATTTTACTCTTAAGTATAGCTCTGGTATTCTCAGTTCACTTGTCTATTCAACAAATAAATGGAAGTTCTATCTATCAATATCTATGGTCTTGGACCATCAATAACGATTTTTCCTTAGAATTTGGATACTTGATCGACCCCCTTACGTCTATTATGTTAATACTAATTACTACTGTAGGAATCTTGGTTCTTATTTATAGTGACGATTATATGTCTCACGATGAAGGATATTTGAGATTTTTTGTTTATATAAGTTTTTTTAATACTGCCATGTTGGGATTGGTTACTAGTTCCAATTTGATACAAATTTATTTTTTTTGGGAACTTGTCGGAATGTGTTCCTATTTATTGATAGGCTTTTGGTTTACACGACCAATTGCAGCGAGTGCTTGCCAAAAAGCTTTTGTAACTAAT?GTGTAGGGGATTTTGGTCTGTTATTAGGAATTTTAGGTTTTTTTTGGATAACGGGTAGTTTAGAGTTTCGGGATTTGTTCAAAATAGCTAATAACTGGATTCCTAATAATGGAATTAATTCCTTACTTACTACTTTGTGTGCTTTTTTATTATTCCTTGGTGCAGTTGCAAAATCTGCACAATTCCCTCTTCACGTATGGTTACCCGATGCTATGGAAGGACCCACTCCCATTTCTGCTCTTATACACGCAGCAACTATGGTTGCTGCGGGGATTTTTCTTCTAGCTCGACTTCTTCCTCTTTTCATATCCCTACCCTTGATAATGAGTTTTATTTCTTTAGTAGGTACAATAACACTCTTCTTAGGAGCCACTTTAGCTCTTGCTCAGAGAAATATTAAAAGAAGCTTAGCCTATTCTACAATGTCTCAATTGGGTTATAAGAGG?TAG?T?TAGGTATAGGTTCTTATGAAGCTGCTTTATTCCATTTGATCACTCATGCTTATTCGAAAGCTTTATTGTTCTTAGGATCCGGATCCATTATTCATTCAATGGAACCTCTTGTTGGATATTCACCAGATAAAAGTCAGAATATGGTTCTTATGGGTGGTTTAAGAAAATACGTTCCAATTACAAGAACTACTTTTTTATGTGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCACCTCTTGCTTGCTTCTGGTCCAAAGATGAAATTCTTAGTAATAGTTGGTTATATTCACCTTTTTTTGGAATAATAGCCTCTTTTACTGCAGGATTAACAGCATTTTATATGTTTT????????????????????????????????CGTGTTCATTTTCAAAATTACAGCAGTACTAAAGAAGGTTCGTTGTATTCAATATCCTTATGGGGAAAAGGCATATCCAAAGGAGTCAATAGGGATTTTGTTTTATCAACAATGAAGGGTGGAGTTTCTTTTTTTTCACAAAATATACC??????CAAAATTCCTGATAATACAAGAAATAAGATAGGATCCTTTAGTACTCCC??????TTTGGGGCTAAAAACACTTTTGTCTATCCTCATGAAACGGGAAATACTATGTTATTTCCTCTTCTTATATTACTGCTTTTTACTTTGTTCATTGGATCCATAGGAATCCATTTTGATAATGGAATAAAGGGTAATGGAATATCGGAGTTAACCATATTATCAAAGTGGCTAACTCCTTCAATAAACTTTTTCCAGGAAAGTTCTAATTCTTCCATAAATTCATATGAATTTCTCATTAATGCAATTTCTTCTGTAAGTTTAGCAATTCTTGGTCTATTCATAGCATATATCTTCTATGGATCTACTTATTCTTTTTTTCAGAATTTAAATTTTCTAAATTCCCTTGT??????AAAAGGGAACCAAAAAAAGAACTTTTTGGATGAAGTAAAAGAAAAGATATACAGCTGGTCATATAATCGCGGTTATATAGATGTTTTCTATACTAGGGTTTTTATCTTGGGTATAAGAAGATTAGCCGAACTAACGAATTTTTTCGATAAGGGTGTCATTGATGGAATTACCAATGGAGTA 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Zea_mays