#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on March 29, 2024; 7:59 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Moody M., & Les D. 2010. Systematics of the Aquatic Angiosperm Genus Myriophyllum (Haloragaceae). Systematic Botany, 35(1): 121-139. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S9987] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=60; TAXLABELS Gonocarpus_montanus Haloragis_digyna Laurembergia_repens Myriophyllum_alpinum Myriophyllum_alterniflorum Myriophyllum_aquaticum Myriophyllum_balladoniense Myriophyllum_caput_medusae Myriophyllum_coronatum Myriophyllum_crispatum Myriophyllum_decussatum Myriophyllum_dicoccum Myriophyllum_drummondii Myriophyllum_farwellii Myriophyllum_filiforme_1 Myriophyllum_filiforme_2 Myriophyllum_heterophyllum_1 Myriophyllum_heterophyllum_2 Myriophyllum_heterophyllum_3 Myriophyllum_hippuroides Myriophyllum_humile Myriophyllum_latifolium Myriophyllum_laxum_1 Myriophyllum_laxum_2 Myriophyllum_limnophilum Myriophyllum_lophatum Myriophyllum_mattogrossensis Myriophyllum_muricatum Myriophyllum_oguraense Myriophyllum_papillosum Myriophyllum_pedunculatum Myriophyllum_pedunculatum_T Myriophyllum_petraeum Myriophyllum_pinnatum Myriophyllum_quitense_NA Myriophyllum_quitense_SA Myriophyllum_robustum Myriophyllum_salsugineum Myriophyllum_sibiricum Myriophyllum_sibiricum_EU Myriophyllum_simulans_441 Myriophyllum_simulans_622 Myriophyllum_sp_425 Myriophyllum_sp_nov_476 Myriophyllum_sp_nov_542 Myriophyllum_sp_red1 Myriophyllum_sp_red2 Myriophyllum_spicatum Myriophyllum_tenellum Myriophyllum_tillaeoides Myriophyllum_trachycarpum Myriophyllum_trifidum Myriophyllum_triphyllum Myriophyllum_ussuriense Myriophyllum_variifolium_444 Myriophyllum_variifolium_457 Myriophyllum_verrucosum Myriophyllum_verticillatum Myriophyllum_votschii Trihaloragis_hexandrus ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa2; DIMENSIONS NTAX=71; TAXLABELS Gonocarpus_montanus Haloragis_digyna Laurembergia_repens Myriophyllum_alpinum Myriophyllum_alterniflorum Myriophyllum_amphibium Myriophyllum_aquaticum Myriophyllum_balladoniense Myriophyllum_caput_medusae Myriophyllum_coronatum Myriophyllum_crispatum Myriophyllum_crispatum_WA Myriophyllum_decussatum Myriophyllum_dicoccum Myriophyllum_drummondii Myriophyllum_echinatum Myriophyllum_farwellii Myriophyllum_filiforme_1 Myriophyllum_filiforme_2 Myriophyllum_heterophyllum_1 Myriophyllum_heterophyllum_2 Myriophyllum_heterophyllum_3 Myriophyllum_hippuroides Myriophyllum_humile Myriophyllum_latifolium Myriophyllum_laxum_1 Myriophyllum_laxum_2 Myriophyllum_limnophilum Myriophyllum_lophatum Myriophyllum_mattogrossensis Myriophyllum_muricatum_1 Myriophyllum_muricatum_2 Myriophyllum_muricatum_3 Myriophyllum_oguraense Myriophyllum_papillosum_c1 Myriophyllum_papillosum_c2 Myriophyllum_papillosum_c3 Myriophyllum_pedunculatum Myriophyllum_pedunculatum_T Myriophyllum_petraeum Myriophyllum_pinnatum Myriophyllum_quitense_NA Myriophyllum_quitense_SA Myriophyllum_robustum Myriophyllum_salsugineum Myriophyllum_sibiricum_EU Myriophyllum_sibiricum_c1 