#NEXUS [!This data set was downloaded from TreeBASE, a relational database of phylogenetic knowledge. TreeBASE has been supported by the NSF, Harvard University, Yale University, SDSC and UC Davis. Please do not remove this acknowledgment from the Nexus file. Generated on May 24, 2024; 18:42 GMT TreeBASE (cc) 1994-2008 Study reference: Symmank L., Samain M., Smith J., Pino G., Stoll A., Goetghebeur P., Neinhuis C., & Wanke S. 2011. The extraordinary journey of Peperomia subgenus Tildenia: biogeographic insights into diversification and colonization patterns from its origin in Peru to the Trans-Mexican Volcanic Belt. Journal of Biogeography, . TreeBASE Study URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/study/TB2:S11468] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=209; TAXLABELS Gymnotheca_chinensis Houttuynia_cordata Peperomia_albonervosa_Pe22 Peperomia_albonervosa_Pe26 Peperomia_ampla_Pe206 Peperomia_andina_GP919 Peperomia_andina_Pe359 Peperomia_andina_Pe393 Peperomia_andina_Pe492 Peperomia_andina_Pe500 Peperomia_ayacuchoana_GP1114 Peperomia_ayacuchoana_Pe428 Peperomia_ayacuchoana_Pe429 Peperomia_ayacuchoana_Pe430 Peperomia_basiradicans_Pe11 Peperomia_basiradicans_Pe4 Peperomia_bracteata_Pe17 Peperomia_bracteata_Pe18 Peperomia_bracteata_Pe19 Peperomia_bracteata_Pe247 Peperomia_bracteata_Pe249 Peperomia_bracteata_Pe256 Peperomia_bracteata_Pe28 Peperomia_bracteata_Pe29 Peperomia_bracteata_Pe31 Peperomia_bracteata_Pe32 Peperomia_bracteata_Pe33 Peperomia_bracteata_Pe346 Peperomia_bracteata_Pe46 Peperomia_bracteata_Pe523 Peperomia_bracteata_Pe525 Peperomia_bracteata_Pe527 Peperomia_bracteata_Pe528 Peperomia_bracteata_Pe529 Peperomia_bracteata_Pe530 Peperomia_bracteata_Pe531 Peperomia_bracteata_Pe532 Peperomia_bracteata_Pe533 Peperomia_bracteata_Pe534 Peperomia_bracteata_aff_Pe255 Peperomia_cavispicata_Pe14 Peperomia_cavispicata_Pe3 Peperomia_cerrateae_Pe111 Peperomia_cerrateae_Pe171 Peperomia_cerrateae_Pe222 Peperomia_cerrateae_Pe353 Peperomia_cerrateae_Pe371 Peperomia_cerrateae_Pe408 Peperomia_cerrateae_Pe417 Peperomia_cerrateae_Pe433 Peperomia_cerrateae_Pe434 Peperomia_chutanka_Pe436 Peperomia_claytonioides_Pe202 Peperomia_cuchumatanica_Pe348 Peperomia_cyclaminoides_Pe110 Peperomia_cyclaminoides_Pe114 Peperomia_cyclaminoides_Pe115 Peperomia_cyclaminoides_Pe117 Peperomia_cyclaminoides_Pe118 Peperomia_cyclaminoides_Pe218 Peperomia_cyclaminoides_Pe219 Peperomia_cyclaminoides_Pe220 Peperomia_dolabella_P152 Peperomia_dolabella_Pe392 Peperomia_dolabella_Pe396 Peperomia_dolabella_RM254 Peperomia_elatior_Pe12 Peperomia_exclamationis_Pe25 