#NEXUS

[!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file.


Generated on April 24, 2024; 15:52 GMT

TreeBASE (cc) 1994-2008

Study reference:
Hunter R., & Halanych K. 2008. Evaluating connectivity in the brooding brittle star
Astrotoma agassizii across the Drake Passage in the Southern Ocean. Journal of
Heredity, 99: 137-148.

TreeBASE Study URI:  http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S2013]

BEGIN TAXA;
        TITLE  COII___16S_rDNA_combined;
        DIMENSIONS NTAX=65;
        TAXLABELS
            Astrohamma_tuberculatum_1
            Astrohamma_tuberculatum_2
            Astrotoma_agassizii_St_1.1
            Astrotoma_agassizii_St_1.2
            Astrotoma_agassizii_St_1.3
            Astrotoma_agassizii_St_1.4
            Astrotoma_agassizii_St_1.5
            Astrotoma_agassizii_St_1.6
            Astrotoma_agassizii_St_1.7
            Astrotoma_agassizii_St_1.8
            Astrotoma_agassizii_St_14.1
            Astrotoma_agassizii_St_14.2
            Astrotoma_agassizii_St_14.3
            Astrotoma_agassizii_St_14.4
            Astrotoma_agassizii_St_3.1
            Astrotoma_agassizii_St_3.2
            Astrotoma_agassizii_St_3.3
            Astrotoma_agassizii_St_3.4
            Astrotoma_agassizii_St_4.1
            Astrotoma_agassizii_St_4.2
            Astrotoma_agassizii_St_4.3
            Astrotoma_agassizii_St_4.4
            Astrotoma_agassizii_St_4.5
            Astrotoma_agassizii_St_4.6
            Astrotoma_agassizii_St_47.1
            Astrotoma_agassizii_St_5.1
            Astrotoma_agassizii_St_5.2
            Astrotoma_agassizii_St_5.3
            Astrotoma_agassizii_St_5.4
            Astrotoma_agassizii_St_5.5
            Astrotoma_agassizii_St_5.6
            Astrotoma_agassizii_St_5.7
            Astrotoma_agassizii_St_5.8
            Astrotoma_agassizii_St_7a
            Astrotoma_agassizii_St_8.1
            Astrotoma_agassizii_St_8.2
            Astrotoma_agassizii_St_82.1
            Astrotoma_agassizii_St_82.2
            Astrotoma_agassizii_St_82.3
            Astrotoma_agassizii_St_82.4
            Astrotoma_agassizii_St_82.5
            Astrotoma_agassizii_St_85.3
            Astrotoma_agassizii_St_9.1
            Astrotoma_agassizii_St_9.2
            Astrotoma_agassizii_St_9.3
            Astrotoma_agassizii_St_9.4
            Astrotoma_agassizii_St_9.5
            Astrotoma_agassizii_St_9.6
            Astrotoma_agassizii_St_9.7
            Astrotoma_agassizii_St_9.8
            Astrotoma_agassizii_Sts_1_18
            Astrotoma_agassizii_Sts_3_5_8_9
            Astrotoma_agassizii_Sts_31_47_82_85
            Astrotoma_agassizii_Sts_4_14
            Astrotoma_agassizii_Sts_4_5_14
            Astrotoma_agassizii_Sts_4_7b_14
            Astrotoma_agassizii_Sts_47_78
            Astrotoma_agassizii_Sts_47_82
            Astrotoma_agassizii_Sts_47_82_85.1
            Astrotoma_agassizii_Sts_47_82_85.2
            Astrotoma_agassizii_Sts_5_6.1
            Astrotoma_agassizii_Sts_5_6.2
            Astrotoma_agassizii_Sts_5_7b
            Astrotoma_agassizii_Sts_8_9
            Astrotoma_agassizii_Sts_9_18
            ;
END;

BEGIN TREES;
      TITLE Tb8946;
      LINK TAXA = COII___16S_rDNA_combined;
      TREE Fig._2 = [&R] (Astrohamma_tuberculatum_2,Astrohamma_tuberculatum_1,(((((Astrotoma_agassizii_St_7a,(Astrotoma_agassizii_St_9.5,Astrotoma_agassizii_Sts_1_18),(Astrotoma_agassizii_St_1.7,Astrotoma_agassizii_St_8.1),Astrotoma_agassizii_St_8.2),(Astrotoma_agassizii_St_1.3,Astrotoma_agassizii_St_1.6)),((Astrotoma_agassizii_Sts_8_9,(Astrotoma_agassizii_St_9.1,Astrotoma_agassizii_St_9.2,Astrotoma_agassizii_Sts_3_5_8_9,(Astrotoma_agassizii_St_9.3,Astrotoma_agassizii_St_9.8),(Astrotoma_agassizii_Sts_9_18,Astrotoma_agassizii_St_9.7),Astrotoma_agassizii_St_9.4,Astrotoma_agassizii_St_9.6,Astrotoma_agassizii_St_1.8,Astrotoma_agassizii_St_3.1),Astrotoma_agassizii_St_1.1,(Astrotoma_agassizii_St_1.2,Astrotoma_agassizii_St_1.4,Astrotoma_agassizii_St_1.5),Astrotoma_agassizii_St_3.2,Astrotoma_agassizii_St_3.3),Astrotoma_agassizii_St_3.4),Astrotoma_agassizii_Sts_5_7b,Astrotoma_agassizii_Sts_5_6.1,(Astrotoma_agassizii_St_5.1,(Astrotoma_agassizii_Sts_5_6.2,Astrotoma_agassizii_St_5.8)),Astrotoma_agassizii_St_5.2,Astrotoma_agassizii_St_5.3,Astrotoma_agassizii_St_5.4,Astrotoma_agassizii_St_5.5,Astrotoma_agassizii_St_5.6,Astrotoma_agassizii_St_5.7),((Astrotoma_agassizii_Sts_4_7b_14,(Astrotoma_agassizii_Sts_4_14,Astrotoma_agassizii_St_4.2),Astrotoma_agassizii_St_4.4,Astrotoma_agassizii_St_4.5),(Astrotoma_agassizii_St_14.1,Astrotoma_agassizii_Sts_4_5_14,Astrotoma_agassizii_St_14.2,Astrotoma_agassizii_St_14.3,Astrotoma_agassizii_St_14.4,Astrotoma_agassizii_St_4.1,Astrotoma_agassizii_St_4.3,Astrotoma_agassizii_St_4.6))),(Astrotoma_agassizii_St_47.1,(Astrotoma_agassizii_Sts_47_82_85.1,Astrotoma_agassizii_Sts_47_82,Astrotoma_agassizii_St_82.3),Astrotoma_agassizii_Sts_31_47_82_85,Astrotoma_agassizii_Sts_47_82_85.2,(Astrotoma_agassizii_Sts_47_78,Astrotoma_agassizii_St_82.4),Astrotoma_agassizii_St_82.1,Astrotoma_agassizii_St_82.2,Astrotoma_agassizii_St_85.3,Astrotoma_agassizii_St_82.5)));
[!  TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr3006]


END;