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TreeBASE (cc) 1994-2008

Study reference:
Bayly M.J., & Ladiges P. 2007. Divergent paralogues of ribosomal DNA in eucalypts
(Myrtaceae). Molecular Phylogenetics and Evolution, null.

TreeBASE Study URI:  http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S1705]

BEGIN TAXA;
        TITLE  pseudogenes_and_a_broad_sample_of_presumably_functional_eucalypt_rDNA_sequences;
        DIMENSIONS NTAX=68;
        TAXLABELS
            Allosyncarpia_ternata
            Angophora_bakeri
            Angophora_costata
            Angophora_melanoxylon
            Arillastrum_gummiferum
            Corymbia_eximia
            Corymbia_haematoxylon
            Corymbia_henryi
            Corymbia_maculata
            Corymbia_tessellaris
            Corymbia_trachyphloia
            Eucalyptopsis_papuana
            Eucalyptus_EUC_3_ELn
            Eucalyptus_EUC1_EA_and_EC
            Eucalyptus_EUC2_EA_and_ECn
            Eucalyptus_acies
            Eucalyptus_acies_pseudo
            Eucalyptus_amygdalina
            Eucalyptus_balladoniensis
            Eucalyptus_brachyandra
            Eucalyptus_brevistylis
            Eucalyptus_camaldulensis
            Eucalyptus_cloeziana_1
            Eucalyptus_coccifera_2
            Eucalyptus_curtisii_1
            Eucalyptus_curtisii_2
            Eucalyptus_deglupta_1
            Eucalyptus_diversicolor
            Eucalyptus_diversifolia
            Eucalyptus_dives
            Eucalyptus_erythrocorys
            Eucalyptus_eudesmoides
            Eucalyptus_gamophylla
            Eucalyptus_globoidea
            Eucalyptus_globoidea_pseudo
            Eucalyptus_grandis_1
            Eucalyptus_guilfoylei
            Eucalyptus_hallii
            Eucalyptus_insularis
            Eucalyptus_insularis_pseudo
            Eucalyptus_lacrimans
            Eucalyptus_lacrimans_pseudo
            Eucalyptus_lansdowneana
            Eucalyptus_latisinensis
            Eucalyptus_leucophloia
            Eucalyptus_megacarpa
            Eucalyptus_microcorys
            Eucalyptus_nitens_2
            Eucalyptus_obliqua
            Eucalyptus_pachyphylla
            Eucalyptus_paliformis
            Eucalyptus_paliformis_pseudo
            Eucalyptus_pauciflora
            Eucalyptus_pilularis
            Eucalyptus_pulchella_1
            Eucalyptus_radiata
            Eucalyptus_regnans
            Eucalyptus_rubiginosa
            Eucalyptus_sepulcralis
            Eucalyptus_sepulcralis_pseudo
            Eucalyptus_sieberi
            Eucalyptus_spectatrix
            Eucalyptus_spectatrix_pseudo
            Eucalyptus_tenuipes
            Eucalyptus_triflora
            Eucalyptus_triflora_pseudo
            Eucalyptus_umbra
            Stockwellia_quadrifida
            ;
END;

BEGIN TREES;
      TITLE Tb8149;
      LINK TAXA = pseudogenes_and_a_broad_sample_of_presumably_functional_eucalypt_rDNA_sequences;
      TREE Fig._5 = [&R] ((((((((((((((((Eucalyptus_EUC2_EA_and_ECn,Eucalyptus_dives,Eucalyptus_radiata),Eucalyptus_coccifera_2),(((Eucalyptus_pilularis,Eucalyptus_obliqua),Eucalyptus_regnans),Eucalyptus_EUC1_EA_and_EC,Eucalyptus_paliformis),Eucalyptus_pauciflora,Eucalyptus_pulchella_1,Eucalyptus_amygdalina,Eucalyptus_triflora,Eucalyptus_lacrimans,Eucalyptus_spectatrix,Eucalyptus_globoidea),Eucalyptus_sieberi),Eucalyptus_rubiginosa,Eucalyptus_umbra,Eucalyptus_latisinensis),Eucalyptus_diversifolia,(Eucalyptus_acies,Eucalyptus_sepulcralis),Eucalyptus_insularis),(Eucalyptus_brevistylis,Eucalyptus_EUC_3_ELn)),Eucalyptus_megacarpa),Eucalyptus_cloeziana_1),(((Eucalyptus_acies_pseudo,Eucalyptus_sepulcralis_pseudo),Eucalyptus_insularis_pseudo),(((Eucalyptus_lacrimans_pseudo,Eucalyptus_paliformis_pseudo,Eucalyptus_spectatrix_pseudo),Eucalyptus_globoidea_pseudo),Eucalyptus_triflora_pseudo))),Eucalyptus_tenuipes),(((Eucalyptus_leucophloia,Eucalyptus_lansdowneana),(((((Eucalyptus_camaldulensis,Eucalyptus_grandis_1),Eucalyptus_nitens_2),Eucalyptus_hallii),(Eucalyptus_deglupta_1,Eucalyptus_brachyandra)),((Eucalyptus_diversicolor,(Eucalyptus_pachyphylla,Eucalyptus_balladoniensis)),Eucalyptus_guilfoylei))),Eucalyptus_microcorys)),((Eucalyptus_eudesmoides,Eucalyptus_gamophylla),Eucalyptus_erythrocorys)),(Eucalyptus_curtisii_1,Eucalyptus_curtisii_2)),(((Corymbia_trachyphloia,Corymbia_haematoxylon),(((Corymbia_maculata,Corymbia_henryi),(Corymbia_tessellaris,Corymbia_eximia)),((Angophora_bakeri,Angophora_costata),Angophora_melanoxylon))),(Stockwellia_quadrifida,(Allosyncarpia_ternata,Eucalyptopsis_papuana)))),Arillastrum_gummiferum);
[!  TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr2651]


END;