#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on May 17, 2024; 12:20 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Archambault A., & Bruneau A. 2004. Phylogenetic utility of the LEAFY/FLORICAULA gene in the Caesalpinioideae (Leguminosae): Gene duplication and a novel insertion. Systematic Botany, 29(3): 609-626. TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1098] BEGIN TAXA; TITLE exons_only_all_seq.; DIMENSIONS NTAX=123; TAXLABELS Acacia_caven_A13 Acacia_caven_A16 Afzelia_bella_A13 Afzelia_bella_A3 Amherstia_nobilis_A1 Amherstia_nobilis_A13 Amherstia_nobilis_C1 Anthonotha_macrophylla_A1 Anthonotha_macrophylla_A10 Anthonotha_macrophylla_A9 Apios_americana_A19 Apios_americana_A7 Bauhinia_bohniana Bauhinia_syringifolia Berlinia_confusa_A2 Berlinia_confusa_A4 Berlinia_confusa_B20 Berlinia_confusa_B21 Brachystegia_laurentii_A2 Brachystegia_laurentii_A4 Brachystegia_mildbraedii Brachystegia_spiciformis Brownea_ariza_A1 Brownea_ariza_A2 Brownea_ariza_A3 Brownea_ariza_A4 Brownea_ariza_A5 Brownea_ariza_A6 Brownea_coccinea_A2 Brownea_coccinea_A4 Brownea_coccinea_B1 Brownea_coccinea_B3 Brownea_coccinea_C3 Brownea_coccinea_C5 Brownea_grandiceps_B2 Brownea_grandiceps_B3 Brownea_grandiceps_C1 Brownea_grandiceps_C7 Brownea_leucantha_A1 Brownea_leucantha_A2 Brownea_leucantha_A4 Brownea_leucantha_A5 Brownea_multijuga_A11 Brownea_multijuga_A4 Brownea_multijuga_A7 Brownea_multijuga_A9 Browneopsis_ucayalina_A3 Browneopsis_ucayalina_A5 Caesalpinia_decapatala Cercis_canadensis_A3 Cercis_canadensis_A6 Cercis_canadensis_A7 Chamaecrista_nictitans Crudia_gabonensis_A11 Crudia_gabonensis_A7 Cynometra_ramiflora_A1 Cynometra_ramiflora_A4 Cynometra_ramiflora_A5 Cynometra_ramiflora_B1 Delonix_elata_A4 Delonix_elata_A5 Delonix_elata_A6 Delonix_elata_A9 Dialium_guianensis Dussia_tessmannii Ecuadendron_acostasolisianum_A15 Ecuadendron_acostasolisianum_A7 Ecuadendron_acostasolisianum_A9 Elizabetha_paraensis_A1 Elizabetha_paraensis_A2 Englerodendron_usambarense_A1 Englerodendron_usambarense_A2 Englerodendron_usambarense_A3 Englerodendron_usambarense_B1 Englerodendron_usambarense_B2 Englerodendron_usambarense_B3 Entada_polyphylla_A10 Entada_polyphylla_A12 Eperua_falcata_A1 Eperua_falcata_A10 Eperua_falcata_A12 Eperua_falcata_A16 Eperua_falcata_A17 Eperua_falcata_A18 Eperua_falcata_A4 Eperua_falcata_A5 Eperua_falcata_A6 Gossweilerodendron_balsamifera_A2 Gossweilerodendron_balsamifera_A6 Gossweilerodendron_balsamifera_A8 Guibourtia_demeusii_B4 Guibourtia_demeusii_B5 Guibourtia_demeusii_B6 Guibourtia_demeusii_B8 Humboldtia_laurifolia_A2 Humboldtia_laurifolia_A7 Humboldtia_laurifolia_A9 Hymeneae_verrucosa Hymenostegia_ngounyensis Macrolobium_ischnocalyx_A2 Macrolobium_ischnocalyx_A4 Macrolobium_ischnocalyx_A6 Pisum_sativum Plagiosiphon_emarginatus_A1 Plagiosiphon_emarginatus_A12 Plagiosiphon_emarginatus_A3 Saraca_dives_A10 Saraca_dives_A13 Schizolobium_parahyba Schotia_afra_A13 