ATGTCAATGGGATTTGGACTTTTTCTTATTCCTACAGCAACAAAAAATCTTCGTCGTATATGGGCTTTTCCTAGTATTTTACTCTTAAGTATAGCTATGGTATTCTCACTTCACCTGTCTATTCAACAAATAAATGGAAGTTCTATCTATCAATATCTATGGTCTTGGACCATCAATAATGATTTTTCCTTAGAATTTGGATACTTGGTCGACCCCCTTACGTCTATTATGTTAATACTAATTACTACTGTAGGAATCTTAGTTCTTATTTATAGTGACGATTATATGTCTCACGATGAAGGATATTTGAGATTTTTTGTTTATATAAGTTTTTTTAATACTTCCATGTTAGGATTGGTTACTAGTTCCAATTTGATACAAATTTATTTTTTTTGGGAACTTGTCGGAATGTGTTCCTATTTATTGATAGGCTTTTGGTTTACGCGGCCAATTGCAGCGAGTGCTTGTCAAAAAGCTTTTGTAACTAATCGTGTAGGGGATTTTGGTCTGTTATTAGGAATTTTAGGTTTTTTTTGGATAACGGGTAGTTTGGAGTTTCGGGATTTGTTCAAAATAGCTAATAACTGGATTCCTAATAATGGGATTAATTCCTTACTTACTACTTTGTGTGCTTTTTTATTATTCCTTGGTGCAGTTGCAAAATCTGCACAATTTCCTCTTCACGTATGGTTACCTGATGCTATGGAAGGACCCACTCCTATTTCGGCTCTTATACACGCAGC???TATGGTTGCTGCGGGGATTTTTCTTCTAGCTAGACTTCTTCCTCTTTTCATATCCCTACCCTTGATAATGAGTTTCATTTCTTTAATAGGTACAATAACACTCTTCTTAGGAGCCACTTTAGCTCTTGCTCAGAGAGATATTAAAAGAAGCTTAGCCTATTCTACAATGTCTCAATTGGGTTATATGATGTTAGCTCTAGGTATAGGTTCTTATCAAGCTGCTTTATTCCATTTGATCACTCATGCTTATTCGAAAGCTTTATTGTTCTTAGGATCCGGATCCGTTATTCATTCAATGGAACCTCTTGTTGGATATTCACCAGATAAAAGTCAGAATATGGTTCTTATGGGTGGTTTAAGAAAATACGTTCCAATTACAAGAACTACTTTTTTATGTGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCACCTCTTGCTTGCTTCTGGTCCAAAGATGAAATCCTTAGTAATAGTTGGTTGTATTCACCCTTTTTTGGAATAATAGCCTCTTTTACTGCAGGATTAACTGCATTTTATATGTTTCGGATATATTTACTTACTTTTGATGGGTATTTGCGTGTTCATTTTCAAAATTACAGTAGTACTAAAGAAGGTTCGTTGTATTCAATATCCTTATGGGGAAAAAGTATATCCAAAGGAGTCAATAGGGATTTTGTTTTATCAACAATGAAGAGTGGAGTTTCTTTTTTTTCACAAAATATACC??????AAAAATTCCTGCTAATACAAGAAATAAGATAGGATCCTTTAGTACTCCC??????TTTGGGGCTAAAAATACTTTTGTCTATCCTCATGAAACGGGAAATACTATGCTATTTCCTCTTCTTATATTACTACTTTTTACTTTGTTCATTGGATCCATAGGAATCCATTTTGATAATGGAGTAAAGGATAATGGAATATTGGAGTTAACCATATTATCAAAGTGGCTAACTCCTTCAATAAACTTGTTCCAGGAAAATTCTAATTCTTCCATAAATTCATATGAATTTCTCACTAATGCAATTTCTTCTGTAAGTTTAGCAATTTTTGGTCTATTCATAGCATATATCTTTTATGGATCTGCTTATTCTTTTTTTCAGAATTTGAATTTTCAAAATTCCCTTGT??????AAAAAAGAATCCAAAAAAGAGCTTTTTGGATGAAGTAAAAAAAAAGATATACAGCTGGTCATATAATCGTGGTTATATAGATTTTTTCTATACTAGGGTTTTTATCCTAGGTATAAGAAGATTAGCCGAACTAACGCATTTTTTTGATAAAGGTGTCATTGATGGAATTACCAATGGAGTA Zeugites_pittieri