#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on March 29, 2024; 2:27 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Stone R., & Andreasen K. 2009. The Afro-Madagascan genus Warneckea (Melastomataceae): molecular systematics and revised infrageneric classification. Taxon, 98(1): 141-145. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S9995] BEGIN TAXA; TITLE Taxa1; DIMENSIONS NTAX=52; TAXLABELS Lijndenia_barteri_S2533 Lijndenia_barteri_S2548 Lijndenia_cf_brenanii_S2438 Lijndenia_danguyana_S2377 Lijndenia_laurina_C72_C74 Lijndenia_procteri_S2440 Lijndenia_roborea_S2386 Memecylon_albescens_S2392 Memecylon_erythranthum_S2434 Memecylon_lateriflorum_M1352 Memecylon_macrodendron_S2545 Memecylon_pauciflorum_Flecker Memecylon_umbellatum_M2752 Mouriri_crassifolia_PB35_PB927 Mouriri_guianensis_Munich Mouriri_helleri_A11165 Mouriri_sagotiana_M2026 Spathandra_blackioides_B1078 Spathandra_blackioides_JS3261 Votomita_guianensis_P6c4_659_P6c4_2317 Warneckea_amaniensis_S2415_S2420 Warneckea_austrooccidentalis_S2516_S2518 Warneckea_cf_erubescens_S2435 Warneckea_cf_schliebenii_L8741 Warneckea_cf_schliebenii_L8759 Warneckea_cinnamomoides_Meise Warneckea_fosteri_S2536 Warneckea_hedbergiorum_S2416 Warneckea_hedbergiorum_S2431 Warneckea_hedbergiorum_S2436_2437 Warneckea_madagascariensis_S2395 Warneckea_mangrovensis_S2539 Warneckea_masoalae_S2407 Warneckea_melindensis_S2427 Warneckea_membranifolia_S2448 Warneckea_membranifolia_S2540 Warneckea_mouririifolia_S2424 Warneckea_mouririifolia_S2428 Warneckea_pulcherrima_S2471 Warneckea_pulcherrima_S2525 Warneckea_sansibarica_S2423 Warneckea_sansibarica_S2426 Warneckea_sapinii_S2523 Warneckea_sapinii_S2532 Warneckea_sapinii_S2552 Warneckea_sousae_L10168 Warneckea_sp_indet_L10155 Warneckea_sp_indet_L8777 Warneckea_wildeana_S2544 Warneckea_yangambensis_H7867 Warneckea_yangambensis_S2562 Warneckea_yangambensis_S2563 ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa2; DIMENSIONS NTAX=55; TAXLABELS Lijndenia_barteri_S2533 Lijndenia_barteri_S2548 Lijndenia_danguyana_S2377 Lijndenia_laurina_C72_C74 Lijndenia_procteri_cf_brenanii Lijndenia_roborea_S2386 Memecylon_albescens_S2392 Memecylon_erythranthum_S2434 Memecylon_lateriflorum_M1352 Memecylon_macrodendron_S2545 Memecylon_pauciflorum_Flecker Memecylon_umbellatum_M2752 Mouriri_crassifolia_PB35_PB927 Mouriri_guianensis_Munich Mouriri_helleri_A11165 Mouriri_sagotiana_M2026 Spathandra_blackioides_B1078 Spathandra_blackioides_JS3261 Votomita_guianensis_P6c4_659 Warneckea_amaniensis_S2415_S2420 Warneckea_austrooccidentalis_S2516_S2518 Warneckea_cf_erubescens_S2435 Warneckea_cf_schliebenii_L8759_L8741 Warneckea_cinnamomoides_Meise.7 Warneckea_cinnamomoides_Meise.8 Warneckea_fosteri_S2536 Warneckea_hedbergiorum_S2416_S2436_S2437 