Peperomia_gigantea_Pe358 Peperomia_gracillima_aff_Pe16 Peperomia_gracillima_aff_Pe23 Peperomia_hispidula_Pe503 Peperomia_hispiduliformis_Pe169 Peperomia_jalcaensis_Pe394 Peperomia_klopfensteinii_Pe356 Peperomia_klopfensteinii_Pe384 Peperomia_klopfensteinii_Pe397 Peperomia_lilliputiana_Pe361 Peperomia_lilliputiana_Pe370 Peperomia_macrandra_Pe13 Peperomia_macrandra_Pe201 Peperomia_macrandra_Pe203 Peperomia_macrandra_Pe205 Peperomia_macrandra_Pe260 Peperomia_macrandra_Pe50 Peperomia_macrorhiza_Pe354 Peperomia_macrorhiza_RM275 Peperomia_mandonii_Pe170 Peperomia_mexicana_Pe200 Peperomia_mexicana_Pe252 Peperomia_mexicana_Pe45 Peperomia_monticola_Pe257 Peperomia_moralesii_Pe347 Peperomia_occulta_Pe49 Peperomia_occulta_Pe582 Peperomia_occulta_Pe583 Peperomia_ocrosensis_Pe355 Peperomia_ovatopeltata_Pe20 Peperomia_ovatopeltata_Pe30 Peperomia_ovatopeltata_Pe42 Peperomia_ovatopeltata_aff_Pe41 Peperomia_ovatopeltata_aff_Pe43 Peperomia_ovatopeltata_aff_Pe44 Peperomia_parvifolia_Pe172 Peperomia_parvifolia_Pe357 Peperomia_parvifolia_Pe420 Peperomia_parvifolia_Pe427 Peperomia_parvisagittata_Pe113 Peperomia_parvisagittata_Pe352 Peperomia_parvisagittata_Pe409 Peperomia_pedicellata_Pe36 Peperomia_pedicellata_Pe37 Peperomia_peruviana_Pe104 Peperomia_peruviana_Pe108 Peperomia_peruviana_Pe109 Peperomia_peruviana_Pe112 Peperomia_peruviana_Pe116 Peperomia_peruviana_Pe119 Peperomia_peruviana_Pe120 Peperomia_peruviana_Pe168 Peperomia_peruviana_Pe173 Peperomia_peruviana_Pe188 Peperomia_peruviana_Pe208 Peperomia_peruviana_Pe212 Peperomia_peruviana_Pe438 Peperomia_peruviana_Pe440 Peperomia_peruviana_Pe441 Peperomia_peruviana_Pe80 Peperomia_peruviana_Pe82 Peperomia_polycephala_Pe135 Peperomia_polycephala_Pe443 Peperomia_polycephala_Pe445 Peperomia_polycephala_Pe446 Peperomia_polycephala_Pe450 Peperomia_polycephala_Pe451 Peperomia_polycephala_Pe574 Peperomia_pseudoperuviana_P151 Peperomia_pseudoperuviana_Pe575 Peperomia_pseudoverruculosa_Pe426 Peperomia_pseudoverruculosa_Pe432 Peperomia_pseudoverruculosa_Pe437 Peperomia_pseudoverruculosa_Pe455 Peperomia_pseudoverruculosa_Pe456 Peperomia_pseudoverruculosa_Pe457 Peperomia_pseudoverruculosa_Pe567 Peperomia_pseudoverruculosa_Pe568 Peperomia_pseudoverruculosa_Pe571 Peperomia_pugnicaudex_Pe412 Peperomia_purpureonervosa_Pe174 Peperomia_putlaensis_Pe48 Peperomia_putlaensis_Pe9 Peperomia_querocochana_Pe372 Peperomia_querocochana_Pe566 Peperomia_questionis_Pe15 Peperomia_questionis_Pe588 Peperomia_radiatinervosa_Pe121 Peperomia_radiatinervosa_Pe209 Peperomia_radiatinervosa_Pe211 Peperomia_radiatinervosa_Pe215 Peperomia_radiatinervosa_Pe217 