#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on March 28, 2024; 17:00 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Tippery N., Les D., Regalado J., Averyanov L., Vu N., & Raven P. 2009. Transfer of Villarsia cambodiana to Nymphoides (Menyanthaceae). Systematic Botany, 34(4): 818-823. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S9969] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=32; TAXLABELS Liparophyllum_capitatum Liparophyllum_congestiflorum Liparophyllum_exaltatum Liparophyllum_exiguum Liparophyllum_gunnii Liparophyllum_lasiospermum Liparophyllum_latifolium Liparophyllum_violifolium Menyanthes_trifoliata Nephrophyllidium_cristagalli Nymphoides_aurantiaca Nymphoides_cordata Nymphoides_crenata Nymphoides_cristata Nymphoides_exiliflora Nymphoides_geminata Nymphoides_indica Nymphoides_minima Nymphoides_peltata Nymphoides_spinulosperma Nymphoides_thunbergiana Ornduffia_albiflora Ornduffia_calthifolia Ornduffia_marchantii Ornduffia_parnassifolia Ornduffia_reniformis Ornduffia_submersa Ornduffia_umbricola Villarsia_cambodiana Villarsia_capensis Villarsia_goldblattiana Villarsia_manningiana ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M4196] TITLE 'Morphological, ITS structure, filler gaps'; LINK TAXA = Taxa1; DIMENSIONS NCHAR=400; FORMAT DATATYPE=Standard SYMBOLS= "0 1 2 3 4 5" MISSING=? GAP= -; CHARSTATELABELS 1 'Chromosome base number (x)' / 9. 17., 2 'Diploid chromosome number (2n)' / 18. 36. 54. 102., 3 Duration / annual perennial, 4 Leaf_lamina_base / 'attenuate, truncate, or shallowly cordate' deeply_cordate_to_obtusely_lobed leaves_trifoliate, 5 Floating_leaves / vegetative_only_or_absent supporting_lax_inflorescence, 6 Isorhamnetin / absent present, 7 Kaempferol / absent present, 8 Quercetin / absent present, 9 Inflorescence_habit / lax erect, 10 Flowers_per_node / four_or_fewer more_than_eight, 11 Corolla_lobe_color / white yellow, 12 Corolla_throat_color / white yellow, 13 Petal_base / glabrous with_fringed_corona, 14 Petal_lateral_wings / absent present, 15 Lateral_wing_margin / entire_or_serrulate fimbriate, 16 Petal_median_wing / absent present, 17 Interstaminal_glands / absent present, 18 Carpellary_glands / absent present, 19 Flower_type / hypogynous epigynous, 20 Capsule_adnation_to_calyx / basal_only 'more than one-quarter capsule length', 21 Capsule_length_relative_to_calyx / equal shorter longer, 22 Capsule_dehiscence / indehiscent_or_irregularly_dehiscent '2-valved' '4-valved', 23 Ovules_per_placenta / ten_or_fewer more_than_ten, 24 Seed_length / '<= 1 mm' '1.2-3.0 mm' '> 4 mm', 25 Seed_caruncle / absent_or_reduced conspicuous, 26 Seed_epidermal_cells / narrowly_elongate polygonal interdigitating, 27 Seed_surface / unornamented tuberculate 'with trichomes > 50 um', 28 Seed_trichome_density / one_per_epidermal_cell some_cells_without_trichomes marginal_only, 29 Seed_hilum_location / subterminal terminal, 30 Pollen_type / 'Menyanthes-type' 'Villarsia-type', 31 Pollen_exine / smooth spinulose striate_or_rugulose, 32 Hermaphroditic_flowers / absent present, 33 Unisexual_flowers / absent present, 34 Heterostyly / absent present, ; MATRIX [ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 ] [ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ] Liparophyllum_capitatum 0000011111111100?1112200010-112101------------------------------------------------------------------011111101---111-----1100---11111100??132????111--11011111100------111101011---11-00--??230312????11111100????1111011111---11100---111---11011---111----0000??0231340????0011-0111100111011000??1????110111-11-11--11101--111000011111-100000011-1101111000??11220101????11---11111100??20??????????????????? Liparophyllum_congestiflorum 0000000111111100??111201110-112101------------------------------------------------------------------000111101---111-----1100---11111100??132????111--1111111110001----101110001---11-00--??210312????11111100????1111011111---11100---111---11011---111----000-??0231341????0011--111100111111000??2????110011-11-10--11101--111000011111-100000011-1101111000??11220101????11---11111100??20??????????????????? Liparophyllum_exaltatum 0210011110111101??1102011221112101------------------------------------------------------------------00011110----1110----1100---11111100??222????1110-11111111100------110111111---11-00--??130312????11111100????111101111----01100000111---11000---111----000-??0301341????111100111100111111000??0????011011-11-10--11101--111000011111-100000011-1101111000??11220101????11---11111000??20??????????????????? Liparophyllum_exiguum ???0000110111100?111{01}001020-11?10?------------------------------------------------------------------011111101---111-----1100---11111100??132????111--10111011100------111101011---11-0000??230310????11111100????1111011111---11100---111---11011---111----000-??0231341????0000--111100111111000??2????111110-11-11--11101--111000011111-100000011-1101111000??11220101????11---11111100??20??????????????????? Liparophyllum_gunnii ??100001-000010000?00001020-112100------------------------------------------------------------------00011110----1111----1100---11111100??222????111--01111111100------111100011---10-00--??230312????11111100????1111011110---11100---111---11000---111----000-??0231341????0011--111100111111000??2????011011-11-10--11101--111000011111-101111000-1101111000??11220101????11---11111100??20??????????????????? Liparophyllum_lasiospermum 00100011100011011110{01}2010221112101------------------------------------------------------------------000111110---1110----1100---11111100??122????111--11101111100------111100011---11-00--??230312????11111000????1111011110---11100---111---11000--01111---000-??0231231????0011-0111100111111000??1????011011-11-10--11101--111000011111-111000011-1101111000??11220101????11---11111100??20??????????????????? Liparophyllum_latifolium 0010001110111100??111201110-11?101------------------------------------------------------------------000111101---111-----1100---11111100??132????111--11111111100------111101011---10-00--??230312????11111100????11110111110--11100---111---11000---111----000-??0131341????0011--111100111111000??2????011011-11-11--11101--111000011111-100000011-1101111000??11220101????11---11111100??20??????????????????? Liparophyllum_violifolium 00?0001110111100?1111201110-11210?