Warneckea_hedbergiorum_S2431 Warneckea_madagascariensis_S2395 Warneckea_mangrovensis_S2539 Warneckea_masoalae_S2407 Warneckea_melindensis_S2427.2 Warneckea_melindensis_S2427.4 Warneckea_melindensis_S2427.5 Warneckea_membranifolia_S2448 Warneckea_membranifolia_S2540_Meise.3 Warneckea_mouririifolia_S2424 Warneckea_mouririifolia_S2428 Warneckea_pulcherrima_S2471 Warneckea_pulcherrima_S2525 Warneckea_sansibarica_S2423_S2426.4 Warneckea_sansibarica_S2426.2 Warneckea_sansibarica_S2426.3 Warneckea_sapinii_S2523 Warneckea_sapinii_S2552 Warneckea_sousae_L10168 Warneckea_sp_indet_L10155 Warneckea_sp_indet_L8777 Warneckea_wildeana_S2544 Warneckea_yangambensis_H7867.1 Warneckea_yangambensis_H7867.2 Warneckea_yangambensis_H7867.3 Warneckea_yangambensis_H7867.7 Warneckea_yangambensis_H7867.8 Warneckea_yangambensis_S2562_S2563 ; END; BEGIN TAXA; TITLE Taxa3; DIMENSIONS NTAX=51; TAXLABELS Lijndenia_barteri_S2533 Lijndenia_barteri_S2548 Lijndenia_cf_brenanii_S2438 Lijndenia_danguyana_S2377 Lijndenia_laurina_C72_C74 Lijndenia_procteri_S2440 Lijndenia_roborea_S2386 Memecylon_albescens_S2392 Memecylon_erythranthum_S2434 Memecylon_lateriflorum_M1352 Memecylon_macrodendron_S2545 Memecylon_pauciflorum_Flecker Memecylon_umbellatum_M2752 Mouriri_crassifolia_PB35_PB927 Mouriri_guianensis_Munich Mouriri_helleri_A11165 Mouriri_sagotiana_M2026 Spathandra_blackioides_B1078 Spathandra_blackioides_JS3261 Votomita_guianensis_P6c4_659 Warneckea_amaniensis_S2415_S2420 Warneckea_austrooccidentalis_S2516_S2518 Warneckea_cf_erubescens_S2435 Warneckea_cf_schliebenii_L8741 Warneckea_cf_schliebenii_L8759 Warneckea_cinnamomoides_Meise Warneckea_fosteri_S2536 Warneckea_hedbergiorum_S2416 Warneckea_hedbergiorum_S2431 Warneckea_hedbergiorum_S2436_2437 Warneckea_madagascariensis_S2395 Warneckea_mangrovensis_S2539 Warneckea_masoalae_S2407 Warneckea_melindensis_S2427 Warneckea_membranifolia_S2448 Warneckea_membranifolia_S2540 Warneckea_mouririifolia_S2424 Warneckea_mouririifolia_S2428 Warneckea_pulcherrima_S2471 Warneckea_pulcherrima_S2525 Warneckea_sansibarica_S2423 Warneckea_sansibarica_S2426 Warneckea_sapinii_S2523 Warneckea_sapinii_S2552 Warneckea_sousae_L10168 Warneckea_sp_indet_L10155 Warneckea_sp_indet_L8777 Warneckea_wildeana_S2544 Warneckea_yangambensis_H7867 Warneckea_yangambensis_S2562 Warneckea_yangambensis_S2563 ; END; BEGIN CHARACTERS; [! TreeBASE Matrix URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/matrix/TB2:M4350] TITLE rDNA_ETS; LINK TAXA = Taxa2; DIMENSIONS NCHAR=669; FORMAT DATATYPE=DNA SYMBOLS= "A C G T" MISSING=? 