Peperomia_radiatinervosa_Pe61 Peperomia_radiatinervosa_Pe62 Peperomia_radiatinervosa_Pe81 Peperomia_rupiseda_Pe350 Peperomia_rupiseda_Pe367 Peperomia_rupiseda_Pe407 Peperomia_rupiseda_Pe413 Peperomia_rupiseda_Pe576 Peperomia_schizandra_Pe21 Peperomia_schizandra_Pe24 Peperomia_schizandra_Pe265 Peperomia_schizandra_Pe27 Peperomia_schizandra_aff_Pe250 Peperomia_scutellifolia_Pe579 Peperomia_sp_Pe421 Peperomia_sp_Pe422 Peperomia_species_Pe2 Peperomia_tepoztecoana_Pe10 Peperomia_umbilicata_Pe324 Peperomia_umbilicata_Pe578 Peperomia_umbilicata_Pe580 Peperomia_umbilicata_Pe581 Peperomia_umbrosa_Pe395 Peperomia_umbrosa_Pe479 Peperomia_umbrosa_Pe570 Peperomia_verruculosa_Pe105 Peperomia_verruculosa_Pe351 Peperomia_verruculosa_Pe410 Peperomia_verruculosa_Pe414 Peperomia_verruculosa_Pe415 Peperomia_verruculosa_Pe416 Peperomia_verruculosa_Pe418 Peperomia_verruculosa_Pe419 Peperomia_verruculosa_Pe424 Peperomia_verruculosa_Pe425 Peperomia_verruculosa_Pe435 Peperomia_verruculosa_Pe442 Peperomia_verruculosa_Pe453 Peperomia_verruculosa_Pe454 Peperomia_verruculosa_Pe478 Peperomia_verruculosa_Pe569 Peperomia_verruculosa_Pe572 Peperomia_verruculosa_Pe573 Peperomia_wernerrauhii_Pe481 Peperomia_wernerrauhii_Pe482 Peperomia_wernerrauhii_Pe487 Piper_crocatum Saururus_cernuus Saururus_chinensis ; END; BEGIN TREES; TITLE Tildenia_full_phylogeny; LINK TAXA = Taxa; TREE tree1 = [&R] ((Houttuynia_cordata:0.029558,(Gymnotheca_chinensis:0.02895,(Saururus_chinensis:0.009033,Saururus_cernuus:0.001881):0.020495):0.006956):0.0609665,(Piper_crocatum:0.031443,((Peperomia_mandonii_Pe170:0.087818,(Peperomia_hispiduliformis_Pe169:0.004175,Peperomia_hispidula_Pe503:0.007755):0.059413):0.007693,(((Peperomia_gigantea_Pe358:0.008095,(Peperomia_klopfensteinii_Pe384:0.010698,(Peperomia_klopfensteinii_Pe356:0.002538,Peperomia_klopfensteinii_Pe397:0.003134):0.01159):0.001718):0.002789,(Peperomia_rupiseda_Pe367:0.005169,(Peperomia_rupiseda_Pe576:0.004413,(Peperomia_rupiseda_Pe350:0.00182,(Peperomia_rupiseda_Pe407:0.001983,Peperomia_rupiseda_Pe413:0.002372):0.001682):0.001952):0.001068):0.006653):0.008557,(((((Peperomia_sp_Pe421:0.001164,Peperomia_sp_Pe422:3.73E-4):0.00527,(Peperomia_umbrosa_Pe395:0.001137,(Peperomia_umbrosa_Pe479:3.96E-4,Peperomia_umbrosa_Pe570:4.1E-4):0.002036):0.00579):0.0038,(Peperomia_polycephala_Pe443:0.004219,(Peperomia_polycephala_Pe135:4.24E-4,Peperomia_polycephala_Pe451:7.74E-4):0.004096,(Peperomia_polycephala_Pe446:0.004039,Peperomia_polycephala_Pe450:0.002832,Peperomia_polycephala_Pe445:0.001182,Peperomia_polycephala_Pe574:0.00195):0.00279):0.0079):8.15E-4,(Peperomia_purpureonervosa_Pe174:0.010002,(Peperomia_peruviana_Pe173:0.006961,((Peperomia_peruviana_Pe168:0.001187,Peperomia_peruviana_Pe440:7.82E-4,(Peperomia_peruviana_Pe441:0.005664,Peperomia_peruviana_Pe438:0.001649):0.00124):0.001391,(Peperomia_peruviana_Pe80:3.83E-4,Peperomia_peruviana_Pe188:3.77E-4,Peperomia_peruviana_Pe104:3.8E-4,Peperomia_peruviana_Pe108:3.88E-4,Peperomia_peruviana_Pe109:3.94E-4,Peperomia_peruviana_Pe112:3.91E-4,Peperomia_peruviana_Pe82:3.83E-4,Peperomia_peruviana_Pe120:7.82E-4,Peperomia_peruviana_Pe119:9.32E-4,(Peperomia_peruviana_Pe116:3.77E-4,Peperomia_peruviana_Pe212:3.8E-4,Peperomia_peruviana_Pe208:7.59E-4):7.69E-4):8.93E-4):0.003119):0.004207):0.002753):0.01078,((Peperomia_pugnicaudex_Pe412:0.005376,(Peperomia_ocrosensis_Pe355:0.002782,Peperomia_querocochana_Pe372:3.91E-4,Peperomia_querocochana_Pe566:0.002318):0.007176):0.001085,(Peperomia_scutellifolia_Pe579:0.012452,(Peperomia_parvisagittata_Pe113:0.006381,(Peperomia_parvisagittata_Pe409:0.005643,Peperomia_parvisagittata_Pe352:0.01074):0.001257):0.009862,((Peperomia_cerrateae_Pe371:0.001614,Peperomia_cerrateae_Pe408:0.001744):0.006916,(Peperomia_cerrateae_Pe353:0.007155,(Peperomia_cerrateae_Pe433:0.002602,(Peperomia_cerrateae_Pe417:9.66E-4,(Peperomia_cerrateae_Pe434:0.003268,(Peperomia_cerrateae_Pe222:7.87E-4,Peperomia_cerrateae_Pe111:7.91E-4,Peperomia_cerrateae_Pe171:0.001207):0.001195):0.001017):0.001189):0.003851):0.00383):0.002366,((Peperomia_ayacuchoana_Pe428:3.98E-4,Peperomia_ayacuchoana_Pe429:0.001177,(Peperomia_ayacuchoana_Pe430:0.002411,Peperomia_ayacuchoana_GP1114:0.001192):7.85E-4):0.004937,((Peperomia_pseudoverruculosa_Pe457:0.009195,(Peperomia_pseudoverruculosa_Pe456:0.001616,Peperomia_pseudoverruculosa_Pe455:0.002304):7.65E-4):0.005287,((Peperomia_pseudoverruculosa_Pe568:0.002181,Peperomia_pseudoverruculosa_Pe437:0.004295):0.001202,(Peperomia_pseudoverruculosa_Pe571:0.006078,(Peperomia_pseudoverruculosa_Pe567:0.001788,(Peperomia_pseudoverruculosa_Pe426:3.92E-4,Peperomia_pseudoverruculosa_Pe432:7.7E-4):0.001296):0.004288):0.001182):0.001285):0.00124):0.003365):0.002478,((Peperomia_umbilicata_Pe581:0.001154,(Peperomia_umbilicata_Pe580:3.85E-4,Peperomia_umbilicata_Pe324:0.001543,Peperomia_umbilicata_Pe578:3.9E-4):0.002326):0.012528,((Peperomia_macrorhiza_RM275:0.001378,Peperomia_jalcaensis_Pe394:0.002798):8.1E-4,((Peperomia_dolabella_RM254:6.93E-4,Peperomia_andina_GP919:0.001166,Peperomia_dolabella_P152:0.003161,(Peperomia_dolabella_Pe396:7.88E-4,(Peperomia_dolabella_Pe392:7.75E-4,Peperomia_andina_Pe393:3.92E-4):7.82E-4):7.79E-4):0.001777,((Peperomia_pseudoperuviana_P151:0.002