ATGTCAATGGGATTTGGACTTTTTCTTATTCCGACAGCAACAAAAAATCTTCGTCGCATATGGGCTTTTCCTAGTGTTTTACTCTTAAGTATAGCTATGGTATTCTCAGTTCACCTGTCTATTCAACAAATAAATGGAAGTTCTATCTATCAATATCTATGGTCTTGGACCATCAATAATGATTTTTCCTTAGAATTTGGATACTTGATCGACCCGCTTACTTCTATTATGTTAATACTAATTACTACTGTAGGAATCTTGGTTCTTATTTATAGTGACGATTATATGTCTCACGATGAAGGATATTTGAGATTTTTTGTTTATATAAGTTTTTTTAATACTTCCATGTTGGGATTGGTTACTAGTTCCAATTTGATACAAATTTATTTTTTTTGGGAACTTGTCGGAATGTGTTCCTATTTATTGATAGGCTTTTGGTTTACACGGCCAATTGCAGCGAGTGCTTGTCAAAAAGCTTTTGTAACTAATCGTGTAGGGGATTTTGGTCTGTTATTAGGAATTTTAGGTTTTTTTTGGATAACAGGTAGTTTAGAGTTTCGGGATTTGTTCAAAATAGCTAATAACTGGATTCCTAATACTGGTATTAATTCCTTACTTACTACTTTGTTTGCTTTTTTATTATTCCTTGGTGCAGTTGCAAAATCTGCACAATTCCCTCTTCACGTATGGTTACCCGATGCTATGGAAGGACCCACTCCCATTTCGGCTCTTATACACGCA???ACTATGGTTGCTGCGGGTATTTTTCTTGTAGCTCGACTTCTTCCTCTTTTCATATCTCTACCTTTGATAATGAGCTTCATTTCTTTAGTAGGTACAGTAACACTCTTCTTAGGAGCCACTTTAGCTCTTGCTCAGAGAGATATTAAAAGAAGCTTAGCCTATTCTACAATGTCTCAATTGGGTTATATGATGTTAGCTCTAGGTATAGGTTCTTATCAAGCTGCTTTATTCCATTTGATCACTCATGCTTATTCGAAAGCTTTATTGTTCTTGGGATCCGGGTCCATTATTCATTCGATGGAACCTCTTGTTGGATATTCGCCAGATAAAAGTCAGAATATGGTTCTTATGGGTGGTTTAAGAAAATACGTTCCAATTACAAGAACTACTTTTTTATGCGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCACCTCTTGCTTGCTTCTGGTCCAAAGATGAAATCCTTAGTAATAGTTGGTTGTATTCACCCTTTTTTGGAATAATAGCCTCTTTTACTGCAGGATTAACCGCATTTTATATGTTTCGGATATATTTACTTACTTTTGATGGGTATTTGCGTGTTCATTTTCAAAATTACAGTAGTACTAAAGAGAGTTCGTTGTATTCAATATCCTTATGGGGAAAAAGCATACCCAAAGGAGTCAATAGGGATTTTGTGTTATCCACAACGAAGAGTGGAGTTTCCTTTTTTTCACAAAATATACC??????AAAAATTCCTGGTAATACAAGAAATAAGACGGGATCCTTTAGTACTCCC??????TTTGGGGCTAAAAAAACTTTTGTCTATCCTCATGAAACGGGAAATACTATGCTATTTCCTCTTCTTGTATTACTTATTTTGACTCTGCTCATTGGATTCATAGGAATCCATTTTGATAATAGAGTAAAGGATAATGGAATATCGGAGTTAACCATATTATCAAAGTGGCTAACTCCTTCAATAAACTTTTTCCAGGAAAGTTCTAATTCTTCCATAAATTCATATGAATTTCTCACTAATGCAATTTCTTCTGTAAGTTTAGCTATTTTTGGTCTATTCATAGCATATATCTTCTATGGATCCGCTTATTCTTTTTTTCAGAATTTGAATTTTAAAAATTCCCTTTT??????ACAAGGGAATCAAAAAAAGTTCTTTTTGGATGAAGTAAAAAAAAATATATACAGTTGGTCATATAATCGTGGTTATATAGATGTTTTCTATACTCGGGTCTTTATCCTGGGTATAAGACGATTAACCGAACTAACGAATTTTTTCGATAAAGGTGTCATTGATGGAATTACCAATGGAGTA Zuloagaea_bulbosa