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Warneckea_hedbergiorum_S2416_S2436_S2437 GCATGGTTTGTATTGATCACATACTAACGTGTTTAGTGTTTTGTGA-G-TGGGTTT-CCCCT-----CATGAGCTGCTGGCTCGTTTATGGTGATTGAT-CTG-CCAATGGGAC-GGCGCATGAGTTGTGATTAGGATGTGCTTTCATGCAGGCTCTACGTATTTTATGTTGAACTGTGTGGAGCTATCCATTTCAGTAG-TCCGTTGCTTCGGCTTG------GCT-GTTGCAAAAATGATTTGGTGGTTTCTGTGTTATCTACCGATTTCTGTATGAGCGAT-TGATAGAATCCGTTGTCTTTT------GTTCTTTCCGCTGTT-GGCTTGGCTAGTGAC-GGTGGATGTTGCATTGGTCTCCTGTGTTCCTTGCAAGTT-AT--CCCTTT-ATGGG-AGT--GGATTTGCAGTGGCCCATAGGTGGCTGTCTTT----GCTCTT-GGG-TATGTGAAATA-TTTGGTTGATGTTTGGGTCTTT-AACCT-ATACATATCATATCTCGAGCATGTAGCCTTATTTTGTT--TGACCC-TCGT--GCATGTTCCTAAG--CTCATT-GAGCCTT-AGTGCTCATTGTTCGTCATGGAGA-TGT-TGAGGTCTACA---AGGAATGCCT--ACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTC Warneckea_hedbergiorum_S2431 GCATGGTTTGTATTGATCACATACTAACGTGTTTAGTGTTTTGTGA-G-TGGGTTT-CCCCT-----CATGAGCTGCTGGCTCGTTTATGGTGATTGAT-CTG-CCAATGGGAC-GGCGCATGAGTTGTGATTAGGATGTGCTTTCATGCAGGCTCTACGTATTTTATGTTGAACTGTGTGGAGCTATCCATTTCAGTAG-TCCGTTGCTTCGGCTTG------GCT-GTTGCAAAAATGATTTGGTGGTTTCTGTGTTATCTACCGATTTCTGTATGAGCGAT-TGATAGAATCCGTTGTCTTTT------GTTCTTTCCGCTGTT-GGCTTGGCTAGTGAC-GGTGGATGTTGCATTGGTCTCCTGTGTTCCTTGCAAGTT-AT--CCCTTT-AT{GT}GG-AGT--GGATTTGCAGTGGCTCATAGGTGGCTGTCTTT----GCTCTT-GGG-TATGTGAAATA-TTTGGTTGATGTTTGGGTCTTT-AACCT-ATACATATCATATCTCGAGCATGTAGCCTTATTTTGT{CT}--TGACCC-TCGT--GCATGTTCCTAAG--CTCATT-GAGCCTT-AGTGCTCATTGTTCGTCATGGAGA-TGT-TGAGGTCTACA---AGGAATGCCT--ACCTGGTTGATCCTGCCAGTAG??????????????? Warneckea_madagascariensis_S2395 GCATGG?ATGCATTGATTACATACTAACGTGTTCAGTGTTTTGTGA-G-TGGGTTT-CCCCT-----CATGAGCTGCTGACTCGTTTGTGGTGATTGAT-GTG-CCAATGGGAC-GGCGCATGAGTGGTGATTAGGATGTGCTTTCATGCAGGCTCTACGTACTTTATGTTGAACTGTGTTGAGCTATCCATTTCAGTGG-TCCGTTGCTTCGACTTGTCTTT-GTT-GTTGCAAAA-TGATTTGGTGGTTTCTGTGTTATCTACCGATTTTGGTATGAGCGAT-TGATAGAATTCGTTGTCTTTT------GTTCTTTCCGCTGTT-GGCTTGTCTAGTGAA-GGTGGACGTTGCATTGGTCTCCTGTGTTCCTTGCAGGTT-AT--CCCTTT-ATGGG-AGT--GGATTTGTAATGGCTCATAGGTGGCTGTCTTT----GCTCTT-GGG-TATGTGAAATA-TTTGGTTACCGTTTGGGTCTTT-GACCT-ATACATATCATATCTTGAGCATGTAGCCTTATTTTGTT--TGACCC-TCGT--GCATGTTCCTAAG--CTCATT-GAGCCTT-AGTGCTCATTGTTCGTCATGGAGA-TGT-CGAGGTCTACG---AGGAATG-CT--ACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTC Warneckea_mangrovensis_S2539 GCATGGCATGTATTGATCACATACTAATGTGTTCAGTGTTTTATGA-G-TGGGTTT-TCCCT-----CATGAGCTGCTGGCTTGTTTGTGGTGATTGAT-CTT-CCAATGGGAC-GACGCATGAGTGGTGATTAGGATGTGCTTTTATGCAGGCTCTGCGTATTTTGCGTTGAATTGCATTGAGCTATCCATTTCAGTAG-TTCGTTGCTTCGACTTGTCTTT-GCT-GTTGCAAAA-TGATTTGGTGGTTTTTGTGTTGTCTACCGATTTTGGTATGAGCGAT-TGATAGAATCTGTTGTGTTTT------GTTCTTTCCGTTGCT-GGCTTGTCCAGTGAA-GGTGGACGTTGCATTGGTCTCCTGTGTTCCTTGCAAGTT-AT--CCTTTT-ATGGG-TGT--GGATTTGTAATGGCTCATAGGTGGCTGTCTTT----GCTCTT-GGG-TAAGTGAAATA-TTCGGTTATCGTTTGGGTCTTT-GACCT-ATACATATAATATCTTGAGCATGTAGCCTTATTTTGTT--TGACCA-TCGT--GCATGTTCCTAAG--CTCATT-GAGCCTT-AGTGCTCATTGTTCGTCACGGAGA-TGC-TGAGGTCTACG---AGGAATG-CT--ACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTCATATGCTTGTCTC Warneckea_masoalae_S2407 ??????????????????????????????????????TTTTGTGA-G-TGGGTTT-CCCCT-----CATGAGCTGCTGACTCGTTTGTGGTGATTGAT-ATG-CTAATGGGAC-GGCGCATGAGTGGTG{AG}TTAGGATGTGCTTTCATGCAGGCTCTACGTATTTTATGTTGAACTGTGTTGAGCTATCCATTTCAGTAG-TCCGTTGCTTCGACTTGT------------GGAAAA-TGATCTGGTGGTTTCTGTGTTATCTACCGATTTCGGTATGAGCGAT-TGATAGAATCCGTTGTCTTTT------GTTCTTTCCGCTGTT-GGCTTGTCTAGTGAA-GGTGGACGTTGCATTGGCCTCCTGTGTTCCTTGCAGGTT-AT--CCCTTT-ATGGG-AGT--GGATTTGTAATGGCTCATAGGTGGCTGTCTTT----GCTCTT-GGG-TATGTGAAATA-TTTGGTTACCGTTTGGGTCTTT-GACCT-ATACATATCATATCTTGAGCAAGTAGCCTTATTTTGTT--TGACCC-TCGT--GCATGTTCCTAAG--CTCATT-GAGCCTT-AGTGCTCATTGTTCGTCATGGGGA-TGT-CGAGGTCTACG---AGGAATG-CT--ACCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTC????????????? 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Lijndenia_roborea_S2386, 7 Memecylon_lateriflorum_M1352, 8 Memecylon_albescens_S2392, 9 Memecylon_erythranthum_S2434, 10 Memecylon_macrodendron_S2545, 11 Memecylon_pauciflorum_Flecker, 12 Memecylon_umbellatum_M2752, 13 Mouriri_crassifolia_PB35_PB927, 14 Mouriri_guianensis_Munich, 15 Mouriri_helleri_A11165, 16 Mouriri_sagotiana_M2026, 17 Spathandra_blackioides_B1078, 18 Spathandra_blackioides_JS3261, 19 Votomita_guianensis_P6c4_659, 20 Warneckea_amaniensis_S2415_S2420, 21 Warneckea_austrooccidentalis_S2516_S2518, 22 Warneckea_cinnamomoides_Meise.7, 23 Warneckea_cinnamomoides_Meise.8, 24 Warneckea_cf_erubescens_S2435, 25 Warneckea_fosteri_S2536, 26 Warneckea_hedbergiorum_S2416_S2436_S2437, 27 Warneckea_hedbergiorum_S2431, 28 Warneckea_madagascariensis_S2395, 29 Warneckea_mangrovensis_S2539, 30 Warneckea_masoalae_S2407, 31 Warneckea_melindensis_S2427.2, 32 Warneckea_melindensis_S2427.4, 33 Warneckea_melindensis_S2427.5, 34 Warneckea_membranifolia_S2448, 35 Warneckea_membranifolia_S2540_Meise.3, 36 Warneckea_mouririifolia_S2424, 37 Warneckea_mouririifolia_S2428, 38 Warneckea_pulcherrima_S2471, 39 Warneckea_pulcherrima_S2525, 40 Warneckea_sansibarica_S2423_S2426.4, 41 Warneckea_sansibarica_S2426.2, 42 Warneckea_sansibarica_S2426.3, 43 Warneckea_sapinii_S2523, 44 Warneckea_sapinii_S2552, 45 Warneckea_cf_schliebenii_L8759_L8741, 46 Warneckea_sousae_L10168, 47 Warneckea_wildeana_S2544, 48 Warneckea_yangambensis_H7867.1, 49 Warneckea_yangambensis_H7867.2, 50 Warneckea_yangambensis_H7867.3, 51 Warneckea_yangambensis_H7867.7, 52 Warneckea_yangambensis_H7867.8, 53 Warneckea_yangambensis_S2562_S2563, 54 Warneckea_sp_indet_L8777, 55 Warneckea_sp_indet_L10155; TREE Fig._4 = [&R] ((((1,2),(3,(5,(4,6))))Lijndenia,(((7,(8,(12,(10,(9,11)))))Memecylon,(17,18)Spathandra),(19,((13,16),(14,15))Mouriri))),(((((20,(26,27)),(24,54,(45,(55,(46,(36,37)))))),(28,30))Warneckea_section_Warneckea,(29,((47,((21,(38,39)),(43,44))),((((22,25),(23,34,35)),(50,53)),(49,(48,51,52))))Warneckea_section_Strychnoidea))Warneckea_subgenus_Warneckea,((31,32,33),(40,41,42))Warneckea_subgenus_Carnosa)Warneckea); END; BEGIN