106,Peperomia_pseudoperuviana_Pe575:3.7E-4):0.002005,(Peperomia_wernerrauhii_Pe487:3.95E-4,Peperomia_lilliputiana_Pe370:0.002322,Peperomia_andina_Pe492:0.001508,Peperomia_wernerrauhii_Pe481:3.83E-4,Peperomia_andina_Pe500:7.8E-4,(Peperomia_parvifolia_Pe172:0.001157,Peperomia_wernerrauhii_Pe482:0.003896):0.001567,(Peperomia_lilliputiana_Pe361:0.001545,Peperomia_macrorhiza_Pe354:3.9E-4):7.71E-4,(Peperomia_parvifolia_Pe357:8.05E-4,Peperomia_andina_Pe359:0.001891):8.51E-4,(Peperomia_cuchumatanica_Pe348:6.78E-4,(Peperomia_parvifolia_Pe427:0.001165,Peperomia_parvifolia_Pe420:0.001562):7.07E-4):7.75E-4):0.001567):0.001078):0.002529):0.007024):0.00163,((Peperomia_radiatinervosa_Pe61:0.001996,Peperomia_radiatinervosa_Pe81:0.001953,(Peperomia_radiatinervosa_Pe62:0.001174,(Peperomia_radiatinervosa_Pe215:7.97E-4,Peperomia_radiatinervosa_Pe209:8.33E-4):0.002095,(Peperomia_radiatinervosa_Pe217:3.92E-4,(Peperomia_radiatinervosa_Pe211:0.003204,Peperomia_radiatinervosa_Pe121:0.002031):7.87E-4):0.001181):8.17E-4):0.001259,((Peperomia_cyclaminoides_Pe218:0.001174,Peperomia_cyclaminoides_Pe219:0.003121,(Peperomia_cyclaminoides_Pe114:7.9E-4,Peperomia_cyclaminoides_Pe110:7.88E-4,Peperomia_cyclaminoides_Pe118:3.9E-4,Peperomia_cyclaminoides_Pe117:7.82E-4,(Peperomia_cyclaminoides_Pe115:0.001472,Peperomia_cyclaminoides_Pe220:9.37E-4):0.001184):7.39E-4):0.002361,(Peperomia_verruculosa_Pe569:0.001186,(Peperomia_verruculosa_Pe435:0.003537,Peperomia_verruculosa_Pe573:3.89E-4):7.75E-4,(Peperomia_verruculosa_Pe478:3.91E-4,(Peperomia_verruculosa_Pe572:3.9E-4,(Peperomia_verruculosa_Pe105:7.87E-4,Peperomia_verruculosa_Pe410:0.001572,(Peperomia_verruculosa_Pe351:0.003287,Peperomia_verruculosa_Pe453:0.011705):7.66E-4,(Peperomia_verruculosa_Pe414:0.002894,Peperomia_verruculosa_Pe415:0.00116,Peperomia_verruculosa_Pe418:0.001264,Peperomia_verruculosa_Pe424:8.14E-4,Peperomia_verruculosa_Pe425:7.98E-4,(Peperomia_verruculosa_Pe442:0.00116,Peperomia_verruculosa_Pe454:0.001426):0.00116,(Peperomia_verruculosa_Pe416:0.00118,Peperomia_verruculosa_Pe419:4.14E-4):0.001175):8.77E-4):7.97E-4):0.00132):0.001304):8.86E-4):0.00135):0.006393,(Peperomia_chutanka_Pe436:0.009188,((Peperomia_moralesii_Pe347:0.003011,(Peperomia_gracillima_aff_Pe16:4.36E-4,Peperomia_questionis_Pe588:0.00165):0.006424):0.001294,((Peperomia_occulta_Pe49:0.004737,Peperomia_occulta_Pe582:0.008765):7.51E-4,(Peperomia_occulta_Pe583:0.008153,(Peperomia_mexicana_Pe200:0.005936,Peperomia_mexicana_Pe45:0.004046,Peperomia_mexicana_Pe252:0.003941):0.001262):7.97E-4):0.00324,((Peperomia_bracteata_Pe46:0.005056,(Peperomia_bracteata_aff_Pe255:0