#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on May 12, 2024; 16:23 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Nordin A., Savić S., & Tibell L. 2010. Phylogeny and taxonomy of Aspicilia and Megasporaceae. Mycologia, 102(6): 1339-1349 . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S10678] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=62; TAXLABELS Aspicilia_caesiocinerea_T448 Aspicilia_calcarea_T513 Aspicilia_cinerea_T466 Aspicilia_cinerea_T467 Aspicilia_cuprea_T576 Aspicilia_cyanescens_T542 Aspicilia_dendroplaca_T538 Aspicilia_dendroplaca_T747 Aspicilia_desertorum_SS301 Aspicilia_dudinensis_T552 Aspicilia_dudinensis_T722 Aspicilia_emiliae_SS302 Aspicilia_emiliae_SS309 Aspicilia_epiglypta_T698 Aspicilia_farinosa_T918 Aspicilia_gibbosa_T491 Aspicilia_haeyrenii_T682 Aspicilia_hispida_T829 Aspicilia_indissimilis_T547 Aspicilia_laevata_T443 Aspicilia_laevata_T471 Aspicilia_leprosescens_T554 Aspicilia_leprosescens_T643 Aspicilia_mashiginensis_T455 Aspicilia_mastrucata_T472 Aspicilia_mastrucata_T473 Aspicilia_nikrapensis_T765 Aspicilia_permutata_T550 Aspicilia_recedens_T946 Aspicilia_rivulicola_T668 Aspicilia_simoensis_T488 Aspicilia_supertegens_T508 Aspicilia_supertegens_T610 Aspicilia_verruculosa_T507 Aspicilia_zonata_T485 Aspilidea_myrinii_T677 Coccotrema_maritimum_AF329163 Coccotrema_pocillarium_AF329166 Dibaeis_baeomyces_AY300883 Icmadophila_ericetorum_AY853327 Lepolichen_coccophorus_AF329168 Lobothallia_melanaspis_L010 Lobothallia_radiosa_DQ780274 Megaspora_verrucosa_L009 Ochrolechia_oregonensis_DQ780276 Ochrolechia_parella_AF329173 Ochrolechia_tartarea_AY300899 Ochrolechia_yasudae_DQ780282 Pertusaria_albescens_AF329175 Pertusaria_amara_AY584713 Pertusaria_coronata_AY300902 Pertusaria_hemisphaerica_DQ973000 Pertusaria_hymenea_AY567988 Pertusaria_lactea_AF381564 Pertusaria_ophthalmiza_AY567993 Pertusaria_pertusa_AF381565 Pertusaria_pustulata_DQ780295 Pertusaria_velata_AY300906 Thamnolia_vermicularis_AY853345 Trapelia_placodioides_AF431962 Trapeliopsis_granulosa_AF381567 Varicellaria_rhodocarpa_AF381569 ; END; BEGIN TREES; TITLE Megasporaceae_manus_TB; LINK TAXA = Taxa; TREE Fig._1 = [&R] ((Trapelia_placodioides_AF431962:60.0,Trapeliopsis_granulosa_AF381567:49.0):15.0,((Thamnolia_vermicularis_AY853345:40.0,(Icmadophila_ericetorum_AY853327:39.0,Dibaeis_baeomyces_AY300883:31.0):34.0):61.0,(((Pertusaria_hymenea_AY567988:15.0,(Pertusaria_pertusa_AF381565:1.0,Pertusaria_coronata_AY300902:2.0):8.0):14.0,Pertusaria_pustulata_DQ780295:35.0):63.0,((Lepolichen_coccophorus_AF329168:31.0,(Coccotrema_maritimum_AF329163:0.0,Coccotrema_pocillarium_AF329166:3.0):29.0):72.0,((((Ochrolechia_yasudae_DQ780282:31.0,Ochrolechia_oregonensis_DQ780276:35.0):11.0,Ochrolechia_tartarea_AY300899:8.0):11.0,Ochrolechia_parella_AF329173:9.0):22.0,((((Varicellaria_rhodocarpa_AF381569:17.0,(Pertusaria_velata_AY300906:52.0,(Pertusaria_lactea_AF381564:0.0,Pertusaria_hemisphaerica_DQ973000:1.0):28.0):28.0):54.0,(Pertusaria_ophthalmiza_AY567993:75.0,(Pertusaria_amara_AY584713:20.0,Pertusaria_albescens_AF329175:10.0):26.0):22.0):10.5,Aspilidea_myrinii_T677:27.0):10.5,((Lobothallia_melanaspis_L010:31.0,((Lobothallia_radiosa_DQ780274:14.0,Aspicilia_recedens_T946:18.0):16.0,Aspicilia_farinosa_T918:30.0):9.0):15.0,(((Aspicilia_mastrucata_T472:0.0,Aspicilia_mastrucata_T473:2.0):11.0,(Aspicilia_simoensis_T488:17.0,Aspicilia_zonata_T485:7.0):4.0):22.0,((Megaspora_verrucosa_L009:45.0,((Aspicilia_gibbosa_T491:23.0,(Aspicilia_leprosescens_T554:0.0,Aspicilia_leprosescens_T643:2.0):7.5):7.5,(Aspicilia_caesiocinerea_T448:10.0,(Aspicilia_calcarea_T513:22.0,((Aspicilia_desertorum_SS301:4.0,(Aspicilia_emiliae_SS302:0.0,Aspicilia_emiliae_SS309:0.0):2.0):4.0,Aspicilia_hispida_T829:9.0):9.0):3.0):4.5):4.5):8.0,(Aspicilia_epiglypta_T698:29.0,(((((((Aspicilia_dendroplaca_T538:0.0,Aspicilia_dendroplaca_T747:0.0):2.0,Aspicilia_mashiginensis_T455:5.0):3.0,Aspicilia_rivulicola_T668:7.0):5.0,Aspicilia_nikrapensis_T765:2.0):2.0,((Aspicilia_permutata_T550:4.0,Aspicilia_verruculosa_T507:8.0):4.0,(Aspicilia_supertegens_T508:1.0,Aspicilia_supertegens_T610:0.0):7.0):1.0):12.0,Aspicilia_haeyrenii_T682:14.0):8.0,(((Aspicilia_cinerea_T467:5.0,Aspicilia_cinerea_T466:2.0):1.0,(Aspicilia_dudinensis_T552:1.0,Aspicilia_dudinensis_T722:4.0):3.0):12.0,((Aspicilia_cuprea_T576:9.0,Aspicilia_cyanescens_T542:17.0):5.0,(Aspicilia_indissimilis_T547:14.0,(Aspicilia_laevata_T443:0.0,Aspicilia_laevata_T471:0.0):14.0):3.5):3.5):9.0):2.0):2.0):2.0):2.0):31.0):3.0):3.0):6.0):10.0):15.0); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr19966] END;