#NEXUS

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TreeBASE (cc) 1994-2008

Study reference:
Kubatko L., Gibbs H.L., & Bloomquist E.W. 2011. Inferring Species-Level Phylogenies
and Taxonomic Distinctiveness Using Multi-Locus Data In Sistrurus Rattlesnakes.
Systematic Biology, .

TreeBASE Study URI:  http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S11174]

BEGIN TAXA;
        TITLE  taxa;
        DIMENSIONS NTAX=52;
        TAXLABELS
            Agkistrodon_contortrix_1
            Agkistrodon_contortrix_2
            Agkistrodon_piscivorus_1
            Agkistrodon_piscivorus_2
            Sistrurus_catenatus_catenatus_IL1_1
            Sistrurus_catenatus_catenatus_IL1_2
            Sistrurus_catenatus_catenatus_IL2_1
            Sistrurus_catenatus_catenatus_IL2_2
            Sistrurus_catenatus_catenatus_MI_1
            Sistrurus_catenatus_catenatus_MI_2
            Sistrurus_catenatus_catenatus_NY_1
            Sistrurus_catenatus_catenatus_NY_2
            Sistrurus_catenatus_catenatus_OH_1
            Sistrurus_catenatus_catenatus_OH_2
            Sistrurus_catenatus_catenatus_ON1_1
            Sistrurus_catenatus_catenatus_ON1_2
            Sistrurus_catenatus_catenatus_ON2_1
            Sistrurus_catenatus_catenatus_ON2_2
            Sistrurus_catenatus_catenatus_PA_1
            Sistrurus_catenatus_catenatus_PA_2
            Sistrurus_catenatus_catenatus_WI_1
            Sistrurus_catenatus_catenatus_WI_2
            Sistrurus_catenatus_edwardsii_AZ_1
            Sistrurus_catenatus_edwardsii_AZ_2
            Sistrurus_catenatus_edwardsii_CO_1
            Sistrurus_catenatus_edwardsii_CO_2
            Sistrurus_catenatus_edwardsii_NM1_1
            Sistrurus_catenatus_edwardsii_NM1_2
            Sistrurus_catenatus_edwardsii_NM2_1
            Sistrurus_catenatus_edwardsii_NM2_2
            Sistrurus_catenatus_tergeminus_KS1_1
            Sistrurus_catenatus_tergeminus_KS1_2
            Sistrurus_catenatus_tergeminus_KS2_1
            Sistrurus_catenatus_tergeminus_KS2_2
            Sistrurus_catenatus_tergeminus_KS3_1
            Sistrurus_catenatus_tergeminus_KS3_2
            Sistrurus_catenatus_tergeminus_MO1_1
            Sistrurus_catenatus_tergeminus_MO1_2
            Sistrurus_catenatus_tergeminus_MO2_1
            Sistrurus_catenatus_tergeminus_MO2_2
            Sistrurus_miliarius_barbouri_FL1_1
            Sistrurus_miliarius_barbouri_FL1_2
            Sistrurus_miliarius_barbouri_FL2_1
            Sistrurus_miliarius_barbouri_FL2_2
            Sistrurus_miliarius_barbouri_FL3_1
            Sistrurus_miliarius_barbouri_FL3_2
            Sistrurus_miliarius_miliarius_NC_1
            Sistrurus_miliarius_miliarius_NC_2
            Sistrurus_miliarius_streckeri_OK1_1
            Sistrurus_miliarius_streckeri_OK1_2
            Sistrurus_miliarius_streckeri_OK2_1
            Sistrurus_miliarius_streckeri_OK2_2
            ;
END;

BEGIN TREES;
      TITLE Sistrurus_TB;
      LINK TAXA = taxa;
      TREE CL51A = [&R] (((Agkistrodon_contortrix_1:0.002662,Agkistrodon_contortrix_2:0.001346):0.003119,(Agkistrodon_piscivorus_1:0.001394,Agkistrodon_piscivorus_2:0.001364):0.002675):0.0089615,((Sistrurus_catenatus_catenatus_IL1_1:0.001388,Sistrurus_catenatus_catenatus_IL1_2:0.001356,Sistrurus_catenatus_catenatus_IL2_1:0.001373,Sistrurus_catenatus_catenatus_IL2_2:0.001366,Sistrurus_catenatus_catenatus_MI_1:0.001389,Sistrurus_catenatus_catenatus_MI_2:0.001389,Sistrurus_catenatus_catenatus_NY_1:0.001386,Sistrurus_catenatus_catenatus_NY_2:0.001375,Sistrurus_catenatus_catenatus_OH_1:0.001391,Sistrurus_catenatus_catenatus_OH_2:0.001376,Sistrurus_catenatus_catenatus_ON1_1:0.001372,Sistrurus_catenatus_catenatus_ON1_2:0.001375,Sistrurus_catenatus_catenatus_ON2_1:0.001368,Sistrurus_catenatus_catenatus_ON2_2:0.001387,Sistrurus_catenatus_catenatus_PA_1:0.001369,Sistrurus_catenatus_catenatus_PA_2:0.002761,Sistrurus_catenatus_catenatus_WI_1:0.0014,Sistrurus_catenatus_catenatus_WI_2:0.001348):0.003433,(Sistrurus_catenatus_edwardsii_AZ_1:0.001357,Sistrurus_catenatus_edwardsii_AZ_2:0.001382,Sistrurus_catenatus_edwardsii_CO_1:0.001392,Sistrurus_catenatus_edwardsii_NM2_1:0.001366,Sistrurus_catenatus_edwardsii_NM2_2:0.001352,Sistrurus_catenatus_tergeminus_MO1_1:0.001387,Sistrurus_catenatus_tergeminus_MO1_2:0.001399,(Sistrurus_catenatus_edwardsii_NM1_1:0.0014,Sistrurus_catenatus_edwardsii_NM1_2:0.001374):0.002797,(Sistrurus_catenatus_tergeminus_MO2_1:0.001466,Sistrurus_catenatus_tergeminus_MO2_2:0.001459):0.002709,(Sistrurus_catenatus_edwardsii_CO_2:0.001523,(Sistrurus_catenatus_tergeminus_KS3_1:0.001488,(Sistrurus_catenatus_tergeminus_KS1_1:0.001388,Sistrurus_catenatus_tergeminus_KS1_2:0.001357,Sistrurus_catenatus_tergeminus_KS2_1:0.001397,Sistrurus_catenatus_tergeminus_KS2_2:0.001373,Sistrurus_catenatus_tergeminus_KS3_2:0.001381):0.00279):0.003012):0.002671,(Sistrurus_miliarius_barbouri_FL1_1:0.001366,Sistrurus_miliarius_barbouri_FL1_2:0.001373,Sistrurus_miliarius_barbouri_FL2_1:0.001368,Sistrurus_miliarius_barbouri_FL2_2:0.001367,Sistrurus_miliarius_barbouri_FL3_1:0.001397,Sistrurus_miliarius_barbouri_FL3_2:0.001363,Sistrurus_miliarius_miliarius_NC_1:0.001392,Sistrurus_miliarius_miliarius_NC_2:0.001375,(Sistrurus_miliarius_streckeri_OK1_1:0.001392,Sistrurus_miliarius_streckeri_OK1_2:0.001394,Sistrurus_miliarius_streckeri_OK2_1:0.001383,Sistrurus_miliarius_streckeri_OK2_2:0.00138):0.002791):0.005413):0.00365):0.0089615);
[!  TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr27445]


END;