Myriophyllum_sibiricum_c2 Myriophyllum_sibiricum_c3 Myriophyllum_sibiricum_c4 Myriophyllum_sibiricum_c5 Myriophyllum_simulans_441 Myriophyllum_simulans_622 Myriophyllum_sp_425 Myriophyllum_sp_nov_476 Myriophyllum_sp_nov_542 Myriophyllum_sp_red1 Myriophyllum_sp_red2 Myriophyllum_spicatum Myriophyllum_tenellum Myriophyllum_tillaeoides Myriophyllum_trachycarpum Myriophyllum_trifidum Myriophyllum_triphyllum Myriophyllum_usurriense Myriophyllum_variifolium_444 Myriophyllum_variifolium_457 Myriophyllum_verrucosum Myriophyllum_verticillatum Myriophyllum_votschii Trihaloragis_hexandrus ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M4176] TITLE 'ITS1_5.8S_ITS2'; LINK TAXA = Taxa2; DIMENSIONS NCHAR=644; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Myriophyllum_balladoniense 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Myriophyllum_caput_medusae 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Myriophyllum_coronatum 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Myriophyllum_crispatum 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Myriophyllum_decussatum 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Myriophyllum_drummondii 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Myriophyllum_filiforme_1 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Myriophyllum_humile 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Myriophyllum_latifolium 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Myriophyllum_laxum_1 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Myriophyllum_limnophilum 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Myriophyllum_mattogrossensis 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Myriophyllum_muricatum 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Myriophyllum_papillosum 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Myriophyllum_variifolium_457 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Myriophyllum_verrucosum 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Myriophyllum_verticillatum 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Myriophyllum_votschii 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Trihaloragis_hexandrus ?????????????????????????????GGAAAGGAACGGAAAAAATAGCATGTCGTATCCATGGAGAATTCTGAGAATATTTTATTCTTACCAGATTGGTAGAAAGACTTGTTTGGTTTGAAGTCTTGGGCGAAATAAAAAA-TTCAAA--------TATAAA--------GTAGGGTCTGGGGAATAAATGGATAGAGCCCTATGGCTCCAATTGTAGGAAAACAACAAGCGACGGGCTGATGTTCGCAATTTGAATAATTACCCGATCTAATTAGACGTTAAAAATATATTAGTGCCTGATGCGGGAAAGGCTTCTCCCATGAGTGGATTATCCATTTTTT-AGTGAATCCTAACTATTTCCTATTCTCCAGTATGGAGTGGATATGAATGTGTAGAAGAAGCAGTATATTGATAAAGAAAAATTTTTCCAAATCAAAAGAGCGATTGGGTTGAAAAAATAAAGGATTTCTAACCATCTTATTATC-----CAATAAATGAACATAAACAATGAACATAAACCGATTAG-ATGG-------AAAAGATTG--TAGAGGGTCC-------------------GTCGCTGCGTTTACCTGTCTCCGAGGTGTCCATTCATAATAATACCTTGTTTTAACTGTATCGCACTATGTATCATTTGATAATCCAAGAAATCCAGTATTCTTTTTT---ACTTCAAA--------------------TCAAATTTAAAATGGAGGAATTGCAAGTATATTTAGAAATAGATAAATTTCGTCAACACAAC???????????????????????????????????????????????????????GATCTATTTTGTTAGAAAATGTCAGTTATGACAATAAATCAAGTTTCCTACTTGTTAAACGTTTAATTACTCGAATGTACCAACAGAATCATTTTATTATTTCCGCTAATGATTCTAACCAAAATATATTTTTGGGACGTAACAAAAATTTGTATTCTCAAATGTTATCAGAGGGATTTTCAGTGATTATGGAAATTTCATTTTCCCTACGACTAGAATCTTCTCTAAAAAGGAAAAAAATAAAAAAATCTCAAAATCTACGATCAATTCATTCAATATTTCCTTTTTTAGAAGATAATTTTGTACATTTAAACTATGTGTCAGGTATACTAATACCTCATCCCATCCATCTAGAGATATTGCTTCAAGCCCTTCGCTACCGGGTGAAAGACGCCGCTTCTGTACATTTCTTACGCTTCTTTCTCTACGAGGCTCGTAATTGGAATAGTGTTATTTCTACAAAGAAATCGATTTCTCTTTTTTCAAAAACGACTCAAAGATTATTATTGTTCCTATATAATTCTCATGTATGTGAATACGAATGCACCTTCGCCTTTTTACGTAACCAATCTTCGCATTTACGGTCAATATCTTTTGGAGTTCTTCTTGAGCGAATATTTTTCTATAGAAAAACAAAACATTTTATAGGAGTCTTTGCTAATGATTTTCATGCCAACCTTTGGTTGTTCATGGATCCTTTCATGCATTATATTAGATATCAAGGAAAATCAATTCTGGCTTCAAAAGGCACGCCTCTTCTGATGAATAAGTGGAAATATTACCTTGTCAATTTCTGGCAATGTCATTTTTATGTGTGGTCTCAACCAGGAAGGATCCATATAAAACAATTAGCCAACAATTCCCTCGATTTTATGGGCTATTTTTCGAGTGTGCAACTAAACCCTTCAGCGGTACGGAGTCAAATATTAGAAAATTCATTTCTAATAGATAATACTATTAAGAAATTCGATATTCGAGTTCCAATTATTCCTCTGATTGGATCATTGGCTAAATCAAAATTTTGTAATTTATTAGGGCATCCCATTAGTAAGCCTACTTGGACTGATTCATCCGATGCGGATATTATCGATCGATTTGTGCGTATATGCAGAAATCTTTCTCATTATTACAGTGGATCCTCAAAAAAAAAGACTTTGTATCGACTAAAGTATATACTTAGGCTTTCTTGTGCGAGAACTTTGGCTCGTAAACACAAAAGTTCTGTACGTTCTTTTTTGAAAAAATTAGGTTCCGAATTATTGGAAGAGTTCCTTACGGAGGAAGAAAAAGTATTTTCTTTGCTCTTCCCGAAGGTTTCTTCTATTTCGCGTAGGTTATATAGAGGTCGGGTGTGGTATTTGGATATTTTTTGTATCAATGATCTGGCCAATCATTGATGATTGGTTCGGAGACCATAGAAATGAAAATGAAACGGAAATTATCCTTGACGAGATAACAAAAAACGAAAAGAATTCCTATTCTGAAATGTTCATACAGGTACGGATTGAATCAATTGACTATTCAACA???????????????? ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions (CHARACTERS = trnK3_matK_trnK5) = N: 1-2384; CODONPOSSET CodonPositions (CHARACTERS = trnK3_matK_trnK5) = N: 1-2384; END; BEGIN TREES; TITLE Tb10400; LINK TAXA = Taxa2; TRANSLATE 1 Myriophyllum_triphyllum, 2 Myriophyllum_salsugineum, 3 Myriophyllum_alterniflorum, 4 Myriophyllum_spicatum, 5 Myriophyllum_sibiricum_c1, 6 Myriophyllum_sibiricum_EU, 7 Myriophyllum_filiforme_1, 8 Myriophyllum_filiforme_2, 9 Myriophyllum_coronatum, 10 Myriophyllum_trachycarpum, 11 Myriophyllum_verrucosum, 12 Myriophyllum_caput_medusae, 13 Myriophyllum_robustum, 14 Myriophyllum_balladoniense, 15 Myriophyllum_verticillatum, 16 Myriophyllum_oguraense, 17 Myriophyllum_quitense_SA, 18 Myriophyllum_quitense_NA, 19 Myriophyllum_decussatum, 20 Myriophyllum_sp_red1, 21 Myriophyllum_sp_red2, 22 Myriophyllum_aquaticum, 23 Myriophyllum_mattogrossensis, 24 Myriophyllum_pedunculatum, 25 Myriophyllum_pedunculatum_T, 26 Myriophyllum_tillaeoides, 27 Myriophyllum_votschii, 28 Myriophyllum_alpinum, 29 Myriophyllum_drummondii, 30 Myriophyllum_limnophilum, 31 Myriophyllum_echinatum, 32 Myriophyllum_lophatum, 33 Myriophyllum_usurriense, 34 Myriophyllum_petraeum, 35 Myriophyllum_sp_nov_542, 36 Myriophyllum_crispatum, 37 Myriophyllum_sp_425, 38 Myriophyllum_variifolium_444, 39 Myriophyllum_simulans_622, 40 Myriophyllum_crispatum_WA, 41 Myriophyllum_variifolium_457, 42 Myriophyllum_sp_nov_476, 43 Myriophyllum_humile, 44 Myriophyllum_tenellum, 45 Myriophyllum_hippuroides, 46 Myriophyllum_heterophyllum_1, 47 Myriophyllum_heterophyllum_2, 