TREES; TITLE Tb10420; LINK TAXA = Taxa3; TRANSLATE 1 Lijndenia_barteri_S2533, 2 Lijndenia_barteri_S2548, 3 Lijndenia_cf_brenanii_S2438, 4 Lijndenia_danguyana_S2377, 5 Lijndenia_laurina_C72_C74, 6 Lijndenia_procteri_S2440, 7 Lijndenia_roborea_S2386, 8 Memecylon_lateriflorum_M1352, 9 Memecylon_albescens_S2392, 10 Memecylon_erythranthum_S2434, 11 Memecylon_macrodendron_S2545, 12 Memecylon_pauciflorum_Flecker, 13 Memecylon_umbellatum_M2752, 14 Mouriri_crassifolia_PB35_PB927, 15 Mouriri_guianensis_Munich, 16 Mouriri_helleri_A11165, 17 Mouriri_sagotiana_M2026, 18 Spathandra_blackioides_B1078, 19 Spathandra_blackioides_JS3261, 20 Votomita_guianensis_P6c4_659, 21 Warneckea_amaniensis_S2415_S2420, 22 Warneckea_austrooccidentalis_S2516_S2518, 23 Warneckea_membranifolia_S2448, 24 Warneckea_membranifolia_S2540, 25 Warneckea_cinnamomoides_Meise, 26 Warneckea_cf_erubescens_S2435, 27 Warneckea_fosteri_S2536, 28 Warneckea_hedbergiorum_S2436_2437, 29 Warneckea_hedbergiorum_S2416, 30 Warneckea_hedbergiorum_S2431, 31 Warneckea_madagascariensis_S2395, 32 Warneckea_mangrovensis_S2539, 33 Warneckea_masoalae_S2407, 34 Warneckea_melindensis_S2427, 35 Warneckea_mouririifolia_S2424, 36 Warneckea_mouririifolia_S2428, 37 Warneckea_pulcherrima_S2471, 38 Warneckea_pulcherrima_S2525, 39 Warneckea_sansibarica_S2423, 40 Warneckea_sansibarica_S2426, 41 Warneckea_sapinii_S2523, 42 Warneckea_sapinii_S2552, 43 Warneckea_cf_schliebenii_L8741, 44 Warneckea_cf_schliebenii_L8759, 45 Warneckea_sousae_L10168, 46 Warneckea_wildeana_S2544, 47 Warneckea_yangambensis_H7867, 48 Warneckea_yangambensis_S2562, 49 Warneckea_yangambensis_S2563, 50 Warneckea_sp_indet_L8777, 51 Warneckea_sp_indet_L10155; TREE Fig._6 = [&R] ((((1,2),((3,6),((4,7),5)))Lijndenia,((8,(9,(((10,12),11),13)))Memecylon,((((14,17),(15,16))Mouriri,20),(18,19)Spathandra))),((((((21,((28,29),30)),(26,((((35,36),45),51),(43,44)),50)),(31,33))Warneckea_section_Warneckea,((((22,(37,38)),(41,42)),46),(((23,24),(25,27)),(47,(48,49))))Warneckea_section_Strychnoidea),32)Warneckea_subgenus_Warneckea,(34,(39,40))Warneckea_subgenus_Carnosa)Warneckea); END; BEGIN TREES; TITLE Tb10419; LINK TAXA = Taxa1; TRANSLATE 1 Lijndenia_barteri_S2533, 2 Lijndenia_barteri_S2548, 3 Lijndenia_cf_brenanii_S2438, 4 Lijndenia_danguyana_S2377, 5 Lijndenia_laurina_C72_C74, 6 Lijndenia_procteri_S2440, 7 Lijndenia_roborea_S2386, 8 Memecylon_lateriflorum_M1352, 9 Memecylon_albescens_S2392, 10 Memecylon_erythranthum_S2434, 11 Memecylon_macrodendron_S2545, 12 Memecylon_pauciflorum_Flecker, 13 Memecylon_umbellatum_M2752, 14 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