ATGTCAATGGGATTTGGACTTTTTCTTATTCCGACAGCAACAAAAAATCTTCGTCGCATATGGGCTTTTCCTAGTATTTTACTCTTAAGTATAGCTCTGGTATTCTCAGTTCACCTGTCTATTCAACAAATAAATGGAAGTTCCATCTATCAATATCTATGGTCTTGGACCATCAATAACGATTTTTCTTTAGAATTTGGATACTTGATCGACCCCCTTACGTCTATTATGTTAATACTAATAACTACTGTAGGAATCTTGGTTCTTATTTATAGTGACGATTATATGTCTCACGATGAAGGATATTTGAGATTTTTTGTTTATATAAGTTTTTTTAATACTGCCATGTTGGGGTTGGTTACTAGTTCCAATTTGATACAAATTTATTTTTTTTGGGAACTTGTCGGAATGTGTTCCTATTTATTGATAGGCTTTTGGTTTACACGGCCAATTGCAGCGAG{GT}GCTTGCCAAAAAGCTTTTGTAACTAATCGTGTAGGGGATTTTGGTCTGTTATTAGGAATTTTAGGTTTTTTTTGGATAACGGGTAGTTTAGAGTTTCGGGATTTGTTCAAAATAGCTAATAACTGGATTCCTAATAATGGGATTAATTCCTTACTTACAACTTTGTGTGCTTTTTTATTATTCCTTGGTGCAGTTGCAAAATCCGCACAATTCCCTCTTCACGTATGGTTACCCGATGCTATGGAAGGACCCACTCCCATTTCGGCTCTTATACACGCAGCAACTATGGTTGCTGCGGGGATTTTTCTTCTAGCTCGACTTTTTCCTCTTTTCATATCCCTACCTTTGATAATGAGTTTTATTTCTTTAGTAGGTACAATAACACTCTTCTTAGGAGCCACTTTAGCTCTTGCTCAGAGAGATATTAAAAAAAGCTTA?CCTATTCTACAAT?TCTCAATTGGGTTATATGATGTTAGCTCTCGGTATAGGTTCTTATGAAGCTGCTTTATTCCATTTGATCACTCATGCTTATTCGAAAGCTTTATTGTTCTTAGGATCCGGATCCGTTATTCATTCAATGGAACCTCTTGTTGGATATTCACCAGATAAAAGTCAGAATATGGTTCTTATGGGTGGTTTAAGAAAATACGTTCCAATTACAAGAACTACTTTTTTATGTGGTACACTTTCTCTTTGTGGTATTCCACCTCTTGCTTGCTTCTGGTCCAAAGACGAAATCCTTAGTAATAGCTGGTTGTATTCACCTTTTTTTGGAATAATAGCCTCTTTTACTGCAGGATTAACTGCATTTTATATGTTTCGGATATATTTACTTACTTTTGATGGGTATTTGCGTGTTCATTTTCAAAATTACAGCAGTACTAAAGAAGGTTCGTTGTATTCAATATCCTTATGGGGAAAAGGCATATCCAAAGGAGTCAATAGAGATTTTGTTTTATCAACAATGAAGGGTGGAGTTTCTTTTTTTTCACAAAATATACC??????CCAAATTCCTGGTAATACAAGAAATAAGATAGGATCCTTTAGTACTCCC??????TTTGGGGCTAAAAACACTTTTGTCTATCCTCATGAAACGGGAAATACTATGCTATTTCCTCTTCTTATATTACTGCTTTTTACTTTGTTCATTGGATCCATAGGAATCCATTTTGATAATGGAATAAAGGGTAATGGAATATCGGAGTTAACTATATTATCAAAGTGGCTAACTCCTTCAATAAACTTTTTCCAGGAAAGTTCTAATTCTTCCATAAATTCATATGAATTTCTCATTAATGCAATTTCTTCTGTAAGTTTAGCAATTCTTGGTCTATTCATAGCATATATCTTCTATGGATCTACTTATTCTTTTTTTCAGAATTTGAATTTTATAAATTCCCTTGT??????AAAGGGGAATCCAAAAAAAAACTTTTTGGATCAAGTAAAAGAAAAGATATACAGCTGGTCATATAATCGTGGTTATATAGATGTTTTCTATACTAGGGTCTTTATCTTGGGTATAAGAAGATTAGCCGAACTAACGAATTTTTTCGATAAGGGTGTTATTGATGGAATTACCAATGGA?TA ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = Paniceae_ndhF) = N: 