Schotia_afra_A17 Schotia_afra_A2 Schotia_afra_A22 Scorodophleus_zenkerii_A16 Scorodophleus_zenkerii_A9 Senna_alata Tamarindus_indica_A1 Tamarindus_indica_A2 Tamarindus_indica_A4 Tamarindus_indica_A5 Tamarindus_indica_A6 Tamarindus_indica_A7 Umtiza_listeriana ; END; BEGIN TREES; TITLE Tb6742; LINK TAXA = exons_only_all_seq.; TREE PAUP_22 = [&R] (((((Umtiza_listeriana,((((Acacia_caven_A13,(Entada_polyphylla_A10,Entada_polyphylla_A12))Mimosoideae,(Chamaecrista_nictitans,Senna_alata)),(Schizolobium_parahyba,((Delonix_elata_A9,(Delonix_elata_A4,Delonix_elata_A6)),Delonix_elata_A5))),Caesalpinia_decapatala)),Dialium_guianensis),((Pisum_sativum,(Apios_americana_A19,Apios_americana_A7)),Dussia_tessmannii)Papilionoideae),(((Eperua_falcata_A17,Eperua_falcata_A5,Eperua_falcata_A6),(((((((Tamarindus_indica_A1,Tamarindus_indica_A2),Brachystegia_spiciformis),Anthonotha_macrophylla_A1,((Berlinia_confusa_B21,Berlinia_confusa_B20),Englerodendron_usambarense_B3),((Elizabetha_paraensis_A2,Elizabetha_paraensis_A1),Macrolobium_ischnocalyx_A6),Amherstia_nobilis_C1),Cynometra_ramiflora_B1,(Ecuadendron_acostasolisianum_A15,Ecuadendron_acostasolisianum_A7)),Brownea_leucantha_A2),Brownea_coccinea_B1,Brownea_coccinea_C5,Brownea_ariza_A1,Brownea_coccinea_A2),Brownea_grandiceps_C7)),((((((((Plagiosiphon_emarginatus_A1,Plagiosiphon_emarginatus_A3,Plagiosiphon_emarginatus_A12),((Cynometra_ramiflora_A1,Cynometra_ramiflora_A5),Cynometra_ramiflora_A4)),(((Gossweilerodendron_balsamifera_A8,Gossweilerodendron_balsamifera_A2,Amherstia_nobilis_A1),Gossweilerodendron_balsamifera_A6),((((Macrolobium_ischnocalyx_A2,Macrolobium_ischnocalyx_A4),Guibourtia_demeusii_B8,Guibourtia_demeusii_B4),Englerodendron_usambarense_A1),Englerodendron_usambarense_A3)),(Brachystegia_laurentii_A4,Brachystegia_mildbraedii,Brachystegia_laurentii_A2)),((Hymenostegia_ngounyensis,(Scorodophleus_zenkerii_A16,Scorodophleus_zenkerii_A9)),Crudia_gabonensis_A7)),(Saraca_dives_A13,Saraca_dives_A10),(Humboldtia_laurifolia_A9,Humboldtia_laurifolia_A7)),Afzelia_bella_A3),(Schotia_afra_A2,Schotia_afra_A17)),(((Tamarindus_indica_A7,Tamarindus_indica_A5),(Humboldtia_laurifolia_A2,(((Englerodendron_usambarense_B1,Englerodendron_usambarense_B2),(Anthonotha_macrophylla_A10,Anthonotha_macrophylla_A9),(Berlinia_confusa_A2,Berlinia_confusa_A4)),(((Brownea_ariza_A3,(Brownea_coccinea_C3,(Browneopsis_ucayalina_A3,Browneopsis_ucayalina_A5))),((Brownea_leucantha_A4,Brownea_leucantha_A5),Brownea_grandiceps_B2,Brownea_grandiceps_B3)),(((Brownea_ariza_A2,Brownea_ariza_A5),Brownea_grandiceps_C1),(Brownea_multijuga_A11,(Brownea_multijuga_A7,Brownea_multijuga_A9),Brownea_multijuga_A4)))))),((Eperua_falcata_A1,Eperua_falcata_A16,Eperua_falcata_A12),(Guibourtia_demeusii_B6,Guibourtia_demeusii_B5)))))),((Bauhinia_syringifolia,(Cercis_canadensis_A3,Cercis_canadensis_A7)),Bauhinia_bohniana)Cercideae); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr1686] END;