------------------------------------------------------------------011111101---111-----1100---11111100??132????111--10111011100------111101011---11-000-??230311????11111100????1111011111---11100---111---11011---111----000-??0231341????0000--111100111111000??2????111111-11-11--11101--111000011111-100000011-1101111000??11220101????11---11111100??20??????????????????? Menyanthes_trifoliata 02120111100010--01102111000-102101------------------------------------------------------------------0111101-----1111----1000--000111100??321????001--1111011111000----11100-111---11000--??211302????11111000????1111-111100--00000---111---11100--1111----000-??1131241????111100111100111111000??0????11110--11000001110---11111--11111-110000-11-1101110000??20031111????11---11110000??20??????????????????? Nephrophyllidium_cristagalli 13110111100001010?112211000-002101------------------------------------------------------------------0011111-----1110----1111--000111100??321????111--11110111111------1110--11110-11000--??232102????11111000????1111-1111-----0000---111---11100--1111----000-??1431241????111100111100111111000??0????11110--11-110-111100011111--01111-110000-11-1101110000??21101111????11---11111100??20??????????????????? Nymphoides_aurantiaca ??111???00111110110-{02}0010120112101------------------------------------------------------------------01111111----1110----0000---11111100??222????110--11111111101------1111--011---10-0---??232313????11111000????1111011110---11000---111---11000---11111--1000??0231320????0011-0111100111110000??1????011110-11-11--11110--111000011111-111000011-1101111000??11220101????110--11111100??10??????????????????? 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Liparophyllum_congestiflorum 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Liparophyllum_exaltatum 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Liparophyllum_exiguum 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Liparophyllum_gunnii 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Liparophyllum_lasiospermum 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Liparophyllum_violifolium 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Menyanthes_trifoliata 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Nymphoides_exiliflora 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Nymphoides_geminata 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Ornduffia_reniformis 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Villarsia_cambodiana 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Villarsia_goldblattiana 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; END; BEGIN SETS; CHARSET matK_indel (CHARACTERS = ITS_matK_rbcL) = 3601-3700; CHARSET 5.8S (CHARACTERS = ITS_matK_rbcL) = 400-554; CHARSET matK_gene (CHARACTERS = ITS_matK_rbcL) = 1685-3280; CHARSET _fillergaps (CHARACTERS = ITS_matK_rbcL) = 881-900 3578-3600 3633-3700 5049-5100; CHARSET 5trnK (CHARACTERS = ITS_matK_rbcL) = 901-1684; CHARSET 26S (CHARACTERS = ITS_matK_rbcL) = 862-900; CHARSET ITS2 (CHARACTERS = ITS_matK_rbcL) = 555-861; CHARSET rbcL_DNA (CHARACTERS = ITS_matK_rbcL) = 3701-5100; CHARSET 18S (CHARACTERS = ITS_matK_rbcL) = 1-37; CHARSET ITS1 (CHARACTERS = ITS_matK_rbcL) = 38-399; CHARSET 3trnK (CHARACTERS = ITS_matK_rbcL) = 3281-3592; CHARSET ITS_DNA (CHARACTERS = ITS_matK_rbcL) = 1-900; CHARSET matK_indel (CHARACTERS = ITS_matK_rbcL) = 3601-3657; CHARSET matK_DNA (CHARACTERS = ITS_matK_rbcL) = 901-3600; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = ITS_matK_rbcL) = N: 1-5100; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = ITS_matK_rbcL) = N: 1-5100; END; BEGIN TREES; TITLE Tb10362; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Nymphoides_cordata, 2 Nymphoides_cristata, 3 Nymphoides_thunbergiana, 4 Nymphoides_indica, 5 Nymphoides_minima, 6 Nymphoides_spinulosperma, 7 Nymphoides_aurantiaca, 8 Villarsia_cambodiana, 9 Nymphoides_geminata, 10 Nymphoides_exiliflora, 11 Nymphoides_peltata, 12 Nymphoides_crenata, 13 Liparophyllum_gunnii, 14 Liparophyllum_exiguum, 15 Liparophyllum_congestiflorum, 16 Liparophyllum_capitatum, 17 Liparophyllum_exaltatum, 18 Liparophyllum_lasiospermum, 19 Liparophyllum_latifolium, 20 Liparophyllum_violifolium, 21 Villarsia_capensis, 22 Villarsia_goldblattiana, 23 Villarsia_manningiana, 24 Ornduffia_albiflora, 25 Ornduffia_calthifolia, 26 Ornduffia_marchantii, 27 Ornduffia_parnassifolia, 28 Ornduffia_reniformis, 29 Ornduffia_submersa, 30 Ornduffia_umbricola, 31 Nephrophyllidium_cristagalli, 32 Menyanthes_trifoliata; TREE Fig._2 = [&R] (((((((((((1,2),3),4),5),6),(7,8)),(((9,10),11),12)),((13,(((((14,20),16),15),19),17)),18)),(21,(22,23))),((((24,27),(25,26)),29),(28,30))),(31,32)); END;