1-2061; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = Paniceae_ndhF) = N: 1-2061; END; BEGIN TREES; TITLE Tb10323; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Panicum_latissimum, 2 Dichanthelium_cumbucana, 3 Dichanthelium_koolauense, 4 Dichanthelium_sabulorum, 5 Digitaria_setigera, 6 Echinochloa_colona, 7 Echinolaena_inflexa, 8 Echinolaena_minarum, 9 Echinolaena_minarum_b, 10 Echinolaena_standleyi, 11 Eriochloa_punctata, 12 Homolepis_glutinosa, 13 Hopia_obtusa, 14 Hymenachne_donacifolia, 15 Hymenachne_grumosa, 16 Hymenachne_pernambucense, 17 Ichnanthus_pallens, 18 Lasiacis_sorghoidea, 19 Megathyrsus_maximus, 20 Melinis_repens, 21 Mesosetum_chaseae, 22 Moorochloa_eruciformis, 23 Acroceras_zizanioides, 24 Altoparadisium_chapadense, 25 Andropogon_gerardii, 26 Anthaenantia_lanata, 27 Anthaenantiopsis_rojasiana, 28 Apochloa_euprepes, 29 Apochloa_subtiramulosa, 30 Arthropogon_villosus, 31 Arundinella_hirta, 32 Axonopus_anceps, 33 Bothriochloa_bladhii, 34 Canastra_lanceolata, 35 Cenchrus_ciliaris, 36 Chaetium_bromoides, 37 Chasmanthium_laxum_sessiliflorum, 38 Chionachne_koenigii, 39 Cymbopogon_flexuosus, 40 Cyphonanthus_discrepans, 41 Danthoniopsis_dinteri, 42 Dichanthelium_acuminatum, 43 Dichanthelium_clandestinum, 44 Ophiochloa_hydrolithica, 45 Oplismenopsis_najada, 46 Oplismenus_hirtellus, 47 Otachyrium_versicolor, 48 Panicum_adenophorum, 49 Panicum_anceps, 50 Panicum_antidotale, 51 Panicum_aquaticum, 52 Panicum_bergii, 53 Panicum_biglandulare, 54 Panicum_caricoides, 55 Panicum_cervicatum, 56 Panicum_chapadense, 57 Panicum_chloroleucum, 58 Panicum_claytonii, 59 Panicum_crateriferum, 60 Panicum_cyanescens, 61 Panicum_dichotomiflorum, 62 Panicum_elephantipes, 63 Panicum_fauriei, 64 Panicum_gouinii, 65 Panicum_hylaeicum, 66 Panicum_irregulare, 67 Panicum_mertensii, 68 Panicum_miliaceum, 69 Panicum_millegrana, 70 Panicum_mistasypus, 71 Panicum_nephelophilum, 72 Panicum_olyroides, 73 Panicum_parvifolium, 74 Panicum_pedersenii, 75 Panicum_petersonii, 76 Panicum_piauiense, 77 Panicum_pilosum, 78 Panicum_prionitis, 79 Panicum_pulchellum, 80 Panicum_pulchellum_b, 81 Panicum_racemosum, 82 Panicum_repens, 83 