48 Myriophyllum_heterophyllum_3, 49 Myriophyllum_latifolium, 50 Myriophyllum_farwellii, 51 Myriophyllum_muricatum_1, 52 Myriophyllum_muricatum_2, 53 Myriophyllum_muricatum_3, 54 Myriophyllum_dicoccum, 55 Myriophyllum_pinnatum, 56 Myriophyllum_laxum_1, 57 Myriophyllum_laxum_2, 58 Myriophyllum_sibiricum_c2, 59 Myriophyllum_sibiricum_c3, 60 Myriophyllum_sibiricum_c4, 61 Myriophyllum_sibiricum_c5, 62 Myriophyllum_simulans_441, 63 Myriophyllum_papillosum_c1, 64 Myriophyllum_papillosum_c2, 65 Myriophyllum_papillosum_c3, 66 Myriophyllum_amphibium, 67 Myriophyllum_trifidum, 68 Laurembergia_repens, 69 Haloragis_digyna, 70 Trihaloragis_hexandrus, 71 Gonocarpus_montanus; TREE Fig._1 = [&R] (70,(((((((1,17,18),((2,(3,(4,((5,58,59,60,61),6))),11,14),12)),(13,(15,16))),19),(((21,22),20),23)),((((((7,8),9),10),((27,(28,62),32,35),(((29,30),31),((33,(36,40)),(((37,41),38,39),42)),34),(63,(64,65)))),(((43,((44,(56,57)),50),((((45,46),47),48),55)),((52,53,51),54)),49)),((24,25),26,66)),67),68),(69,71)); END; BEGIN TREES; TITLE Tb10401; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Myriophyllum_trifidum, 2 Laurembergia_repens, 3 Haloragis_digyna, 4 Myriophyllum_triphyllum, 5 Myriophyllum_salsugineum, 6 Myriophyllum_alterniflorum, 7 Myriophyllum_spicatum, 8 Myriophyllum_sibiricum, 9 Myriophyllum_sibiricum_EU, 10 Myriophyllum_filiforme_1, 11 Myriophyllum_filiforme_2, 12 Myriophyllum_coronatum, 13 Myriophyllum_trachycarpum, 14 Myriophyllum_verrucosum, 15 Myriophyllum_caput_medusae, 16 Myriophyllum_balladoniense, 17 Myriophyllum_verticillatum, 18 Myriophyllum_quitense_NA, 19 Myriophyllum_quitense_SA, 20 Myriophyllum_oguraense, 21 Myriophyllum_robustum, 22 Myriophyllum_decussatum, 23 Myriophyllum_sp_red2, 24 Myriophyllum_sp_red1, 25 Myriophyllum_aquaticum, 26 Myriophyllum_mattogrossensis, 27 Myriophyllum_pedunculatum, 28 Myriophyllum_pedunculatum_T, 29 Myriophyllum_tillaeoides, 30 Myriophyllum_votschii, 31 Myriophyllum_alpinum, 32 Myriophyllum_drummondii, 33 Myriophyllum_limnophilum, 34 Myriophyllum_lophatum, 35 Myriophyllum_ussuriense, 36 Myriophyllum_petraeum, 37 Myriophyllum_latifolium, 38 Myriophyllum_sp_nov_542, 39 Myriophyllum_crispatum, 40 Myriophyllum_sp_425, 41 Myriophyllum_simulans_441, 42 Myriophyllum_variifolium_444, 43 Myriophyllum_simulans_622, 44 Myriophyllum_variifolium_457, 45 Myriophyllum_sp_nov_476, 46 Myriophyllum_papillosum, 47 Myriophyllum_dicoccum, 48 Myriophyllum_muricatum, 49 Myriophyllum_farwellii, 50 Myriophyllum_humile, 51 Myriophyllum_tenellum, 52 Myriophyllum_hippuroides, 53 Myriophyllum_heterophyllum_1, 54 Myriophyllum_heterophyllum_2, 55 Myriophyllum_heterophyllum_3, 56 Myriophyllum_pinnatum, 57 Myriophyllum_laxum_1, 58 Myriophyllum_laxum_2, 59 Trihaloragis_hexandrus, 60 Gonocarpus_montanus; TREE Fig._2 = [&R] ((((((((4,(18,19)),((5,15),14),(6,(7,8,9)),16,21),22),(17,20)),((23,(24,25)),26)),((((((10,11),(12,13)),((((30,34),((31,(38,41)),(32,33))),((35,39),(36,((((40,43),44),42),45)))),46)),((37,(47,48)),(49,(50,51,(57,58)),(52,((53,54,55),56))))),(27,(28,29))),1)),2),(3,60),59); END;