.00636,Peperomia_schizandra_aff_Pe250:0.006352):0.001142):0.002421,((Peperomia_macrandra_Pe260:0.005125,(Peperomia_macrandra_Pe201:7.52E-4,Peperomia_macrandra_Pe50:7.66E-4):0.003025):0.003075,(Peperomia_schizandra_Pe265:0.011118,((Peperomia_schizandra_Pe21:0.006679,(Peperomia_schizandra_Pe24:0.007677,Peperomia_schizandra_Pe27:0.004821):0.005065):0.002383,(Peperomia_bracteata_Pe528:0.003457,(Peperomia_albonervosa_Pe22:0.00718,Peperomia_albonervosa_Pe26:0.007117):0.001989):0.001936):0.001246):9.58E-4):0.001049,(Peperomia_tepoztecoana_Pe10:0.00659,(Peperomia_monticola_Pe257:0.003085,(Peperomia_basiradicans_Pe11:7.92E-4,Peperomia_basiradicans_Pe4:0.001174):0.004245,((Peperomia_pedicellata_Pe37:0.001943,(Peperomia_macrandra_Pe205:0.001928,Peperomia_macrandra_Pe203:0.002785):8.14E-4):0.001735,(Peperomia_putlaensis_Pe48:0.007908,(Peperomia_pedicellata_Pe36:0.017729,Peperomia_claytonioides_Pe202:0.012802):0.003749):0.001077):8.61E-4,(Peperomia_cavispicata_Pe14:0.001133,Peperomia_ampla_Pe206:0.003551,(Peperomia_ovatopeltata_Pe30:0.003013,Peperomia_macrandra_Pe13:0.003432):0.002261,((Peperomia_ovatopeltata_aff_Pe41:0.002392,Peperomia_ovatopeltata_Pe42:0.00186):7.74E-4,(Peperomia_ovatopeltata_aff_Pe43:0.001885,Peperomia_ovatopeltata_aff_Pe44:8.03E-4):7.88E-4):0.002382,(Peperomia_bracteata_Pe17:0.001509,Peperomia_bracteata_Pe18:0.001165,Peperomia_bracteata_Pe19:8.07E-4,(Peperomia_elatior_Pe12:0.004478,Peperomia_bracteata_Pe346:0.001179,Peperomia_bracteata_Pe523:5.05E-4,Peperomia_bracteata_Pe529:0.002512,(Peperomia_bracteata_Pe249:0.001348,Peperomia_bracteata_Pe530:6.68E-4):0.001173,(Peperomia_questionis_Pe15:7.85E-4,Peperomia_ovatopeltata_Pe20:3.9E-4):0.00117):0.00153):0.001547,(Peperomia_putlaensis_Pe9:0.002026,((Peperomia_gracillima_aff_Pe23:0.00591,(Peperomia_species_Pe2:0.001548,Peperomia_cavispicata_Pe3:0.001172):0.001562):7.92E-4,(Peperomia_exclamationis_Pe25:0.006244,(Peperomia_bracteata_Pe33:0.001957,(Peperomia_bracteata_Pe32:3.95E-4,Peperomia_bracteata_Pe247:3.9E-4,(Peperomia_bracteata_Pe28:0.00116,Peperomia_bracteata_Pe31:3.77E-4):7.58E-4,(Peperomia_bracteata_Pe533:0.001133,Peperomia_bracteata_Pe534:7.58E-4,Peperomia_bracteata_Pe532:0.001911,Peperomia_bracteata_Pe531:3.88E-4,Peperomia_bracteata_Pe527:0.001948,Peperomia_bracteata_Pe525:0.001159,Peperomia_bracteata_Pe29:0.002706,Peperomia_bracteata_Pe256:3.85E-4):7.59E-4):0.001131):0.003067):7.56E-4):7.43E-4):0.001138):0.00119):8.34E-4):0.001738):8.7E-4):0.003621):8.8E-4):0.011159):0.007747):0.014318):0.050673):0.0609665); [! TreeBASE tree URI: http://purl.org/phylo/treebase/phylows/tree/TB2:Tr46195] END;