Panicum_rigidulum, 84 Panicum_rude, 85 Panicum_rude_b, 86 Panicum_rudgei, 87 Panicum_schwackeanum, 88 Panicum_sellowii, 89 Panicum_stenodes, 90 Panicum_stoloniferum, 91 Panicum_stoloniferum_b, 92 Panicum_stramineum, 93 Panicum_tenerum, 94 Panicum_trichanthum, 95 Panicum_tricholaenoides, 96 Panicum_tuerckheimii, 97 Panicum_validum, 98 Panicum_venezuelae, 99 Panicum_venezuelae_b, 100 Panicum_verrucosum, 101 Panicum_virgatum, 102 Panicum_wettsteinii, 103 Parodiophyllochloa_cordovensis, 104 Parodiophyllochloa_missiona, 105 Parodiophyllochloa_ovulifera, 106 Parodiophyllochloa_penicillata, 107 Paspalidium_geminatum, 108 Paspalum_arundinellum, 109 Paspalum_conjugatum, 110 Paspalum_glaziovii, 111 Paspalum_remotum, 112 Paspalum_vaginatum, 113 Pennisetum_alopecuroides, 114 Pennisetum_setaceum, 115 Phacelurus_digitatus, 116 Phanopyrum_gymnocarpon, 117 Plagiantha_tenella, 118 Pseudechinolaena_polystachya, 119 Renvoizea_sacciolepoidea, 120 Renvoizea_trinii, 121 Sacciolepis_indica, 122 Setaria_lachnea, 123 Setaria_macrostachya, 124 Setaria_palmifolia, 125 Setaria_viridis, 126 Sorghum_bicolor, 127 Steinchisma_decipiens, 128 Steinchisma_hians, 129 Steinchisma_laxa, 130 Steinchisma_spathellosa, 131 Stenotaphrum_secundatum, 132 Streptostachys_asperifolia, 133 Streptostachys_ramosa, 134 Tatianyx_arnacites, 135 Thysanolaena_maxima, 136 Urochloa_acuminata, 137 Urochloa_plantaginea, 138 Zea_mays, 139 Zeugites_pittieri, 140 Zuloagaea_bulbosa; TREE Fig._1 = [&R] ((((135,41),139),37),(((12,45,(89,(54,67)),(40,133),(21,134),(24,30),(116,(34,((49,(83,93)),(75,78)),(28,29)))),(17,((10,(8,9)),(98,99)),(119,120),(132,(32,44)),((13,(112,(109,(110,(108,111))))),(97,(27,96))),(7,((66,79,80,(59,53),(90,91)),((84,(85,1)),(76,56))))),(26,(((117,(47,((128,130),(127,129)))),(14,(15,16))),(65,77)))),(31,38,138,(115,126,(25,33,39))),(5,((94,(100,(121,(60,102,(73,87)))),(69,88)),((2,(43,3,(42,4))),(48,58)),(23,6,(105,(103,104,106)),(46,(18,118))),((62,64,82,(((57,81,95,101),(70,72)),(55,86)),(51,61,74),(52,68,92,(63,71))),((136,(20,22),(19,137,(36,11))),((123,124),(113,(35,114)),(((122,140),(50,125)),(107,131))))))))); END;